Meta分析与PubMed文献检索
Meta分析的步骤与实例分析2014-07-25
1. 将原始研究中可用的资料提取出来，以免混乱，便于集中分析； 2. 在提取过程中，对资料进行质量分析和评价； 3. 将原始资料条理化，便于 Meta 分析作者对文献中的具体工作进行评价， 以评估系统评价的准确性；
4. 多个Meta分析作者应对质量分析的一致性进行自测；
5. 根据立题时的目标设计制定详细的资料录入表格。
Meta分析的文献检索
收集文献：中文文摘数据库(首都医科大学)
Meta分析的文献检索
收集文献：循证医学数据库(首都医科大学)
Meta分析的文献检索
文献检索：是一门专业，可在研究生阶段选修相关课程，以及参加培训课程
Meta分析的文献检索
收集文献：药物临床试验数据库，信息量大，更新迅速
Meta分析的文献检索
Meta分析的文献检索后的纳入
为使用当前最佳证据而检索：充分检索
如对治疗证据进行检索，一般： 首选Cochrane Library（CDSR） 不满意 DARE， ACP Journal Club，EBM指南, Bandolier等 仍不满意
MDELINE，EMBASE，CBMdisc等
还不满意 指南、专业杂志、会议录数据库等
6. 亚组结果Outcomes：亚组人群中多少例罹患食管癌、多少未罹患
7. 列出原始研究的所有测量指标，也可能是最后舍弃的（本研究中食管腺
癌资料最终从表格中被舍弃）
Meta分析的数据提取---实例
Meta分析的数据提取
影响数据提取的因素：资料不全
1. 对每篇进入分析的文章主要内容进行描述，如治疗方法的可比性、病人 特点、疾病程度、并发症、取材手段、检测方法等；
收集文献：注意事项
1. 全面性的概念以及不同层面的概念，例如地域、领域、方法等；
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法摘要：一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文：一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院（NIH）开发和维护的一个免费生物医学文献数据库，包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页，可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮，可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定，从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中，可以采用一些策略提高检索效果。
例如，使用截词符（*）进行词干检索，或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例：假设我们想查找关于“新冠病毒”（SARS-CoV-2）的研究文献，可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”，然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章，如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等，了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符（AND、OR、NOT）在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如，输入“新冠病毒AND 疫苗”，可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中，可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件，缩小检索范围，提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具，如引文导出、文献收藏、文献标签等。
诊断性试验Meta分析报告
诊断性试验Meta分析报告一、引言诊断性试验在医学领域中具有至关重要的作用，它们帮助医生确定患者是否患有某种疾病，以及评估疾病的严重程度和预后。
