Catalyst入门教程

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药物开发软件Catalyst及其在计算机辅助药物设计中的应用

2011年3月第25卷第1期总83期北京联合大学学报（自然科学版）Journal of Beijing Union University （Natural Sciences ）Mar.2011Vol.25No.1Sum No.83［收稿日期］2010－11－07［作者简介］化玮（1990—），男，北京市人，北京联合大学应用科技学院学生，研究方向为电子信息工程。

［通讯作者］杜丽娜（1977—），女，山东济南人，北京放射医学研究所副研究员，博士，研究方向为新药开发。

药物开发软件Catalyst 及其在计算机辅助药物设计中的应用化玮1，杜丽娜2（1.北京联合大学应用科技学院，北京100101；2.北京放射医学研究所，北京100085）［摘要］计算机辅助药物设计（CADD ）是一门多学科交叉的边缘学科，在新药研发，特别是在先导化合物的发现和优化过程中发挥着越来越重要的作用。

Catalyst 是一种基于药效团模型的综合性药物开发软件。

本文着重介绍了Catalyst 软件的基本功能及其在新药筛选中的应用。

［关键词］Catalyst 软件；药效团；计算机辅助药物设计［中图分类号］R 918－39［文献标志码］A［文章编号］1005-0310（2011）01-0028-06Pharmacophore Modeling Software-Catalyst and its RecentApplications in Computer Aided Drug DesignHUA Wei 1，DU Li-na 2（1.College of Applied Science and Technology of Beijing Union University ，Beijing100101，China ；2.Beijing Institute of Radiation Medicine ，Beijing100085，China ）Abstract ：Computer-aided drug design （CADD ）is a frontier science involving more than one subject and playing a more and more important role during new drug research and development ，especially in the discovery and opti-mization of leading compounds.The Catalyst software is a comprehensive solution for pharmacophore modeling and 3D database management.Its basic functions and applications in drug research are mainly described.Key words ：catalyst ；pharmacophore modeling ；computer aided drug design0引言在与疾病作斗争的过程中，人类需要新的药物。

化学反应速率(无机化学核心教程)

化学反应速率
Rate of chemical reaction
作业：PP55 1，3，4，9，13
CO(g) + NO(g) == CO2(g) + 1/2 N2(g) Kθp=1.9×1060 >> 500 (298K)
常温下，此反应基本上不能进行，为什么？
CO(g) + NO(g)
3 2 1
时间变化
反应物浓度减少
生成物浓度增加
想一想：化学反应速度与普通物体的移动速度有些什么相同的地方？
全程平均速度某一点的瞬时速度
二、化学反应的平均速率和瞬时速度
平均速率瞬时速率
△c（反应物） =－ △t
dc（反应物） = －
dt
IH2O2(aq) === H2O(l) + 1/2O2(g)
E
E1 A+B+C
(1)
(2) [AC]+B
C A+B AB
[AB]+C
练习题
√1、如果催化剂能使正增加三倍，
那么必然也能使逆增加三倍。
×2、加入催化剂能使平衡常数增大。
×3、催化剂能使非自发反应变成自发反应。
三、生物催化剂——酶
酶
底物
产物（脂肪、淀粉）
特点
选择性特别高须适当的pH、T 催化效率特别高
2.50
0
0
1.00min 2.50－2x 4x
x
c0= 2.50/5.00 = 0.500(mol/L)
lnc = - kt + lnc0
0.5mol/L
1.68x10-2s-1 60 s
N2O5的剩余浓度：c = 0.182(mol/L) ∴ N2O5的剩余量 = 0.182×5.00 = 0.910(mol) ∵ 2.50 － 2x = 0.910 ∴ x = 0.795 (mol)

索尼 catalyst edit 2022 用户手册说明书

修订日期：2022年5月19日XDCAM、XDCAM EX、XAVC、XAVC S、NXCAM、SxS和Professional Disc是Sony Corporation 的商标。

Avid和DNxHD是Avid Technology,Inc.或其子公司在美国和/或其他国家/地区的商标或注册商标。

所有其他商标或注册商标是其在美国和其他国家和地区的各自所有者的财产。

有关详细信息，请参阅https:///licensenotices本文件中，Sony Corporation可能拥有专利、专利申请、商标、版权或其他知识产权，涵盖不同的主题。

