生物群落多样性的测度方法讲解

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生物多样性的测度方法

生物多样性的测度方法

生物多样性的测度方法一、物种多样性测度方法:1. 物种丰富度(Species richness):指在一个特定地域或样地中物种的数量。

物种丰富度越高,生物多样性越丰富。

2. 物种均匀度(Species evenness):衡量各物种个体数量的分布均匀程度。

若各物种个体数量相对平均,物种均匀度较高。

3. Simpson指数(Simpson's index):用于衡量物种丰富度和均匀度的综合指标,数值越小表示物种多样性越高。

4. Shannon-Wiener指数(Shannon-Wiener index):度量物种多样性的指标,考虑了物种在一个区域内出现的频率和相对丰度。

二、遗传多样性测度方法:1. 遗传变异度(Genetic variation):通过测量表型或基因频率上的变异,来评估群体内部的遗传多样性。

2. 核酸序列差异(Nucleotide sequence divergence):通过比较不同个体或种群之间的基因或基因组的核酸序列,来评估遗传多样性。

3. 随机增殖多态性(Random amplified polymorphic DNA,RAPD):使用PCR技术扩增一些随机选择的DNA片段,通过分析片段的长度变异来评估遗传多样性。

三、生态系统多样性测度方法:1. 生境多样性(Habitat diversity):用于描述一个地区或区域内不同生境类型的数量和种类。

生境多样性越高,生态系统多样性越丰富。

2. 生物量(Biomass):指生态系统中所有生物的总生物质量,可以作为评估生态系统多样性的指标。

3. 功能多样性(Functional diversity):指在一个生态系统内不同物种的功能差异。

一个生态系统内具有更多的功能多样性,可以提高其稳定性和生态系统功能。

以上只是一些常用的生物多样性测度方法,随着科学的发展,还会有更多新的测度方法不断涌现。

这些测度方法可以帮助我们更好地理解和评估生物多样性,从而制定出更有效的保护措施,确保地球上各种生物的持续繁荣。

生物群落多样性的测度方法讲解

生物群落多样性的测度方法讲解
D=1- λ
当两个个体从无限大的群落中随机抽取时,得到多样性 测度为:
S
因此: D 1 (Pi)2 =也称Gini指数
i 1
• 种间相遇指数PIE (Hurlbert, 1917)
该指数表示不同物种的个体在随机活动情况下相遇 的概率,可证明PIE=D
2. Shannon-Wiener多样性指数
• Motomura 1932 首先应用几何级数(等比级数)拟合
E-总资源量;P-最重要物种占有资源的比例 • 适用于物种贫乏的环境或群落演替的早期阶段
Logarithmic series distribution
• Fisher 1943 鳞翅目昆虫的物种多度分布时应用
级数分布形式:f(x) = α Xn/n 为具n个个体的物种数目 求和得到: S= α[-ln (1-x)]
物种多样性指数
• 物种多度分布模型中的拟合参数可作为多样性 指标来描述群落的多样化程度
• 但是
某些理论分布的参数与样本大小无关,不宜做多样性指 数; 观察数据不能很好的与理论分布拟合; 某些群落在做多样性测度时尚不清楚其多度分布格局。
• 所以 产生了众多与分布格局独立的多样性测度方法。
物种多样性指数 (diversity index or biodiversity index)
• 物种多度分布(而非多度)——理论分布拟合 对数正态分布;几何级数分布; 对数级数分布;分割线段模型
Log normal model
• Preston1948 美国纽约某山谷鸟类群落分布:很稀疏的 种类似乎不多于富集的种类,最多的物种属于个体数量 中等状态的物种
S
log2N
Geometric Model -niche pre-emption model

《2024年生物群落多样性的测度方法Ⅰα多样性的测度方法(上)》范文

《2024年生物群落多样性的测度方法Ⅰα多样性的测度方法(上)》范文

《生物群落多样性的测度方法Ⅰα多样性的测度方法(上)》篇一生物群落多样性的测度方法:Ⅰ. α多样性的测度方法(上)一、引言生物群落多样性是生态学领域中一个至关重要的概念,它反映了生物群落内部物种的丰富程度和均匀度。

