基于医学MRI图像的脑部垂体瘤分割任务书_3

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基于特征提取的脑部MRI肿瘤自动分割

基于特征提取的脑部MRI肿瘤自动分割
efc v n s ftefau esl t n, da h e ea c u a yo 68 % o m e m e tt n. fe t e e so h e tr ee i i c o a c iv a c rc f9 .2 n n n t orsg n i u a o
1 概述
由于 具 有 非 损 伤性 和 较 高 的软 组 织 分 辨率 ,磁 共 振 ( g e c R snn e Ma nt eo a c,MR 图像 已成为诊 断脑部肿瘤 的重要 i ) 工具。在利 用磁共振 图像诊 断脑部肿瘤 时,医生必须对 图像
献[】 MR图像 中的前列腺肿瘤进行 自动检测 , 图像提取 4 对 对 特征之后 ,根据训练集 的知识和贝叶斯准则对 每个特征建立 幅肿瘤类的似然图, 然后利用 A ao s方法对各似然 图进 dB ot 行 加权组合得到最终 的似然 图,这实际上也是一 个特征选择 的过程 。 综上所述 ,用 A a ot dBo s 方法进行特征选择 和分类在 医学 图像处理方面 已经取得 了一定的成果 ,但 总的来说 应用 还不 多,在脑部 MR 肿瘤分割 中,还没有此类的方法 出现 。 I

中的肿 瘤进行 分割,从而 了解肿瘤 的位置和大小 ,以及其 附 近功能组织 的分布 。 阶段肿瘤分割仍然依靠 医生手工完成 , 现 这种 方法大量消耗医生的精力 和时间。同时,不 同医生或是 同一医生在不同时间所做 出的分割结果误差很大 ,可重复操 作性差。如 果能够利用计 算机对肿 瘤进行 自动分 割将 大大提 高医生的工作效率 ,并且可以提供 一个客观 的分割结果 。然 而遗憾的是 ,由于肿瘤 的形状、位置、灰度分布等的复杂多 变性 ,现在还没有一种分割方法能够满足临床应 用的要求。 现有肿瘤分割方法中大部分是基于 模式识 别的方法 ,将 分割问题 看作像素的分类问题 ,其成功的关键 是提取 有效 的 特征区分肿瘤类和各种正常组织。常用的特征有 灰度特征 和 纹理特 征等 。现 有的研究中存在 的主要 问题是在特征提取 的 同时缺乏对 特征 的选择 ,尤其是纹理特征 ,通常 维数 较高 ,

