生物化学 第5章 核酸(2)

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生物化学核酸知识点总结

生物化学核酸知识点总结

生物化学核酸知识点总结
核酸是由核苷酸组成的,核苷酸是核酸的基本组成单位。

核苷酸由碱基-核糖-磷酸基团组成。

核酸可分为核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)。

碱基可分为5大类,即腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)、尿嘧啶(U)和胸腺嘧啶(T)。

DNA分子中出现的碱基有A、T、C和G;RNA分子中所含的碱基是A、U、C和G。

核酸中含量相对恒定的元素是磷。

DNA分子由2条脱氧核糖核苷酸链组成,绝大部分RNA由1条核糖核苷酸链组成。

DNA碱基组成有一定的规律,即DNA分子中A的摩尔数与T相等,C与G相等。

碱基与碱基之间的连接中,(A)和(T)之间靠2个氢键连接,(C)和(G)之间靠3个氢键连接。

生物化学课后习题答案

生物化学课后习题答案

第二章糖类1、判断对错,如果认为错误,请说明原因。

(1)所有单糖都具有旋光性。

答:错。

二羟酮糖没有手性中心。

(2)凡具有旋光性的物质一定具有变旋性,而具有变旋性的物质也一定具有旋光性。

答:凡具有旋光性的物质一定具有变旋性:错。

手性碳原子的构型在溶液中发生了改变。

大多数的具有旋光性的物质的溶液不会发生变旋现象。

具有变旋性的物质也一定具有旋光性:对。

(3)所有的单糖和寡糖都是还原糖。

答:错。

有些寡糖的两个半缩醛羟基同时脱水缩合成苷。

如:果糖。

(4)自然界中存在的单糖主要为D-型。

答:对。

(5)如果用化学法测出某种来源的支链淀粉有57 个非还原端,则这种分子有56 个分支。

答:对。

2、戊醛糖和戊酮糖各有多少个旋光异构体(包括α-异构体、β-异构体)?请写出戊醛糖的开链结构式(注明构型和名称)。

答:戊醛糖:有3 个不对称碳原子,故有2 3 =8 种开链的旋光异构体。

如果包括α-异构体、β-异构体,则又要乘以2=16 种。

戊酮糖:有2 个不对称碳原子,故有2 2 =4 种开链的旋光异构体。

没有环状所以没有α-异构体、β-异构体。

3、乳糖是葡萄糖苷还是半乳糖苷,是α-苷还是β-苷?蔗糖是什么糖苷,是α-苷还是β-苷?两分子的D-吡喃葡萄糖可以形成多少种不同的二糖?答:乳糖的结构是4-O-(β-D-吡喃半乳糖基)D-吡喃葡萄糖[β-1,4]或者半乳糖β(1→4)葡萄糖苷,为β-D-吡喃半乳糖基的半缩醛羟基形成的苷因此是β-苷。

蔗糖的结构是葡萄糖α(1→2)果糖苷或者果糖β(2→1)葡萄糖,是α-D-葡萄糖的半缩醛的羟基和β- D -果糖的半缩醛的羟基缩合形成的苷,因此既是α苷又是β苷。

两分子的D-吡喃葡萄糖可以形成19 种不同的二糖。

4 种连接方式α→α,α→β,β→α,β→β,每个5 种,共20 种-1 种(α→β,β→α的1 位相连)=19。

4、某种α-D-甘露糖和β-D-甘露糖平衡混合物的[α]25D 为+ °,求该平衡混合物中α-D-甘露糖和β-D-甘露糖的比率(纯α-D-甘露糖的[α]25D 为+ °,纯β-D-甘露糖的[α]25D 为-°);解:设α-D-甘露糖的含量为x,则(1-x)=X=%该平衡混合物中α-D-甘露糖和β-D-甘露糖的比率:=5、请写出龙胆三糖[β-D-吡喃葡萄糖(1→6)α-D-吡喃葡萄糖(1→2)β-D-呋喃果糖] 的结构式。

