食品微生物基因组学的研究进展
年度总结微生物(3篇)
第1篇一、引言微生物作为地球上最基本的生物群体，与人类生活息息相关。
在过去的这一年里，微生物领域的研究取得了显著成果，不仅加深了我们对微生物的认识，也为人类健康、农业、环境保护等领域提供了新的思路。
本文将对微生物领域的研究进展进行总结，并对未来发展趋势进行展望。
二、微生物领域研究进展1. 微生物基因组学微生物基因组学是微生物领域研究的热点之一。
近年来，随着测序技术的快速发展，微生物基因组数据量呈指数级增长。
以下是一些重要进展：（1）微生物基因组注释：通过生物信息学方法，对微生物基因组进行注释，揭示其基因功能、代谢途径等信息。
（2）微生物基因岛研究：发现微生物基因岛在基因转移、适应性进化等方面发挥重要作用。
（3）微生物基因组进化：通过比较不同微生物基因组，研究其进化历程和适应性进化机制。
2. 微生物与人类健康微生物与人类健康密切相关。
以下是一些微生物领域在人类健康方面的研究进展：（1）肠道菌群与疾病：研究发现，肠道菌群与多种疾病的发生、发展密切相关，如肥胖、糖尿病、心血管疾病等。
（2）微生物与抗生素耐药性：随着抗生素的广泛应用，细菌耐药性逐渐增强。
研究微生物耐药机制，为开发新型抗生素提供依据。
（3）微生物与传染病：研究微生物与传染病的相互作用，有助于开发新型疫苗和治疗方法。
3. 微生物与农业微生物在农业领域发挥着重要作用。
以下是一些微生物领域在农业方面的研究进展：（1）微生物肥料：利用微生物促进植物生长，提高农作物产量和品质。
（2）生物防治：利用微生物抑制害虫和病原菌，减少化学农药的使用。
（3）微生物酶制剂：利用微生物生产酶制剂，提高工业生产效率。
4. 微生物与环境保护微生物在环境保护方面具有重要意义。
以下是一些微生物领域在环境保护方面的研究进展：（1）生物修复：利用微生物降解污染物，净化环境。
（2）生物降解：研究微生物降解塑料、有机物等，减少环境污染。
（3）微生物与碳循环：研究微生物在碳循环中的作用，为应对气候变化提供科学依据。
食品生物技术的研究进展
食品生物技术的研究进展食品生物技术是指利用生物技术手段来改良和提高食品生产过程中的一项新技术。
随着生物技术的发展, 食品生物技术的研究取得了许多重要的进展。
本文将介绍食品生物技术的主要研究领域和取得的进展。
转基因技术是食品生物技术的重要组成部分。
转基因技术是将外源基因导入到食品作物的基因组中，以增加其产量、耐逆性和品质等方面。
通过转基因技术，科学家们已经开发出多种转基因作物，如转基因水稻、转基因玉米和转基因大豆等。
这些转基因作物在增加农作物产量、抗虫害和抗除草剂等方面表现出了明显的优势。
食品工业中的发酵技术也是食品生物技术的重要领域之一。
发酵技术是利用微生物通过其代谢反应来改变食品原料的性质和质量。
通过生物发酵，可以制造出多种食品，如酸奶、啤酒、红酒等。
发酵技术还可以用于生产食品添加剂和调味品等。
食品加工和储存技术也是食品生物技术研究的重要方向。
对于食品加工和储存过程中的微生物污染和食品变质等问题，研究者们已经通过生物技术开发出了多种解决方案。
利用发酵菌和益生菌防止食品变质，利用抗菌肽等天然抗菌物质防止食品微生物污染等。
食品生物技术还在食品检测和质量控制方面发挥了重要作用。
通过生物技术手段，可以开发出快速、准确和灵敏的食品检测方法。
利用PCR技术可以检测食品中的转基因成分，利用酶联免疫吸附测定法可以检测食品中的有害菌。
这些方法不仅可以保证食品的质量和安全，还可以为食品生产企业提供快速和可靠的质量控制手段。
食品生物技术在转基因技术、发酵技术、食品加工和储存技术以及食品检测和质量控制方面取得了许多重要的研究进展。
随着科学技术的不断发展，相信食品生物技术还会有更多的创新和突破，为改善食品生产和保障食品安全做出更大贡献。
微生物学研究的最新进展及其应用
微生物学研究的最新进展及其应用微生物学是研究微生物及其生态、生理、遗传学、生物化学及其与疾病、卫生、农业、环境、工业、能源等的科学。
