CMA在产前诊断中的应用

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泌尿系统畸形胎儿染色体核型及CMA产前诊断

泌尿系统畸形胎儿染色体核型及CMA产前诊断

·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2017年第9卷第2期泌尿系统畸形胎儿染色体核型及CMA产前诊断商梅娇1 周 2(1.厦门大学附属第一医院产科,福建厦门 361003;2.中山大学附属第一医院妇产科胎儿中心,广东广州 510080)【摘要】 目的 探讨常规G显带染色体核型分析及染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrayanaly sis,CMA)技术在先天性泌尿系统畸形胎儿产前诊断中的应用价值及发病相关性,探讨泌尿系统畸形可能的致病机制。

方法 回顾性研究134例产前超声检查发现胎儿泌尿系统畸形并行常规G显带染色体核型分析的病例,其中30例按照AffymetrixCytoScanHD芯片平台的操作手册对胎儿及部分父母的DNA进行消化、连接、PCR、片段化、标记、杂交、洗染并全基因组扫描,采用配套的CHAS软件进行结果分析。

结果 ①134例泌尿系统畸形病例,128例胎儿染色体正常;2例异常,分别为46,XY,del(21)(qter p11:)和46,XY,der(22)t(Y,22)(q11;q13.3),4例染色体多态性,染色体异常率为1.50%(2/134)。

②30例CMA结果均成功获得分析,19例结果正常,检出11例CNVs,CNVs检出率为36.7%(11/30);30例行CMA检测病例仅1例常规染色体核型分析异常(CMA亦检出病理性CNVs),余29例均正常,泌尿系统畸形但染色体核型正常胎儿CNVs检出率为34.5%(10/29)。

③11例CNVs,20%(6/30)考虑为良性CNVs,16.7%(5/30)为病理性CNVs。

6例良性CNVs胎儿,其中5例行父母亲外周血CMA检测,发现均为来源父系或母系的遗传。

5例病理性CNVs胎儿,有3例行父母外周血CMA检测,发现均为新发CNVs。

29例泌尿系统畸形但染色体核型正常胎儿的病理性CNVs检出率为13.8%(4/29)。

2014年染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识

2014年染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识

染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用协作组目前,G 显带染色体核型分析技术仍然是细胞遗传学产前诊断的“金标准”,但该技术具有细胞培养耗时长、分辨率低以及耗费人力的局限性。

包括荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH) 技术在内的快速产前诊断技术的引入虽然具有快速及特异性高的优点,但还不能做到对染色体组的全局分析。

染色体微阵列分析(chromosomal mlcroarray analysis,CMA) 技术又被称为“分子核型分析”,能够在全基因组水平进行扫描,可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copy number variant,CNV),尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排具有突出优势。

根据芯片设计与检测原理的不同,CMA 技术可分为两大类:基于微阵列的比较基因组杂交(array- based comparative genomic hybridization ,aCGH) 技术和单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array) 技术。

前者需要将待测样本DNA 与正常对照样本DNA 分别标记、进行竞争性杂交后获得定量的拷贝数检测结果,而后者则只需将待测样本DNA 与一整套正常基因组对照资料进行对比即可获得诊断结果。

通过aCGH 技术能够很好地检出CNV,而SNP array 除了能够检出CNV 外,还能够检测出大多数的单亲二倍体(uniparental disomy,UPD) 和三倍体,并且可以检测到一定水平的嵌合体。

而设计涵盖CNV+SNP 检测探针的芯片,可同时具有CNV 和SNP 芯片的特点。

2010 年,国际细胞基因组芯片标准协作组(lntemational Standards for Cytogenomic Arrays Consortium,ISCA Consortium) 在研究了21698 例具有异常临床表征,包括智力低下、发育迟缓、多种体征畸形以及自闭症的先证者的基础上,发现aCGH 技术对致病性CNV 的检出率为 12.2%,比传统G 显带核型分析技术的检出率提高了10%。

