AKTApurifier方法编辑窗口 on-siter training SOP II
AKTA Purifier中文操作手册
GE Healthcare实施您ÄKTApurifier的首次运行重要用户信息所有用户必须阅读整本手册以充分理解ÄKTApurifier的使用安全。
WARNING（警告）警告标识强调必须严格遵循指令以避免人身伤害。
在说明书完全弄懂和所有规定条件都具备后才能开始动手操作。
Caution（小心）小心标识用于引起注意以避免人身伤害，必须遵循指令和条件以避免毁坏产品和其它设备。
在说明书完全弄懂和所有规定条件都具备后才能开始动手操作。
Note（注意）注意标识用于指出对产品的无故障及最佳使用的重要信息。
CE证书产品符合适用于CE规定的所有要求。
相应合格证的复印件函索即寄。
CE标志和相应合格证对该仪器是有效的。
当仪器– 连接到其它标有CE标志的 GE Healthcare 仪器上，或，– 连接到本手册中推荐或所述的其它仪器上, 和，– 除了在本手册中提到的变更外，按 GE Healthcare 所提供的说明使用。
警告本产品为A类产品。
在局部环境下，本产品可能引起无线电干扰，在此情况下用户可能需要进行适当的测量。
销售条款和规定除非另有书面协议，在 GE Healthcare 集团供应范围内，所有售出货物和服务都服从公司的销售条款和规定。
这些销售条款和规定的复印件函索即寄。
如果您对本产品有任何意见，我们将乐意接受。
请寄往：GE HealthcareSE-751 84 UppsalaSweden商标水滴图样, ÄKTA, ÄKTApurifier, UNICORN and Superloop 均为 GE Healthcare 的商标。
Amersham 和 Amersham Biosciences 为 GE Healthcare 的商标。
.Windows为Microsoft Corporation 的注册商标。
办事处地址GE HealthcareSE-751 84 UppsalaSwedenGE Healthcare 香港办事处香港九龙望角亚皆老街8号朗豪坊办公大楼12楼电话：（852）2100 6314传真：（852）2100 6338GE Healthcare 北京办事处北京市经济开发区永昌北路1号电话：（010）5806 9689传真：（010）6787 1162邮编： 100176GE Healthcare 上海办事处上海市虹桥开发区兴义路8号万都中心2401室电话：（021）5257 4650－67337传真：（021）5208 1282邮编： 200336GE Healthcare 广州办事处广州市建设六马路33号宜安广场1212室电话：（020）8363 3828－67961，67956 传真：（021）8363 3291邮编： 510060800热线：800－810－9118© GE Healthcare Life Sciences 2003版权- 所有权利受保护目录1关于本指南 (5)1．1 必要条件 (5)1．2 印刷上的规定 (5)2系统和软件 (6)2．1 概论 (6)2．2 UNICORN综述 (9)2．3 帮助 (11)3 建立方法 (12)4准备运行系统 (15)4．1 系统连接 (15)4．2 系统的一般准备 (16)4．2．1充满入口管道 (17)4．2．2 充满样品环 (17)5开始运行 (18)6查看运行 (23)7查看和打印结果 (26)7．1 查看 (26)7．2 打印和生成报告 (29)8缓冲液制备 (32)9探索 (34)10进一步应用 (36)索引（略）简短说明 (38)注意：本手册所涉及内容以英文原版为准1关于本指南本指南是为不熟悉UNICORN™ 软件和ÄKTApurifier™的用户而写的。
skia库编译
skia库编译
要编译Skia库，您可以按照以下步骤进行操作：
1. 获取Skia源码：您可以从Skia的官方网站或GitHub仓库获取最新的源码。
确保下载适用于您所需的平台和编译目标的正确版本。
2. 配置编译选项：在开始编译之前，您需要配置Skia的编译选项。
这包括选择要构建的模块和功能，设置编译器标志等。
在Skia
的源码根目录下，有一个名为“tools”的目录，其中包含一个名为“skia_builder.sh”的脚本文件，您可以使用该脚本进行配置。
3. 执行编译：配置完成后，您可以执行编译过程。
在Skia的源码根目录下，运行以下命令：
```arduino
make
```
这将编译Skia的所有模块和功能，并生成相应的库文件和可执行文件。
4. 安装Skia：编译完成后，您可以选择将Skia安装到指定的目录中。
在Skia的源码根目录下，运行以下命令：
```bash
make install
```
这将把Skia的库文件和可执行文件复制到您指定的安装目录中。
5. 使用Skia：完成安装后，您可以在您的应用程序中链接和使用
Skia库。
根据您的平台和开发环境，您可能需要配置链接器以找到Skia 库文件和相关依赖项。
请注意，上述步骤仅为概述，具体的编译过程可能因平台、编译器和配置选项而有所不同。
您可能需要根据您的具体情况进行适当的调整和修改。
此外，Skia的官方文档和社区资源也是很好的参考和学习资源，可以帮助您更好地理解和使用Skia库。
AKTAPurifier使用学习教程
每月清洗（Monthly cleaning） 必须每月按时清洗系统或在遇到问题时清洗系统（如色普峰出现重影）： 用1M NaOH ，执行SystemWash指令. 之后立即用水将NaOH冲洗干净.
