最常用生物软件大全介绍讲解
一、基因芯片：
1、基因芯片综合分析软件。
ArrayVision 7.0
一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。
Arraypro 4.0
Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。
phoretix™ Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综
合分析软件。
J-express
挪威Bergen大学编写，是一个用JAVA语言写的应用程序，界面清晰漂亮，用来分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据，需要下载安装JAVA运行环境JRE1.2后(5.1M)后，才能运行。
2、基因芯片阅读图像分析软件
ScanAlyze 2.44
，斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件，进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式，可很容易地转化为任何数据库。
3、基因芯片数据分析软件
Cluster
斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇（Cluster)分析与其它各种处理的软件。
SAM
Significance Analysis of Microarrays 的缩写，微矩阵显著性分析软件，EXCEL软件的插件，由Stanford大学编制。4．基因芯片聚类图形显示
TreeView 1.5
斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。
FreeView
是基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据，比Treeview增强了某些功能。
5．基因芯片引物设计
Array Designer 2.00
DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具
二、RNA二级结构。
RNA Structure 3.5
RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA
一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室获得。提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力，使之为一个界面友好的RNA 折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。RNA draw中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜单显示对鼠标当前所指向的对象/窗口可以使用的功能列表。RNA文库（RNA Library）用一种容易操作的方式来组织你所有的RNA数据文件。
基本配置：Windows95,Windows98或WindowsNT。Pentium 以上芯片，32兆内存。
RNAdraw
是一个进行RNA二级结构计算的软件。 1. 它是Windows 下的多文档窗口 (multipledocument interface) 软件，允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。2. RNAdraw中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜单显示对鼠标当前
所指向的对象/窗口可以使用的功能列表。3. RNA文库（RN A Library）用一种容易操作的方式来组织你所有的RNA数据文件。
loopDloop 2.07b
Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JAV A虚拟机。
Circles 0.1.0
Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JAV A虚拟机。
三、序列综合分析
Vector NTI Suite 8.0
不喜欢装备各种专业性强的软件，而希望用一个综合性的软件代替的同志可以选择本软件。本阶段的大部分功能它都有。该软件具体特有良好的数据库管理（增加、修改、查找），对要操作的数据放在一个界面相同的数据库中统一管理。软件中的大部分分析可以通过在数据库中进行选定（数据）->分析->结果（显示、保存和入库）三步完成。在分析主界面，软件可以对核酸蛋白分子进行限制酶分析、结构域查找等多种分析和操作，生成重组分子策略和实验方法，进行限制酶片段的虚拟电泳，新建输入各种格式的分子数据、加以注释，输出高质量的图像。Vector NTI Suite还有以下独立的分析程序，完成相关分析。这些独立的程序，可以通过选定->分析->结果三步调用。
l 3DMol－显示PDB格式分子的三维结构
l Align X－序列相似性比较
l Align Xblocks－序列局部完全相同比较
l ContigExpress－将小片段拼装成长序列
l GCGConverter－GCG格式文件转换成NTI的格式
l PubMed/Entrez Search－搜索PubMed、PDB、GenBank
l Back Translation－核酸->蛋白->核酸反向翻译的工具
l Matrix Editor－矩阵数据编辑
l Tools Manager－连接其他程序和网络连接的界面。分成Al ign、Analyze、Assemble、Tools四部分。
DNAStar5.03 即著名的Lasergene Suite，由EditSeq MegAlig n、GeneQuest MapDraw PrimerSelect Protean SeqMan II七个模块组成，该软件的MegAlign模块，可以对多达64000的片段进行拼装。整个拼装过程即时显示，并提示可能的完成时间。拼装结果采用序列、策略等方式显示。DNAstar是哈佛大学医学院是使用的序列分析软件，可见其功能强大。Omiga 2.0实际上，大部分对核酸蛋白的序列分析功能，在O miga 2.0中都能找到；而且界面非常友好。Omiga作为强大的蛋白质、核酸分析软件，它还兼有引物设计的功能。主要功能：编辑、浏览、蛋白质或核酸序列，分析序列组成。用Clustal. W进行同源序列比较，发现同源区。实现了核酸序列与其互补链之间的转化，序列的拷贝、删除、粘贴、置换以及转化为RNA链，以不同的读码框、遗传密码标准翻译
成蛋白质序列。查找核酸限制性酶切位点、基元（Motif）及开放阅读框（ORF），设计并评估PCR、测序引物。查找蛋白质解蛋白位点（Proteolytic Sites）、基元、二级结构等。查寻结果可以以图谱及表格的显示，表格设有多种分类显示形式。利用Mange快捷键，用户可以向限制性内切酶、蛋白质或核酸基元、开放阅读框及蛋白位点等数据库中添加或移去某些信息。每一数据库中都设有多种查寻参数，可供选择使用。用户也可以添加、编辑或自定义某些查寻参数。可从MacVectorTM、Wisconsin PackageTM等数据库中输入或输出序列。另外，该软件还提供了一个很有特色的类似于核酸限制酶分析的蛋白分析，对蛋白进行有关的多肽酶处理后产生多肽片段。
DS gene : Omiga 2.0的换代产品，accelrys公司Discovery stu dio系列，accelrys公司的insight II,GCG是业内蛋白分析和核酸分析的权威软件，DS gene 是GCG的个人机简版，功能强大，而且可以直接与GCG服务器相连。由于受到vector N TI的界面影响，DS gene 与Omiga 2.0相比界面有了很大的改变。
DNASIS for Windows 2.5版是日立软件公司（Hitachi Sofewa re Engineering Co.,Ltd.）97年推出的一个功能强大的序列分析软件。包含有大部分分子生物学软件的常用功能，可进行DNA，RNA，蛋白质序列的编辑和分析，甚至还能进行质粒
作图、数据库查询等功能，足可满足一般实验室的要求。在DOS时代，DNASIS 7等版本便是流传甚广并曾给过许多人以帮助的分子生物学软件，因此我们有理由期待Win版的D NASIS 会带给我们惊喜。
DNASIS MAX 1.0 DNASIS 2.5的更新换代产品。综合序列分析软件，体积比上一个版本一下膨胀了许多。界面风格也改变了很多。
DNATools 5.1 与Omiga, DNAsis, PCgene等软件属于同一类的综合性软件,操作简单功能多。DNATools设计的用户友好、强壮，以便快速、方便地获取、贮藏和分析序列及数据库查询获得的序列相关信息。DNATools包容性很好，能把几乎所有文本文件打开作为序列。当程序不能辨别序列的格式时（通过寻找常用序列格式的特征），会显示这个文件的文本形式，以便你编辑生成正确的蛋白质或DNA序列，编辑后可以再被载入程序。若你的序列是DNATools格式时（DNA 或寡核苷酸序列），程序不加注解的载入序列，程序模式调整成可以接受载入的数据类型（蛋白质、DNA和寡核苷酸引物序列）。在一个项目中可以加入几千个序列或引物，并在整个项目中分析这些序列及标题。这个程序的一个特点是给每个序列或引物添加文本标题。这样就可以用自定义的标题识别序列，而不必通过它们的文件名。
Bioedit一个具有序列简单分析和序列对比功能的软件。该软
件有一个简单亲切的界面，集成其他已经很有效果的序列比对软件。另外该软件还有很多有用的相关站点连接。虽然该软件看起来结构简单，但却又很强的可充性，可以自由整合许多软件，例如viewtree.
