蛋白质组学的研究方法和进展

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蛋白质组学研究方法与实验方案

蛋白质组学研究方法与实验方案

蛋白质组学研究方法与实验方案1. 什么是蛋白质组学?好吧,咱们先聊聊什么是蛋白质组学。

想象一下,咱们的身体就像一个精密的机器,每个部件都有它的角色,而这些部件就是蛋白质。

蛋白质组学,简单来说,就是研究这些蛋白质的科学。

通过它,我们能够了解它们的结构、功能,以及它们在身体里是如何相互作用的。

就像侦探破案一样,蛋白质组学帮我们解开生命的奥秘。

真是既神秘又有趣,尤其是当你发现一些小细节时,那种“啊哈!”的感觉,简直让人兴奋得想跳起来!2. 蛋白质组学的研究方法2.1 样本准备首先,样本准备可是一门艺术。

你不能随便拿个东西就往实验室一扔,这样可不行哦!一般来说,样本可能是血液、细胞或者组织。

准备这些样本时,注意卫生和安全,搞得像开派对一样,干净利索才行。

样本收集后,我们需要把它们冷藏,保持它们的新鲜度,毕竟没人想要一份过期的蛋白质套餐,对吧?2.2 蛋白质提取接下来,我们进入蛋白质提取的阶段。

想象一下,像是在厨房里做大餐,首先要把食材准备好。

提取蛋白质就像把牛肉从牛排里切下来,一刀切下去,油油的鲜香就出来了。

我们用各种化学试剂,像是盐酸、乙醇这些,来分离出蛋白质,得小心别让它们变成一团糟。

处理得当,才能确保后面的分析顺利进行。

3. 蛋白质分析3.1 质谱分析然后就是蛋白质分析环节。

这时候,质谱仪就像一位高级侦探,能够识别出蛋白质的身份。

你可以把质谱想象成一个超级厉害的放大镜,它能让我们看到蛋白质的分子量和结构。

分析结果能告诉我们这些蛋白质的种类、数量,甚至还可以了解它们的相互作用。

哇哦,真的是一门高科技的艺术呢!3.2 数据解读最后,我们得对数据进行解读。

就像读一本悬疑小说,刚开始可能没看懂,但越往后看越有趣。

这个过程需要耐心和细心,数据可能会让你感到困惑,但一旦你理解了其中的奥妙,简直就像解开了一个千古之谜。

通过这些数据,我们能够找到疾病的潜在标志物,或者探索新药物的目标,真是让人感到自豪的工作!4. 实验方案小贴士当然啦,在整个实验过程中,有几个小贴士可以帮助你事半功倍。

