6学技术及其在环境微生物研究中的应用

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分子生物技术在环境工程微生物领域中的应用

分子生物技术在环境工程微生物领域中的应用

分子生物技术在环境工程微生物领域中的应用摘要:随着农业和工业技术的发展以及生产力的提高,开发和使用了许多具有新的物理、化学和生物特性的新物质,这既有益于人类,又对人类环境产生了不利影响。

此外,一些污染物在环境中生物转化,某些有毒物质(如甲醛)的诱变、致畸和致癌性质已经对人类健康和生命构成严重威胁。

将不再满足现代环境工程发展需要的现有环境管理技术相结合,使分子生物技术得以引入环境工程,并找到了解决这些环境问题的新方法。

以DNA技术为指导的分子生物技术在解决这些环境问题方面具有独特的优势,正在逐步取代旧的环境污染管理方法。

二者的结合已成为环境工程领域研究和实践的主要焦点。

关键词:分子生物技术;环境工程;应用措施引言微生物学是一门与其他学科密切相关的重要学科,具有跨领域特点,可以为这些学科的发展提供不同的支持。

通过分析和研究,分子生物技术在微生物领域的应用与环境工程相结合,可以在环境工程领域提供巨大的价值和实际指导。

目前分子生物技术的应用不够广泛,相关的技术能力需要进一步提高,这就需要进一步分析和研究其具体应用。

1城市环境保护污水治理的意义目前社会发展与城市建设中,一个直观的问题便是环境污染、资源浪费,因为我国人口基数比较大,所以实际上人均水资源占有量比较少。

工业与城市化的飞速发展,致使水资源短缺成为城市环境保护中需要重点解决的问题,而且会对现代化进程形成制约,由此也可以肯定水资源治理工作的必要性。

城市生态环境监测期间,发现城市污水排放直接威胁到群众日常生活,也会对生态环境保护带来非常恶劣的影响[1]。

生产与生活污水排放缺乏合理性,城市附近区域的水域水质较差,而且水中生物越来越少,污水的不合理排放还会产生部分恶臭气味,污染大气环境,污水中的有害物质在食物链、水循环作用下回归,从而危害到人们的人身安全。

