海洋生物膜隐藏的微生物多样性和功能性潜能

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微生物在海洋生态系统中的功能与作用

微生物在海洋生态系统中的功能与作用

微生物在海洋生态系统中的功能与作用海洋是地球上最为广阔的生态系统之一,它拥有丰富多样的生物资源,其中微生物在海洋生态系统中起着非常重要的角色。

微生物包括细菌、真菌、病毒和古菌等,它们不仅参与着海洋生态系统的物质循环和能量转化过程,还对其他生物的生存和繁衍起着至关重要的作用。

本文将就微生物在海洋生态系统中的功能与作用展开论述。

1. 营养循环微生物在海洋生态系统中扮演着关键的角色,其中包括了碳循环、氮循环、硫循环等。

细菌和古菌通过碳循环将有机碳分解为无机碳,使其重新进入生物圈。

这些微生物还可以参与到底物的氧化还原反应中,将有机底物氧化为二氧化碳并释放出能量。

此外,微生物还能利用硝酸盐和铵盐等无机氮化合物,进行氮循环,将氮转化成不同的形式,提供给其他生物利用。

微生物所承担的这些营养循环过程,是海洋生态系统中物质循环的重要环节。

2. 生物间关系微生物在海洋生态系统中对其他生物的生存和繁衍具有重要意义。

一个典型的例子是益生菌。

益生菌是一种有益的细菌,它能够生产有利于其他生物生存的物质。

在海洋生态系统中,益生菌可以与浮游植物密切合作,对其提供营养物质,并帮助其生长和繁殖。

益生菌还可以产生抗生素,抑制有害微生物的生长,维持海洋生态系统的稳定。

除了益生菌,还有一些微生物能够形成共生关系,与其他生物建立密切的互惠互利的关系。

比如,有些浮游生物和细菌之间会形成共生关系,浮游生物为细菌提供所需的营养物质,而细菌则能够利用光合作用产生的氧气。

这种共生关系不仅使生物之间能够相互依赖,还促进了海洋生态系统的多样性和稳定性。

3. 分解与再生微生物在海洋生态系统中承担着分解有机物的重要任务。

它们能够分泌腐解酶,将有机物分解为小分子的无机物,从而释放出养分。

这些养分再被其他生物吸收利用,参与新的生物合成过程。

微生物的分解和再生过程,有助于将有机物循环利用,并促进海洋生态系统中各个层次的物质流动。

此外,微生物还能够分解污染物,帮助修复受损的海洋生态系统。

海洋沉积物微生物分解作用

海洋沉积物微生物分解作用

海洋沉积物微生物分解作用海洋是地球上最广阔的生态系统之一,其中的沉积物扮演着重要的角色。

海洋沉积物是指在海洋底部沉积的各种颗粒状物质,包括有机物和无机物。

这些沉积物中存在着大量微生物,它们在海洋生态系统中扮演着至关重要的角色。

本文将重点探讨海洋沉积物中微生物的分解作用。

一、海洋沉积物中微生物的多样性海洋沉积物中的微生物种类繁多,包括细菌、真菌、原生动物等。

这些微生物通过不同的代谢途径参与有机物和无机物的分解过程。

其中,细菌是海洋沉积物中最主要的微生物群体,其代谢活动对有机物的降解至关重要。

此外,真菌在海洋沉积物中也扮演着重要的角色,它们能够分解各种有机物,促进养分的循环利用。

二、有机物的分解过程海洋沉积物中的有机物主要来源于死亡的海洋生物、植物残体以及陆地输入。

这些有机物经过微生物的分解作用,逐渐降解为简单的有机物和无机物。

细菌是海洋沉积物中最主要的分解者,它们通过产生各种酶类来降解复杂的有机物,将其转化为可被其他生物利用的物质。

这一过程促进了养分的循环,维持了海洋生态系统的平衡。