潍坊地区染色体核型分析和CMA技术在预防出生缺陷中的应用研究

潍坊地区染色体核型分析和CMA技术在预防出生缺陷中的应用研究

中外医疗China &Foreign Medical TreatmentDOI:10.16662/ki.1674-0742.2021.25.036潍坊地区染色体核型分析和CMA 技术在预防出生缺陷中的应用研究吉龙龙1,郑国华1,于淼2,孙明强1,翟玉涵11.潍坊市妇幼保健院检验科,山东潍坊261011;2.潍坊市妇幼保健院审计科,山东潍坊261011[摘要]目的探讨潍坊地区染色体核型分析和微阵列分析(CMA)技术在预防出生缺陷中的应用价值。

方法方便选取2019年1—12月于该院进行产前诊断的92例孕妇作为研究对象,均自愿接受染色体核型分析和CMA 检测,对其两种方法的检查结果及临床资料进行对比分析。

结果92例孕妇的染色体核型分析和CMA 检测的异常率分别为9.78%和10.87%,两种检测方法的染色体异常检出率比较,差异无统计学意义(χ2=0.059,P>0.05),且CMA 和核型分析结果相符率为90.22%。

CMA 可敏感地检出染色体的微缺失和微重复,染色体核型分析可更好地检出染色体倒位和嵌合。

结论染色体核型分析和CMA 技术均可敏感地检出胎儿染色体异常,CMA 对染色体微重复和微缺失的检出敏感性更高,核型分析在检出易位、倒位等方面更具优势,临床上产前诊断医师可将二者结合应用于产前诊断中以提高染色体异常的检出率,减少出生缺陷的发生。

[关键词]染色体核型分析;微阵列分析技术;出生缺陷;染色体异常[中图分类号]R714[文献标识码]A[文章编号]1674-0742(2021)09(a)-0036-04Application of Chromosome Karyotype Analysis and CMA Technology inPrevention of Birth Defects in Weifang AreaJI Longlong 1,ZHENG Guohua 1,YU Miao 2,SUN Mingqiang 1,ZHAI Yuhan 11.Department of Laboratory Medicine,Weifang Maternal and Child Health Hospital,Weifang,Shandong Province,261011China;2.Auditing Department,Weifang Maternal and Child Health Hospital,Weifang,Shandong Province,261011China [Abstract]Objective To explore the application value of chromosome karyotype analysis and microarray analysis (CMA)technology in the prevention of birth defects in Weifang.Methods Conveniently selected 92pregnant women who underwentprenatal diagnosis in the hospital from January to December 2019as the research subjects.All of them voluntarily accepted chromosome karyotype analysis and CMA testing,and compared the results of the two methods and clinical data.Results The abnormal rates of chromosome karyotype analysis and CMA detection of 92pregnant women were 9.78%and 10.87%,respectively.There was no statistically significant difference in the detection rates of chromosome abnormalities between the two detection methods (χ2=0.059,P>0.05),and the coincidence rate of CMA and karyotype analysis results was 90.22%.CMA can sensitively detect chromosome microdeletion and microduplication,and chromosome karyotype analysis can better detect chromosome inversion and mosaicism.Conclusion Both chromosome karyotype analysis and CMA technology can detect fetal chromosomal abnormalities sensitively.CMA is more sensitive to the detection of chromosome microrepetition and microdeletion,and karyotype analysis has more advantages in detecting translocation and inversion.Clinical prenatal diagnostics can combine the two to improve the detection rate of chromosomal abnormalities and reduce the occurrence of birth defects.[Key words]Chromosome karyotype analysis;Microarray analysis technique;Birth defects;Chromosomal abnormalities [基金项目]潍坊市卫生健康委员会科研项目计划(wfwsjk_2019_071)。

核型分析联合染色体微阵列分析在胎儿超声异常中的应用

核型分析联合染色体微阵列分析在胎儿超声异常中的应用

《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第2期·论著· 核型分析联合染色体微阵列分析在胎儿超声异常中的应用刘建珍 林铿 许碧秋 陈鸿桢 (广州市花都区妇幼保健院,广东广州,510800)【摘要】 目的 探讨核型分析联合染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrays,CMA)技术在胎儿超声异常的应用价值。

方法 分析2020年1月至2022年6月就诊于广州市花都区妇幼保健院的220例胎儿超声异常病例的核型分析和CMA结果,按超声情况分为单发结构异常、多发结构异常、结构异常合并软指标异常、单项软指标异常、多项软指标异常共五组,分析各组染色体异常情况。

