SNP标记及其在园艺作物上应用的研究进展
SNP分子标记在玉米非生物逆境抗性上的研究进展
SNP分子标记在玉米非生物逆境抗性上的研究进展近年来，玉米是世界上最重要的粮食作物之一，受非生物逆境如干旱、高温、盐碱胁迫、重金属污染等的影响，玉米产量受到了严重的影响。
对于玉米的非生物逆境抗性进行研究具有重要意义。
而随着分子生物学和基因组学技术的快速发展，单核苷酸多态性（SNP）分子标记成为近年来研究玉米非生物逆境抗性的重要手段之一，该技术已在玉米的非生物逆境抗性方面取得了重要的进展。
本文将对SNP分子标记在玉米非生物逆境抗性上的研究进展进行综述，为相关领域的研究提供参考。
一、SNP分子标记及其在玉米遗传研究中的应用SNP（Single Nucleotide Polymorphism）是一种单碱基多态性，是一种常见的DNA序列变异形式。
由于SNP分子标记具有高度位点密度、易于分析和识别等特点，因此在遗传图谱构建、基因定位、基因功能分析等方面被广泛应用。
在玉米中，SNP分子标记的应用已成为玉米遗传育种研究的重要手段之一。
多年来，研究人员通过对不同玉米种质库中SNP标记的分析，发现了大量与非生物逆境抗性相关的关键基因及其功能。
通过对玉米抗旱基因的SNP标记分析，研究人员发现了一些与抗旱相关的重要基因，这为进一步进行抗旱基因的克隆和功能研究奠定了基础。
通过SNP标记对玉米耐盐基因的研究，也为玉米耐盐性的遗传机制研究提供了重要的线索。
还有研究表明，通过SNP分子标记的分析，可以发现一些与玉米抗旱基因密切相关的新基因。
研究人员通过比较SNP标记位点的分布情况，发现了一些新的抗旱基因，这些基因在玉米抗旱性状中发挥着重要的作用，为进一步的玉米抗旱性状的改良提供了新的思路。
尽管SNP分子标记在玉米非生物逆境抗性研究中取得了重要进展，但仍然存在一些问题需要解决。
目前对于玉米非生物逆境抗性相关基因的SNP标记研究还比较零散，缺乏系统的研究。
目前对于一些重要抗逆性状的SNP标记位点的功能研究还比较匮乏，对于这些SNP标记位点的功能还需要进一步的探索和验证。
基于GBS测序开发SNP在植物上的应用进展
基于GBS测序开发SNP在植物上的应用进展作者：薛晓杰杜晓云盖艺唐岩孙燕霞宋来庆姜中武来源：《江苏农业科学》2020年第13期摘要：基因分型测序（genotyping by sequencing，GBS）因具有实现相对简单、成本较低、可产生高通量SNP的优点而受到青睐。
单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）因简单、快速、特异性强、稳定遗传、便于检测等特点已成为目前最广泛使用的分子标记之一。
本文就利用GBS技术开发SNP分子标记近年来在亲缘关系评价、重要农艺性状鉴定、遗传多样性研究、遗传图谱构建以及基因定位等方面在国内外的研究进展进行综述，并对其今后的研究提出展望，以期为其在植物上的更广泛应用提供参考。
关键词：SNP分子标记;GBS技术;简化基因组测序;遗传图谱构建;QTL定位;基因定位中图分类号：S184 文献标志码： A文章编号：1002-1302（2020）13-0062-07收稿日期：2020-040-02基金项目：山东省外专双百计划（编号：WST2018013）;山东省重点研发项目（编号：2018GHZ005）。
作者简介：薛晓杰（1994—），女，山东烟台人，硕士研究生，主要从事果树分子与生理技术研究，E-mail：xuexiaojieYT@;共同第一作者：杜晓云（1979—），女，山西吕梁人，博士，高级农艺师，主要从事果树生物技术育种研究，E-mail：duxiaoyunduzi@。
