第9章 两因素及多因素方差分析(生物统计学)
生物统计-方差分析

FB=
s /s
A
2
2 e
s /s
B
2
2 e
无重复观测值的二因素方差分析—多重比较
• 多重比较 对达到显著差异的因素的平均数进行多重比较 以SSR检验为例,
设因素A、B的水平数分别a、b,
LSR0.05=SSR0.05* s x 当检验因素A各水平平均数之间的差异显著性时,
s
x
= s
(Excel 文件)
二因素方差分析
无重复观测值的二因素方差分析—方差
• 平方和与自由度的分解 SST=SSA+SSB+SSe dfT=dfA+dfB+dfe
• 各项的方差
s SS / df
2 A A
A
s SS / df
2 B B
BБайду номын сангаас
s SS / df
2 e e
e
无重复观测值的二因素方差分析—F检验
x
= s
an
具有重复观测值的二因素方差分析—多重比较
当检验AxB各水平平均数之间的差异显著性时,
s
x
=
s
2 e
n
例6.5
• 为了研究某种昆虫滞育期长短与环境的关系,在给定的温 度和光照条件下进行实验室培养,每一处理记录4只昆虫的 滞育天数(数据见Excel文件)。试作方差分析,并进行多 重比较。 本例是一个固定模型的方差分析 (Excel 文件)
• F检验 (2)随机模型:A和B均为随机因素
s /s F = s /s
FA=
B
2
2 AB
A
2
2 AB 2 e
B 2
第九章双因素和多因素方差分析

第九章双因素和多因素方差分析引言方差分析是一种常用的统计方法,用于比较两个或多个组之间的差异。
双因素和多因素方差分析是方差分析的扩展,允许考虑两个或多个自变量对因变量的影响。
本文将介绍双因素和多因素方差分析的概念、假设检验、模型构建等内容。
双因素方差分析双因素方差分析主要用于对两个自变量对因变量的影响进行分析。
其中一个自变量称为因子A,另一个自变量称为因子B。
通过双因素方差分析,我们可以了解到两个自变量对因变量的主效应以及交互效应。
假设检验进行双因素方差分析时,我们需要对两个自变量的主效应和交互效应进行假设检验。
主效应是指每个因子对因变量的影响,交互效应是指两个因子之间是否存在相互影响。
在进行双因素方差分析时,我们需要提出以下假设:•零假设H0: 两个因子对因变量没有主效应和交互效应•备择假设H1: 至少一个因子对因变量有主效应或交互效应然后,我们可以通过方差分析结果的显著性检验来判断是否拒绝零假设。
模型构建双因素方差分析可以通过构建线性模型来进行。
通常,我们使用以下模型进行双因素方差分析:Y = μ + α + β + (αβ) + ε其中,Y表示因变量,μ表示总体均值,α表示因子A的主效应,β表示因子B的主效应,(αβ)表示交互效应,ε表示误差。
通过对数据进行拟合并计算模型中的各个参数,我们可以得到双因素方差分析的结果。
多因素方差分析多因素方差分析是对多个自变量对因变量的影响进行分析。
多因素方差分析可以包含两个以上的自变量,并且可以考虑每个自变量的主效应和交互效应。
假设检验进行多因素方差分析时,我们同样需要对每个自变量的主效应和交互效应进行假设检验。
假设检验的步骤与双因素方差分析类似。
模型构建多因素方差分析的模型构建与双因素方差分析类似,但是需要考虑多个自变量的影响。
Y = μ + α1 + α2 + … + αn + β + (αβ) + ε其中,Y表示因变量,μ表示总体均值,α1, α2, …, αn表示各个自变量的主效应,β表示交互效应,(αβ)表示两个或多个自变量之间的交互效应,ε表示误差。
生物统计附试验设计第九章协方差分析ppt课件

协方差分析有二个意义 , 一是对试 验进行统计控制,二是对协方差组分进行 估计。
一、对试验进行统计控制
为了提高试验的精确性和准确性 ,对 处理以外的一切条件都需要采取有效措施严 加控制,使它们在各处理间尽量一致,这叫 试验控制。但在有些情况下,即使作出很大 努力也难以使试验控制达到预期目的。例如: 研究几种配合饲料对猪的增重效果,希望试 验仔猪的初始重相同,因为仔猪的初始重不 同,将影响到猪的增重。
统计学已证明:两个变量的总乘积和与自 由度也可按变异来源进行剖分而获得相应的 均积。这种把两个变量的总乘积和与自由度 按变异来源进行剖分并获得获得相应均积的 方法亦称为协方差分析。