结果 核型分析、CMA在胎儿超声异常病例的染色体异常检出率分别为8.18%(18/220)、11.36%(25/220),两种技术对于胎儿染色体异常的检出率差异无统计学意义(χ2=1.26,犘=0.26)。

核型分析较CMA额外检出2例平衡易位,CMA较核型分析额外检出6例拷贝数变异(CNVs)和3例纯合区域(ROH)。

单发结构异常、多发结构异常、结构异常合并软指标异常、单项软指标异常、多项软指标异常的染色体异常检出率分别为11.11%(4/36)、25.00%(2/8)、16.67(2/12)、10.26%(16/156)、50.00%(4/8)。

多发结构异常的胎儿染色体异常率高于单发结构异常,多项软指标异常胎儿染色体异常率显著高于单项软指标异常,差异有统计学意义(χ2=11.23,犘=0.00)。

结论 胎儿超声异常与染色体异常的关系密切,多项超声异常的胎儿染色体异常风险增加。

核型分析能有效检出染色体平衡易位,CMA对CNVs和ROH检测效能高,两者联合能提高胎儿超声异常的染色体异常检出率,明确致病片段来源及性质,并使异常结果得到验证。

【关键词】 胎儿超声异常;核型分析;染色体微阵列分析【中图分类号】 R714.55 【文献标识码】 A犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2023.02.005 通信作者:陈鸿桢,Email:527538053@qq.com犃狆狆犾犻犮犪狋犻狅狀狅犳犽犪狉狔狅狋狔狆犻犮犮狅犿犫犻狀犲犱犮犺狉狅犿狅狊狅犿犪犾犿犻犮狉狅犪狉狉犪狔狊犻狀犳犲狋犪犾狌犾狋狉犪狊狅狌狀犱犪犫狀狅狉犿犪犾犻狋犻犲狊犔犻狌犑犻犪狀狕犺犲狀,犔犻狀犓犲狀犵,犡狌犅犻狇犻狌,犆犺犲狀犎狅狀犵狕犺犲狀 (犎狌犪犱狌犕犪狋犲狉狀犻狋狔犪狀犱犆犺犻犾犱犎犲犪犾狋犺犮犪狉犲犎狅狊狆犻狋犪犾,犌狌犪狀犵狕犺狅狌犌狌犪狀犵犱狅狀犵,510800,犆犺犻狀犪)【犃犫狊狋狉犪犮狋】 犗犫犼犲犮狋犻狏犲 Toexploretheapplicationofkaryotypiccombinedchromosomalmicroarrays(CMA)infetalultrasoundabnormalities.犕犲狋犺狅犱狊 AnalyzedthekaryotypingandCMAresultsof220fetalultrasoundabnormalitiesvisitedinourhospitalfromJanuary2020toJune2022,andtheultrasoundconditionsweredividedintofivegroups:singlestructuralabnormalities,multiplestructuralabnormalities,structuralabnormalitiescombinedwithsoftindexabnormalities,singlesoftindexabnormalities,andmultiplesoftindexabnormalities,andthedetectionofchromosomalabnormalitiesineachgroupwasanalyzed.犚犲狊狌犾狋狊 ThedetectionratesofchromosomalabnormalitiesinultrasoundfetalabnormalitiesbykaryotypeanalysisandCMAwere8.18%(18/220)and11.36%(25/220),respectively,andtherewasnosignificantdifferenceinthedetectionrateofchromosomalabnormalitiesbetweenthetwotechniques(χ2=1.26,犘=0.26).Karyotypeanalysisdetected2additionalcasesofequilibriumtranslocation,6additionalcasesofcopynumbervariation(CNVs)and3additionalcasesofhomozygousregion(ROH)comparedwithCMAanalysis.Thedetectionratesofchromosomalabnormalitiesofsinglestructural32Copyright ©博看网. All Rights Reserved.·论著·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2023年第15卷第2期abnormalities,multiplestructuralabnormalities,structuralabnormalitiescombinedwithsoftindexabnormalities,singlesoftindexabnormalities,andmultiplesoftindexabnormalitieswere11.11%(4/36),25.00%(2/8),16.67(2/12),10.26%(16/156)and50.00%(4/8),respectively.Thefetalchromosomalabnormalityrateofmultiplestructuralabnormalitieswashigherthanthatofsinglestructuralabnormalities,andthefetalchromosomalabnormalitiesofmultiplesoftindexabnormalitiesweresignificantlyhigherthanthatofsinglesoftindexabnormalities,andthedifferencewasstatisticallysignificant(χ2=11.23,犘=0.00).犆狅狀犮犾狌狊犻狅狀 Fetalultrasoundabnormalitiesarecloselyrelatedtochromosomalabnormalities,andtheriskoffetalchromosomalabnormalitiesincreaseswithmultipleultrasoundabnormalities.Karyotypeanalysiscaneffectivelydetectthebalancedtranslocationofchromosomes,andCMAhashighefficiencyinthedetectionofCNVsandROH.Thecombinationofthetwocanimprovethedetectionrateofchromosomalabnormalitiesinfetalultrasoundabnormalities,identifythesourceandnatureofpathogenicfragments,andvalidatetheabnormalresults.【犓犲狔狑狅狉犱狊】 Fetalultrasoundabnormalities;Karyotypeanalysis;Chromosomemicroarrayanalysis 超声异常包括结构异常和软指标异常,胎儿超声异常与染色体异常密切相关[1]。