然而，单个诊断性试验往往受到样本量、研究人群、研究方法等因素的限制，其结果可能存在偏差。
Meta 分析作为一种系统评价方法，能够综合多个诊断性试验的结果，提供更全面、更准确的诊断信息。
二、目的本 Meta 分析的目的是综合评估某种诊断性试验在特定疾病中的诊断价值，为临床医生的诊断决策提供依据。
三、资料与方法（一）检索策略我们在多个数据库（如 PubMed、Embase、Cochrane Library 等）中进行了系统的检索，检索时间范围为_____至_____。
检索词包括疾病名称、诊断性试验名称以及相关的关键词。
（二）纳入与排除标准纳入标准：①研究对象为疑似患有特定疾病的患者；②使用了所关注的诊断性试验；③报告了诊断准确性的相关指标，如敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值等。
排除标准：①重复发表的研究；②研究质量差，如样本量过小、方法学存在明显缺陷等；③无法获取全文或关键数据的研究。
（三）数据提取由两名研究者独立提取纳入研究的基本信息（如作者、发表年份、研究地点等）、研究对象的特征（如年龄、性别、疾病严重程度等）、诊断性试验的方法和参数、诊断准确性的指标等。
如有分歧，通过讨论或咨询第三方解决。
（四）质量评估采用 QUADAS-2（Quality Assessment of Diagnostic Accuracy Studies 2）工具对纳入研究的质量进行评估，评估内容包括病例的选择、待评价试验、金标准、病例流程和进展情况等方面。
（五）数据分析使用 Review Manager 53 软件进行数据分析。
对于诊断准确性的指标，计算合并的敏感度、特异度、阳性似然比、阴性似然比和诊断比值比，并绘制森林图和受试者工作特征（ROC）曲线。
采用随机效应模型或固定效应模型进行合并分析，根据异质性检验的结果（I²值）选择合适的模型。
meta分析的文献检索策略
与Medline相比，PubMed具有以下特点： 1.资源更丰富 2.更新速度快 3.个性化服务MyNCBI 4.强大的链接功能：与NCBI其它数据库的链接、 全文链接、相关文献链接
OLDMEDLINE-记录中用[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966] 以早期印刷版《美国医学索引》（CIM）为主要收集 对象，目前收录约200万条1951一1965年间生物医学 文献，无文摘、未经主题词标引。
PreMedline-记录中用[PubMed－in Process]
cystadenocarcinoma/ mass Choriocarcinoma（绒膜癌） Fallopian Tube Neoplasms（输卵管肿瘤）
腹腔镜
Laparoscopy Peritoneoscopy abdominoscopy Celioscopy（体腔镜检查）
检索词的确定： 1.选择规范的检索词以及主题词，外文中常用的表 达方式，避免选用冷僻词和自选词 2.考虑同义词、近义词、相关词等，注意使用缩略 语、以、英文中的不同拼写形式以及词形变化等； 3.从专业词典、手册、分类表以及期刊中选择检索 词或者参考现有的原始文献。
• 缩略语
• EBM OR evidence based medcine • SR OR systematic review
• 不同拼写形式
ischemic/ischaemic leukaemia/leukemia
paediatric/pediatric behaviour/behavior
• 词形变化 diet diets diatary
Meta分析的统计过程
Meta分析的统计过程引言Meta分析是一种统计分析方法，用于合并和综合研究文献中的统计数据，以产生更准确、可靠和有说服力的结论。
它对多个独立研究的结果进行整合，从而提高统计成效和推广性。
本文将介绍Meta分析的统计过程，并提供相应的Markdown文本格式输出。
数据收集Meta分析的第一步是收集与研究主题相关的研究文献。
这可以通过文献检索数据库，如PubMed或Scopus进行。
收集到的文献应进行筛选，选择与研究目的最为相关的研究，以防止潜在的偏差。
数据提取在Meta分析中，需要提取每个研究的统计数据。
常见的统计数据包括均值、标准差、样本量和相应的效应量。
这些数据将用于计算汇总效应量和其可信区间。
在数据提取过程中，应注意保持数据的一致性和准确性。
