化学结构式检索
SciFinder使用指南(图示讲解)
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反应物中没有硫 醇的缩硫醛化反 应共330个
A
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A
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对1，4，5，8－萘四酰二亚胺的修饰
物质的盐，同位素，混合物，聚合物 查询物质是目标物质的一部分
环锁定工具
结构与查询物质相似，但不相同
原子锁定工具，被锁定的原子不允许接取代基
A代表氮原子链接除氢原子外的任何基团
A
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符合检索条件的物质共有2013个
反应结构式 反应产率 反应步数 反应类别
A
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重复基团工具，乙基的数目可以为1－5个，扩大硫醇范围
A
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获取所有反应物 中有硫醇的反应
如果要用到 combine功 能一定要存 储为sfr格式
A
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退回到所有缩硫 醛化反应的界面
A
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两次结果之和
两次结果重合的部分 结果A去除结果B的部分 结果B去除结果A的部分
A
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例二 得到具备一定条件的结构信息
问题： ➢存在多少种环结构 ➢X= F，Cl， Br，I 分别有多少种物质 ➢R1=H，OH，X分别有多少物质
R1= H，OH，X R2= O，S
A
47
检索物质的途径
主题检索 Explore
Research Topic
文献链接物质。Get Related
按化学结构 检索化学反应
A
8
用介词of, with, by, beyond 连接关键词,不要使用布 尔逻辑符
选择有“Concept”和“closely associated”字样的检索结果
A
9
选择框
检索结果数目
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教你如何使用ChemDraw在线检索功能
教你如何使用ChemDraw在线检索功能ChemOffice由几大组件组成，除了应用于绘制结构的ChemDraw和ChemBio 3D，还有应用于检索结构文件的ChemFinder。
熟练使用ChemFinder可以对分子结构有更多了解，本节ChemDraw教程就教您如何在ChemDraw中使用线检索功能。
通过在线检索，不仅能查找该分子结构的ACX编号，而且还能够查找相关合成路线以及参考文献来了解该化合物的一些基本的理化性质。
如果能够灵活使用ChemFinder在线检索功能，不仅在化学教学上有较大帮助，而且对化学相关的科研工作也大有裨益。
如何使用ChemFinder在线检索功能在ChemDraw绘制出分子结构式后，用选择工具选中该结构式，在联网的状态下选择Search 菜单就可实现在线检索功能。
需要注意的是，在检索之前要在被检索的网站免费注册，注册后通过输入用户名和密码即可进行检索，下图是Search菜单下的各种命令。
ChemDraw的Search菜单1、选择Find Suppliers on 命令可以检索出该化合物的供货商。
2、Search SciFinder命令是在网站中查找该化合物的相关理化数据，并且在ChemDraw绘制窗口有专门的Search SciFinder按钮。
3、Find ACX Numbers from Structure命令是查找该化合物的ACX编号，选择该命令后会弹出一个要求输入化合物名称的对话框。
4、Find Structure from ACX Numbers命令是查找该ACX编号对应放入化合物结构，选择该命令后会弹出一个要求输入ACX编号的对话框。
5、Find Structure from Name at 命令是在网站中以化合物名称为索引查找化合物结构，选择该命令后会弹出一个要求输入化合物名称的对话框。
除此之外，还有几个Browse单词开头的命令，这些命令分别指向中文官网的官方下载软件补丁、技术支持、购买或注册页面，与实际教学和科研的关系不大。