α多样性作为群落多样性的一个重要组成部分,主要描述了单个群落或生境内物种的丰富性和均匀性。

正确而精确地测量α多样性对于了解群落结构、功能及其与生态环境的关系具有重要意义。

本文旨在探讨生物群落多样性中α多样性的测度方法,主要从上篇来详述,以便更深入地理解并运用这些方法。

二、α多样性的基本概念α多样性通常通过以下几个指标来衡量:物种丰富度、香农-维纳指数、辛普森指数等。

这些指标都旨在从不同角度反映群落内部的物种组成、分布和丰富程度。

物种丰富度简单明了,直接统计群落内的物种数量;而香农-维纳指数和辛普森指数则更加综合地考虑了物种的丰富度和均匀度。

三、物种丰富度的测度方法1. 物种计数法:最直接的方法是对群落内的每个物种进行计数,然后求和得到物种总数。

这种方法简单易行,但仅能提供基本的物种数量信息。

2. 密度/频率统计法:在有些情况下,如果某些物种在数量上占绝对优势,仅仅计数所有物种可能无法准确反映多样性情况。

这时,可以考虑通过统计每个物种的密度或频率来更好地了解物种组成。

四、香农-维纳指数的测度方法香农-维纳指数(Shannon-Wiener Index)是一种更为综合的多样性测度方法。

它不仅考虑了物种的数量,还考虑了物种的均匀度。

该指数通过计算每个物种的相对数量(如个体数或生物量)的对数转换值,并加权求和得到。

香农-维纳指数的值越高,表示群落的多样性越高。

五、辛普森指数的测度方法辛普森指数(Simpson Index)是另一个常用的α多样性测度指标。

它基于群落内不同物种之间的相对数量关系进行计算,与香农-维纳指数类似,但计算方式略有不同。

辛普森指数强调的是群落内物种的分布情况,对于一些特别占优势的物种具有一定的敏感性。

生物群落多样性的测度方法多样性的测度方法

生物群落多样性的测度方法多样性的测度方法

生物群落多样性的测度方法多样性的测度方法一、本文概述本文旨在探讨生物群落多样性的测度方法。

生物群落多样性作为生物学研究的核心领域之一,对于理解生态系统的稳定性、物种间的相互作用以及生物多样性的保护具有重要意义。

本文首先将对生物群落多样性的基本概念进行界定,并阐述其研究的重要性和价值。

随后,本文将详细介绍几种常用的生物群落多样性测度方法,包括物种丰富度指数、物种均匀度指数和物种多样性指数等。

这些方法在生态学研究中被广泛应用,可以帮助我们量化描述生物群落的组成和结构。

在介绍完测度方法后,本文将对这些方法的优缺点进行分析,并讨论其在实际应用中的限制和适用范围。

本文还将探讨生物群落多样性测度方法在不同生态系统中的应用,以及它们在生物多样性保护、生态恢复和环境监测等领域的潜在应用。

本文将对未来生物群落多样性测度方法的发展趋势进行展望,以期为生态学研究和生物多样性保护提供有益的参考和启示。

二、生物群落多样性的基本类型生物群落多样性可以从多个维度进行测度和理解,这些维度包括但不限于物种多样性、生态系统多样性和遗传多样性。

物种多样性:物种多样性是最直观也是最常见的生物群落多样性类型。

它主要关注群落中物种的种类和数量,以及物种间的相对丰度。

常见的物种多样性测度方法包括物种丰富度(群落中物种的总数)、物种均匀度(不同物种在群落中的分布均匀程度)和物种优势度(群落中优势物种的影响力)。

生态系统多样性:生态系统多样性关注的是群落内部不同生态系统或生境的类型和数量。

这包括森林、草原、湖泊、河流等不同类型的生态系统。

生态系统多样性的测度方法可能涉及生态系统的类型数量、空间分布、以及各生态系统间的相互作用和联系。

遗传多样性:遗传多样性是生物群落多样性的重要组成部分,它涉及到物种内部遗传变异的程度和分布。

遗传多样性对于物种的适应性和生存能力具有重要影响。

常见的遗传多样性测度方法包括基因多样性指数、遗传距离和种群结构分析等。

这些基本类型的生物群落多样性是相互关联、相互影响的。

第九章 群落物种多样性的测度方法

第九章 群落物种多样性的测度方法

第二节 物种丰富度的测度方法
• 能全部计数的群落的物种丰富度较易获 得,而不能全部计数的群落其丰富度的 估计要采用抽样方法。
一、少量样方估计法 Rarefaction method
• 问题:A群落中抽取了2200个个体,它们 分别属于125个物种,B群落中抽取了750 个个体,它们分别属于75个种。两群落 谁的物种丰富度高?
B群落=1- (0.32+0.32+0.42)=0.66
• 在群落中任一抽取两个个体,如果不可 能是同一物种,则群落的异质性较高。 如果属同一物种,则群落的异质性较低。
三、均匀性Eveness
• 指群落中各物种个体数的分配状况。 • 如果各物种的个体数相等,则均匀性最
高。
问题
• A群落有5个物种,各物种个体数分别为 50,20,5,15,10。B群落有3个物种, 各物种个体数分别为30,30,40。试问哪个 群落的物种多样性高?
二、Jackknife估计法
• 调查时只记录物种是否存在,而不考虑 其个体数
• 统计唯一种的种数。 • 唯一种是指仅在一个样方中出现的物种。
物种 样方A B C D E F
1 1 0 01 0 1
2 0 1 00 0 0
3 1 1 11 0 1
4 0 0 001 0
• 物种数的估计方法

S

s

(n
1)

k
n
s:为n个样方中观察到的总物种数; n:为总抽样样方数; k:为唯一物种数。
• 适用条件 – 群落中的稀有物种相对较少。 – 调查的样方数要多。
• 阅读P153中例子 –例中哪5个物种为唯一种?
三、种与面积曲线估计法

《2024年生物群落多样性的测度方法Ⅰα多样性的测度方法(上)》范文

《2024年生物群落多样性的测度方法Ⅰα多样性的测度方法(上)》范文

《生物群落多样性的测度方法Ⅰα多样性的测度方法(上)》篇一生物群落多样性的测度方法:Ⅰ. α多样性的测度方法(上)一、引言生物群落多样性是生态学研究的核心领域之一,其涉及到的范围从微观的遗传多样性到宏观的地理分布多样性。

作为生态系统功能和结构的重要评价指标,生物群落多样性的研究方法与技术手段不断更新与完善。

其中,α多样性作为群落多样性的一个重要组成部分,其测度方法在生态学领域具有广泛的应用。

本文将重点介绍α多样性的测度方法及其应用。

二、α多样性的概念α多样性,又称群落内多样性或物种丰富度,是描述单一群落内部物种数量及其相对丰度的指标。

它反映了群落内部物种组成的复杂性和均匀度,是衡量生态系统健康和稳定性的重要参数。

三、α多样性的测度方法1. 物种丰富度(Species Richness)物种丰富度是最直接反映群落多样性的指标之一。

其具体方法包括物种数目、香农指数等。

其中,物种数目是指一个群落内所有物种的数量,这种方法简单易行,能够直观地反映出群落的多样性。

然而,该方法忽略了个体数量和相对丰度等因素的影响。

香农指数则综合考虑了物种的丰富度和均匀度,是一个更综合的多样性测度方法。

其计算涉及到的数学公式能反映群落内的种类组成比例以及它们的数量关系,对研究区域进行客观地分析评价。

2. 优势度指数(Dominance Index)优势度指数则是用于评估某物种在群落中的主导地位或相对重要性。

在生物群落中,一些物种可能占据着较大的比例或具有较高的数量优势,这些物种被定义为优势种。

优势度指数通过对优势种在群落中的分布情况进行分析,可以更深入地了解群落的生态结构与动态变化。

3. 均匀度指数(Evenness Index)均匀度指数则用于衡量群落中各物种个体数量的分布均匀程度。

它能够反映群落的稳定性及对环境变化的响应能力。

常见的均匀度指数包括Pielou均匀度指数、Berger-Parker指数等。

Pielou 均匀度指数能够体现各物种的个体数量差异和整体均匀程度,而Berger-Parker指数则适用于简单评估特定物种种群内的均匀程度。

第十章 生物群落多样性的测度方法(马克平)

