基因芯片技术与临床应用
基因芯片技术及其应用

基因芯片技术及其应用随着生物学、生命科学的发展,基因芯片技术越来越受到关注。
基因芯片又称为DNA芯片,是一种利用微阵列技术来检测基因表达水平的高通量方法。
基因芯片技术的发展带来了许多应用领域的新成果,包括疾病预测、药物研发等。
本文将介绍基因芯片技术及其应用。
一、基因芯片技术的原理基因芯片技术是一种高通量的生物技术,它利用微阵列生物芯片来检测基因表达的水平。
这种技术利用了DNA分子的特异性与完整性,它可以在任何生物样品中高效地检测出其蛋白质表达水平和基因组变异情况。
基因芯片技术的工作原理基于蛋白质表达水平与基因组变异情况的探测。
首先,需要将基因DNA序列通过逆转录过程转换成mRNA序列,进而使用荧光标记标记mRNA序列。
接下来将标记好的mRNA序列通过微阵列技术固定到芯片上,并使用高通量扫描技术来观察标记后荧光强度的变化程度。
荧光值越高,则说明该基因表达水平越高。
基因芯片技术不仅可以检测基因表达水平,还可以检测基因序列的变异情况,用于了解某种疾病或细胞状态的基因组变化情况。
比如,可以用这种技术针对某种疾病相关的单核苷酸多态性位点检测基因变异情况。
二、基因芯片技术的应用1. 癌症筛查基因芯片技术可用于癌症筛查,将肿瘤组织中的RNA与正常细胞组织的RNA进行比较,寻找表达水平具有显著差别的基因,进而确定这些基因是否与癌症发展相关。
利用这种方法可以更加准确地判断某个癌症的种类、发展程度等。
2. 个性化药物设计基因芯片技术可用于个性化药物设计,通过基因芯片可以确定某个病人,是否会对某种药物产生不良反应,从而确定是否使用该药物。
同时,可以利用基因芯片技术根据病人的基因组变异情况,设计出一种更加适合该病人的药物。
3. 遗传疾病筛查基因芯片技术可用于遗传疾病筛查,利用基因芯片技术可以检测出某些基因的表达水平是否异常,从而确定在某些疾病中,基因的表达水平是否存在异常。
4. 农业和环保应用基因芯片技术不仅可以应用在医学领域,还可以应用于农业和环保领域,例如种植业、畜牧业、水产养殖业等。
生物芯片技术在临床医学中的应用

生物芯片技术在临床医学中的应用生物芯片技术是一门新兴的技术,也被称为生物检测技术。
它是指将微电子技术与生物学相结合,通过微型化和微电子化的方法来检测和分析生物样品中的生物分子,为临床医学等相关领域提供了更加简便、快速、准确、重复性好的检测手段,在基因分析、药物筛选、诊断、治疗等方面得到广泛应用。
生物芯片技术在临床医学中的应用越来越广泛,下面我们来详细介绍一下。
一、基因芯片在疾病的发病机制研究中的应用基因芯片是指检测基因表达的芯片,使用基因芯片可以同时测定数万到十万个基因的表达水平,对于疾病的分型、疾病的发病机制的研究非常有帮助。
利用基因芯片技术,可以研究疾病的致病基因、通路和分子机制,进而实现药物的精准治疗。
例如,肝癌是一种具有极高发病率和凶险性的癌症,其发病机制非常复杂,长期以来一直是一个难点。
利用基因芯片技术,可以同时研究多个分子通路,揭示肝癌的致病基因和分子机制。
基因芯片技术发现了肝癌的分子亚型,为肝癌的个体化治疗和精准化治疗提供了有力的依据。
二、蛋白芯片在临床检测中的应用蛋白芯片是指检测蛋白质的芯片,利用蛋白芯片可以同时测定数百到数千种蛋白质的表达水平和蛋白质结构等信息,对于临床检测非常有帮助。
比如,目前已经出现了能够同时检测数百种蛋白分子的腺病毒蛋白芯片,可以用于诊断和治疗各种疾病和症状,包括心血管、神经系统、肿瘤等疾病。
三、生物芯片在诊断中的应用利用生物芯片技术可以实现对有关疾病标志物的精准检测,从而为临床诊断提供有力的依据。
例如,利用生物芯片可以诊断出不明原因发热和自身免疫性疾病等难以诊断的疾病。
四、生物芯片在癌症筛查和治疗中的应用利用生物芯片技术可以检测人体中极低浓度的肿瘤标志物。