效应量计算Meta分析的核心是计算汇总效应量及其误差估计。
根据具体的研究设计和效应量类型，可以选择不同的计算方法。
常见的效应量包括标准化平均差(SMD)、风险比(RR)和比率差(RD)等。
计算汇总效应量时，需要考虑各个研究的样本量权重，以提高结果的可靠性。
效应量的统计分析在Meta分析中，需要进行统计分析以评估汇总效应量的显著性。
通常使用Z检验或T检验来计算汇总效应量与零假设之间的统计差异。
此外，还可以计算Q统计量和I^2统计量，以评估研究间异质性的程度。
辅助分析可以帮助研究者更好地理解研究结果和异质性源。
效应量的可信区间估计除了汇总效应量，Meta分析还需要估计汇总效应量的可信区间。
常用的方法是计算95%的可信区间，用于描述汇总效应量的精确性。
根据不同的效应量类型，可以选择不同的估计方法，如固定效应模型或随机效应模型。
可信区间的大小将给出一个效应量真值的范围。
效应量的整合与解释Meta分析的最终目标是整合研究结果并给出结论。
通过汇总效应量和可信区间，可以得出关于研究主题的定量结论。
此外，还可以对汇总效应量的大小和方向进行解释，以帮助读者更好地理解研究结果。
如何使用pubmed进行 文献检索
一、PubMed简介
• 很多医务工作者宁可在每次检索时 都花上成倍的时间，却不愿花上几个小 时去认真研究一下PubMed。"君欲善其事， 必先利其器"，PubMed就好像一把功能强 大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动 扳机就可以发射子弹，更重要的是，你 要知道如何利用准星瞄准，如何把这把 枪的功能发挥到及至。
• 回溯年代：1948年至今 • 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记
MEDLINE数据库简介
学科范围：
• 基础生命科学 临床生命科学
• 生物科学
解剖学
• 组织学
化学与药物
• 心理学
社会医学
• 农业
医技设备学
• 医技工业学
医学信息学
使用词表：MeSH（医学主题词表）
4.2 PreMEDLINE
1998/03[dp]; 1998[dp]; 1996:1998[dp]; 1998/01:1998/04 [dp]
• Publication Type[PT]：出版类型 review[pt]
• Title[TI] ：文章题名 • Text Words[TW]：文本词
包括Title, Abstract, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段
检索规则
1、自动转换匹配
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。 对于输入检索框的检索词，PubMed按4个转换表 进行对照、匹配和转换，然后进行检索。 ① MeSH表：包括MeSH的主题词、副主题词、款目 词。 ②期刊刊名表： 所收录的刊名全称、缩写和ISSN ③短语表：文献篇名或文摘中出现的短语。 ④著者索引表： PubMed所收录的的作者姓名组成。
如何使用pubmed进行文献检索
如何使用pubmed进行文献检索使用PubMed进行文献检索是非常重要的，因为它是一个专门为生命科学和医学领域提供的免费文献数据库。
下面是一个详细的步骤指南，以帮助你使用PubMed进行文献检索。
2. 进行关键词：在PubMed首页的框中输入你感兴趣的关键词，可以是疾病名称、特定的治疗方法、生物标志物等。
点击“”按钮。
4.阅读摘要和全文：当你找到感兴趣的文章时，你可以点击标题以查看摘要。
摘要通常提供了关于研究目的、方法、结果和结论的概述。
如果你对文章感兴趣并且有免费全文可用，你可以直接点击“全文”链接以阅读完整的文章。
5. 扩大或缩小范围：如果你的结果不够理想，你可以尝试扩大或缩小范围。
你可以使用更广泛或更具体的关键词来，或者使用PubMed高级功能来更精确地定位你的。
6. 使用MeSH词汇进行检索：MeSH（Medical Subject Headings）是PubMed的一种标准词汇，用于对文章进行分类和索引。
如果你想进行更准确的检索，你可以使用MeSH词汇来。
在框中输入你的关键词，然后点击右侧的“在[MeSH]中”按钮以进一步精确。
7. 使用历史和提示：PubMed提供了历史和提示功能，以帮助你更好地管理和改进你的。
你可以在框下方找到你最近的历史记录，并且当你输入关键词时，PubMed会自动提供相关的建议。