三、无机物的转化过程除了有机物的分解,海洋沉积物中的微生物还参与了各种无机物的转化过程。

例如,硫氧化细菌能够将硫化物氧化为硫酸盐,促进硫循环的进行;氮固氮细菌能够将氮气还原为氨,提供植物生长所需的氮源。

这些微生物的代谢活动在海洋沉积物中形成了复杂的物质转化网络,维持了海洋生态系统的稳定性。

四、微生物对海洋环境的影响海洋沉积物中微生物的分解作用对海洋环境具有重要的影响。

首先,微生物的分解作用促进了有机物和无机物的循环利用,维持了海洋生态系统的平衡。

其次,微生物的代谢活动产生了大量的二氧化碳和甲烷等气体,参与了海洋碳循环的过程。

此外,微生物还能够降解一些有毒物质,净化海洋环境,保护海洋生物的生存。

五、未来展望随着对海洋生态系统的深入研究,人们对海洋沉积物中微生物的分解作用有了更深入的理解。

未来,我们可以通过进一步研究海洋沉积物中微生物的多样性和功能,探索其在海洋生态系统中的作用机制,为保护海洋环境、维护海洋生态系统的稳定性提供更多的科学依据。

海绵相关的微生物群落的多样性和生物技术潜能

海绵相关的微生物群落的多样性和生物技术潜能
从海绵Spirastrella sp.中分离到得细菌Arthrobacterilicis和真Mucor sp.被发现能够产生乙酰胆碱酯酶和淀粉酶,这两种酶是热耐性型 的,它们的活性不受海水中相对高浓度的主要阳离子Na+, Ca2+, and Mg2+,的影响 。
淀粉酶,纤维素酶,蛋白酶,和其它水解酶在工业上用于药物, 食品,饮料,糖果,也在纺织和皮革生产,废水的处理中有广泛 的应用
用不同微生物16S rDNA的荧光原位杂交技术(FISH),在海绵组织 薄片上,对海绵体内微生物进行荧光原位杂交分析,结果表明在不需 要对微生物(其中包括许多不可分离培养的微生物)进行分离培养的 条件下,可以将存在于海绵中质层内的细菌,精确分类到属甚至种的 水平上。
海绵微生物和海绵天然产物
两千多年前,地中海沿岸的居民就将海绵的角质骨骼用于沐浴、洗涤、医 药、美术和美容等,古时欧洲人还将其用做止血剂。我国的本草纲目也记 载了一种名为紫梢花的淡水海绵可以入药。
从六个不同的区域(包括温带,亚热带,热带)中的海绵分离的真菌中寻找新 的天然化合物,从16个海绵种中一共分离得到681真菌菌种。分离的真菌属于 13个子囊菌属类,2个接合菌类,37个放线菌类真菌。不同的区域的样本,真菌 属的多样性和每个样本分离得到的真菌数量是不同的。
海绵相关微生物研究技术
1.早期对海绵共附生微生物多样性的研究主要是通过形态观察(显微镜) (1)细菌细胞壁的特征(革兰氏阳性和革兰氏阴性) (2)用透射电子显微镜观察的细菌细胞膜的结构
类似于周围海水环境的细菌,并不是海 绵所特有的 细胞内的细菌,它们是海绵所特有的
细菌在海绵的胶层中,也是海绵所特有的
海绵相关的真菌
从生态学上讲真菌在营养更新的循环中起着重要的作用,一些海洋真菌会引起海洋 动物和植物的疾病,而其它一些真菌会与一些器官形成互助的共生关系。一些真菌 产生毒素,一些会是免疫损害海洋动物和海滩游泳者的病原菌。

生物工程知识:深海微生物学——深海微生物的新奥秘

生物工程知识:深海微生物学——深海微生物的新奥秘

生物工程知识:深海微生物学——深海微生物的新奥秘深海微生物学——深海微生物的新奥秘深海是指那些水深超过200米的海域,拥有广阔的海底平原、陡峭的海底峡谷、神秘的海底温泉和冷泉等多种地形,同时还有着丰富而独特的生物。