WOS检索举例-化学结构检索
• 检索举例：对二乙苯的（产率>99%）的合成反应
对二乙苯的（产率>99%）的合成反应
化学结构检索
• 是专门为满足化学与药学研究人员的需求所设计的数据库。收集了全球 核心化学期刊和发明专利的所有最新发现或改进的有机合成方法，提供 最翔实的化学反应综述和详尽的实验细节，提供化合物的化学结构和相 关性质，包括制备与合成方法。 • CCR可以跟踪最新的合成技术，包括了摘自39个权威出版机构的一流期 刊和专利的单步和多步的新合成方法。每一种方法都提供了完整地反应 流程，同时伴有详细精确的图形来代表每个反映步骤。 • IC主要聚焦新化合物的快讯报道，包括了来自国际一流期刊报道的新型 有机合成反应的结构与评论数据。除此以外，数据库中的很多全记录展 示了从最初原材料到最终产品的整个反应流程。IC是揭示生物活性化合 物和自然产品的有关最新信息的重要资源。
进行化学结构式检索
检索结果页面
链接到反应细节
Байду номын сангаас
链接到文献全记录
转至化合物检索结果
怎样搜索化学结构式
怎样搜索化学结构式化学结构式是用来描述化合物构成和连接方式的图形表示方法。
在化学领域，结构式的搜索是非常重要的，可以用于寻找特定的化合物、了解其性质和应用等。
下面将介绍一些常用的方法和工具，来帮助大家进行化学结构式的搜索。
1. 化学数据库化学数据库是存储大量化合物信息的资源，其中包含了化合物的结构式、性质、制备方法等。
通过查询化学数据库，可以找到想要的化合物的结构式。
一些常用的化学数据库包括：PubMed、ChemSpider、PubChem等。
在这些数据库中，用户可以通过关键字、化学式、结构式等进行搜索，并且可以进行进一步的筛选和排序来获取满足条件的化合物。
同时，一些化学数据库还提供了化学品的商品信息和供应商等相关信息。
2. 结构搜索引擎结构搜索引擎是专门用于搜索、检索和比对化学结构式的工具。
它们通过将用户输入的结构式与数据库中的化合物进行比对，从而找到相似的化合物或满足特定条件的化合物。
常见的结构搜索引擎有：ChemSpider、SciFinder等。
这些工具可以根据用户的需求，进行精确搜索或模糊搜索，并提供相应的结果和相关信息，如物理性质、制备方法、毒性等。
3. 软件和应用程序除了化学数据库和结构搜索引擎外，还有一些软件和应用程序可以帮助进行化学结构式的搜索。
例如，ChemDraw是一款常用的化学作图软件，可以通过绘制结构式来搜索相应的化合物。
此外，一些化学计算软件和模拟工具也提供了结构式的搜索功能，如Gaussian、VASP等。
这些工具除了能够搜索化合物，还可以用于分子建模、计算性质等应用。
4. 文献和专业资源除了在线数据库和搜索引擎外，还可以通过查阅相关的文献和专业资源来获取化学结构式。
化学期刊、学术论文、专利文献等都是搜集化学结构式的重要来源。
通过查询相关文献，可以了解到已有的研究工作、新发现的化合物等信息。
此外，一些化学参考书和手册也提供了大量的化学结构式的资料，可以作为补充参考。
化学结构式检索
化学结构式检索化学结构式检索是一种用于查找化合物的方法，通过输入化合物的结构式，可以快速检索到相关的化学信息。
本文将介绍化学结构式检索的原理、应用以及常用的结构式检索工具。
一、化学结构式检索的原理化学结构式检索是基于化合物的结构式进行检索，其原理是根据化合物的结构特征，通过计算机程序对化合物数据库进行搜索，找出与输入结构式相似或相关的化合物。
常用的化学结构式检索方法包括子结构搜索、相似性搜索和精确匹配搜索。
1. 子结构搜索：根据输入的结构式中的子结构进行搜索，找出包含该子结构的化合物。
这种方法适用于已知的化合物结构式。
2. 相似性搜索：根据输入的结构式与已知化合物的结构式进行比较，计算它们之间的相似性指数，找出相似度较高的化合物。
这种方法适用于未知的化合物结构式。
3. 精确匹配搜索：根据输入的结构式与已知化合物的结构式进行完全匹配，找出与输入结构式完全一致的化合物。
这种方法适用于已知的化合物结构式。
化学结构式检索在化学领域有着广泛的应用。
以下是一些常见的应用场景：1. 新药研发：化学结构式检索可以帮助研究人员找到与目标分子结构相似或相关的化合物，从而加快新药研发的速度。
2. 化学品安全评估：化学结构式检索可以用于快速评估化学品的毒性和环境影响，为化学品的安全使用提供参考。
3. 化学教学和研究：化学结构式检索可以用于教学和研究中的化合物的查找和分析，为科学研究提供便利。
4. 化合物命名：化学结构式检索可以用于化合物的命名和标识，避免化学品命名的混淆和错误。
三、常用的结构式检索工具有许多化学结构式检索工具可供使用。