随着科技的发展，微生物学的研究也在不断深入。
最新进展1. CRISPR-Cas9技术CRISPR-Cas9技术是指利用CRISPR-Cas系统进行基因编辑的方法。
这种技术能够将DNA序列切除或替换成新的DNA序列，导致基因组的特定部分发生变化。
CRISPR-Cas9技术被广泛应用于微生物学研究中，如构建抗药性菌株、探究微生物代谢途径等。
2. 基因组学基因组学是指对生物体的基因组进行全面研究。
近年来，基因组学在微生物学中的应用日益广泛。
通过对微生物基因组的分析，可以了解微生物代谢、毒力、抗药性等方面的信息，从而开展微生物防治、抗菌药研发等。
3. 合成生物学合成生物学是指将生命体系的分子元件进行组合和重新编程，为生命进程设计新的组织、细胞和生物功能。
在微生物学中，合成生物学被广泛应用于微生物代谢、细胞生长、生物制品生产等领域，为微生物工业化生产开辟了新途径。
应用1. 小分子化合物开发小分子化合物是指分子量小于500的化合物。
微生物学可用于小分子化合物的开发。
利用微生物合成反应途径，可生产大量的小分子化合物，如药物、抗生素等。
2. 食品加工微生物在食品加工中发挥着重要作用。
酸奶、豆腐、面包、啤酒等都是利用微生物发酵而制成的。
微生物学研究可为食品加工提供新的技术支持，如开发新的微生物种类，制造新的发酵食品等。
3. 环境治理微生物在环境治理领域也具有重要作用。
微生物可以降解污染物，改善水质和土壤质量，修复受污染的环境等。
微生物学研究为环境治理提供了一系列新的治理方法和技术手段。
4. 医学疾病微生物学在医学疾病方面具有广泛的应用。
利用微生物学技术，可以开发新的抗生素，治疗感染性疾病等。
同时，微生物学研究还可以了解致病菌的致病机理和病原菌抗药性的原因，为治疗和预防疾病提供新的思路和方法。
组学分析技术在食用菌中的研究进展
食品科技组学分析技术在食用菌中的研究进展于 洋1，张彦龙2*（1.黑龙江大学 农业微生物技术教育部工程研究中心，黑龙江哈尔滨 150500；2.黑龙江大学 生命科学学院，黑龙江哈尔滨 150080）摘 要：基因组、转录组、蛋白组、代谢组学技术作为研究生物体受到内外环境扰动后基因、蛋白和小分子等物质的重要手段，被广泛应用于植物学、微生物学、食品安全等领域。
本文对组学分析技术在食用菌中的研究进展进行了综述，以期为食用菌的分子机理研究提供借鉴与参考。
关键词：食用菌；组学分析技术；基因组；转录组；蛋白组多组学分析技术主要从基因序列、转录本、蛋白质、生物小分子代谢物不同角度出发，在整体上探索生物体变化的规律[1]。
多组学分析技术主要包括基因序列对应的基因组学技术、转录本对应的转录组学技术、蛋白质对应的蛋白质组学技术，生物小分子代谢物对应的代谢组学技术等。
食用菌是一种可以供人们食用的大型真菌，不仅营养价值丰富，具有极佳的口感。
而且种类繁多。
如今，已经通过栽培技术开始栽培食用菌，并且为种植菌农带来巨大的经济效益，但同时由于人们对食用菌了解还处于发展阶段，使一些问题还不能解决，导致菌农利益亏损，通过组学分析技术对食用菌在分子方面进行深入研究，对日后食用菌的改善有巨大意义。
因此，本文对基因组学、转录组、蛋白组、代谢组及多组学联合分析在食用菌中的应用及展望进行综述。
1 基因组学在食用菌研究中的应用1.1 基因组学技术在食用菌中的应用基因组学在食用菌中应用最广泛的是全基因组学技术。
草菇是作为最常见的食用菌之一，由于它的营养物质丰富，深受人们喜爱，但因其在生长发育过程中生物转换效率较低，使草菇的发展受到限制。
研究者将草菇的全基因组进行高通量测序后，得到35.7 Mb的基因组数据。
测序结果显示，草菇生物转化率低的主要原因之一可能是由于草菇中缺少降解木质素能力的酶，即木质素降解酶系统[2]。
灵芝是食用菌中被人们熟知的名贵药材，全基因组测序结果为38.24 Mb，其中包含基因数12 080个。
微生物学的研究进展
微生物学的研究进展微生物学是研究微生物界生命活动及其与其他生物以及环境的相互作用的学科。