生物医学中的蛋白质组学研究进展

生物医学中的蛋白质组学研究进展

生物医学中的蛋白质组学研究进展近年来,生物医学研究中的蛋白质组学已受到广泛关注。

蛋白质组学是一种高通量技术,可以对大量的蛋白质进行分析,从而为研究生物学、生物化学、医学、药学等领域提供更深入的了解和新的解决方案。

蛋白质组学研究是一种把人体中的所有蛋白质进行系统分析的科学方法。

通过蛋白质组学研究,可以加深人们对蛋白质的认识,探讨蛋白质在复杂生物学基础上的功能以及与疾病的关系。

这一方法已经极大地推动了生物学、生命科学和生物医学的发展。

近年来,许多科学家已经把研究重心转向蛋白质组学,在这一领域里取得了许多进展。

现在,蛋白质组学已经成为医学诊疗和新药研发的重要方法。

一、蛋白质组学技术蛋白质组学技术是指将蛋白质从生物样品中提取出来,并通过分离和鉴定来确定其种类、数量、结构和功能等的技术。

具体包括质谱技术、二维凝胶电泳、蛋白质芯片、蛋白质相互作用技术等。

1.质谱技术质谱技术最为成熟,在蛋白质组学中得到广泛应用。

分析前,蛋白质需要经过某些步骤,如消化、分离、富集,最后才能进入质谱仪。

2.二维凝胶电泳二维凝胶电泳分离、定量、鉴定和分析蛋白质是蛋白质组学中最经典和传统的方法之一。

这种技术可以将复杂的蛋白质混合物分离成数千个不同的蛋白质,对于大量蛋白质的鉴定具有非常大的优势。

3.蛋白质芯片蛋白质芯片被认为是蛋白质组学领域中非常有前途的技术之一,即将大量不同的蛋白质在几张平凡玻片或其他基材上通过特殊的技术进行分析。

蛋白质芯片具有高通量、高精度、高效性和可重复性,对于筛选药物靶点、发现新的蛋白质以及蛋白质相互作用等方面都具有很强的优势。

4.蛋白质相互作用技术蛋白质相互作用技术通过探测不同蛋白质之间的相互作用,能够解决许多疾病发生的分子机制问题。

蛋白质相互作用技术已经成为细胞生物学、医学等领域的研究重点。

二、蛋白质组学在疾病的研究中的应用蛋白质组学关注蛋白质的表达、定量、亚细胞位点定位、翻译后修饰等,在生物医学研究中,已经广泛地应用于疾病的诊断、治疗和预防等方面。

