IMC WSM无线热图绘制案例
工具用R快速制作heatmap图,一学就会!

工具用R快速制作heatmap图,一学就会!作者:解螺旋.冬至解螺旋原创转载请注明来源:解螺旋,医生科研助手这个heatmap图是不是很炫?知道是怎么做出来的吗?想学跟我来吧!1、首先下载R(/)根据自己的系统选择适合的版本安装2、安装pheapmap程序包由于我的是mac OS X版本,下面以Mac OS X版本示范安装pheapmap程序包。
打开R,菜单里面选择Packages & Data 下面的Package Installer,如果没有任何下面的Package选择,选择Get List,选择离我们最近的站点。
在左侧Package Search里面搜索pheatmap,点击install selected。
3、准备数据文件在Excel里面输入所需要画heatmap图数据,第一列为名称,后面的为均一化之后的数值。
二代测序的表达量差异的结果,芯片表达差异的结果,甚至是qPCR的结果都可以。
然后将整理好的Excel文件另存为制表符分割的文本.txt,命名为all.txt。
打开all.txt确定一下,是否正确。
4 、制作heatmap图启动R,先设置工作目录。
选择菜单Misc里面的Change Working Directory,选择存放要做图的数据文件all.txt所在的文件夹。
复制输入以下代码,注意all.txt与文件名一致,miRNA_name与Excel里面第一列的名称一致,输出pdf的名称可以随意data<>all.txt',head=T) #读入数据文件attach=datas(data)<>miRNA_name #提取行名data<-data[,-1]>data<-data.matrix(data)>library(pheatmap) #加载pheatmap函数pdf('test.pdf', height=10, width=10) #将绘图输出到PDFpheatmap(data,cluster_cols=FALSE,clustering_distance_row='correlation',clustering_method='complete',color=colorRampPalette(c('green','black','red')(100),revC=FALSE,scale='row',margin s=c(5,10),fontsize_row=8,cellheight=10,cellwidth=30) #默认参数dev.off()回车,在设置的工作目录里找test.pdf文件,即是生成的heatmap 图。
基于最小二乘法的热量表温度采集模块设计

基于最小二乘法的热量表温度采集模块设计张华强;李玉峰【摘要】A new design method of hardware circuit and software control scheme of heat meter temperature acquisition module was proposed. According to the theory of least square method , the mathematical model of the temperature acquisition module was established. It used the distribution curve method to eliminate the missing error of the data acquisition. The collected voltage data from the A/D converter can be changed into the corresponding temperature value directly. The low power, high precision and high efficiency of the temperature module was achieved by using the time-sharing power supply technology. TheoreLical analysis and practical tests show that the circuit operation is stable,the method of temperature calculation is simple,the theoretical error is less than 0. 000 8 ℃, and its measured error is less than 0. 04 ℃ . It'S less than 0. 1 ℃ ordinary heat meter error requirement and has great practical value.%针对热量表的温度采集模块提出了一种新的硬件电路设计方法和软件控制方案.根据最小二乘法的有关理论建立了温度采集模块的数学模型,采用分布图法剔除采集数据中的疏忽误差,由A/D转换器采集的电压值直接转换成对应的温度值,采用分时供电技术,实现了温度采集模块的低功耗、高精度和高效率.理论分析和实际测试表明:该电路工作稳定,计算简便,理论误差小于0.000 8℃,实测误差小于0.04℃,满足普通热量表误差小于0.1℃的要求,因而具有很大的实用价值.【期刊名称】《仪表技术与传感器》【年(卷),期】2011(000)002【总页数】3页(P16-18)【关键词】热量表;最小二乘法;分布图法;分时供电【作者】张华强;李玉峰【作者单位】哈尔滨工业大学(威海)电气工程系,山东威海,264209;哈尔滨工业大学(威海)电气工程系,山东威海,264209【正文语种】中文【中图分类】TP2160 引言热量表是计量热交换回路中释放热量的一种仪表,是国内供暖系统按热量收费改革后的主要计量器具,在整个系统中占据重要的作用。
热图如何绘制,怎么分析?看完这篇就会了

热图如何绘制,怎么分析?看完这篇就会了在组学研究中,我们常常会用到热图(Heatmap)。
色彩丰富的热图总能吸引读者的眼球,给文章增色。
但一堆堆的色块让人眼花缭乱,背后的分析方法更让人不知从何下手。
今天我们先来初步探一探门道。
热图的解读热图如下(Nucleic Acids Res (2015) 43 (W1): W566-W570.),本质上它是表现一个数值矩阵,图上每一个小方格都是一个数值,按一条预设好的色彩变化尺(称为色键,Color Key),来给每个数值分配颜色,虽然看起来眼花,但道理却很简单。
这幅图就是24个样本(列)中,30类基因(行)的表达情况。
但不同基因在不同样本中的表达量,可能会跨越好几个数量级,这样就会把色键分得很细,所以通常会对表达量取对数,或取Z-score,这样色键的范围一般就在个位数内变化。
