南方医-医学信息获取与管理PPT课件
医学信息收集.ppt
搜索引擎
网络信息收集方法
这是网络中最常用的搜索工具， 包括有综合性的搜索引擎和专业性的 搜索引擎。目前国外已有十余种医学 专业的搜索引擎，如Medical Matrix、 Medical World Search等，但是国 内还未出现医学专业的搜索引擎。
网络数据库
网络信息收集方法
美国国立医学图书馆主页上有大量 免费的生物医学数据库，包括著名的 MEDLINE数据库，而国内网络数据库主 要有：中国期刊网、重庆维普资讯和万 方数据库，这些数据库一般都有相对应 的光盘数据库。
HMIS侧重于医院行政事物的管 理和医院财务的管理。其目的在于加 强医院的管理，完善医院成本体系， 保证医疗费支出合理、准确，提高 医院竟争力。
医院管理信息系统收集的信息包括：
门诊管理信息
包括挂号、处方、划价、收费和 发药等有关信息。
药品管理信息
包括药房、药库和各种药品的各 种性质、性能、采购、定价、进出库、 报损、统计、查询等信息。
信息收集的原则
先行性原则 针对性原则 系统性原则 准确性原则 多渠道原则 收集与分析相结合的原则
信息收集的相关政策和法规
遵守国家的基本法律和政策 尊重隐私权 维护知识产权
信息源的含义、属性及特征
含义
联合国科教文组织出版的《文献 术语》把其定义为：个人为满足其信 息需要而获得信息的来源,称为"信息 源"。
CIS是用于临床信息管理的大型数 据库应用系统。包括电子病历、图像 传输、实验室检查和仪器传输系统以 及远程医疗等到人机交互系统。
该系统以病人为中心，临床医生是 病人信息收集和利用的主体,各类仪器 设备为信息载体。
临床信息系统收集的信息包括：
既往病史信息采集
2024版《医学信息学课件十讲》
《医学信息学课件十讲》contents •医学信息学概述•医学信息学基础知识•医学信息系统•医学数据挖掘与分析•医学信息安全与隐私保护•医学信息学前沿技术•医学信息学实践与应用目录01医学信息学概述医学信息学的定义与发展医学信息学定义医学信息学是研究医学信息的获取、处理、存储、传播和利用的科学，是医学与计算机科学、信息科学等学科交叉融合的产物。
发展历程医学信息学经历了从医学文献管理、医学图像处理到临床信息系统、区域卫生信息化等发展阶段，目前正朝着大数据、人工智能等方向深入发展。
研究医院信息系统、电子病历系统、实验室信息系统等的规划、设计、实施和评价。
医学信息系统研究医学图像的获取、处理、分析和可视化，以及基于医学图像的疾病诊断和治疗。
医学图像处理研究基因组学、蛋白质组学等生物信息数据的获取、处理和分析，以及基于生物信息学的疾病预测和治疗。
生物信息学研究基于数据挖掘、机器学习等技术的医学决策支持系统，为医生和患者提供个性化的诊疗建议。
医学决策支持医学信息学的研究领域提高医疗质量降低医疗成本促进医学研究推动医疗改革医学信息学的重要性通过电子病历系统、临床决策支持系统等应用，提高医生诊疗水平和患者治疗效果。
通过生物信息学、医学图像处理等技术，促进基础医学和临床医学的研究和发展。
通过医院信息系统、区域卫生信息化等建设，实现医疗资源的优化配置和共享，降低医疗成本。
通过医学信息学的应用和推广，推动医疗卫生体制改革和医疗卫生服务模式的创新。
02医学信息学基础知识03计算机网络基础网络的定义、分类、拓扑结构以及TCP/IP 协议等基础知识。
01计算机硬件组成包括中央处理器、内存、硬盘、显卡等硬件设备的功能和作用。
02计算机软件分类系统软件和应用软件的定义、特点及常见类型。
计算机基础知识医学信息学的概念、研究范围以及与相关学科的关系。
医学信息学定义医学数据与信息医学信息系统医学数据的类型、特点，以及医学信息的获取、处理和应用。
南方医--医学信息获取与管理
主要文献类型的著录格式
• 专著: 作者. 书名. 出版地:出版者,出版年 如: Borko H, Bernier C L. Indexing concepts and methods. New
主题词字顺表 (包括主题词,副主题词,款目词）
树状结构表(仅主题词，分15个大类）
A Anatomy
解剖学