羊水原位培养法联合染色体微阵列分析在产前诊断中的应用

羊水原位培养法联合染色体微阵列分析在产前诊断中的应用

羊水原位培养法联合染色体微阵列分析在产前诊断中的应用向文秀;钱罡【期刊名称】《临床检验杂志》【年(卷),期】2024(42)2【摘要】目的评估羊水原位培养法联合染色体微阵列分析(CMA)技术在产前诊断检出胎儿染色体异常中的应用价值。

方法回顾性分析2018年10月至2023年2月于怀化市妇幼保健院因不同产前诊断指征而行羊水穿刺术的3133例孕妇,比较羊.水原位培养法和CMA法在胎儿染色体异常方面的检出率和差异。

结果在3133例样本中,双指征组的异常检出率均较单指征组分别增加0.95%(羊水原位培养法)和2.36%(CMA);两种技术联合检测共检出796例异常(检出率25.41%),其中羊水原位培养法检出300例(9.58%),CMA法检出706例(22.53%)。

两者均能检出145例非整倍体异常和31例染色体结构异常,但CMA另增加检出169例提示致病或可能致病的染色体拷贝数变异(CNV)、杂合性缺失(L0H)、杂合性不存在(A0H)/纯合区域(ROH)及单亲体二倍体异常(UPD),而羊水原位培养法增加检出11例染色体结构异常。

两者联合检出嵌合体23例(0.73%)。

结论羊水原位培养法与CMA技术互为补充,联合应用可显著提高胎儿染色体异常的检出率,可为产前遗传咨.询提供更详细准确的信息,有助于孕妇决策是否终止妊娠。

【总页数】5页(P85-89)【作者】向文秀;钱罡【作者单位】怀化市妇幼保健院遗传科;浙江博圣生物技术股份有限公司【正文语种】中文【中图分类】R466【相关文献】1.荧光原位杂交与染色体微阵列分析技术在胎儿标记染色体产前诊断中的应用2.染色体微阵列分析技术在759例不同产前诊断指征孕妇羊水中的临床应用分析3.染色体核型分析联合染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用价值4.比较羊水细胞原位培养法和胰酶消化法在产前诊断染色体检查中的应用价值因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

应用CMA产前诊断10q23缺失综合征1例

应用CMA产前诊断10q23缺失综合征1例

·病例报道·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2018年第10卷第3期应用CMA产前诊断10q23缺失综合征1例罗晓辉1 杜娜2 胡蓉1 卢建1 李怡1 黄伟伟1(1.广东省妇幼保健院医学遗传中心,广东广州 510080;2.广东省妇幼保健院新生儿科,广东广州 510080)【中图分类号】 R714.55 【文献标识码】 B犇犗犐:10.13470/j.cnki.cjpd.2018.03.012 通讯作者:黄伟伟,E mail:254129529@qq.com 10q23缺失综合征(chromosome10q23deletionsyndrome)是一种罕见的染色体微缺失综合征,缺失区域包含犅犕犘犚1犃、犖犌犚3、犌犚犐犇1等致病基因。

