生物医学类外文数据库
西文生物医学数据库使用说明
根据初步检索结果调整关键词， 添加同义词、近义词、相关词等， 以扩大检索范围。
布尔逻辑运算符应用
逻辑“与”（AND）
用于缩小检索范围，提高查准率，如同时包含 两个或多个关键词的文献。
逻辑“或”（OR）
用于扩大检索范围，提高查全率，如包含任意 一个关键词的文献。
逻辑“非”（NOT）
用于排除某些不需要的文献，如排除某个作者或某个机构的文献。
拓展了学术视野
通过接触大量的生物医学文献，学员们对 学科前沿和热点有了更深入的了解和认识。
增强了科研能力
通过学习和实践，学员们提高了自己的信 息获取、分析和利用能力，为今后的科研
工作打下了坚实的基础。
未来发展趋势预测
数据库整合与共享
未来西文生物医学数据库将更加注重资源的整合和共享，打破数据库之间的壁垒，实现资源的互 通有无。
开放共享
数据库的开放共享程度将更高， 促进学术交流和合作。同时，数 据库的安全性和隐私保护也将得 到更加重视。
02
检索方法与技巧
关键词选择及优化
01
医学主题词表 （MeSH）应用
使用医学主题词表进行关键词规 范化和扩展，提高检索准确性和 查全率。
关键词类型
02
03
关键词优化
选择具有代表性和专指性的关键 词，如疾病名称、药物名称、基 因名称等。
截词符与通配符使用
截词符（*）
用于替代词干后的部分字母，以检索具有相同词干的词，如“cancer*”可检索出“cancer”、 “cancers”、“cancerous”等。
通配符（?）
用于替代单词中的任意一个字母，以检索拼写相近的词，如“p?tient”可检索出“patient”、 “potient”等。
6.数据库检索外文 Pubmed医学专业研究生必看
3、关键词与主题词检索
Pubmed的关键词检 索有何特别？ 有了Pubmed的特色 功能还要主题词检索 作什么？
为什么还要强调主 题词检索？
2
3 4
只要用主题词 检索就足够了 吗？
1
(1)为什么还要强调主题词检索？
• 主题词是在关键词的基础上经过规范化处理的，就是在文 献存储时，对文献中的同义词、近义词、多义词等进行严 格的控制与规范，使得同一主题概论的文献相对集中在一 个主题词之下。
• Publisher-Supplied
出版商提供的电子文献题录，每条记录标有:
[PubMed-as supplied by publisher]，分为两类： – MEDLINE 收录，逐步转为In Process, Indexed状态。 – Not MEDLINE：PubMed 收录，MEDLINE不收录， 一直标注[PubMed-as supplied by publisher]或 [PubMed]
检索键
只查重点论述的文献
系统自动扩展检索下位词， 勾选后不检索下位词
(4)只要用主题词检索就足够了吗
• 不是每个词都有对应的主题词 • 没有主题标引的文献不可以用主题词检索 ----如何识别主题标引的文献 策略：根据实际需求选择，最好的是使用主 题词与关键词相结合
4、值得推荐的功能与资源
1. 2.
