LI-6400光合作用仪..
光合仪模式使用说明
LI-6400便携式光合仪的使用说明1. 仪器使用功能LI-6400并非单一用于研究植物光合作用，他同时包括光合、呼吸（分为植物呼吸和土壤呼吸）、蒸腾、荧光等多项测量功能，多项功能的完全集成使得LI-6400成为生态学研究领域上重要的必不可少的基础研究设备。
其测量参数包括：净光合速率（Pn）、气孔导度（Gs）、蒸腾速率（Ts）、细胞间隙CO2浓度（Ci）、大气CO2浓度（Ca）、光量子通量密度（PFD）、叶温（TL）、相对空气湿度（RH）。
如果配备6400-40叶绿素荧光叶室，可测试以下参数：最大荧光（Fm）、初始荧光（Fo）、可变荧光（Fv）、光化学猝灭（qP）、非化学猝灭（qN）。
此外，进行自动测量的基础上还可以进一步计算饱和点、补偿点等多项重要生理生态指标。
表1 LI-6400参数表（主机显示屏测量菜单显示的参数说明，A-L是行号）3. 仪器使用流程3.1仪器安装连接，并连接好进气管缓冲瓶。
3.2打开位于主机右侧的电源开关。
3.3仪器在启动后将显示“Is the IRGA connected?(Y/N)”选择Y3.4叶室配置选择：选择目前安装的叶室配置，如已经安装了标准叶室，请选择Factory default，然后回车。
如果安装了荧光叶室，请选择6400-40 Default Flurometer，然后回车。
如果安装了土壤叶室，请选择6400-09 soil Chamber，然后回车。
其他叶室方法相同，只需要选择不同的叶室就可以了。
3.5调零向SCRUB方向拧紧碱石灰管和干燥管上端的螺母。
关闭叶室，即压下黑色手柄，并旋紧固定螺丝即可。
在主菜单按F3按钮选“Calib Menu”项①选“Flow Meter Zero”项（调气流量为零），回车等待流速的电压读数基本稳定，用F1、F2上下调节，至读数基本稳定，且在-0.5—0.5范围内，按EXIT按钮退出。
②选“IRGA Zero”（红外线气体分析仪探头调零），回车等待CO2浓度和H2O浓度的下降，至读数基本稳定（一般在20分钟左右），按F3“Auto All ”进行自动调节，结束后“Exit ”退出。
LI-6400简易使用手册(带功能行和参数行说明)
LI-6400便携式光合仪的使用说明1. 仪器使用功能LI-6400并非单一用于研究植物光合作用，他同时包括光合、呼吸(分为植物呼吸和土壤呼吸)、蒸腾、荧光等多项测量功能，多项功能的完全集成使得LI-6400成为生态学研究领域上重要的、必不可少的基础研究设备。
其测量参数包括：净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Ts)、细胞间隙CO2浓度(Ci)、大气CO2浓度(Ca)、光量子通量密度(PFD)、叶温(TL)、相对空气湿度(RH)。
如果配备6400-40叶绿素荧光叶室，可测试以下参数：最大荧光(Fm)、初始荧光(Fo)、可变荧光(Fv)、光化学猝灭(qP)、非化学猝灭(qN)。
此外，进行自动测量的基础上还可以进一步计算光饱和点、光补偿点、CO2饱和点、CO2补偿点等多项重要生理生态指标。
表1 LI-6400参数表(2. 硬件组成与存放正确的硬件连接与存放对于使用和维护来说是至关重要的。
关于仪器的连接请与培训人员联系学习。
图1 仪器在主机箱内的安放位置与名称(请注意安放的方式)3. 仪器使用流程3.1仪器安装连接：正确连接仪器管线，并连接好进气管缓冲瓶(注意样品室、参照室管路连接，信号线红色Mark 标记要相对，除去外置光量子传感器红色盖帽)。
3.2开机：打开位于主机右侧的电源开关。