生物化学 核酸名词解释

生物化学 核酸名词解释

1、Ribozyme:具有高效特异催化功能的RNA。

2、自杀性底物:Kcat型不可逆抑制剂不但具有与天然底物相似的结构,而且本身也是酶的底物,可被酶催化而发生类似底物的变化。

因此称之为“自杀性底物”3、酶的活性部位(活性中心):与底物接触并且发生反应的部位就称为酶的活性中心,也称为酶的活性部位。

4、变构酶又称别构酶,酶分子的非催化部位与某些化合物可逆地非共价结合后,引起酶的构象的改变,进而改变酶的活性状态5、卫星DNA:主要分布在染色体着丝粒部位,由非常短的串联多次重复DNA序列组成,因为它的低复杂性又称简单序列DNA,又因其不同寻常的核苷酸组成,常在浮力密度离心中从整个基因组DNA中分离成一个或多个“卫星”条带,故称卫星DNA。

6、Southern印迹:将凝胶上分离的DNA片段转移到硝酸纤维素膜上,再通过同位素标记的单链DNA或RNA探针的杂交作用检测这些被转移的DNA 片段的方法。

步骤:限制性酶切DNA分子、琼脂糖凝胶电泳分离、碱变性、转膜、探针杂交、洗膜除去未杂交的探针、放射性自显影。

Nouthern印迹:将RNA分子从电泳凝胶转移到硝酸纤维素膜上,然后进行核酸杂交的一种那个实验方法。

Wouthren:将蛋白质从电泳凝胶中注意到硝酸纤维素膜上,然后与放射性同位素i125标记的特定蛋白质的抗体进行反应。

7、酶活力:指酶催化某化学反应的能力,其大小可以用在一定条件下所催化的某一化学反应的反应速率来表示,两者呈线性关系。

8、1)、可逆抑制作用:抑制剂与酶以非共价键结合,用透析、超滤或凝胶过滤等方法可以除去抑制剂,恢复酶活性。

主要包括:竞争性抑制、非竞争性抑制和反竞争性抑制作用三种。

竞争性抑制是I与S竞争E的结合部位,影响了S与E的正常结合。

非竞争抑制是I与S同时与E结合,但三元复合物不能进一步分解为产物,酶活性下降。

反竞争抑制是E只有与S结合后,才能与I结合,三元复合物不能进一步分解为产物。

2)、不可逆抑制作用:抑制剂通常以共价键与酶的必须基团进行不可逆结合,从而使酶失去活性。

第5章核酸的化学 第四节 核酸的性质

第5章核酸的化学 第四节  核酸的性质

食品生物化学
图5-15 RNA紫外吸收曲线
波长nm
食品生物化学
四、核酸的变性与复性
当核酸在某些理化因素(如有机溶剂、酸、碱、尿素、加 热及酰胺等)作用下,互补碱基对间的氢键断裂,双螺旋结构 松散,变成单链的过程称为变性(denaturation)。变性使核酸的 二级结构、三级结构改变,但核苷酸排列顺序不变。变性后的 核酸理化性质改变,生物学活性丧失。
核酸是相对分子质量很大的高分子化合物,高分子溶液比 普通溶液黏度要大得多,高分子形状的不对称性愈大,其黏度 也就愈大,不规则线团分子比球形分子的黏度大,线形分子的 黏度更大。由于DNA分子极为细长,因此即使是极稀的溶液也 有极大的黏度,RNA的黏度要小得多。
二、核酸的酸碱性质
核酸和蛋白质一样,也是两性电解质,在溶液中发生两性 电离。因磷酸基的酸性比碱基的碱性强,故其等电点偏于酸性。 利用核酸的两性解离能进行电泳,在中性或偏碱性溶液中,核 酸常带有负电荷,在外加电场力作用下,向阳极泳动。利用核 酸这一性质,可将相对分子质量不同的核酸分离。
DNA的变性是可逆的。变性DNA在适当条件下,变性的两 条互补链重新结合,恢复原来的双螺旋结构和性质,这个过程 称为复性(renaturation)。热变性的DNA经缓慢冷却(称退火处 理)即可复性。最适宜的复性温度比Tm值约低25℃,这个温度 又叫退火温度。
食品生物化学
图5-16 两种不同来源的DNA在260nm的吸收值与温度变化的关系
食品生物化学
DNA的解链过程发生于一个很窄的温度区内,DNA的变性 过程是爆发式的,有一个相变过程,把A260达到最高值的一半时 对应的温度称为该DNA的解链温度或融解温度,用Tm表示。 Tm值大小与DNA碱基组成有关,由于G-C之间的氢键联系要比 A-T之间的氢键联系强得多,故G+C含量高的DNA其Tm值越高。 通过测定Tm值可知其G+C碱基的含量。