上方两条色彩稍微简单的横条,是根据实验分组,用颜色标出组别。
两个横条表示两种分组方式,也就是两个变量(normal tumor和tissue)。
就这幅图来说,第一行的黄色表示正常组织,紫色表示肿瘤组织;第二行的蓝绿色表示乳腺,红色表示前列腺。
图外围那些线条,是聚类分析的树形图。
越靠下游的子目录中的个体关系越近,最先聚为一类,之后小类与小类又聚为一个大类。
而且有些节点走了很远才跟其他组别聚成一类,有些节点没走多远就聚了,所以这些支线的长短,就代表了距离。
高通量测序的数据,通常比较磅礡,生成的热图,每个方格就会很小,基本看不清。
这时就可以用一些处理技巧,比如上面那幅图,研究纳入了54675个基因,如果都画出来,这图就会很长,色块也会很密。
所以它先通过K均值聚类算法,把这些基因聚成30类。
热图的绘制绘制热图,最常用的是R语言,当然也能用GraphPad Prism做。
但如果数据量不是特别大的话,这里推荐一个在线工具ClustVis,但数据量大时还是容易卡顿。
另一个不太卡的在线工具叫Morpheus,博大研究所开发的。
python中热力图绘制

python中热⼒图绘制⼀、热⼒图绘制参数详解sns.heatmap(data, vmin=None, vmax=None, cmap=None, center=None, annot=None, fmt='.2g', annot_kws=None, linewidths=0, linecolor='white', cbar=True,cbar_kws = None, square=False, xticklabels='auto', icklabels='auto', mask=None, ax=None) data:指定绘制热⼒图的数据集vmin,vmax:⽤于指定图例中最⼩值与最⼤值的显⽰值cmap:指定⼀个colormap对象,⽤于热⼒图的填充⾊center:指定颜⾊中⼼值,通过该参数可以调整热⼒图的颜⾊深浅annot:指定⼀个bool类型的值或与data参数形状⼀样的数组,如果为True,就在热⼒图的每个单元上显⽰数值fmt:指定单元格中数据的显⽰格式annot_kws:有关单元格中数值标签的其他属性描述,如颜⾊、⼤⼩等linewidths :指定每个单元格的边框宽度linecolor:指定每个单元格的边框颜⾊cbar:bool类型参数,是否⽤颜⾊条作为图例,默认为Truesquare:bool类型参数,是否使热⼒图的每个单元格为正⽅形,默认为Falsecbar_kws:有关颜⾊条的其他属性描述xticklabels,yticklabels:指定热⼒图x轴和y轴的刻度标签,如果为True,则分别以数据框的变量名和⾏名称作为刻度标签mask:⽤于突出显⽰某些数据ax:⽤于指定⼦图的位置1import pandas as pd2import seaborn as sns3# 读取数据4 Sales = pd.read_excel('Sales.xlsx')5# 根据交易⽇期,衍⽣出年份和⽉份字段6 Sales['year'] = Sales.Date.dt.year7 Sales['month'] = Sales.Date.dt.month8# 统计每年各⽉份的销售总额9 Summary = Sales.pivot_table(index = 'month', columns = 'year', values = 'Sales', aggfunc = np.sum)1011# 绘制热⼒图12 sns.heatmap(data = Summary, # 指定绘图数据13 cmap = 'PuBuGn', # 指定填充⾊14 linewidths = .1, # 设置每个单元格边框的宽度15 annot = True, # 显⽰数值16 fmt = '.1f'# 以科学计算法显⽰数据17 )18#添加标题19 plt.title('每年各⽉份销售总额热⼒图')20# 显⽰图形21 plt.show()。
Icepak

目录什么是Icepak? (2)程序结构 (2)软件功能 (3)练习一翅片散热器 (8)练习二辐射的块和板 (43)练习三瞬态分析练习四笔记本电脑练习五改进的笔记本电脑练习六 IGES模型的输入练习七非连续网格练习八 Zoom-in 建模1.1 什么是Icepak?Icepak是强大的 CAE 仿真软件工具,它能够对电子产品的传热,流动进行模拟,从而提高产品的质量,大量缩短产品的上市时间。
Icepak能够计算部件级,板级和系统级的问题。
它能够帮助工程师完成用试验不可能实现的情况,能够监控到无法测量的位置的数据。
Icepak采用的是FLUENT计算流体动力学 (CFD) 求解引擎。
该求解器能够完成灵活的网格划分,能够利用非结构化网格求解复杂几何问题。
多点离散求解算法能够加速求解时间。
Icepak提供了其它商用热分析软件不具备的特点,这些特点包括:•非矩形设备的精确模拟•接触热阻模拟•各向异性导热率•非线性风扇曲线•集中参数散热器•外部热交换器•辐射角系数的自动计算1.2 程序结构Icepak软件包包含如下内容:•Icepak, 建模,网格和后处理工具•FLUENT, 求解器图 1.2.1:软件架构Icepak本身拥有强大的建模功能。
你也可以从其它 CAD 和 CAE 软件包输入模型. Icepak 然后为你的模型做网格, 网格通过后就是进行CFD求解。
计算结果可以在Icepak中显示, 如图 1.2.1所示.1.3 软件功能所有的功能均在Icepak界面下完成。
1.3.1 总述•鼠标控制的用户界面o鼠标就能控制模型的位置,移动及改变大小o误差检查•灵活的量纲定义•几何输入IGES, STEP, IDF, 和 DXF格式•库功能•在线帮助和文档o完全的超文本在线帮助 (包括理论和练习册) •支持平台o UNIX 工作站o Windows NT 4.0/2000/XP 的PC机1.3.2 建模•基于对象的建模o cabinets 机柜o networks 网络模型o heat exchangers 热交换器o wires 线o openings 开孔o grilles 过滤网o sources 热源o printed circuit boards (PCBs) PCB板o enclosures 腔体o plates 板o walls 壁o blocks 块o fans (with hubs) 风扇o blowers 离心风机o resistances 阻尼o heat sinks 散热器o packages 封装•macros 宏o JEDEC test chambers JEDEC试验室o printed circuit board (PCB)o ducts 管道o compact models for heat sinks 简化的散热器•2D object shapes 2D模型o rectangular 矩形o circular 圆形o