Jellyfish 2.1 只水母不简单，可以用来进行DNA翻译，序列排队比较，限制酶消化，提交序列进行BLAST，研究项目管理等。操作十分简单，只需拖动与点击便可。
Genetools Genebio公司的核酸序列分析软件，虽然不及vec t NTI 和DS gene 强大，它具有repeat /vect find 使其他分析软件所不具有的，值得一提的是该软件具有的CpG island分析。
DNAMAN 限制酶分析，引物设计，对排（aligment）,翻译，数据库操作，Blast，序列装配（Sequence assembly）.易学易用，操作方便。
四、限制酶切位点分析：
DNAssist2.0
大多软件只对线性序列进行分析，那么cN NNNN…NNNgaat t环状的序列就找不到EcoR I的位点。DNAssist 1.0能很容易把这个EcoR I位点找出来。另外DNAssist在输出上非常完美，除了图形、线性显示外，还有类似DNASIS的列表方式，列出有的位点（按酶排列，按碱基顺序排列）。
五、质粒绘图：
Gene Construction Kit 2.0
这一个非常好的质粒构建软件包。与大多数分析的软件不同，它制作并显示克隆策略中的分子构建过程；包括质粒构建，模拟电泳条带；当然还可以质粒作图（有无序列均可）。通过它绘出来的图还可以继续用来构建克隆策略图谱。只是该软件由于功能太强，使用起来也不简单；幸亏它附有详细的使用帮助，认真研究后，应该没有问题。
Winplas 2.6
该软件用来绘制发表质量的质粒图，可广泛应用与论文、教材的质粒插图。其特性包括：1.知道序列或不知序列结构均能绘制质粒图；2. 可读入各种流行序列格式文件引入序列信息；3. 自动识别限制位点可构建序列结构，功能包括：从文件插入序列、置换序列、序列编辑、部分序列删除等；4. 绘图功能强大，功能包括：位点标签说明、任意位置文字插入、生成彩图、线性或环形序列绘制、可输出到剪贴板、可输出到图像文件；5. 限制酶消化分析报告输出与序列输入报告功能。
Plasmid Premier2.02
是由加拿大的Premier Biosoft公司推出的用于质粒作图的专业软件，主要用于进行质粒作图，质粒特征分析和质粒设计。
其主要界面分为序列编辑窗口（Genetank），质粒作图窗口（Plasmid Design），酶切分析窗口（Restriction Sites）和纹基分析窗口（Motif）。打开程序就可进入序列编辑窗口，可以直接打开Genbank或Vector数据库中已知质粒的序列文件，将序列读入，并将有关于质粒的各种特征，包括编码区，启动子，多克隆位点以及参考文献等信息保存在Header中；也可以直接输入序列进行未知质粒的设计。
Redasoft Visual Cloning 2000
用来帮助生命科学家快速而轻松地绘制专业级质量的质粒
载体图，主要的性能包括：快速和轻松地生成一个清晰，色彩鲜明的环行或线性的载体图。自动识别和解析序列文件。新增的web浏览功能允许你链接到数据库站点，并支持下载和自动将序列文件转换成载体图。强大的限制性内切酶分析功能和拥有将近1000种来自REBASE的限制性内切酶。片段的删除和插入完全模拟克隆实验并和其他图形兼容。所看即所得 (What You See Is What You Get)的编辑环境使得你的打印结果和你在屏幕上看到的保持一致。自动标记各种区段的碱基位置以避免重叠。可选择的图形比例尺使几个构造图间很容易比较。允许质粒图拷贝到剪贴板并粘贴到其他Win dows应用程序。可以用e-mail的方式传递载体图。SimVector
质粒图绘制软件，绘制发表质量的质粒图与序列、载体图。
Clone Manager
小巧的研究人员日常使用的辅助克隆工具，主要功能是限制酶切割、分子重组、质粒作图等。
六、引物分析：
Primer Premier 5.0
顾名思义，该软件就是用来进行引物设计的。可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物，而在手动的任何时候，下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异二聚体、发夹结构等。也可以给定条件，让软件自动搜索引物，并将引物分析结果显示出来。而且进行这些操作非常简单Oligo 6.57
引物分析著名软件，主要应用于核酸序列引物分析设计软件，同时计算核酸序列的杂交温度（Tm）和理论预测序列二级结构。
Primer D'Signer 1.1
免费的引物设计辅助软件，专门用于pASK-IBA和pPR-IBA 表达载体，简化引物设计工作。
Array Designer 2.00
DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具
Beacon Designer
1.01 PCR定量分析分子信标(Molecular beacon )设计软件NetPrimer
于WEB界面的引物设计程序，1.8M，包括JAVA程序和帮助文件，解压后，可在本地直接使用，不须再连到原始网站使用。
七、蛋白二级结构分析
ANTHEPROT 4.5
是位于法国的蛋白质生物与化学研究院（Institute of Biolog
y and Chemistry of Proteins）用十多年时间开发出的蛋白质研究软件包。软件包包括了蛋白质研究领域所包括的大多数内容，功能非常强大。应用此软件包，使用个人电脑，便能进行各种蛋白序列分析与特性预测。更重要的是该软件能够提供蛋白序列的一些二级结构信息，使用户有可能模拟出未知蛋白的高级结构。
Peptool,
与genetool同出一家，可以进行氨基酸序列的二级结构预测，motif的寻找，酶切片断的分析，以及转录后的甲基化分析。是为数不多的蛋白分析软件。
VHMPT
（Viewer and editor for Helical Membrane Protein Topologies）是螺旋状膜蛋白拓扑结构观察与编辑软件，可以自动生成带
有跨膜螺旋的蛋白的示意性2维拓扑结构，并可对拓扑结构进行交互编辑。由台湾生物医学科学研究所的黄明经博士编制。安装Tcl 8.0 (2.6M)方可运行。
MACAW
序列构建与分析工作台软件(Multiple Alignment Constructio n & Analysis Workbench, MACAW)是一个用来构建与分析多序列片段的交互式软件。MACAW具有几个特点：
1. 新的搜索算法查寻类似区，消除了先前技术的许多限制。
2. 应用一个最近发展的数学原理计算block类似性的统计学显著性。
3. 使用各种视图工具，可以评估一个候选block包含在一个多序列中的可能性。
4．可以很容易地编辑每一个block。
八、凝胶分析软件：
BandScan 4.30
通用的电泳胶条带定量分析软件，手动、自动找到条带，手动的条带可以是无规则的，可以清除背景。进行分子量、百分比、质量、波峰等方面的定量分析。直接使用扫描仪。将数据输出到excel文件。
band leader 3.0
小巧的凝胶图像分析软件。
TotalLab 2.0
是一个全智能化的凝胶分析软件，对DNA、蛋白凝胶电泳图像、arrays, dot blots与colonies等图像可以进行很方便的处理。功能齐全，很容易上手。
Quantityone ：
bio-rad公司的1d凝胶分析软件，但可配套各种产品，界面华丽，能够生成报告，具有大公司的风范。
QuantiScan 2.1
功能单一的1D凝胶分析软件，但经评测能够及其准确的测量出各个条带的分子量。
Gel-Pro Analyzer
Media Cybernetics公司的产品，一向以提供专业级的分析软件而著称。
SigmaGel 1.0
SPSS公司凝胶分析产品。
Melanie 3 Viewer
Swiss Institute of Bioinformatics (SI用来查看使用Melanie3软件获得的凝胶图片与相关数据，也包括一些有限的凝胶数据分析功能。
PDQuest 6.2.1
bio-rad公司一个分析2维凝胶并生成数据库的标准软件。使用它，可以同时分析100个凝胶图像，生成包含1000个凝
胶图像的数据库。
九、三维结构显示
RasMol 2.7
是计算化学与分子图形学以及信息产业的同步高速发展的成果，使一个普通的科研工作人员，在自己的个人电脑上，就可以从Internet上的各种免费数据库中，下载所需观察与研究的分子坐标文件，进而通过RasMol 2.7以各种模式、各种角度，甚至按照自己的意愿旋转着，观察此分子神秘的微观三维立体结构，进而了解化合物分子结构和各种微观性质与宏观性质之间的定量关系。RasMol 2.7的作者是Glaxo&W ellcome公司（世界第一大制药公司）研发中心的科学家Ro ger Sayle。 RasMol 2.7最大的特点是界面简单，基本操作简单，运行非常迅速，对机器的要求较低，对小的有机分子与大分子，如蛋白质、DNA或RNA, 均能适用，且显示模式非常丰富。而且它程序短小，功能强大。尚无在功能上出其右者。其显示窗口可以很简单通过选择相应的菜单来显示分子的三维结构。用命令行窗口，通过输入命令可以执行和显示复杂和要求极高的三维图形。