蛋白质组学的研究方法和进展

蛋白质组学的研究方法和进展

蛋白质组学的研究方法和进展蛋白质是细胞中最重要的一类生物大分子,不仅构成生物体的大部分物质,而且参与多种生物过程。

在生物学的研究中,蛋白质组学就是广泛用于研究蛋白质及其解析结构、功能和相互作用的一种技术。

蛋白质组学技术的不断发展,为科学家们提供了更广阔的研究领域和更深入的认识和理解。

一、蛋白质分离技术蛋白质在细胞中有着多种不同的类型和数量,分离这些蛋白质对于进一步的研究至关重要。

凝胶电泳是一种最早应用于蛋白质分离的技术,在这一技术中,蛋白质被分离到一条凝胶条中,并且能够根据其分子量进行鉴定。

近年来,液相色谱技术得到快速发展,以逆相高效液相色谱(RP-HPLC)为主的技术广泛应用于蛋白质的分离、富集和纯化中。

二、蛋白质鉴定技术现代蛋白质组学技术的特点是高通量、高分辨率、高灵敏度和准确率。

鉴定样品中的所有蛋白质非常复杂,多组学技术的整合在蛋白质组学的研究中显得尤为重要。

代表性的鉴定技术是质谱法,可将蛋白质析出后离线或在线进行鉴定。

其中,MALDI-TOF 质谱技术是蛋白质鉴定中的重要方法之一,该技术使用激光脱附离子化(MALDI)策略以减少化学修饰和分离过程对蛋白质结构的影响。

三、蛋白质表达技术从DNA转录到蛋白质翻译的过程,是生物体逐步实现功能的一个重要环节。

蛋白质表达技术是在外部体系中重现这一过程的有效方法,在研究中应用极为广泛。

常见的蛋白质表达系统有大肠杆菌、酵母、哺乳动物等,其中,大肠杆菌是最常用的单细胞表达体系。

近年来,蛋白质表达与修饰的转化药学已经成为一个热门领域,各种新型表达体系也层出不穷。

四、蛋白质数据分析鉴定蛋白质,只是蛋白质组学研究的第一步,有关数据分析和解释的关键环节,对于进一步的研究显得尤为重要。

目前,由于蛋白质比较庞大并且互相之间联系复杂,因此数据分析技术的不断发展就格外重要了。

从最初的数据搜索和标识,到后来的蛋白质序列分析、结构预测、功能预测和网络分析等,蛋白质数据分析技术已经成为蛋白质组学研究的重要环节。

蛋白质组学研究的现状和未来

蛋白质组学研究的现状和未来

蛋白质组学研究的现状和未来随着科学技术的不断发展,各个领域也越来越得到人们的重视。

其中,生命科学领域的研究成果对医学、生物学等领域都有着深刻的影响。

而蛋白质组学作为一种较为新兴的技术,其研究也受到了越来越多的关注。

本篇文章将介绍蛋白质组学研究的现状和未来。

一、蛋白质组学研究的背景蛋白质是生命体中最为重要的分子之一,它们负责调节生命体内的许多关键过程,如催化化学反应、支持细胞结构和传递信号等。

蛋白质组学研究的目的就是发现、识别、定量、分析和模拟生物体中所有蛋白质在特定时间和环境下的表达、结构、功能、相互作用和调节。

与其它技术不同的是,蛋白质组学通过综合分析其它多种技术获得的大量数据,从而全面认识生物体中蛋白质在宏观和微观层面上的作用机制。

二、蛋白质组学研究的核心技术蛋白质组学是一种综合的技术,并需要多种技术的有机结合才能实现从样本中获得大量有关蛋白质的信息。

在这个过程中,其中最主要的技术是质谱技术和蛋白质芯片技术。

1、质谱技术质谱技术是一种分析技术,通过质谱仪将大分子物质分解成其成分离子,并对这些离子的分子质量进行质量测定、分析和鉴定。

应用到蛋白质组学研究中,它可以通过肽段质谱和蛋白质质谱分析等手段,对蛋白质进行鉴定和定量的工作。

同时,质谱技术作为高通量研究中的核心技术之一,也可通过基于“表征-鉴别-定量”策略从样本中高效地获得大量的蛋白质。

在高通量蛋白质组学研究中,质谱技术所扮演的角色越来越重要,其自动化、灵敏度、精度、准确度和高通量检测能力甚至被认为是蛋白质组学研究的“金标准”。

2、蛋白质芯片技术蛋白质芯片技术是以蛋白质为基质,类似于DNA芯片的方法检测和解析蛋白质功能。

与质谱技术所使用的方法不同,蛋白质芯片技术则基于蛋白质本身对于化学环境、温度、酸碱性、电场等因素的变化反应产生的行为,检测和解析蛋白质的性质和功能。

对于蛋白质芯片技术的发展实现,一方面这种技术可针对某些单一蛋白质的研究,另一方面也可针对高通量蛋白质研究。

蛋白质组学研究方法与实验方案

蛋白质组学研究方法与实验方案

蛋白质组学研究方法与实验方案1. 蛋白质组学的神奇世界大家好,今天我们要聊聊蛋白质组学。

这是什么呢?简单来说,就是研究蛋白质这个小家伙的学问。

想象一下,蛋白质就像是一群勤奋的工人在身体里干活儿,它们负责各种任务,比如修复受伤的细胞、传递信息等。

了解这些“工人”的工作方式、合作模式,可以帮助我们更好地理解健康和疾病。

这就像揭开了一本厚重的百科全书的封面,里面充满了惊喜和知识的宝藏。

接下来,我们就来看看,怎么才能深入了解这些小家伙们呢?1.1 蛋白质组学的基本概念首先,我们得知道蛋白质组学是什么。

它是一门研究蛋白质全貌的学问。

也就是,不仅仅看单个蛋白质,而是把所有蛋白质都放在一个“大杂烩”里研究。

想象一下,你在一家大餐厅里,看到了一整桌丰盛的菜肴,这就是蛋白质组学的“全景图”。

我们不仅要知道每道菜是什么,还得了解这些菜肴如何搭配,如何一起让你胃口大开。