自然界中微生物的种类极为繁多，包括了细菌、病毒、真菌、原生动物等。
微生物在生物界中具有非常重要的作用，例如产生氧气、帮助植物吸收营养、分解废物等。
与此同时，微生物还能够导致许多疾病，造成生态系统的破坏等问题。
因此，微生物学的研究具有非常重要的意义。
在科技的发展下，越来越多的微生物被发现，微生物学研究的内容也越来越丰富。
下面将从以下三个方面着重介绍微生物学的研究进展。
微生物的基因组学研究近年来，随着高通量测序技术的发展，微生物的基因组学研究取得了巨大的进展。
这项技术能够快速、准确地测序大量的DNA或RNA序列，尤其是第二代高通量测序技术，其测序速度更快、精度更高。
通过测序技术，人们发现许多微生物中存在着大量的基因，在这些基因中有许多还没有被发现、研究。
利用基因组学技术，我们可以预测微生物的一些特性，比如说它们能否合成某些化合物、遇到某些环境条件会发生哪些变化等。
这有望为人类解决一些疑难问题提供新的思路。
微生物的多样性研究微生物的种类非常多，在各种环境中都能找到它们的身影。
科学家对各种微生物进行系统的分类学研究，以便更好地理解微生物的多样性和分类规律。
随着技术的进步，科学家们开始重视微生物界中那些特殊的、难以培养的微生物。
这些微生物在地球上的生存环境中扮演着至关重要的角色，但由于难以培养，我们对它们的了解很有限。
为了更好地了解这些微生物，科学家在微生物分离、培养以及分类方面进行研究，提供了一种新的思路。
微生物的生态学研究微生物在生态系统中具有非常重要的作用。
科学家通过监测环境中的微生物群落，了解了它们的功能在自然界中的作用，并提供了一些新对策。
微生物能够分解废物，对污染环境的处理具有火山重大的贡献。
在许多工业污水处理过程中，微生物都发挥着重要的作用。
同时，微生物对植物的生长和其他动物的生命也具有重要的影响。
总结微生物学是一门综合性的学科，而且也是研究的热点领域。
基于宏基因组和宏转录组的发酵食品微生物研究进展
基于宏基因组和宏转录组的发酵食品微生物研究进展雷忠华，陈聪聪，陈 谷*（华南理工大学食品科学与工程学院，广东 广州 510641）摘 要：揭示传统发酵食品中微生物群落结构特征、演替变化规律和功能基因是多年来科学研究和工业生产共同关注的焦点。
近年来，高通量测序技术以其高效和相对廉价的优势，成为传统发酵食品微生物研究的重要工具。
本文从高通量测序技术的基因组和转录组层面的研究出发，综述了近8 年来宏基因组学与宏转录组学在研究发酵食品微生物群落结构、相互作用及挖掘功能基因等方面的进展，并分析讨论其面临的主要问题和发展趋势，为未来发酵食品的科学研究和工业生产提供一定参考。
关键词：发酵食品；宏基因组学；宏转录组学；微生物群落结构；演替变化规律；功能基因挖掘Metagenomic and Metatranscriptomic Analysis of Microbiota in Fermented Foods: Review of Recent AdvancesLEI Zhonghua, CHEN Congcong, CHEN Gu *(School of Food Science and Engineering, South China University of Technology, Guangzhou510641, China)Abstract: Exploring the microbial community structure, succession and functional genes in traditional fermented foods has been the focus of common concern for academic and industrial researchers in the field of food for many years. Because of its high efficiency and relatively low