以下是几个常用的结构式检索工具：1. PubChem：PubChem是一个免费的化学结构式检索数据库，提供了大量的化合物信息和结构式搜索功能。
2. ChemSpider：ChemSpider是由皇家化学学会(Royal Society of Chemistry)开发的化学结构式检索系统，提供了全球最大的化学数据库和在线结构式搜索功能。
reaxys使用介绍
结构式画图软件
-Marvin Sketch
-Symyx ISIS Draw
-Symyx Draw -CrossFire Structure Editor
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Reaxys登陆界面
网址：
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IP绑定模式
用户注册并登陆
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选择画图软件
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Reaxys的检索界面—化学反应
> 更加方便： 新型易用的界面使您的工作从检索结果到决策辅 助，从多步反应研究、反向合成分析到合成路线设计，实现无 缝对接；就在您的桌面上呈现最终结果。
> 更加高效： 在识别有前景的新项目、终止无效的先导化合物 及设计经济、高产率的合成路线方面，其新型内置功能将更加 节省时间和成本。
> 更多灵感：凝聚创造力的捷径，用更少的时间产生更多的先导 化合物。
CrossFire Gmelin Database:全面的无机化学和金属有机化学数值和事 实库
1772年至今，3个月更新一次 详细的理化性质、地质学，矿物学，冶金学，材料学等方面的信息资源
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8
Information Explosion
How do I navigate through
this efficiently?
Reaxys的检索方式
一、关键字检索 二、结构式检索
三、 联合检索（关键字与结构式） 四、二次筛选的应用 五、 合成路线的智能设计
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Reaxys的检索方式
一、关键字检索 二、结构式检索
三、 联合检索（关键字与结构式） 四、二次筛选的应用 五、 合成路线的智能设计
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四、二次筛选功能
Beilstein Patent Gmelin
scifinder化学结构式检索
scifinder化学结构式检索Scifinder化学结构式检索引言：Scifinder是一种常用于化学领域的专业检索工具，它能够帮助化学研究人员快速准确地获取所需的化学结构式信息。
本文将介绍Scifinder化学结构式检索的基本原理和使用方法，以帮助读者更好地利用该工具开展化学研究。
一、Scifinder的基本原理Scifinder是一种基于化学结构式的检索工具，它通过分析和识别化合物的结构式，从庞大的化学数据库中提取与其相关的文献、专利和实验数据等信息。
其基本原理是通过化学结构式的比对和匹配，寻找具有相似结构和性质的化合物，并提供相关的文献和数据资源。
二、Scifinder的使用方法1. 登录与注册用户需要注册一个Scifinder账号并登录。
用户可以通过所在机构或组织的许可获取登录凭证，并按照要求填写个人信息完成注册。
2. 结构式检索在登录后，用户可以利用Scifinder进行化学结构式的检索。
用户可以输入化合物的结构式或者关键词等信息进行查询。
在输入结构式时，可以使用分子编辑器绘制化合物的结构式，或者直接复制粘贴已有的结构式。
3. 结果筛选与分析Scifinder将根据用户的查询条件，在数据库中检索相关的文献和数据信息，并将结果以列表的形式呈现给用户。
用户可以根据需求对结果进行筛选和排序，以获取最相关的信息。
4. 文献获取与下载在获取到相关的文献信息后，用户可以通过Scifinder提供的链接或DOI获取全文文献。
用户还可以将相关文献保存到个人文件夹或导出到其他文献管理工具进行管理和引用。
5. 数据分析与比较Scifinder不仅提供了文献资源，还包括了大量的实验数据和化学信息。
用户可以通过Scifinder进行数据的分析和比较，以支持其研究工作。
三、Scifinder的优势和应用1. 广泛的数据库资源Scifinder拥有庞大的化学数据库资源，包括了全球范围内的文献、专利和实验数据等。