除在Sony Corporation的书面许可协议中明确提供，提供本文件并不能作为对这些专利、专利申请、商标、版权或其他知识产权的许可授权。

Sony Creative Software Inc.1S.Pinckney St.Suite520Madison,WI53703USA本手册中所含信息如有变更，恕不另行通知，并且它不代表任何形式的Sony Creative Software Inc.的保证或承诺。

所有的与本手册内容相关的更新和附加信息都公布在Sony Creative Software Inc.网站上，地址为https://。

本软件是根据最终用户许可协议和软件隐私政策提供给您使用的，并且使用和/或复制必须遵守以上协议。

除非在最终用户许可协议中明确描述，否则严格禁止复制或分发本软件。

除非获得Sony Creative Software Inc.的明确书面同意，本手册中的任何部分都不得被再生产或者以任何形式或目的的传播。

目录目录3简介7 Catalyst Edit窗口7使用项目9创建项目9打开项目9重新链接项目媒体10保存项目10使用时间线调析器11共享项目15渲染项目16导出项目17导出项目：支持的功能18查找媒体21支持的视频阅读格式24添加媒体并创建剪辑46播放媒体51预览视频51导航时间线58设置播放的入点和出点标记60音轨编辑61为项目添加音轨61删除音轨62移动音轨62目录3创建画中画效果63调整音轨控件67使用音轨调析器71调整时间线设置76剪辑编辑79编辑工具79选择剪辑和放置光标81移动剪辑82修剪剪辑85流编辑(L-J片段)89分割剪辑91滑动剪辑91裁切剪辑93剪切、复制并粘贴剪辑96删除剪辑97波纹编辑97剪辑贴靠98按帧量化99使用标记101嵌套时间线102剪辑淡化104剪辑音量自动调节105替换剪辑的媒体109撤消和重做编辑操作110使用剪辑调析器110应用效果115使用视频效果1154目录使用视频生成器121添加标题剪辑121添加纯色剪辑125添加色彩渐变剪辑126使用视频过渡129创建画中画效果130使用关键帧为视频创建动画效果参数134处理音频137音频音量和平移137处理多通道音频138监视音频音量146音轨计量表146编辑Catalyst Edit选项149键盘快捷方式151手势161索引163目录56目录简介Catalyst Edit 是用于4K 、RAW 和HD 视频的专用快速剪切工具。

CATALYST教程1

目录Catalyst介绍 (2)Catalyst操作界面 (3)Catalyst示例 (4)一、选择并导入已定义好的PSD设计文件 (4)二、按钮转换 (7)三、输入框转换 (10)四、列表....................................................................................................错误!未定义书签。

五、滚动条................................................................................................错误!未定义书签。

六、控件事件............................................................................................错误!未定义书签。

七、状态转换效果....................................................................................错误!未定义书签。

八、音频....................................................................................................错误!未定义书签。

九、播放视频............................................................................................错误!未定义书签。

十、导入SWF文件 ..................................................................................错误!未定义书签。

交换机配置

交换机配置方法网络交换机的详细配置方法(图文教程)交换机本地配置谈起交换机本地配置，首先我们来看一下交换机的物理连接。

交换机的本地配置方式是通过计算机与交换机的“Console”端口直接连接的方式进行通信的。

计算机与交换机的“Console”端口连接网管型交换机一般都有“Console”端口，用于进行交换机配置。

物理连接完成后就要进行交换机软件配置，下面以思科“Catalyst 1900”为例来说明如何进行交换机软件配置：第1步：单击“开始”按钮，在“程序”菜单的“附件”选项中单击“超级终端”，弹出如图所示界面。

第2步：双击“Hypertrm”图标，弹出如图所示对话框。

这个对话框是用来对立一个新的超级终端连接项。

第3步：在“名称”文本框中键入需新建超的级终端连接项名称，这主要是为了便于识别，没有什么特殊要求，我们这里键入“Cisco”，如果您想为这个连接项选择一个自己喜欢的图标的话，您也可以在下图的图标栏中选择一个，然后单击“确定”按钮，弹出如图所示的对话框。