cost, high-throughput sequencing has become one of the most important tools for exploring the microbiota of fermented foods. Based on high-throughput sequencing, metagenomics and metatranscriptomics have greatly advanced our knowledge about microbial succession, interaction and functional genes in various fermented foods. Here, we review the progress that has been made over the past eight years in the metagenomic and metatranscriptomic analysis of the microbiota in fermented foods. We also discuss the limitations and prospects of metagenomics and metatranscriptomics. We hope that this review will provide useful information for future research and industrial production of fermented foods.Keywords: fermented foods; metagenomics; metatranscriptomics; microbial community structure; microbial succession; discovery of functional genesDOI:10.7506/spkx1002-6630-201803049中图分类号：TS201.3 文献标志码：A 文章编号：1002-6630（2018）03-0330-08引文格式：雷忠华, 陈聪聪, 陈谷. 基于宏基因组和宏转录组的发酵食品微生物研究进展[J]. 食品科学, 2018, 39(3): 330-337. DOI:10.7506/spkx1002-6630-201803049. LEI Zhonghua, CHEN Congcong, CHEN Gu. Metagenomic and metatranscriptomic analysis of microbiota in fermented foods: review of recent advances[J]. Food Science, 2018, 39(3): 330-337. (in Chinese with English abstract) DOI:10.7506/spkx1002-6630-201803049. 收稿日期：2016-10-09基金项目：广东省公益研究与能力建设专项资金项目（2015A020209029）第一作者简介：雷忠华（1989—），男，硕士研究生，研究方向为发酵食品微生物。
基因组学研究的最新进展报告
基因组学研究的最新进展报告基因组学是研究生物体基因组的结构、功能、组成以及相互关系的科学领域。
近年来，基因组学研究取得了许多重要的突破，为人们对遗传学和生物学的理解带来了新的认识。
本报告将介绍基因组学领域的最新进展，并讨论其对医学、农业和环境等领域的潜在影响。
一、基因组测序技术的革新基因组测序是基因组学研究的核心内容之一。
近年来，随着测序技术的不断创新与改进，基因组测序的速度和精确度大大提高。
首先，单分子测序技术的发展使得基因组测序更加快速和高效。
通过独立测序单个DNA分子的技术，可以避免PCR扩增等步骤带来的偏差和失真，提高数据的准确性。
其次，长读取长度测序技术的应用拓展了基因组测序的范围。