在随机模型的方差分析中,根据均方MS 和期望均方 EMS的关系, 可以得到不同变 异来源的方差组分的估计值。同样,在随机 模型的协方差分析中,根据均积 MP 和期望 均积 EMP 的关系,可 得 到 不同变异来源 的协方差组分的估计值。有了这些估计值, 就可进行相应的总体相关分析。这些分析在 遗传、育种和生态、环保的研究上是很有用 处的。
12
4 12
=1.64
dft(x,y) =k-1=4-1=3
3、处理内乘积和与自由度
SPe SPT SPt 8.25 1.64 6.61
dfe(x,y) dfT (xv) dft(xv) 47 3 44
平方和、乘积和与自由度的计算结果列 于表10-3。
表10-3 x与y的平方和与乘积和表
732.50 63.15 550.50 8.25 412
dfT ( x, y) =kn-1=4×12-1=47
两因素及多因素方差分析

第4页/共50页
③ 交互作用(互作,interaction)
在多因素试验中, 一个因素的作用要受到另一个因素的影 响,表现为某一因素在另一因素的不同水平上所产生的效应 不同,或者说,某一因素的简单效应随着另一因素水平的变
化而变化时,则称该两因素存在交互作用。
A1
B1
470
B2
480
B2-B1
10
平均
第23页/共50页
二 两因素单独观察值试验的方差分析
A、B两个试验因素的全部ab个水平组合
中,每个水平组合只有一个观察值,全部试 验共有ab 个观察值。其数据模式如表11—2 所示。
第24页/共50页
交 叉 分 组
A 因素 B1
B 因素
合计 平均
B2 … Bj … Bb
xi.
xi .
两
A1 x11 x12 … x1j … x1b x1 . x1.
SST=SSA+SSB+SSe dfT=dfA+dfB+dfe 各项平方和与自由度的计算公式为:
矫正数 C=x2../ab
总平方和
ab
ab
SST
(xij x..)2
xi2j C
i1 j 1
i1 j 1
A因素平方和
a
SS A b
i 1
(xi . x..)2
1 b
a i 1
xi2. C
表11-1日粮中加与不加赖、蛋氨酸雏鸡增重(g)
A1
B1
470
B2
480
B2-B1
10
平均
475
A2
A2-A1
平均
472
2
生物统计学 方差分析 新

资料,说明多重比较是做什么的?常用 多重比较有哪些?各种方法有何特点?
§8.4 多重比较(multiple comparison)
目的:
哪些处理之间存在显著差异,平均数之间进 行一对一比较。 LSD(最灵敏) Duncan(SSR) S-N-K Tukey Bonferroni Scheffe
A1 B1 A1B1
A2 A2B1
A3 A3B1
B2 B3
A1B2 A1B3
A2B2 A2B3
A3B2 A3B3
试验中所研究的影响试验指标的原因或原因组合称 为试验因素(experimental factor)或处理因素 (treatment factor),简称因素或因子(factor)。 在试验中人为地加以调控的因素称为固定因素或可 控因素。该因素水平可准确控制,且水平固定后, 其效应也固定,同时在实验进行重复时可以得到相 同的结果。 试验中不能人为调控的因素称为非控因素或随机因 素。该因素不能严格控制(随机抽取不同水平), 或虽水平能控制,但其效应仍为随机变量,同时在 实验进行重复时不易得到相同的结果。 因素通常用大写拉丁字母A、B、C…表示
In this table, the upper half is results of S-N-K multiple comparison, and the lower half is results of Duncan. Deferent groups are defined as deferent rows. There is no significant difference between the groups in the same column; conversely, there is significant difference in deferent columns. Question: which groups are significant different with group 5? (There is significant difference between the groups marked with different Latin letters on the right.)