8. 使用PubMed Central进行全文检索：除了PubMed，你还可以使用PubMed Central来全文可用的文章。
PubMed Central是一个免费的全文文献数据库，其中包含了许多生命科学和医学领域的文章。
你可以在PubMed结果页面的右上方切换到PubMed Central进行检索。
总结起来，使用PubMed进行文献检索需要一些技巧和经验。
通过使用关键词、筛选结果、阅读摘要和全文、扩大或缩小范围、使用MeSH词汇、使用历史和提示、使用PubMed Central进行全文检索、导出和管理文献等功能，你可以更有效地利用PubMed来找到相关的研究文献。
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法【原创版4篇】目录（篇1）I.检索PubMed的意义II.PubMed的检索方法III.PubMed检索结果的展示和筛选IV.检索PubMed的注意事项正文（篇1）I.检索PubMed的意义PubMed是全球最大的生物医学数据库之一，提供了大量的生物医学文献资源。
对于研究人员、医学专业人士和学生来说，了解和掌握PubMed的检索方法，可以帮助他们快速找到所需的文献。
II.PubMed的检索方法1.打开PubMed网站，输入网址：https:///2.在页面左侧导航栏中选择“Search”按钮，进入检索页面。
3.在检索页面中，可以选择不同的检索方式，如关键词、作者、出版日期等。
4.输入检索词后，点击“Search”按钮，即可得到相关的检索结果。
III.PubMed检索结果的展示和筛选1.检索结果会按照相关度排序，用户可以选择不同的排序方式。
2.每个检索结果都包含标题、摘要、作者、出版日期等信息。
3.对于需要进一步阅读的文献，可以点击“Open”按钮，查看全文。
4.可以通过筛选条件，如主题、关键词、学科领域等，缩小检索范围。
IV.检索PubMed的注意事项1.避免使用过于具体的检索词，以免得到过多的无关结果。
2.对于复杂的检索需求，可以使用逻辑运算符和短语检索等方式进行组合检索。
目录（篇2）I.引言A.为什么需要pubmed文献检索方法B.pubmed简介II.pubmed文献检索方法A.如何使用pubmed1.输入关键词2.选择检索结果3.查看文献详情B.pubmed的优点1.方便快捷2.检索结果全面3.文献质量较高C.pubmed的不足1.检索结果可能不全面2.文献质量可能较低3.检索结果可能存在误导III.结论A.pubmed文献检索方法的重要性和实用性B.如何利用pubmed进行有效的文献检索正文（篇2）pubmed文献检索方法是一种非常实用的工具，可以帮助科研人员快速、准确地检索到所需的文献。
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SMD
SMD:即标准化均数差，为2组估计均数差值 除以平均标准差而得到。
Meta分析中效应尺度的合理选择
1、流行病学研究设计类型 前瞻性研究（对列研究和RCTs)可以计算相 对危险度(RR)和发病比值比（OR)；病例对 照研究只能计算暴露比值比（OR)；横断面 研究可以计算患病比值比
Meta分析中效应尺度的合理选择
Overall
.001355
1 Odds ratio
Odds ratio (95% CI)
% W eight
0.52 ( 0.16, 1.70) 17.5
0.03 ( 0.00, 0.27) 11.6
ห้องสมุดไป่ตู้
0.52 ( 0.19, 1.44) 18.6
0.06 ( 0.02, 0.19) 17.6
0.21 ( 0.02, 2.06) 10.3
Meta分析中效应尺度的合理选择
2、二分类变量合并统计量的选择 纳入研究为病例对照研究只能选择OR。队 列研究和RCTs首选RR。
Meta分析中效应尺度指标选择的实例
实例1：两种不同隆胸埋植剂预防包膜纤维痉 挛的Meta分析，下图显示的是其主要结果。
Study Asplund 1996 Burkhard 1994 Burkhard 1995 Coleman 1991 Fagrell 2001 Hakellus 1992 Tarplla 1997
解决各研究结果的不一致性 寻求新的假说
效应尺度指标