B Organisms 生物体
C Diseases
疾病
D Chemicals&Drugs 化学物质与药物
E Analytical…… 诊断治疗技术与设备
F Psychiatry…… 精神病与心理学
• 一次文献：是指作者以本人的研究成果为基本 素材而创作或撰写的文献，如阅读性图书、期 刊论文、科技报告、专利文献、会议文献、学 位论文、技术档案等都是一次文献。
文献的级别
• 二次文献：是指文献工作者对分散的无组织 的一次文献进行搜集、提炼、浓缩、加工、 整理,并按一定的科学方法组织编排、编辑出 版的文献，是为了更有效地管理和利用一次 文献而编辑的工具性文献。如各种目录、题 录、文摘及机读型书目数据库、网上检索引 擎等都属于二次文献。
influenza NOT vaccination
位置检索
“with” 表示“同字段与”
检索式A with B，表示限定检索词A和B 在同一字段范围内出现的文献为命中文
献。例：stomach with ache
位置检索
2024年医学信息检索与利用课件
2024/2/29
培养批判性思维和信息评价能力
临床医生在面对海量的医学信息时，需要具备批判性思维和信息评价能力，能够判断信 息的真伪和价值。
18
科研人员的医学信息检索与利用
跟踪学科前沿和研究热点
获取全面的研究资料和数据
科研人员需要利用专业的医学数据库和网站获取全 面的研究资料和数据，支持自己的研究工作。
医学词汇分词技术
针对中文医学文本，采用专业的分词算法对文本进行分词处理。
医学词汇词性标注
对分词后的医学词汇进行词性标注，为后续文本处理提供基础信 息。
9
医学文本挖掘技术
医学实体识别
从医学文本中识别出疾病、症状、药物等实体，为后续分析和挖掘 提供基础数据。
医学关系抽取
从医学文本中抽取实体之间的关系，如疾病与症状、药物与疾病等 关系。
用户反馈机制
建立用户反馈机制，收集用户对 检索结果的满意度和改进意见， 不断优化个性化检索算法。
2024/2/29
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03
医学信息的利用与价值
2024/2/29
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医学信息的分类与内容
医学文献信息
包括医学期刊、论文、会议文献等，涵 盖基础医学、临床医学、预防医学等各
个领域。
医学图像信息
2024/2/29
通过获取和应用最新的医学信 息，医生可以不断更新自己的 知识和技能，提高诊断和治疗 水平，为患者提供更好的医疗 服务。
医学信息是医学教育和培训的 重要内容，通过信息检索和利 用，学生可以获取丰富的学习 资源和实践经验，提高学习效 果和综合素质。
通过获取和分析大量的医学信 息，可以及时发现和预防公共 卫生事件和疾病流行趋势，为 政府和社会提供科学的决策依 据和健康管理建议。
2024版医学信息学概论第一章绪论ppt课件
contents •绪论•医学信息学基础知识•医学信息学核心技术•医学信息学在医疗领域应用•医学信息学在公共卫生领域应用•医学信息学发展趋势与挑战目录01绪论医学信息学定义与发展医学信息学定义发展历程医学信息学经历了从医学文献管理、医学图像处理到临床信息系统、区域卫生信息化等发展阶段，逐渐成为医疗卫生领域不可或缺的重要支撑。
医学信息学研究对象与内容研究对象研究内容医学信息学应用领域及价值应用领域价值体现02医学信息学基础知识计算机硬件基础计算机软件基础计算机网络基础030201计算机科学与技术基础医学基础知识人体解剖学与生理学包括人体各系统、器官的结构和功能，以及生命活动的基本过程。
医学诊断与治疗基础涵盖常见疾病的诊断方法、治疗手段和预防措施。
医学影像学基础涉及医学影像技术的基本原理、检查方法和影像诊断。
信息管理与信息系统基础信息管理基础01信息系统基础02医学信息学应用基础0303医学信息学核心技术数据挖掘与知识发现技术数据预处理数据挖掘算法结果解释和评估生物信息学技术基因组学数据分析对基因组数据进行组装、注释、比较分析等，揭示基因与疾病的关系。