3.3仪器在启动后将显示“Is the IRGA connected?(Y/N)” 选择Y 3.4叶室配置选择：选择目前安装的叶室配置，如果安装的是标准叶室，请选择Factory default ，然后回车。
如果安装了荧光叶室，请选择6400-40 Default Flurometer ，然后回车。
如果安装了土壤叶室，请选择6400-09 soil Chamber ，然后回车。
其他叶室方法相同，只需要选择不同的叶室就可以了。
3.5调零向SCRUB 方向拧紧碱石灰管 和干燥管上端的螺母。
关闭叶室(压下黑色手柄)，并旋紧固定螺丝即可。
LI6400光合作用测定仪产品性能介绍
二、电缆保养
1、留意不要将固定螺丝旋的太紧； 2、拔卸电缆时，要握住插头，不要直接拉电缆线；
留意：最近很多单位维修的仪器，在测量时显示〝 IRGAs Not Ready〞，为运用中拔电缆不正确所致。 3、寄存时，要将电缆盘起来； 4、最新的电缆接头是金属头，我们有配件可以改换。
三、剖析器的保养
1、叶室的维护 2、叶温热电偶的维护 3、婚配阀的维护 4、IRGA的维护
• 查在测量界面L行参数值。显示如以下图：
正常状况下，下面四个值都应在+/-5000内。
勇于开始，才能找到成功的路
通常仪器出厂时，CRagc_mv和CSagc_mv值都在0左近； HRagc_mv和HSagc_mv值在-1500左近。假设参照室 (CRagc_mv和HRagc_mv)值正常，而样品室(CSagc_mv和 HSagc_mv)值很高，在2000-5000之间或更高，说明样品室内 较脏，需求对叶室和光路清洁保养。
1、叶室的维护
• 叶室封锁 • 叶室的封锁时，叶室的调理螺丝不能旋的太紧，否那么容 易将闭锁杆折断。
• 调理叶室的正确方法是：闭合叶室，调理螺丝使上下叶室 封锁即可。判别叶室能否漏气：对着叶室吹口吻，看样品室 CO2(CO2_S)能否动摇很大。假设叶室闭紧后仍漏气，能够泡 沫垫圈需求改换。
•泡沫垫圈维护 • 维护叶室泡沫垫圈十分重要。光合仪不运用时，应松开叶 室闭锁。假设长时间不松开闭锁，泡沫垫圈不时处于受压榨形 状，叶室上黑色的氯丁(二烯)橡胶垫圈经过一昼夜能够恢复弹性， 但LED红蓝光源上的白色垫圈将失掉弹性，无法恢复。
抽出塑胶座：塑胶座可以直接从叶室上抽出。假设觉得太紧， 可以左右的旋转一下。不要拉热电偶的连线。
拔出新的热电偶：稍许润干冷电偶O形密封圈，或许运用大 批硅脂，这样装新热电偶就比拟容易。
LI-6400便携式光合仪操作使用规程
LI-6400便携式光合仪操作使用规程仪器使用范围：植物单叶或群体光合速度、蒸腾速率、气孔导度、光饱和点和补偿点、二氧化碳饱和点和补偿点等。
1、开机：打开位于主机右侧的电源开关。
仪器在启动后将显示“Is the IRGA connected? (Y/N)”选择Y2、叶室配置选择：选择Factory default（常规）或他叶室（6400-02B红蓝光源），然后回车自动进主菜单。
3、手动测量：按F4“New Measurements”菜单进入测量菜单。
①设定文件：按F1“Open Logfile”建立新文件。
回车后输入自己设定的文件名。
当显示屏出现提示“Enter Remark”时，输入需要的标记(英文，用于标记样地、植物种类、样品号等)。
继续回车，文件设置结束。
在夹入叶片之前如果ΔCO2大于0.5或小于-0.5，按F5“Match”进行匹配。
②测量：选取需要测量的植物叶片(3-5次重复)。
测量时间尽量选择在晴朗的上午10：00-11：30间最好。
③向Bypass方向拧紧碱石灰管和干燥管上端的螺母。