通过在早期发现癌症,可以降低死亡风险和治疗成本。
同时,结合生物芯片的检测技术,可以定制化治疗方案,实现对癌症的有效治疗,为患者带来更好的治疗效果和生存率。
总之,生物芯片技术在临床医学中的应用范围非常广泛,从基础研究到临床应用,都有着不可替代的作用。
生物芯片技术及其在医学上的应用

生物芯片技术及其在医学上的应用近年来,随着生物芯片技术的高速发展,其在医学领域中的应用越来越广泛。
生物芯片技术是指将微小的生物材料固定在芯片的表面上,以探测生物分子、细胞或组织的一种技术手段。
它的优势在于快速、准确、高通量和高灵敏度,被广泛应用于高通量基因分型、蛋白质鉴定、细胞生物分析、药物筛选、立体图像构建等领域。
一、生物芯片技术生物芯片技术是指使用微电子技术制造出小型芯片,在芯片上通过精巧的设计排列多个生物分子检测元件,可同时进行大量生物学实验,并可快速记录和分析实验结果,极大地提高了实验效率。
其中,常用的生物芯片技术有基因芯片技术、蛋白质芯片技术和细胞芯片技术。
1.基因芯片技术基因芯片技术是基于DNA、RNA的芯片技术,用于同步探测及分析大量基因DNA序列的表达情况,从而了解不同组织、不同状态下基因表达水平的变化,并寻找与特定疾病有关的基因表达水平的差异。
它的快速高通量的处理能力可为全基因组表达分析、基因突变筛查、SNP检测、基因亚型鉴定、疾病识别、药物靶标发现和新药研究等提供有力的支持。
2.蛋白质芯片技术蛋白质芯片技术是利用固相法在玻片、滤膜、微球或微芯片的表面上制备一系列纯化的特异性或全长的蛋白质样品阵列,用于快速大规模地筛选靶蛋白质,分析蛋白质相互作用、酶活性或某些组分与特定蛋白质的结合能力等。
它可用于疾病标记物的检测和筛选、蛋白功能鉴定、蛋白特异性鉴别、药物筛选等方面。
3.细胞芯片技术细胞芯片技术是利用微流控技术制作微小的通道和微型反应器,在芯片上实现细胞的悬浮、培养和观测等操作。
它可应用于各种组织细胞的轻松快捷的分离、单细胞的提取、测序和分析,可推广到药物筛选和个性化医疗等领域。
二、生物芯片技术在医学上的应用生物芯片技术的高通量、高灵敏度、高可靠性和高通用性,使其成为了医学领域中的重要工具,可应用于诊断、预后分析、治疗方案的制定和药物研究等方面。
1.疾病诊断和预后分析基因芯片技术可用于疾病的早期诊断,如乳腺癌、卵巢癌、肾癌、直肠癌等癌症的检测。
生物芯片技术在医学检验中的应用

生物芯片技术在医学检验中的应用生物芯片技术,是一种利用微电子技术制造的生物检测标准品,用于对特定生物分子进行检测的技术。
它广泛应用于药物研发、疾病诊断、基因筛查等领域,特别是在医学检验中,由于其高效准确、快速简便的特点,被越来越广泛地应用。
1. 蛋白芯片技术在肿瘤筛查中的应用蛋白芯片技术是一种利用微阵列芯片来检测蛋白质结构和功能的技术。
在肿瘤筛查中,蛋白芯片技术可以用于检测特定蛋白质的表达情况,为癌症的早期诊断提供了一种新的手段。
目前,蛋白芯片技术已经被广泛应用于人类乳腺癌、肺癌、卵巢癌等多种肿瘤的诊断,成为肿瘤筛查中不可或缺的技术手段。
2. 基因芯片技术在疾病预测中的应用基因芯片技术是一种利用微阵列芯片来检测基因表达的技术。
在疾病预测中,基因芯片技术可以用于检测特定基因的表达情况,从而预测患有某种疾病的风险。
例如,对于某些与遗传性疾病、癌症等相关的基因,通过基因芯片技术可以快速、精准地筛查患者是否存在相应的基因突变,从而预测有无发病风险。
3. DNA芯片技术在个性化医疗中的应用DNA芯片技术是一种利用微阵列芯片来检测DNA序列的技术。
在个性化医疗中,DNA芯片技术可以用于分析患者基因序列的特点,并根据这些特点制定适合他们的治疗方案,以达到最佳的治疗效果。
例如,在癌症等疾病治疗中,利用DNA芯片技术可以精确地判断患者针对某种药物的敏感性,从而指导临床治疗方案的制定。