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系统移动（Moving the system）
移动系统时小心谨慎，拆下外围的部件和管 道，并防止剧烈震动，
10ml系统
100ml系统
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维护－每六个月
Monitor UV-900
• 清洗UV流通池，如果样品很脏则须更频繁的清洗.
Monitor pH/C-900
•检查和校正pH计 （pH计在不使用时必须保存在下述溶液中： 1:1 mixture of pH 4 buffer and 2 M KNO3或pH4.0的饱和KCl溶液 中）
二、层析原理
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20%乙醇流速减半。
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仪器使用（5）
进样： 1、用注射器洗进样环，特别是入口处容易残留上次进样样品，需要特别注意。 2、进样时保证进样阀处于load位置。 3、注射器吸取样品时，尽量避免气泡，少量微小气泡关系不大。 4、进样体积大于定量环体积，否则容易进气泡。
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仪器使用（6）
泵冲洗液（Pump rinsing solution）：
AKTA avant操作步骤
AKTA avant操作步骤1 实验前准备过膜的超纯水过膜的20%乙醇过膜的0.5M NaOH过膜的样品剪好的1.5mL EP管1mL、2mL、5mL注射器2 多肽的纯化2.1开机打开仪器开关；打开电脑，等待几分钟后，仪器界面显示Ready；打开软件，avant1的密码：defaultss，avant2、3、4的密码：default；在System control模块中点击，弹出Connect to System对话框，default前勾选，点OK，仪器和电脑联机2.2内置收集器的准备注：齿轮条码向外放置（System control模块→View→ Fraction collector content）2.3水洗泵和管路将入口管A1和B1浸入超纯水中→System control模块→Manual→弹出Manual instructions → Pump and pressure→ Pump wash→ Inlet A：A1；Inlet B：B1；Buffer Pro/Q inlet：off；Sample inlet：off(此处无需特别去设置) → Insert→ Execute→置换管路中的20%乙醇→水洗平衡10min（没有固定时间，基本上冲到UV_280和cond线平衡了，就可以停止了）后，手动停止；水洗了之后，还要再用B液洗去B管路中的水，因此将入口管B1浸入B液中→System control模块→Manual→弹出Manual instructions → Pump and pressure→ Pump wash→ Inlet B：B1；→ Insert→ Execute→置换管路中的水→平衡到UV_280和cond线平衡，手动停止。
注意，凝胶柱只需要一种缓冲液，B管路就不需要管，不需要水洗，不需要缓冲液洗，只洗A管路。
