实验五家猪染色体核型分析

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猪IFN_基因多态及功能分析

猪IFN_基因多态及功能分析

农业生物技术学报JournalofAgriculturalBiotechnology2008,16(2):221 ̄224*基金项目:国家自然科学基金-广东省联合基金(No.U0631005)及广东温氏食品集团博士后科研基金项目资助。

**通讯作者。

Authorforcorrespondence.讲师,主要从事动物分子生物学研究。

E-mail:<chenhy5000@126.com>,<chenhy5000@163.com>.收稿日期:2007-06-06接受日期:2007-06-16・研究论文・猪IFN-γ基因多态及功能分析*陈慧勇1,2**,吴珍芳1,2,毕英佐1,2,赵书红3,曾海玉2,周秀2(1.华南农业大学动物科技系,广州510640;2.广东温氏食品集团,新兴县527400;3.华中农业大学动物科技学院,武汉430070)摘要:γ-干扰素(interferon-gamma,IFN-γ)在机体免疫应答调节及抵抗病毒感染方面具有重要的作用。

为了探测猪IFN-γ基因作为猪抗病育种中一种分子标记的可能性,首先对其进行了不同猪品种间的基因组测序,以揭示核苷酸水平的变化,结果在IFN-γ基因中发现了3个单核苷酸多态(SNP)。

其中2个SNP为中国地方猪种二花脸所特有。

另一SNP则在杜洛克、长白、皮特兰、圣特西及大白中具有广泛的多态分布,群体杂合度为0.4820。

此多态位点经PCR-SSCP检测发现3种基因型:II基因型(A碱基插入纯合型)、DD型(A碱基缺失纯合型)和DI杂合型。

该标记基因型与表型间的卡方独立性检验尚没有发现IFN-γ基因与猪健康状况的现场记录直接相关,但多重比较分析却发现该基因与猪的繁殖性能有关。

关键词:猪;IFN-γ;单核苷酸多态(SNP);关联分析中图分类号:S188文献标识码:A文章编号:1006-1304(2008)02-0221-04SearchingandCharacterizingSingleNucleotidePolymorphismsinPorcineIFN-γGeneCHENHui-yong1,2**,WUZhen-fang1,2,BIYing-zuo1,2,ZHAOShu-hong3,ZENGHai-yu2,ZHOUXiu2(1.DepartmentofAnimalScience,SouthChinaAgriculturalUniversity,Guangzhou510640,China;2.GuangdongWen’sGroup,Xinxing527400,China;3.CollegeofAnimalScienceandTechnology,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China)Abstract:Interferon-gamma(IFN-γ)playsanimportantroleintheinnatehostdefenseagainstviralinfection.InordertoanalyzethevalueoftheIFN-γgenetobeageneticmarkerornotinporcinediseaseresistance,genomicsequencingwasemployedindifferentbreeds.Andthreesinglenucleotidepolymorphisms(SNPs)wereidentified.TwoofthemwerefoundonlyinErhualian,andtheotheronewaspolymorphicwithheterozygositybeing0.4820indifferentbreeds,whichareDuroc,Landrace,PietrainandSynthethic.ThreegenotypesweredetectedbyPCR-SSCPfortheSNP,whichwereII(homozygoteforinsertionofA),DD(homozygotefordeletionofA)andheterozygoteDI.Associationwasnotdetectedbetweenmarkersandhealthlevelsrecordedinherdbychi-squaredistributiontest,butbetweenmakersandporcinereproductiontraitsbyDuncan'smultiplerangetest.Keywords:pig;IFN-γ;singlenucleotidepolymorphisms(SNP);associationanalysis近几年猪疾病基因表达方面的研究积累了越来越多的可能候选基因(Niewoldetal.,2005;Petryetal.,2005;Suradhatetal.,2003;Zhaoetal.,2006),其中干扰素-γ基因(interferon-gamma,IFN-γ)基因即是一例。