scifinder使用手册
scifinder使⽤⼿册研发⼯具Scifinder《使⽤说明书》第⼀章 Scifinder数据库介绍1.1 Scifinder数据库1.1.1 检索系统⽀持的检索⽅式：主题检索、物质名称检索、分⼦式检索、结构式检索、亚结构式检索、相似结构式检索、反应式检索、类反应式检索、分析与⼆次检索。
作者、机构名称、杂志名称、专利号、CA号检索结果后处理系统：Scifinder不仅仅包含有分⼦式、反应式和结构式（包括亚结构检索）等多种检索功能，⽽且在得到初步检索结果的基础上还可以进⼀步利⽤超过20个选项的后处理功能以最快的速度找到最精确的答案。
它已经超越了检索⼯具的范畴，⽽成为研发⼈员不可或缺的研发⼯具。
包含的信息量：⼤于2600万条⽂章记录；3000多万个有机⽆机物质，5800多万⽣物序列，1100多万条单步多步反应。
信息时效：1907年－⾄今1.1.2 原⽂下载系统Scifinder具有强⼤的期刊和专利链接，收录了全世界9500多种主要期刊和50多家合法专利发⾏机构的专利⽂献中公布的研究成果，占全球化⼯信息的98%。
其中能直接链接原⽂的化⼯类核⼼期刊1365种，约占全球英⽂版电⼦化⼯类期刊总数的90%，⼏乎包含了所有⾼影响因⼦期刊。
1.2 Scifinder的化学学科覆盖事实上，Scifinder数据库囊括了⾃20世纪以来所有与化学相关的资料，以及⼤量⽣命科学及及其它科学学科⽅⾯的信息。
1.2.1 ⽣命科学领域遗传学、基因组学、酶学、蛋⽩质组学、实验内科学、⽣物化学、⽣物技术学、分⼦⽣物学、微⽣物学、细胞⽣物学、药理学等能够保证将9⼤主要专利组织2⽇内发布的与⽣物加⼯⽅法、蛋⽩质组技术、新遗传学⼯艺，及其它对现代药品开发⾄关重要的课题等相关的专利收录进来；通过Scifinder访问遗传学、酶学、⽣物化学、⽣物技术学及更多科学信息。
⽤户可查找：摘⾃细胞、科学、核酸研究、现代药品开发资料及其它知名期刊的科学信息。
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化学结构式检索
第一部分：学习数据库
Dialog系统可以进行结构式检索的数据库：
Beilstein Facts (File 390)
Derwent Chemistry Resource (File 355)
IMS Patent Focus (File 447,947)
IMS R&D Focus (File 445,955)
Index Chemicus (File 302)
Pharmaprojects (Files 128,928)
Prous Science Drug Data Report (File 452)
Prous Science Drugs of the Future (File 453)
390: Beilstein Facts
389: (ONTAP Beilstein Facts)
Beilstein 贝尔斯坦化学文摘（390，391，393号文档）
是世界上最大的关于有机化学事实的数据库，数据来源于175种期刊，已收录9百多万个化合物和9百多万个反应。
作为最基本的化学文献数据库，Beilstein能帮助有机化学研究人员形成新思路、设计合成路径（包括起始原料和中间体）、确定生物活性和物理性质、了解外界环境对化合物的影响，等等。
主要数据的索引分为3部分：其中390 Beilstein Facts即化学物质部分收集了结构信息及相关的事实和参考文献，包括化学、物理和生物活性数据；391 Beilstein Reactions反应部分提供化学物质制备的详细资料，帮助研究人员用反应式检索特定的反应路径；393 Beilstein Abstracts文献部分包括引用、文献标题和文摘，化学物质部分和反应部分的条目与文献部分有超链接。
1771至今，季度更新。
355: Derwent Chemistry Resource
Derwent Chemistry Resource 德温特化学资源（355号文档）
可对Derwent世界专利索引（Derwent World Patent Index，DWPI）和Derwent药学文档（Derwent Drug File，DDF）中的化学内容进行结构检索。
DWPI含有全球40多个专利发布权威机构的一千一百万篇专利文献，并且每年新增一百五十万。
本库提供专利中的化学信息，包括化学结构、分子式、化学名称等信息，通过它可以直接用化学结构绘图检索DWPI和DDF中的专利信息，并掌握相关的化学信息。
每周更新2次。
445: IMS R & D Focus
IMS R&D Focus ，IMS医药研发聚焦（445号文档）
该库侧重企业和健康研究机构新药的研发过程。