在深海中,微生物群落是生命体系的重要基础,它们不仅能在深海海水中自主生长和繁殖,而且具有多种数量外的生理特性,对人们的生产和生活也有着很大的意义。

本文将对于深海微生物的新奥秘进行简要介绍。

一、深海微生物大航海深海微生物是深海生态系统的重要组成部分,是深海生命多样性的基石,也是研究深海生态系统的热点领域。

深海微生物的种类繁多,分别属于古菌和细菌,它们具有多种数量外的特点,可以在极端的温度、压力、化学物质等条件下自主生存和繁殖。

随着科技的发展和深海探测设备的广泛应用,对于深海微生物的研究也越来越深入。

不断发现的新品种、新特性,使得我们对于深海微生物的了解也越来越深入。

二、深海微生物的多样性深海微生物的多样性是深海生态系统的关键,它们占据着整个海洋生态系统的生物量的很大一部分,是深海生物圈的重要组成部分。

深海微生物群落主要分为两类,即古菌和细菌。

在深海中,细菌是最广泛分布的生物,它们可以处于嗜卤、光合和化学营养等多种模式下进行生存。

同时,古菌是深海中最古老的微生物,可以在高温、高压、强微生物群落下进行生存。

三、深海微生物的物种特性深海微生物的物种特性也是深海微生物学的重要内容之一。

深海微生物高度适应深海环境,具有多种独特的且生态学功能广泛的特征。

深海细菌和古菌硫化物氧化酶、硝化酶、厌氧呼吸酶等是深海生态系统的重要功能菌群,同时也是深海环境下维持能量平衡的关键因素。

此外,深海微生物还具有多种抗生素、酵素、酶、有机溶液和光感受器等生物活性物质,对抗生物和抗氧化有着重要的作用。

四、深海微生物的经济意义随着技术的不断发展,深海微生物在生产和生物技术上的应用也逐渐被人们所关注。

深海微生物的多样性和巨大潜力成为生物技术研究的热点,也成为了人们日常生活和药物研发的重要来源。

海洋环境中微生物的功能与多样性

海洋环境中微生物的功能与多样性

海洋环境中微生物的功能与多样性海洋是地球上最广阔的生态系统之一,承载着丰富的生物多样性。

而在这个复杂而庞大的生态系统中,微生物扮演着重要的角色。

微生物由于体型微小,只能在显微镜下观察到,但是它们却拥有着丰富多样的功能,对维持海洋生态系统的平衡和稳定起着重要作用。

首先,海洋中微生物的功能之一是促进能量流动。

微生物通过对有机物的分解和氮循环等过程,将有机物和无机物之间进行转化,进而使得能量在海洋中得以传递。

例如,细菌和真菌等微生物通过分解有机废物释放出大量的养分,从而提供了其他生物的食物源。

此外,一些光合细菌和浮游植物通过光合作用将太阳能转化为化学能,进一步促进了能量流动和物质循环。

其次,微生物在海洋中具有重要的生物地球化学循环功能。

其中最著名的是微生物的海洋碳循环。

海洋中的微生物通过利用二氧化碳进行光合作用或者进行呼吸作用,促进了碳的转化和循环。

光合细菌和浮游植物通过光合作用吸收大量的二氧化碳,并将其固定在有机物中。

而一些细菌和浮游动物则通过呼吸将有机物中的碳释放为二氧化碳。

这样,微生物在海洋碳循环中起着至关重要的作用,影响着全球碳平衡。

此外,微生物还在海洋中发挥着重要的生态位竞争和生物防御功能。

由于海洋环境中养分的稀缺性,微生物之间存在着激烈的竞争。

一些微生物通过产生抗生素等化学物质来竞争有限的资源。

同时,微生物还可以通过分泌胞外聚合物形成生物膜,从而附着在固体表面上,避免被其他微生物吞食。

这些生态位竞争和生物防御的功能使得海洋生物能够在复杂的环境中存活和繁衍。

最后,微生物的多样性是海洋生态系统的重要组成部分。

海洋中微生物的种类繁多且多样性高,包括细菌、真菌、浮游植物等。

研究表明,微生物的多样性与生态系统的稳定性和抗干扰能力密切相关。

在海洋环境中,微生物的多样性使得海洋生态系统具有更高的抗干扰能力,能够更好地适应外部环境的变化。

综上所述,海洋环境中微生物的功能与多样性是海洋生态系统中不可忽视的重要因素。

海洋微生物的多样性与功能

海洋微生物的多样性与功能

海洋微生物的多样性与功能海洋是地球上最大的生态系统之一,其中包含着丰富而独特的生物多样性。

而在这个生态系统中,微生物起着不可或缺的作用。

海洋微生物包括细菌、古菌和真核微生物等,它们在维持海洋生态平衡和提供各种生态功能方面发挥着重要作用。

本文将探讨海洋微生物的多样性以及它们所具备的功能。