生物统计课件第9章 协方差分析

P195 习题3
三种日投饵量,测定初始体长(x,cm)与试验结束 时体长(Y,cm),作协方差分析。
请同学们思考,如何输入数据:
(1)输入数据与选择数据: (2)菜单: (3)结果分析:
• 初始体重x与最终体重y之间的回归显著性分析 • 不同日投饵量的差异显著性分析 • 平均值校正 • 平均值多重比较
回归协方差分析
(1)三个回归系数b差异显著性检验:p=0.5870,没有显著差 异,可以用共同的回归系数0.0127 (2)三个回归截距差异显著性检验:p=0.0000,差异非常显 著,需要用三个不同的截距:
y1=0.3446+0.0127x y2=1.4413+0.0127x y3=1.1707+0.0127x
平均值校正后,消除初始体长x的影响,三种投 饵水平下,投饵量1的最终体长为6.9371,投饵量2 为7.9377,投饵量3为7.3451。投饵量2最好。
多重比较结果为:三种投饵水平导致最终体长的 差异都是非常显著的(p<0.01).
回归协方差分析
(1)三个投饵水平下,建立三条直线回归方程,对三个回归 系数b差异显著性进行检验:p=0.1885>0.05,没有显著差异, 可以用共同一个回归系数(b=0.9227) (2)三个回归截距a的也有非常显著的差异:p=0.000<0.01, 需要用三个不同的a。
协变量x:1个,草鱼初始重
DPS法 (1)输入数据与选择数据:
DPS法 (2)菜单:
DPS法 (3)对话框:
配方有3个:因此处理A个数为3; 协变量x为初始重,1个。
DPS法
(4)结果:
• 初始重X与草鱼日增重Y的 存在回归关系,可以用方程 y=0.2222+0.0199x表示, R=0.55886,效果不好,这 是因为把所有数据当作一个 样本来处理,由于忽略了三 种饲料的差异。
生物统计学答案 第九章 两因素及多因素方差分析

第九章两因素及多因素方差分析9.1双菊饮具有很好的治疗上呼吸道感染的功效,为便于饮用,制成泡袋剂。
研究不同浸泡时间和不同的浸泡温度对浸泡效果的影响,设计了一个两因素交叉分组实验,实验结果(浸出率)见下表[52]:浸泡温度/℃浸泡时间/min10 15 2060 23.72 25.42 23.5880 24.84 28.32 29.5595 30.64 31.58 32.21对以上结果做方差分析及Duncan检验。
该设计已经能充分说明问题了吗?是否还有更能说明问题的设计方案?答:无重复二因素方差分析程序及结果如下:options linesize=76 nodate;data hermed;do temp=1 to 3;do time=1 to 3;input effect @@;output;end;end;cards;23.72 25.42 23.5824.84 28.32 29.5530.64 31.58 32.21;run;proc anova;class temp time;model effect=temp time;means temp time/duncan alpha=0.05;run;The SAS SystemAnalysis of Variance ProcedureClass Level InformationClass Levels ValuesTEMP 3 1 2 3TIME 3 1 2 3Number of observations in data set = 9The SAS SystemAnalysis of Variance ProcedureDependent Variable: EFFECTSum of MeanSource DF Squares Square F Value Pr > FModel 4 87.0707778 21.7676944 12.56 0.0155Error 4 6.9321778 1.7330444Corrected Total 8 94.0029556R-Square C.V. Root MSE EFFECT Mean0.926256 4.741881 1.31645 27.7622Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr > FTEMP 2 78.7202889 39.3601444 22.71 0.0066TIME 2 8.3504889 4.1752444 2.41 0.2058The SAS SystemAnalysis of Variance ProcedureDuncan's Multiple Range Test for variable: EFFECTNOTE: This test controls the type I comparisonwise error rate, notthe experimentwise error rateAlpha= 0.05 df= 4 MSE= 1.733044Number of Means 2 3Critical Range 2.984 3.050Means with the same letter are not significantly different.Duncan