DICOM文件解读
dicom讲义
第十三部分：点对点通信支持的打印管理。 定义了在打印用户和打印提供方之间点对点连 接时，支持DICOM打印管理应用实体通信的必 要的服务和协议。点对点通信框架提供了与第 8部分相同的上层服务，因此打印管理应用实 体能够应用在点对点连接和网络连接。点对点 打印管理通信也使用了低层的协议，与已有的 并行图像通道和串行控制通道硬件硬拷贝通信 相兼容。
第八部分：消息交换的网络通讯支持。说明了 在网络环境下的通讯服务和支持DICOM应用进 行消息交换的必要的上层协议。 第九部分：消息交换的点对点通讯支持。说明 了与ACR-NEMA2.0兼容的点对点通讯的服务和 协议。
第十部分：用于介质交换的介质存储和文件 格式。该部分说明了在可移动存储介质上医学图像 信息存储的通用模型。提供了在各种物理存储介质 上交换不同类型的医学图像的框架，支持封装任何 信息对象定义的文件格式。 第十一部分：介质存储应用框架。用于医学 图像及相关设备信息交换的兼容性声明。给出了心 血管造影、超声、CT、核磁共振等图像的应用说明 和CD-R格式文件交换的说明。
第十四部分：说明了灰度图像的标准显示功能。 这部分仅提供了用于测量特定显示系统显示特性 的方法。这些方法可用于改变显示系统以与标准 的灰度显示功能相匹配或用于测量显示系统与标 准灰度显示功能的兼容程度。 第十五部分：安全措施
第十六部分 内容映射资源(content mapping resource)定义了标准使用的模板和上下文组。 第十七部分 说明信息 第十八部分网络化，而不论设备的 开发商是谁。 有助于开发和推广图像存档和传输系统 （PACS），并能与其它医学信息系统联系。 建立有价值的诊断信息数据库，它能处理地 理上分散的不同设备间的请求。
发展： DICOM以开放式连结系统（OSI）参考模式定下 的7层协议为基础，为影像、公用信息、应用 服务及通讯协议提供了标准模式，允许医学图 像在检查仪器、电脑和医院之间进行交换，医 学影像设备采用此标准数据格式和数据接口后， 其图像可通过网络系统存储和传输。 1982年美国联合成立委员会，制定DICOM标 准，1985 - 公布1.0版本，1988 - 公布2.0版本 DICOM在持续更新中，目前是DICOM 3.0 2004版
dicom文件格式
3.0标准的作用
在影像扫描设备、存储设备、后处理工作站等设备之间交换影像 时，要寻找一种把数字化影像及其信息输入、输出影像设备的方 法。在没有一种工业化的标准之前，每种影像设备上都必须有一 个专门的接口。放射科的影像设备来自多个厂家，它们之间数据 都不兼容。为实现设备的互联，医院必须专门开发或者购买相应 的接口。一个医学影像设备内置有对DICOM标准的支持，那么无 须开发专门的接口,利用DICOM标准的计算机联网技术，就可与 另一台支持DICOM标准的设备直接相连,与医院内可能已经存在 的网络硬件和远程通信设施相连。无论是进行医院内部网络建设、 实现远程临床通信，还是实现远程放射会诊，利用DICOM都会获 益。
3.0标准的特点
它按照多部分的文档结构来组织。通过简化新特性的增 加，这种结构使标准在迅速发展的环境中的演变更为容 易。ISO指示——定义如何去构造多部分文档——已经 加入到DICOM标准的构造中。
它提出了明确的信息对象，并不只是针对图象和图形， 还有研究、报告等。
它为唯一地识别任何信息对象指定了一个确定的技术。 这促进了在网络上运作的信息对象之间的关系的明确定 义。
第三部分：利用面向对象的方法，定义了两类信息对象类：普通性、 复合型。
第四部分：服务类，说明了许多服务类，服务类详细论述了作用与信 息对象上的命令及其产生的结果。
第五部分：数据结构及语意，描述了怎样对信息对象类和服务类进行 构造和编码。
DICOM标准文件内容概要
第六部分：数据字典，描述了所有信息对象是由数据元素组成的， 数据元素是对属性值的编码。
第七部分：消息交换，定义了进行消息交换通讯的医学图像应用 实体所用到的服务和协议。