4. 微量分析芯片在医学诊断中的应用微量分析芯片是一种利用微流控和微纳米加工技术制造的高通量、高灵敏度的检测平台。
在医学诊断中,微量分析芯片可以用于极小体积样品的快速检测,例如血液、尿液等生物体液。
同时,由于微量分析芯片的高灵敏度,可以检测到非常微量的生物标记物,有助于提高医学检查的准确性与敏感性。
总之,生物芯片技术在医学检验中的广泛应用,极大地提高了检测的准确性和效率,为临床诊断和治疗提供了新的手段和思路。
随着技术的不断创新和进步,相信生物芯片技术的应用领域还将不断拓展,为医学检验带来更多的创新和突破。
生物芯片技术在医学治疗中的应用

生物芯片技术在医学治疗中的应用随着时代的发展,科学技术越来越受到人们的关注和重视,而生物芯片技术作为其中的一项十分重要的技术,已经被广泛应用于医学领域中。
生物芯片技术可以通过微型化,大大缩小实验室的规模,而且具有高通量、高灵敏度、高速度等特点,使得其在生物医学领域中具有重要的应用价值。
一、什么是生物芯片技术?生物芯片技术是一种新型的生物分析技术,它是利用芯片的微电子加工技术和生物分析技术相结合的一种研究方法。
生物芯片技术包括基因芯片、蛋白芯片等多种类型,其设计原理都是在芯片上加工大量的分析单元,可以同时检测多个生物分子或者分析多种生物学过程。
二、生物芯片技术在医学领域的应用1. 基因芯片技术在癌症治疗中的应用基因芯片技术是利用芯片上的DNA探针,同时检测大量基因,从而发现某些基因的变异,它可以探究生命体内的分子特征以及其发生的变化,对于发现癌症的病因具有十分重要的作用。
在癌症的治疗方面,基因芯片技术可以预测患者对于某种治疗方法的反应性,并且能够提高患者的治疗效果。
2. 蛋白芯片技术在疾病诊断中的应用蛋白芯片技术是利用芯片上的抗体探针,检测患者血液中某些特定的蛋白质水平的技术。
它可以用于疾病的信号检测和诊断,是生物医学领域中的一项重要技术。
蛋白芯片技术可以提供高通量分子分析的能力,这对于广泛筛选患者的血液标志物,以及疾病预后和疾病诊断都具有很大的帮助。
3. 生物芯片技术在药物筛选中的应用药物筛选就是根据试验人员预先设计好的试验流程,来筛选出一些药物,以便能够发挥其在生物体内的作用。
生物芯片技术可以使药物筛选变得更加智能化和高通量,能够同时进行很多药物的筛选。
并且,生物芯片所用到的细胞可以保存着治疗疾病的基因特征,因此可以预测药物治疗可能带来的健康问题以及治疗效果。
4. 生物芯片技术在干细胞治疗中的应用干细胞治疗是一个新的治疗方式,可以大大拓展医学领域的应用范围。
干细胞具有分化成各种特定功能细胞的潜能,因此被广泛用于疾病治疗。
基因芯片技术的应用

基因芯片技术的应用随着生物技术和基因研究的不断进展,基因芯片技术已经广泛应用于生物医学、农业、动植物繁殖、环境保护等领域。
本文将从基因芯片技术的原理、应用场景和前景展开阐述,探讨该技术的研究热点和发展趋势。
一、基因芯片技术的原理基因芯片是一种利用高通量技术同时检测成千上万个基因表达的工具。
它通过利用DNA技术将成千上万的基因DNA序列固定在玻璃芯片上,并可检测目标样本中RNA或cDNA的水平。
基因芯片技术主要包括以下步骤:1. 设计芯片:确定目标基因序列,利用计算机技术进行芯片设计,制备出针对目标基因甚至全基因组的芯片。
2. 样本制备:提取RNA或cDNA,并借助反转录技术将RNA 转化成cDNA,再对其进行扩增。
3. 杂交:采用特殊设备将目标样本中的cDNA标记为不同颜色的探针,与芯片表面的DNA序列杂交。
4. 扫描和分析:利用激光扫描装置对芯片表面进行扫描,测量复合体的强度,并进行统计和分析。
这样,我们就能够在一张小芯片上探测到成千上万个基因,分析并比较样本之间的差异,从而揭示出基因调控、信号传递和代谢途径等生物学特征。