特点
• • • • • • • • 资源免费 收录广泛 更新迅速 数据权威 检索方便 检索结果精准 个性化定制功能丰富 外部分析工具功能强大
是目前使用最广泛、影响力最大的生物医学信息资源检索系统。
• MEDLINE Indexed
1966 to prensent的MEDLINE已标引数据， 有MeSH字段和摘要，每条记录标有： [PubMed-indexed for MEDLINE]
PubMed外文数据库检索
大部分为英语语种的文献，其中我国大陆期刊80多
种。
二、MedLine数据库使用形式
MedLine CD-ROM 由出版商将数据库制成了光盘，然后邮寄给用户 。 不同出版商的数据库检索界面略有不同，我国主要 引进Ovid（原Silver Platter)公司产品。检索界面与 CBMdisc类似。
PubMed的主体部分，记录末尾标有[PubMed-indexed for MedLine]。 （2）PreMedline
临时性的医学数据库，收录最新出版的文献，缩短文献报 道时差。PreMedline中的记录每天有进有出，新进的记录标有 [PubMed-in process]，标引好主题词和文献类型等字段的记录 转入Medline。
检索区 主要功能区 辅助功能区
二、PubMed主页简介
1.检索区 位于主页上方，通过点击数据库栏列表中PubMed旁
边的下拉菜单，根据实际检索需要可以更改数据库（主 要用来检索的数据库有：all database、PubMed、 Protein、Nucleotide、GSS、EST、Structure、Genome 等），高级检索（Advanced ），点击Help可查看检索帮 助，在检索式输入框中输入检索式，点击“Search”按 钮，可执行检索操作。
PMID(PubMed Unique Identifier)号,用PMID号可快 速检索到该ID号对应的文献。
提纲
一．PubMed概述 二．PubMed主页简介 三．PubMed检索规则 四．PubMed的检索途径和方法 五．PubMed的检索结果处理
二、PubMed主页简介
PubMed主页面分为3部分 1. 检索区 2. 主要功能区 3. 辅助功能区
国外医学数据库简介
国外医学数据库简介一、EMBASE数据库EMBASE是将EMBASE—荷兰医学文摘（1974年推出）中1100多万条生物医学记录与700多万条独特的MDELINE记录（1966年推出）相结合，经过去重，形成全球最大最具权威性的生物医学与药理学文献数据库。
EMBASE囊括了70多个国家/地区出版的7,000多种刊物，覆盖各种疾病和药物信息，尤其是它所涵盖的大量欧洲和亚洲医学刊物。
是医学研究和科技查新不可或缺的工具。
最新版本的EMBASE提供如下功能：1、同步检索超过1800万条EMBASE+MEDLINE记录，且结果无重复；2、每天新增2000多条记录，每年新增记录达到600000万条；3、EMBASE记录在收到原始刊物后10个工作日内即会出现；4、涵盖70多个国家/地区出版的7,000多种刊物；5、80%的记录都包含摘要；6、EMTREE包含超过50,000条药物与医学术语、10,000条代码和大约200,000条同义词（完全集成了MeSH术语）。
二、MD Consult数据库MD Consult是全球最大的STM (科技、医学信息) 出版公司Elsevier的核心全文医学资讯平台，MD Consult把当今世界上领先的医学信息资源整合到一个网上服务系统之中，拥有50多套权威的医学参考书籍，80多种各专业临床医学权威期刊，22,000多种药物资讯，1,000种临床实践指南，10,000种病患须知及手册，同时以上各项内容均在不断地增加。
十大版块介绍如下：1、First Consult—在线专家诊疗系统，为医生及医学生提供患者评估、诊断、治疗、管理和预防等方面持续更新的循证医学指导。
包括三大版块：医学主题、鉴别诊断、操作程序。
检索方式：字母顺序、关键词搜索2、Books—参考书，提供50部各主要医学领域最新版本的经典参考书在线阅读，例如：西氏内科学、克氏外科学、坎贝尔手术骨科学、Campbell-Walsh泌尿学、尼尔森儿科学、Braunwald’s 心脏病、米勒麻醉学、Williams内分泌学、Kelley’s风湿病学、Hoffman血液学、Abeloff’s临床肿瘤学、Sleisenger & Fordtran’s胃肠和肝脏病等。
Pubmed生物医学数据库NCBI medline
子集限制
时间
文献类型
语种
物种
性别
文档子集
年龄组
文本选择
字段
高级检索
可以选择任意字段进行检索
可以进行逻辑组配检索 检索举例：
肝癌的基因治疗
liver cancer
gene therapy
返回主页
高级检索页面
检索字段
Search History
检索式回顾 编辑检索式 最多可保存100条检索史，可保存8小时
保存检索结果
电子邮件
显示检索结果（Display)
Display旁的下拉菜单，选择记录格式：