第4步：在“连接时使用”下拉列表框中选择与交换机相连的计算机的串口。

单击“确定”按钮，弹出如图所示的对话框。

第5步：在“波特率”下拉列表框中选择“9600”，因为这是串口的最高通信速率，其他各选项统统采用默认值。

单击“确定”按钮，如果通信正常的话就会出现类似于如下所示的主配置界面，并会在这个窗口中就会显示交换机的初始配置情况。

Catalyst 1900 Management ConsoleCopyright (c) Cisco Systems，Inc。

Standard Edition SoftwareEthernet address：00-E0-1E-7E-B4-40PCA Number：73-2239-01PCA Serial Number：SAD01200001Model Number：WS-C1924-ASystem Serial Number：FAA01200001User Interface Menu[M] Menus//主配置菜单[I] IP Configuration//IP地址等配置[P] Console Password //控制密码配置Enter Selection：//在此输入要选择项的快捷字母，然后按回车键确认至此就正式进入了交换机配置界面了，下面的工作就可以正式配置交换机了。

ChemDraw教程(很全)

单瓣型轨道
dz2-轨道
s-轨道杂化轨道
p-轨道
s-轨道的绘制
选择轨道
定位原子
点击或向外按动
单瓣型轨道的绘制
选择轨道
定位原子
点击或向外按动
p-轨道及杂化轨道的绘制
选择轨道
定位原子
点击或向外按动
环正、负电荷
5.2 化学符号孤对电子
H-点
一般正、负电荷
H-划自由基阴、阳离子
H-点：表示沿Z轴向平面外伸出的氢 H-划：表示沿Z轴向平面里进入的氢
四、Fischer葡萄糖结构图建立与五连键垂直的水平键
四、Fischer葡萄糖结构图在原子上定位建立标记
五、透视图形
CH2OH
O OH
OH
OH
OH
五、透视图形
旋转指示箭头
选择环己烷
旋转环己烷
在原子上定位建立标记
五、透视图形
按Alt键，任意键长
添加垂直键
五、透视图形
选择套索工具，阴影右下脚按Shift键
一、反应方程式依次输入文本信息
一、反应方程式选择阴影框
将反应方程式全部罩上
二、绘制中间体结构
O OH
二、绘制中间体结构选择环己烷以建立六员环模型
选择橡皮，擦去六员环一部
二、绘制中间体结构
选择单键定位
连续单击生成新的单键单击单键中央，生成双键
二、绘制中间体结构在原子上定位建立标记
ChemDraw 起始界面
常用术语
点位：移动鼠标直到鼠标的光标放到所要进行操作的位置，如果选择的位置在图形结构中的键、原子、线等的上面，一般出现黑方块，称之为光标块，选择块或操作块。

CATalyst 3.0 安装手册

您不得使用任何工具或任何方式对本软件产品进行反向工程，反向编译。

未经广州广电运通金融电子股份有限公司许可，您不得以任何目的和方式发布本软件产品及任何相关资料的部分或全部，否则您将受到严厉的民事和刑事制裁，并在法律允许的范围内受到最大可能的民事起诉。

目录目录1. 产品说明 (1)1.1.产品更新说明 (1)1.2.产品部件列表 (1)2. 安装前准备 (2)3. 安装 (3)3.1.安装说明 (3)3.2.系统配置 (10)3.3.启动和关闭 (18)3.4.系统安装测试 (19)4. 卸载 (20)5. 产品升级 (21)5.1.实现步骤 (21)5.2.条件限制 (21)6. 服务支持 (23)前言前言非常感谢您选用广州广电运通金融电子股份有限公司的CAT alyst 3.0 ，为了便于您的操作，请仔细阅读本产品的相关手册。

CAT alyst 3.0 说明书包括以下三本手册：●《CAT alyst 3.0 用户使用手册》描述了CAT alyst 3.0 所提供的功能、特性说明和更新说明；详细描述了系统的使用方法，如：使用前准备，系统结构，系统包括的各种开发、调试工具以及各种工具的具体功能使用方法等。

预期读者：系统管理员、用户●《CAT alyst 3.0 安装手册》描述了CAT alyst 3.0 所提供的功能、特性说明、产品部件明细和更新说明；详细描述系统安装、卸载及升级的操作流程，如：安装前准备、软件安装、系统配置、软件卸载、软件的启动和关闭等。

预期读者：工程人员、系统管理员●《CAT alyst 3.0 维护手册》描述了CAT alyst 3.0 所提供的功能、特性说明和更新说明；列举了系统常见问题及解决方法和出错处理。