夹上叶片(尽量让叶片充满整个叶室空间，面积为6cm2，小叶片需测量面积，并在测量菜单状态下按数字“3”后按F1来修改叶面积值，关闭叶室，旋紧固定螺丝至适度位置。
④等待C行PHOTO读数稳定（小数点后最后一位数字的波动在2左右）后即可记录 (按F1“LOG”按钮或者按分析仪手柄上的黑色按钮2秒即可记录一组数据。
⑤换叶片进行下一次测量。
重复②--④步骤。
4、自动测量与环境条件控制LI-6400可以控制的环境条件包括温度、CO2浓度、光强等。
一般而言，需要控制环境条件的实验有两种情况。
一种是环境变化剧烈，无法准确进行同等环境条件的测量。
另一种情况是进行光曲线和ACI曲线测量。
环境控制只需要在手动测量时，按数字来切换菜单。
具体各菜单情况如下图所示。
温度控制：按数字2，按F4控制温度(输入需要的温度回车即可，注意温度控制范围是环境温度的±6℃)。
LI-6400系列光合仪使用说明书
CO 2/H 2O 分析器位于传感器的头部， 消除了气体交换测量的时滞； （ 3）可自动或手动控制叶室内部的环境条件 （ CO 2 浓度、光照强度、相对湿度、温度等）； （ 4）具有多个自动测量程序，如光响应曲线、 CO 2 响应曲线、光诱导曲线、 光呼吸曲线、荧光 CO 2 响应曲线、荧光光响应曲线、荧光动力学曲线、荧光循环曲线等。多年的实践表明，即使在 野外恶劣的环境条件下， LI-6400 系列光合仪的分析器和传感器依然能够保持强大的功能和高可靠性。
合用户的使用经验和实验需求，对这些使用手册进行了重新整合和优化，进一步提高了使用手册前后的连贯性和一
致性。该使用手册的主要内容包括光合作用测量的理论基础、
LI-6400 系列光合仪的发展、硬件介绍、使用方法、应
用实例、维护和保养等。对于初学者，该使用手册将缩短其学习时间，达到事半功倍的效果；对于熟练掌握者，该
根据 CO 2 及 O2 体积的变化，主要有微量定积检压法； （ 3）根据 O2 浓度的变化，主要有氧电极法； （ 4）根据 CO 2
浓度的变化：
酸度法、 碱吸收法、
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C 标记法、
红外气体分析法、
微气象法。 目前， 最常见的方法是红外气体分析法。
三、便携式光合仪的发展历程
简单配置阶段： 20 世纪 50 年代初开始应用，其配置相对简单，只有叶室（或同化箱）及相应气路和气泵等配
6、 连接完成，如图？所示。
5
第四章 测量参数与计算参数
一、测量参数
缩写
参数
单位
行号
CO 2R_μ ml 参比室 CO 2 浓度 μmol CO2 mol -1
CO 2S_μ ml 样本室 CO 2 浓度 μmol CO2 mol -1
LI-6400常见问题处理
注意
仪器进水处理
为将损失降低到最小，请即刻按如下规程处理： 1. 一旦发现进水，立刻关机 2. 立刻清理主机外部进气管道，包括进气管道、苏打瓶和 的损失降到最少 4. 并注明出事时间、处理办法、及您观察到的其它问题
匹配(match)时仪器显示 “leak” 时仪器显示 匹配
1. 初次匹配缘故：有时为假报警，连续匹配2-3次后消失， 如果不消失为真漏气； 2. 缓冲瓶容量不够； 3. 通气管道未连接好； 4. 叶室未夹紧； 5. 气路垫圈丢失或未装好； 6. 叶室密封圈失去弹性。
CO2/H2O不稳定问题 不稳定问题
光合仪漏气问题
一、漏气查找 如果CO2读数不稳定，就要注意是否有漏气的地方。 二、分析器头或主机? 如果参照室浓度稳定，样品室浓度不稳定，表示分析器头某处 有漏气。如果两室都不稳定，应考虑主机有漏气。 1、分析器头漏气 •如果参照室是稳定的，闭合叶室做一下漏气测试：在叶室周 围吹气，看样品室CO2是否有反应。 •为了确定漏气位置，可以使用小细管向选定的位置吹气。