基于深度学习的MRI脑图像分割技术研究

基于深度学习的MRI脑图像分割技术研究

基于深度学习的MRI脑图像分割技术研究MRI脑图像分割技术是目前医学图像处理领域广泛研究的热点之一。

随着深度学习技术的发展,其在图像分割领域也展现出了强大的优势,取得了许多令人瞩目的成果。

本文将介绍基于深度学习的MRI脑图像分割技术研究。

一、MRI脑图像分割的背景和意义脑部MRI图像是一种非常重要的医学数据,对于诊断和治疗神经系统疾病有着非常重要的作用。

然而,脑部MRI图像由于其复杂性和多样性,通常包括大量的噪声、伪影和图像纹理等问题,这使得其在医学图像处理中的应用变得非常具有挑战性。

MRI脑图像分割是一种重要的处理手段,可以将MRI图像中的特定区域或组织分离出来,以便进行进一步的分析和处理。

例如,可以用来构建三维模型、进行虚拟手术模拟等等。

因此,MRI脑图像分割技术对于医学研究和临床实践有着非常重要的意义。

二、传统MRI脑图像分割方法的局限性传统的MRI脑图像分割方法主要依赖于图像处理技术,例如阈值分割、区域生长和边缘检测等。

这些方法大多数都需要手动预设参数,并且容易受到图像噪声、结构变化和异形等因素的影响,导致分割结果不太可靠。

此外,传统的MRI脑图像分割方法通常不能很好地处理图像中的复杂结构和多种组织类型,例如在MRI脑图像中,灰质、白质和脑脊液等组织的分割。

这些问题使得传统MRI脑图像分割方法的应用受到了很大的限制。

三、深度学习在MRI脑图像分割中的应用近年来,随着深度学习技术的快速发展,研究者开始利用深度学习方法来解决MRI脑图像分割问题,获得了非常显著的进展。

深度学习方法在MRI脑图像分割中的主要优点在于其能够自动学习图像的特征表达,避免了手动选择特征的繁琐过程。

例如,卷积神经网络(CNN)可以自动识别出图像中的不同类型的组织,在分割中扮演了极其重要的角色。

通过深度学习方法,研究者可以从大量标注好的数据集中得到更加准确和可靠的分割模型。

这使得深度学习方法在MRI脑图像分割中应用广泛,成为当前非常活跃的研究领域。

垂体瘤的MRI诊断与鉴别诊断课件

垂体瘤的MRI诊断与鉴别诊断课件

MRI诊断垂体瘤的过程
1
定位
通过定位扫描确定垂体的位置和病变所在。
2
扫描序列
使用不同序列进行扫描,如T1WI和T2WI,以获得更详细的图像信息。
3
图像重建
通过图像重建算法生成三维图像,以便医生进行更全面的分析和诊断。
MRI鉴别诊断垂体瘤的方法
1 增强扫描
对比剂增强扫描可以帮助医生区分垂体瘤与其他病变,如囊肿或炎症。
2 动态增强扫描
通过连续扫描观察垂体瘤的灌注情况,有助于鉴别垂体瘤的恶性程度。
3 磁共振波谱
通过检测肿瘤内的代谢物,帮助鉴别垂体瘤的类型和组织构成。
MRI诊断垂体瘤的结果解读
肿瘤性质
MRI图像可描绘出肿瘤的特点和性质,如大小、 形状、囊性与实性部分。
病灶定位
通过MRI可以准确定位垂体瘤的位置,便于手术 或放疗计划。
周围组织受累
MRI能够显示垂体瘤对周围结构的侵犯情况,帮 助评估治疗方案。
其他影像学检查
MRI在垂体瘤诊断中的优势与其他影像学检查方 法相比较,并提供更准确的定性和定量信息。
其他影像学检查与MRI的对比
X射线
X射线能显示骨骼结构,但对于 垂体瘤的诊断能力有限。
CT扫描
CT扫描能提供更高分辨率的图 像,但对于软组织分辨能力不 如MRI。
垂体瘤的MRI诊断与鉴别 诊断
MRI诊断垂体瘤是一种非常重要的手段,它能提供非常清晰的图像以帮助医生 准确分析和诊断肿瘤。
为什么需要进行MRI检查?
MRI检查是诊断垂体瘤的首选方法,其高分辨率图像能够显示垂体及其周围结 构细节,帮助医生评估肿瘤的性质和大小。
进行MRI检查前的准备工作
在进行MRI检查之前,您需要脱掉所有金属物品,并确保您没有心脏起搏器等 装置,以免对检查造成干扰。

基于深度学习的脑肿瘤MRI分割

基于深度学习的脑肿瘤MRI分割

基于深度进修的脑肿瘤MRI分割摘要:脑肿瘤是一种常见的脑部疾病,早期的识别和治疗对于患者的生存率和生活质量具有极大的影响。

脑肿瘤的识别主要通过 MRI 影像分析完成,然而对于大量复杂的信息的分析需要大量的人工介入,而标准化智能的脑肿瘤分割技术也并不完善。

为了提高脑肿瘤分割效率和准确率,本文将深度进修技术应用于 MRI 脑肿瘤分割。

在对 T1c 加权影像预处理后,利用深度进修的卷积神经网络 CNN 和全卷积神经网络(FCN)分别对 T1c 加权、T2 加权和 FLR 影像进行分割,最后融合多个网络的猜测结果得到最终脑肿瘤的分割结果。