家猪(Sus scrofa dorrzestica)体细胞染色体的研究1)

家猪(Sus scrofa dorrzestica)体细胞染色体的研究1)

1 .3 .2 10土014 68土009 .4 .7 53 上003 .4 .8
6 2 士0 01 .0 . 7
55 土005 .8 .3 55 土005 .1 .5 53 土005 .1 .5 51 土00 8 .0 .5 50土005 .9 .5 43 土007 .2 .4 40 士001 .4 .5 ) 32 土00 1 .5 .6 28土009 .7 .6 83土01 1 .2 .0
4 .9 . 1 91 士0 2 9Biblioteka 4.6 .2 8 5 士0 4 2
4 .8 0 3 5 9 2 土 .1
用放大约 20 倍的显微摄影照片进 行染 50 色体测量, 每种猪各测 1 个细胞, 6 分别算出相 对长度和着丝点指数的平均值 ( 1 表 、表 2 作 ) 为染色体编号和配对的依据。 从测量数据看来, 这些家猪染色体的相对长度和着丝点指数都很
3 . 1 .6 6 9 土0 4 1
, x g J0 1t lZ
3 .3 .3 57土0f9 ) 4 .0 .7 36 土042 4 .5 .6 27 士055 4 .7 .3 84土046
4 . 9十 0. 2 84 36
3 ,8 .0 77土046 4 .4 .6 43 土050 4 .4 .2 64士056 3 .6 .7 74土037 4 .4 .1 33土068 4 .3 .6 38 士058 4 .1 .7 84士036
序 5 4。 2+ 0. , 多2
邻 .4 .9 ,土030 4. .5 9b 土016 7 4 .8 .4 9 5土02 4
4 .2 .3 9 4 土0 1 3
4 .2 .1 69 土035 3 .6 .9 45 土03 1 4 .2 .2 45 土050 4 .8 .0 63 士035 4 .2 .1 86 士0 34 4 .9 .4 91 土022

全基因组关联分析影响猪GLU和GSP的染色体位点-畜牧兽医论文-农学论文

全基因组关联分析影响猪GLU和GSP的染色体位点-畜牧兽医论文-农学论文

全基因组关联分析影响猪GLU和GSP的染色体位点-畜牧兽医论文-农学论文——文章均为WORD文档,下载后可直接编辑使用亦可打印——引言【研究意义】血液中的血糖(glucose,GLU)循环全身,对人体具有重要的生理功能,是反映机体生理状况的一个重要指标。

空腹血糖浓度(fasting serumglucose, FSG)是糖尿病临床诊断的常规指标,也是糖尿病诊断后10 年内因心血管疾病的预警指标。

糖尿病病人的空腹血糖浓度持续偏高,波动较小,是一种营养代谢性疾病。

有研究表明,空腹血糖浓度是可遗传的,遗传力为0.62 0.08(P<0.01),属于高遗传力性状。

糖基化血清蛋白(glycosylatedserum proteins,GSP)是一个比血糖更稳定、更能反映机体23 周内平均血糖水平的指标。

猪作为模式动物,与人类具有相似的代谢功能、心血管系统、成比例的器官大小等,已经成为研究人类肥胖、糖尿病及并发症等疾病的最佳模式动物。

研究影响猪GLU和GSP 的染色体位点及候选基因定位,不仅对猪代谢生理功能的遗传解析具有重要意义,而且对人类相关疾病的临床研究具有参考价值。

【前人研究进展】近年来,已定位了多个影响GLU 和GSP 的QTL。

Cai 等在对西班牙裔儿童研究中发现,影响空腹血糖浓度的QTL 定位在13 号染色体的8599 cM处;An 等在人19 号染色体的88cM 处定位到了显着影响空腹血糖浓度的QTL,在7 号染色体的163cM处定位到了染色体可显着影响空腹血糖浓度的QTL;Kobayashi 等在由SMSMXA-5 构建的F2小鼠中,在8 号染色体上定位到了影响空腹血糖浓度的QTL。