inclined 斜板o polygon 多边形板•complex 3D object shapes 3D模型o prisms 四面体o cylinders 圆柱o ellipsoids 椭圆柱o elliptical and concentric cylinders 椭圆柱o prisms of polygonal and varying cross-section 多面体o ducts of arbitrary cross-section 任意形状的管道1.3.3 网格•自动非结构化网格生成o六面体,四面体,五面体及混合网格•网格控制o粗网格生成o细网格生成o网格检查o非连续网格1.3.4 材料•综合的材料物性数据库•各向异性材料•属性随温度变化的材料1.3.5 物理模型•层流/湍流模型•稳态/瞬态分析•强迫对流/自然对流/混合对流•传导•流固耦合•辐射•体积阻力•混合长度方程(0-方程), 双方程(标准- 方程), RNG - , 增强双方程 (标准- 带有增强壁面处理), 或Spalart-Allmaras 湍流模型•接触阻尼•体积阻力模型•非线性风扇曲线•集中参数的fans, resistances, and grilles1.3.6 边界条件•壁和表面边界条件:热流密度, 温度, 传热系数, 辐射,和对称边界条件•开孔和过滤网•风扇•热交换器•时间相关和温度相关的热源•随时间变化的环境温度1.3.7求解引擎对于求解器FLUENT,是采用的有限体积算法。
MICAPS4帮助文档

目录
0 快速入门手册.........................................................................................................................6 0.1 安装.............................................................................................................................. 6 0.2 快速配置......................................................................................................................6 0.2.1 数据源配置.......................................................................................................6 0.2.2 综合图配置.......................................................................................................7 0.2.3 单站雷达默认配置(工具栏)...................................................................... 9 0.2.4 模式剖面默认配置(工具栏)...................................................................... 9 0.2.5 累积降水默认配置(工具栏).................................................................... 10 0.2.6 表格数据默认配置(工具栏).....................................................................11 0.2.7 模式探空默认配置.........................................................................................11 0.2.8 基础地图信息配置.........................................................................................12 0.2.9 交互层“另存为”保存................................................................................ 13 0.2.10 系统启动配置与出图配置.......................................................................... 14 0.2.11 传真图配置.................................................................................................15
itginsight帮助

使用手册 版本 V 1.0.0
目录 目录 .................................................................................................................................................. I 第一章:功能与用户 ...................................................................................................................... 3 1.1 功能简介............................................................................................................................. 3 1.2 适用用户............................................................................................................................. 3 第二章:安装与运行 ...................................................................................................................... 3 2.1 安装必备...................................................................