转录组学数据分析研究基因转录产物在特定条件下的表达情况，揭示基因表达的调控机制。
蛋白质组学数据分析研究蛋白质的结构、功能、相互作用等，揭示蛋白质在生命活动中的作用。
医学影像处理技术医学影像处理医学影像获取对获取的影像数据进行预处理、增强、分割等操作，提取感兴趣区域。
医学影像分析04医学信息学在医疗领域应用医嘱管理医生可通过电子病历系统开具医嘱，包括药品、检查、治疗等，实现医嘱的规范化、标准化管理，减少医疗差错。
病人信息管理电子病历系统可实现病人基本信息的录入、存储和查询，包括个人信息、病史、家族史等，方便医生快速了解病人情况。
病历质量控制电子病历系统可对病历进行质量控制，如完整性检查、逻辑性检查等，提高病历质量。
1 2 3在线咨询远程会诊远程监护移动医疗应用健康管理疾病预防医疗辅助05医学信息学在公共卫生领域应用公共卫生信息系统建设公共卫生信息系统架构数据来源与标准化信息共享与协同传染病监测与预警系统应用监测网络构建数据分析与挖掘预警模型建立健康教育与促进工作支持健康知识库建设个性化健康教育健康促进活动支持06医学信息学发展趋势与挑战大数据时代下的挑战与机遇数据驱动的医疗决策支持患者数据隐私保护医疗数据共享与协同智能辅助诊断医学影像分析个性化医疗利用人工智能技术辅助医生进行疾病诊断和治疗方案制定。
医院管理信息系统PPT课件
完整的医院信息系统
管理信息系统(HMIS)
临床医疗信息系统(CIS)
管理信息系统(HMIS)
门 、 急 诊 挂 号 及 收 费 子 系 统
住 院 病 人 管 理 子 系 统 药 库 、 药 房 管 理 子 系 统 病 案 管 理 及 统 计 子 系 统 人 事 、 工 资 管 理 子 系 统 财 务 管 理 与 医 院 经 济 核 算 子 系 统 医 院 后 勤 物 资 供 应 子 系 统 固 定 资 产 、 医 疗 设 备 管 理 子 系 统 支院 持长 系办 统公 综 合 查 询 与 辅 助 决 策
开发医院信息系统的意义
竞争的需要 管理者的需要 医务工作者的需要 患者的需求
(3) 医院信息化与数字化医院及HIS
根据1997年4月召开的全国信息化工作会议的精神，国家信 息化的定义是：在国家统一规划和组织下，在农业、工业、 科学技术、国防及社会生活各个方面应用现代信息技术，深 入开发、广泛利用信息资源，加速实现国家现代化的进程。 套用国家信息化的定义，医院信息化应该是：在医院统一规 划和组织下，应用现代信息技术，深入开发、广泛利用信息 资源，加速实现医院现代化的进程。 数字化医院也称 E-hospital ,按字面理解为医院信息数字化 或电子化，也有人理解为无纸化、无胶片化医院。无论数字 化、电子化实质上是采集、处理、利用信息资源加快实现医 院信息化。因此数字化医院与医院信息化只是提法不同（后 者更好）。 广义的HIS是现代化医院建设（数字化医院）的基础设施与支 撑环境。
⒈2 发展及现状
（1）国外状况 美国： 探索阶段：（20 世纪 60 年代初－70 年代初），以小型机 的事务处理系统和收费系统为主。 发展阶段：（20世纪70年代中－80年代中）利用在线通 讯技术开发全院信息系统。（门诊、住院、收费、医技 等） 成熟阶段：（ 20 世纪 80 年代末－ 90 年代中），为提供 医疗质量和护理质量，重点开发与诊疗有关的医嘱系统、 LIS、PACS、病人监护系统、合理用药系统等。 提高阶段：（ 20 世纪 90 年代末－）重点开发电子病历、 辅助决策、统一医学语言系统及HIS评估。
医学信息学课件
具有跨学科性、综合性、实践性等特点，涉及医学、计算机 科学、信息科学等多个领域的知识。
医学信息学的历史与发展
1 2 3
起源
医学信息学起源于20世纪50年代，随着计算机 技术的发展而逐渐发展。
发展历程
经历了医疗数据处理、医疗信息系统、医疗大 数据等多个阶段，目前正朝着智能化、精准化 的方向发展。
医学专家系统的应用
医学专家系统广泛应用于临床决策支持、疾病诊断、治疗方案制定等领域。例如，基于人 工智能技术的肺结节检测系统，能够辅助医生快速准确地检测出肺结节病变。
05
医学信息学的未来趋势
大数据与医学信息学
总结词：深度融合