Grouping Mean N TEMPA 31.477 3 3B 27.570 3 2C 24.240 3 1The SAS SystemAnalysis of Variance ProcedureDuncan's Multiple Range Test for variable: EFFECTNOTE: This test controls the type I comparisonwise error rate, notthe experimentwise error rateAlpha= 0.05 df= 4 MSE= 1.733044Number of Means 2 3Critical Range 2.984 3.050Means with the same letter are not significantly different.Duncan Grouping Mean N TIMEA 28.447 3 3AA 28.440 3 2AA 26.400 3 1从方差分析结果可以得知,温度是极显著的影响因素,时间是不显著因素。
第九章-两因素及多因素方差分析

B2
2
AA2 B、A2BB间=A存(1 B在A11交B21互+A2作AB2用B1 2。) 交-38互(2作A414用B2的+1大A82小B212为)4:
20
【例】假设学生分两类:在校和在职。把两类学生随 机分成两组,分别采用课堂讲授和交互式教学方法, 考试结果如下表。
课堂讲授 交互式教学
要说明两个因素的交互作用是否显著:
H0 : ( )11 12 ( )ab 0 HA : ( )11,( )12, ,( )ab不全为0
第三步:计算统计量
平方和的简易计算法:
SST
a i 1
bn
SST
j1 k 1
a
xi2jk i 1
ii11 jj11 kk 11
aa
bb
nn [[((xxii.... xx...... )) ((xx.. jj.. xx...... )) ((xxiijj.. xxii.... xx.. jj.. xx...... )) ((xxiijjkk xxiijj.. ))]]22
xb 2 n
ajb1 nk1
x2 ijk
x2
abn
a b
SiS1Aj1
kbn1n1 xiai2jS1k SxiA2axb2nabx1bn2n ia,1
x2 i
SaSxbB2n ,
1 an
b
SSxB2j
jj 11
ii
abn
x...)2
(xijk xij. )2
i1 j1 k 1
离差平方和的分解
a
SSA bn xi x 2 i 1
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量均高或均低效果都差。
量0.4%的组合增重效果最好。
当A、B因素的交互作用显著时,一般不必进行
两个因素主效应的显著性检验(因为这时主效应的显著 性在实用意义上并不重要),而直接进行各水平组合平 均数的多重比较,选出最优水平组合。
(4) 简单效应的检验
简单效应实际上是特定水平组合平均数间的差数。 ①A因素各水平上B因素各水平平均数间的比
2 ijk
a
b
n
交互作用平方和与自由度 SS AB SST SS A SS B SS E , df E ab(n 1), MS AB SS AB / df AB
【例9.1】 为了研究饲料中钙磷含量对幼猪生长发 育的影响,将钙(A)、磷(B)在饲料中的含量各分 4个 水平进行交叉分组试验。选用品种、性别、日龄相同, 初始体重基本一致的幼猪 48 头,随机分成16组,每 组3头,用能量、蛋白质含量相同的饲料在不同钙磷 用量搭配下各喂一组猪,经两月试验,幼猪增重结果 (kg)列于下表,试分析钙磷对幼猪生长发育的影响。
SST SS A SS B SS AB SS E dfT df A df B df AB df E
各项平方和、自由度及均方的计算公式如下:
矫正数
2 C x... / abn
2 xijk C,dfT abn 1
总平方和与自由度 SST 观测值试验资料的数学模型为:
xijk i j ( )ij ijk (i 1,2,, a; j 1,2,, b; k 1, ,2,, n)
其中, x…为总平均数;
αi为Ai的效应; βj为Bj的效应; (αβ) ij为Ai与Bj的互作效应,
A因素─钙的含量分4个水平,即a=4;B因素─磷的含量分4个 水平,即b=4;共有ab=4×4=16个水平组合;每个水平组合重 复数n=3;全试验共有48个观测值。
1、计算各项平方和与自由度
2 C x... / abn
1326.9 2 /( 4 4 3) 36680.4919
1 1 2 SS B x. j. C (327.22 363.82 357.82 278.12 ) 36680.4919 an 43 37064.2275 36680.4919 383.7356
1 n b 2 SS E y yij. 147.4133 n i1 j 1 i 1 j 1 k 1
2、列出方差分析表,进行F检验
查临界F值: F0.05(3,32)=2.90, F0.01(3,32)=4.47; F0.01(9,32)=3.02。