2.4 手动上样将2mL上样环与loop E和loop F相连；采用注射器与鲁尔接口相连，大于2mL超纯水（体积至少大于上样环两倍体积）清洗上样环（注：水中不可有气泡）；将排除气泡的样品用注射器注入上样环中（注：注射器不可拔出，不可有气泡）；2.5 层析柱的准备与连接（这步习惯称为五个参数！）System control模块→Manual→ Manual instructions→Alarms→ Alarm pre-pressure：5.0 MPa→ Insert→Alarms→ Alarm delta-pressure：1.8 MPa→ Insert→Pump and pressure → system flow：1mL/min→ Insert→Flow path→ Column position→ Position：position 3.→ Insert→Flow path→ Inlet A→ Position：A→ Insert→ Execute连接柱子：待管路中气泡排出→A口与柱子上端连接→水从柱子下端流出后，与排气泡后的B口相连）2.6 编辑方法Method Editor模块→File→ New Method→弹出New Method界面→Predefined Method→Gel Filtration（凝胶层析）→OKMethod settings → Column type: Superdex Peptide 10/300GL→ Column position: Position 3→Flow rate：1mL/min→ UV：220 nm（蛋白吸收峰是280nm，多肽不一样？）Equilibration（层析柱）→ Flow rate: 1mL/min → Equilibrate until：the total volume is 2 CVSample Application（上样）→ Flow rate: 1mL/min →Inject sample from loop→ Fill loop using: Manual load→ Loop type: Capillary loop→ Empty loop with: 4 mL→Fractionate→ in waste (do not collect)（第一次纯化的话，最好都收集）Column Wash（去除结合的非特异性肽）→ Wash until the total volume is 2 CV→Fractionate→ in waste (do not collect) Elution（目标物）→ Flow rate：1mL/min →Gradient elution→Linear→Target B 100%→length：2 CV （洗脱两倍柱体积可能有点少。
AKTApurifier手动命令介绍
Watch功能一般在自动编程方法中应用。
Watch电导曲线功能，Delta_Peak为根据峰顶 的差额来区分不同峰的参数。Delta_Base为 根据平均峰高来区分不同峰的参数。
Watch功能一般在自动编程方法中应用。
Alarms&Mon
Watch浓度曲线功能，Delta_Peak为根据峰顶 的差额来区分不同峰的参数。Delta_Base为 根据平均峰高来区分不同峰的参数。
Frac
进行峰收集的曲线来源，UV为紫外， AD900为检测糖类的一个信号转换。
进行紫外曲线峰收集的参数设定，可以根 据紫外水平或者斜率来设定。
24 / GE Title or job number /
2020/3/15
Frac
进行AD900曲线峰收集的参数设定，只可 以根据AD900水平来设定。
Pump
系统泵流速压力控制模式的调节参数。一 般情况不进行改变。
样品泵流速压力控制模式：在此模式下，当样 品泵压力达到设定的压力上限时系统会自动调 节流速，从而降低压力；若达到设定最低流速 时还超过设定压力，系统报警，停止。
Pump
AKTAexplorer系统泵清洗命令。其中A1进 口有八个通道，请确认A1入口的阀门位置 。
Watch功能一般在自动编程方法中应用。
Watch PH曲线功能，Delta_Peak为根据峰顶 的差额来区分不同峰的参数。Delta_Base为 根据平均峰高来区分不同峰的参数。
Watch功能一般在自动编程方法中应用。
Alarms&Mon
Watch压力曲线功能，Delta_Peak为根据峰顶 Watch功能一般在自动编程方法中应用。 的差额来区分不同峰的参数。Delta_Base为 根据平均峰高来区分不同峰的参数。
蛋白纯化AKTA操作说明#(优选.)