试验结果表明,本文提出的方法能够有效地分割出脑肿瘤区域,较传统的方法具有更高的准确性和有效性。

关键词:深度进修;MRI;脑肿瘤;分割;卷积神经网络;全卷积神经网络;猜测结果融合1、介绍脑肿瘤是指在脑内形成的一种病变,其恶性程度及治疗方式有着明显的差异。

MRI 影像一般被用来帮助诊断和治疗。

然而,医学影像存在许多问题,如结构多样性、组织相似性和图像噪声等,使得MRI脑肿瘤的准确分割成为了一项复杂的任务。

因此,利用深度进修进行MRI脑肿瘤分割可以有效地提高分割准确性和处理效率。

2、方法本文接受了卷积神经网络(CNN)和全卷积神经网络(FCN)两种深度进修模型进行MRI脑肿瘤分割。

起首,对T1c加权影像进行预处理,对图像进行裁剪和正规化。

然后,CNN模型分别对T1c加权、T2加权和FLR影像进行分割,得到三个逐像素的分割概率图。

最后,将三个分割概率图通过加权平均算法融合得到最终分割结果。

3、试验设计本试验接受了MICC BRAin Tumor Segmentation(BraTS)数据集,包含来自多个医院的MRI图像数据。

数百个带注释的MRI数据集被分成三部分,其中两个数据集用于训练,一个数据集用于测试。

4、结果在本文的试验中,接受MICC BRAin Tumor Segmentation数据集进行训练和测试,结果表明本文的方法能够高效地进行MRI 脑肿瘤分割。

MRI图像上的脑肿瘤分割与定位方法研究

MRI图像上的脑肿瘤分割与定位方法研究

MRI图像上的脑肿瘤分割与定位方法研究MRI图像上的脑肿瘤分割与定位方法研究摘要:脑肿瘤分割与定位是医学图像处理领域的一个关键问题,准确的脑肿瘤分割与定位有助于医生进行诊断和治疗 planning. 在过去几十年中,很多的方法已经被提出来处理这个问题。