通信作者：姜中武，博士，研究员，主要从事果树育种与栽培技术研究。
E-mail：jiangzhongwu@。
随着分子生物学的发展，分子标记技术发展迅速，基因组测序技术日渐成为标记开发的重要手段。
简化基因组测序（GBS）技术近年发展起来。
GBS技术可以捕获基因组重要区域，获得大量单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），且无需已知基因组信息[1]。
SNP标记在玉米研究上的应用进展
SNP标记在玉米研究上的应用进展SNP（单核苷酸多态性）标记是一种分子标记，可用于研究生物种群的遗传多样性、基因定位、基因组建图和群体遗传学等方面的研究。
玉米（Zea mays）是被广泛种植的重要作物之一，对于玉米育种和遗传改良的研究中，SNP标记的应用进展非常显著。
本文将着重探讨SNP标记在玉米研究上的应用进展。
SNP标记的应用在玉米研究中的一个重要方面是遗传多样性的研究。
通过对不同玉米栽培种及其野生种进行SNP分析，可以揭示玉米中存在的遗传多样性，了解种间和种内的遗传差异，并帮助选择可能具有重要农艺性状的遗传多样性资源。
利用SNP标记可以对大量样品进行高通量分析，大大提高了分析的效率和准确性。
通过SNP标记，可以对玉米的基因定位进行研究。
SNP标记是遗传图谱构建的重要工具，可以帮助确定具体基因的位置。
玉米基因组已经被充分测序和注释，可以利用SNP标记将特定基因与其它经济重要性状进行关联。
通过SNP标记的定位，可以更加准确地进行基因定向选育，提高玉米的产量和抗性等重要农艺性状。
SNP标记的应用还可以研究玉米的群体遗传学。
通过对不同玉米群体的SNP标记分析，可以了解玉米群体的遗传结构和亲缘关系，并推断群体的起源和演化历史。
这对于玉米品种的保护、遗传改良和科学种植都具有重要意义。
SN 和遗传结构等调查研究提供了准确数据，从而加强了玉米种子的选育速度和品质。
SNP标记的应用还可以促进玉米的遗传改良。
利用SNP标记进行分子标记辅助选择（MAS）和全基因组选择（GS）等技术，可以加快育种过程，提高选育效率。
通过对SNP标记与农艺性状之间的关联分析，可以筛选出具有目标基因的候选材料，从而更好地实现育种目标。
SNP标记还可以用于进行种质资源评价和亲和性分析，辅助提高玉米育种的成功率和育种进展。
SNP标记在玉米研究上的应用进展
SNP标记在玉米研究上的应用进展SNP（Single Nucleotide Polymorphism）即单核苷酸多态性，是DNA序列中最常见的变异形式之一。
由于其高度丰富和广泛分布于基因组中，SNP标记已成为近年来遗传学研究领域的热点。
在玉米研究中，SNP标记的应用进展主要包括以下几个方面。
SNP标记在玉米的种质资源鉴定和种质筛选上发挥了关键作用。
通过对玉米种质资源中SNP位点的分析，可以快速、准确地鉴定和评价不同种质资源的遗传多样性和遗传背景。
这对于种质资源的筛选和合理利用具有重要意义。
研究人员利用SNP标记对不同玉米种质资源进行遗传多样性分析，发现存在丰富的遗传多样性，为玉米的遗传改良提供了重要的遗传资源。
SNP标记在玉米的基因组图谱构建和基因定位上具有重要意义。
通过对大规模SNP位点的分析，可以构建出较为完整和精细的玉米基因组图谱，有助于解决玉米中许多重要性状的基因定位问题。
研究人员利用SNP标记对玉米中的抗病性状进行基因定位，发现了多个影响抗病性的关键基因，并为进一步的抗病性育种提供了重要的理论依据。
SNP标记在玉米的遗传连锁图构建和群体遗传学研究中发挥了重要作用。
通过对大规模SNP位点的分析，可以构建出玉米的高密度遗传连锁图，揭示玉米基因组的遗传连锁关系，解决遗传连锁和连锁不平衡问题。