10q23缺失综合征表型复杂多样,表型可为发育迟缓、语言发育迟缓,特殊面容(眼距宽、低位耳等),有少许患者可见心脏、手脚等先天畸形[1]。

染色体异常是导致新生儿出生缺陷的关键因素。

10q23微缺失综合征的产前诊断目前报道较少,本文对1例10q23缺失综合征的病例进行产前诊断及遗传学分析,现将该病例报道如下。

1 资料与方法1.1 一般资料 孕妇,32岁,G4P1A2,因“停经17+周,超声发现胎儿NT增厚(3.3mm)”来本科室就诊,孕妇孕期顺利,无特殊不适。

无抽烟、嗜酒史,无胎儿畸形家族史,2018年1月3日孕妇超声提示:宫内妊娠,单活胎,胎儿NT增厚。

1.2 方法 1.2.1 标本采集 该孕妇接受检测前的遗传咨询并签署同意书,根据孕周行羊膜腔穿刺,在B超探头引导下行羊膜腔穿刺术抽取羊水30ml进行培养以及染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrayanalysis,CMA)。

1.2.2 CMA检测 采用美国Affymetric公司提供的高分辨全基因组CytoScan750K芯片,实验操作严格按照Affymetric公司提供的操作流程。

染色体微阵列分析技术在胎儿遗传病诊断中的应用

·综述·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2016年第8卷第3期染色体微阵列分析技术在胎儿遗传病诊断中的应用顾莹1 黄欢2 孙丽洲2(1.连云港市妇幼保健院生殖遗传科,江苏连云港 222006;2.江苏省妇幼保健院产科,江苏南京 210036)【摘要】 染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrayanalysis,CMA)技术是一种通过对染色体进行全基因组扫描,发现染色体组的数目和结构异常的检测技术。

CMA以其高分辨率、高效率、高自动化操作等优点,不仅能有效检测传统核型分析技术所能检测的染色体数目异常及非平衡性结构异常,还能检测染色体组亚显微结构水平上不平衡重排引起的拷贝数变异(copynumbervariation,CNV),成为现代临床遗传学常规诊断工具,并被引入到产前胎儿遗传疾病检测中。

本文将就产前胎儿遗传病、胎儿遗传病检测的技术回顾、CMA技术的发展及在胎儿遗传病检测中的应用、优势和面临的挑战等做一个详细的综述。

【关键词】 染色体微阵列分析;产前诊断;遗传病;遗传咨询【中图分类号】 R714.53 【文献标识码】 A犱狅犻:10.13470/j.cnki.cjpd.2016.03.011 遗传病指人体遗传物质(包括细胞核DNA和核外线粒体DNA)发生变异或可遗传性修饰而导致的疾病,可由亲代遗传给子代,故称遗传病。

在产前胎儿检测的遗传性疾病中主要包括染色体病、基因病、线粒体病等。

目前已发现的人类染色体异常超过10000种[1],主要包括数目异常,如唐氏综合征21号染色体比正常多一条,女性先天卵巢发育不全缺少一条X染色体;部分染色体大片段结构变异,罗氏易位等;染色体亚显微结构的微缺失或重复,如17q21.31微缺失综合征和22q1l.2微重复综合征。

染色体病对胎儿的危害尤其巨大,除极少数三体和性染色体异常可以存活下来,大多数的染色体数目异常均以流产、死胎而告终,而染色体结构异常则是引起新生儿出生缺陷非常重要的原因,包括智力低下、发育迟缓、多器官畸形等[2],而目前尚无有效的治疗措施,因此需要及早准确检测和积极干预。

染色体微阵列分析在产前诊断中的应用价值

染色体微阵列分析在产前诊断中的应用价值李敏;张庆娥;董晶晶;周月云;郑建丽【期刊名称】《中国妇幼健康研究》【年(卷),期】2022(33)5【摘要】目的探讨染色体微阵列分析(CMA)在产前诊断中的应用价值。

方法选取2018年1月至2021年1月就诊于盐城市妇幼保健院的不良孕产史、无创DNA 产前检测筛查异常、超声检查异常、高龄、血清学筛查异常、父母染色体异常等808例孕妇,行染色体核型分析和CMA检查,并对两种检查结果进行比较分析。