二、基因芯片技术的应用场景基因芯片技术的应用范围极广,以下列举几种典型场景:1. 生物医学基因芯片技术在生物医学领域中主要用于诊断和治疗基因相关疾病。
例如,我们能够将基因芯片应用于肿瘤分型和分级、遗传性疾病的基因筛查、药物研发等方面。
此外,基因芯片技术还可以为个体化医学提供技术支持,为临床医生制定精准个体化治疗方案提供重要依据。
2. 农业基因芯片技术的应用在土地的病虫害监测、作物品种鉴定、转基因食品检测等方面具有重要意义。
例如,在生产实践中,农民们经常遭受由于病虫害带来的经济损失,而基因芯片技术能够帮助他们快速诊断设备,确定病虫害的种类和数量,从而更好地进行管理和防范。
3. 环境保护环境污染问题已经成为全球性的挑战,而基因芯片技术则为环境保护带来了新的手段。
例如,通过检测微生物的基因组DNA,我们可以了解大气、水环境以及土壤中的微生物种类组成状况,协助我们了解生态系统的状况和进行环境监测。
基因芯片技术高效

基因芯片技术是一种用于大规模分析特定基因表达水平的技术,它可以将数以亿计的探针分子固定在芯片上,与标记的样品进行杂交,从而快速、准确地检测到基因表达的变化,并用于药物开发、遗传病诊断和医学研究等领域。
该技术的高效性主要体现在以下几个方面:
1. 高通量:基因芯片技术可以在短时间内分析大量样品,通过一次杂交即可检测到多个基因的表达水平,大大提高了实验的效率。
2. 高灵敏度:基因芯片技术可以检测到低丰度的基因表达水平,对于一些难以检测的基因,基因芯片可以作为一种有效的检测手段。
3. 高精度:基因芯片技术的杂交过程可以在显微镜下观察和计数,保证了实验结果的准确性。
此外,基因芯片还可以对多个样品进行并行分析,大大提高了实验的便捷性和自动化程度。
4. 临床应用:基因芯片技术在临床诊断和药物开发等领域的应用也越来越广泛,它可以帮助医生更准确地诊断疾病,并为患者提供个性化的治疗方案。
同时,基因芯片还可以用于药物筛选和开发,为新药研制提供了更为准确和高效的手段。
在实际应用中,基因芯片技术已经成为了生物医药领域不可或缺的一部分。
但是,基因芯片技术也存在一些问题和挑战,例如实验技术的复杂性和成本较高,以及实验结果的可解释性等方面仍有待提高。
总之,基因芯片技术以其高效、高通量、高灵敏度、高精度等特点,在药物开发、遗传病诊断和医学研究等领域得到了广泛应用。
虽然还存在一些问题和挑战,但随着技术的不断发展和完善,基因芯片技术的应用前景将更加广阔。
基因芯片技术及其在生物医学中的应用

基因芯片技术及其在生物医学中的应用随着科技日益发展,基因芯片技术受到了越来越多的关注和重视,因为它可以对数万个基因进行分析,并在更短的时间内获取更准确的基因信息。
在现代生物医学领域中,基因芯片技术可以被应用到许多方面,如研究疾病的原因、制定诊断方案和治疗方案等。
一、基因芯片技术的原理基因芯片技术以小而微的芯片为载体,通过高通量的技术对芯片表面上的核酸探针进行检测,从而检查目标核酸(如DNA, RNA)的序列和表达谱。
这些芯片上一般会固定几万甚至几十万个寡核苷酸探针,用于检测样本中的基因、蛋白质、代谢物等。
二、基因芯片技术在疾病研究中的应用1. 研究肿瘤的发生和发展基因芯片技术可以用于研究肿瘤的发生和发展,它可以检测数千个基因的表达谱,并找到可能与肿瘤相关的基因。
这些信息可以帮助人们了解肿瘤的细胞生长、代谢、分化和凋亡等生理和病理过程,从而为研究肿瘤的治疗和预防提供重要的基础数据。
2. 帮助筛选新的药物靶标基因芯片技术可以帮助科学家筛选新的药物靶标。
例如,专家可以通过比较病人的肿瘤基因组和正常组织样本的基因组数据,找到与肿瘤相关的基因。
然后,研究人员可以进一步研究这些基因的功能,验证其与肿瘤形成过程的相关性。
这样,基因芯片技术可以帮助研究人员快速准确地找到可能用于开发新药物的分子靶标。