CHIME 2.6
IE与NetScape浏览器插件,安装后,可以直接用浏览器观看P DB格式的文件,直接在浏览器中观看3D分子。
ICMLite
维分子浏览工具，是MolSoft公司出品的软件ICM的简化版,免费推出，但功能十分强大。可读取PDB格式及其他数种格式的分子文件,易于操作,显示的分子图像我认为优于Ras Mol,值得一试。还可以进行一些计算操作。
POV-Ray 3.5
是一个高质量、完全免费创造最棒三维图像的非常有名的工具，用在分子生物学上，便是用它生成高质量的三维大分子图像。见过Science封面上漂亮极的分子图像吗？便是用它与以下软件结合制作出来的。运算POV格式文件，生成三维图形，非常棒。该软件相当于一种语言，修改pov格式文件，可以定义光源、摄像机、材质、阴影等因素，把生物分子的表面用材质填充，根据光源、摄像机得到分子三维图的一个角度的图。分辨率最大可达1280*1024。图象质量精美。DS viewer pro 5.0
Accerlys公司Discovery studio系列中的一员。
3D-mol viewer,
带动windows系统下生物软件革新的vector NTIsuite中的一员。
Cn3D
是由NCBI开发的用于观看蛋白质三维结构的软件，其设计的主要目的是为NCBI在其站点中的蛋白质结构数据库MM
DB提供专业的结构观察软件，其主要的操作界面分为两个窗口，如右图所示，一个为结构窗口，另一个为序列窗口。与其他的类似的软件，如Rasmol，Weblabview等相比，其在结构观察方面主要功能上基本相似，但是图形格式上比R asmol和Weblabview要差一些。而在与网络连接上，该软件能依托NCBI所建立的所建立的MMDB结构数据库，能直接根据输入的序列号从数据库中利用其内嵌的Entrez搜索引擎调出蛋白结构来进行观察，比其他软件要简便。而Cn3D 主要的特点是能够将两个蛋白放在一起直观地进行三维结
构上的比较，如下图中是将两种核酸外切酶的三维结构通过VAST对准得到的结构比较图：同样，Cn3D在结构比较方面也能利用其内嵌的Blast搜索引擎直接访问Genbank数据库找到具有局部相似性的结构数据，并在三维结构图中显示出二者具有相似性的结构区域。
Spdbv 即Swiss-PdbViewer，
是一个界面非常友好的应用程序，使用起来比RASMOL方便，用来同时分析几个蛋白PDB文件。可以将几个蛋白叠加起来用来分析结构类似性，比较活性位点或其它有关位点。通过菜单操作与直观的图形，可以很容易获得氢键、角度、原子距离、氨基酸突变等数据。该软件与Swiss-Model服务器（蛋白立体结构构建服务器）紧密关联，可以从软件直接连到Swiss-Model服务器进行理论蛋白立体结构构建。而且，
该软件可以调用POV-Ray软件（见上）生成质量非常高的蛋白图像。
Molmol 主要用来进行各种分子文件的转换，支持30种主要分子格式，也可以用来进行3维分子的简单显示。可将PDB 格式输出为POV格式后，用POV-RAY进行渲染，生成非常漂亮的三维图形。演示版只支持样板文件与原子数小于20
的分子文件格式的转换。不知是否有取巧的办法。
十、生物显微图像分析
Scion Image
是一个优秀的免费图像处理与分析工具。是非常流行的苹果机上的NIH（National Institutes of Health) Image的WINDO WS版，用来显示编辑分析各种图像。读取格式为 TIFF 与B MP格式,是一个专业图像分析软件，适用与于科学处理，这点从研发单位便可看出。生物学工作者处理图像必备。SigmaScan Pro 5.0
是一个有力的图像分析软件30天全功能演示版，进行数字图像的分析处理，可以很容易地将图像进行分析，得出科学结论。
Image-Pro Plus Version 4.5
Media Cybernetics公司的专业产品，不仅可以进行显微分析，还可也进行其他科学分析。
十一、数据统计类软件
SAS世界排名第一，专业性极强，能做各种统计，是FDA
唯一批准有效的统计软件。但人机对话不方便，主要是类似DOS下的命令操作，最新的8.0版本，稍有改进，鼠标操作性较好，若今后能进一步改进操作的话，其应用将大大广泛。是专业统计人员的首选软件。
SPSS，世界排名第二，最新版本11.01，其特点：功能强大，易于操作，简单明了，人机对话方便，数据库接口丰富，最新SPSS可以读出SAS数据，是业余人员的首选。最新版本纠正以往的不稳定、运行速度慢的缺点。11.0运行速度是 1 0.0的十倍以上，主要原因是SPSS公司将原有的内核全部更换了。但SPSS分为不同版本，如basic版、standard版和ad vance版。许多复杂的统计功能只在advance版中才出现，如复杂多元相关、神经网络统计，而前两版中许多复杂统计并没有（可能为了便于安装使用吧，11.0的basic版约60M，s tandard约110M-150M,而高级版本则几百M。象SAS完成安装则达6张CD！因而绝大多数人不可能使用它全部功能。因而常规建议是SPSS+origin6.0一个统计，一个作图，而且二者数据可以通用，效果很好！在我的主页的站点导航statisitic：最新10.0，运行速度最快，模块化操作，不同统计数据有不同界面风格，使用方便，目前国内有很多用户。但其知名度在前二者之下，对一般用户可以考虑选用。
Origin 7.0 是一个非常有名并且易于使用的科学用途数据绘图与数据分析处理工具软件，各种期刊上的统计图，几乎都是出自他的手笔。
以上的软件过于强大，下面是一些小巧易用的数据统计作图，更适合生物学的数据分析：
GraphPad Prism著名的数据处理软件,用来进行生物学统计、曲线拟合以及作图。短小而功能齐全。
SigmaPlot 2002 著名的绘图和数据分析软件包可以根据各种数据，绘制精确的两维或三维曲线，可以自由定制各数据轴的特性，并能进行数据的各种统计分析。进行一般的生物类数据处理作图，功能足以。
Simstat 一个易于使用的智能统计软件尤其适合对统计知识了解不多的人使用，它具有一个“专家系统”，引导你对数据进行统计分析。可与SigmaPlot结合生成高质量数据图。CurveExpert ELISA标准曲线拟合、及其它各种有关的实验数据分析，都可以应用CurveExpert进行数据分析。它使用非常方便，可以说是实验数据处理的圣手，并且可以生成漂亮的曲线应用到论文之中。
生物信息学软件及使用概述
生物信息学软件及使 刘吉平 liujiping@https://www.360docs.net/doc/234737555.html, 用概述 生 物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m
生物信息学是一门新兴的交叉学生物信息学的概念： 科，它将数学和计算机知识应用于生物学，以获取、加工、存储、分类、检索与分析生物大分子的信息，从而理解这些信息的生物学意义。 生 物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m
分析和处理实验数据和公共数据，生物信息学软件主要功能 1.2.提示、指导、替代实验操作，利用对实验数据的分析所得的结论设计下一阶段的实验 3.实验数据的自动化管理 4.寻找、预测新基因及其结构、功能 5.蛋白质高级结构及功能预测（三维建模，目前研究的焦点和难点） 生 物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m
功能1. 分析和处理实验数据和公共数据，加快研究进度，缩短科研时间 ?核酸：序列同源性比较，分子进化树构建，结构信息分析，包括基元(Motif)、酶切点、重复片断、碱基组成和分布、开放阅读框（ORF ），蛋白编码区（CDS ）及外显子预测、RNA 二级结构预测、DNA 片段的拼接； ?蛋白：序列同源性比较，结构信息分析（包括Motif ，限制酶切点，内部重复序列的查找，氨基酸残基组成及其亲水性及疏水性分析)，等电点及二级结构预测等等； ?本地序列与公共序列的联接，成果扩大。 生 物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m
Antheprot 5.0 Dot Plot 点阵图 Dot plot 点阵图能够揭示多个局部相似性的复杂关系 生 物秀-专心做生物！ w w w .b b i o o .c o m
大学专业介绍之生物科学类1(生物科学、生物技术、生物信息学)
大学专业介绍之生物科学类1（生物科学、生物技术、生物 信息学） 1．生物科学 本专业培养具有生物科学学科的基本理论、基本知识、基本技能，同时掌握生物科学的理论前沿、应用前景、最新发展动态和应用能力的技术人才，为我国生态建设及植物资源利用和中药资源产业化提供能从事教学、技术研究、生产管理、产品开发等方面的高级技术人才。 业务培养要求：本专业学生主要学习生物科学方面的基本理论、基本知识，受到基础研究和应用基础研究方面的科学思维和科学实验训练，具有较好的科学 1. 2.掌握动物生物学、植物生物学、微生物学、生物化学、细胞生物学、遗传学、发育生物学、神经生物学、分子生物学、生态学等方面的基本理论、基本知 3.