第十章 生物群落多样性的测度方法(马克平)

第十章 生物群落多样性的测度方法 马克平 1引言  生物群落是在一定地理区域内其内部存在言极为复杂的相互联系即系统的加合性或突生性使得该集合体或生态单元具有与组成它的种群不同的静态和动态特征结构在一定的景观或区域内而景观的异质性格局是由生物群落的多样性决定的不论从概念上还是测度方法上都相对比较成熟而对于功能和动态多样性的研究则甚为少见但实践上难度较大以往的群落多样性研究除旨在揭示群落客观存在的物种还试图通过结构与功能间相关关系来间接地揭示群落的功能多样性当时的工作主要集中于群落中物种ArrheniusGleason192519341932英国多样性指数的概念1958年用此函数来测度多样性此后又有大量的多样性测度指数提出它都是把物种数和均匀度结合起来的一个单一的统计量就形成了大量的物种多样性指数物种多样性已是一个无用的概念Hurlbert一些学者试图提出更具普遍意义的多样性指数表达式以包括已经提出的重要的多样性指数Hill此外1964等还提出了均匀度的测度公式自70年代中期以来1972197519751984等对生物群落多样性测度方法进行了比较全面的综述  我国在节肢动物群落多样性万方浩等吴亚等尤民生等1992高宝嘉等李代芹等彭少麟等王伯荪等钱宏高宝嘉等郝占庆等物种相对多度模型物种丰富度与相对多度综合形成的指数是最简单直至目前特别是植物生态学家使用MagurranBeaman等则物种丰富度会提供很有用的信息物种丰富度几乎是没有意义的换言之但二行之间又没有确定的函数关系一般采用两种方式用单位面积的物种数目Hurlbert来测度物种的丰富程度一般用每平方米的物种数目表示即数量丰度这种方法多用于水域物种多样性研究Kempton等样方大小往往是不同的500个个体此时因为样方的大小对物种丰富度有很大的影响SandersRarefaction technique19681971  ∑−−−−−=]})!(/!/[])!(!/)![(1{)(i i iin N n N n NN n N N S E 式1 式中S N为拟稀疏标准化的样方中记录的个体总数 这种方法虽然提高了不同大小的样方间物种丰富度的可比性Magurran在可能的情况下尽量采用同样大小的样方物种丰富度除用一定大小的样方内物种的数目表示外dwhittaker其中比较重要的有dGL=S/lnA (Gleason,1922) 式2 dMa=(S-1)/lnN (Margalef,1958) 式3 dMe=S/N1/N (Menhinick,1964) 式4 dMo=S/N (Monk,1996) 式5 式中 N为所有物种的个体数目  A为样方面积 物种丰富度是物种多样性测度中较为简单且生物学意义明显的指数关键的环节是样方大小的控制WhittakerMagurranConnor等这种方法也存在着很多不足之处不能全面地反映群落的多样性水平潜在定居者的数量距离定居者来源地的远近群落面积的人小和群落内物种问的相互作用等 2 物种的相对多度模型 物种的绝对多度可以以个体数量植物盖度基面积以及生产力等为测度指标为了讨论方便  物种丰富度是指一定大小的样方中的物种数目也可以用生物量的差异忽略富集种Rare Species至少对于信息的利用是不充分的大多数生物群落都由许多物种组成Pielou如果答案是肯定的其普适性如何种曲线如二的唯一的理论分布形式那么就可能揭示出参数值与其描述的群落类型之间的有意义的相互关系MagurranPielouFisher等May在对群落中物种多度分布格局不了解的情况下否则会导致错误的结论Fisher等当物种多度服从对数正态分布时1973作为多样性指数的n*一02作为多样性的测度指标两个分量1971和1og李典漠即物种重要性顺序Ranked-abundance list只有少数几个种时列出所有的物种多度表样方中含有大量物种个体数少的稀疏种很多时最常用的方法是列出由r个个体组成的物种的数目fr(r=1显然这样做的结果即可形成物种Pielou物种多度的分布可以由若干理论分布拟合Pielou么枕生等Wilson有4个理论分布模型效果较好PiclouMayMcNaughtonMagurranWilson对数止态分布对数级数分布和分割线段模型2 1 几何级数分布元村勋首次用几何级数收到了极好的效果提出了生态位优先占领假说群落中物种对资源的占有作如下分配位优势种优先占领有限资源的一定部分依此类推同时假设每个物种的个体数量与它所占领资源的多少成比例或生物量是第二位优势种的若干倍Whittaker1972  1)1([−−=r r p p E A 式6 式中  p为最重要物种占有资源的比例如果第一个物种利用总资源量的13939其余类推物种多度的几何级数分布多出现在物种贫乏的环境或群落演替的早期阶段物种多度分布则可能转变为对数级数分布2Log series distribution在研究鳞翅目昆虫的物种多度分布时应用了对数级数分布Williams首次提出了多样性指数的概念使其在动物物种分布特别是在昆虫学研究中得到了广泛的应用对于这一理论分布的性质的研究更加深入MagurranSouthwood1975ThOmas等Lollium perenne的物种多度格局物种多度分布往往服从对数级数分布稀疏种很多的格局1981兰人工针叶林中的林下植被的物种多度分布服从对数级数分布 x2/2x3/3xn/n 式7 式中x为预期只有1个个体的物种数目x2/2为预期具有之个个体的物种数目xn/n为预期具有n个个体的物种数目物种总数(S)引是上述各项之和  S=x/(1-x) 式9 合并式8和式9得到物种总数与个体总数  )aNln(1+=αS 式10 式中的1943式8成正比大量的研究表明是一个很好的多样性指数也是如此2Log normal distributionSugihara1980当每一个物种在取样中的个体数量是随机决定而下依赖于其它物种时尚玉昌1948最多的物种属于那些个体数量中等状态的物种1943它提出了用对数正态分布模型来拟合所得数据并取得了良好的效果PielouMagurranWilson ])(exp[)(2020R R a S R S −−= 