MestReNova核磁谱图处理指南
核磁数据处理方法
核磁数据处理方法核磁共振（NMR）是一种重要的分析技术，广泛应用于化学、生物学和医学等领域。
在进行核磁实验时，我们需要对得到的数据进行处理和分析，以获得实用的信息。
本文将详细介绍核磁数据处理的方法和步骤。
一、数据获取和预处理1. 数据获取：通过核磁共振仪器获取样品的核磁共振谱图。
谱图通常包含两个维度的数据，即横轴表示化学位移，纵轴表示信号强度。
2. 数据预处理：对获得的谱图进行预处理，包括去除噪声、基线校正和相位校正等。
去除噪声可以提高信噪比，基线校正可以消除谱图中的基线漂移，相位校正可以调整信号的相位。
二、数据处理和分析1. 峰识别：通过峰识别算法找出谱图中的峰，并确定其化学位移和峰面积。
常用的峰识别算法包括峰拟合法和峰积分法。
2. 化学位移校正：根据已知的内部标准品或者参考物质的峰位置，对谱图进行化学位移校正，以提高数据的准确性和可比性。
3. 峰归属：通过与数据库或者文献比对，确定峰的归属，即确定峰所代表的化合物或者功能基团。
4. 峰积分和积分校正：对峰进行积分，计算峰的面积。
如果需要，还可以进行积分校正，以消除不同峰的积分因子差异带来的影响。
5. 峰定量：根据峰的面积和浓度关系，进行峰定量分析，计算样品中目标物质的含量。
6. 数据可视化：将处理后的数据进行可视化展示，通常使用谱图或者曲线图来展示数据的特征和变化趋势。
三、常用的数据处理软件和工具1. NMRPipe：是一个常用的核磁数据处理软件，提供了丰富的数据处理和分析功能。
2. MestReNova：是一款功能强大的核磁数据处理软件，可以进行多维数据处理、峰识别和峰归属等操作。
3. TopSpin：是一款广泛应用于核磁实验室的数据处理软件，提供了直观的用户界面和丰富的数据处理功能。
4. MATLAB：是一种常用的科学计算和数据处理工具，可以编写自定义的数据处理算法和脚本。
四、注意事项和常见问题1. 数据质量：核磁数据处理的结果受到数据质量的影响，因此在进行数据处理前，需要确保获得的数据质量良好。
MestReNova使用方法
MestReNova使⽤⽅法MestReNova 使⽤⽅法⼯具栏中各图标作⽤⼀维谱图处理⼀般顺序维谱图处理般顺序?1、调整基线和相位。
线2、校正化学位移。
3、积分。
4、标注化学位移。
5、输出谱图。
输出谱图⼀维谱图处理维谱图处理、双击图标运⾏。
1双击图标运⾏p菜单到需2、进⼊“File/Open”菜单，找到需要处理的实验数据，打开名为“fid”的⽂件。
?3、调整相位和基线。
调整相位和基线单击⼯具栏中的按钮进⾏相位校正；单击按钮进⾏基线校正。
、校正化学位移。
4校正化学位移单具栏中单击⼯具栏中的按钮，选择要⽤来校正的峰。
要⽤来校正的峰5、积分。
单击⼯具栏按钮右边的⼩箭头，在下拉菜单中选择“Manual”进⾏⼿动积分；单M l”进⾏⼿动积分单击则软件⾃动积分（不推荐）。
积分数值的改变6、积分数值的改变。
将⿏标移到积分曲线上，曲线区域颜⾊变为红⾊后双击，修改“Normalized”中的数值后关掉即可。
数值后关掉即可7、标注峰的化学位移值。
单击⼯具栏按钮右边的⼩箭头，在下拉菜单中选择“Manual Threshold”进⾏拉菜单中选择Manual Threshold进⾏⼿动标峰；单击则软件⾃动标峰。
峰析8、多重峰分析。
单击⼯具栏按钮进⾏多重峰分析。
在右边⼩箭头的下拉菜单中选择“Report”输出分析结果。
出分析结果9、输出采样参数。
进⼊“View/Tables/Parameters”菜单将其显⽰出来单击“”按钮可将其粘显⽰出来，单击Report按钮可将其粘贴到谱图上。
输数值10、输出积分数值。
进⼊View/Tables/Integrals菜单将其显进⼊“”菜单将其显⽰出来，单击“Report”按钮可将其粘贴到谱图上。
到谱图上11、输出谱图。
进⼊“File/Save As”菜单可将处理后的谱图输出多种格式。
图输出多种格式⼆维谱图处理进⼊“File/Open”菜单，找到需要处理的菜单维实数据开为或者⼆维实验数据，打开名为“2rr”“acqu”的⽂件。
MestReNova软件及教程2--二维图谱处理
①选中水平的H 打钩，垂直的C打钩,对齐
画图，左边□ ，改为Contour plot。
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
2D校准；点击tms,拉动鼠标把鼠标移到相关点上读取相应的H,C 化学 位移，在把鼠标拉到所要对准的峰位置点击鼠标左键把要对准的化学位
移改为刚才读取的要改的H或C.