本文综述了MRI 图像上的脑肿瘤分割与定位方法,并对这些方法进行了比较与分析。

关键词:脑肿瘤分割,MRI图像,医学图像处理,定位方法1. 引言脑肿瘤是一种常见的并且危险的疾病,在临床上的早期诊断和治疗中起着重要的作用。

脑肿瘤分割和定位方法可以准确地确定肿瘤的位置和区域,并对肿瘤的形状和大小进行测量。

这为医生提供了重要的信息,以在治疗过程中做出正确的决策。

MRI图像是脑肿瘤分割和定位的常用工具。

MRI图像提供了丰富的解剖信息,包括肿瘤的位置、形状和分布。

然而,由于图像中的灰度分布复杂,噪声和影像伪影的存在,脑肿瘤分割和定位是一个具有挑战性的问题。

2. 相关工作在过去的几十年中,许多方法已经被提出来处理MRI图像上的脑肿瘤分割和定位问题。

这些方法可以分为传统方法和深度学习方法。

2.1 传统方法传统方法主要基于图像处理技术和数学模型来实现脑肿瘤的分割和定位。

这些方法包括阈值分割、区域生长、区域分裂合并等。

阈值分割方法通过选择一个合适的阈值来分割图像中的肿瘤区域。

区域生长方法根据像素的相似性来自动地识别并扩展肿瘤区域。

区域分裂合并方法通过分裂和合并区域来得到更准确的肿瘤分割结果。

然而,传统的方法通常没有考虑到图像中的上下文信息和复杂的灰度分布,导致分割结果不准确。

2.2 深度学习方法近年来,深度学习方法在医学图像处理领域取得了巨大的成功。

深度学习方法通过构建深度神经网络来学习图像特征和模式,并实现脑肿瘤分割和定位。

常用的深度学习方法包括卷积神经网络(CNN)、循环神经网络(RNN)和生成对抗网络(GAN)等。

CNN是一种特别适用于图像处理的深度学习方法。

CNN可以自动地学习图像的复杂特征,并实现高准确度的分割和定位。

基于图割的MRI脑部图像肿瘤提取方法

基于图割的MRI脑部图像肿瘤提取方法

中 图分类号:T 311 P9. 4
基 于 图割 的 MR I脑 部 图像 肿 瘤 提 取 方法
蒋世忠 ,易法令 ‘ ,汤浪平 ,涂泳秋
( 广东药学院信息 j 1 : 程学院 ,广州 5 0 0 ;2 华南理工大学计算机科学与工程学院 ,广州 5 0 4 ) 10 6 . 16 1
摘 要 :针 对当前 医学 图像特征提取 仗从局部特征 出发的问题 ,提 出一 种基于 图割的脑 部肿 瘤提取 方法 为兜服 图割仅适用于较少像素的
o d r t ) e c mc t e d f c st tg a h c t so l re t d t ma li g n a i e d t m a l u — e . l se i g i a p i d t m a e t r e O(、 F o h e e t ha r p — u si n y o i n e o s l ma e a d e s l la o a s l c ts t a c u t rn s p l o i g o y e i p o e t e a c r c n p e ff a u e e ta to n h n b i h mo y— u ste fi g . u g a h of l se i g i a e c n b o y m r v i c u a y a d s e d o e t r x r c i n a d t e u l t e Go r Hu c t r e o l d ma e S b r p u t rn m g a e g t c b
r l ov h dg so en mg t e e e fGo mo y Hu c t r c f rt e v l e o C t.a d t e s b— a e c n b b a n d a trt e s b r ph i ma p d t rg n l ma e r — u s t b a u f U S n h u i g a e o t i e fe i u g a s e h m l p e o o i i a i g . Th s me h d i a l d t u i t o s pp i o t mor x r c i n o RI e e r l ma e e ta t fM e o r ba c i g Ex e i e t l e u t h wst a e me h d c l p e ie y e ta tt mo fc r b a p rm n a s l s o h t h t o a l r c s l x r c u r t ro e e r l

基于图的脑组织磁共振图像分割方法

基于图的脑组织磁共振图像分割方法

中图分 类号 :T314 P9.1
文献 标 志码 :A 文 章编 号 : 59 67 21)0 —03 0 02 — 59(00 2 05 —7
G r p Ba e e a c c l Cl s e i e h d f r a h- s d Hi r r hi a u t rng M t o o A u o a i a n M R m a e S g e t to t m tc Br i I g e m n ain
Z NG Jn d n , HA ig a
( . e a m n fM te a c ,S nY t e nvri ,G agh u5 0 7 , hn ; 1 D pr et ah m t s u a— nU iesy un zo 2 5 C ia t o i s t 1
第4 9卷
21 0 0年
第 2期
3月
中山大学 学报 ( 自然科 学版 )
A T S I N I R M N T R LU U I E ST TS S N A S N CA CE TA U A U A I M N V R IA I U Y T E I
Vo. 9 No 2 14 . Ma. 2 0 r 01
p e e td. F rty,t t n a d g a h- s d meh d i p le o p o uc o r e s g n ain o r i rs ne isl he sa d r r p ba e t o s a p i d t r d e a c a s e me tto fb a n MR ma e Ho v r,t e s g n a in r s l o h r p b s d me h d i v r s g n ai n be a e o i g. we e h e me t t e u t ft e g a h— a e t o s o e — e me tto c us f o t e c mp ia e tucu e o r i h o lc td sr t r fb an.S o,we a p y a da tv u c in t o to h a u fp r me e p l n a p i e f n t o c n r lt e v l e o a a trk o i h r p - a e t o n t e g a h b s d meh d,wh c ne rt s t e i fr t n fo t ih- e u n y s b n s o u l ih i tg ae h n o mai m he h g f q e c ub a d f d a - o r r te o lx wa e e r n f r r e c mp e v ltta so m. T n,t e h e a c i a l t rn t d i s d t r e t e o e -e - he h ir r h c lcuse g meho s u e o me g h v rs g i me t d r g o n t e s g n ai n r s l. Th t o s v ld t d b xe sv x e i n s u i e l n e e insi h e me tto e u t e me h d i a i ae y e tn ie e p rme t sng r a T1 weg td MR ma e 一 ih e i g s,a o a e t he sae o -h — r lo t ms nd c mp r d wih t tt — fte a ta g r h . i Ke r s: g a — a e t o y wo d r ph b s d me h d;du lte o a —r e c mplx wa ee r n f r ;i g e me tto e v l tta so m ma e s g n ai n;b an MR ri

基于多模态磁共振的脑肿瘤图像分割方法[发明专利]

基于多模态磁共振的脑肿瘤图像分割方法[发明专利]

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201710812864.7(22)申请日 2017.09.11(71)申请人 南京理工大学地址 210094 江苏省南京市孝陵卫200号(72)发明人 纪则轩 (74)专利代理机构 南京理工大学专利中心32203代理人 王玮(51)Int.Cl.G06T 7/11(2017.01)G06T 7/162(2017.01)G06K 9/62(2006.01)(54)发明名称基于多模态磁共振的脑肿瘤图像分割方法(57)摘要本发明公开了一种基于多模态磁共振的脑肿瘤图像分割方法,根据磁共振成像(Magneticresonance imaging ,MRI)本身的特性,通过简单结合不同模态的MRI实现脑肿瘤分割。