第八部分：消息交换的网络通讯支持，说明了在网络环境下的通 讯服务和支持DICOM应用进行消息交换的必要的上层协议。
DICOM的名词解释
DICOM的名词解释DICOM（Digital Imaging and Communications in Medicine）即医学数字成像和通信，是一种用于医学图像和相关信息的国际标准。
DICOM被广泛应用于医学影像设备、医疗信息系统和图像处理软件等领域。
本文将介绍DICOM标准中一些常用的名词和概念。
1. DICOM图像DICOM图像是医学成像设备生成的二维或三维图像，如CT扫描、X射线片、核磁共振图像等。
DICOM图像文件通常以.dcm为扩展名，并包含了图像本身的像素数据以及与图像相关的患者信息、设备信息等。
DICOM图像具有跨平台、互操作性强的特点，可以在不同的医疗设备和软件中进行传输、显示和分析。
2. DICOM文件格式DICOM文件格式定义了图像和相关信息在存储和传输中的组织方式。
DICOM文件由一系列的数据元素（Data Element）组成，每个数据元素包含了一个标签、一个值和一些描述信息。
标签用于唯一标识每个数据元素，而值则存储了具体的信息。
DICOM文件采用二进制格式存储，可以通过解析文件头部的元数据来获取图像本身的像素数据。
3. DICOM标准DICOM标准由美国医学影像与生物工程学会（ACR-NEMA）和国际电工委员会（IEC）共同制定，旨在促进医学图像设备和信息系统之间的互操作性。
DICOM 标准规定了医学图像的格式、传输协议、数据元素的定义等内容，确保了不同厂商的设备和软件能够正确读取和解析DICOM图像。
DICOM标准的持续更新和演进，使其成为了医学影像行业的重要基础。
4. DICOM服务DICOM服务定义了医学影像设备和信息系统之间的通信方式和协议。
常见的DICOM服务包括图像查询检索服务（C-FIND）、图像存储服务（C-STORE）、图像传输服务（C-MOVE）等。
这些服务通过网络协议（如TCP/IP）实现，允许不同设备之间的图像传输、共享和查询。
DICOM服务的实现，使得医学影像数据能够在不同地点和时间进行远程交流和访问。
pydicom和SimpleITK分别解析医学影像中dicom文件
pydicom和SimpleITK分别解析医学影像中dicom⽂件⾸先，⽆论是pydicom还是SimpleITK都是需要事先导⼊到python中的库，如果使⽤的是pycharm IDE，可以先创建python3的虚拟环境，然后在虚拟环境下通过file-setting-Project interpreter ，在添加模块⾥⾯直接搜上述两个库的名称，点击安装即可。
pydicom提取单张dicom图像1import pydicom2from matplotlib import pyplot34 ds = pydicom.read_file('C:/Users/****/Desktop/CT000000.dcm')# DICOM⽂件的位置5print(ds.dir()) # 打印所有 DICOM TAG 名6print(ds.dir('Pixe')) # 打印包含 'pat' 的 DICOM TAG7print(ds.PatientName, ds.PatientSex, ds.PatientID, ds.PatientBirthDate, ds.PatientAge) # 打印 DICOM TAG 相应的属性值8print(ds.data_element('PatientName')) # 打印⼀个完整的数据元素，包括 DICOMTAG编码值（Group, Element）, VR, Value9print(ds.data_element('PatientID').VR, ds.data_element('PatientID').value)10 pixel_bytes = ds.PixelData # 原始⼆进制⽂件1112 pix = ds.pixel_array # 像素值矩阵13print(pix.shape) # 打印矩阵维度14 pyplot.imshow(pix, cmap=pylab.cm.bone)15 pyplot.show() # cmap 表⽰ colormap,可以是设置成不同值获得不同显⽰效果,打印dicom图⽚注意，此时可能会报错，报错的地⽅是ds.pixel_array，原因是某些格式的dicom⽂件不能⽤pydicom提取，。