把峰的化学位移改为相关点的化学位移
2D校准；点击tms,拉动鼠标把鼠标移到相关点上读取相应的H,C 化学 位移，在把鼠标拉到所要对准的峰位置点击鼠标左键把要对准的化学位
2d标峰（自动或手动）
2d标峰（自动或手动）；标出H,C化学位移
对qc, roesy,在图上双击2D Spectrum(跳出)/number of positive number negative改为0；或者将positive number改为0，保留nagative值。
对qc, roesy,在图上双击2D Spectrum(跳出)/number of positive number negative改为0。
移改为刚才读取的要改的H或C.（如可以把5.5ppm改为5.33ppm)
2D改颜色：双击鼠标、nmrspectrum/2dspectrum/palette改为Grayscale; nmrspectrum/1dspectrum/color改为黑色。
2D改颜色：双击鼠标、nmrspectrum/2dspectrum/palette改 为Grayscale; nmrspectrum/1dspectrum/color改为黑色。
点击tms拉动鼠标把鼠标移到相关点上读取相应的hc化学位移在把鼠标拉到所要对准的峰位置点击鼠标左键把要对准的化学位移改为刚才读取的要改的h或c
MestreNova
mestrenova pagesetting参数
mestrenova pagesetting参数MestReNova页面设置参数MestReNova是一款用于核磁共振（NMR）和质谱数据处理的软件。
在进行数据处理和分析时，合理设置MestReNova的页面参数可以提高工作效率和结果可视化。
本文将介绍MestReNova的页面设置参数，帮助读者更好地使用这款软件。
1. 页面大小和方向在MestReNova中，可以通过设置页面大小和方向来适应自己的工作需求。
点击菜单栏中的“编辑”选项，选择“页面设置”打开页面设置对话框。
在对话框中，可以选择页面大小为A4、Letter等常用纸张大小。
同时，可以选择页面方向为纵向（纵向放置）或横向（横向放置）。
2. 边距设置页面边距设置可以控制图谱在页面上的位置和间距。
在页面设置对话框中，有4个边距选项：上边距、下边距、左边距和右边距。
可以根据实际需求调整这些边距数值，以达到理想的页面布局效果。
3. 标题设置在进行图谱分析时，通常需要在图谱页上添加标题。
MestReNova提供了页面标题设置选项，可以在页面上添加自定义标题。
点击菜单栏中的“编辑”选项，选择“页面标题”打开页面标题设置对话框。
在对话框中，可以选择标题内容、字体、字号、颜色等参数，并通过预览功能查看效果。
设置完成后，点击“确定”按钮即可将标题添加到图谱页面上。
4. 网格设置在图谱页面上添加网格可以帮助读者更好地观察和分析数据。
在MestReNova中，可以通过网格设置选项来控制网格的样式。
点击菜单栏中的“查看”选项，选择“网格线”打开网格设置对话框。
在对话框中，可以选择网格样式、线条颜色、线型、线宽等参数。
设置完成后，点击“确定”按钮即可在图谱页面上显示出所设置的网格线。
5. 刻度设置刻度设置可以帮助读者更好地读取和理解图谱上的数据信息。
在MestReNova中，刻度设置可以设置图谱页面上的坐标轴刻度及其样式。
点击菜单栏中的“查看”选项，选择“刻度”打开刻度设置对话框。
MestReNova核磁谱图处理指引
MestReNova核磁谱图处理指南1、单击Mnova图标运行Mnova。
2、进入File/Open菜单或使用键盘快捷键CmdO in Mac或单击工具栏的Open 按钮。
3、找到您磁盘上需要处理的实验数据打开实验数据文件夹打开名为fid的文件。
Mnova界面上将会出现在谱仪上已经经过初步处理的谱图。
4、标定化学位移。
单击工具栏的Reference按钮选择要用来定标的峰。
PabloMonjePhD25、调整相位和基线。
单击工具栏的PhaseCorrection按钮和Baseline Correction 按钮。
6、粘贴参数表格在谱图上。
在菜单栏上按以下操作View/Tables/Parameters。
出现对话框之后单击Report按钮译者注如无特别需要此步骤可以不做。
建议在谱图上手动添加样品编号其操作方法是通过菜单操作Annotate/Text 或按键盘T键在谱图的某一位置手动添加一个文本框加入样品编号。
7、标注各峰化学位移。
单击工具栏的PeakPicking按钮自动标注各峰化学位移。
译者补充如果您认为自动标注标出的峰太多或太少可以选择手动标注其操作方法是单击工具栏的PeakPicking按钮右边的小箭头在其中选择manual这样便可以3能过鼠标选择区域进行标注。
8、积分。