式11 式中R的物种数 R为倍程序号 a为常数PrestonPreston即Ri的个体数是Ri-l倍程中个体数的2倍28因此组的中点是3/26落在组边界上的物种另一半个体属于右侧倍程当时他引用的 Birks分组并绘图这个直方图看起来好象很符合一个左边截断的对称正态曲线图1 在灯光诱虫器捕获的蛾子集合中种的多度Preston 拟合的曲线是n(R)=48exp[-0R0=3是众数倍程的数目 曲线左边的截断[Preston称为隐线因为以致于在现在太小的样本中期望个体数小于1因此如果样本大小增加一倍于是整个曲线就可能向右移动一个倍程隐点以前未发现的一些种就可能出现在集合中如果某一群落的种多度曲线服从对 数正态分布整个群落如果拟合数据的截断对数正态曲线以下的面积等于S则完整的未截断曲线以下的面积就给出了总体物种数的估计值1975的公式/a)1/2 式12 式中为圆周率等于3其它各项与式11相同2 Preston对数正态分布中的3个基本参数即S0与物种的相对多度有关则可根据这种相关关系给出总体的分布模型物种多样性可以通过计数群落中的物种数目予以测度也说明了物种丰富度在物种多样性测度中的重要意义甚至有人对其作用予以否定LambsheadMagurran2但是在某些范围较窄的比较均匀的群落中例如森林中一定地段作巢的鸟种的相对多度往往取决于物种间的竞争在这种情况下分割线段模型有时称为随机生态位边界假说1957而且其中至少有一种资源是有限制的那么某个物种个体数多了亦即生态位不能重叠或一条线段从而该棒状物被分割成若干段其表达式为  ∑−+=)]1/(1[/j S S N N j 式13 式中按优势程度从小到大顺序排列 S为调查到的物种总数结果大多不甚满意该模型倾向于低估富集种多度McNaughton, 1979May, 19751966分割线段模型也有应用的较为成功的实例其各个方面的特征都不可能用少数的几种模式予以描述或刻画因此很难断定哪些模式是叶的哪些是不好的上述四个物种分别适用于不同的群落类型分割线段模型适用于比较均质的群落因个体数量上的优势没有得到足够的发展但并不显著如一个森林局部地段中筑巢的鸟类群落以及具有较为稳定的种群和较长生活周期的高等陆生动物群落物种少而生境又不相互重叠的群落个体数量很多往往该类群落中稀疏种的数目远远大于富集种的数目多适用于生境条件较好在这样的群落中而重要性处于中间状态的物种都很多KrebsMagurran尚玉昌等Pielou19911975通过X2检验相对多度曲线的比较相结合的方法是可以对拟合效果进行评价的Plelou北京林学院等1991New multiple range testWilson在具体的评价过程中但有一条是肯定的2当观察到的数据较好地服从某一理论分布时例如它有2个参数a和x而另一个参数a下受样本大小的影响因此Williams将其定义为多样性指标通过理论分布的参数去测度群落物种多样性的方法有很大的局限性某些理论分布的参数与样本大小有关第二Magurran因此Pie1ou下面仅对应用较为广泛的几类予以介绍 33 1 Simpson指数  Simpson指数又称为优势度指数Concentration1949其中属于第i种的有Ni个个体2S随机抽取2个个体并且不再放回则说明其集中性高其概率可表示为NiNi一1N一1为了克服由此带来的不便1956Magurran由式是集合多样性的无偏估计量而当两个个体从无限大的群落随机抽取时  ∑∑===)/(2)/(2N N P p N Ni i i iλ 式16 相应地 ∑−=21iPD 式17 显然Kva1seth21PIE评述了各种多样性指数及其特点概念上的和技术上的问题念Hurlbert,1917Probability of Interspecific Encounter的概念及其表达式i=1,2,1990)33 多样性的奇测法Statistical odds 1)()1/(1−=−∑αααi P N 式19 当+时1)(12−=−∑αi P N 式20 11max−=−∞P N 式21 11min−=−∞−P N 式22 式20到式22的意义如下∑2iPMagurran Ludwig µÈºÜÄѽâÊÍÆäÉú̬ѧº¬ÒåÆäͳ¼ÆÑ§ÒâÒå¾ÍºÜÃ÷ÏÔÁ˸ù¾Ýͳ¼ÆÆæÊýµÄ¶¨ÒåÆäͳ¼ÆÆæÊýÈç¹ûÒ»¸öËæ»úʼþµÄ¸ÅÂÊΪ1-P 比较式23和式17OD即自样本中随机抽取的2个个体属于不同物种的统计奇数Kvalseth19701975文章的有关部分 22 多样性的信息度量 22即A1每个个体属于且仅属 于其中一类i=1类的概率为Pi我们希望找出Pi的一个函数P1作为总体并且它满足下述条件对于给定的S,当Pi=1/S时用L于是  L1/S,2/S,,1如果假定还有下含个体的S2类这将不影响总体的多样性指数的大小P10假设总体经受另一个分类过程当其分类是独立的情况下AB十H’ÔòÓÐH’APielouPi是一个个体属于第i类的概率一般置C式28假定个体是取自一个无限大的总体只的真值未知N作为有偏估计值Magurran:  3212112)(1211log 'N P P N P N S P P H i i ii i −−−−+−+−−−=∑∑ 式29 事实上式29中等式右端除第一项外实际工作中可忽略不计∑−=i i P P H log ' 式30 此式即由Shannon和Wiener分别提出来的信息不确定性测度公式[并非Shannon和Weaver提出来的]如果从群落中随机地抽取一个个体而且物种数目越多因此并且两者用同一度量  式28满足的3个条件在生态学上的意义可以理解为各种间数量分布均匀时第二条表明物种数目越多第三条表明多样性可以分离成几个不同的组成部分从而为生物群落等级特征引起的多样性的测度提供了可能e和10为底分别为bitPielou生态学上所用的单位及其名称都未标准化Magurran5至3很少超过4Magurran ∑∑−+−=22/)1(/])ln ()(ln ['22N S N p P p P VarH i i i 式31 据此1970间差异的方法 ]/)(/)/[(2)(22'212'1'2'1N VarH N VarH