详细描述：大数据技术与方法在医学信息学领域的应用将进一步拓展，涉及从临 床决策支持到患者管理等多个方面，推动医学信息学向更高效、更精准的方向发 展。
数据清洗和处理
对采集到的数据进行清洗和处理，包括数据筛选 、缺失值填充、异常值处理等。
数据分析
采用适当的统计分析方法，对处理后的数据进行 深入的分析和挖掘，提取有用的信息和知识。
04
医学信息学的技术工具
医学数据库系统
医学数据库系统的定义和分类
医学数据库系统是用于存储、管理、检索和保护医学数据的计算机系统。根据数据类型和 用途，可分为临床数据库、生物信息数据库、影像数据库等。
医学数据库系统的功能
医学数据库系统应具备数据存储、数据查询、数据分析、数据共享等功能，以确保医学数 据的准确性和完整性，提高医疗服务质量。
医学数据库系统的应用
医学数据库系统广泛应用于临床决策支持、病例跟踪、流行病预测、药物研发等领域。
医学信息检索系统
01
医学信息检索系统的概述
医学信息检索与利用PPT课件
信息素质能力的评价标准
“美国高等教育中学生信息素质能力标准”： • 能确定信息资源的特点和范围； • 能有效地获取所需信息； • 能评价信息及其来源，利用其知识基础和 价值系统选择适当的信息； • 能有效利用所获得的信息实现特定的目标； • 在信息获取和利用时自觉遵守道德规范和 有关的法律。
5
（二）科技创新与信息检索
（三）主题语言
• 主题检索语言：一种采用描述文献主题 内容的词语标识并按照字顺排检文献的 检索语言。主要包括主题词和关键词两 种。 • 叙词法：严格规范化、可进行概念组配、 具有完善参照系统、具有范畴索引等。 • 关键词法：以出现在文献的标题、摘要 或全文中能表达文献实质内容的词或关 键性专业名词术语作为检索标识。 31
二、医学信息检索的基本概念
（一）信息——知识——文献
• 信息： 对现实世界事物的反映。
在自然界、人类社会以及人类思维活 动中普遍存在，是物质存在方式及其运动 的规律、特点的外在表现。 • 知识：人们通过信息对世界的认识与掌握， 是人的大脑通过思维重新组合的系统化信 息的集合。 • 文献：记录有知识的一切载体。
1、主题语言——主题词
主题词： 又称叙词，是以规范化的词汇来表 达文献内容的主题。 规范化也就是对文献中的同义词、 近义词、多义词等加以规范，同一主题 概念的文献相对集中在一个主题词下。 • 采用参照系统间接反映主题概念之间的 关系
32
如：“肾功能衰竭” renal failure
或 Kidney failure
医学信息检索与利用
总 论
1
一、学习医学信息检索课 的目的和意义
（一） 提高信息素质与信息检索 （二） 科技创新与信息检索
2
（一）信息素质教育与信息检索
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• 期刊: 作者(多作者用逗号分开,超过3个者用et al). 文章题 目.刊物名称,年代,卷数(期数):页数
如: Porter MF, Zhang J. An algorithm for suffix stripping. Program, 1980, 14(3):130~137
例：stomach near4 ache
截词
• 包括后截（最常用）、中截、前截等。 • 不同检索系统截词符各有规定，常用有：?、*、！、$
• *——无限截断，可代替词尾的0-n个字母,
– 如: vaccin*,可以查出所有含有vaccin词根的文献,如： vaccina ; vaccine; vaccines; vaccination; Vaccinium ; vaccinated ; post-vaccinal ; Post-vaccination; vaccine-naive
• 学位论文:作者.题名[学位论文]. 保存地点:保存单 位,年份
如:Cairns R B. Infrared spectroscopic studies on solid oxygen
• Know-what Know-why • Know-how Know-who
什么是情报（Information）?