4. 5. 6.掌握资料查询、文献检索及运用现代信息技术获取相关信息的基本方法；具有一定的实验设计，创造实验条件，归纳、整理、分析实验结果，撰写论文， 主干课程：植物生物学、动物学、微生物学、生物化学、生物化学实验技术、细胞生物学、遗传学、分子生物学、植物生理学、生态学、天然产物化学、药用植物资源学、中药材生产质量控制、中药材加工学、生物制药等。 就业方向与深造：毕业后可在科研机构、学校从事药用植物和植物生态与资源利用科学研究和教学工作；在企、事业单位从事技术研究、产品开发和生产管理等工作。 2．生物技术 本专业是以生物化学和分子生物学为基础、应用于现代生物技术产业为特色的理科类专业。培养系统掌握现代生命科学知识、生物技术的基本理论和基因工程、细胞工程、发酵工程、生物信息及数据分析等技能，具备良好的科学素养和创新精神的高级专门人才。 主干课程：普通生物学、生物化学与分子生物学、微生物学、细胞生物学、遗传学、基因工程原理与技术、酶工程原理及技术、细胞工程原理与技术、微生物与发酵工程，生物信息学等。 业务培养要求：本专业学生主要学习生物技术方面的基本理论、基本知识，受到应用基础研究和技术开发方面的科学思维和科学实验训练，具有较好的科学
常用生物学软件简介
网址： https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/ 1. Oligo 6是目前使用最为广泛的一款引物设计软件，除了可以简单快捷地完成各种引物和探针的设计与分析外，还具有很多其他同类软件所不具有的高级功能：a) 已知一个PC R引物的序列，搜寻和设计另一个引物的序列。b) 按照不同的物种对MM子的偏好性设计简并引物。c) 对环型DNA片段，设计反向PCR引物。d) 设计多重PCR引物。e) 为LCR反应设计探针，以检测某个突变是否出现。f) 分析和评价用其他途径设计的引物是否合理。g) 同源序列查找，并根据同源区设计引物。 h) 增强了的引物/探针搜寻手段。设计引物过程中，可以“Lock”每个参数，如Tm值范围和引物3’端的稳定性等。i) 以多种形式存储结果；支持多用户，每个用户可保存自己的特殊设置。 网址： Oligo 6.71 Demo（引物设计软件）：https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/Soft/2006/112.htm Oligo—引物设计软件电子教程（引物设计和评估） Oligo 6 Tour 主要功能介绍 https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/ 2．Vector NTI Suite是一套功能最全，而且界面最美观，最友好的分子生物学应用软件包。主要包括四个大型软件，它们分别可以对DNA、RNA、蛋白质分子进行各种分析和操作。Vector⑴NTI：作为Vecto r NTI Suite的核心组成部分，它可以在生物研究的全过程中提供数据组织和序列编辑的软件支持。Vector NTI 是以一种窗口形式，且支持项目组织的数据库来完成这一功能的；通过这个数据库，可以保存和组织大部分的实验数据，比如：基因结构、载体、序列片断、引物、蛋白质、多肽、电泳Markers和限制性内切酶等。实际上，该数据库还支持对Vector NTI Suite中各种小型的绘图和结果展示工具的管理。Vector NTI 可以按照用户要求设计克隆策略。用户只需提供克隆载体，外源片断序列，明确载体克隆的大致位置或酶切位点，其它工作由软件完成。设计结果以图文形式输出到屏幕；最后根据客户定制的条件进行模拟电泳。Vector NTI 还具有强大的设计和评估PCR引物、测序引物和杂交探针功能。BioPlot⑵：BioPlot 是一个对蛋白质和核酸序列进行各种理化特性分析的综合性工具，它是一种方便的桌面程序。和其他程序不同的是，BioPlot可以绘制50种以上预定制的蛋白质特征图谱，如疏水性和抗原性；并将序列与特征图谱和活性序列区域一一对应。BioPlot还可以对核酸序列进行8种不同类型的分析，如：退火温度、自由能和GC含量等。AlignX⑶：AlignX可以对多个蛋白质或核酸序列进行同源比较，以寻找不同序列之间的同源区域或相似性很高序列中的不同碱基，并绘制进化树；为下一步设计PCR引物、探针及研究系统发育提供基础。AlignX可以识别所有标准TXT格式，如FASTA、GeneBank、EMBL、SWISS－PROT、GenPept 和ASCII Text。ContigExpress⑷：Contig Express是用来对多个小核酸片段进行拼接而形成连续的长序列。这些小片段可以是Text序列，也可以是直 接从自动测序仪得到的测序图。它用同一个浏览窗口来组织序列片段和拼接结果，同时还有一个由多个子窗口组成的窗口将序列和它们的特性测序图及拼接示意图分别对应。拼接的结果可以直接保存成GeneBan k、EMBL或FASTA文件。Vector NTI Suite⑸其他功能：支持多用户。提供PubMed/Entrez－Search、B last Search、Blast Viewer和3D－Mol(用来看PDB文件)等在线工具。 网址： Vector NTI7.0 中文使用手册 Vector NTI Suite 9.1 Demo（综合性蛋白核酸分析工具包）https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/Soft/2007 /460.htm https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/solutions/vectornti/index.html 3．DNAStar 是一款基于Windows和Macintosh平台的序列分析软件，特点是操作简单，功能强大。主
生物技术专业介绍
生物技术专业介绍 生物技术专业是于2000年设立并正式开始招生，经过多年的建设，现已成为学校的优势专业，是山东省特色专业，又是山东省应用型特色名校工程重点建设专业。 一、人才培养目标 培养德、智、体、美全面发展，系统掌握农业生物技术的基本理论、基本知识、基本技能，具有较强的自主学习能力、实践能力、创新能力，能够支撑现代农业生物技术产业体系，服务于山东区域经济社会发展的高素质应用型人才。 二、特色和优势 1. 构建了一支高学历、教学经验丰富、科研能力强的一支师资队伍。本专业现有专职教师70人，其中正高职称22人、副高职称28人，讲师20人，高级职称教师占71.4%；具有博士学位的教师57人，占专职教师的81.4%；具有国外学习和研修经历的19人；泰山学者海外特聘专家3人、山东省教学名师2人、国务院特殊津贴获得者1人、“留学回国人员成就奖” 获得者1人、博士生导师4人。 2. 具有生物学科特色。本专业具有植物学、动物学、微生物学、生理学、遗传学等多学科支撑，以及生物化学与分子生物学省级重点学科支撑，生物学科特色鲜明。我们在生物技术专业的建设中，以厚基础，宽口径为前提，在课程体系与教学内容上力求突出自身的学科优势，形成专业特色，培养高素质应用型生物技术专业人才。 3. 以科研促教学，提高人才培养质量。（1）通过科研，提高教师自身素质，为提高教学质量提供了重要保证；（2）科研促进了教学条件的建设。在投资1000多万购置实验仪器的基础上，目前又新组建了科研用组培室与炼苗室各1间及教学用组培室与炼苗室各1间，极大充实了教学条件；（3）科研充实了教学内容。通过科研，提高教师学术水平，把新知识、新观点及时充实到教学中，激发学生对学科的兴趣，切实提高教学质量；（4）科研培养学生动手能力、创新思维。本专业于2003年率先在全校实施了“本科生导师制”制度，使学生从大二开始进入实验室，参与教师的科研活动，独立设计试验并完成科研任务，切实提高学生独立操作能力及创新能力。 三、学科建设 本专业为山东省特色专业，先后获得生物化学与分子生物学、遗传学、植物
常用分子生物学软件简介
常用分子生物学软件简 介 公司内部编号：（GOOD-TMMT-MMUT-UUPTY-UUYY-DTTI-