长读取长度使得我们能够更好地解析复杂的基因组结构，如基因家族和重复序列等。
这对于揭示生物体的进化历程和功能基因的鉴定具有重要意义。
再次，新一代测序技术的推出降低了测序成本。
高通量测序平台的广泛应用大大加快了基因组测序的速度，同时也降低了测序的费用，使得越来越多的研究能够利用基因组测序技术。
二、功能基因组学的研究进展功能基因组学研究关注基因组中基因的功能和作用方式，并通过基因组的功能注释来解析生物体的生命活动。
近年来，功能基因组学的研究取得了显著的进展。
首先，全转录组测序技术的应用使得我们能够准确地测量基因的表达水平。
通过全转录组测序，我们可以深入了解基因在不同生理状态和环境中的表达模式和调控机制。
这对于研究疾病的发生机制和药物的研发具有重要意义。
其次，表观基因组学的研究推动了我们对基因调控的理解。
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰等，这些修饰形式可以影响基因的表达和功能。
通过表观基因组学的研究，我们能够揭示基因组在不同细胞类型和发育阶段中的调控模式，进一步理解生物体的发育和疾病的机制。
三、基因组学在医学中的应用基因组学的研究为医学领域带来了众多的应用，特别是在疾病的诊断、治疗和预防方面。
基因组测序的广泛应用使得人类遗传病的检测更加准确和精细化。
微生物学研究的发展现状与未来趋势分析
微生物学研究的发展现状与未来趋势分析微生物学是生物学中一门重要的学科，研究微生物的结构、功能、分布、生态和应用。
随着科技的不断进步，微生物学的研究也在不断发展，取得了许多重要的成果。
本文将从多个角度分析微生物学研究的发展现状与未来趋势。
首先，微生物学研究的发展现状很大程度上受益于技术的突破。
比如，高通量测序技术的出现使得微生物的基因组学研究水平大幅提高。
通过对微生物基因组的分析，人们可以深入了解微生物的遗传信息，揭示微生物的功能和演化。
此外，基于分子生物学的技术也推动了微生物学的进步。
克隆、表达和定量PCR等技术的应用，使得研究者可以更好地研究微生物的基因表达和功能。
其次，微生物学的研究已经从单一物种向微生物群落水平拓展。
微生物群落是由多种微生物共同生活在一个环境中形成的，如土壤、肠道、水体等。
对微生物群落的研究有助于人们了解微生物之间的相互作用、物种多样性和生态功能。
同时，随着“组学”研究的兴起，如微生物组学、转录组学和代谢组学等，人们可以深入了解微生物群落的多样性和代谢功能。
此外，微生物学的研究与环境保护和健康领域息息相关。
例如，微生物在环境中的作用被广泛研究，包括土壤肥力的维持、水污染的处理和废物降解等。
微生物学还在食品安全和营养方面发挥了重要作用。
近年来，关于微生物群落与人类健康之间的关系的研究也备受关注。
许多疾病的发生与微生物的失衡有关，如肠道微生物与肥胖、糖尿病等疾病的关系。
因此，微生物学研究在预防和治疗人类疾病方面具有巨大潜力。
微生物学未来的发展趋势将更加多样化和综合化。
首先，跨学科研究将更加普遍。
微生物学从生物学、化学、物理学到数学等多个学科的交叉融合，将有助于揭示微生物的奥秘。
其次，大数据和人工智能的应用将进一步加快微生物领域的研究进展。
大数据的分析和挖掘，以及机器学习和深度学习等技术的发展，将有助于揭示微生物的复杂性和规律性。
此外，新技术的不断涌现也将推动微生物学的发展，如高效基因编辑技术、CRISPR-Cas系统的应用等。
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微生物菌种 食品级真菌 酿酒酵母 乳酸克鲁维酵母 黑曲霉 食品级细菌 枯草芽胞杆菌 乳酸乳球菌 植物乳杆菌 唾液链球菌 保加利亚乳杆菌 细菌病原菌 空肠弯曲杆菌 大肠杆菌 I!J, ： K, 金黄色葡萄球菌 单核细胞增生杆菌 蜡状芽孢杆菌
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食品科学
!综述
食品微生物基因组学的研究进展