可视化技术使用技巧:通过热力图和散点图发现隐藏的关联性(七)

数据可视化是一种通过图形化展示数据的方式,使人们更容易理解和分析数据的工具。
在可视化技术中,热力图和散点图是常用的方法。
它们可以帮助我们发现数据中隐藏的关联性,为决策和问题解决提供更深入的洞察力。
一、热力图的使用技巧热力图是一种以颜色的变化来显示数据密集程度的可视化工具。
通过对数据的热度进行编码,我们可以快速地发现数据中的模式和趋势。
以下是一些使用热力图的技巧。
首先,选择适当的颜色映射。
颜色映射是将数据值映射到颜色的过程。
在使用热力图时,我们应该根据数据的特点选择适合的颜色映射。
例如,如果要显示一个连续的数值范围,可以使用渐变的颜色映射,如从蓝色到红色。
如果要显示离散的数值,可以使用不同的颜色来代表不同的数值。
其次,调整颜色的亮度和饱和度。
亮度和饱和度可以影响人们对数据的感知。
通常,较亮的颜色代表较高的数值,较暗的颜色代表较低的数值。
而饱和度较高的颜色会更加吸引人的注意力,可以用来突出特定的数据。
最后,添加附加信息。
除了颜色编码之外,热力图还可以通过添加其他信息来提供更多的上下文。
例如,我们可以在热力图中添加标签、标题等,以帮助人们更好地理解数据。
此外,我们还可以在热力图上添加轴标签和图例,以便更准确地解读图表。
二、散点图的使用技巧散点图是一种以点的位置和形状来展示两个变量之间关系的可视化工具。
通过在坐标轴上绘制点,我们可以直观地发现数据中的相关性和分布。
以下是一些使用散点图的技巧。
首先,选择适当的坐标轴范围。
坐标轴的范围可以影响我们对数据的感知。
如果坐标轴的范围过大或者过小,可能会导致数据的分布被扭曲或者无法显示。
因此,在使用散点图时,我们应该根据数据的范围选择适当的坐标轴范围,以保证数据的准确性和清晰度。
其次,使用不同的符号和颜色来表示不同的类别或属性。
如果在散点图中存在多个类别或属性,我们可以通过改变点的形状、大小或颜色来区分它们。
这样做可以帮助我们更好地理解数据,并从中发现隐藏的关联性。
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WSM射频管理无线热图绘制案例
一.组网需求
无线网络在部署过程中最重要的一个指标就是要保证信号的覆盖范围。
而由于现场环境、地形等对信号的影响较大,所以工程中如何确定AP的布放位置通常需要花费很大精力去分析计算。
IMC WSM组件提供了射频管理功能,可以根据AP的Radio类型、发射功率,以及周围环境(混凝土墙、玻璃窗、门等)对无线信号衰减的影响,计算和绘制出AP的信号覆盖效果图,并且支持按信号强度、接入速率、信道三种方式进行展示。
从而让工程人员在实际部署前就对部署后能达到的效果有一个直观的了解,并可将效果图作为参考直接将AP部署到对应位置减短工程周期。
二.组网图
用户已经搭建了无线网络,部署好AP,希望从iMC网管中看到无线网络中的实际信号覆盖情况。
三.配置步骤
点击业务-无线业务管理-视图管理-位置视图,进入位置视图列表,并点击【增加】来新建一个位置视图,如下图1:
图1
输入位置视图的名称和类型,如下图2:
点击创建好的位置视图名称链接,进入位置视图详细页面,如下图3:
图3
点击页面中的【增加到本位置】来为此位置增加可管理的AP,如下图4:
图4