检查线索： • O-rings(O形圈) 确定6个O形圈在适当位 置(叶室和IRGA叶室基 座间)，清洁稍加润滑。 • Gaskets(叶室垫圈) Gaskets( ) 是否在中间？下面是否 安装有皱缩，导致漏气？ 不要忘记后面的3-孔垫 圈。
2、导气软管漏气 不是很常见，但有时由于软管接头处O形圈老化、磨损或破裂 造成漏气。 3、主机漏气 主机漏气，常常是化学管漏气。可以向化学管吹气，几秒钟 后参比和样品CO2浓度将迅速升高。(最好在CO2 scrub On情 况下进行，因此进入正常空气进气口的呼吸气体都被吸收)。
“IRGAs Not Ready”问题 问题
光合仪使用说明及注意事项
LI-6400便携式光合仪的使用说明1. 仪器使用功能LI-6400并非单一用于研究植物光合作用，他同时包括光合、呼吸（分为植物呼吸和土壤呼吸）、蒸腾、荧光等多项测量功能，多项功能的完全集成使得LI-6400成为生态学研究领域上重要的必不可少的基础研究设备。
其测量参数包括：净光合速率（Pn）、气孔导度（Gs）、蒸腾速率（Ts）、细胞间隙CO2浓度（Ci）、大气CO2浓度（Ca）、光量子通量密度（PFD）、叶温（TL）、相对空气湿度（RH）。
如果配备6400-40叶绿素荧光叶室，可测试以下参数：最大荧光（Fm）、初始荧光（Fo）、可变荧光（Fv）、光化学猝灭（qP）、非化学猝灭（qN）。
此外，进行自动测量的基础上还可以进一步计算饱和点、补偿点等多项重要生理生态指标。
表1 LI-6400参数表（主机显示屏测量菜单显示的参数说明，A-L是行号）2. 硬件组成与存放正确的硬件连接与存放对于使用和维护来说是至关重要的。
关于仪器的连接请与培训人员联系学习。
图1 仪器在主机箱内的安放位置与名称（请注意安放的方式）关闭叶室，确定叶室关闭紧密，接上电池插头，开主机3. 仪器使用流程3.1仪器安装连接，并连接好进气管缓冲瓶。
3.2打开位于主机右侧的电源开关。
3.3仪器在启动后将显示“Is the IRGA connected?(Y/N)” 选择Y 3.4叶室配置选择：选择目前安装的叶室配置，如已经安装了标准叶室，请选择Factory default ，然后回车。
如果安装了荧光叶室，请选择6400-40 Default Flurometer ，然后回车。
如果安装了土壤叶室，请选择6400-09 soil Chamber ，然后回车。
其他叶室方法相同，只需要选择不同的叶室就可以了。
6400-02B 红蓝光源6400-03充电电池主机分析仪与叶室主机与分析仪的连线CO 2注入系统野外支架（4根）3.5调零向SCRUB方向拧紧碱石灰管和干燥管上端的螺母。
LI-6400光合作用仪
打开已有文件名：
对于一个已经存在的文件名，可以在OpenLogFile 下直接用下箭头查 找，确定，直接选中，回车，界面出现如下右图所示的提示，提醒用户， 此文件名已经存在，请问有三种选择，O、A、C；
O为Overwrite，即将此文件名下以前记录的数据全部覆盖掉，这种方 式会将之前保存在该文件名下的数据全部丢失，所以一般很少选择； A为Append，即追加，即在该文件名下已有的数据后面继续追加新的 数据记录，这是最常用的选择；
C为Cancel，即取消使用这个文件名，重新建立一个文件名
5.进行测量
预热期间的检查
1）检查温度
检查h行三个温度值Tblock, Tair和 Tleaf，是否合理，且彼此相差应该 在1℃以内； 叶温热电偶的位置是否正确，直接测量叶片温度时，叶温热电偶的结 点位置应高于叶室垫圈约1mm，保证夹叶片时能与叶片充分接触；如果 使用能量平衡方法测量叶片温度，则叶温热电偶的结点位置应低于叶室 垫圈1mm，确保夹叶片时，接触不到叶片。