生物化学第五章核酸化学习题含答案

生物化学第五章核酸化学习题含答案

核酸的化学一、是非题1.嘌呤碱分子中含有嘧啶碱结构。

2.核苷由碱基和核糖以β型的C—N糖苷键相连。

3.核苷酸是由核苷与磷酸脱水缩合而成,所以说核苷酸是核苷的磷酸酯。

4.核苷酸的碱基和糖相连的糖苷键是C—O型。

5.核糖与脱氧核糖的差别是糖环的2’位有无羟基。

6.核苷酸的等电点的大小取决于核糖上的羟基与磷酸基的解离。

7.在DNA双链之间,碱基配对A-T形成两对氢键,C-G形成三对氢键,若胸腺嘧啶C-2位的羰基上的氧原于质子化形成OH,A-T之间也可形成三对氢键。

8.任何一条DNA片段中,碱基的含量都是A=T,C=G。

9.DNA碱基摩尔比规律仅适令于双链而不适合于单链。

10.用二苯胺法测定DNA含量必须用同源的DNA作标准样品。

11.DNA变性后就由双螺旋结构变成线团结构。

12.Tin值低的DNA分子中(A-T)%高。

13.Tin值高的DNA分子中(C-G)%高。

14.由于RNA不是双链,因此所有的RNA分子中都没有双螺旋结构。

15.起始浓度高、含重复序列多的DNA片段复性速度快。

16.DNA的复制和转录部必须根据碱基配对的原则。

17.某氨基酸tRNA反密码子为GUC,在mRNA上相对应的密码子应该是CAG。

18.细胞内DNA的核苷酸顺序都不是随机的而是由遗传性决定的。

19.RNA链的5 ′核苷酸的3′羟基与相邻核昔酸的5′羟基以磷酸二酯键相连。

20.假如某DNA样品当温度升高到一定程度时,OD260提高30%,说明它是一条双链DNA。

21.核酸外切酶能够降解所有的病毒DNA。

二、填空题1.核苷酸是由___、____和磷酸基连接而成。

2.在各种RNA中__含稀有碱基最多。

3.T m值高的DNA分子中___的%含量高。

T m值低的DNA 分子中___%含量高。

4.真核生物的DNA存在于____,其生物学作用是____________。

5.细胞内所有的RNA的核苷酸顺序都是由它们的______决定的。

6.将双链DNA放置在pH2以下或pH12以上,其OD260___,在同样条件下单链DNA的OD260______。

第5章核酸的化学 第二节 核酸的化学组成

第5章核酸的化学 第二节  核酸的化学组成
DNA和RNA分子中,主要元素有碳、氢、氧、氮、磷等, 个别核酸分中还含有微量的S。磷在各种核酸中的含量比较接 近和恒定,DNA的平均含磷量为9.9%,RNA的平均含磷量为 9.4%。因此,只要测出生物样品中核酸的含磷量,就可以计算 出该样品的核酸含量,这是定磷法的理论基础。
食品生物化学
二、核酸的水解产物
3.次黄嘌呤衍生物——次黄嘌呤核苷酸(IMP)
在肌肉组织中,腺嘌呤核苷酸循环过程中由AMP脱氨形成 次黄嘌呤核苷酸。
次黄嘌呤核苷酸在生物体内是合成腺嘌呤核苷酸和鸟嘌呤 核苷酸的关键物质,对生物的遗传有重要的功能。另外,它还 是一种很好的助鲜剂,有肉鲜味,与味精以不同比例混合制成 具有特殊风味的强力味精(见第九章第二节鲜味)。
2.腺苷衍生物——环腺苷酸(cAMP)
cAMP是由ATP经腺苷酸环化酶催化而成的。
食品生物化学
图5-7 环腺苷酸(cAMP)
食品生物化学
cAMP广泛存在于一切细胞中,浓度很低。它们的主要作 用不是作为能量的供体,而是在生物体内参与细胞内多种调节 功能,如它可调节细胞内催化糖和脂肪反应的一系列酶的活性, 也可以调节蛋白激酶的活性。一般把激素称为第一信使,而称 cAMP为“第二信使”。
核酸是一种聚合物,它的结构单位是核苷酸 。
核酸
核苷酸
磷酸
核苷
碱基
戊糖
(嘌呤碱和嘧Ch啶em碱Pa)st(e核r 糖或脱氧核糖)
图5-1 核酸的水解产物
食品生物化学
三、核酸水解产物的化学结构
1.戊糖
DNA和RNA的主要区别是所含戊糖不同,DNA分子中的戊 糖是β-D-2-脱氧核糖,而RNA分子中的戊糖是β-D-核糖 。
碱基 Ade Gua Cyt Ura