在弹出的AP选择框中输入检索条件,点击【查询】将会查到所有符合检索条件的AP来供添加,如下图5:
图5
点击【确定】后即可在位置视图中看到包含的所有AP信息,如下图6:
至此,要展示的位置视图已经创建完成了,点击【资源-网络拓扑(Applet)】来打开无线位置视图拓扑,如下图7:
图7
在打开的位置视图“二楼”拓扑中点击【增加背景图片】来为此视图增加一个背景,如下图8:
图8
在弹出的选择对话框中可以选择【用户上传背景图片】来上传一个自己绘制的图片,也可以选择【从背景图库中选择】来使用系统自带的图片,如下图9:
图9
本案例我们选择【用户上传背景图片】并点击【选择文件】,在弹出的选择文件对话框中选择本地的图片文件来作为视图背景,选择后点击【设置】即可完成。
需要注意的是上传本地文件时系统会默认将图片先保存到背景图片库中,如果背景图片库中图片太多可能导致空间不足图片上传失败,可手动删除背景图库中的图片来释放空间。
设置完背景图片后,需要在拓扑中右键【设置比例尺】来设置背景图和真实楼层的比例关系,如下图10:
图10
点击设置比例尺后鼠标变成“+”型,在背景图中选择一个起始点左键单击,然后按住左键移动一段距离后释放,即可绘制出一条直线,并弹出设置真实长度窗口,如下图11:
图11
输入真实长度后,即可为视图添加障碍物,点击【添加障碍物】图标。
如下图12:
图12
在弹出的窗口中选择障碍物的形状、类型以及厚度等参数。
如下图13:
图13
选择好障碍物参数后,在背景图中选择一起始点左键,然后移动鼠标到另外一结束点再次左键,完成一面障碍物的添加。
如下图14:
图14
按照上步方法,添加完成后的楼层图如下图15:
图15
点击工具栏中的信号显示图标选择信号显示方式,这里选择按信号强度显示,如下图16:
图16
点击之后即可看到信号强度的覆盖范围效果,如下图17:
图17
默认情况下显示的强度阈值比较小,所以很弱的信号也会显示出来视图看着比较乱,可以在工具栏中点击信号强度阈值设置,如下图18:
图18
完成之后就会显示强度高于阈值中设置的强度的信号覆盖范围,如下图19:
图19
WSM无线热图提供了添加虚拟AP的功能,即在真实AP部署前,可以模拟部署并测试信号覆盖效果,指导后期实际工程。
在拓扑中右键选择【增加虚拟AP到本位置】,如下图20:
图20
在弹出的AP型号选择对话框中选择所要用到的AP型号,如下图21:
图21
选择完成之后虚拟AP显示为蓝色,旁边会有“V”标示,如下图22:
图22
完成之后再次查看信号覆盖效果,即可看到虚拟AP所产生的信号覆盖范围,如下图23:
图23
系统默认情况下预定义了各个强度信号的颜色,如果需要修改颜色设置可以在拓扑中右键选择【颜色设置】并选择【设置信号强度颜色】,如下图24:
图24
完成之后即可看到当前的信号颜色已经变更为自定义的了。
如下图25:
图25
四.配置注意点
1.打开拓扑时,不要选择“资源-查看拓扑”或者直接在位置视图信息页面选择“更
多-查看拓扑”,因为这两种方式打开的都是HTML5绘制的拓扑图,功能较弱,所以可能会无法显示热图内容;
2.在选用自己上传的背景图时iMC会默认将图片先保存在图片库中,如果图片
太多可能会导致空间不足上传失败,请手工删除图库中图片,确保空间够用;
3.为避免数据丢失,在修改完拓扑图后请在工具栏中手动进行保存;。