3. 帮助制定个性化医疗方案基因芯片技术也可以使用个体化医疗的方法。
通过使用基因芯片技术,医生可以获得患者的基因组数据,并根据这些数据来制定个性化的治疗方案。
例如,基因芯片可以检测基因突变和异常表达以确定治疗某种癌症所需的化疗药物,甚至可以在治疗开始之前查明是否存在的不良反应风险。
三、基因芯片技术在生殖医学中的应用1. 早期孕期检测基因芯片技术可以作为一种早期孕期检测手段,通过检测孕妇血液中游离DNA的含量来确定胚胎的健康状况,并预测是否存在胎儿染色体异常,如唐氏综合征等。
这种方法使用基因芯片可以快速、精确和无创地确定胚胎的染色体状态。
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使用多种掩盖物能以更少的合成步骤生产出 高密度的阵列,在合成循环中探针数目呈指 数增长。
某一含n个核苷酸的寡聚核苷酸,通过4×n 个化学步骤能合成出4n个可能结构。
例如:一个完整的十核苷酸通 过32个化学步骤,8个小时可能 合成65,536(即216)个探针。
现在全世界已有十多家公司从事基因芯片 研究和开发工作,而且已有较为成型的产 品和设备问世。这些公司主要以美国的 Affymetrix公司为代表。
美国“Fortune”杂志在1997年3月对基因芯片技 术未来产业化的前景进行了重点介绍。
图片来自益来基因网: /
基因芯片制备技术 靶基因的制备 杂交和检测
提出问题
芯片设计基因芯片设计 Nhomakorabea杂交图像分析
……
芯片制作
原位合成 合成点样
表达差异分析 多态性分析 再测序
生物信息学 数学优化 数据库 标准化
试样处理
PCR扩增 靶基因标记
芯片杂交
实际应用
数据分析
杂交检测
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1.基因芯片的主要类型
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二.基因芯片的定义
又称DNA芯片,是指将许多特定的寡核苷酸片段或基
因片段作为探针,有规律地排列固定于支持物上,然后
与待测的标记样品的基因按碱基配对原理进行杂交,再
通过激光共聚焦荧光检测系统等对芯片进行扫描,并配
以计算机系统对每一探针上的荧光信号作出比较和检测,
从而迅速得出所要的信息。
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三.基因芯片相关技术及其进展
图片来自益来基因网: /
256*256分子印章阵列显微图 (0.18%) 高密度芯片DNA阵列显微图(0.16%)
高密度芯片DNA阵列荧光杂交图(0.09%)
分子印章多次压印合成法点样机
图片来自益来基因网: /
基因芯片视分类方法不同可分为不同类型
片基或支持物
无机芯片 有机合成物芯片
探针阵列形式
原位合成
光引导聚合法 喷墨打印合成法(压电打印法)
合成点样
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基因芯片的主要类型及其简要特点
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2.基因芯片的制备
基因芯片的实质是高度集成的寡核苷酸 阵列
制造基因芯片首先要解决的技术问题就 是如何在芯片片基上定位合成高密度的 核酸探针
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基因芯片制备的两种基本方法
原位合成
• 直接在芯片上用四种核苷酸合成所需的探针
合成点样
• 将已经合成好的探针定位在芯片上
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原位光刻合成