所以,基于生态环境监测的城市环境保护工作、污水治理十分必要。

2城市环境工程污水治理的现状现阶段国内缺乏完整的污水治理管理制度,缺乏完整的污水管理系统,在参与污水治理管理时,并未形成良好的监督管理体系。

微生物学研究的最新进展及其应用

微生物学研究的最新进展及其应用

微生物学研究的最新进展及其应用微生物学是研究微生物及其生态、生理、遗传学、生物化学及其与疾病、卫生、农业、环境、工业、能源等的科学。

随着科技的发展,微生物学的研究也在不断深入。

最新进展1. CRISPR-Cas9技术CRISPR-Cas9技术是指利用CRISPR-Cas系统进行基因编辑的方法。

这种技术能够将DNA序列切除或替换成新的DNA序列,导致基因组的特定部分发生变化。

CRISPR-Cas9技术被广泛应用于微生物学研究中,如构建抗药性菌株、探究微生物代谢途径等。

2. 基因组学基因组学是指对生物体的基因组进行全面研究。

近年来,基因组学在微生物学中的应用日益广泛。

通过对微生物基因组的分析,可以了解微生物代谢、毒力、抗药性等方面的信息,从而开展微生物防治、抗菌药研发等。

3. 合成生物学合成生物学是指将生命体系的分子元件进行组合和重新编程,为生命进程设计新的组织、细胞和生物功能。

在微生物学中,合成生物学被广泛应用于微生物代谢、细胞生长、生物制品生产等领域,为微生物工业化生产开辟了新途径。

应用1. 小分子化合物开发小分子化合物是指分子量小于500的化合物。

微生物学可用于小分子化合物的开发。

利用微生物合成反应途径,可生产大量的小分子化合物,如药物、抗生素等。

2. 食品加工微生物在食品加工中发挥着重要作用。

酸奶、豆腐、面包、啤酒等都是利用微生物发酵而制成的。

微生物学研究可为食品加工提供新的技术支持,如开发新的微生物种类,制造新的发酵食品等。

3. 环境治理微生物在环境治理领域也具有重要作用。

微生物可以降解污染物,改善水质和土壤质量,修复受污染的环境等。

微生物学研究为环境治理提供了一系列新的治理方法和技术手段。

4. 医学疾病微生物学在医学疾病方面具有广泛的应用。

利用微生物学技术,可以开发新的抗生素,治疗感染性疾病等。

同时,微生物学研究还可以了解致病菌的致病机理和病原菌抗药性的原因,为治疗和预防疾病提供新的思路和方法。

生物学在环境保护中的新技术

生物学在环境保护中的新技术

生物学在环境保护中的新技术随着人类活动的不断增加,环境污染问题日益突出。

为了保护和改善环境,生物学科学家不断努力开发新的技术手段。

本文将讨论生物学在环境保护中的新技术及其作用。

一、植物修复技术植物修复技术是一种利用植物吸收、转化或稳定污染物的方法。

植物具有吸收污染物、增加土壤稳定性和提供生境的能力。

例如,水生植物如芦苇和莎草可以吸收水中的重金属离子,从而净化水体。

植物修复技术具有经济效益和环境友好的特点,可以用于处理污染土壤和水体。

二、基因工程技术基因工程技术是通过改变生物的遗传物质来改善其性状或功能的技术手段。

在环境保护中,基因工程技术可以被应用于改良植物和微生物,以提高它们对污染物的降解能力。

比如,通过基因工程改造细菌,可以使其产生特定的酶,进而降解有机物污染物。

三、生物降解技术生物降解技术是利用微生物降解有机污染物的方法。

通过培养、研究和筛选特殊的微生物,可以获得具有高效降解能力的菌种。

这些菌种可以利用有机物作为能源和营养源,并将其转化为无毒或低毒的物质。

生物降解技术具有高效、经济和环境友好的特点,广泛应用于废水和废弃物的处理。

四、生物吸附技术生物吸附技术是通过微生物或其他生物体吸附污染物的方法。

生物吸附材料可以是天然的,也可以是经改良的。

生物吸附技术被广泛应用于废水处理、气体净化和重金属去除等领域。

它具有高效、经济、易操作和可再生的特点。

五、生物传感器技术生物传感器技术是利用生物材料对环境中的化学或生物学变化做出反应,并将其转化为电信号的技术。

生物传感器可以用于监测环境污染物的浓度、种类和来源。

此外,生物传感器还可以用于检测环境中的重金属离子、有机物污染物和病原体等。

六、基因组学和蛋白质组学技术基因组学和蛋白质组学技术是利用高通量技术研究生物体遗传信息和蛋白质表达情况的方法。

这些技术可以用于分析环境中微生物的种类和功能,以及生物体对污染物的响应机制。

通过对基因组学和蛋白质组学的研究,可以揭示生物体的适应性和响应机制,从而为环境保护提供科学依据。

微生物的基础科学研究与应用

微生物的基础科学研究与应用