通过蛋白质组学,我们可以发现哪些蛋白质在特定的疾病中“捣乱”,哪些在健康状态下“勤勤恳恳”。

这就好比你在看一部精彩的电视剧,不只是盯着主角,而是要了解所有配角、剧情的每个细节。

1.2 蛋白质组学的研究方法那么,如何进行这些研究呢?首先,科学家们会用一种叫做“质谱分析”的技术。

这就像是给蛋白质做个超级详细的X光检查,能够精确地知道每个蛋白质的“身份信息”。

其次,还有一种叫做“二向色谱”的技术,它能帮忙把混乱的蛋白质样本整理成条理清晰的“小档案”。

这些技术就像是给你提供了一本超级强大的工具书,让你能一目了然地看到每个蛋白质的真实面貌。

2. 实验方案的细节了解了基本概念和方法,我们再来说说实验方案。

做蛋白质组学实验,就像是调制一道复杂的美食,需要准备许多食材,还要按照步骤来操作。

首先,你得从样本中提取蛋白质。

这一步就像是把食材从冰箱里拿出来,准备好各种配料。

接着,把这些蛋白质进行分离和鉴定。

这时,实验室里就变成了一个“厨房”,各种仪器和试剂就像是厨具和调料,为你制作出最精美的“蛋白质大餐”。

蛋白质组学的研究方法

蛋白质组学的研究方法

蛋白质组学的研究方法蛋白质组学是运用先进的分析技术,通过对细胞内的蛋白质分子进行检测、分离、同位素标记与定量等方法,研究不同细胞型、组织型、发育阶段以及病变状态等生物样本中蛋白质组成及其功能性调控的科学。

它是一门综合性学科,既涉及生物化学、蛋白质工程、分子生物学等学科,也涉及信息学及计算机科学等学科,运用了各种生物学技术和数学模型,将复杂的生物体蛋白质组织成一个有机的整体,从而更好地了解蛋白质的结构与功能关系。

蛋白质组学的研究方法主要包括:一、蛋白质分离与鉴定:蛋白质分离是蛋白质组学的基础步骤,其目的是从生物样本中提取蛋白质。

常用的技术包括凝胶电泳、膜分离、微萃取、液相色谱法以及离心分离等。

蛋白质分离之后,还需要进行鉴定,以获得蛋白质的名称及其细胞定位等信息,以便进行后续研究。

常用的方法包括凝集试验、蛋白质印迹、Western blotting、质谱分析以及二级结构分析等。

二、定量蛋白质组学:定量蛋白质组学是指利用有效的检测技术,对生物样本中的蛋白质进行定量分析,以便获得蛋白质组成及其功能性调控情况的精确信息。

定量蛋白质组学技术主要包括酶标记蛋白质定量、质谱定量以及流式细胞蛋白质定量等。

三、蛋白质组学的应用:蛋白质组学的研究结果可以用来研究基因调控、细胞信号转导、疾病机理等方面的问题。

它可以帮助研究人员更好地理解生物的复杂性,并为有效的治疗策略的制定提供重要的参考和指导。

它还可以用于研究新型药物的研究和开发,为疾病的治疗提供新的思路。

蛋白质组学的发展前景广阔,它不仅可以用于解决当前生物学上的实际问题,还可以为未来的研究提供重要的科学研究基础。

随着技术的进步和数据量的增加,蛋白质组学技术将会为生物学研究带来更多的惊喜和发现。

蛋白质组学的研究方法和进展

蛋白质组学的研究方法和进展

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样品预分级的主要依据
蛋白质溶解性:可溶性蛋白、非溶性蛋白等 蛋白质定位:膜蛋白、核蛋白等 蛋白质细胞器定位:线粒体、高尔基体、叶
绿体等
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组织水平蛋白质组样品制备
原因:临床样本都是各种细胞或组织混杂, 而且状态不一,如肿瘤中癌变的上皮类细胞 总是与血管、基质细胞等混杂。
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科技部已将疾病蛋白质组研究列入我 国“973”计划项目和“863”计划项目; 国家自然科学基金委员会也将“蛋白质 组研究”列为重点项目。
我国在鼻咽癌、白血病、肝癌和肺癌 蛋白质组研究方面取得了较大进展。
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第二节 蛋白质组学研究方法概述
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H3 High-grade
Apoliprotein A-I (H4) H4 H4
40 Low-grade
40 High-grade
Peroxiredoxin 6 (H5)
13 48
H5 Low-grade
13 48
H5 High-grade
33
二维电泳优点
可分离10~100 kD 范围内蛋白质 高灵敏度和高分辨率 便于计算机进行图像分析处理 与质谱分析匹配
克服了载体两性电解质阴极漂移等缺点。 可以精确设定pH梯度。
尤其可在较窄的pH范围内进行第二轮分析, 大大提高了分辨率及重复性。
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第二向SDS-PAGE电泳
双向凝胶垂直电泳 双向电泳后的凝胶经染色后蛋白呈现二
维分布图:水平方向反映出蛋白在pI上的 差异,垂直方向反映分子量上的差别。
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蛋白质组学的研究方法和进展