生物化学第5章核酸化学

生物化学第5章核酸化学

生物化学第5章核酸化学课外练习题一、名词解释1、核苷酸;2、核酸的一级结构;3、增色效应;4、DNA变性;5、T m值;二、符号辨识1、DNA;2、RNA;3、mRNA;4、tRNA;5、rRNA;6、AMP;7、dADP;8、A TP;9、NAD;10、NADP;11、FAD;12、CoA;13、DNase;14、RNase;15、Tm;三、填空1、RNA有三种类型,它们是(), ()和();2、除()只含有DNA或者只含有RNA外,其它生物细胞内既含有DNA也含有RNA;3、核酸具有不同的结构,()通常为双链,()通常为单链;4、原核生物染色体DNA和细胞器DNA为()状双链,真核生物染色体DNA为()双链;5、核苷酸由核苷和()组成,核苷由()和()组成;6、构成核苷酸的碱基与戊糖连接的类型属于()连接,糖的构型为()型;7、稀有碱基在RNA中的含量比在DNA中的丰富,尤其在()中最为突出,约占10%左右;8、具有第二信使功能的核苷酸是()和();9、辅酶类核苷酸包括()、()、()和();10、多聚核苷酸是通过核苷酸的C5’-()与另一分子核苷酸的C3’-()形成磷酸二酯键相连而成的链状聚合物。

11、两个核苷酸之间形成的磷酸二酯键通常称为()磷酸二酯键;12、核酸的一级结构是指单核苷酸之间通过()相连接以及单核苷酸的()及排列顺序;13、真核生物的mRNA分子存在5’-()结构(甲基化的鸟苷酸)和3’-()尾结构;14、1953年,J.Watson和F.Crick提出了著名的()模型;15、DNA分子由两条DNA单链组成,为()双螺旋结构,螺旋中的两条主干链方向(),侧链()互补配对;16、碱基的相互结合具有严格的配对规律,即A与()结合,G 与()结合,这种配对关系,称为();17、碱基互补形成碱基对时,A和T之间形成()个氢键,G与C之间形成()个氢键;18、维持DNA双螺旋结构稳定性的因素包括:两条DNA链之间形成的()、()堆积力和()的负电荷与介质中阳离子的正电荷之间形成的离子键;19、DNA的()结构是指DNA分子通过扭曲和折叠所形成的特定构象;20、超螺旋是DNA()结构的一种形式;21、真核生物的核酸通常与蛋白质复合在一起,称为()。