一、海洋微生物的多样性海洋是一个巨大而广阔的系统,存在着各种生物体,而微生物则是其中最丰富的一群。

海洋微生物的多样性表现在多个层次上,包括物种多样性、遗传多样性和功能多样性。

1. 物种多样性海洋微生物的物种多样性相当丰富,充满了许多未知的微生物物种。

据估计,海洋中微生物的物种总数可能超过数百万。

这些微生物包括了各种不同类型的细菌和古菌,以及各种真核微生物,如原生动物和微型浮游动物。

这些微生物形态、特征各异,存在着丰富的物种组成。

2. 遗传多样性海洋微生物的遗传多样性也非常丰富。

由于微生物的短生命周期和巨大的繁殖速度,它们在短时间内可以积累许多遗传变异。

这种遗传多样性使得微生物在适应环境变化和应对各种生态压力方面具有很强的潜力。

3. 功能多样性除了物种和遗传多样性外,海洋微生物还展现出丰富的功能多样性。

它们在海洋生态系统中扮演着许多不同的角色,包括有机物分解、营养循环、底物转化等。

例如,一些细菌和古菌参与了重要的氮循环和硫循环过程,在生态系统的营养链中发挥了重要作用。

二、海洋微生物的功能海洋微生物具有多种重要的功能,对海洋生态系统的稳定运行和能量流动起着至关重要的作用。

下面将介绍几种典型的功能。

1. 有机物分解海洋微生物是海洋中最主要的有机物分解者之一。

它们通过分解有机物质,将其分解为更简单的化合物,释放出有机碳、氮、磷等元素,为其他生物提供营养物质。

这一过程对于海洋生态系统的能量流动和养分循环至关重要。

2. 底物转化海洋微生物对底物的转化能力也非常重要。

它们可以将一些有害的底物转化为无害或有用的物质,帮助维持海洋生态系统的稳定性。

海洋生物多样性及其生态作用

海洋生物多样性及其生态作用

海洋生物多样性及其生态作用海洋生物多样性是指海洋中各种生物的种类和数量的丰富程度。

海洋是地球上最丰富和多样化的生态系统之一,拥有广泛的生物多样性。

它不仅包括海洋中的鱼类、海洋无脊椎动物和海洋植物,还包括微生物和海洋中的生态系统。

海洋生物多样性对维持地球生态平衡、保护海洋环境及人类的生活具有重要的生态作用。

首先,海洋生物多样性对于维持地球生态平衡至关重要。

海洋是地球上最大的生态系统之一,占地球表面的70%。

海洋生物多样性的存在有助于保持海洋中食物链的稳定。

不同种类的生物在海洋食物网中扮演不同的角色,形成复杂的生态关系。

例如,浮游生物是海洋食物链的基础,它们是海洋中其他生物的重要食物来源。

如果浮游生物数量减少,整个海洋生态系统将受到严重破坏。

因此,保护海洋生物多样性对于维持地球生态平衡至关重要。

其次,海洋生物多样性在保护海洋环境方面发挥着重要作用。

海洋生物可以有效地吸收和存储二氧化碳,起到减缓气候变化的重要作用。

海洋中的浮游植物通过光合作用吸收二氧化碳,并释放出氧气。

此外,海洋中的珊瑚礁是海洋生物多样性的热点区域,它们不仅是众多海洋生物的栖息地,还对防止海岸线侵蚀和提供风暴保护起着重要作用。

保护海洋生物多样性有助于保护珊瑚礁及其他海洋生态系统的完整性,维护海洋的稳定性和可持续性。

此外,海洋生物多样性对人类的生活也具有非常重要的影响。

海洋中的鱼类是人类的重要食物来源之一,维持了全球数亿人口的食物安全。

此外,海洋中的生物还提供了丰富的药物资源。

许多药物和治疗方法都源自海洋生物,如海洋中的海绵类和软体动物含有丰富的生物活性物质,具有抗癌、抗病毒和抗菌等治疗潜力。

因此,海洋生物多样性对于人类的健康和医药领域具有重要意义。

然而,目前海洋生物多样性正面临着严重的威胁。

气候变化、过度捕捞、海洋污染和栖息地破坏等因素都对海洋生物多样性造成了巨大的压力。

全球变暖导致海洋温度升高和酸化,影响了海洋生物的繁殖和生长。

过度捕捞导致了许多鱼类和其他海洋生物的数量急剧减少,甚至濒临灭绝。

海洋生态系统的微生物多样性与功能

海洋生态系统的微生物多样性与功能

海洋生态系统的微生物多样性与功能海洋生态系统是地球上最广阔的生物群落之一,其中微生物扮演着至关重要的角色。

微生物多样性与功能之间存在着密不可分的关系,对于维持海洋生态系统的平衡和稳定起着重要的作用。

一、微生物多样性的重要性微生物包括细菌、古菌、原生动物、真菌和病毒等,它们的数量庞大,种类繁多。