微生物的基础科学研究与应用微生物是指生物体积极地参与环境、人类和其它生物体的生存活动。

微生物的种类繁多,包括细菌、真菌、病毒等,它们扮演着极其重要的角色,生活在各行各业,从土地到水中,从人体内到宇宙空间。

微生物的基础科学研究及其应用将使我们更深入地了解微生物的生态环境、生命过程、生理学和基因组学,更全面高效地应用微生物带来的各种好处。

一、微生物的基础科学研究1. 微生物基因组学微生物基因组学是对微生物基因组序列的解析和分析。

随着高通量测序技术的快速发展,敏感的分析技术已经被广泛应用于微生物基因研究领域。

这种基因研究的最主要的挑战是如何来知晓每个基因在生物内部的作用和功能。

研究者们希望通过对基因组和它们的表达在细胞中的编译的了解,来推断出基因之间的相互作用的情况,以及它们参与复杂生物环境中的资源利用和代谢的过程。

2. 微生物的生物化学和分子生物学微生物的生物化学和分子生物学的研究最主要关注的是微生物的代谢和遗传物质,它们如何在不同的环境下适应,并进行生长和繁殖。

代谢和遗传物质的研究有助于深入了解微生物代谢机制和新型代谢物合成方式,以及其他有可能的新型微生物制剂应用领域。

3. 微生物生态学微生物生态学是研究微生物在不同生态系统中的生物学角色以及它们在非人类物质循环、生态保护、生物资源等方面的应用。

包括土壤、水体、大气、动植物体内、人体等多种生态环境,微生物生态学的研究已经成为破译全球大气和水循环、生态增长和生态景观保护的发展方向,是基础性、前沿的重要科学分支之一。

二、微生物的应用1. 微生物在自然资源保护、治理中的应用微生物是自然界氮、磷、硫循环的重要参与者;微生物可利用或减缓非常规能源的形成,包括如何利用深海油气资源等;微生物是垃圾厌氧处理、城市污水治理和废弃物处理的重要工具等。

微生物的应用及其微机械技术的发展,使得对自然资源更加高效和环保。

2. 微生物在医学、食品、能源和化学工业中的应用微生物在医药、保健、食品、美容等领域中长期具有不可替代的作用;而它们的新型代谢物可以通过生物合成技术,来制造药品、食品和材料等的有用生物化学品;另一方面,微生物本身的代谢也可以用于生产生物燃气、清洁能源,以及从建筑环保与材料等领域,还有化学工业的反应物等操作上。

研究微生物技术在环境工程应用中的作用

研究微生物技术在环境工程应用中的作用

研究微生物技术在环境工程应用中的作用作者:蒋瑞来源:《科学与财富》2017年第27期摘要:随着科学技术的不断进步,出现了许多新兴技术,这些技术被应用于社会生活的各个方面,起到了非常有效的作用。

其中微生物技术被应用于环境工程的建设中,利用微生物的分解和化学作用,对自然环境中的污染问题进行治理,有着成本低廉,效果明显的优点,并且不会对自然环境造成污染,能够对环境中的各类污染问题,如水污染问题,废料处理问题,工业废气排放问题等等,都有着非常好的处理效果。

本文从微生物技术在环境工程中的起到的作用进行研究分析,对微生物技术在各类污染问题上的处理进行详细的分析,旨在能够在环境工程的建设中提供一些帮助。

关键词:环境工程;微生物一、引言因国内工业的快速发展而造成的环境污染问题日益增多,工业废水的不合理排放造成水污染问题,废气的过量排放造成大气污染等等,对生态环境产生了极大的危害,引发的自然灾害如酸雨、雾霾天气、臭氧破坏严重威胁着人类的生存环境和身体健康。

传统的污染治理技术无法有效的处理工业发展带来的污染问题,甚至不科学的处理方式会导致环境的再次污染,造成更严重的环境问题。

在研究新的环境治理方案的过程中,发现微生物能够很好的降解环境污染中的化学物质,对于任何的有害物质都有非常强大的降解作用,并且因为微生物本身就是大自然中存在的生物,不会对大自然造成任何形式上的影响,还能够通过自身作用帮助环境更快的恢复生态平衡。

因此,这种用微生物来处理环境问题的技术正成为环境工程中十分重要的一项应用,为环境污染的治理作出很大的帮助。

二、微生物技术的应用利用微生物技术可以在多个方面起到环境保护的作用,其中,利用微生物技术可以用来监测水质的变化,许多国家的卫生部门将大肠菌群做为检测水源品质的指标之一,我国的水质标准准确说明了大肠菌群的含量,品质为第三级水质的水源中,每升水中大肠菌群的含量大于五万。

对于水中大肠菌群数量的检测,使用发酵法来进行,通过大肠菌群和乳糖进行反应,使乳糖发酵,产生气体这一原理,通过计算定量乳糖产生的气体质量,通过大肠菌群和乳糖反应的化学公式来计算水中所含的大肠菌群的数量,来以此判断当前检测水源的品质。