Meta分析中效应尺度指标，也称合并统计量。 常用的效应尺度指标：OR值，RR值和MD 一、OR即比值比或优势比，是测量疾病与暴 露联系强度的一个重要指标，是某组中某事 件的比值与另一组中该事件的比值之比。
效应尺度指标
比值（odds):是指某事件发生可能性的一种 表示方式，为一个样本中发生某事件的人 数与没有发生某事件的人数之比。 如：在一个100人的样本中，20人死亡，80 人存活，那么这个样本中发生死亡的比值 就是20:80=0.25。 它也可以定义为：某事件发生与不发生的概 率之比，即p/1-p（p表示某事件发生的概率）
Meta分析与PubMed文 献检索
主讲人：贺小峰 长治医学院附属和平医院
循证医学
循证医学的相关概念 循证医学（evidence-based medicine):即遵循 证据的医学，是国际临床领域近年来迅速 发展起来的一种新的医学模式。 1996年Sackett将其定义为：慎重、准备和明 智地应用所能获得的最好证据来确定患者 治疗措施。
2.数据类型与效应尺度指标 Meta分析中的数据类型主要有以下几类： （1）二分类变量：可计算相对危险度或比值
比。 （2）连续性变量：可计算加权均数差
（WMD)或标准化均数差（SMD) （3）等级资料 （4）时间事件数据
Meta分析中效应尺度的合理选择
1、连续性变量合并统计量的选择：当对同 一干预措施效应的测量方法或单位完全相 同时，选择WMD。当对同一干预措施效应 采用不同的测量方法或单位，如测定疼痛 采用不同的量表测量，或者不同研究间均 数差异过大时，应选择SMD作为统计合并 量。
Risk ratio (95% CI)
% W eight
0.56 ( 0.20, 1.61) 17.5
0.06 ( 0.01, 0.40) 10.0
0.58 ( 0.25, 1.36) 19.5
Meta分析中效应尺度指标选择的实例
这是计算合并RR值的森林图：也证实了原文 作者错误的解释OR含义而夸大研究效应
Study
Asplund 1996 Burkhard 1994 Burkhard 1995 Coleman 1991 Fagrell 2001 Hakellus 1992 Tarplla 1997 Overall
循证医学
循证医学的相关概念 2000年Sackett等将其更新为：循证医学是整 合最佳临床证据、临床经验和患者价值观 的一门学科。 目前较为公认的定义：循证医学是通过系统 地列出可以回答的相关问题，并应用数学 的方法评估其概率和危险性，进而改进临 床医生在诊断、治疗、预防及相关领域中 传统技能的一种方法。
Meta分析
证据是循证医学的核心，而Meta分析是目前 公认的最高级别的证据。
Meta-分析的定义： Meta-分析是运用定量方法去概括（总结）
多个研究结果的系统评价。 Meta-分析是文献评价中，将若干个研究结
果合并成一个单独的数字估计的统计学方 法。
Meta-分析的统计目的
增加统计功效：由于单个研究的样本量通 常较小，难以明确肯定某种效应，而这些 效应对研究者来说又可能是重要的
效应尺度指标
表5-1 暴露（干预）与疾病关系的资料四格 表
组别 疾病 非疾病
暴露 a c a+c
非暴露 b d b+d
合计 a+b c+d
三种比值比
1、发病比值比：对于对列研究或RCTs，可 以计算出发病比值比。 2、暴露比值比：主要是针对病例对照研究 3、患病比值比：主要是针对横断面研究
RR
RR表示相对危险度，其意义为两组的事件 概率之比。RR是反映暴露（干预）与事件 关联强度的最有用的指标。RR=1表示两组 没有差异。RR=P1/P2。需要注意的是只有 队列研究和RCTs结果可以直接获得RR值。
MD
MD:均数差，也称为加权均数差（WMD)。 用于Meta分析中所入选研究具有相同连续性 结局变量（如体重）和测量单位。在进行 连续型（计量）资料的meta分析时需要知道 每个原始文献的均数、标准差和样本量。
0.02 ( 0.00, 0.45)
7.8
0.65 ( 0.18, 2.37) 16.7
0.19 ( 0.07, 0.52) 100.0
737.972
Meta分析中效应尺度指标选择的实例
作者在原文中对Meta分析结果中进行如下描 述：采用随机效应模型合并的OR值为0.19 （95%CI：0.07-0.52），提示采用smooth埋 植隆胸后发生纤维包膜痉挛的可能性是 textured埋植剂的5倍。 本文最大的错误是把OR值错误的解释为RR 值，夸大了研究效应，对于RCTs的meta分 析在选择合并统计量时首选RR值