海洋微生物的多样性主要体现在不同的物种组成、丰度分布和功能特征上。

微生物多样性对于维持海洋生态系统的稳定性至关重要。

首先,微生物是海洋食物链的基础。

它们通过不同的代谢途径参与有机质的降解和循环,为高级生物提供养分和能量。

其次,微生物在氮循环、硫循环和磷循环等重要生态过程中发挥着关键的角色,保持了海洋生态系统的稳定性。

此外,微生物还对水体的光合作用、营养盐循环和底栖有机质分解等起到重要的调控作用。

二、海洋微生物多样性的分布特征海洋微生物多样性的空间分布具有明显的地理差异。

研究发现,热带海洋区域的微生物多样性较高,而极地和寒冷海洋地区的微生物种类相对较少。

这主要与气候、温度和盐度等环境因素有关。

此外,海洋微生物多样性还受到水体深度、营养盐浓度和光照条件等因素的影响。

不同的生态地理区域拥有不同类型的微生物群落,这种多样性反映了海洋生态系统内微生物的适应能力和生态功能。

三、海洋微生物功能的关键作用海洋微生物不仅具有丰富的多样性,还拥有丰富的生态功能。

首先,微生物通过降解有机物质来维持海洋生态系统的平衡。

它们参与了有机物的降解和循环过程,将有机物转化为无机物质,并释放出养分供其他生物利用。

其次,微生物在海洋中起到了重要的光合作用。

某些微生物如古菌和浮游植物等通过光合作用产生氧气并吸收二氧化碳,为海洋生物提供了重要的氧气来源。

此外,微生物还参与了氮循环、硫循环和磷循环等重要生态过程,并调节了水体中的养分转化和分布。

此外,微生物还能够分解底栖有机质,维持海洋底栖生态系统的平衡。

四、保护海洋生态系统微生物多样性的重要性海洋生态系统微生物多样性对于维持海洋生态平衡和气候稳定具有重要的意义。

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海洋生物膜隐藏的微生物多样性和功能性潜能
来自美格基因
Marine biofilms constitute a bank of hidden microbial diversity and
functional potential
海洋生物膜隐藏的微生物多样性和功能性潜能
作者: Weipeng Zhang,Wei Ding, Yong-Xin Li等
期刊: Nature Communications
影响因子:11.878
发表时间:2019-1
一、研究背景
微生物在生物地理学循环过程、微生物之间的相互作用以及为脊椎动物提供重要的化学元素扮演着重要角色,维护并保持着海洋生态系统的健康和修复。

随着高通量测序技术的蓬勃发展,海洋微生物的群落研究得到了空前的发展,比如著名的Tara Oceans 项目极大地促进了我们从全球角度去探索海洋微生物多样性。

但目前大部分的研究对象主要聚焦于海洋浮游微生物,全球大范围的海洋微生物微膜群落结构的研究还比较少。

为了验证“海洋生物膜蕴藏着之前在海水中未有检测到的微生物,且它们有拥有着持续且迥然不同的重要功能”猜想,作者通过人造海洋生物膜结合高通量测序的方法对全球8个样点共101个生物膜样和24个海水样本进行测序,旨在全球范围里探索微生物膜“被隐藏”的微生物和功能潜能。

二、实验设计
本文作者在覆盖全球8个位置采样点里利用人工面板和聚苯乙烯培养皿在海水下1-2m制备生物膜,30d后采集金属表面形成的生物膜,共采集了101个生物膜样本以及临近样点海水样本24个,海水样本0.22μm和0.1
μm滤膜器过滤后用DNA储存液储存跟生物膜样本一并于-80℃保存,生物膜样本同时用激光共聚焦显微镜进行结构观察。

样本用试剂盒提取DNA后,建350bp小片段文库,用HiSeq 2500和HiSeq X Ten 进行宏基因组测序,生物膜和海水样本平均测序深度为115±39和130±33 milion reads。

随后进行数据质量控制,用MEGAHIT进行reads拼接,同时下载了OM-RG C以及Tara Oceans项目中的宏基因组数据。

从宏基因组抽出16S 数据后预测出miTags,97%相似度聚类成OTU,随后对OT U进行了物种注释,为了得到测序深度对物种及鉴定的影响,把香港2017点11月采集的2个生物膜和海水样本进行深度测序(110Gb每样本),然后随机抽取特定数量reads 进行分析。