结果CMA共检出染色体数目异常79例(9.78%),其中21三体41例(51.90%)、18三体15例(18.99%)、X三体13例(16.46%)、X四体1例(1.27%)、Y三体6例(7.59%)、其他三体3例(3.80%),与染色体核型分析一致;染色体核型分析检出染色体结构异常9例(1.11%),其中缺失3例(33.33%)、重复2例(22.22%)、嵌合体4例(44.44%)。

CMA检出拷贝数目变异(CNVs)93例(11.51%),其中微重复55例(59.14%)、微缺失38例(40.86%),杂合性缺失(LOH)/单亲二倍型(UPD)10例;CMA染色体异常检出率为23.02%(186/808),明显高于染色体核型分析的10.89%(88/808)(χ^(2)=42.208,P<0.05)。

在93例CNVs中,临床意义不明的CNV(VUS)占64.52%(60/93),良性占25.81%(24/93),致病性CNVs占9.68%(9/93);VUS和良性的发生率均明显高于致病性CNVs发生率,差异均有统计学意义(χ^(2)值分别为62.004、8.392,P<0.05)。

结论CMA用于产前诊断有助于提高染色体异常检出率,但多数CNVs为VUS,因此CMA的数据库还有待进一步完善,以准确判读CNVs的类型进行产前指导。

【总页数】6页(P96-101)【作者】李敏;张庆娥;董晶晶;周月云;郑建丽【作者单位】盐城市妇幼保健院产前诊断中心【正文语种】中文【中图分类】R173【相关文献】1.染色体微阵列分析技术在侧脑室增宽胎儿产前诊断中的应用价值2.染色体微阵列分析在超声软指标产前诊断中的应用价值3.荧光原位杂交与染色体微阵列分析技术在胎儿标记染色体产前诊断中的应用4.染色体微阵列分析在单纯不良孕产史孕妇产前诊断中的应用价值5.染色体核型分析联合染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用价值因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

染色体微阵列分析技术(CMA)在产前诊断中的应用

拷贝数变异(CNVs)是染色体上较大区域的缺失或重复,可 能导致多种疾病,如自闭症、智力障碍等。CMA技术能够 检测出CNVs,为产前诊断和遗传咨询提供有力支持。
基因组印记异常的案例分析
总结词
基因组印记异常是指基因组中某些基因的印记表达异 常,可能导致胎儿发育异常或疾病,CMA技术有助于 发现基因组印记异常。
原理
通过微阵列芯片与待测样本DNA进行 杂交,检测基因组中碱基序列的变异, 并将变异结果进行高分辨率的定位和 识别。
CMA技术的优势和局限性
优势
高分辨率、高灵敏度、高特异性、快速检测、可检测多种染色体异常和基因组变异。
局限性
无法检测染色体结构异常、无法检测单基因遗传病、无法检测线粒体基因组变异、存在假阳性或假阴性的可能。
印记异常研究
CMA技术能够用于印记异常 的深入研究,为疾病发病机 制和遗传学研究提供有力支 持。
03
CMA技术在产前诊断中的临床 价值
提高产前诊断的准确性和可靠性
CMA技术通过高分辨率的微阵列芯 片,能够检测到染色体的微小变异, 包括拷贝数变异和单核苷酸变异,从 而提高了产前诊断的准确性。
与传统的染色体核型分析相比,CMA 技术具有更高的灵敏度和特异性,能 够更准确地检测出染色体异常,避免 了漏诊和误诊的情况。
降低假阳性率和假阴性率
CMA技术能够更准确地检测出染色体 异常,从而降低了假阳性率和假阴性 率,避免了不必要的侵入性产前诊断 和终止妊娠。
CMA技术可以检测到染色体的微小变 异,而传统的染色体核型分析可能无 法检测到这些变异,因此CMA技术能 够更全面地评估胎儿的染色体异常风 险。
为遗传咨询和生育建议提供依据
CMA技术能够检测出罕见疾病, 如肌萎缩侧索硬化症、脊髓性肌 萎缩症等。

染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识(完整版)