提供23300种处于R&D阶段的药物，9400种表现活跃的药物，4800种生物制品，关注3000家业内公司及国际药品市场从研发到商业等一系列进展。
每条记录包括药品从研发到推向市场的全部信息。
信息来源于IMS HEALTH 公司出版的R&D Focus和R&D Focus Drugs News。
1991至今，每周更新。
447: IMS Patent Focus
IMS Patent Focus （IMS药物专利数据库）
IMS药物研发数据库是IMS HEALTH公司的产品。
该数据库的信息来源于各国专利文献和相关的化学资源，提供了超过3,000种商业制药化合物的专利申请状况，包括市场动态和III期临床试验（或之后）的信息，包括药品的属名、药厂编号、CAS注册号、化学名称、同义词、治疗说明、专利文摘、发展历史、世界范围发展的最新阶段、商业潜力和公司活动。
重点在药物专利的全球申请状况，评估专利届满日期和延长的可能性。
302: Index Chemicus
Index Chemicus IC化学索引（302号文档）
该索引是The Institute of Scientific Information(美国科学情报所，简称ISI)的基础出版物该刊用图示文摘形式报道世界各国100 多种重要刊物上刊登的有关有机、药物和药物化学的有价值的研究论文。
其内容包括新的有机化合物、化合物合成和新化合物的鉴定分析。
IC关注新化合物的报道，每年新增200，000个新成分和中间体。
资料来自世界顶级的有机化学期刊，可以以文本方式和结构式检索。
它不仅是一个化合物数据库，也是一个了解发展近况的工具，有作者索引、关键词索引和生物活性等方面的索引，并有来源期刊的名称。
每年还有累积索引。
通过IC，使用者可以追踪最新研究进展，发现项目新点子，关注别的研究组的工作，节省用在图书馆和实验室的时间。
1993至今，每周更新。
128: Pharmaprojects
Pharmaprojects 在研新药动态（128号文档）
该数据库是英国著名的PJB Publication LTD出版的一套反映世界范围内新药，包括化学药和生物药，研究、开发动态的信息资料，是从事医药生产、科研、教学、经营管理的人员和医疗卫生工作者及时了解世界范围内药物研发进展和动态的必备工具。
Pharmaprojects 中的每个药物都包含以下信息：药物名称、开发阶段、各国上市情况、该药物开发公司的情况、药理依据、化学依据、专利情况、各国上市情况。
1980至今，每周更新。
452: Prous Drug Data Report
Prous Science Drug Data Report ，Prous药品数据报告（452号文档）
跟踪报道6.5万种生物活性成分。
包括了大约10，000种候选药物的结构、生物活性、专利和版权信息及参考文献。
每月公布的专利中新的具有生物活性的化合物都加入到数据库中，并且追踪其进展情况和临床试验。
在了解医药工业发展、追踪竞争对手的研究进展方面很有价值；在确定结构特征对特定的生物活性的影响方面也是极好的选择。
提供全文格式，1988至今，每月更新。
453: Prous Drugs of the Future
Prous Science Drugs of the Future ，Prous未来药物数据库（453号文档）
报道处于各研究阶段的药物进展，从开始研制、临床试验到上市的信息。
包括药物的制备方法、药理、毒理、临床疗效及市场信息等。
提供药物的结构式、CAS登记号、临床研究和制造商。
1990至今，月度更新。
第二部分：检索平台
Dialoglink5.0
第三部分：检索过程
1. 使用画图软件画出结构式并复制。
N
N
N
HN O
HO
OH
SO 3Na
N
N
N
O O
O
S
N
2. 检索：
1） 点击chemical structure ，进入结构式检索：
2）选择检索类型和数据库：
3）找到化学结构式，点击结构式进行检索：
4）点击插头登录连接，回车键输入指令
5）得到检索结果S1
6） 输出结果：
点击command ，输入指令，如T s1/gs/1-10 或者：T s1/na,gs,im,rn/all
N
N
N O
O
O S
N
第四部分检索费用
Cost指令：显示当次检索费用
机时费：$16/小时
结构式检索费：$20/次
数据库检索费：见各数据库蓝页
355号文档：$3.28/分钟
记录输出费：见各数据库蓝页
355号文档：全纪录$1.50/个；
390号文档：gs格式$10.34/个，t s1/gs/1-10
Rn,gs,im,na组合格式约$20.68/个，t s1/rn,gs,im,na/1-10 关于字段定义和指令格式见dialog相关教材。