AKTA pure操作说明分子筛层析操作步骤：1. 开机：打开AKTA pure开关，看指示灯，泵同步（泵内有注入液体的声音）。
2. 打开系统：打开电脑：双击Unicorn 7.0打开系统，进入log on 界面，用户名默认为Default，输入密码：default，点ok键，出现提示对话框，继续点确定，进入系统。
注意：进入系统时会弹出三个界面：System Control界面，Evaluation界面和Administration界面。
其中system Control界面为主操作窗口，所有的设置选项都是在该界面下完成：Manual---Execute Manual instructions---......；Evaluation界面为结果数据查看及处理窗口；Administration界面为Unicorn 7.0系统设置界面。
3. 洗泵：把A1泵头从20%乙醇中取出，用去离子水冲洗，放入分子筛缓冲液中，在SystemControl界面下，点击manual---Execute Manual instructions---Pumps---Pump A wash---点开inlet，选择A1---Excuse。
4. 设置系统参数：设柱压：Alams---alam systerm pressure---high alam---设置柱压---Execute；设流速：Pumps---System flow ---设置system flow（1mL/min）---Execute。
注意：流速和柱压设置参照“GE蛋白纯化柱表”，不要超出最高限制。
5. 装柱子(先上后下)：接柱子的上面：拧下连接进样阀和检测器之间的线，等进样阀出口有液体流出时，拧开柱上面线头的螺帽，将它连到进样阀出口；接柱子的下面：去掉柱下端连接的注射器，连上接头，连上一段线，待液体滴出滴出液体滴到检测器上的连接口的洞里，滴满，将接头连到检测器的连接口里。
AKTA全自动层析仪(AKTA Purifier)操作规程
AKTA全自动层析仪（AKTA Purifier）操作规程1.开机打开主机和电脑电源，待仪器自检完毕（CU950上面的3个指示灯完全点亮不闪烁），双击桌面上UNICORN图标，进入操作界面。
2.准备流动相和样品所有的工作溶液和样品必须经过0.45 um的滤膜过滤，样品也可高速离心后取上清备用。
当缓冲液中含有有机溶剂（如乙腈，甲醇），需在使用前用低频超声唾弃10 min。
3.清洗管道及装柱3.1首先将A1管道放入平衡液或banding buffer中，将B1管道放入高盐溶液中或elutionbuffer中，再system control窗口点击manual → pump → pump wash basic，选中A1，B1管道为ON，点击execute。
泵清洗程序会自动运行至结束。
3.2选择manual → pump → flow rate，输入流速为1 mL/min，点击insert；选择manual →alarm＆mon → alarm pressure，设置high alarm（输入填料的耐受压力，可在填料说明书中查到），点击insert，点击execute。
将进样阀的1号位管道接入柱子的柱头（用几滴管道中流出的液体润湿，防止空气进入），稍微拧紧后将柱子下端的堵头卸掉，直接拧入紫外流动池或连接管道（可用柱子中流出的液体润湿接头，防止空气进入）。
4.手动运行4.1平衡柱子平衡好了（观察电导COND及pH的数值曲线走稳了），此时将紫外调零：选择manual → alarm＆mon → autozero，点击execute，就准备上样了。
4.2上样4.2.1用样品环上样：将样品吸进注射器，推掉气泡，从进样阀的3号位推入（进样量不得低于样品环的体积的2倍），不要取下注射器，选择manual →flowpath → injectionValve → inject，点击execute。
4.2.2用样品泵上样（AKTA explorer系统）：将样品置于Sample Valve 1号位（可以选8个不同的位置），点击manual → pump → Direct Load_960输入进样流速和体积，点击execute。
（完整word版）freesurfer使用教程
（完整word版）freesurfer使用教程freesurferfreesurfer 是一个处理大脑3D 结构像数据，进行自动皮层和皮下核团分割的工具，用起来非常方便。
freesurfer wiki 上的教程也非常详细，但是有一点，freesurfer 的命令很复杂，很难准确地记住每个参数该怎么设置。
本人比较懒，不愿记，也记不住，每次都需要打开wiki 进行对照。
由于wiki 非常详尽，每次都是在一大篇英文中搜索命令。
在这里弄一个简洁版，只把分析流程所用到的命令贴在这里，以便查阅。
一、数据处理freesurfer分析3D,最好是原始的dem数据，不要进行数据转格式转换和坐标变化，原始数据就可以。
所以把数据放在sub1,sub2,sub3 ??…这样我们就可以用循环来做了。
我们的计算机中心用的是PBS的系统，进行并行运算：#！/bin/bash# SUBJECTS_DIR is where you want to put your resultSUBJECTS_DIR=your_subjeets_pathimge='ls your_subjects_path/sub1/*.IMA|head -n 1'reeon-all -s sub1 -i ${imge}recon-all -all -s $sub1这就是分析一个被试的代码, 然后用前面介绍过的sed 命令,把sub1 替换成其他被试编号, 就生成了其他被试代码。
然后在端口敲入命令：sh 代码文件。
数据就开始分析了。
二、数据检查数据检查主要tkregister2 、tkmedit 、tksurfer 三个命令结合起来。
但是在这种视觉检查以前, 应该先看前面recon-all.log 文件是否报错。