天津大学生物化学05第五章核酸化学

天津大学生物化学05第五章核酸化学
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(二)DNA的二级结构1(总)
1.DNA双螺旋结构模型的要 点 2.双螺旋结构的稳定因素 3.DNA双螺旋的不同类型
.
(二)DNA的二级结构2
➢公 认 的 为 1953 年 watson 和 crick 提 出 的 DNA 双 螺旋结构模 型
.
(二)DNA的二级结构3
➢此模型的建立主要基于两方面的根据 ➢(1)碱基组成A=T,C=G,并证明A 与T之间可生成两个氢键,而C与G之间 三个氢键。 ➢( 2 ) X 衍 射 结 构 分 析 : 不 同 来 源 的 DNA纤维具有相似的X光衍射图谱。
➢含量:占总RNA的5% ➢存在:在细胞核中以DNA为模板被合成以后,
可能暂存于核仁内,也可能立即转移到胞质中, 并以每分子mRNA与几个或几十个核蛋白体结合 成串珠样的多核蛋白体形式而存在。
➢特点:一般都很不稳定,代谢活跃,更新迅速,
寿命较短,种类很多。
➢功能:在蛋白质生物合成中起传递遗传信息的作
➢(2)离子键及范德华力:DNA分子中磷酸基因在生理 条件下解离,使DNA成为一种多阴离子,这有利于它与 带正电荷的其它阳离子基团发生静电作用,这样减少双链 间的静电排斥,有利于双螺旋的稳定。
➢(3)碱基堆积力:目前普遍认为堆积碱基间的疏水作 用是稳定DNA结构的更重要的因素。大量碱基层层堆积, 两相邻碱基的平面十分贴近,于是使双螺旋结构内部形成 一个强大的疏水区,与介质中的小分子隔开,有利于互补 碱基之间氢键的形成。
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1.DNA双螺旋结构模型要点1(1)
➢(1)DNA分子是由两条方向相反的平行 的多核苷酸链构成。即p5’-糖3‘-p的结构 与p3’-糖5‘-p的结构相对;两条链的糖-磷 酸主链都是右手螺旋,有一共同的螺旋轴。
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核酸含有嘧啶碱和嘌呤碱基,因而DNA 和RNA在紫外光 区具有吸收特性,其最大吸收在260nm处。
利用核酸和蛋白质紫外吸收差别,可鉴定核酸制品中蛋 白质杂质。例如,纯净的DNA A260:A280的比值大约介于 1.65~1.85. 若比值过高,则表明污染有RNA, 比值过低 则表明有蛋白质或酚污染。
分四组,每组加入四种5‘-dNTP(其中一种含
放射线标记)和一种2',3'-ddNTP,并加入E.coli
DNA聚合酶Ⅰ,满足DNA合成所需条件,进行该片段 互补链的合成。当加入的2',3'-ddNTP参入到链中 后,因该类似物脱氧核糖的C-3’位上无OH,不能与 下一个核苷酸连接,故链的延长被终止。例如,加
3 介质中离子强度 离子强度高,Tm高。测定Tm需要特定的条件:即在
四 DNA的变性与复性
(一) DNA的变性
在水溶液中,双股DNA分子在某些物理因素或化学因素 的影响下,双螺旋结构中的碱基堆积力和碱基对间的氢键受 到破坏,严密的双股螺旋变成了两条单一的随机卷曲的多核
苷酸链,该现象称作DNA变性。
热变性是DNA的一个极其重要的性质,在研究DNA时常用到 这一性质。若将DNA稀溶液加热到80℃左右几分钟,双螺旋 结构就会受到破坏,氢键逐步断开,形成无规线团。这种变 化叫做螺旋→线团转换(helix-coil transition).
增色效应:
当DNA溶液慢慢加热到双螺旋开始解链前,在260nm 处的吸收基本保持不变。但当温度达到一定高度(一般在 750C以上)时,紫外吸收急剧增加直到两条单链完全分开 成随机卷曲状态为止。紫外吸收随变性程度加剧而升高
的现象称为高色效应或增色效应(hyper-chromoc
effect)。一般来说,DNA分子变性后,紫外吸收增高
在核酸变性实验中,常Байду номын сангаас用摩尔磷消光系数。摩尔 磷消光系数是指含磷为1.0摩尔浓度的核酸水溶液在 260nm处的消光值,用ε(p) 表示: ε(p) = A260/C·L = A260×30.98/ W·L A: 被测核酸样品的消光值; C: 每升溶液中磷酸摩尔数; W: 每升溶液中磷的重量;30.98是磷的原子质量; L: 比色杯的内径。 核酸变性时,ε(p)值就会大大升高,当复性时, ε(p) 便降低或恢复到原来的水平,故ε(p) 可作为核 酸变性与复性的重要指标。