蛋白质组学的研究方法和进展

蛋白质组学的研究方法和进展蛋白质组学的研究方法主要包括样品制备、质谱分析以及数据分析三个阶段。

在样品制备阶段,研究人员需要选择合适的方法来提取和纯化蛋白质。

常用的方法包括差凝蛋白法、电泳法、柱层析法等。

质谱分析是蛋白质组学的核心技术,主要有两种方法:质谱图谱分析和质谱定量分析。

质谱图谱分析可以通过比对已知蛋白质的质谱图数据库来鉴定未知蛋白质;质谱定量分析可以测定样品中各个蛋白质的数量变化。

数据分析是蛋白质组学研究的关键环节,用于解读大量的质谱数据。

近年来,蛋白质组学的研究取得了诸多重要进展。

首先,高通量质谱技术的发展使得大规模蛋白质组学研究成为可能。

比如,液相色谱和质谱联用技术(LC-MS/MS)可以同时检测数千种蛋白质,大大提高了鉴定和定量蛋白质的效率和准确性。

其次,全蛋白质组学的研究范围不断拓展。

除了研究细胞蛋白质组,研究人员还开始探索组织蛋白质组和生物体蛋白质组等更高层次的组学研究。

通过研究这些复杂组织中蛋白质的种类和功能,可以深入了解细胞和生物体的复杂生理和病理过程。

此外,蛋白质组学也开始向单细胞水平的研究发展,可能为研究细胞发育、疾病药物靶点等方面提供新的突破口。

蛋白质组学在医学和生命科学领域有着广泛的应用前景。

通过深入了解蛋白质组的变化和相互作用,可以揭示细胞和生物体的生理和病理过程,为疾病的早期检测和诊断提供重要依据。

蛋白质组学也可以用于发现新的疾病标志物、筛选新药靶点以及评估药物的疗效和安全性。

此外,蛋白质组学还可以用于研究生命起源、进化以及各种生物学过程的分子机制。

总之,蛋白质组学的发展必将为生命科学研究带来更多的突破和进展。

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空上有序和协同作用

新陈代谢以蛋白质复合体或多蛋白质网
络协同作用实现

细胞信号转导及病原体感染和免疫反应
1.酵母双杂交系统 (yeast two-hybrid system)

1989年Field 和Song等人在酵母细胞中 设计的分析蛋白质相互作用的方法。

以真核细胞转录激活因子的结构和活性 特点为基础的。
近于生命细胞的“全部蛋白质”的蛋白
质组图谱。
二、蛋白质组学的产生与发展
背景

基因组时代 →后基因组时代 研究重点的转移及其标志
功能基因组学的主要任务

mRNA水平的基因表达研究取得进 展,但mRNA与蛋白质间的相关系 数仅为0.4~0.5

蛋白质自身特点难以从DNA和mRNA
水平得到解答
进 展

鉴定和注释蛋白质的路线

通过肽质谱指纹图(peptide mass fingerprinting,PMF)和数据库搜寻匹 配

通过测出样品中部分肽段二级质谱信息或 氨基酸序列标签和数据库搜寻匹配
目录
仪 器

MALDI-TOF质谱仪:灵敏度高
(可达fmol),分析速度快,
谱图简单易于解析以及受缓冲液、 盐份的干扰小
肽质谱指纹图在数据库中匹配 不成功的可能原因

样品量太少,PMF图信噪比太低,输 入库中搜寻的数据质量不好。 2-DE胶上所取的一个蛋白质点并非单 一蛋白质,所获PMF图实际上是两个 以上蛋白质的混合图。

续:




操作中角蛋白或其他蛋白质的污染 蛋白质发生了较多的转译后修饰,数据 库中未有记载 所用胰蛋白酶质量不够好,蛋白酶自酶 解片段多 未知的新蛋白质 数据库规模太小
蛋白质组是:

对应于基因组的所有蛋白质构成的整 体,不是局限于一个或几个蛋白质。

同一基因组在不同细胞、不同组织中 的表达情况各不相同 。
在空间和时间上动态变化着的整体。

蛋白质组学(proteomics)
指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门
新兴科学,其目的是从整体的角度分析细胞
内动态变化的蛋白质组成成份、表达水平与
激光捕获显微切割(laser capture microdissection,LCM) 可直接在显微镜下从组织切片 中精确分离特定的细胞或细胞群。
(二)蛋白质组研究中的样品分离

双向凝胶电泳two-dimensional electrophoresis,2-DE):利用蛋 白质的等电点和分子量,结合凝胶化 学特性,分离各种蛋白质的方法。

传统O’Farrell系统双向电泳的缺陷。 Bjellgvist等发展并完善了固相pH梯 度等电聚焦技术,GÖrg等成功地将 之应用于双向电泳。 优点
固相pH梯度等电聚焦的优点
克服了载体两性电解质阴极漂移等缺点。 稳定的可以随意精确设定的pH梯度。 尤其可在较窄的pH范围内进行第二轮
分析,大大提高了分辨率及重复性。
毛细管电泳
capillary electrophoresis,CE

液质联用技术(LC-MS/MS)
蛋白质混合物直接通过液相色谱分离以 代替2-DE的分离,然后进入MS系统获得肽 段分子量,再通过串联MS技术,得到部分 序列信息,最后通过计算机联网查询、鉴定 蛋白质。

多维色谱技术(LC/LC-MS/MS) 根据蛋白质带电性及疏水性不同, 用MS分离多肽复合物。
(五)定量蛋白质组学研究
概念:把一个基因组表达的全部 蛋白质或一个复杂体系中所有的
蛋白质进行精确的定量和鉴定。
蛋白质定量的难点
低丰度蛋白质检测困难 蛋白质表达量差异很小,如在50% 以下时,精确定量成为瓶颈 蛋白质表达的瞬时变化
1.基于双向凝胶电泳的定量 蛋白质组研究策略
双向凝胶电泳(2-DE)是目前唯一能分离展 示大量蛋白质并进行蛋白质定量分析的一种 方法。 荧光差异显示双向电泳(F-2D-DIGE)

功能蛋白质组学 (functional proteomics)的提出

功能蛋白质组:细胞在一定阶段或与某
一生理现象相关的所有蛋白质。

介于对个别蛋白质的传统蛋白质化学研 究和以全部蛋白质为研究对象的蛋白质 组学之间。

从局部入手研究蛋白质组的各个功能亚
群体。

将多个亚群体组合起来,逐步描绘出接
2003成立了中国人类蛋白质组组 织(CHHUPO),并分别于2003年9 月、2004年8月以及2005年8月召开 了中国蛋白质组学首届、第二届及第三 届学术大会,2004年10月在中国北京 召开了第三届国际蛋白质组学会议。
科技部已将疾病蛋白质组研究列入我国“973”
计划项目和“863”计划项目;国家自然科学基

样品预分级的主要方法
蛋白质溶解性:可溶性蛋白、非溶性 蛋白等



蛋白质定位:膜蛋白、核蛋白等
蛋白质细胞器定位:线粒体、高尔基 体、叶绿体等
样品预分级主要作用在于 提高低丰度蛋白质的上样量和 检测灵敏度。
组织水平上的蛋白质组样品制备
临床样本都是各种细胞或组织 混杂,而且状态不一,如肿瘤中癌 变的上皮类细胞总是与血管、基质 细胞等混杂。
第九章 蛋白质组学的研究方法和进展
背 景
基因数量有限性和基因结构的相对稳定性
vs 生命现象的复杂性和多变性
从genomic到proteome