预期读者：维护人员、系统管理员文档约定文档约定本手册使用以下约定，以区分手册中其它部分。

Rosetta Stone Catalyst 用户指南说明书

Welcome to Rosetta Stone CatalystThe Rosetta Stone Catalyst solution has a language proficiency assessment tool that places you in the correct program based on your goals questionnaire andplacement test answers. Once you’ve completed your registration and onboarding, you’ll be placed at the appropriate level in Foundations or Fluency Builder.Set Up Your ProfileAs a new user, you should have received a welcome email from Rosetta Stone. Click the “Start Now” button as seen below.1You will now have the option to choose a password, native language, voice type, and time zone. Make sure to agree to the T erms of Use and Privacy Policy by checking the box at the bottom left.Click “Agree and Continue”32Rosetta Stone ®Catalyst ®Getting Started GuideRosetta Stone Catalyst QuestionnaireNow that you have defined your basic preferences, it’s time to determine your language goals through a 5-minute questionnaire. Click “Start” to begin.2You will now be asked a series of questions about the length of time you have studied your chosen language, how you previously learned that language (if applicable), and the goals you would like to achieve through this learning program. Please answer all questions as honestly as you can.1Once you have answered all of the questions in this questionnaire, you will have the opportunity to take a self-assessment or a placement test, depending on your language of study. These assessments will place you at the appropriate level in your language program.3Rosetta Stone Catalyst Placement TestOnce you have taken the questionnaire, it will be time to determine what level within the product best fits your language needs. See your chosen language below to determine how this will take place:English, Spanish, French, or GermanIf you have chosen to learn English, Spanish, French, or German, you will now take a placement test that will assign you to a level that is best for you. The test should take between 30-45 minutes to complete. Click “Start” to begin.1You will answer multiple choice questions in an untimed environment. T ry your best to answer the questions without consulting reference materials.Be sure to turn your sound up, as some items will require you to listen to a question and/or response.23English, Spanish, French, or German (c o n t i n u e d)W hen the test is complete, you will see your score, CEFR level (CommonEuropean Framework of Reference), and a description of your general language abilities at that level. T o enter your new product, simply click “Start Learning.”4Note: The CEFR levels are:A1Low BeginnerA2High BeginnerB1Intermediate,B2Higher IntermediateC1Advanced Chinese, Italian, or DutchIf you have chosen to learn Chinese, Italian, or Dutch, you will now take partin a self-assessment that will place you in a product and level that is best for you.The assessment should take about 10 minutes to complete.Click “Start” to beginY ou will now be asked a series of questions relating to your comfort and skill levelwith your chosen language. Please answer these questions as accurately as possible. 21Chinese, Italian, or Dutch (c o n t i n u e d)W hen you have completely answered all self-assessment questions, you will be given a CEFR level based on your results. Click “Start Learning.”3Additional LanguagesIf you have chosen to learn a language that is not English, Spanish, French, German, Chinese, Italian, or Dutch, you will automatically be placed intoRosetta Stone Foundations. Simply click on “Foundations”to get started!Rosetta Stone Catalyst DashboardAfter completing the questionnaire and assessment, you’ll see an option to “Choose your Product.”What mobile application should I use?After you have been placed into a Rosetta Stone program, youwill be presented with an option to have the mobile application information for your program sent to your email.Future Sign In1. Navigate to your organization’s launch padhttps://2. Enter your username and password3. Click “Sign In”4. Click on your program to open your accountBest PracticesDon’t forget to use a USB headset. This is important while completing lessons and especially while attending Live T utoring sessions. The correct headset will ensure that you get the best feedback on your speaking skills.Practice a little bit every day to keep everything you’re learning fresh in your mind! We recommend that you practice in the program for 30 minutes, 3-5 times per week.Schedule practice time on your calendar. This will help you remember to get those 30 minutes in, and ensure that learning with Rosetta Stone becomes a part of your daily routine.Find a language partner in your organization or in your community. Learn and practice your new vocabulary together.Immerse yourself in your new language. Look for opportunities to practice your language skills outside of the program. This could be reading news and articles, listening to music, or watching movies in your new language. Full immersion is the key!System RequirementsIn order to get your language learning experience off to a strong start, it is important to ensure that your computer meets the Rosetta Stone ® system requirements.You can find system requirements listed on our support portal by clicking the link below:Having a problem?Call, click, or chat to get answers to your questions:**************************** 877-223-9848System Requirements。