三 核糖体RNA的结构与功能
核糖体是蛋白质合成的机构,由大小两个的亚基组成。 在原核生物中,这两个亚基分别是30S(小亚基)和50S (大亚基)。在真核生物中,这两个亚基分别是40S(小 亚基)和60S(大亚基),S表示它们在超离心时的沉降系 数。核糖体大约由65%的RNA和35%的蛋白质组成。 rRNA与功能的关系是与它们同核糖体蛋白包装或核糖 体密切相关的,与mRNA和tRNA在核糖体上结合以及mRNA的 信息翻译成新生肽链密切相关。
30—40%。
减色效应
任何多聚核苷酸在260nm处都有一个特征性 的紫外吸收的最大值,但这种吸收在天然DNA分 子中,由于碱基的堆积而受到抑制,比组成双螺 旋分子的两条单链处在随机卷曲状态的吸收或核 苷酸单体的总吸收要低得多,这种现象称作低色 效应或减色效应(hypo- chromic effect)。
E.coli16SrRNA的结构
第五节
核 酸 的 性 质
(一)核酸的溶解性质和粘性
核酸(RNA 和DNA)都是由核苷酸组成的生物大分子,它们
含有许多极性基团,因此DNA和RNA都能溶解于水,不溶于乙醇氯仿 等有机溶剂。
在细胞内DNA和RNA通常与蛋白质结合在一起,成为DNA-蛋 白质(简称DNP), RNA-蛋白质(简称RNP)复合体,它们在盐溶 液中的溶解度不同, DNP溶于高浓度盐溶液, RNP在低盐溶液中可 以溶解。 核酸的粘性(Viscosity) 天然DNA溶液具有很高的粘性,但当DNA变性时其粘性急剧下 降. 不规则线团比球状分子的粘度大,而线性分子的粘度比无规线 团的大。
4 二氢尿嘧啶环(D环):在三叶草结构的左侧有 一个由8-12个氨基酸残基形成的大突环,因为其中含 有二氢尿嘧啶核苷酸,所以称为D环。 5 可变环(额外环):在TψC环和反密码环之间 有一个可变环,不同的分析不同的tRNA具有不同的可变 环,所以是tRNA分类的重要标志。分析不同来源的tRNA 结构后发现,约有15个碱基的位臵总是不变的,大约有 8个碱基的位臵是半不变的。这些不变或半不变的碱基 大多数出现在可变环中。
当DNA在溶液中处于天然状态时,由于双螺旋的刚性 以及长长的线性结构,天然DNA的粘度很大,即使稀溶液 其粘度也很大。DNA变性后,由于双螺旋的刚性失去,氢 键断开,两条链彼此分开,单链分子处于随机卷曲状态, 因而粘度急剧下降。因此,DNA粘度的改变,可作为DNA分 子变性的重要指标。 二、核酸的紫外吸收特征
在热变性过程中,双股螺旋被解开一半的温度称 为解链温度或融解温度(melting temperature) 或转 换温度(transition temperature),用Tm表示。
DNA变性后的性质改变: 1 增色效应:指DNA变性后对260nm紫外光的光 吸收度增加的现象; 2 旋光性下降; 3 粘度降低; 4 生物学功能丧失。
(三) 3'-端多聚腺苷酸结构
在真核生物中,成熟的mRNA 3'-端有一段长约50— 100个或更长的腺苷酸(poly A)尾链结构。然而它的前 体的 3'-端只有一段保守的AAUAAA结构,成熟的 mRNA3'-端的poly A结构位于这段保守序列下游约10-30
个核苷酸处。显然,这段序列为腺苷酸的酶促转移、加
(二) DNA的(浮力)密度(buoyant density)
把DNA放在密度梯度介质的上面,以相当高的速度离心时, DNA在梯度中迁移,直到达到同它自己的密度相同的部位为止, 即漂浮于介质的某一密度梯度中,该部位称作DNA的(浮力)密度。 不同的DNA具有不同的(浮力)密度。可利用(浮力)密度的差别, 借助密度梯度超离心法来分离制备DNA。 DNA的(浮力)密度与其分子的碱基组成有密切的关系,与 G·C含量在一定范围内(20%--80%)呈正比关系。Schidkraut et al. 导出了下面公式: ρ = 1.660 + 0.098 ( G + C ,) DNA的(浮力)密度与其分子构象有密切的关系,与分子大小 无关。 DNA变性后,分子卷曲成致密的线团,故比天然DNA的 (浮力)密度大。
入5'-dGTP类似物ddGTP,则链的延伸会在鸟苷酸残
基处终止。