对蛋白质的数量、结构、性质、相互关系
和生物学功能进行全面深入的研究已成为
生命科学研究的迫切需要和重要任务。
主要内容
第一节 蛋白质组学的概念及其发展史 第二节 蛋白质组学研究方法概述 第三节 蛋白质组学在疾病研究中的应用
主要任务。
一、蛋白质组表达模式的 研究方法
蛋白质组表达模式 (expression profile):

研究蛋白质组的组成成分 支撑技术主要有双向凝胶电泳、 以质谱为代表的蛋白质鉴定技术
及生物信息学分析。
(一)蛋白质组研究中的样品制备

通常可采用细胞或组织中的全蛋白 质组分进行蛋白质组分析。 也可以进行样品预分级,即将细胞 或组织中的全体蛋白质分成不同部 分,分别进行研究。

多维蛋白质鉴定技术 (multidimensional protein identification technology)
(三)蛋白质组研究中的样品分析鉴定
传统方法:蛋白质微量测序
氨基酸组成分析
新型蛋白质鉴定技术 —— 质谱(MS)法
基本原理:样品分子离子化后, 根据离子间质荷比(m/z)的差 异来分离并确定样品的分子量。
蛋白质组数据库是蛋白质组 研究水平的标志和基础

瑞士的SWISS-PROT拥有目前世界上最 大、种类最多的蛋白质组数据库。 目前应用最普遍的数据库是NRDB 和 dbEST数据库。

dbEST数据库
由美国国家生物技术信息中心(NCBI)和 欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑, 包括许多生物体的表达序列标签(EST) 肽序列标签(PST)或部分序列信 息最适合查寻
金委员会也将“蛋白质组研究”列为重点项目。
我国在鼻咽癌、白血病、肝癌和肺癌蛋白质组
研究方面取得了较大的进展。
第二节
蛋白质组学研究方法概述
蛋白质组研究更为复杂和困难:
蛋白质数目大大超过基因数目。
蛋白质随时间和空间而变化。
当前主要任务
发展高通量、高灵敏度、高准 确性的研究技术平台是现在乃至相
当一段时间内蛋白质组学研究中的
修饰状态,了解蛋白质之间的相互作用与联 系,揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。
主要研究内容
了解某种特定的细胞、组 织或器官制造的蛋白质种类; 明确各种蛋白质分子是如 何形成类似于电路的网络的; 描绘蛋白质的精确三维结构,揭 示其结构上的关键部位,如与药物结 合并且决定其活性的部位。
研究对象 基础技术 研究层次
2.基于生物质谱的定量蛋白 质组研究策略
原理:对于具有相同离子化能力的蛋 白质或多肽,可以通过比较质谱峰的 强度(或峰面积)得到待比较蛋白质 的相对量。
二、蛋白质组功能模式的 研究方法
主要研究目标

揭示蛋白质组成员间的相互作用、相互
协调的关系,并深入了解蛋白质的结构
与功能的相互关系,以及基因结构与蛋
“软电离”的特点

分子电离时保留整个分子的完整性,不 会形成碎片离子。 灵敏度高、快速、能同时提供样品的精 确分子量和结构信息、既可定性又可定 量、并能有效地与各种色谱联用来分析 复杂体系。

主要质谱类型

基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱 (matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS) 电喷雾质谱(electrospray ionization mass spectrometry, ESI-MS)
Celera公司投资上亿美元独自启动了全 面鉴定和分类汇总人类组织、细胞和体 液中的蛋白质及其异构体,构建新一代 的蛋白质表达数据库的工作。
1997年召开了第一次国际“蛋白质组学” 会议 1998年在美国旧金山召开了第二届国际 蛋白质组学会议 1999年1月在英国伦敦举行了应用蛋白
质组会议
我国也于1998年启动了蛋白质组学研 究,在中科院上海生物化学研究所举办 了两次全国性的蛋白质组学研讨会
转录激活因Leabharlann GAL4的特点N端含NLS和与酵母GAL1基因启动子上游 激活序列(UASG)结合的结构域

C端含GAL1转录激活结构域
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