分子生物学技术及其在环境污染治理中的应用研究进展

分子生物学技术及其在环境污染治理中的应用研究进展

例如,对于某些复杂的环境污染问题,需要研究更加有效的基因工程技术; 对于克隆技术的应用,需要进一步优化和标准化;对于核酸检测技术,需要提高 其灵敏度和特异性等。
未来,随着分子生物学技术的不断发展和完善,相信其在环境污染治理领域 的应用将会越来越广泛。为了有效解决环境污染问题,我们需要进一步加强分子 生物学技术的研究和应用,以期为人类创造一个更加清洁、健康、和谐的环境。
五、结论与展望
环境生物技术在环境污染治理中具有广阔的应用前景。然而,在实际应用中 仍需克服一些局限性,如提高处理效率、降低成本等。未来,随着科技的不断进 步和创新,相信环境生物技术将在环境污染治理领域发挥更大的作用,为人类创 造更加美好的生态环境做出贡献。
谢谢观看
应用进展:在环境污染治理方面,分子生物学技术主要应用在水污染和大气 污染的治理中。对于水污染,科学家们通过基因工程技术,将特定基因导入细菌 细胞内,使其能够分解水中的有害物质。同时,克隆技术也被广泛应用于水环境 监测中,通过对水样中的微生物进行克隆,可以了解水体中各种有害物质的含量 和分布情况。此外,核酸检测技术在环境监测中也发挥着重要作用,可以快速检 测水体中的有害物质,为水污染治理提供科学依据。
总之,环境生物技术在污染治理方面具有很大的潜力和优势,未来需要进一 步加强基础研究和应用研究,提高技术的可行性和经济性,为环境保护事业做出 更大的贡献。
参考内容二
一、引言
随着工业化和城市化进程的加速,环境污染问题日益严重,给人类生活和健 康带来了巨大威胁。为了有效解决环境污染问题,各种环境生物技术应运而生。 这些技术利用生物的特性,对污染物进行降解、转化和去除,为环境污染治理提 供了新的解决方案。本次演示将介绍环境生物技术在环境污染治理中的应用研究。

生物信息学技术在微生物学研究中的应用

生物信息学技术在微生物学研究中的应用

生物信息学技术在微生物学研究中的应用微生物学是研究微生物的生物学科学,微生物就是肉眼看不见的微小生物,包括了细菌、真菌、病毒等多种生物类群。

随着现代生命科学技术的飞速发展,生物信息学技术应用于微生物学研究中,可以得到更加丰富的关于微生物的信息。

本文将探讨生物信息学技术在微生物学研究中的应用。

一、全基因组测序截止2021年,已有数百种微生物的完整基因组测序结果公布了。

全基因组测序可以了解一种微生物的所有基因和蛋白质编码信息,帮助分析该微生物的生存策略、代谢能力、抗药性等生物学特征。

通过对多个物种的基因组进行比较分析,可以更好地理解微生物的进化历史和生境适应能力。

全基因组测序技术同时可以预测微生物的基因功能,预测微生物可能存在的合成代谢路径及其转录表达模式等。

二、转录组测序转录组测序是对微生物转录活动进行大范围检测和分析的技术,可以通过这项技术获取微生物在生长过程中大量的RNA序列信息。

这些数据可以用于研究微生物生长过程中的基因表达模式,寻找差异表达基因、筛选新的代谢途径、判定微生物对外界环境变化的响应等。

这项技术也可以帮助微生物学家更好地理解微生物对其所处生境的适应能力, 包括在不同物理化学条件下的生长模式、适存范围和代谢能力等。

三、蛋白质组学蛋白质组学是对微生物蛋白质组成进行研究的科学技术,在微生物学领域具有广泛的应用。

比如蛋白质组学可以用于一个微生物中不同蛋白质的相对丰度分析,研究微生物的代谢网络、蛋白质与宿主相互作用等重要问题。

核糖体蛋白是细菌中最丰富的蛋白质之一,核糖体蛋白组中蛋白质的数量和组成状况都对细胞生存和对外界环境的适应发挥重要作用。

因此,蛋白质组学得到广泛地应用于微生物学研究中。

四、宏基因组测序宏基因组测序从样本中提取DNA,并对其进行测序、分析,从而获得生态系统中大量微生物的基因组信息。

在过去,微生物研究大多局限于狭窄的群体,而宏基因组测序技术使得科学家可以研究更广泛的微生物群体中的基因组和基因表达等信息。

分子生物学技术在生态环境中的应用

分子生物学技术在生态环境中的应用

分子生物学技术在生态环境中的应用随着科技的不断创新和进步,分子生物学技术的应用范围越来越广泛,不仅涉及到医学、农业、畜牧、生产等众多领域,同时也在环境保护和生态治理中发挥了重要作用。