VarH VarH df ++= 式33 式中VarH2’分别为第1和第2个样方多样性指数的方差Magurran32 Brillouin指数当不能保证随机抽样如灯光诱捕或总体是有限的则应按照下式计算总体的多样性式中NiS19581985H为Brillouin指数式341975第一Ni有H即  'lim )min(H H i N =∞→ 式35  第二强调了它们之间不容忽视的差别不是估计的H'总是通过样本对总体的估计而且或标准差第三具相近的数值H’往往大于HH而Shannon-Wiener公式既要估计总体抽样的部分 第四H’的值下变换言之这也是大多数生态学家倾相于用Shannon-Wiener指数 2 2Hierarchical diversity因为群落是由处于不同分类等级上的相互作用的生物体构成的集合生物的等级属性是应该考虑的并且两者物种数目和各物种相对多度相同都不能比较出两个群落的差别如果一个群落中所有种都属于同一个属很显然若从遗传多样性角度考虑更是如此1967Lloyd 考虑一个全面普查的群落令个体分类成属为G分类第i属中个体数为Ni∑=NN i²¢¼Ù¶¨ÔÚµÚj ÊôÖÐÓÐSi ¸öÖÖj=1∑=iijN NGGSHi并且∑=)()/()(S H N N S Hg i i 式36 表示在所有g个属中显然GS十HG对于测量大群落多样性的Shannon-Wiener指数H’来说GS十HG1975属和种三个等级的多样性1968 然而理由是目前物种水平多样性的信息度量还没有取得满意的结果因此Magurran1988Growth form19773 多样性的几何度量 McIntosh其点的位置可由下式确定 2/12)(∑=i N U 式40 此式之值可作为某样方至没有任何个体的裸地的距离U依赖于样方中的个体总数及其在种间的分布种数越多因此U是群落一致性的量度达到最大值达到最小所以McIntosh将N-U作为多样性的绝对度量最大绝对多样性为N-N1群落的最大多样性力为N-N/S1/2为了比较方便D且0 )/()(2/1N N U N D −−= 式43 当S和N一定时式43比较常用只具有一定的理论意义4 均匀度指数 无论怎样定义多样性指数多样性信息度量因此Evenness生物量分布的均匀程度1964提出均匀度的测度方法以来现择重要者介绍如下41969定义为群落的实测多样性H’max之比率Pielou 的均匀度指数  J=H’ S P P J iisw log /)log (∑−= 式47 因为∑−=)/1log()/1('max S S H SS log )log 1(log 1=−×−= 相应地)/11/()1(])/1(1/[)1(22S P S P J i i gi −−=−−=∑∑∑ 式48 以McIntosh指数计算的均匀度指数即式43 42 3 Heip均匀度指数  Heip得下式 式50  此即Heip均匀度指数 4F21S因此上述3个指数同样受到样本大小的强烈影响Alatalo19731)/exp对分子和分母分别减去l得到的Kva1seth认为式38是一个比较好的均匀度指数还克服了民Peet4G2 MolinariAlatalo均匀度指数和Pielou的J指数都存在下列两点不足对均匀度低的样本估计过高其变化是非线性的Molinari提出了标准化的均匀度指数其表达式为114Hurlbert完全均匀群落的多样性群落中一个种有个个体S-l Ehu/(min) 式52 式中为实测多样性 min分别为最大和最小多样性值Hill1991Bulla提出了生态意义比较明确的均匀度指数为我们提出了一个均匀度测定的新思路 2Hill即有些指数倾向于强调富集种据此他把多样性指数定义为平均相对多度的倒数P2如果以生物量测度很明显Simpson指数为当1个种占绝对优势或近于单优群落时1 当群落中所有种的相对多度都相等时n之间可以定义 N2Pn Degree of po1ydominancea=[(W1P1a-1+W2P2-1++WNPNA-1)/(W1+W2++WN)]1/(1-a)  式55 此式即将n个物种的相对多度的尔后求其 由于Wi=Pi  N(P1++Pn) 式56 N到+其中=-02 N-即Nmin N1为Shannon-Wiener指数的指数值H’1973N2为Simpson指数的倒数或  1/( P12+P22+Pn2)即Berger-ParkerNNmax为最富集物种的个体数 Hill利用N5, N1, N1的值横坐标为样带位置值存在N+1十C的关系N据此N1可能更有意义还有待于更广泛的实例予以证实6 群落多样性测度的指数和模型提出但这种选择又必须做出体验用于检验的数据分为两类Contrived data虚拟数据的优点在于然而并非象大多数理论数据中那样各自独立地变化用现实数据比较或选择多样性测度方法就更有意义是比较它们对某些即定标准的符合程度对于样方大小的敏感程度强调哪一个多样性组分被利用和理解的广泛性1978之所以如此而这两个方面都要求多样性指数具有很强的区别能力1978其结果是对数级数分布模型的参数a居首位物种丰富度SSimpson指数的倒数等1979N0至N0N1即expH越接近N四效果越差1981Dmg=InNMagurran强调物种丰富度的指数比强调优势度/均匀度的指数具有更大的区别差异的能力一般说来Kempton2的Hi11多样性系列和Berger-parker指数等按照受稀疏种和富集种的相对多度影响的程度不同Magurran结果如下Berger-pdrker指数以及Shannon-Wiener换言之而其它的指数对数正态分布模型参数McInyosh U指数即对稀疏种敏感的指数应用最广泛的几种多样性指数依次是SH’D´ËÍâ197519751978´Óʵ¼ùÉÏ¿¼ÂÇÕâÑù²»Í¬ÀàÐÍ»ò²»Í¬Ñ§ÕßµÄÑо¿½á¹ûµÄ±È½ÏÌṩ¿ÉÄÜÎïÖַḻ¶ÈÖ¸ÊýShannon-WienerÖ¸ÊýSimpson指数和Margalef指数当然此外物种多度分布模型比单一的多样性指数提供更多的有关群落多样性的信息 3 