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摘 要
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Байду номын сангаас
赵学明
天津大学化工学院生物化学工程系
天津
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随着已完成或正在进行基因组测序的食品微生物数量的迅速增加，利用基因组信息进行比较基因组学及功
能基因组学的研究将有益于食品生物技术的发展， 它不但有助于了解微生物细胞的生理及代谢功能， 而且还为利用食 品级生物改进食品的功能及安全性提供了众多可能性。 关键词 比较基因组学 功能基因组学 食品微生物
食品生物技术主要涉及将原材料生物转化为可最终消费 的产品，微生物在此过程中起着重要作用。一方面可利用它生 产某些食品组份及改进食品的功能，另一方面病原微生物和腐 败微生物也影响着食品的安全及卫生。因此，食品微生物基因 组学的研究将对食品生物技术产生积极的影响，由于微生物的 基因组较小以及高通量测序设备的出现，使微生物基因组学迅 速发展，本文将简要介绍食品微生物功能及比较基因组学的最 新进展。
组相比较，其外侧基因的转移范围比预期的要广，同时还发现 了 !",# 个新的基因 Q O R 。对 T) 642143 的两个菌株 L 二甲氧基苯青 霉素抗性及万古霉素抗性 N 的基因组全序列进行分析之后，也 发现了基因转移现象
Q, R
。测定这些食品病原菌的基因组全序
列，不但有助于研究新的抗感染疗法而且还能通过分析病原菌 对食品加工条件所起的反应，发现其弱点从而找出根治的方 法。 $ 食品微生物的比较基因组学 可以利用比较基因组学中最简单的方法，序列比对，对食 品微生物进行研究。例如，全基因组与高度相关的基因组序列 全基因组与中等相关程度的基 之间的比较 L 两株 T) 642163 N Q , R ， 表! 已完成或正在进行基因组测序的食品微生物 基因组 L M> N !$) %O# !$ "% P) $!P $) "OJ ") "%# !) # $) " !) OP! J) P+# $) #!% $) +PP J 参考资料 Q!R Q$R Q !J R Q"R QPR Q !O R Q !, R Q !# R QJR QOR Q,R Q !+ R Q $% R
!
食品微生物基因组的测序 目前已完成或正在进行基因组测序的食品微生物如表 !
所示。 在食品组微生物中，T) ;121B.3.61 的全基因组测序率先完成 Q ! R ， 与这相关的其它醇母菌基因组测序工作已展开。 U) (6;/.3 的基 因组大小与 T) ;121B.3.61 相似，并约有 $%%% 多个可读框架与后 者同源 Q $ R 。丝状真菌作为酶制剂生产菌在食品工业中具有重要 用途，但同时它们还是腐败微生物及植物病原菌，与工业化生 产相关的 V) :.<12 的基因组测序正在进行之中。 食品级细菌由革兰氏阳性菌 L W X N 组成。作为 W X 菌的模式 菌株， Y) 34>/.(.3 的基因组全序列的测定最先完成 Q " R 。Z) (6;/.3 的 基因组全序列也于 $%%! 年公开发表 Q P R ， 尽管 Z) (6;/.3 的基因组 大小仅有 Y) 34>/.(.3 分别为 !# 和 "P 个， 这也许反映了两者生态 环境的不同，Z) 34>/.(.3 分别为 !# 和 "P 个，这也许反映了两者 生态环境的不同， Z) (6;/.3 一般生长于营养条件相对稳定的环境 中 L 如牛奶 N 而 Y) 34>/.(.3 则是能形成孢子土壤微生物。 由于在制药行业中极具重要性，许多食品病原菌的基因组 全序列测序工作也已完成。 G) [1[4:. 是引发食品腐坏而导致腹 泻的主要原因，在食品病原菌中，其基因组全序列的测定是最 先完成的 Q J R 。 许多由食品腐坏而 \) ;’(.I!J, ] K, 能产生细胞毒素， 导致出血性结肠炎的爆发均与之有关。 这与 \) ;’(.U!$ 的基因