Summary：著者、篇名、出处、语种（非英文时列出）、 出版物类型（只有综述时列出）PMID(PubMed Unique Identifier）和记录状态
Abstract： Summary加文摘、著者单位、地址。 MEDLINE : 60多个字段，最完整，有标识符
Tei index
限定检索
2000-2010年在核心期刊上发
表的，篇名中含有Tei指数的有 关儿童心功能检测的英文文献
Limits（检索限制选择）
29字段限制：（著者、刊名、篇名）等 数据输入时间：出版时间和录入 文献类型限制
PubMed时间，限制选择30天-10年
语种限制
年龄限制
检索原理
自动转换匹配功能（Automatic Term Mapping），按照四个表顺序进行检索。
自动扩展检索,系统自动对主题词、副主题词 进行扩展检索。
短语检索（Phrase Searching） 即强制检索，短语加双引号，不进行词汇的 自动转换，也不进行MeSH词的扩检。
截词检索：仅有*，仅限于150个单词，且在 截词检索时，不进行词汇的自动转换，词组 无效。
生物医学文献数据库
PubMed基本检索
smith j
作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写)， 之间不用标点 键入作者姓名
PubMed基本检索
"smith j"[au]
精确检索避免 PubMed自动 词汇转换，实 现精确查找
PubMed基本检索
期刊检索
在检索框中键入期刊名，如：European journal of immunology，系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成"Eur J Immunol"[Journal] OR "european journal of immunology"[All Fields]进行检索。
概述
PubMed收录的期刊最早追溯至1865年，共收 录了70余个国家36000余种期刊，1900多万篇 文献； PubMed 的子集Medline收录的文献最早追溯 至1902年，现有记录1790多万篇； 目前每年增加约60余万条文献记录；
•Pubmed是目前国际上公认的检索生物医学文 献最具权威、利用率最高、影响最广的数据库， 也是我国卫生部认定的科技查新必须检索的国外 医学数据库。
考虑到作者姓名的不同形式，PubMed采用自动转换功能进 行作者姓名检索，如：smith j将检索成smith ja,smith jb,smith jr 等。
精确检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段限 定[AU]，如："smith j"[au]，这样可避免PubMed自动转换，实 现精确查找。
也可以直接输入Medline的期刊标准缩写形式，如： Eur J Immunol ，或者是输入刊物的ISSN（国际标准出版物代码）进 行检索，如：0014-2980。
医学研究证据常用的检索数据库
医学研究证据常用的检索数据库
- 中国生物医学文献数据库（CBM）：收录了国内医学期刊种类较多，与 Pubmed 有良好的兼容性。
- Medline：是美国国立医学图书馆生产的国际性综合生物医学信息书目数据库，是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。
- ScienceDirect 数据库：收录了爱思唯尔出版集团的同行评议期刊、系列丛书、手册和参考书等。
- Cochrane library：是循证医学数据库，提供有关最新医疗的客观信息。
- SpringerLink：是德国施普林格出版集团提供的电子图书数据库，包括各种类型的Springer 图书产品。
- OALib：可以免费获取各类文献，包括经过同行评议过的期刊文章、参考文献、技术报告、学位论文等全文信息。
- Free Medical Journals：是因特网上免费提供生物医学全文最多的期刊集合网站，收录了1460余种生物医学全文期刊。
- 科学公共科学图书馆（PLOS）：旨在推广世界各地的科学和医学领域的最新研究成果，使其成为一种公众资源。
PLOS 出版了8种生命科学与医学领域的期刊，可以免费获取全文。
不同的数据库有不同的特点和优势，建议根据研究需求和学科领域选择合适的数据库进行检索。
外文医学数据库
主页结构
四、PubMed的检索途径和方法
基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索
（一）基本检索
PUBMED提供了词汇自动转换功能：
MeSH转换表 期刊转换表 短语表 作者姓名索引 逻辑运算符检索
检索运算符
（1）逻辑运算符： OR、AND、NOT 运算顺序：OR<AND<NOT，可用（）改变检索词的处 理顺序。
题录格式内容（几个字段？）
作者限定字段检索
例在二西文例文:献著里者，“著H者en的ry署H名em一il般a”名应在转前换姓成在后， 查“找H作em者ila hH”,e后m加il著a者h字著段作限的定来文检献索，