• 是解决特定问题所需要的知识 （知识性、传递性、效益性）
• 情报（信息）意识:即“意识情报的能 力”，是人们对大量客观存在的情报的 自觉反应。情报意识也指人们获取情报 的积极性和主动性。
主要通过“和(and,*)”、“或(or,+)”、“非 (not,-)”等将检索词联结起来。 • 如：信息检索 AND 计算机
（信息检索 OR 文献检索） AND 计算机 文献检索 NOT 文献检索课
布尔逻辑运算符
AND
OR
NOT
influenza AND vaccination
vaccination OR vaccine
• 狭义概念——仅指上述过程的后半部分，即从信息 集合中找出所需要的信息的过程，相当于人们通常 所说的信息查寻（Information Search)。
计算机检索的基本原理
• 检索技术及其实现。 • 检索技术包括基本布尔逻辑组配、截词、词位
限制、检域限制等。 • 布尔逻辑组配是现行计算机检索的基本技术，
• 是知识的外在表现形式。
信息与知识、情报、文献的相互关系
•
信息←→知识→情报
文献
文献
情报 知识 信息
信息检索（Information Retrieval）
• 广义概念——是指将信息按一定的方式组织和存贮 起来，并根据信息用户的需要找出有关的信息过程， 故全称：“信息的存贮与检索(Information Storage and Retrieval ) 。
• ？——有限截断，可代替词中的1个字符。
– 例:白介素?2,可以查出白介素-2的文献；环孢?素可以查 出含有环孢霉素、环孢菌素的文献；Leukemi?可以查 出含有Leukemia、Leukemic、Leukemid的文献
检索技术及其实现——检域限制
• 检域限制也称字段限制，包括前缀限制符和后缀限制符。 如对DIALOG系统而言，前缀限制符有：
• 运用加权检索可以命中核心概念文献，因此它是一种缩小 检索范围提高检准率的有效方法。但并不是所有系统都能 提供加权检索这种检索技术，而能提供加权检索的系统， 对权的定义、加权方式、权值计算和检索结果的判定等方 面，又有不同的技术规范。
主要文献类型的著录格式
• 专著: 作者. 书名. 出版地:出版者,出版年 如: Borko H, Bernier C L. Indexing concepts and methods. New
医学信息获取与管理
什么是信息（Information）？
• 是生物体通过感觉同外界交换内容的总称， 是物质的一种基本属性，是物质存在方式 及其运动规律特点的外在表现。
– 信息有多种类型：自然信息、生物信息、社 会信息等。
春天来了？
什么是知识（knowledge）？
• 是人们通过信息对自然界，人类社会以及思 维活动规律的认识与掌握，是人脑通过思维 重新组合的系统化信息的集合。–ຫໍສະໝຸດ AU= 限查特定作者–
JN= 限查特定刊名
–
LA= 限查特定语种
–
PN= 限查特定专利号
–
PY= 限查特定年代
• 后缀限制符例如：
–
/TI 限在题目中查
–
/AB 限在文摘中查
–
/DE 限在叙词标引中查
• 目前大多数检索系统提供菜单式检索，只需选择字段，不 需要记住及输入字段代码。
• 加权检索是某些检索系统中提供的一种定量检索技术。加 权检索同布尔检索、截词检索等一样，也是文献检索的一 个基本检索手段，但与它们不同的是，加权检索的侧重点 不在于判定检索词或字符串是不是在数据库中存在、与别 的检索词或字符串是什么关系，而是在于判定检索词或字 符串在满足检索逻辑后对文献命中与否的影响程度。加权 检索的基本方法是：在每个提问词后面给定一个数值表示 其重要程度，这个数值称为权，在检索时，先查找这些检 索词在数据库记录中是否存在，然后计算存在的检索词的 权值总和。权值之和达到或超过预先给定的阈值，该记录 即为命中记录。
情报的属性
• 知识性：经过加工并为用户所需要的特 定知识或信息。
• 传递性：动态接受与利用。 • 效用性：启迪思维、增进见识、改变知
识结构、提高认识能力，发挥实用的、 社会的、经济的价值。
什么是文献（Literature, Document）?
• 用一定的方式（文字、图象、声音）记 录在一定的载体（纸张、磁盘、光盘） 上的知识都成为文献。
influenza NOT vaccination
位置检索
“with” 表示“同字段与”
检索式A with B，表示限定检索词A和B 在同一字段范围内出现的文献为命中文
献。例：stomach with ache
位置检索
“near(n)” 表示“同句与”
检索式A near B，限定检索词在同一自 然句中，即在同一句话中包含检索词A 和B的文献为命中文献。N为一个数字， 表示检索词之间间隔的词数。