人和鼠的血糖性状QTL 定位结果具有很高的一致性。

在对猪的研究中,Yoo 等利用长白韩国本地猪种F2群体,在SSC1 和SSC8 上定位到染色体可显着影响GLU 的QTL;Dsauts 等利用梅山猪和大白猪构建的F2群体在SSC1、3、5、8 四条染色体上定位到了影响GLU 浓度的QTL;陈蓉蓉等在白色杜洛克二花脸资源家系SSC14 的68 cM 处定位到了1 个5%基因组显着影响GLU 的QTL。

植物染色体核型分析ppt课件

植物染色体核型分析ppt课件

2021精选ppt
8
编号 绝对 长度 (μm)
1 2 3 4 5 6 ……
相对 长度
短臂 长臂 臂 着丝粒 随体 染色体 (μm) (μm) 比 指数 有无 类型
染色体类型由臂比值确定。 Total length: μm P217
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9
臂比(长臂/短臂)
形态特征
1-1.7
m 中着丝粒染色体
1.71-3.0
sm 近中着丝粒染色体
3.01-7.0
st 近端着丝粒染色体
>7.01
t 端着丝粒染色体
染色体类型由臂比值确定。 Total length: μm P217
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核型分析之染色体自动核型分析系统
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核型分析之染色体自动核型分析系统
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核型分析之染色体自动核型分析系统
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核型分析之染色体自动核型分析系统
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核型分析之染色体自动核型分析系统
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核型分析之教师用图片
1-13 2- 9 3- 7 4-14 5- 6 8-11 10-12
3. 排列:染色体长的在前,带随体的染色体排在最后 (大随体在前,小随体在后)
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7
五、实验步骤:
染色体照片的测量和对比:
4. 剪贴:将上述染色体按顺序粘贴在实验报告上,粘贴 时,应使着丝点处于同一水平线上,一律短臂在上, 长臂在下,构成核型图。
要求:染色体从大到小,短臂向上,长臂向下,各染色 体着丝粒排在同一直线上。有特殊标记的染色体(如 含有随体的)及性染色体可单独排列。

实验五 植物染色体的核型分析

实验五   植物染色体的核型分析

1959年以后在人类中发现越来越多的各种各样的染色 年以后在人类中发现越来越多的各种各样的染色 体异常。 体异常。1960年 4月在美国丹佛市召开的国际学术会议上 年 月在美国丹佛市召开的国际学术会议上 对人的染色体分群和命名的术语、符号、 对人的染色体分群和命名的术语、符号、方法等作了统一 规定,在第五次国际人类遗传学会议上产生的人类染色体 规定 在第五次国际人类遗传学会议上产生的人类染色体 命名常务委员会又于1977年专门召开了会议进行修订,会 命名常务委员会又于 年专门召开了会议进行修订, 年专门召开了会议进行修订 后公布了《人类细胞遗传学命名国际体制( 后公布了《人类细胞遗传学命名国际体制(ISCN) ) (1978)》。1981年该委员会又公布了《人类细胞遗传学高 年该委员会又公布了《 》 年该委员会又公布了 分辨显带命名国际体制》 分辨显带命名国际体制》,在1977年所制订的中期染色体 年所制订的中期染色体 带型命名规定的基础上提出了高分辨的晚前期和早中期染 色体带型命名规定和模式图。 色体带型命名规定和模式图。这些规定目前为世界各国学 者所普遍采用。 者所普遍采用。
1964年芝加哥历史露天博物馆哺乳动物部主任 年芝加哥历史露天博物馆哺乳动物部主任 D.Dwight Davis发表了一篇关于大熊猫解剖的详细 发表了一篇关于大熊猫解剖的详细 论文,并根据50个器官的比较研究结果认为大熊猫 论文,并根据 个器官的比较研究结果认为大熊猫 是熊科的一员。但不久英国的Desmond Morris和 是熊科的一员。但不久英国的 和 R.F.Ewer根据其举止和形态分别断言大熊猫属于浣 根据其举止和形态分别断言大熊猫属于浣 熊科。到本世纪80年代美国的动物学家 年代美国的动物学家John 熊科。到本世纪 年代美国的动物学家 F.Eisonbeg和George B.Schaller建议把大熊猫单 和 建议把大熊猫单 列一科,即熊猫科,这一观点在86年也取得我国一 列一科,即熊猫科,这一观点在 年也取得我国一 些动物学家的赞同。到底大熊猫的起源如何呢? 些动物学家的赞同。到底大熊猫的起源如何呢?