多样性可以定义为沿着环境梯度的变化物种替代的程度据Pielou称其为物种周转速率物种替代速率和生物变化速率很多学者19771972Wilson等1984都对此进行过深入的研究多样性还包括不同群落间物件组成的差异1988多样性具有重要的意义p多样性的测定值可以用来比较不同地段的生境多样性 Overall diversity3多样性测定  二元属性数据又称0无数据 而不管其个体数目1984多样性测定疗法进行了较好的评价 1是第一个 S为所研究系统中记录的物种总数为各样方或样本的平均物种数还有三种表达方式ws=expH’c/exp mH’-1 式58 wm=Mn/Ms-1 式60 式中 Ecc是所研究系统的物种总数n1重要值对数差的比率lgn1一lgnslgn1一lgns Ms是各个种出现的样方数的平均值式60将得到与式57相同的结果w指数等于lw指数等于2也就是说其分化值应为零Whittaker在ws指数计算简便多样性与物种丰富度若以物种丰富度作为多样性的测度指标多样性多样性与总体多样性S即ws是一种应用较为广泛的11975多样性定为物种在生境梯度的每个点上被替代的速率Cody以及PielouWhittaker1984Amount of diffirentiation他们用Cody的速率测度对生境梯度的积分来定义 2/)]()([H l H g c +=β 式61 式中HH对于沿生境梯度变化排列的样本多样性的含义1RIE)  Routledge多样性和w多样性指数进行认真的比较研究之后多样性指数S为所研究系统中的物种总数Species pairs式中1)exp(−===∑∑I E i i e T ββα 式64 34 Wilson和Shmida指数1984多样性指数 αβ2/)]()([H l H g T += 式65 很显然式中变量的含义与式57和式61的相应变量相同1Whittaker1972PielouWilson等1984都从不同角度对p多样性指数进行不同程度的评价1984对上述6种p多样性指数的优劣予以评价与群落更替的直观概念一致在一定程度上依赖于准确反映群落更替程度为了检验这个特性在第一种情况下无群落更替满足于这条标准的测得的个完全群落变化系统中获得的值多样性指数中g在更有限的条件下其余两种C和 第二如果沿环境梯度有三个抽样位置ac多样性等于从a到b和从b到C的  ),(),(),(c b b a c a βββ+= 这就是可加性则 在6种C在所有条件下都具有可加性w和而I和独立于就一个群落来说多样性是群落环境异质性的表征均匀度高的群落多样性就高多样性较低的群落未必和 在RIE和多样性独立的C却随着因而它与独立于样本的大小测定wRC和I和这是因为E是由Pielou研究离散寄主植物上昆虫的生态位宽度和重叠测度时得出来的样本因此在分析一个连续梯度物种分布数据时所以E的使用受到限制表1多样性测度的评价使用w并没有假设一个环境结构所以多样性测度方法多样性测度方法的评价 评价准则 C I T y n y n y y 群落更替的直观性可加性 y y n n n y 独立于ja1+an 6 相似性系数测度  多样性的另一方面即不同群落间的比较成熟的群落分类和排序技术是解决这一问题的较好方法多样性应用最广WhitakerSouthwoodJanson等1981j为两个群落或样地共有种数此外197219571966此下赘述2 数量数据的多样性测度方法的优点在于计算简便然而不考虑每一物种的个体数量或相对多度而导致不合理 的结论生态学家试图利用数量数据测度1978 1 Bray-Curtis 指数 该指数是在Sorenson指数是一个应用非常广泛的指数aN为样地A的物种数目 jN为样地AjNb21981因此Wolda并应用于热带螳螂群落的p多样性测定Wolda改进公式为aN  ani和bni为A和B样地中第i种的个体数目1986她的结论是多样性测度方法不尽如人意式67式69198833 Whittaker的以半变1960其表达式为CC0为群落的即重复样方的相似性1960X轴Y轴当用最小二乘法拟合这条直线时一般说来左右 相似性可以由Bray-Curtis指数亦可由下式求得 )/()min(2k j ik ij N N n n PS +•∑= 其中Nj和Nk分别为样方j和k的个体总数如乔木层结果往往不同WhittakerWhittaker等去发现控制群落组成和结构的一般规律Watkins等群落多样性研究的实践意义主要包括保护与监测两个方面人们常以多样性指数为依据评价群落或生态系统的状况其理论根据是群落的多样性指数越高从遗传资源或基因多样性的保护角度考虑是有一定道理的如地带性顶极群落往往比其前几个演替阶段的物种多样性指数低与当地环境适应的群落好因此依据不同的目的去合理地利用多样性指数特别是水域监测方面已取得了一些成功的实例生物群落多样性的测度是生物多样性研究中十分重要的内容我国这方面研究还比较薄弱笔者希望本文能力本领域的研究起到一定的促进作用陈常铭 综防区和化防区稻田害虫天敌群落组成及多样性的研究6丁裕国气候统计气象出版社 尤民生 1989 福建农学院学报4 1992 福建农学院学报1彭少麟鼎湖山森林群落分析93-97 王宗英 图门江流域林区居民点鸟类群落的研究动物学研究1 1980北京 1991 应用生态学报3赵敬钊棉田蜘蛛群落及其多样性研究205-213 李荣冠 1989 生态学报3 1987 生态学杂志4金翠霞 稻田蜘蛛群落结构及其动态的初步研究生态学杂志4许崇任等 洋河水库轮虫群落用于水质评价的研究13101-106 张洁北京地区鼠类群落结构的研究4265-271 张晓爱青海省海北地区高寒草甸鸟类群落结构的季节变化32180-187 罗志义上海佘山地区棉田节肢动物群落多样性分析及杀虫剂对多样性的影响2 255-266 罗森源等轮藻群落对数正态分布在湘江水质评价中的应用511-15 赵志模1990重庆重庆分社 尚玉昌1992上册北京大学出版社 周庆强1982兽类学报1吴亚群落多样性的测定及其应用的探讨28-33 胡萃1992植物保护学报4赵士洞等长白山北坡阔叶红松林及其次生白桦林高等植物物种多样性比较516-23 钱宏长白山高山冻原植物群落的生态优势度924-27 高宝嘉1992北京林业大学学报2张执中等封山育林对昆虫群落结构及多样性稳定性影响的研究121-15 