注意：姓在前，名在后 姓全称，名缩写
四、PubMed的检索途径和方法
基本检索 高级检索 主题检索 期刊检索 专用检索
（2）截词符：*。eg: cell*：cell、cells、celliferous、 cellophane和cellular等词的文献。
（3）利用字段标识符进行限定检索： 检索式格式：检索词A[字段标识B]，检索在字段中含 有检索词A的文献。 如： hepatitis[TI]，smith [AU]，cell[TA]。
获取生物医学权威期刊最多
世界上70多个国家的7395种权威期刊
多种检索方法，多条检索途径 时效性极强(每周更新) 回溯年代久远（1950年至今） 利用MeSH作为转换词表，标引质量高 部分文献可以免费获取全文 检全率、检准率高
三、PubMed主页
免费进入PubMed途径：
/PubMed /sites/entrez
二、PubMed的数据范围
MEDLINE OLDMEDLINE(1950-1965)
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- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
PubMed Central
PubMed Central由美国国家医学图书馆建立的生命科学期刊全文免费数据库，目前加入P MC的期刊108种，另有8种期刊即将加入，这些期刊免费全文访问的时间延迟是出版后0 -2个月，所有文献的浏览、检索、下载均是无需注册的。
网站地址：/
创建者：U.S. National Library of Medicine
eScholarship Repository
eScholarship是由加利福尼亚数字图书馆创立的，包括已发表的论文专著、本校学术期刊、连续出版物、研究生研讨课资料等。
提供免费全文浏览和下载，目前已有6953种，140万篇文献可提供下载。
网站地址：/escholarship/
创建者：California Digital Library, University of California
DOAJ
DOAJ是由瑞典的隆德大学图书馆建立的。
目前收录的开放存取期刊超过1500种、文章7万多篇。
该系统收录的均为学术性、研究性期刊，具有免费、全文、高质量的特点，对学术研究有很高的参考价值。
网站地址：/
创建者：Lund University Libraries
BioMed Centeral
BioMed Central以出版网络版期刊为主，目前出版120种生物学和医学领域的期刊，少量期刊同时出版印刷版。
BMC网站免费为读者提供信息服务，其出版的网络版期刊可供世界各国的读者免费检索、阅读和下载全文。
网站地址：/browse/journals
创建者：BioMed Centeral
The Free Medical Journals
The Free Medical Journals提供了全部免费的医学生物学相关期刊的全文链接，包括1 350种免费的英文和非英文（15种语言）的生物医学全文期刊。
检索Freemedicaljournal s期刊有专业(specialty)和字顺二种途径。
网站地址：/
创建者：AmedeoGroup.
美国国家学术出版社所有PDF图书开放免费下载（附：全球部分免费开放的电子图书
馆）来源：张文鼎的日志
美国的国家学术出版社（National Academies Press，NAP）于2011年6月2日宣布，将其出版的所有PDF版图书对所有读者免费开放下载，并且将这
些图书去除DRM保护。
这其中不仅包括超过4000种最新出版的图书，还包括已经提交报告将于未来一段时间出版的图书。
国家学术出版社负责美国国家科学院（National Academy of Sciences）、美国国家工程学院（National Academy of Engineering）、美国国家医学院（T he Institute of Medicine）和美国国家研究委员会（National Research Counci l）相关研究成果的出版，其目标是在维持收支平衡的同时尽可能广泛地传播这些研究机构的研究成果。
为了实现这一目的，NAP从1994年就开始提供免费的在线内容。
在6月2日的声明之前，这些所有的PDF版图书对发展中国家都是免费的，65%的内容对所有国家用户免费。
网址：/
附：全球部分免费开放的电子图书馆
1.澳大利亚国立大学ANU电子出版库：.au/
2.阿德雷德大学电子文本收藏中心，包括古典文学，哲学，科学和医学著作：h ttp://.au/
3.澳大利亚数字化人文门户(澳大利亚人文学界的数字化资源门户) http://ww .au/
4.科廷大学技术文献库(科廷技术大学科研人员和研究生的科研成果)http://es .au/R
5.墨尔本大学电子出版物收藏网
.au/eprints/
6.昆士兰大学数字文库
.au/
7.SETIS悉尼大学学术电子文本及图像服务. au/
8.新西兰数字文献收集网