常用分子生物学软件 一、基因芯片： 1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。Arraypro Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。 phoretix? Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综合分析软件。 J-express 挪威Bergen大学编写，是一个用JAVA语言写的应用程序，界面清晰漂亮，用来分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据，需要下载安装JAVA运行环境后后，才能运行。 2、基因芯片阅读图像分析软件 ScanAlyze ，斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件，进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式，可很容易地转化为任何数据库。 3、基因芯片数据分析软件 Cluster
斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇（Cluster)分析与其它各种处理的软件。 SAM Significance Analysis of Microarrays 的缩写，微矩阵显着性分析软件，EXCEL软件的插件，由Stanford大学编制。 4．基因芯片聚类图形显示 TreeView 斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。 FreeView 是基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据，比Treeview增强了某些功能。 5．基因芯片引物设计 Array Designer DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具 二、RNA二级结构。 RNA Structure RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室获得。提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力，使之为一个界面友好的RNA折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退
生物学专业自我介绍范文
生物学专业自我介绍范文 每一次自我介绍都是一次销售自己的开始，那么生物专业的你成功了吗以下是小编为您整理的生物学专业自我介绍内容，希望能帮到你。 生物学专业自我介绍第一篇我叫xxx，是山东师范大学生命科学学院生物技术专业2012届毕业生。 大学四年，我始终严格要求自己，全方面锻炼和发展自我。不断的加强与人沟通交流的能力并取得了很大的提高，积极的参加实践活动，大大的提高了我的实践能力。学习上，我踏实努力，以优秀的成绩通过了所有课程，连续三年获得三好学生的称号并获得二等奖学金，专业成绩名列前茅。实验操作能力在大学期间得到很大的提高，能够顺利地独立完成实验课程。同时，我广泛学习了英语、计算机等各方面知识，先后通过了国家英语 四、六级考试，国家计算机水平考试二级，三级，能熟练操作计算机常用软件。我有着很强的学习能力和适应新环境的能力，较强的团体协作能力和实践能力。 我的学校XX师范大学是山东省省属重点大学，具备师范类及非师范类专业。我所在专业生物技术专业是非师范类的，侧重于生产应用，所学习课程是面向生物制药公司，发酵类公司，以及研发部门的。除学习了较宽广的生物基础知
识外，我对生物技术的四大工程课程还有着较深入的学习。 生物学专业自我介绍第二篇我是生物工程系06级园艺班学生洪转移，作为一名即将毕业的大学生，社会实践是我们在大学学习生活中的一个重要环节，现在毕业后找工作首先要求有工作经验，如果能提前在企业实习，正好为将来求职积累一些资本。大三第一学期末,我有幸到连云港振兴恒巨花卉实习,在将近4个月的实习期里,我初步接触到蝴蝶兰各个苗期的栽培与养护的一些技术，催花技术，组盆技术以及年宵花卉出售情况,熟悉了蝴蝶兰的生物学特性，在不同的生长时期蝴蝶兰对光照，温度，水分，湿度，肥料的要求以及病虫害的防治等。积累了一定的社会经验和工作经验。负责指导我的是一名姓李的主管，实习内容主要是蝴蝶兰的日常管理技术。在我们主管的悉心教导下，很快我就熟悉了蝴蝶兰的栽培与养护流程，使自己的基础知识更牢固，技术更全面，实际操作能力有所提高，以下就是我的一些实习过程和体会。 首先实习让我觉得很新鲜，因为这毕竟是自己的第一个实习单位，也觉得自己应该会在这里过得很快乐的。第一天进仓实习，我怀着惴惴不安的心情。只见几个陌生的脸孔。我微笑着和他们打招呼。从那天起，我养成了一个习惯，每天早上见到他们都要微笑的说声你早或早上好，那是我心底真诚的问候。我总觉得，经常有一些细微的东西容易被我们
食品生物技术专业简介
食品生物技术专业简介 专业代码570101 专业名称食品生物技术 基本修业年限三年 培养目标 本专业培养德、智、体、美全面发展，具有良好职业道德和人文素养，掌握生物化学、微生物发酵技术、食品生物新技术等基本知识，具备发酵、产品分离提取、菌种培养等能力，从事调味品及食品添加剂、酒、饮料及精制茶等生物食品的生产操作、设备使用和维护、生产过程质量监控、工艺与设备管理、技术研发辅助等工作的高素质技术技能人才。 就业面向 主要面向生物食品制造技术及应用行业，在发酵、产品分离提取、菌种培养等岗位群，从事生产操作、设备使用和维护、生产过程质量监控、工艺与设备管理、技术研发辅助、生物产品检验检疫、生物产品销售等工作。 主要职业能力 1.具备对新知识、新技能的学习能力和创新创业能力； 2.具备在工作中发现问题和寻找解决问题方法的能力； 3.具备食品生物新技术初步研发的能力； 4.掌握生产过程质量管理的相关知识及技能，具备生物食品生产过程质量监控的能力； 5.掌握生物食品工艺技术及应用，具备生物食品生产工艺与设备管理的能力； 6.掌握微生物菌种培养、发酵和产品提取的基本知识及技能，具备生物食品生产操作的能力； 7.了解相关生产设备的结构、工作原理及基本操作，具备生物食品生产设备使用
和维护的能力。 核心课程与实习实训 1.核心课程 生物化学、微生物基础、微生物发酵技术、发酵工程设备、食品质量与安全、发酵食品生产技术、食品生物新技术等。 2.实习实训 在校内进行微生物基础技能训练、微生物发酵技术技能训练、发酵食品生产技术综合训练、食品生物新技术研发训练等实训。 在生物食品生产企业进行实习。 职业资格证书举例 发酵工微生物培菌工酿酒工酱油酱类制作工食用酶制剂制造工 衔接中职专业举例 食品生物工艺 接续本科专业举例 生物技术生物工程酿酒工程
常用生物软件简介汇总(window 版)
一、基因芯片： 1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：69 00美元。 Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。 phoretix™ Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综合分析软件。 J-express 挪威Bergen大学编写，是一个用JAVA语言写的应用程序，界面清晰漂亮，用来分析微矩阵（microarray）实验获得的基因表达数据，需要下载安装JAVA运行环境JRE1.2后(5.1M)后，才能运行。 2、基因芯片阅读图像分析软件 ScanAlyze 2.44 ，斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件，进行微矩阵荧光图像分析，包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式，可很容易地转化为任何数据库。 3、基因芯片数据分析软件 Cluster 斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇（Cluster)分析与其它各种处理
的软件。 SAM Significance Analysis of Microarrays 的缩写，微矩阵显著性分析软件，E XCEL软件的插件，由Stanford大学编制。 4．基因芯片聚类图形显示 TreeView 1.5 斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster 成为了基因芯片处理的标准软件。 FreeView 是基于JAVA语言的系统树生成软件，接收Cluster生成的数据，比Tr eeview增强了某些功能。 5．基因芯片引物设计 Array Designer 2.00 DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具 二、RNA二级结构。 RNA Structure 3.5 RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室获得。提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力，使之为一个界面友好的RNA折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。RNAdraw中一