因为, FA>F0.05(3,32); FB>F0.01(3,32);FA×B>F0.01(9,32),
表明钙、磷及其互作对幼猪的生长发育均有显著或极显 著影响。 因此,应进一步进行钙各水平平均数间 、 磷各水平平 均数间、钙与磷水平组合平均数间的多重比较和进行简
两因素有重复观测值试验结果方差分析平方和与自 由度的剖分式为:
SST SS A SS B SS AB SSe dfT df A df B df AB dfe
其中,SSAB,dfAB为A因素与B因素交互作用平方 和与自由度。
若用SSAB,dfAB表示A、B水平组合间的平方和与自 由度,即处理间平方和与自由度,则因处理变异可 剖分为A因素、B因素及A、B交互作用变异三部分, 于是SST、dfT可剖分为:
2 SS T xijl C (22.0 2 26.5 2 20.0 2 19.0 2 ) 36680.4919
37662.8100 36680.4919 982.3181 1 1 2 SS A xi.. C (324.92 350.12 332.42 319.52 ) 36680.4919 bn 43 36725.0025 36680.4919 44.5106
SS A
1 df xi2.. C, A a 1 MS A SS A / df A bn
1 B因素平方和与自由度 SS B x.2j. C,df B b 1, MS B SS B / df B an
误差平方和与自由度
1 n b 2 SS E y yij. , df E ab(n 1), MS E SS E / df E n i1 j 1 i 1 j 1 k 1
当磷含量0.8%时,钙以0.4%为好,但除显著高于 钙为 1.0% 的水平外 ,与 钙 为0.6%、0.8%的差异不 显著;当磷的水平为0.6%时,钙的水平也以0.6%为好, 但除显著高于钙为1.0%的水平外,与钙为0.4%、 0.8%的差异不显著;磷含量0.4%时,钙含量以0.8% 为好;磷含量为0.2%时,钙水平达到1.0%效果较好, 但与钙为0.8%的差异不显著。 同样也呈现一种随着磷 含量降低,钙水平应提高的趋势。
则可从主效应检验 中分别选出A、B因素的最优水平相组合, 得到最 优水平组合;
若A、B因素交互作用显著
,则应进行水平组合平 均数间的多重比较, 以 选出最优水平组合,同时 可进行简单效应的检验。
各水平组合平均数比较表(T法)
由于钙磷交互作用的存在,最优组合(即增重好的
组合) 并不是A2B2,而是A2B3,即钙含量0.8%和磷含
磷含量0.8%时,钙以0.4%为好,但除显著高于钙为 1.0% 的水平外,与钙为0.6%、0.8%的差异不显著; 磷含量为0.6%时,钙也以0.6%为好,但除显著高于 1.0%的水平外,与钙为0.4%、0.8%的差异不显著; 磷含量0.4%时,钙含量以0.8%为好;磷含量为0.2% 时,钙水平达到1.0%效果较好,但与钙为0.8%的差 异不显著。 也呈现一种随着磷含量降低,钙水平应提高的趋势。 综观全试验,以A2B3(钙0.8%,磷0.4%)效果最好, 钙磷含量均高或均低效果都差。
2 ijk
a
b
n
SS AB SST SS A SS BSS E 406.6586
dfT abn 1 4 4 3 1 47
df A a 1 4 1 3 df B b 1 4 1 3 df A B (a 1)(b 1) (4 1)( 4 1) 9 df e ab(n 1) 4 4(3 1) 32
单效应的检验。
3、多重比较
(1)钙含量(A)各水平平均数间的比较 不同钙含量平均数比较表
(2) 磷含量(B)各水平平均数间的比较 不同磷含量平均数比较表(q法)
结论:
钙的含量以占饲料量的0.8%(A2)增重效果最好; 磷的含量以占饲料量的0.6%(B2)增重效果最好。
若A、B因素交互作用不显著,
第九章 两因素及多因素方差分析
设A与B两因素分别具有a与b个水平,共有ab个水平组合,每 个水平组合有n次重复,则全试验共有abn个观测值。如下表:
不同符号代表的意义:
xij. xijl
l 1 b
n
xij. xijl / n
l 1 b
n
x i .. xijl
j 1 l 1 a n
n
xi .. xijl / bn
j 1 l 1 a n
n
x. j . xijl
i 1 l 1 a b
x. j. xijl / an
i 1 l 1 a b
x... xijl
i 1 j 1 l 1
n
x... xijl / abn
i 1 j 1 l 1
A1水平(1.0)
A2水平(0.8)
A3水平(0.6)
A4水平(0.4)
②B因素各水平上A因素各水平平均数间的比较
简单效应检验结果表明:
当饲料中钙含量达1.0%时,磷含量各水平平均数间 差异不显著;当饲料中钙含量为 0.8% 时,磷含量以 0.4%为宜 ( 但与磷含量为 0.6% 的差异不显著) ; 当钙为0.6%时,磷以0.6%为好,且有小猪的生长发 育对磷含量的变化反应比较敏感的迹象; 当钙含量为 0.4% 时,磷以0.8%为好 (但与磷含量为 0.6%、0.4%的差异不显著); 就试验中所选择的钙磷含量水平来看,有一种随着饲 料中钙含量的减少,要求磷含量增加的趋势。