本文将针对分子生物学技术在生态环境中的应用进行详细阐述。

一、生态环境中的分子生物学技术生态环境是指消息环境、食品环境、空气环境、土壤环境和水环境等各种不同类型的环境,其中每一种环境都会直接或间接地影响到生物体的发育和生存。

在这样的生态环境中,生物体中的基因和分子结构通常是不稳定的,因此需要利用分子生物学技术来对其进行监测和分析。

分子生物学技术的主要包括基因克隆技术、PCR技术、基因表达分析技术、蛋白质组学以及生物芯片技术,并且在生态环境中的应用也十分广泛。

下面,我们将从不同领域的角度来探讨分子生物学技术在生态环境中的应用。

二、在环境污染监测中的应用1.水污染监测随着经济水平的提高和人口的增加,很多地区遭受着严重的水污染问题。

因此在水环境治理中,分子生物学技术被广泛应用以监测水中的微生物污染和有机污染物。

其中最为常见的是PCR技术,使用特异性引物和探针进行定量检测和鉴定致病微生物和污染物。

此外,生物芯片技术可以同时检测多种污染物和微生物,为水环境治理提供了更为有效的手段。

2.空气污染监测分子生物学技术在空气环境中的应用主要涉及到检测空气中的微生物和致病菌。

PCR技术和蛋白质组学被广泛应用于空气微生物的定量检测和鉴定,通过监测空气中的微生物数目以及其变化可以了解到环境的空气质量变化。

这对于保护大众的健康和改善城市环境有着十分重要的意义。

三、在环境保护中的应用1.生物多样性保护生物多样性是地球上不同生物种类和生态系统的多样性,是维持自然平衡和生态稳定的重要基础。

以前的生物多样性研究主要依赖于人工标本和普通生态学方法,建立物种名录和种实体库。

然而,随着分子生物学技术的发展,生物多样性研究也可以通过评估物种多样性和遗传多样性的变异性来实现。

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分子生态学技术及其在环境微生物研究中的应用张于光!,李迪强!!,肖启明"(!#中国林业科学院森林生态环境与保护研究所,北京!$$$%!;"#湖南农业大学生物安全科技学院,湖南长沙&!$!"’)摘要分子生态学作为一门新兴的学科已经成为国内外科学家关注和研究的热点。