首先,使用水平集方法在FLAIR模态上检测出整个异常区域也就是肿瘤区域包括肿瘤和水肿;然后将该区域映射在T1ce模态上,进而使用k均值算法将水肿和肿瘤组织分割开来。

相比于传统的脑肿瘤分割方法,本发明中的方法容易实现并且具有较高的分割精度。

权利要求书1页 说明书5页 附图3页CN 107705308 A 2018.02.16C N 107705308A1.一种基于多模态磁共振的脑肿瘤图像分割方法,其特征在于具体步骤如下:步骤一,输入肿瘤患者的不同模态的磁共振图像,包括T1ce和FLAIR;步骤二,对输入的T1ce和FLAIR图像进行直方图归一化处理,调整图像的灰度分布;步骤三,在FLAIR模态上,采用水平集算法提取肿瘤区域;步骤四,将FLAIR模态中得到的肿瘤区域映射到T1ce图像上,然后使用k均值算法对T1ce上影射后的肿瘤区域进行分割,其中K=2,即将图像分割为肿瘤核与水肿两部分。

2.根据权利要求1所述的基于磁共振脑肿瘤图像分割方法,其特征在于:步骤三所述提取肿瘤区域的具体方法如下:设Ω→R 2是图像域,I:Ω→R 2是一个指定的图像灰度,对于给定的图像I(x ,y),C是图像域Ω上的一个闭合曲线,将图像分为外部区域Ω1和内部区域Ω2;使用RSF模型作为能量函数,通过图像灰度变化区分目标和背景:E x (C ,f 1,f 2)=λ1∫outside(C)K σ(x-y)|I(y)-f 1(x)|2dx +λ2∫inside(C)K σ(x-y)|I(y)-f 2(x)|2dx 其中,λ1和λ2是常量;outside(C)和inside(C)分别表示轮廓线C的外部和内部区域;f 1(x)和f 2(x)分别近似轮廓线外部和内部区域的灰度平均值;使用如下的高斯函数来引导曲线的运动其中σ是标量常数。

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本科生毕业设计(论文)任务书
基于医学MRI图像的脑部垂体瘤分割题目名称
学院
专业班级
姓名
学号
指导老师
一、毕业设计(论文)的内容与要求
(课题内容应明确、详细,难度适中、工作量饱满;强调通过文献研究,找出多个解决方案并进行多方案对比;强调解决复杂工程问题;强调对现代工具的使用及局限性分析,强调对实验结果分析等;明确应用工程管理原理和经济决策方法,分析和评价解决方案对社会、健康、安全、法律以及文化的影响)脑肿瘤是威胁人类生命安全的常见肿瘤之一,据统计资料表明,中国已是脑肿瘤发病人数和死亡人数的世界第一。

垂体瘤是一组从垂体前叶和后叶及颅咽管上皮残余细胞发生的肿瘤,临床上有明显症状者约占颅内肿瘤的10%,通常发生于青壮年时期,常常会影响患者的生长发育、生育功能、学习和工作能力,是人类常见的重大疾病之一,其高发率和致死率不得不引起人们的重视,而对脑部肿瘤病灶区域的分割对医生的精确诊断和精准治疗都至关重要。

然而,由于脑部组织结构复杂以及医学成像设备的干扰,常常会出现噪声、边缘不明显等问题,因此,如何准确地对病灶区域进行分割依旧是一个难点和挑战,如何提高分割的精度已成为热门的话题。

图像分割的目标是将一幅图像分成一组语义上有意义的、同质的、不重叠的区域,这些区域具有相似的属性,如强度、深度、颜色或纹理。

分割结果要么是识别每个均匀区域的标签图像,要么是一组描述区域边界的轮廓线。

MRI(Magnetic Resonance Imaging),也就是磁共振成像,是断层成像的一种,是利用磁共振现象从人体中获得电磁信号,并重建出人体信息。

MRI不会产生辐射,可以得到任何方向的断层图像,且其采集参数可以调整,以给出不同组织和不同类型神经病理学的不同灰度,与计算机断层扫描(CT)相比,MRI图像具有更好的对比度。