染色体核型分析

染色体核型分析

染⾊体核型分析姓名程开源系年级2010级临床医学⼋年制同组者孙琳、孙晶鑫、窦云德科⽬分⼦细胞⽣物学题⽬染⾊体核型分析学号201000232012【实验⽬的】1.了解⼩⽩⿏睾丸细胞染⾊体的形态及数⽬。

2.初步掌握⼩⽩⿏睾丸细胞染⾊体的玻⽚标本制作⽅法。

3.观察动物细胞染⾊体的数⽬和形态。

【实验原理】染⾊体的制备在原则上可以从所有发⽣有丝分裂的组织和细胞悬浮液中得到。

最常⽤的途径是从⾻髓细胞、⾎淋巴细胞和组织培养的细胞中制备染⾊体。

⼩型动物的染⾊体制⽚最好最有效的材料就是⾻髓组织。

⾻髓细胞中,有丝分裂指数相当⾼,因此可以直接得到中期细胞⽽不必象淋巴细胞或其它组织那样要经过体外培养;对⼤型动物通常采⽤对⾻骼、脊或胸⾻穿刺术吸取红⾻髓,⼩型动物多采⽤剥离术取股⾻以获得⾻髓细胞。

制作染⾊体标本的先决条件1. 细胞具有旺盛的分裂能⼒选择活跃的组织:胸腺,⾻髓,睾丸,⼩肠施加药物使细胞分裂:PHA2. 设法得到⼤量的中期细胞:秋⽔仙素(1) PHA:粗细胞分裂,使淋巴细胞返幼,变为淋巴母细胞(2) 秋⽔仙素:破坏微管装配,使纺锤体不能形成,使⼤量细胞停⽌在分裂中期。

(3) 低渗作⽤:⽔进⼊细胞内,细胞内容空间变⼤,染⾊体间的距离拉⼤,易于染⾊体展开(4) 空⽓⼲燥:使细胞和染⾊体展开(5) 固定:⽤甲醇:冰醋酸=3:1作⽤使蛋⽩质变性,对染⾊体内的组蛋⽩讲,变性后硬度增加,保持了染⾊体的“及时形态”,对细胞膜蛋⽩讲,变性使细胞膜硬度增强,形成屏障作⽤,防⽌了细胞内物质外溢和丢失。

对于⼩⿏精巢染⾊体标本的制作,⼀般包括以下⼏个要点: 1. ⽤⼀定剂量的秋⽔仙素破坏纺锤丝的形成,使细胞分裂停滞在中期, 使中期染⾊体停留在⾚道⾯处; 2. ⽤低渗法使将细胞膨胀, 以⾄于在滴⽚时细胞被胀破, 使细胞的染⾊体铺展到载玻⽚上; 3.空⽓⼲燥法可使使细胞的染⾊体在载⽚上展平, 经Giemsa染⾊后便可观察到染⾊体的显微图象。