对所有样本进行了α和β多样性分析。

宏基因组数据随后进行了ORF预测,比对OM-RGC数据库,得到非冗余unigene集BCGC,用COG,KEGG,eggNOG,Pfam,SEED 数据库进行功能注释。

为了比较生物膜和free-living培养的微生物群落的区别,以某一香港海水样本来源的微生物进行室内培养实验,进行了群落结构分析。

最后,用Meta_RNA提取了16S rRNA gene序列,采用进化树的分析方法进一步挖掘新物种,同时抽取了长度大于10Kb的contigs用混合binning的方法做了基因组binning,检测了bins 的完整度和污染度,用antiSMASH鉴定了生物合成基因簇基因,用MinCED挖掘了基因组的CRISPR信息。

三、实验结果
1、海洋生物膜的微生物群落和结构
16S群落结构分析发现,生物膜样本特有OTU有13,604,而新的海水样本有50个,Tara海水样本则是331个(Figure 1a),聚焦到丰富物种上(样本中每个OTU至少有9条序列),生物膜样本则有6411个OTU是特有的(Figure 1b);同时门水平的物种归属生物膜和海水样本有很大的区别
(Figure 1c),和Tara的物种相比,生物膜样本中有7300个OTU在Tara 样本中没有被检测到(Figure 2)。

Fig1 101个生物膜和24个海水样本微生物群落结构比较分析
Fig2 生物膜样本和Tara样本OTU venn 图比较
样本累计曲线分析发现,本次实验已经采集了足够多的样本和测序数据去解构微生物群落结构。

抽取了10,000 miTags进行α和β多样性分析,生物膜和海水OTU中位数分别为2790和2155(Figure 3a),ACE、Shannon、Chao1显示生物膜的多样性高于
海水样本,PCoA显示生物膜和海水样本的微生物群落结构能完全的分离开来。

Fig 3 α和β多样性分析
2、重要功能分析和实验依据
宏基因组数据分析发现生物膜样本里57.7%的ORFs在OM-RCS 或新的海水样本gene catalog里没有比对信息,最后过滤找到了生物膜的core gene catalog(BCGC),共包含了195,639个非冗余编码蛋白基因。

BCGC的物种注释发现97.3%的基因属于细菌,2.5%属于真核生物,古菌基因只有不到0.2%(Figure 4a),且只有38.9%的ORFs在COG,KEGG和SEED数据库里有比对信息(Figure 4b)。

40个丰度最高的SEED功能类别包含了从生物膜形成、压力应答、环境适应到DNA修复等多个功能,这些基因横跨了众多的门中(Figure 4c)。

Pfam的注释结果共找到了2567个结构域,这些结构域基因主要涉及压力抵抗和抗生素抗性,MEGARes比对结果从852个基因里共找到了18种抗生素抗性分类。

同时将香港的海水样本放于实验室进行free living和生物膜两种方式培养,该实验证了低丰度微生物从移动状态到表面附着的过渡期间,丰度低的物种及功能是富集的。

Fig4 biofilm core gene catalog(BCGC)的功能构成
最后通过hybrid genome binning方法从宏基因组数据里组装到479个微生物基因组,它们分别属于25个细菌门,包括Alpha-、β-、γ-、δ-、ε-变形细菌等。

基于binning的contig,共鉴定出了1148个生物合成基因簇,分类在了20个微生物门里(Figure 6a),其中分别有153、194和20个是合成NRPS、PKS 和NRPS-PKS基因簇的。

数量最大的基因家族来自γ-变形杆菌门,
其次是蓝细菌门和拟杆菌门。

同时鉴定基因组中的CRISPR arrays,共分布在了11个细菌门中(Figure 6b),最长的来自蓝细菌门,
其次是γ-变形杆菌门和酸杆菌门。

Fig5 479个微生物基因组(bins)的功能潜能分析
四、结论
本文作者通过高通量测序对全球8个样点的101个生物膜样和24个海水样本进行高通量测序,结合Tara Oceans的宏基因组数据,研究了生物膜样的微生物群落结构。

最终鉴定出了超过7300个在海水样本里没检测到的形成生物膜的物种,增加了对海洋微生物群落多样性的了解,为海洋生
态位的分化提供了证据。

基因功能鉴定发现了生物膜里重要的基因功能,
包含了很多门的细菌,这些菌可能在压力应答、微生物互作上扮演着重要
角色,Genome Binning也找到了很多新的生物合成基因簇和CRISPR-Cas系统。

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