高玮1988野生动物6相桂权等东北山地次生林鸟类多样性的研究101992中国环境科学3高中信等沽河林区夏季森林鸟类群落结构研究20周庆强等内蒙古白音锡勒典型草原区鼠类群落的空间配置及其结构研究112-21 黄玉瑶等应用大型无脊椎动物群落结构特征及其多样性指数监测蓟运河污染133-146 彭少麟1983谭向红成都地区农田鼠类群落结构研究11121-125 蔡晓明1992应用生态学报4J等李育中等译统计生态学内蒙古大学出版社 May19761980北京E1969 1978北京E19851991第二版科学出版社 SouthwoodR罗河清等译生态学研究方法科学出版社 Alatalo V Problems in the measurement of evenness in ecology37J et al Diversity and distribution patterns in the flora of Mount Kinabalu P )NetherlandsJ et al Diversity of planktonic Foraminifera in deep seasediments168J&J Curtis An ordination of the upland forest communities of southern Wisconsin Monogr325-349Bulla1994Oikos167-171Cody L Towards a theory of continental species diversity bird distributions over Mediterranean babitat gradients L M) CambridgeE et al Species number and compositional similarity of the Galapagos flora and avifauna MongrR et al The relation between the number of species and the number of individuals in a random sample of an animal population Anim12:42-58Harper L Population Biology of PlantsC1974J BiolM1973an unifying notation and its consequences54 S1971 The non-concept of species diversity EcologyR1979BiometricsA1978BiometricsC Ecology New York :Harper & Row PublishersKvalseth O Note on biological diversity and homogeneity measures62(l) :123-127Lambshead et al Structural patterns of marine benthic assemblages and their relationships with empirical statistical models P(ed Proceedings of the 19th European Marine BiologySymposium CambridgeM1968Amer497-515MacArthur H Notes on Mrs Ecology1074MacArthur H Geographical Ecology New YorkA1988New JerseyR Patterns of species abundance and diversity in M Cody and J Diamond (eds Ecology and Evolution of Communities Harvard University PressP An index of diversity and relation of certain concepts to diversity48:392-404 McNaughton J1979New York Rinehart and WinstonMolinari1989OikosR1974Ann Ecol 5 :285-307Pielou C Ecological DiversityF1948EcologyRoutledge D On whittaker's components of diversity58H1968 a comparative study Nat102A1969Ecology466-467 Simpson H Measurement of diversity163Sugihara1980AmerL1978Williams a variety of diversities AWarloff (eds Diversity of Insect FaunasOxford :BlackwellA and J Wilson Plant structureOikos91-98Whittaker H V egetation of the Siskiyou Mountains Ecol279-338Whittaker H Dominance and diversity in Land plant communities147H Evolution and measurement of species diversity21 :213-251Whittaker H Evolution of species diversity in land communities K W Steere and B)V ol New York 1-67Wilson B Methods for fitting dominance/diversity curves2:35-46Wilson V L1983Vegetatio129-141。