生物技术(本科)课程简介
生物工程专业本科人才培养计划 一、培养目标 本专业旨在培养德、智、体全面发展，系统掌握生物工程专业的基础知识、基本理论与基本技能，具有较强的生物工程技能和创新能力，能够在生物工程及相关领域，从事生产工艺及技术管理、教学、新技术研究及新产品开发工作的高素质的应用型人才。 二、基本业务规格 1．具有良好的道德修养、心理素质和健康的体魄； 2．掌握本专业长远发展所必需的自然科学的基础理论和基本知识； 3．掌握生物学、生物化学、微生物学、化工原理、生化分离工程、生物工程设备、发酵工程、酶工程、细胞工程及基因工程等学科的基本理论、基本知识和基本技能； 4．有一定的分析和解决问题的能力，具备在生物工程领域从事生产工艺及技术管理、教学、新技术研究及新产品开发的基本能力； 5．解生物工程学科的理论前沿、应用前景和最新发展动态； 6．具有本专业所需的计算机应用的初步能力； 7．掌握一门外国语言，具有较熟练的听、说、读、写、译能力。 三、基准学制四年 四、授予学位工学学士 五、主干学科生物学 六、专业主干课程 生物化学、化工原理、生物分离工程、生物工程设备、分子生物学与基因工程、细胞生物学与细胞工程、发酵工程、酶工程等。 七、课程设置及学分要求 本专业毕业最低学分为160学分，其中，普通教育课程31学分，基础教学课程37学分，专业教学课程37学分，实践教学环节40学分，公共选修课程15学分。 本专业毕业另须修满10个素质拓展学分。
生物工程专业本科主要课程简介 课程代码：1F10691 课程名称：生物化学Biochemistry 学分：3 预修课程：无机及分析化学、有机化学、生物学概论 内容简介：本课程主要介绍生物化学的发展历史，生物化学研究中的重要化学概念，组成蛋白质的20种天然氨基酸，蛋白质的化学组成，蛋白质的空间结构，几种重要蛋白质的结构与功能关系，蛋白质研究的方法学，酶催化原理，核苷酸和核酸的结构与功能，脂类的结构与功能，生物膜的化学组成、结构和跨膜运输原理，碳水化合物的结构与功能。生物能量学，生物分子的分解合成代谢，遗传信息的复制及表达调控机制。 推荐教材： 《生物化学简明教程》（第三版）罗纪盛编高等教育出版社人2001年《Biochemistry》 B.D.Hames 科学出版社2000年 主要参考书：《生物化学》（上、下册）沈同等编高等教育出版社2002年《医学生物化学》周爱儒编北京医科大学出版社2001年 课程代码：1F11035 课程名称：化工原理Principles of Chemical Engineering 学分：4 预修课程：《高等数学》、《物理》、《无机及分析化学》、《有机化学》、《物理化学》内容简介：本课程阐明了化工过程开发步骤和方法及化学工程学的基本观点和方法，主要讲述流体流动过程基本原理及其应用(流体测量、流体输送)、热量传递
生物科学专业个人求职简历
生物科学专业个人求职简历 生物科学专业个人求职简历生物科学专业个人求职简历 姓名：苏xx性别：女学历：本科工作年龄：1年出生年月：1990-4民族：汉族籍贯：xxxx登记时间：2011-12-239:16:33 最高学历：本科毕业学校：xx医学院所学专业：生物科学掌握外语：英语政治面貌：共青团员登记时间：2011-12-239:16:33 教育经历： 2005年08月至2008年06月xx县第三中学 2008年09月至2012年05月xx医学院 工作年龄：1年能力与专长： 2008-2009学期院三等奖奖学金、院文娱先进个人、优秀学生 英语四六级证书，口语三级 xx省普通话二级甲等“2009海洋生态文明（xx）国际论坛”优秀志愿者联合国开发计划署（UNDP）/全球环境基金（GEF）资助的《xx西门岛海洋特别保护区红树林及湿地生态系统保护与综合管理》项目活动志愿者水产养殖和健康管理结业证书 工作经历： 2008年7月至2008年8月xx省海洋水产养殖研究所办公室助理个人简介： 2008-2009年，加入校青年志愿者和阳光志愿者服务社，去敬老院打扫，帮老人量血压，募捐，以及支援西部等宣传活动等等。 2009.7-8，暑期培训班当老师 2009．10-2010.1年，大学时代当服务生 2010.7-2010.8，
xx省海洋水产养殖研究所做办公室助理 2008-2012期间，一直在做家教 希望工作类型壹：涉外业务/外贸希望工资待遇：面议希望工作类型：全职希望工作地点：xx县意向提交时间：2013/3/1 其它工作要求：我的自荐书：希望工作类型贰：办公室文员/电脑打字员希望工资待遇：面议希望工作类型：全职希望工作地点：xx县意向提交时间：2013/3/1 其它工作要求：我的自荐书：希望工作类型叁：检验/化验/测试员希望工资待遇：2000-3000元希望工作类型：全职希望工作地点：xx县意向提交时间：2013/3/1 其它工作要求：我的自荐书：
生物专业自我介绍
生物专业自我介绍 第一篇：生物专业自我介绍 生物专业自我介绍范文 我叫xxx，是安徽师范大学生命科学学院生物技术专业2014届毕业生。 大学四年，我始终严格要求自己，全方面锻炼和发展自我。不断的加强与人沟通交流的能力并取得了很大的提高，积极的参加实践活动，大大的提高了我的实践能力。学习上，我踏实努力，以优秀的成绩通过了所有课程，连续三年获得三好学生的称号并获得二等奖学金，专业成绩名列前茅。实验操作能力在大学期间得到很大的提高，能够顺利地独立完成实验课程。同时，我广泛学习了英语、计算机等各方面知识，先后通过了国家英语四、六级考试，国家计算机水平考试二级，三级，能熟练操作计算机常用软件。我有着很强的学习能力和适应新环境的能力，较强的团体协作能力和实践能力。 我的学校安徽师范大学是安徽省省属重点大学，具备师范类及非师范类专业。我所在专业生物技术专业是非师范类的，侧重于生产应用，所学习课程是面向生物制药公司，发酵类公司，以及研发部门的。除学习了较宽广的生物基础知识外，我对生物技术的四大工程课程还有着较深入的学习。 第二篇：生物专业英文自我介绍
mynameisxxxx.iamanundergraduateofhenannormaluniversity,ma joringinbiotechnology.inthepastthreeyears,ididquiteagoodjobin mystudyandhadacquiredsystemicknowledgeofmymajor.besides,ipass edcet- 6andhaveobtainedthesecondprizeforbandcinthe2014and2014nationa lenglishcontestforcollegestudentstwice.ihavegoodcommunicative skillandstrongteamspiritwhichwillbeagreathelpformetofulfillmy masterdegreecourses.withregardtomycharacter,i'dliketosaythati amoptimisticandeasy- going.besidesstudyienjoywalkingwhichmakesmehealthyandmymindto ugh听. hefollowingismyresume.andtheencloseddocumentismyschoolrep ortofthepastthreeyears!ifishoulddelivertwoprofessor'recommend ationstoyou,iwillpostthemassoonaspossible.thanksforyourattent ion! 第三篇：生物专业英文自我介绍 生物专业英文自我介绍 mynameisxxxx.iamanundergraduateofhenannormaluniversity,ma joringinbiotechnology.inthepastthreeyears,ididquiteagoodjobin mystudyandhadacquiredsystemicknowledgeofmymajor.besides,ipass
生物科学专业简介