SNP标记也可用于玉米群体遗传学研究中，揭示玉米种群的遗传结构、迁移及演化等重要问题。
研究人员通过SNP标记分析，发现了玉米中不同遗传亚群之间的遗传分化和亲缘关系，为玉米的种质保存和遗传改良提供了重要的参考依据。
SNP标记在玉米的分子育种和辅助选择育种中具有广阔的应用前景。
通过选择与目标性状紧密相关的SNP标记，可以在玉米的种质资源中快速筛选出优良种质和亲本，提高育种效率和选择效果。
SNP标记还可以用于玉米的插入导向育种和分子辅助选择育种中，通过分析和利用SNP位点的信息，实现对目标基因的定向选育和导入，提高玉米的产量和品质。
SNP分子标记在玉米非生物逆境抗性上的研究进展
SNP分子标记在玉米非生物逆境抗性上的研究进展SNP分子标记（Single Nucleotide Polymorphism）是一种常见的遗传变异，常表现为DNA序列中单个核苷酸的差异。
它在分子遗传学研究中被广泛应用，包括对玉米曲霉病、干旱等非生物逆境抗性的研究。
玉米作为全球重要的粮食作物之一，在许多地区都面临着各种非生物逆境的挑战。
非生物逆境包括干旱、高温、盐碱等环境压力，对玉米的生长和产量产生了严重影响。
对玉米的非生物逆境抗性进行研究和改良具有重要意义。
近年来，随着技术的发展，SNP分子标记在玉米抗性研究中的应用逐渐增多。
SNP标记相对于传统的分子标记，具有高密度分布、信号清晰、成本低廉等优势，可以更准确地对玉米的抗性基因进行定位和研究。
研究进展表明，SNP分子标记已被应用于多个玉米非生物逆境抗性相关基因的研究。
一项研究发现，在干旱条件下，玉米中一个与逆境抗性相关的基因ZmCIPK15的SNP标记位点与产量性状显著相关。
这表明SNP分子标记可以帮助研究人员更好地理解玉米逆境抗性的遗传机制。
SNP分子标记也被应用于玉米曲霉病抗性的研究。
曲霉病是一种常见的玉米病害，严重影响着玉米的产量和质量。
研究发现，玉米中一些与曲霉病抗性相关的基因的SNP标记可以有效地用于预测品种的抗病性状，并为玉米抗病遗传改良提供了新的思路。
SNP分子标记还被应用于玉米耐盐性的研究。
全球范围内的土地盐碱化问题严重威胁着玉米等作物的生产。
研究发现，玉米中与盐碱逆境相关的基因的SNP标记可以帮助鉴定盐碱逆境下的抗性种质资源，为盐碱地的玉米种植提供更好的遗传材料。
SNP分子标记在玉米非生物逆境抗性上的研究进展表明，它是一个非常有潜力的工具。
通过利用SNP分子标记，人们可以更准确地鉴定和利用玉米的抗性基因，为玉米的抗逆境育种提供科学依据。
随着技术的不断发展，相信SNP分子标记在玉米非生物逆境抗性研究中的应用还会有更大的突破和进展。
SNP分子标记的原理及应用解读
SNP分子标记的原理及应用解读SNP（Single Nucleotide Polymorphism，单核苷酸多态性）是指个体间在DNA序列中存在的单个碱基差异。
SNP是最常见的遗传变异形式，它在基因组中广泛存在，可以用来研究个体之间的遗传差异。
SNP分子标记技术通过检测SNP位点上的碱基差异，可以用来研究生物个体的遗传相关性、种群结构、物种起源、适应性以及疾病的遗传风险等。
SNP分子标记的原理是基于PCR（聚合酶链反应）技术，在PCR反应中引入荧光标记的引物来扩增感兴趣的SNP位点。
SNP位点上的碱基差异会导致引物与模板DNA序列的匹配性不同，从而影响PCR反应的效率和产物的数量。
这种差异可以通过凝胶电泳或者高通量测序等方法来检测。
1.遗传研究：SNP是人类基因组中最常见的遗传变异形式，可以用来研究个体之间的遗传差异。
通过分析SNP位点上的碱基差异，可以确定个体之间的亲缘关系、种群的遗传结构以及物种的起源演化等。