染色体组型分析-PPT精选文档

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dinitrophenyl(DNP),aminoacetyl
fluorene(AAF)均可用于探针标记。
直接标记和间接标记
用生物素或地高辛标记称为间接标记, 杂交后 需要通过免疫荧光抗体检测方能看到荧光信号, 因而 步骤较多, 操作麻烦, 其优点是在信号较 弱或较小时可经抗原抗体反应扩大 直接用荧光素标记DNA的方法称为直接标记. 由于直接标记的探针杂交后可马上观察到荧光 信号, 省去了烦琐的免疫荧光反应, 不再需要购 买荧光抗 体, 也由于近年来荧光素的亮度和抗 淬灭性的不断改进和提高, 直接标记的荧光探 针越来越成为首选, 并采用多种不同颜色的荧 光, 方便在同一标本上同时检测多种异常. 其荧 光强度 和信号大小都易于在普通荧光显微镜下 观察, 使FISH过程变得简便而易于操作.
核型描述

首先列出染色体总数,然后是性染色体组成, 接着列出异常的染色体数目或形态。下列统一 的命名符号:
– – – – – – – – – A-G 染色体组的名称 1-22 染色体编号 X,Y 性染色体 del 缺失 der 结构重排的染色体 dup 重复 inv 倒位 t 易位 +/在染色体符号前表示染色体增加或减少,在 染色体符号后表示染色体多出或缺少一部分

染色体数目确定 染色体形态特征:
长度:绝对、相对 相对长度=每条染色体的长度/全套染色体长度 臂比=长臂/短臂
着丝点指数=短臂/(长+短臂)
随体的有无
分组排队原则

着丝粒类型相同,相对长度相近的分一组 同一组的按染色体长短顺序配对排列 各指数相同的染色体配为一对 可根据随体的有无进行配对 将染色体按长 短排队,短臂向上
染 色 体 超 螺 旋