DNA组织结构上的某些特点(略) 基因重叠(ΦΧ174) 断裂基因(外显子与内含子,鸡卵白蛋白基因) 重复序列(高度,中度重复及单一序列) 回文结构
第四节
RNA 的 结 构 与 功 能
RNA的类型和一般结构特征 除某些双股病毒RNA外,其他都是单股分子,但RNA分子可通 过自身的回折,在分子内部形成局部的双螺旋区. RNA局部的双螺旋结构与DNA的A-型结构相似,每轮螺旋约 有11个bp. 一 mRNA的结构特征
到它的3'-端提供了加入点(或信号)。3'-端poly A结
构可以提高真核生物mRNA的稳定性。
二 转移RNA的结构
tRNA是一种能结合特定氨基酸,并能识别mRNA
上该氨基酸的密码子,将该氨基酸转运到正在合成
的蛋白质多肽链中去的接合体分子。
(一) tRNA的二级结构
tRNA是典型的单链分子,其长度约在75个核苷酸
影响DNA变性(Tm值)的因素
1 DNA均一性 同质DNA均一性高,变性的温度范 围越窄,异质DNA变性的温度范围较宽。据此可分析DNA 的均一性 。
2 G-C含量与Tm值成正比。
不同DNA分子的Tm差别与其碱基组成有密切关系。 在标准条件下,Tm与DNA碱基组成间的关系: Tm = 69.3 + 0.41(G + C)
(二)tRNA的三级结构
tRNA可以在二级结构的基础上进一步折叠形成倒L-
行的三级结构。 tRNA复杂的三级结构是由于广泛堆积作用和螺旋臂间的 碱基配对来维持的。氨基酸的接受部位和反密码子部位分 别 位 于 倒 L- 型 的 两 端 。 tRNA 狭 长 部 分 的 宽 度 约 为 0 . 2 0.5nm,这是它们生物学功能所必需的。因为当蛋白质合成 时,两分子的tRNA必需同是结合在mRNA的两个密码子上。 tRNA的复杂的三级结构是由广泛堆积作用和螺旋臂间 的碱基配对来维持的。在这些相互作用中所涉及的大多数 碱基都属于不变和半不变的,这为所有tRNA都有相似构象 提供了基础。
mRNA存在于细胞质中,是基因的细胞质信使,直接指导蛋白
质的合成。
(一) 非翻译区和Shine-Dalgarno顺序 在原核生物mRNA起始密码子AUG上游约10 核苷酸处,有一段富含嘌呤核苷酸顺序,该顺序 称为前导顺序(Leading sequence) 。因Shine
Dalgarno首先发现,故又称为Shine-Dalgarno
顺序,简称SD顺序。该顺序与翻译起始有关, 是核糖体小亚基16SrRNA结合的部位。
(二) 5'-端甲基化的‚帽‛结构
在真核生物中mRNA的5‘-端有一个甲基化的鸟苷
酸残基.这是mRNA前体在转录合成后加上去的。这种
‚帽‛结构是大多数真核生物mRNA结构上的一个重要
特征。由于真核生物中mRNA缺少SD顺序,故该特殊的 帽结构可能为真核生物mRNA翻译起始提供一个可识别 的标记,亦可阻止5’-核酸外切酶的降解。
左右。根据碱基互补的原则,tRNA的多核苷酸链通 过自身的回折,可以形成类似三叶草的二级结构。 绝大多数tRNA都具有这种三叶草型的结构。
tRNA的二级结构的两个主要特征是:
1 氨基酸臂:5'端和3'端碱基互补配对形成7个bp的臂。 因该臂的3'端具有共同的、能与氨基酸结合的-pCCA-OH结构, 故该臂称作氨基酸接受臂(acceptor stem)或称氨基酸臂。 2 反密码环:在与氨基酸臂相对的另一端,有一个由7个 碱基组成的突环。该突环因顶端含有能识别mRNA密码子的反密码 子,故把这个突环称为反密码环。反密码环通过反密码臂与tRNA 的其他部分连接。 3 TψC环:在三叶草结构的右侧有一个由七个氨基酸 残基形成的突环,因为其中含有假尿嘧啶核苷酸ψ ,所以称为 TψC环。
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