2.遗传性疾病的研究：SNP位点与许多遗传性疾病之间存在关联。
通过分析SNP位点上的碱基差异，可以确定个体对一些疾病的易感性风险，进而进行早期预防和干预。
3.个体化药物治疗：个体的基因差异可以影响药物的代谢和疗效。
通过分析SNP位点上的碱基差异，可以预测个体对一些药物的反应，进而实现个体化的药物治疗。
4.农业育种：SNP分子标记可用于农作物和家畜等的品种鉴定、个体选择和育种进展的监测等。
通过分析SNP位点上的碱基差异，可以选择具有优良特性的个体进行育种，提高农作物和家畜的产量和品质。
除了以上几个应用领域，SNP分子标记还可以应用于环境研究、种群遗传分析、疾病的诊断和预后、区域起源和扩散等方面。
由于其高度可重复性、高通量性和成本效益等特点，SNP分子标记已成为现代生命科学研究的重要工具之一、随着高通量测序技术的不断发展，SNP分子标记技术还将进一步发展和应用。
分子标记技术及其在园林植物遗传育种中的应用 精品
分子标记技术及其在植物遗传育种中的应用近年，随着生物技术的快速发展，分子标记技术在诸多领域得到应用，尤以农业、医药业、畜牧业等行业应用得最多。
分子标记是指以生物大分子的多态性为基础的遗传标记。
分子标记的出现，使植物育种的“间接选择”成为可能，大大提高了遗传分析的准确性和选育种的有效性，因而在遗传育种领域愈来愈受到重视。
在遗传学研究中广泛应用的DNA分子标记已经发展了很多种，一般依其所用的分子生物学技术大致分为两大类：一类是以Southern杂交技术为核心的分子标记(如RFLP)，此类被称为第一代分子标记；以PCR技术为核心的分子标记(如STS、RAPD、AFLP、SSR等)称为第二代分子标记，单核苷酸多态性(SNP)标记称为第三代分子标记，这也是以PCR技术为基础的分子标记技术。
现分别介绍其原理及在植物育种上的应用。
1分子标记在植物育种上的特点分子标记育种(molecular mark-assist selection，MAS)是借助分子标记在DNA水平上对遗传资源或育种材料进行选择，对作物产量，品质和抗性等综合性状进行高效改良，并针对目标性状基困连锁进行优良植株筛选，是现代分子生物学与传统遗传育种相结合的新品种选育方法。
与传统育种相比分子标记的优势是：(1)传统育种通过性状间接筛选目的基因，分子标记则通过直接与目的基因连锁进行筛选，因此，后者比前者准确，特别是在一些表现型与基因型之间对应关系较差时的筛选，(2)传统育种需要在成熟期才能筛选，分子标记筛选则可以不受植物生长发育期的限制，在苗期就可以筛选，而且不影响植株生长，(3)传统方法一次只能标记一个基因，分子标记筛选则可以同时筛选多个目的性状基因，(4)分子标记筛选利用了控制单一性状的多个等位基因，避免了传统育种通过表现型而获得不纯植株的缺陷；(5)分子标记筛选样品用量少，可以进行非破坏性筛选，从而加速育种进程，提高育种效率。
2常用分子标记的技术及其在植物育种上的应用2.1限制性内切酶片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism，RFLP，简称限制片段长度多态性)RFLP是以分子杂交技术为基础的标记技术，其原理是碱基的突变、缺失、重排或是一段DNA的重排或插入，导致限制性内切核苷酸酶的酶切位点分布发生改变，得到的切割片段在数量和长度上不同，从而产生多态性。
SNP标记在玉米研究上的应用进展
SNP标记在玉米研究上的应用进展SNP（Single Nucleotide Polymorphism）即单核苷酸多态性，是指基因组中的单个核苷酸发生变异而造成的遗传多样性。
SNP标记在玉米研究上的应用已经取得了长足的进展。