仪器硬件介绍
CF卡、无线网卡插槽
主机
连接线
分析器
主机
化 学 药 品 管 端 管 线 连 接 端
2.LI-6400XT光合仪测量基本原理
光合作用 光合作用（ Photosynthesis ），即光能合成作用，是 植物、藻类和某些细菌，在可见光的照射下，利用光合色 素，将二氧化碳和水转化为有机物，并释放出氧气的生化 过程。 光合作用是一系列复杂的代谢反应的总和，是生物界 赖以生存的基础，也是地球碳氧循环的重要媒介。
样品测量
（1）打开叶室，夹好测量的样品
（2）按1, F1（Open LogFile）, 选择将数据存入的位置（主 机 or CF卡），建立一个文件，enter ，输入一个remark ， enter （3）等待a行参数稳定，b 行ΔCO2值波动 < 0.2 μmol mol-1， Photo 参数稳定在小数点之后一位； c行参数在正常范围内 （0 < Cond < 1、Ci > 0、Tr > 0）
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2）检查光源和光量子传感器
检查光源是否工作，且工作正常； 检查g行
ParIn_μm 和ParOut_μm传感器是否有响应。
3）检查大气压传感器
检查g行Prss_kPa值是否合理。一般在海平面大气压值约 100kPa
，海 拔1000英尺大气压为 97 kPa ，5000英尺约83 kPa 且随天气变化，大气 压可能会有1到2 kPa的变化
6）检查CO2和H2O IRGAs零点
将两个化学管都旋至完全吸收位置，完全闭合叶室； 等待大约 5 分钟，参比室和样品室 CO 2和 H 2 O 会降到零附近。如果 CO 2
读数在±5ppm以内，且ΔCO2在±1ppm以内；H2O在±0.5毫摩尔每摩 尔以内，且ΔH2O在±0.1毫摩尔每摩尔以内，说明零点正常，不需要校 准。如果它们超过这个范围，我们建议您再等大约10min。如果还不能达 到要求，需进入校准菜单，进行IRGAs zero。
光合作用基本原理
光照
CO２+2H２O*
光合色素
(CH２O)＋O*２ +H２O
光合作用 可分为光反应和碳反应（或暗反应）两个阶段
光合系统的测定原理
特点：开路式、差分法 开路式：保证实时测定当前环境下的光合作用，不受植物自 身影响。
差分法：样品室和参比室之间CO2 /H2O的浓度差。精确计算
出植物的CO2同化速率和蒸腾速率。
3.化学药品管的正确位置
两个原则： 1）、利用缓冲瓶保证进气稳定的非控制环境实验，则两个化学药品管均 在完全Bypass的位置； 2）、使用CO2注入系统来给系统提供 CO2气体，则苏打管在完全 Scrub， 干燥管在完全Bypass；
4.新建一个文件名或打开已有文件名的操作 新建文件名步骤：
在主菜单界面进入F4（New Msmnts）；按F1（Open LogFile）， 定义一个文件名，如输入test，文件名可以保存到当面默认的User下，也 可以通过按F1（Dir）重新定义路径，按上箭头选中 Flash，将文件保存 到Flash（主机箱后槽安装有CF卡时）下。无论保存在User下还是Flash 下，回车，完成此步骤，出现添加或编辑一个Remark的提示，输入需要 进一步提示的内容，回车，完成文件名的新建，界面进入准备测量界面。
LI-6400XT光合系统气体流程图
开路式原理：分析器与叶室直接相连（见图红色虚框）
分析器俯视图
分析器侧视图
匹配（match）原理示意图
3.测量过程的主要内容
日常检查