单击工具栏的Integration按钮谱图将会被自动积分。
积分数值显示在各峰的下面。
详细的各峰区域和积分值列表可以通过菜单操作View/Tables/Integrals将其显示出来。
单击Report按钮可将其粘贴到谱图上。
译者注如无特别需要将各峰区域和积分值列表粘贴到谱图上的步骤可以不做。
4译者补充如果您认为自动积分可能会不准确可以选择手动积分其操作方法是单击工具栏的Integration按钮右边的小箭头在其中选择manual这样便可以能过鼠标选择区域进行积分。
9、您可以通过单击工具栏的MultipletAnalysis按钮自动进行多重峰分析。
MestReNova作图
本教程以dppv的1H NMR谱为例，氘代试剂为Acetone-d6(含TMS)，数据采集于Bruker Avance 400 NMR核磁共振仪，dppv结构如下：本教程所用MestReNova版本信息如下图所示：1H NMR核磁数据所在位置：打开核磁数据，有打开文件和打开文件夹两种方式，如下图所示，(1) 在文件(快捷组合键：Alt+F)下拉菜单的打开(O)选项(快捷组合键：Ctrl+O；键盘操作：Alt+F，然后O)，在弹出的打开对话框中找到文件fid，然后点击打开；(2) 在文件(快捷组合键：Alt+F)下拉菜单的打开(i)选项(快捷组合键：Ctrl+I；键盘操作：Alt+F，然后I)，在弹出的打开文件夹对话框中核磁数据所在文件夹(此处为1)，然后点击选择文件夹：经上述操作后打开的核磁数据如下图所示：1. 背景网格的设置利用如下图所示的三种方式中任意一种打开属性对话框，在NMR谱选项中选择网格，在其中可以设置背景网格的格式：不过通常作图时不需要这些网格线，因此将水平显示、垂直显示和边框显示前面的勾去掉后点击应用或OK即可，效果如下图所示：2. 谱图标题(Title)设置在属性对话框NMR谱选项中点击一般，可以设置标题的各种格式：不过作图时通常不需要这种标题，因此将标题前面的勾去掉，然后点击应用或OK即可，效果如下图所示：3. 标峰标峰的方式有两种，即逐个标峰或者手动设置阈值，在分析下拉菜单中标峰展开项(下图左)或者下图右红色方框的小倒三角展开项中可以选择逐个标峰或者手动设置阈值来进入标峰模式，或者使用快捷键K或Ctrl+K：在手动设置阈值模式下，在谱图空白处按住鼠标左键不放，拖动鼠标，可以看到随着鼠标的移动形成了一片红色区域，如下图所示，在该红色区域内，或者说比该红色区域底边更高的峰将被全部标出：经上述操作后，结果如下图所示：逐个标峰模式也差不多，根据需要使用哪种模式都可以，其目的就是方便快速对自己需要标出的峰进行标峰。
mestrenova使用技巧
mestrenova使用技巧以下是一些MestReNova（Mnova）的使用技巧：1. 导入数据：MestReNova可以导入各种不同格式的数据文件，包括NMR、LC、GC、MS等。
只需点击“导入数据”按钮，选择相应的文件并加载即可。
2. 调整绘图参数：在绘制谱图之前，您可以调整绘图的参数，例如选择峰宽、展宽、纵坐标范围等。
这将有助于您更好地呈现和分析数据。
3. 峰识别和峰归属：MestReNova具有强大的峰识别和峰归属功能。
您可以使用自动峰识别工具来寻找峰，并将其与化合物库进行匹配以进行峰归属。
您还可以手动添加和调整峰的位置和参数。
4. 数据处理和谱图编辑：MestReNova提供了广泛的数据处理和谱图编辑功能。
您可以执行各种操作，如峰积分、积分图、数据拟合、基线校正等。
此外，您还可以修改绘图风格、添加文本和标签等来改善谱图的可读性。
5. 自动生成报告和导出数据：MestReNova允许您自动生成报告，其中包含您的数据、处理结果和谱图。
您还可以将数据导出为各种格式，如PDF、Excel、CSV等，以便与他人共享或进一步分析。
6. 定量分析：MestReNova还提供了定量分析功能，可用于计算峰面积、浓度、纯度等参数。
您可以选择不同的定量方法和计算公式，并根据需要进行自定义。
7. 批处理和自动化：对于需要处理大量数据的任务，MestReNova提供了批处理和自动化功能。
您可以设置和运行批处理脚本，从而自动执行一系列操作，以提高工作效率。
这些只是MestReNova的一部分功能和使用技巧。
根据您的具体需求，您可能还需要探索更多高级功能和工具。
MestReNova核磁数据导出到Excel或Origin
MestReNova核磁数据导出到Excel或Origin
MestReNova核磁数据导出到Excel或Origin
核心提示：以下述核磁图为例。
1. 进入“File”菜单，点击“Save As（另存）”。
2. 在弹出的对话框中，“保存类型”选择“ASCII Text File（*.txt）”文件打开后的内容见下图3. 打开E...