SNP标记在玉米遗传多样性研究中的应用进展显著。
通过对玉米不同种质资源（如野生种和栽培种）及不同类型（如甜玉米和粮用玉米）的SNP分析，可以揭示不同种质资源之间的亲缘关系、遗传背景及遗传多样性水平。
这有助于玉米种质资源的收集、保存和利用，为玉米育种提供了丰富的遗传资源。
SNP标记在玉米疾病抗性研究中的应用也取得了显著进展。
疾病是玉米生产中的重大问题，通过SNP标记可以筛选出与疾病抗性相关的基因，进而培育出抗病性强的新品种。
通过SNP标记筛选出与赤霉病抗性相关的基因，为玉米赤霉病的防控提供了重要的理论基础。
SNP标记在玉米产量性状研究中的应用也有了重要进展。
玉米的产量性状是决定玉米产量的重要因素，通过SNP标记可以筛选出与产量相关的基因，并进行遗传背景分析。
通过SNP分析发现了与玉米籽粒产量相关的基因座，为玉米产量的提高提供了重要的遗传信息。
SNP标记在玉米杂种优势研究中也起到了重要作用。
玉米的杂种优势是指杂交后的后代相比于亲本表现出更好的性状，通过SNP标记可以对杂种优势进行遗传背景分析。
通过SNP标记分析发现了与玉米杂种优势相关的基因座，有助于我们更深入地理解杂交育种的遗传机制。
随着高通量测序技术的发展，SNP标记在玉米基因组学研究中的应用也取得了重要进展。
通过对玉米基因组中的SNP进行测序和分析，可以揭示玉米基因组的结构和功能，进一步了解基因在玉米形态和性状形成中的作用机制。
SNP标记在玉米研究上的应用进展深刻影响了玉米种质资源的收集和保存、疾病抗性育种、产量性状优化和杂种优势研究等方面。
随着技术的不断改进和研究的深入进行，相信SNP标记在玉米研究中的应用前景将更加广阔。
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湖南农 业科学 （ Ｈ Ｕ ＮＡ Ｎ Ａ ＧＲ Ｉ Ｃ ＵＬ Ｔ ＵＲ ＡＬ Ｓ Ｃ Ｉ Ｅ ＮＣ Ｅ Ｓ ）
Ｄ ＯＩ ： １ ０ ． １ ６ ４ ９ ８ ￣ ． ｃ ｎ ｋ ｉ ． ｈ ｎ ｎ ｙ ｋ ｘ ． ２ ０ １ ５ ． ０ ７ ． 上应用 的研 究进展
潘 妃 ，周 榕 ，丁 旭 ，王 治宇 ，秦 玉芝
（ 湖南农业大学 园艺园林 学院 ，湖南 长沙 ４ １ ０ １ ２ ８ ）
摘 要 ：介 绍了 Ｓ Ｎ Ｐ 标记 的概 念 、特点及开发情况 ，阐述 了 Ｓ Ｎ Ｐ 标记在 园艺作 物上应用的研究进展 。 目 前 ，在 园艺 作物上利用 Ｓ Ｎ Ｐ标记进行
的研究主要有开发 Ｃ Ａ Ｐ Ｓ 标记 、构建遗传图谱 、Ｓ Ｎ Ｐ 分型 、开发抗性相关的 Ｓ Ｎ Ｐ 标记等 。
关 键 词 ：Ｓ Ｎ Ｐ ；园艺作物 ；Ｃ Ａ Ｐ Ｓ ；遗传 图谱 ；基 因定位 ；综述
中 图分 类 号 ：Ｇ ６ ４ ２ ． ４ ４
文 献标 识 码 ：Ａ
文章编号 ：１ ０ ０ ６ ． ０ ６ ０ Ｘ （ ２ ０ １ ５ ｌ ０ ７ ． ０ １ ４ ０ ． ０ ４
Ａｂ ｓ ｔ ｒ ａ ｃ ｔ ：Ｓ ＮＰ（ Ｓ ｉ ｎ ｇ ｌ ｅ Ｎｕ ｃ ｌ ｅ ｏ ｔ ｉ ｄ ｅ Ｐ ｏ ｌ ｙ ｍｏ ｒ ｐ ｈ ｉ ｓ ｍ） ｍａ ｒ ｋ ｅ ｒ ｉ ｓ ａ ｋ ｅ ｙ ｒ ｅ ｓ ｅ ａ ｒ ｃ ｈ ｏ ｎ ｍｏ ｌ ｅ ｃ ｕ ｌ ａ ｒ ｍａ ｒ ｋ ｅ ｒ ｓ ｉ ｎ ｒ ｅ ｃ ｅ ｎ ｔ ｙ ｅ ｒＳ ａ ， ａ ｎ ｄ ｉ Ｓ ｗｉ ｄ ｅ ． ｄ ｉ ｓ ｔ ｒ ｉ ｂ ｕ ｔ ｉ ｏ ｎ ，
导 致 表 达 蛋 白 的 多 态 性 变 异 ，而 引 起 功 能 的 改 变 。 Ｈ ａ ｌ ｕ ｓ ｈ ｋ ａ 等［ ４ Ｊ 人 的研 究 表 明 ， Ｓ Ｎ Ｐ在 单 个 基 因或 者 整