由美国Affymetrix公司开发
Picture from UKBF: bf.fu-berlin.de/ Affymetrix Website: /
基因序列数据库正在以前所未有的速度迅速 增长。
2
然而如何充分利用新序列信息资源,怎样 去研究如此众多基因的生物信息及其在生 命过程中所担负的功能,成为生命科学工 作者的共同课题。
3
已建立的诸如Northern印迹、RNA酶保 护实验、S1核酸酶分析、噬斑杂交以及 狭线印迹等方法不能提供足够通量来有 效地利用新的基因组学的资源。为此, 必须发展高通量或平行监测基因表达的 新方法。
基因芯片技术及临床应用
府伟灵 西南医院检验科
一.概述
随着人类基因组测序计划的逐步实施以及分 子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的 动植物、微生物基因组序列得到测定。
在GenBank数据库中已含有300万个序列,总 数超过22亿个碱基对,其中包括19种不同生 物体的完整序列、近9 000个已知功能或已推 测功能的人类基因序列。
步骤
1. 把玻璃基片上的活性羟基修饰上光保 护基团,此光保护基团可被一定波长 的光激活并脱保护。
2. 根据所要制作的阵列的需要设计光刻 掩膜。将掩膜(M1)覆盖在修饰过的 基片上,用光照射使曝光区域的基片 表面脱除保护基团而形成活性羟基(12)。
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3. 引入5`端被X基团保护、3`端被活化的单核苷酸 dNTP,使dNTP的3`端与基片上的活性羟基缩合, 洗去未有效结合的dNTP(3)。
Picture From BROWN LAB /pbrown/
原位喷印合成
芯片原位喷印合成原理与喷墨打印类似, 不过芯片喷印头和墨盒有多个,墨盒中装的 是四种碱基等液体而不是碳粉。
采用的化学原理与传统 的DNA固相合成一致,因 此不需要特殊制备的化学 试剂。
基因芯片技术正是在这样的背景下应运 而生。
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早在80年代初期,有人就曾设想利用 计算机半导体技术生产基因芯片以对 人类基因大量的遗传信息进行分析和 检查。
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但直到1994 年Pease等人创造的光导原位合成高 密、微化的寡核苷酸阵列(ODTA)的制作技术问 世之后,才使该设想逐步成为现实。
因此可以说光导ODTA 化学合成法,为基因芯 片技术奠定了基础。
优势与特点
采用了平面微细加工技术,可实现大批量 生产。通过提高集成度,降低单个芯片的 成本
可组装大量的(104--106种)生物分子探 针,获取信息量大,效率高,特别适合于 基因信息的采集。
结合微机械技术(MEMS),可把生物样 品的预处理,基因物质的提取,扩增,以 及杂交后的信息检测相集成,制备成微物 芯片。
Picture from BioDot:
分子印章多次压印合成法
1.根据所需微阵列,设计有凹 凸的微印章,然后根据预先设 计在制备的各级印章上涂上对 应的单核苷酸。
2.按照设计的顺序将不同的微 印章逐个依次压印在同一基 片上,得到256×256阵列的 高密度基因芯片。
高密度——分辨率高 准确性——合成产率高 一致性——工艺最优化 批量化——平面印刷法
合成点样
合成点样技术在基因芯片尚处于实验 研究阶段时是唯一的芯片制造手段, 曾一度被原位合成技术的光芒所掩盖。
随着原位合成技术缺点的暴露和自动 化技术的进步,合成点样技术又重现 生机。
是将合成好的探针、cDNA或基因组 DNA通过特定的高速点样机器人直 接点在芯片上。