生物科学专业简介 一、培养目标 培养德、智、体、美全面发展，掌握生物科学的基本理论、基本知识、基本技能；能在科研机构、高等学校从事科研和教学工作，能在企业、事业和行政管理部门从事与生物科学有关的应用、研究、技术开发和管理等工作的应用型、复合型高级专门人才。 1．学历层次：四年本科，理学学士。 2．掌握的知识：生物科学的基本理论、基本知识、基本技能 3．具备的能力：能在科研机构、高等学校从事科研和教学工作，能在企业、事业和行政管理部门从事与生物科学有关的应用、研究、技术开发和管理等工作。 4．优势和特色：主要学习生物科学方面的基本理论和基本知识，接受从事生物学研究和技术应用的基本训练，具有研究、开发和应用生物科学各领域的基本能力。毕业实习根据学生的实际情况（兴趣爱好及就业）实行多样化培养。实行3+1培养模式，理论学习3年，最后1年为科研训练和试验操作能力的培养；开办生物科学实验班，对实验班的学生单独设定培养方案，部分专业基础及专业课进行双语教学，小班授课。定期聘请国内外一流专家学者与学生交流，全面培养学生科技创新素养；加强实践教学，提高学生的科研素养。采用一对一的导师制模式，从大一开始进行系统的学术研究能力培养。提供奖学金、创造条件提供国内外研修和交流机会；营造一流学术环境与氛围。 二、学习经历 1．主要基础课 （1）理论课 植物学、动物学、微生物学、生物化学、动物生理学、植物生理学、细胞生物学、分子生物学、发育生物学、遗传学、生物统计学。 （2）实验课
植物学实验、动物学实验、遗传学实验、细胞生物学实验、高级生化研究技术、动物生理学实验、植物生理学实验、微生物学实验技术等。 2．主要专业课： （1）理论课：发酵工程原理、基因与蛋白质组学、细胞工程、基因工程。 （2）实验课：分子生物学大实验Ⅰ、分子生物学大实验Ⅱ、发酵工程原理实验、细胞工程实验、综合实验操作。 3．主要实践项目： 入学教育、军训；毕业教育；专业及两课社会实践；毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想概论课程论文；植物学实习；发酵工程原理实习；科研训练与课程论文；毕业实习；毕业论文；创新教育。 三、就业情况： 近年来毕业生去向：攻读硕士研究生（约占40%）；其余为考取公务员及相关生物技术企业包括葡萄酒、啤酒酿造，制药，食品加工，生物公司等行业。 就业前景：主要到科研机构或、高等学校从事科学研究或、教学工作或在工业、医药、食品、农、林、牧、渔、环保、园林等行业的企业、事业和行政管理部门，从事与生物技术和生物科学有关的应用研究、技术开发、生产管理和行政管理等工作。
常用生物软件大汇总(精)
常用生物软件大汇总 序列综合分析 Vector NTI Suite 8.0 不喜欢装备各种专业性强的软件,而希望用一个综合性的软件代替的同志可以选择本软件。本阶段的大部分功能它都有。该软件具体特有良好的数据库管理(增加、修改、查找,对要操作的数据放在一个界面相同的数据库中统一管理。软件中的大部分分析可以通过在数据库中进行选定(数据->分析->结果(显示、保存和入库三步完成。在分析主界面,软件可以对核酸蛋白分子进行限制酶分析、结构域查找等多种分析和操作,生成重组分子策略和实验方法,进行限制酶片段的虚拟电泳,新建输入各种格式的分子数据、加以注释,输出高质量的图像。Vector NTI Suite 还有以下独立的分析程序,完成相关分析。这些独立的程序,可以通过选定->分析->结果三步调用。 l 3DMol-显示PDB格式分子的三维结构 l Align X-序列相似性比较 l Align Xblocks-序列局部完全相同比较 l ContigExpress-将小片段拼装成长序列 l GCGConverter-GCG格式文件转换成NTI的格式 l PubMed/Entrez Search-搜索PubMed、PDB、GenBank l Back Translation-核酸->蛋白->核酸反向翻译的工具 l Matrix Editor-矩阵数据编辑 l Tools Manager-连接其他程序和网络连接的界面。分成Align、Analyze、Assemble、Tools四部分。
DNAStar5.03即著名的Lasergene Suite,由EditSeq MegAlign、GeneQuest MapDraw PrimerSelect Protean SeqMan II七个模块组成,该软件的MegAlign模块,可以对多达64000的片段进行拼装。整个拼装过程即时显示,并提示可能的完成时间。拼装结果采用序列、策略等方式显示。DNAstar是哈佛大学医学院是使用的序列分析软件,可见其功能强大。 Omiga 2.0实际上,大部分对核酸蛋白的序列分析功能,在Omiga 2.0中都能找到;而且界面非常友好。Omiga作为强大的蛋白质、核酸分析软件,它还兼有引物设计的功能。主要功能:编辑、浏览、蛋白质或核酸序列,分析序列组成。用Clustal. W 进行同源序列比较,发现同源区。实现了核酸序列与其互补链之间的转化,序列的拷贝、删除、粘贴、置换以及转化为RNA链,以不同的读码框、遗传密码标准翻译成蛋白质序列。查找核酸限制性酶切位点、基元(Motif及开放阅读框(ORF,设计并评估PCR、测序引物。查找蛋白质解蛋白位点(Proteolytic Sites、基元、二级结构等。查寻结果可以以图谱及表格的显示,表格设有多种分类显示形式。利用Mange 快捷键,用户可以向限制性内切酶、蛋白质或核酸基元、开放阅读框及蛋白位点等数据库中添加或移去某些信息。每一数据库中都设有多种查寻参数,可供 选择使用。用户也可以添加、编辑或自定义某些查寻参数。可从MacVectorTM、Wisconsin PackageTM等数据库中输入或输出序列。另外,该软件还提供了一个很有特色的类似于核酸限制酶分析的蛋白分析,对蛋白进行有关的多肽酶处理后产生多肽片段。 DS gene :Omiga 2.0的换代产品,accelrys公司Discovery studio系列,accelrys 公司的insight II,GCG是业内蛋白分析和核酸分析的权威软件,DS gene 是GCG 的个人机简版,功能强大,而且可以直接与GCG服务器相连。由于受到vector NTI 的界面影响,DS gene 与Omiga 2.0相比界面有了很大的改变。 DNASIS for Windows 2.5版是日立软件公司(Hitachi Sofeware Engineering Co.,Ltd.97年推出的一个功能强大的序列分析软件。包含有大部分分子生物学软件的常用功能,可进行DNA,RNA,蛋白质序列的编辑和分析,甚至还能进行质粒作图、
生物工程专业主要课程简介
生物工程专业主要课程简介 1F12755 基础生物学学分：4.0 Basic Biology 预修课程：无机及分析化学、有机化学 内容简介：本课程主要介绍了什么是生命、生命科学的发展和研究方法、生命的物质基础、生命的结构基础-细胞、生命活动及生命的形态与建成，其中包括植物的生命活动及生命的形态与建成，被子植物的有性生殖和发育，动物的组织、消化和吸收，动物的循环和呼吸，动物的排泄和水盐平衡，动物的体内调节，动物的行为，动物的生殖和发育等。本课程还介绍了生命活动的维持——能量的获取与转换、生命的遗传与变异、生物体的防卫系统、生命的信息传递和处理、生命起源和生物进化、生物的分类和分界、生物与环境。 推荐教材：《现代生物学》，胡玉佳主编，高等教育出版社，1999年 主要参考书：《普通生物学——生命科学通论》，陈阅增主编，高等教育出版社，2004年 《Biology》（6th ed），Raven and Johnson 主编，McGraw-Hill Science ，2001年 《生物学原理》（影印版），Eldon D. Enger 主编，科学出版社，2004年 1F10693生物化学学分：4.0 Biochemistry 预修课程：无机及分析化学、有机化学、基础生物学 内容简介：本课程主要介绍生物化学的发展历史、生物化学研究中的重要化学概