http://nzdl.sadl.uleth.ca/cgi-bin/library
9.古腾堡数字化图书馆
/wiki/Main_Page
motions 西方文学/哲学网 (包括自美国/英国的文学和西方哲学公开著作)
/
11.康奈尔大学Arxiv (收藏了物理,数学,非线性科学和计算机科学方面的数字
化 "预印本" 出版物)
/
(包含世界历史百科全书,以及哈佛经典著作,提供免费的电子文本)
/
13.Bibliomania (提供超过2000部免费电子文献，以及研究成果) http://ww /
14.Cogprints(有各类心理学，神经科学，语言学，哲学，生物学，人类学和计算机科学电子文献, 部分区域需要注册)
/
15.印第安纳大学国际文献档案库(这是一个服务公众的全文数字图书馆，作者可以提交著作，并被连入参考文献)
/dlc/
16.DLESE地球系统教育数字图书馆( 涵盖了环境，地理，地质，海洋以及其他物理科学；空间科学与技术；教育方法和科学哲学内容) http://www.dlese.o rg/library/
17.Elfwood(拥有超过两万部文学和艺术作品，来自超过一千五百名幻想/科幻艺术家和作家)
/
(收藏了大量在线智慧文学和资源,由华盛顿大学创立)http://e /
19.IPL互联网公共图书馆 (密歇根大学信息学院的学习和教学环境) http:// /
20.库尔特·斯塔博的在线图书馆(收藏了古代和现代的大量生物学著作，其中很多珍本, 可在线阅读) http://www.zum.de/
21.麻省理工学院的开放文献网站/OcwWeb/web/home/hom e/index.htm
22.美国国家科学院在线数据据库(超过3000部科学,工程和健康卫生方面的著作,可以在线阅读,这些文献代表了美国在这些领域的研究精华)
/
(搜集了来自澳大利亚，加拿大，许多欧洲国家，香港，台湾和美国的论文)htt
p:///
24.宾夕法尼亚大学网站
(有超过 16000 部在线电子书 ,值得一读) :http://digital.library.upenn.e du/books/
25.牛津大学档案馆
(建于1976年,这里有用于研究和教学的大量高品质文献资料公共区域可以免费在线检索目录，下载):/
26.弗吉尼亚大学电子文献中心
(超过10000 部可以公开或取的著作（以及超过 164000 幅图像）:http://www2. /etext/index.html
27.Gallica.bnf.fr
(法兰西国家图书馆资助的网站,法文):http://gallica.bnf.fr/
28.世界图书馆(世界图书馆，法语) am.fr/
29.意大利电子书网站(包括小说,诗歌,古典文学，戏剧，传记，恐怖和幻想小说，新经济学等)http://www.ebookgratis.it/
30.日本文学著作( 格式包括 HTML , ZIP(下载)和日文电子书格式)http://www. aozora.gr.jp/
31.今日美国开放图书计划
(一家报纸网站的独立部门，一些有名的小说家开放了他们的版权，供所有的访客阅)/life/books/openbooks/2005-02-01-aboundin g-gutter_x.htm
32.英语文学网站
(超过一千位学生为这个巨大的网站捐助成果，焦点是英语文学) http://www. /
33.计算机程序设计电子书
(包括:Abap, Java, Linux, Php, Oracle & 。
PDF 格式。
注意，在下载之前，需先建立一个账户)
/
34.数学世界
(为学生，教育家，数学爱好者和研究者准备的全面地数学百科全书)http://ma /
35.在线医学百科全书
(超过1500主题的在线医学百科全书，包括康复，疾病，伤害，营养，手术，症状，试验)/
36.医生的免费电子书(免费使用的医学电子书) http://freebooks4doctors.c om/
37.奥地利文献
(超过12000 部奥地利文献,甚至包括明信片,可以在因特网上访问)http://www. literature.at/default.alo;jsessionid=453DD0DC127BBBB02C863B1887F76E2
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38.GPO Access(美国政府文献):/
39.世界最大的社会科学文献网站(ICPSR)
（Inter-university Consortium for Political and Social Research）:htt p:///icpsrweb/ICPSR/
40.National Academy Press
(美国国家科学院、国家工程院、医学协会等机构的论文/报告/PPT,内容几乎涵盖所有学科)
/publications/
41.UNESCO
(联合国教科文组织提供的文档,包含自然科学与社会科学,有多种语言,包括中文）
/new/en/unesco/。