目前的分子生态学技术主要有核酸杂交分析技术、特异性()*扩增技术、+,-序列分析、基因芯片技术等。

这些技术在环境微生物研究中的应用主要包括对微生物多样性的研究、种群结构和动力学的研究、代谢活性的研究以及在全球气候变化中对微生物影响的研究。

最后,对环境微生物的分子生态学研究进行了展望。

关键词分子生态学;环境微生物;基因芯片;全球气候变化中图分类号.%/%#%文献标识码-文章编号!$$012$"!("$$0)$01$$’21$&!"#$%&#’()%"#"*+,$%-."#"*+’./012344#5%’15".5.).65(".7$.1’#!5%("85"#"*+91&/+34-,567897:;9!,<=+>8?>:;9!,@=-A.>8B>;9"(!!"#$%&’(&)*$%+,&-!+#./)&#!0)&%*,%!12/#*$*3,45!&’(&)*$%)6,7*/8/#9!$$$%!;"!1&--!&’0-4#%0)&%*,%!:;#4#39)/,!<#/.!124#9$24&!$!"’)3821(’%1-C:D7E9F G;>;9C7D H F I J,B G K F I7K:E F I G K G9L M:C D F I G B F:M G J E F C F:E I M C N G J J M:J O E F P P G E K O P>O F C I>F;8 J>C J C’:J J F;J>G;#-J N E F C F;J,B G K F I7K:E F I G K G9L J F I M;G K G9L B:>;K L>C;7I K F>I:I>O M L D E>O>Q>;9O F J F I J>G;,()*:B N K>R>8 I:J>G;,+,-C F?7F;I F:;:K L C>C,9F;F I M>N,:;O G J M F E J F I M;G K G9L#S M F L:E F7C F O>;B>I E G D>G K G9L C J7O L B:>;K L>;B>8 I E G D>:K O>T F E C>J L,I G B B7;>J L C J E7I J7E F:;O O L;:B>I C,B F J:D G K>I:I J>T>J L,:;O J M F>B N:I J G R9K G D:K I K>B:J F I M:;9F C J G B>I E G G E9:;>C B C#S M F N E G C N F I J G RB G K F I7K:E F I G K G9L J F I M;G K G9L C J7O L P:C:K C G O>C I7C C F O#:$+;"(/2B G K F I7K:E F I G K G9L;F;T>E G;B F;J:K B>I E G D F;9F;F I M>N;9K G D:K I K>B:J F I M:;9F分子生物学及其技术的发展和变革为生态学的研究开辟了新途径,分子生物学与生态学的交叉领域,越来越引起人们的重视,分子生态学便应运而生,微生物分子生态学是其中的重要分支。

应用分子生态学技术,研究者不必培养微生物,而可以直接对环境微生物进行分析来达到目的。

分子生态学技术在环境微生物研究中的应用始于"$世纪’$年代中期,近年来在土壤、环境、海底沉积物、动物肠道等微生物生态系统的研究中得到了快速的发展,已经成为最富有活力的生态学科前沿领域之一。

<环境微生物+,-的获得从自然环境中直接分离微生物核酸,对不能培养的微生物的检测、对决定选择微生物或自然条件下重组基因的命运、对揭示基因型的多态性和在微生态中的变化都是很重要的[!]。

目前从环境样品中提取+,-的方法主要有"种。

首先是细胞提取法。

最初的报道是从土壤中提取细菌+,-,这种方法包括用不同的离心速度从土壤颗粒中分离细菌,然后溶解提取的细胞提取+,-,最后纯化+,-。

4G K D F;等以该方法为基础提取的+,-纯度足够可以对土壤细菌群落特定基因型进行探针检测,以及对提取+,-进行U G7J M F E;分析和限制性酶分析["]。

第"种方法是直接溶解法。

该方法是由提取沉积物+,-发展而来[/]。

直接溶解后在缓冲液中用碱提取+,-,用乙醇沉淀、)C)K浓度梯度离心等纯化提取的+,-。

环境样品中提取+,-总是同时提取了腐殖物质的+,-,因而干扰了+,-的检测和收稿日期:"$$&1$/1"$作者简介:张于光男,博士。

现主要从事环境微生物分子生态学研究。

项目来源:国家“十五”科技攻关项目("$$!V-0!$V!$);林业局重点项目“自然保护区社会经济生态价值研究”!通讯作者2’微生物学杂志"$$0年%月第"0卷第0期W A X*,-<A YZ=)*A V=A<A56U F N J#"$$0[G K#"0,G#0定量。

这些污染可能抑制!"#中的$%&’()聚合酶,干扰限制性酶的消化,降低转化效率和’()的杂交特异性[*,+]。

因为腐殖物质很难去掉,’()纯化是获得足够纯度的关键步骤。

目前发展了不少修改的方法来去除’()的杂质[,],都取得了较好的效果。

!分子生态学研究的主要技术!-"核酸杂交分析技术核酸分子杂交技术是./世纪0/年代发展起来的一种分子生物学技术。

它是基于’()分子碱基互补配对的原理,用特异性的探针与待测样品的’()或#()形成杂交分子的过程[0]。

根据碱基互补配对的原则,被标记(放射性或非放射性的)的核苷酸探针以原位杂交、12345678印迹杂交、斑点印迹和狭线印迹杂交等不同的方法,可直接用来探测溶液中、细胞组织内或固定在膜上的同源核酸序列。