念、组成蛋白质的20种天然氨基酸、蛋白质的化学组成、蛋白质的空间结构、几种重要蛋白质的结构与功能关系、蛋白质研究的方法学、酶催化原理、核苷酸和核酸的结构与功能、脂类的结构与功能、生物膜的化学组成、结构和跨膜运输原理、碳水化合物的结构与功能、生物能量学、生物分子的分解合成代谢和遗传信息的复制及表达调控机制。 推荐教材：《生物化学简明教程》（第三版），罗纪盛编高等教育出版社，2001年 《Biochemistry》，B.D.Hames，科学出版社，2000年 主要参考书：《生物化学》（上、下册），沈同等编，高等教育出版社，2002年《医学生物化学》，周爱儒编，北京医科大学出版社，2001年 1F11035 化工原理学分：4.0 Principles of Chemical Engineering 预修课程：高等数学、物理、无机及分析化学、有机化学、物理化学 内容简介：本课程阐明了化工过程开发步骤和方法及化学工程学的基本观点和方法，主要讲述流体流动过程基本原理及其应用(流体测量、流体输送)、热量传递过程基本原理及其应用（气体的吸收和液体的精馏过程计算），使学生在理解基本原理和方法的同时提高实际应用能力。 推荐教材：《化工原理》，南京化工大学编著，化学工业出版社 主要参考书：《化工原理》，华东化工学院编著，化学工业出版社 《化工原理实验》，南京化工大学编著，东南大学出版社 《化工原理》，蒋维钧等编著,清华大学出版社 《化工原理学习指导》，匡国柱主编,大连理工出版社
一些国外生物技术公司的简介
一些国外生物技术公司的简介 QIAGEN： 德国著名的试剂公司，该公司的核酸分离纯化系列基于多项专利技术，纯度高，产量高，快速方便，品种齐全，为世界知名品牌。其大多数产品以即用型试剂盒形式提供，随产品有非常详细的操作技术手册。此外，还提供优质的传染系统，RT/PCR反应系统（包括高特异性的逆转录酶及热启动的Taq酶），蛋白及多肽表达、纯化、检测分析系统。 Ambion： 该公司始终致力于开发RNA相关产品，在RNA的分离纯化、RACE、RT-PCR 方面有许多非常有特色的产品，并提供优质的Northern杂交体系，和高效的体外翻译体系。如今，其产品在RNA研究领域已经成为研究人员的首选品牌。 Invitrogen： 该公司成功地提供了PCR产物快速克隆试剂盒，及与之配套的系列产品，包括高效转染和转化试剂、高效感受态细胞、全面的原核及真核基因表达系统、酵母双杂交系统等多种特色产品。大大便利了分子克隆的全过程操作。其成功并购了Gibco/BRL，Novex，Research Genetics等知名公司，产品覆盖更为广泛。 Clontech： 现已成为B.D.公司旗下分子生物学主力舰。该公司的cDNA试剂盒、荧光蛋白报告基因系统、酵母双杂交系统、基因Array产品是独具特色的产品，其中一些试剂盒（GFP、Tet Off &On等）获得过多次大奖。Clontech公司聚集了一大批优秀的科学家，在分子研究的各个领域开发出了许多设计思路独特，快捷便利的试剂产品，紧跟科学前沿。 Strategene： 该公司的特色产品包括：预制基因文库、定制文库、文库构建产品、感受态细胞、高效转染试剂、点突变试剂盒、PCR仪及多种专利产品，在分子生物
启动子生物信息学分析软件
https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/seq_tools/promoter.html 2. PlantCARE（plant cis-acting regulatory elements）, a database of plant cis-acting regulatory elements http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtoo ls/plantcare/html/ 3. promoter 2.0 prediction server http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ 4. 启动子分析网址: 1 https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/seq_tools/promoter.html 2 http://alggen.lsi.upc.es/recerca/menu_recerca.html 3 http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ 4 https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/~molb470/ ... s/solorz/index.html 5 https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/molbio/proscan/ http://bip.weizmann.ac.il/toolbo ... ters.html#databases https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/seq_tools/promoter.html https://www.360docs.net/doc/234737555.html,.sg/promoter/CGrich1_0/CGRICH.htm https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/pub/programs.html#pmatch https://www.360docs.net/doc/234737555.html,.hk/~b400559/arraysoft_pathway.html#Promoter http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalup.html http://intra.psb.ugent.be:8080/PlantCARE/ http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/molbio/proscan/ https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/molbio/signal/ https://www.360docs.net/doc/234737555.html,/thread-41571-1-1.htm 常用启动子分析网址： http://bip.weizmann.ac.il/toolbox/seq_analysis/promoters.html#databas es
牛津大学生物科学专业
https://www.360docs.net/doc/234737555.html, 牛津大学生物科学专业本科包括了生物科学和生物技术两个专业方向，这些专业学科主要培养学生学习生物科学技术方面的基本理论、基本知识，学生将受到应用基础研究和技术开发方面的科学思维和科学实验训练，进而具有较好的科学素养及初步的教学、研究、开发与管理的基本能力。立思辰留学360介绍说，其核心课程主要包括了动物生物学、植物生物学、微生物学、生物化学、遗传学、细胞生物学、分子生物学、普通生态学等学科;必修课程则包括无机及分析化学、有机化学、大学数学、大学物理学、生物统计学、发育生物学、生物技术概论、进化生物学等。 牛津大学生物科学专业申请学术条件 ·A-levels: A*AA - The A* must be in a science or Mathematics ·Advanced Highers: AA/AAB ·IB: 39 (including core points) with 7 in HL Mathematics or a science ·或其他同等学历 在可能的情况下，您的成绩也会被特殊考虑。 申请人需要具有生物学(或人类生物学)IB级别高级，或同等级学历。我们希望您在所选的科学课程中，已经取得并通过了以上要求。 高中毕业文凭、中国大学入学考试或高考成绩对考生申请来说是不够的。
https://www.360docs.net/doc/234737555.html, 牛津大学生物科学专业申请英语要求 立思辰留学360介绍说，牛津大学的所有教学都是用英语进行的(除了一些特定语言的教学)，教师必须确信你有足够流利的书面和口语来应付你的课程。因此，所有非英语母语申请者必须满足下列条件之一： 雅思成绩：总分为7.0分(每个单项至少有7.0分)。 托福(纸质)：总分为600分，写作成绩为5.5分。 托福(互联网)：总分为110，听力22，阅读24，口语25，写作24。 剑桥英语：高级，也被称为高级英语证书(CAE)，A级，如果在2015年1月之前获得，至少185分。 剑桥英语：熟练，也被称为英语水平证书(CPE)，B级，如果在2015年1月之前获得，至少185分。 英语O-level：B级 国际学士学位标准(SL)：英文5分(A或B语言)。 欧洲文凭课程：英语成绩70%。