以下述核磁图为例。
1. 进入“File”菜单，点击“Save As（另存）”。
2. 在弹出的对话框中，“保存类型”选择“ASCII Text File （*.txt）”
文件打开后的内容见下图
3. 打开Excel，选中一个单元格，点击“数据”，选择工具栏中“自文本”，打开刚才另存的文件。
4. 在弹出的对话框中，选择“分隔符号”模式，点击“下一步”继续。
5. 勾选适当的“分隔符号”，看看“数据预览”的数据分列是否正常分开，然后点击“完成”即可。
6. 结果图如下
如需在Origin中使用，直接从Excel中将数据复制过去就OK了。
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MestReNova核磁谱图处理指南
1、单击Mnova图标运行Mnova。
2、进入File/Open菜单或使用键盘快捷键CmdO in Mac或单击工具栏的Open按钮。
3、找到您磁盘上需要处理的实验数据打开实验数据文件夹打开名为fid的文件。
Mnova界面上将会出现在谱仪上已经经过初步处理的谱图。
4、标定化学位移。
单击工具栏的Reference按钮选择要用来定标的峰。
PabloMonjePhD
25、调整相位和基线。
单击工具栏的PhaseCorrection按钮和Baseline Correction按钮。
6、粘贴参数表格在谱图上。
在菜单栏上按以下操作
View/Tables/Parameters。
出现对话框之后单击Report按钮译者注如无特别需要此步骤可以不做。
建议在谱图上手动添加样品编号其操作方法是通过菜单操作Annotate/Text 或按键盘T键在谱图的某一位置手动添加一个文本框加入样品编号。
7、标注各峰化学位移。
单击工具栏的PeakPicking按钮自动标注各峰化学位移。
译者补充如果您认为自动标注标出的峰太多或太少可以选择手动标注其操作方法是单击工具栏的PeakPicking按钮右边的小箭头在其中选择manual这样便可以3能过鼠标选择区域进行标注。
8、积分。
单击工具栏的Integration按钮谱图将会被自动积分。
积分数值显示在各峰的下面。
详细的各峰区域和积分值列表可以通过菜单操作
View/Tables/Integrals将其显示出来。
单击Report按钮可将其粘贴到谱图上。
译者注如无特别需要将各峰区域和积分值列表粘贴到谱图上的步骤可以不做。
4译者补充如果您认为自动积分可能会不准确可以选择手动积分其操作方法是单击工具栏的Integration按钮右边的小箭头在其中选择manual这样便可以能过鼠标选择区域进行积分。
9、您可以通过单击工具栏的MultipletAnalysis按钮自动进行多重峰分析。
10、您可以输出各种格式的多重峰自动分析结果。
单击工具栏的MultipletAnalysis按钮右边的小箭头在其中选择Report出现一个对话框您可以选择您所需要的模板JACS Royal Society of Chemistry and Angewandte。
5
11、您可以通过单击工具栏的Multiplet Analysis按钮右边的小箭头在其中选择copy将多重峰自动分析结果复制到剪贴板粘贴到别的文档中去。
612、您也可以很容易的从别的软件中如ChemdrawIsisDraworChemsketch将化学式粘贴到Mnova的谱图上来。
7译者补充一、工具栏中与一维谱图处理有关的各图标释义。
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 1放大谱图2缩小谱图3显示谱图全部4手动输入数值放大谱图5放大谱图之后移到观察谱图的区域6为谱图的某个小区域做一个放大扩展图7调整谱图的峰高至适合屏幕8增大峰强9减小峰强10准确显示谱图上某一点的信息11裁减谱图右边小箭头有可选项12调出FID数据右边小箭头有可选项13对FID数据进行傅立叶变换右边小箭头有可选项14调整相位右边小箭头有可选项15调整基线右边小箭头有可选项16化学位移标定17标注化学位移右边小箭头有可选项18积分右边小箭头有可选项19多重峰分析右边小箭头有可选项。