可是recon- all.log 文件好大了, 怎么办呢, 用grep 命令，查找一下文件里面有没有"error并输出含有“ error的行数：grep -n “ error ” re-aclol.nlog如果都没有错误，那就0K.另外还有一个命令也很有意思，会自动帮我们察看是否存在top 错误：mris_euler_number sub1/surf/lh.origmris_euler_number sub1/surf/lh.whitemris_euler_number sub1/surf/lh.pial如果这三个命令生成的数字完全一样,就没有top 结构问题,然后我们再进行视觉检查,首先检查register：tkregister2 --mgz --s sub1 --fstal --surf orig然后检查tkmedit 和tksurfer 检查白质、灰质分割问题。
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V.Advanced Unicorn Software——Method Edit
新建柱子
具体软件操作如下：
①在Unicorn软件Method Editor界面中选择Edit→ Column List
②新建一根自己的柱子：New
③→New Column中输入柱参数：输入Height，柱子直径diameter；输入其他相关参数：Vt，Vo，Max Pressure，Default Flowrate，Max Flowrate等，然后Save As 特定的柱名。
这样在Column List中就有了我们自己编辑好的层析柱。
新建方法：
在Unicorn软件Method Editor界面中选择File→New→Wizard→OK
Main Selection层析方式选择：Affinity、Anion/Cation Exchange、HIC、Size exclusion
→Column：Any（或者预装柱）→Flexible Flow Rate在不同阶段用不同流速→Next
Wavelength 波长选择UV：280nm →Pump Inlet入口选择→Next
Equalibration： Start Concentration %B起始浓度选择→Equalibration Volunme： CV 平衡体积→Watch Equlibration和前一个条件是满足任一条件，就跳入下一步。
Sample Injection：Injection Technique: Manual注射器上样→ Empty Loop With：
1mL；
或者 System Pump Direct Loading系统泵直接上样→Injection Volume 上样体积（必须>10mL），默认样品入口为A2(如果HIC，默认B2) →Next
Wash Out Unbound Sample清洗未结合蛋白，默认2CV（最后参数表可以修改）
→Flowthrough Fractionation穿透峰收集（Frac-900、OFF、Outlet F3出口阀F3收集）→Next
Elution Fractionation洗脱收集→Frac-900收集器收集、OFF、Outlet出口阀收集
→Fixed Volume Fractionation固定体积收集、Peak Fractionation峰收集、Fixed Volume and Peak Fractionation固定体积和峰收集相结合→Fraction Volume固定体积收集每管体积→Next
Peak Fractionation设定峰收集→Peak Identification →UV Level峰高度、UV Slope紫外斜率→Minimum Peak Width最小峰宽（排除气泡峰）→Peak Fractionation Volume→Next
Elution洗脱模式(根据工艺选择一种设定)
①Isocratic等度洗脱（凝胶过滤）→Length of Elution 洗脱体积→Finish
②Isocratic with Delayed Frationation延迟峰收集的等度洗脱→Length of Elution before Fractionation 从0.2CV开始采进行峰收集→Length of Elution with Fractionation →Finish
③Linear Gradient 线性洗脱→Target Concentration目标变化浓度→Gradient Length 梯度长度（一般10~20CV）→Use cond or concB to start and stop Fractionation利用电导或B%开始或者停止收集→Clean after Elution at 100B%(5CV)清洗
→Reequilibration after Elution(5CV)再平衡→Finish
④Segmented Gradient Advanced高级梯度→ Gradient Segments最多可以设定9个步骤
Elution –Segment1(1)-Page1(2) →Step阶段梯度\Gradient线性→Pump Inlet A入口→Concentration B浓度→Length of Step 梯度长度
Fraction Volume 固定体积收集→Peak FractionVolume 峰收集设定→设定剩下的梯度后→Finish
Variables →Show details检查各个参数，可以修改→Save
运行方法
System Control→Run→方法→OK→Variables检查一下参数→Evalution Procedures→Method Information/Method Duration总体体积和运行时间→Next→Questions→Directory结果保存文件夹/Name结果名→Start
VI.Training Material ▪培训资料（pdf版本）
▪ÄKTA_purifierFrac920层析仪使用操作规程（Word）▪ÄKTA系统手动命令指南
▪UM UNICORN 5 CN
▪如何安装Unicron软件
▪ÄKTAclub 8
▪ÄKTApurifier training VCD
▪如何安装Unicron软件。