因此,脑部医学图像分割的研究大多采用MRI图像,是
高对比度大脑图像的常用方法。

本课题设计旨在实现医学MR I图像的脑部垂体瘤分割。

具体任务为:(1)完成基于Visual Studio平台的opencv、ITK库、VTK库的环境配置,基于C++语言实现对医学二维MR图像进行简单的读取、处理、显示和保存操作
(2)利用ITK库对MRI脑部垂体瘤图像进行分割预处理。

可采用常规的阈值、区域生长、滤波降噪、图像增强、形态学处理等方法,实现二维图像的一个预处理。

(3)利用ITK库中常用的图像分割方法(如区域生长、分水岭、水平集等)实现垂体瘤的二维及三维分割(三维指对整个MR系列进行的分割,可在处理前将二维MR系列生成三维mha或nii三维文件格式作为输入),分割结果以二维或三维二值图像输出
提高部分:
(1)找到一种合适的分割方法(或多种方法混合)使分割结果肉眼对比基本正确,且能够拥有明显的垂体瘤边界线
(2)能够通过VTK构建一个可视化界面平台,对垂体瘤三维分割过程进行输入三维读取与输出三维显示
二、毕业设计(论文)应完成的工作
(文献研究,方案比较,解决方案对社会等其他领域的影响分析,深入原理,现代工具使用及局限,方案实施,结果分析,本课题工程经济、管理、伦理方面的考虑。


(1)文献研究:
调研国内外关于基于医学MR I图像的脑部垂体瘤分割相关文献,了解相关领域专家学者对脑部垂体瘤分割实现的最新研究成果。

(2)方案比较分析:
目前,可以用于医学MR I图像的脑部垂体瘤分割的方案主要有Matlab、和基于Visual Studio的ITK平台
(3)解决方案对社会等其他领域的影响分析:
近年来,肿瘤的高发病率和高死亡率对人类健康构成了巨大威胁,据统计,临床患者中非侵入型病变的患者预期寿命为几年,而侵入型病变的患者的预期寿命则不超过两年。

有数据表明,如果肿瘤在早期被检测到,并进行合理治疗,患者生存的可能性将会大大提高。

因此,及时精确地检测出肿瘤对肿瘤疾病的治疗
至关重要,目前,计算机辅助诊断系统(CAD)在临床医学领域发挥了重要作用,有效地帮助医生诊断身体疾病和异常,其中包括脑部肿瘤疾病。

在分析肿瘤图像时,通常使用图像处理方法来确定肿瘤的位置、大小和类型,然而,对于脑部病变区域的分割正是其中重要的一环。

(4)深入原理:
暂无。

(5)现代使用工具及局限:
本设计推荐使用Visual Studio的ITK、VTK工具,ITK包含大多传统的分割算法,VTK包含了二维和三维可视化的结构搭建,都拥有封装好的算法接口可以调用,操作相对方便。

Matlab工具也可以完成本课题,且相比会简单很多。

或者基于python的一些工具包,这个如果想通过比较前言的基于深度学习或神经网络的方法进行分割会比较方便,但这些方法都需要拥有大量的数据作为输入来进行模型训练,且对电脑配置要求比较高。

VS是Microsoft Visual Studio的简称。

VS是美国微软公司的开发工具包系列产品,是一个基本完整的开发工具集,它包括了整个软件生命周期中所需要的大部分工具,如UML工具、代码管控工具、集成开发环境(IDE)等等。

所写的目标代码适用于微软支持的所有平台,包括Microsoft Windows、Windows Mobile、Windows CE、.NET Framework、.NET Compact Framework和Microsoft Silverlight及Windows Phone。

Visual Studio是目前最流行的Windows 平台应用程序的集成开发环境。

最新版本为Visual Studio 2019版本,基于.NET Framework 4.7。

(6)方案实施:
暂无。

(7)结果分析:
暂无。

(8)课题工程经济、管理、伦理方面考虑:
三、毕业设计(论文)进程安排
四、应收集的资料及主要参考文献
任务书起始日期:2019-01-10 指导教师签名:
任务预计完成期:2019-05-30 专业负责人签章:
主管教学院长签章:
参考文献:
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