家猪的Ag-NORs染色体联合

家猪的Ag-NORs染色体联合

—对照组
— —23 }上生 一-生‘一M .& 1.1 一 一1W 一3 .竺 一0 3I2 竺 一0L/ m 一一一一 l. f L4 7\ i6 4 1. 士08 7 7. 50 土17 4 -19 .
20 50 .
33 33 .
处{植 成- ; 埋二 素 组 理 I ‘ 二 丫于 一一
( P> 00) .50
N R联合而只注重Q O 和G 带的清晰程度, 随
机拍照了 10 Q 分带细胞和 25 G 分带 0个 一 6个 一 细胞。在这些细胞中观察到的 NO R联合频率 远比上述结果为高 ( 见表 3,平均达 1.3 ) 1 多。 1 同时发现, 关中黑猪中有一例 1 号同源染色体 0 间的 NO R联合, 有一例三条染色体( 两条 1号 0 和一条 8 间的 N R联合, 号) O 杜洛克和巴克夏
一种现象; N R染色体之间的 携带 O 联合是非随机的, 具有品种特征; A- O , 猪的 gN R 染色体 联合受某
些 药物 的影响, 具有可能 作为环境 监测的一个细胞遗传学 指标。
关键词:家猪染色体, 银染,一 Q分带, 一 G 分带,N R联合 O
对人类染色体银染的研究表明,携带银染
头耳根皮下埋植组成素 ( 一种幽体类性激素类
结 果 与 分 析 ( 一)由银染法观察到的 A - O , gN R 染色
体联合
试验分两次进行。厂 第一次选纯种猪 4 头, 0
其中杜洛克4 巴克夏9 关中黑 1头、 头、 头、 2 八
眉猪 1头b 第二次选长巴杂种育肥猪 1头, 5 1 每个个体观察约 5 个中期细胞,以核仁 0 分为处理与对照两个组。处理组 7 头,其中4 组织区之间银染物质连丝的有无为标准,计数
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交一张完整的猪核型图。
牛核型( 染色体端着丝粒) 牛核型( 染色体中着丝粒) 牛核型(Y染色体端着丝粒) 牛核型(Y染色体中,XX)
牛核型(原始图片,中着丝粒Y染色体) 牛核型(原始图片,中着丝粒Y染色体)
家猪染色体的分组
参照第一届国际家养动物分带核型标准化会 议提出家猪染色体核型分类标准,并根据染色 体的测量数值(染色体相对长度、臂比指数 染色体相对长度、臂比指数) 染色体相对长度 将猪的染色体分为A、B、C、D组,然后按照组 、 、 、 组 内染色体的相对长度由长到短的顺序依次递减 由长到短的顺序依次递减 排列,分别标记以1-18的标号,性染色体不编 号,以X和Y表示。
二、原理
核型是指染色体组在有丝分裂中期的 核型是指染色体组在有丝分裂中期的 表型,包括染色体的数目、大小、 表型,包括染色体的数目、大小、形态特 征等。 征等。 按照染色体的数目、 按照染色体的数目、大小和着丝粒位 臂比、次缢痕、随体等形态特征, 置、臂比、次缢痕、随体等形态特征,对 生物核内的染色体进行配对、分组、归类、 生物核内的染色体进行配对、分组、归类、 编号等分析过程称为染色体的核型分析 染色体的核型分析。 编号等分析过程称为染色体的核型分析。
猪核型( , 猪核型(38,XX )
核型分析的排列原则
1、将着丝粒 着丝粒排列在一条直线上; 着丝粒 2、将染色体长臂的最下端 染色体长臂的最下端排列在一条直线上; 染色体长臂的最下端 附注: 附注: 染色体进行排列时候,短臂在上,长臂在下; 短臂在上,长臂在下 短臂在上 臂比指数=长臂 短臂, 长臂/短臂 臂比指数 长臂 短臂 故臂比指数大于或等于1.
家猪染色体的特征
A组:第1-5号染色体,亚中 第 号 亚中着丝粒染色体(sm),其中第1 亚中 第 号染色体最长,最易识别。 号染色体最长 亚端着丝粒染色体(st),其形 B组:第6-7号染色体,亚端着丝粒染色体 号 亚端着丝粒染色体 态容易识别; C组:第8-12对染色体,为中着丝粒 中着丝粒染色体(M),其中, 中着丝粒 对染色体短臂靠着次缢痕; 第8、10对染色体短臂靠着次缢痕 、 对染色体短臂靠着次缢痕 D组:第13-18号染色体,为端着丝 端着丝粒染色体(T),其中 端着丝 号染色体的相对长度仅次于第1号而位列第二 第13号染色体的相对长度仅次于第 号而位列第二 号染色体的相对长度仅次于第 号而位列第二。 X染色体:为中着丝粒 中着丝粒染色体(M),其大小形态与第1号 中着丝粒 第 号 染色体近类似,属于C组; 染色体近类似 Y染色体:为整个染色体中最小的一个 为整个染色体中最小的一个,为中着丝粒 中着丝粒染色 为整个染色体中最小的一个 中着丝粒 体(M),属于C组;
三、实验步骤
1、每人一份家猪的染色体标本; 2、剪下染色体,参照模式图,进行分组、配对; 3、将染色体贴在实验报告上; 4、表明染色体组别及其性染色体,写明核型式并写 上标题; 注意事项: 注意事项 1、剪时要特别小心、仔细、认真; 2、贴得要整齐、美观、大方,不要东倒西歪。
四、实验报告(作业) 实验报告(作业)
实验五 家猪染色体核型分析
学 院: 动物科技学院 课程名称: 课程名称: 动物遗传学实验课 博士、 主 讲 人: 蓝贤勇 博士、副教授 博士、 陈 宏 博士、教授 博士、 雷初朝 博士、教授
一、实验目的
通过家猪染色体核型分析,了解 染色体的特征及其进行分组的方法和 染色体的特征 分组的方法和 技术,为今后研究分析家畜染色体核 分析家畜染色体核 技术 型奠定基础。
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