5! 7
展， 有理由相信基因组学的研究将会扩展至更多的食品微生物。 L 展 望
。随着已完成测序的全基因组数量的迅速增加及生物信息学
的快速发展，进行序列比对的机会也将呈指数形式增加。根据 序列的相似度，在基因组序列的解释及组装阶段就可进行上比 对工作，它能为下一步的功能研究提供一个结构框架。肺炎链 球菌 + ;9@<AB$-$--@: A?<@C$?.8< 4 是鸟嘌呤和胞嘧啶 + D@8?.?< 8?E -F9$:.?<G DH 4 含量较低的革兰氏阳性菌，通过与其它已测序的 微生物菌株全基因组相比较，在预测的 !!’I 个蛋白中有 )"/ 个与 J& %8-9.:KJ*L" 的高度相似， 此外， 仅有 *"/ 个蛋白与共它低 DH 的 D M 菌的已知蛋白没有相似性 5 ) 7 。 若仅有一个模式菌株的基因组全序列或部分序列可供用， * 仍有一些能进行比较基因组学研究的方法。通过系统分析利用 扣除杂交法 + ;@N9=8-9.>< BFN=.E.O89.$? 4 所得到的新的未知序列， ! 可以对其定性。由于其高通量通量， P(Q 微点阵是有潜力的另 一种方法。涵盖 )"R ;& 8@=<@: 基因组的 P(Q 微点阵已经被构 建成功并用于研究 ’I 株从环境中分离到的菌株的多样性及进 化 5 *" 7 。 ’ 食品微生物的功能基因组学 L 由于 ;& -<=<>.:.8< 的遗传背景清楚并且其全基因组序列测 定最先完成，它已成为功能基因组学研究的新的范式系统。利 用转录分布 + S=8?:-=.A9 A=$T.%.?U 4 的方法对 ;& -<=<>.:.8< 的生理学 进行了某些研究，例如在连续培养和高盐两种条件下，进行有 氧及无氧生长时分别分析其全基因组转录特征。此外，还对用 于酿制葡萄酒的众多 ;& -<=<>.:.8- 菌株进行了转录分布的研究， I 结果表明这些菌株的 P(Q 转录程度不同。将转录组学与蛋白 质组学的方法综合起来，研究了 ;& -<=<>.:.8< 的半乳糖代谢途 径， 在测定的 !6) 个蛋白中约有 */ 个受转录后调节 5 ** 7 。 进行全 基因组研究的主要限制是需要用基因的功能信息解释其结果， 从基因组中 而 ;& -<=<>.:.8< 的很多基因所编码的蛋白功能未知， 将共敲除后，这些基因也不显示任何功能。但能过综合分析突 变株中代谢物浓度以及与野生型菌株代谢特征进行比较后，就 可获得有关缺失基因的功能信息，这也是比较代谢组学 + H$CA8=89.>< C<98N$%$C.-: 4 用于基因功能分析的一种方法。 相对于 ;& -<=<>.:.8< 的复杂研究， 与食品相关的细菌基因功 能组学仍处于发展阶段，但近年来有关 V& :@N9.%.: 的研究却取 得丰硕成果。首先， V& :@N9.%.: 启动子转录因子数据库已经建立
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食品微生物的基因组学已研究产生了大量的原始信息，利 用这些基因组信息及相关的生化信息研究微生物基因型与表 型之间接关系将是下一步的研究方向。代谢工程中的代谢通量 分析是适合此研究的较好工具，它已被用于根据 ,& -$%. 的基因 组信息， 分析、 解释并预测其表型的研究 5 *L 7 ， 这也预示着表型组 学 + AB<?$C.-: 4 的兴起。 参考文献 D$TT<8@QG V8==<%%VDG V@::<F2<98%& J.T<W.9BI"""U<?<:& ;-.<?-<G *))IG !0LX /I’ Y /I0& S$TT8?$ Z (.$-B< HG Q=9.U@<?8>< [ <9 8%& V$%$9.? Z [@\@B8=8 ]， D<?$C.-<^A%$=89.$?