核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的高度灵敏性,使核酸分子杂交技术广泛应用于对环境微生物的检测,定性、定量分析它们的存在、分布、丰度和适应性等研究目的[9]。

!#!$%&扩增技术:;9+年,<3==>?发明了聚合酶链式反应(!"#)技术,该技术的产生给整个分子生物学领域带来了一次重大的革命。

同时,衍生出一系列的生物技术,它们在生态学中的应用,特别是在复杂环境中,对那些混合物内低含量的群体成员或生物群中某个特异基因的检测与研究成为可能。

根据扩增的模板、引物序列来源以及反应条件的不同可以将!"#技术分为:反转录!"#技术(#$@!"#)、竞争!"#("@!"#)、扩增7#()限制性酶切分析技术()#’#))、随机扩增多态性’()技术(#)!’)等。

!#’()*序列分析最充分揭示’()多样性的方法是’()序列分析,尤其是核酸自动测序仪的普遍使用。

同时随着生物信息学的发展,已经有许多功能基因及专门的7#()序列数据库和软件供研究,使基因的序列分析可揭示更高水平的多态性。

!-+基因芯片技术基因芯片(<>A72%77%B)技术于:;;:年首次在1A>68A6杂志上被提出[;],是生物芯片(C>2A5>D)的一种。

该技术是随着人类基因组计划的逐步实施和分子生物学的迅猛发展而产生的。

在短短的:/多年时间里基因芯片的研究和应用取得了巨大的进步[:/]。

与传统的多孔膜核酸杂交技术相比,玻片等为载体的基因芯片提供了更多的优点,如高密度、高灵敏度、快速实时检测、经济、自动化和低背景水平等[::],所以,基因芯片技术能很好地适用于自然环境中的微生物群落的研究。

在探针排列类型的基础上,可以将用于环境研究的基因芯片主要分为E类[:.]。

首先是含有编码关于不同生物化学循环过程关键酶(例如去硝化)的功能基因芯片,该技术可以用于检测自然环境中微生物群落的生理地位和功能活动。

第.种是由含有源于核糖体核酸(7#())基因探针的系统发育的寡核苷酸芯片,该芯片主要是用于微生物群落组成和结构的系统发育分析。

第E种是用纯培养微生物的整个’()基因组构建的群落基因组芯片,根据可培养的成分描述微生物群落。

’分子生态学技术在环境微生物研究中的应用’-"物种多样性的研究F2?46>8G2H?2B7和同事从土壤中提取’()的研究,是对环境中存在的大量神秘微生物基因组的首次探索之一[:E]。

他们估计:I土壤中含有大约*///种不同的原核基因组。

尽管仍然不清楚是否每个基因组代表一个不同的物种,研究的结果表明在一个土壤样品中的物种数超出了原来描述的原核生物种数[:E]。

大量以核酸为基础的不要求分离和培养微生物的方法,在用于检测环境样品中微生物群落的基因多样性中得到了广泛的应用。

简单的说,这些方法包括从自然样品中提取总的群落’()。

某些标记基因通过!"#得到扩增,个体基因通过克隆和测序得到分离。

这些标记序列是同源的,差异(替代/缺失)得到记数,序列间的进化距离用系统发育方法得到分析[:*]。

核糖体核酸(7#())是常用于研究原核生物物种多样性的遗传标记。

在./世纪9/年代,(27J%8!%A6和同事就用核糖体方法研究环境中的微生物多样性[:*]。

他们的工作引起了对大量不同栖息地的研究,包括土壤、海水、沉积物、温泉沉积物等[:+]。

这些研究得到的结果可以总99微生物学杂志.+卷结如下:!在大多数的栖息地,微生物的基因组多样性是丰富的,但是很多物种不能培养;"几乎没有一个从环境中提取!"#获得的$%"#基因序列对那些存在于培养物种中是统一的;#与培养的微生物相比,在高度发散的系统发育树上的一些未知序列产生了新的系统发育关系[&’]。

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