生物多样性分析的方法和技术

生物多样性分析的方法和技术

生物多样性分析的方法和技术生物多样性是生命的重要组成部分。

它指的是生态系统中存在的各种物种、群落和生态位的数量和多样性,包括动植物、微生物等。

在当今环境问题日益凸显的现状下,生物多样性的保护显得尤为重要。

为了更好地保护生物多样性,需要对其进行分析,掌握其基本情况、组成结构及分布规律。

本文将介绍一些生物多样性分析的方法和技术。

一、采用样本调查法通过采用样本调查法,可以高效地获取生物多样性的信息,同时减少资源浪费。

在这种方法中,适当选择样本点,进行生物多样性调查。

对于每个样本点,按照一定的规则进行采样调查,记录各类物种的信息。

最后,对数据进行整合分析,以得到该区域内的生物多样性信息。

二、DNA条形码技术DNA条形码技术是一种基于DNA序列的生物鉴定方法。

它将某一生物物种的DNA序列进行测定,将其作为该物种的鉴定依据。

该技术对于物种鉴定的精确度很高,可以应用于快速鉴别大量的生物样本。

此外,DNA条形码技术还可以被用于恢复已经灭绝的物种。

三、多样性指数分析法多样性指数是评价生物多样性的指标之一,可以用于反映生物群落的物种丰富度和物种均衡度。

常见的多样性指数包括Shannon 指数、Simpson指数等。

在多样性指数分析中,研究人员对不同样本中生物群落的物种丰富度和均衡度进行度量,并通过统计分析,得出不同样本的生物多样性指数值。

四、GIS技术GIS技术是一种地理信息系统技术,可以将数据被用于地图、图表等可视化展示。

在生物多样性分析中,GIS技术可以帮助研究人员在地图上标出生物多样性分布的位置和密度,从而更好地理解生物多样性的分布规律。

此外,GIS技术还可以将不同类型的生物多样性数据整合在一起,进行综合分析,更全面地认识生物多样性。

综上所述,生物多样性保护需要全面的数据支持,各种分析方法和技术的应用能够有效的提升人们对生物多样性的认识,并为保护生物多样性提供重要的科学支持。

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• 两个物种个体数量分布均匀的个体,物种数越多,多样性越高; • 多样性具有可加性
α多样性测度方式
1. 物种丰富度指数Species richness index 2. 物种相对多度模型 3. 物种多样性指数/生态多样性指数 4. 物种均匀度指数
物种丰富度指数
• 物种密度(Hurlbert, 1971)-植物多样性研究 • 数量丰度(一定数量个体中的物种数)-水域物种
多样性研究
Shannon和Wiener提出的信息不确定性测度公式。
生态学家称之为Shannon-Wiener指数,如果从群落中随机 抽取一个个体,它将属于哪个种是不定的,而且物种数目 越多,其不定性也就越大。 不定形=多样性。
H’唯一满足下述条件:
• 保证了对种数一定的总体,各种间数量分布均匀时,多样性最高;
令: N= α X/(1-X)
则得到:
• 适用于一个或少数几个环境因子占主导地位的群落,形成富集种 很少,稀疏种很多的格局。
Байду номын сангаас
Broken-stick Model -Random niche boundary hypothesis
• MacArthur 1957提出,群落中生活在一起的物种必然分享生境资源, 其中至少有一种资源是有限的,那么某个物种个体数多了,其他物 种的个体数就会相应的减少。设想其为一棒状物,各个物种生态位 的边界就标记在这根棒状物上。
物种多样性指数
• 物种多度分布模型中的拟合参数可作为多样性 指标来描述群落的多样化程度
• 但是
某些理论分布的参数与样本大小无关,不宜做多样性指 数; 观察数据不能很好的与理论分布拟合; 某些群落在做多样性测度时尚不清楚其多度分布格局。
• 所以 产生了众多与分布格局独立的多样性测度方法。
物种多样性指数 (diversity index or biodiversity index)
样方大小对丰富度的影响???
Rarefaction technique(Sanders, 1968)
E(S)-样方物种数目的期望值; N-样方中记录的个体总数; Ni-样方中第i物种的个体数目; n-样方大小
(Hurlbert, 1971)
物种丰富度的d测度
• 物种丰富度-样方内的物种数目;?物种数目与样方 大小/个体总数的数学关系
生物群落多样性的测度方法
马克平
• 群落多样性-生物群落在组成、结构、功 能和动态方面表现出的丰富多彩的差异。
• 几个概念区分: • 多度 丰富度 • 丰度 分异度
• 物种丰富度(species richness)—指群落所包含的物种数目。------分异度 • 多度(abundance)—群落内各物种的个体数量。-----丰度
• d-物种数目随样方增大而增大的速率(Whittaker,1972)
S-物种数目;N-所有物种的个体数目;A-样方面积
物种的相对多度模型
• 相对多度-物种对群落总多度的贡献 • 物种多度分布研究方法
物种重要性顺序-多度表Ranked-abundance list 物种多度分布表 Species-abundance distribution
Nj为第j个物种的个体数;N为各物种个体数之和;S为调查到的物 种总数
• 在物种多度近于相等的群落中拟合效果较好
各种理论分布模型拟合效果的评价和比较
• λ2检验 • 物种重要性顺序-相对多度曲线 • MLD(Wilson, 1991) • New multiple reange test(Duncan) • 方差分析 • Hotelling T2检验评价模型
• 物种多度分布(而非多度)——理论分布拟合 对数正态分布;几何级数分布; 对数级数分布;分割线段模型
Log normal model
• Preston1948 美国纽约某山谷鸟类群落分布:很稀疏的 种类似乎不多于富集的种类,最多的物种属于个体数量 中等状态的物种
S
log2N
Geometric Model -niche pre-emption model
在群落多样性的测度上,就借用了这个信息论中不定性测量方法, 就是预测下一个采集的个体属于什么种,如果群落的多样性程度 越高,其不定性也就越大。
S
H ' Pi * log 2Pi
i 1
H’ =样品的信息含量 =群落的多样性指数 H’在P=1/S时有极大值
S =种数 Pi =样品中属于第i种的个体的比
假设可以把一个个体无限的总体分成S类,即A1, A2,…As, 每一个 个体属于且仅属于其中一类。随机抽取一个个体属于Ai(i=1,2,…,S) 类的概率为Pi,因此有∑Pi=1,我们希望找到一个Pi的函数,使之成 为总体多样性的一个度量。
信息度量指数的引入: b b b b b b b这样的信息流,都属于同一个字母,要预测下一个字 母是什么,没有任何不定性,其信息的不定性含量等于零。如果 是a,b,c,d,e,f,g,每个字母都不相同。那么其信息的不定 性含量就大。
• Motomura 1932 首先应用几何级数(等比级数)拟合
E-总资源量;P-最重要物种占有资源的比例 • 适用于物种贫乏的环境或群落演替的早期阶段
Logarithmic series distribution
• Fisher 1943 鳞翅目昆虫的物种多度分布时应用
级数分布形式:f(x) = α Xn/n 为具n个个体的物种数目 求和得到: S= α[-ln (1-x)]
是种类和数量分布的函数。根据研究目的不同,有不同的表 示方法。
1. Simpson多样性指数:-优势度指数 从包含N个个体S个种的集合中随机抽取2个个体且不放回, 这两个个体属于同一物种的概率为:
Ni/N为第i物种第一次被抽中的的概率; (Ni-1)/(N-1)为第i物种第二次被抽中的概率
λ为集中性的测度,Greenberg(1956)提出多样性测度
D=1- λ
当两个个体从无限大的群落中随机抽取时,得到多样性 测度为:
S
因此: D 1 (Pi)2 =也称Gini指数
i 1
• 种间相遇指数PIE (Hurlbert, 1917)
该指数表示不同物种的个体在随机活动情况下相遇 的概率,可证明PIE=D
2. Shannon-Wiener多样性指数
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