二、部分快捷键列表X激活裁减模式一次‘X’：
水平裁减两次‘X’：
垂直裁减P激活平移模式一次‘P’：
普通平移两次‘P’：
水平平移三次‘P’：
垂直平移增大峰强-减小峰强Z激活放大模式一次‘Z’：
水平放大两次‘Z’：
垂直放大三次‘Z’：
区域放大SHIFTZ激活缩小模式按键次数功能同上8 Space Bar临时激活平移模式ESC取消工具栏选择SHIFT键盘上键增大峰强SHIFT键盘下键减小峰强鼠标滚轮增大减小峰强F显示谱图全部M手动输入数值放大谱图H调整谱图的峰高至适合屏幕T文字注释E为谱图的某个小区域做一个放大扩展图三、谱图输出Mnova处理的谱图可出输出为多种格式pdf、jpg、txt等通过菜单操作File/Save As可以选择输出格式。
四、谱图打印通过菜单操作File/Print或单击工具栏按钮或通过快捷键CtrlP 可以打印9出Mnova处理的谱图。
由于现在大家使用的普遍是黑白打印机为了保证打印质量建议将谱图上的各种图形的颜色改为黑色。
其操作方法是通过菜单操作Edit/Properties或在谱图上双击或在谱图上单击右键选择Properties出现Properties对话框可以调整谱图上各种图形的颜色、线型等内容。
1、双击图标按照提示一步的安装这个我就不说了。
2、安装完毕后第一次打开程序会出现如下两个提示这个提示的意思是你还没有安装license文件。
这个程序一共有两个license文件一个是NMRPredictDesktop这个是用于核磁预测的另一个就是NMR V
1.0这一个很重要只有安装了这个licensekey文件才能打开fid文件。
这两个提示你都直接点ok就行了
3、下载licence文件进入程序界面后选择菜单help-Evaluate/Buy出现如下对话框在step1里面选择NMRver
1.0然后在step2里面点“Evaluate”这时候会自动打开一个网页这是官方网页如下所示按照表单的提示填入内容e-mail必须要填写比如chasgone
4、激活licence文件下载完毕后回到刚才的MestrecNova界面点“Activate license”这时候会打开一个对话框然后选择刚才下载的lic文件。
选择后点确定。
用同样的方法下载并安装NMRPredict Desktop的lic文件。
完成上述步骤后关闭程序重新打开程序这时候就不会再有那两个提示框了。
这个时候在Activeted licenses里面就会出现你的license相关信息。
只有安装这两个license后才会出现processinganalysistools菜单才能进行图谱处理。
官方下载的lic只能使用45天后将不能再继续使用不过我已经写了一个破解工具在中国核磁共振论坛里核磁共振软件下载NMR软件下载板块有下载地址/dispbbs.aspboardID6ID2435page1二、软件界面MestreNova是一个多界面软件它允许同时打开多个图谱并可以把这多个图谱保存在一个文件里面这样对于处理同一个样品的氢谱、碳谱、二维等图谱是非常方便的。
如图所示左边为导航条右边为显示图谱的区域。
三、快速入门
1、在安装lic之后点菜单file-open或者点快捷打开按钮如下图所示在弹出的对话框中选择你的数据文件varian为fid文件然后点‘打开’此时MestreNova就已经帮你把图谱处理好了。
你不再需要进行傅立叶变换相位校正等过程这个就是本软件比其他软件优越的地方。
2、如果你的图谱需要进行相位矫正或者基线矫正的话则只需按来进行相位矫正按来进行基线矫正。
3、按按钮可以进行自动积分当然也可以进行手动积分的方法是按右边的向下小箭头选择manual然后选择你需要的积分区域即可。
在积分线上点右键则可以对已经过分的区域或者数值进行各种编辑调整。
4、点可以进行TMS或者溶剂峰的定标用同样的方法可以处理其他一维二维及DEPT等图谱。
5、点edit-properties打开一个对话框在这里可以调整图谱标尺积分化学位移相关的信息包括位置、形状、颜色、字体大小背景的颜色是否使用格子等很多信息。