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第1节第2节
搭建 CATALYST 开发环境...................................................................................................................3 创建第一个 CATALYST 项目...............................................................................................................4
3 模块打包方法(推荐) Chris Laco 把 Catalyst 相关的模块打成了一个包:/downloads/CatInABox.tar.gz 把该包下载下来不需要安装即可马上使用.可用于 windows 跟 linux 系统.
前言
本教程是在 CPAN 上 Catalyst 的文档基础上编写的. 阅读本教程前你需要具备的知识： 1. 使用过 perl 编写 cgi 程序 2. 使用过 perl 的 DBI 编写 perl 程序进行数据库操作
Catalyst 入门教程(第 1 版)
编写者: 小生菜菜联系邮箱: laomoi@
第1章
Catalyst 的简介
使用 perl 进行 web 开发,传统的做法是写*.cgi 文件,然后把这些 cgi 文件配到 web server 里面,当 web server 收到客户端的 request 时,就调用对应的 cgi 进行处理. 用这种方法进行 web 开发, cgi 文件之间相对比较独立,代码里面可能含有大量的重复代码,整个系统的结构也是比较松散的, 可扩展性也不强.
我们来看一下这些目录结构以及这些文件的含义:
X/
项目文件夹
X/x.yml
项目的配置文件,Catalyst 的插件 ConfigLoader 会使用该文件
X/t
test 文件夹,放置项目的各种测试脚本
X/script
辅助脚本文件夹,放置 catalyst 为项目准备的辅助脚本,开发时才会用到
第5页
Catalyst 入门教程(第 1 版)
第3页
Catalyst 入门教程(第 1 版)
第2节创建第一个 Catalyst 项目
给我们第一个项目起名为 X, 那么如下使用 Catalyst 创建我们的项目:
perl catalyst.pl X
如果这条命令出错了,那么可能是你的 Catalyst 没有安装好,请参考第一节把 Catalyst 装好. 键入命令后, catalyst.pl 会帮你创建如下文件:
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Catalyst 入门教程(第 1 版)
created "X\t/02pod.t" created "X\t/03podcoverage.t" created "X\root\static\images\catalyst_logo.png" created "X\root\static\images\btn_120x50_built.png" created "X\root\static\images\btn_120x50_built_shadow.png" created "X\root\static\images\btn_120x50_powered.png" created "X\root\static\images\btn_120x50_powered_shadow.png" created "X\root\static\images\btn_88x31_built.png" created "X\root\static\images\btn_88x31_built_shadow.png" created "X\root\static\images\btn_88x31_powered.png" created "X\root\static\images\btn_88x31_powered_shadow.png" created "X\root\favicon.ico" created "X/Makefile.PL" created "X\script/x_cgi.pl" created "X\script/x_fastcgi.pl" created "X\script/x_server.pl" created "X\script/x_test.pl" created "X\script/x_create.pl"
第 6 章调试 CATALYST 程序.......................................................................................................................62
第2页
Catalyst 入门教程(第 1 版)
第1节第2节第3节
简介 ..................................................................................................................................................29 TT 入门 ............................................................................................................................................32 把 TT 作为 VIEW 使用.....................................................................................................................40
在 windows 上安装可以使用 ppm,但是过程比较繁琐,不建议.
2 安装脚本 Matt Trout 写了一个安装脚本: /static/cat-install 只需要从该链接下载脚本,然后 perl cat-install 即可按顺序安装相关模块,可用于 windows 跟 linux, 如果用于 windows 的话,必须保证你的机器上有 c 编译器和 make 工具.
第 2 章剖析应用程序类 ...................................................................................................................................8
第 3 章掌握 CONTROLLER ........................................................................................................................10
第 5 章掌握 MODEL......................................................................................................................................43
第 4 章掌握 VIEW..........................................................................................................................................29
Catalyst 是一套用来 web 开发的框架,基于 Catalyst 开发的 web 系统,具有比较强的可扩展性.
第1节搭建 Catalyst 开发环境
1 一般方法: 在 linux 系统上安装 Catalyst 只需要使用 CPAN 安装即可(推荐)
cpan -i Catalyst cpan -i Catalyst::Devel(用来运行 Catalyst 项目的机器不需要安装该模块,如果需要使用 Catalyst 进行开发则需要安装该模块)
第1页
目录
Catalyst 入门教程(第 1 版)
第 1 章 CATALYST 的简介 ..............................................................................................................................3
created "X" created "X\script" created "X\lib" created "X\root" created "X\root\static" created "X\root\static\images" created "X\t" created "X\lib\X" created "X\lib\X\Model" created "X\lib\X\View" created "X\lib\X\Controller" created "X\x.yml" created "X\lib\X.pm" created "X\lib\X\Controller\Root.pm" created "X/README" created "X/Changes" created " 文件夹,一般放置项目的静态文件,模板文件等