$T9B<B<C.8:-$CF-<9$@:F<8:9:X **& 3%@F><= Z $CF-<: %8-9.:& [,V; J<99G !"""G L60X II Y 0"& ’ 3@?:9G [ _ U8:8W8=8G ( ] $:O<= <9 8%& SB< -$CA%<9< U<?$C< :<‘ a@<?-< $T 9B< D=8C Z A$:.9.>< N8-9<=.@C V8-.%%@: :@N9.%.:& (89@=<G *))0G ’)"X ’IL Y ’0"& V$%$9.?G Q b .?-\<=G c ] 8@U<= ; <9 8%& SB< -$CA%<9< U<?$C< :<a@<?-< $T 9B< %8-9.- 8-.E N8-9<=.@C J8-9$-$--@: %8-9.: :@N ‘ :A& %8-9.:& D<?$C< d<:G !""* + ** 4 X 0’* Y 0/’& / c8=\B.%%G eb=<?G b]@?U8%% <9 8%& SB< U<?$C< :<a@<?-< $T 9B< T$$E Z N$=?< A89B$U<? H8CAF%$N8-9<= f<f@?. =<><8%: BFA<=>8=.8N%< :<a@<?-<:& (89@=<G !"""G L"’X II/ Y II6& c<=?8 (SG c%@?\<99 KKK DG V@=%8?E # <9 8%& D<?$C< :<a@<?-< $T <?‘ 9<=$B8<C$==B8U.- ,:-B<=.-B.8 -$%. _*/0X 20& (89@=< ，!""*G L")X /!) Y /’’& 0 3@=$E8G ]_B98G Sg-B.F8C8 <9 8%& bB$%< U<?$C< :<a@<?-.?U $T C<9.-.%%.? Z =<:.:98?9 ;98ABF%$-$--@: 8@=<@:& J8?-<9G !""*G !*X *!!/ Y *!L"& 6 ) V%899?<=G [dG c%@?\<99 <9 8%& SB< -$CA%<9< U<?$C< :<a@<?-< $T ,:‘ -B<=.-B.8 -$%. 3 Z *!& ;-.<?-<G *))0G !00X *L/’ Y *L0L& S<99<%.?G 2G (<%:$? S <9 8%& H$CA%<9< U<?$C< :<a@<?-< $T 8 >.=@%<?9 .:$%89< $T ;9=<A9$-$--@: A?<@C$?.8<& ;-.<?-<G !""*G !)’X L)6 Y /"I& *" [.9OU<=8%E edG ;9@=E<>8?9G e]8-\.< ;] <9 8%& ,>$%@9.$?8=F U<‘ ?$C.-: $T ;98ABF%$-$--@: 8@=<@:X .?:.UB9: .?9$ 9B< $=.U.? $T C<9B.‘ -.%%.? Z =<:.:98?9 :9=8.?: 8?E 9B< 9$^.- :B$-\ :F?E=$C< <A.E<C.-& !""*G )6X 66!* Y 66!I& c=$- (89% Q-8E ;-. g;Q ， ** KE<\<=G SSB$=::$?#G d8?.:B<98%& K?9<U=89<EU<?$C.-8?EA=$9<$C.8?8%F:<: $T 8 :F:9<C89.-8%%F A<=9@=N<E C<98N$%.- ?<9W$=\& ;-.<?-<G !""*G !)!X )!) Y )’L& *! K:B..G Sh$:B.E8G 3S<=8.G D& PVSV;X 8 E898N8:< $T V8-.%%@: :@N9.%.: A=$C$9<=: 8?E 9=8?:-=.A9.$? T8-9$=:& (@-%<.- Q-.E: d<:G !""*G !)X !06 Y !6"& *’ d$?E$?G ]dd8TT<%G ;eD$$EC8? d ] <9 8%& S$W8=E T@?-9.$?8% U<‘