染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识(完整版)目前,G显带染色体核型分析技术仍然是细胞遗传学产前诊断的“金标准”,但该技术具有细胞培养耗时长、分辨率低以及耗费人力的局限性。

包括荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术在内的快速产前诊断技术的引入虽然具有快速及特异性高的优点,但还不能做到对染色体组的全局分析。

染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)技术又被称为“分子核型分析”,能够在全基因组水平进行扫描,可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copy number variant,CNV),尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排具有突出优势。

根据芯片设计与检测原理的不同,CMA技术可分为两大类:基于微阵列的比较基因组杂交(array.based comparative genomic hybridization,aCGH)技术和单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array.SNP array)技术。

前者需要将待测样本DNA与正常对照样本DNA分别标记、进行竞争性杂交后获得定量的拷贝数检测结果,而后者则只需将待测样本DNA与一整套正常基因组对照资料进行对比即可获得诊断结果。

通过aCGH技术能够很好地检出CNV,而SNP array除了能够检出CNV外,还能够检测出大多数的单亲二倍体(uniparental disomv,UPD)和三倍体,并且可以检测到一定水平的嵌合体。

而设计涵盖CNV+SNP检测探针的芯片,可同时具有CNV和SNP芯片的特点”。

2010年,国际细胞基因组芯片标准协作组(International Standards for Cytogenomic Arrays Consortium,ISCA Consortium)在研究了2 1 698例具有异常临床表征,包括智力低下、发育迟缓、多种体征畸形以及自闭症的先证者的基础上,发现aCGH 技术对致病性CNV的检出率为12.2%,比传统G显带核型分析技术的检出率提高了10%。

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CMA: 应用微阵列技术对整套染色体 核型进行分析成为染色体微阵 列分析。
a-CGH+SNP
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Affymetrix基因芯片技术平台
人基因组:3×109bp 基因:2×109 Affymetrix芯片:750K 每4kb一个探针,100%覆盖国际细胞遗 传学学会认可的基因,93%覆盖X染色体 基因,83%覆盖OMIM疾病相关基因
染色体核型检查未见异常 CMA可发现pCNVs 19-29.7%
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CMA的临床应用
ACMG推荐CMA取代核型作为DD/ID一线遗传学诊断方法
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CMA的临床应用
Angelman综合征(快乐木偶综合征)
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CMA的临床应用 我中心CMA检查指针:
孕期超声检查提示胎儿超声异常(28-34周) 智力低下/自闭症/发育迟滞 习惯性流产/死胎 染色体核型分析发现Marker染色体 既往头胎因智力低下、自闭症、胎儿多发畸形等 已经进行基因芯片检测发现问题,再次妊娠时
CMA可将检出率提高5.2-6.5%

多发畸形 9.5% 单系统畸形 5.6%
(骨骼系统、神经系统)

软指标 2.6%
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CMA的临床应用
ACOG推荐用CMA取代核型检测超声结构异常胎儿
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CMA的临床应用
DiGeorge(22q11.2)综合征
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CMA的临床应用
发育迟滞/智力低下/自闭症(DD/ID/Autism):
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CMA的临床应用 取材要求: 4℃保存,尽快送检
羊水:6-8ml,无菌,2管(备用,培养)
胎儿肌肉:三角肌,1cm3
绒毛组织
全血(EDTA抗凝)
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CMA结果解释
先症者:
智力低下 小头畸形
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CMA结果解释
胎儿:
父母:
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CMA在产前诊断中的应用
(Chromosome microarray analysis)
Hale Waihona Puke LOGO产前诊断中心2014.12.12
胡婷
染色体分析方法的不断进步
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染色体分析方法的不断进步
原位杂交(FISH)
染色体核型分析
定量荧光PCR(QF-PCR)
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染色体微阵列分析(CMA)
Microarray: 通过把标准的全基因组核苷酸 序列或者靶向核苷酸序列固定 在一块面积很小的硅片、玻片 或尼龙膜上而构成微阵列。
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Affymetrix基因芯片技术平台
优势:

不足:
Gain Loss GainMosaic LossMosaic UPD

点突变 多倍体 平衡性改变 单基因病 遗传代谢性疾病
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常见的微缺失/微重复综合征
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CMA的临床应用
超声异常:
染色体核型检测异常率9-35%
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