校准 (Calib Menu)
样品测量
光合基本测量过程
1.硬件连接 2.开机预热
预热15~20mins，在此过程中，可以做一些仪器的简单检查。预热后继 续做“日常检查之预热后检查”工作。
C为Cancel，即取消使用这个文件名，重新建立一个文件名
5.进行测量
预热期间的检查
1）检查温度
检查h行三个温度值Tblock, Tair和 Tleaf，是否合理，且彼此相差应该 在1℃以内； 叶温热电偶的位置是否正确，直接测量叶片温度时，叶温热电偶的结 点位置应高于叶室垫圈约1mm，保证夹叶片时能与叶片充分接触；如果 使用能量平衡方法测量叶片温度，则叶温热电偶的结点位置应低于叶室 垫圈1mm，确保夹叶片时，接触不到叶片。
打开已有文件名：
对于一个已经存在的文件名，可以在OpenLogFile 下直接用下箭头查 找，确定，直接选中，回车，界面出现如下右图所示的提示，提醒用户， 此文件名已经存在，请问有三种选择，O、A、C；
O为Overwrite，即将此文件名下以前记录的数据全部覆盖掉，这种方 式会将之前保存在该文件名下的数据全部丢失，所以一般很少选择； A为Append，即追加，即在该文件名下已有的数据后面继续追加新的 数据记录，这是最常用的选择；
预热后的检查然后在叶室四周吹气，
如果发现A行样品室CO2的读数变化小于2微摩尔，说明叶室密封的比较 好，没有漏气。如果变化超过2ppm以上，说明叶室哪儿可能有漏气。 常发生叶室漏气的地方：叶室垫圈；上下叶室的 O形密封圈；另一个 可能漏气的地方是排气管。
仪器硬件介绍
CF卡、无线网卡插槽
主机
连接线
分析器
主机
化 学 药 品 管 端 管 线 连 接 端
2.LI-6400XT光合仪测量基本原理
光合作用 光合作用（ Photosynthesis ），即光能合成作用，是 植物、藻类和某些细菌，在可见光的照射下，利用光合色 素，将二氧化碳和水转化为有机物，并释放出氧气的生化 过程。 光合作用是一系列复杂的代谢反应的总和，是生物界 赖以生存的基础，也是地球碳氧循环的重要媒介。
LI-6400XT光合-荧光测定仪
1.LI-6400XT光合-荧光测定系统简介
LI-6400XT并非仅可用于研究植物光合作用，他同时包括光合、呼吸 （分为植物呼吸和土壤呼吸）、蒸腾、荧光等多项测量功能，多项功 能的完美集成使得 LI-6400XT成为生态学研究领域上重要的必不可少 的基础研究设备。其测量参数包括：净光合速率（ Pn ）、气孔导度 （Gs）、蒸腾速率（Ts）、细胞间隙CO2浓度（Ci）、大气CO2浓度 （ Ca ）、光量子通量密度（ PPFD ）、叶温（ TL ）、空气相对湿度 （RH）。 如 果 配 备 6400-40 叶 绿 素 荧 光 叶 室 ， 可 测 试 以 下 参 数 ： 最 大 荧 光 （Fm）、初始荧光（F0）、可变荧光（Fv）、光化学猝灭（qP）、非 化学猝灭（qN/NPQ）。 此外，配备6400-02LED红蓝光源和6400-01CO2注入系统还可进行自 动测量多种响应曲线，如光响应曲线、CO2响应曲线等，并在相关模 型支持下进一步计算光饱和点、光补偿点、表观量子效率、CO2饱和 点、CO2补偿点、羧化效率等多项重要生理生态指标。
4）检查是否存在气路堵塞
设定流速为1000，化学管旋钮拧到从完全bypass ，检查仪器实际流速
能否达到650以上，然后将化学管旋钮从完全bypass调节到完全scrub， 检查仪器实际流速能否达到650以上，如果都能达到，则说明气路没有堵 塞；如果发现有达不到的现象，则首先检查苏打管再检查干燥剂管，方 法都是将调解旋钮从一侧完全旋到另一侧，检查流速下降是否大于10， 如果大于10，则存在堵塞。