DICOM医学影像文件格式解析
DICOM医学影像⽂件格式解析DICOM医学影像⽂件格式解析dicom协议中⽂⽂档可去csdn下载1.DICOMDICOM(DigitalImaging andCommunications inMedicine)是指医疗数字影像传输协定，是⽤于医学影像处理、储存、打印、传输的⼀组通⽤的标准协定。
它包含了⽂件格式的定义以及⽹络通信协议。
DICOM是以TCP/IP为基础的应⽤协定，并以TCP/IP联系各个系统。
两个能接受DICOM格式的医疗仪器间，可通过DICOM格式的⽂件，来接收与交换影像及病⼈资料。
⽬前，DICOM被⼴泛应⽤于放射医疗，⼼⾎管成像以及放射诊疗诊断设备（X射线，CT，核磁共振，超声等），并且在眼科和⽛科等其它医学领域得到越来越深⼊⼴泛的应⽤。
⽬前采⽤的标准是DICOM3.0，每⼀张图像中都携带着⼤量的信息，这些信息具体可以分为以下四类：（a）Patient（b）Study（c）Series（d）Image每⼀个DICOM Tag都是由两个⼗六进制数的组合来确定的，分别为Group和Element。
如(0010,0010)这个Tag表⽰的是Patient’s Name，它存储着这张DICOM图像的患者姓名。
2.DICOM存储格式DICOM⽂件的整体结构如下表所⽰，先是128字节的导⾔部分（没有实际信息），接着是四个字节组成的"DICM"字符串，然后是若⼲DataElement元素依次排列直⾄⽂件结束。
导⾔"DICM"DataElement DataElement...DataElement128 Byte 4 Byte n Byte n Byte n Byte2.1 DataElement的三种结构DataElement是存储⽂件信息的主体，DataElement的总体结构如下表所⽰：Tag VR（值表⽰法）Len(数据长度)数据值（内容）4 Byte 2 Byte 2 Byte Len ByteTag由2 Byte的组号（group）和2 Byte的元素号(element)组成，VR是DICOM特有的值表⽰法，关于值表⽰法的解释见下⽂按照VR的类型以及是否显⽰VR，DataElement⼜分为三种具体的结构。
Dicom数据格式资料
平滑
空间平滑就是将数据在空间上用一个光滑的函数(通常
是Gauss函数
)去卷积
作用：
1、提高信噪比
2、符合Gauss随机场的要求
3、消除不同被试脑结构之间的细微差别
DICOM数据格式
张静远
DICOM数据格式
DICOM全称为医疗数位影像传输协定（Digital Imaging and Communications in Medicine），是一组通用的标准协定，在对于医学影像的处理、 储存、打印、传输上。它包含了档案格式的定义及网络通信协定。DICOM 是以TCP/IP为基础的应用协定，并以TCP/IP联系各个系统。两个能接受 DICOM格式的医疗仪器间，可借由DICOM格式的档案，来接收与交换影像 及病人资料。
DICOM文件结构
文件头 数据元素 数据元素 数据元素 …… 数据元素 标签 VR 数据长度 数值
文件头
文件头包含了标识数据集合的相应信息，由128字节的文 字导言构成。如果该导言不传达信息，可由十六进制的00 填充。
文件头之后是DICOM前缀，内容是字符串“DICM”，表示 是DICOM文件。
文件头之后是数据集合，文件头也可以缺省。
DICOM医学图像文件格式解析与信息提取
（） ３ 完成特殊的工作（ 如在胶片上打印图像） ；
（） ４ 工作流程的管理（ 支持 ＷＯ Ｋ ＩＴ和状态 Ｒ ＬＳ 信息 ） ； （） ５ 可视图像的质量和一致性 。
简而 言 之 ， Ｉ Ｏ 标 准 是 基 于 内 容 的 医学 图 ＤＣ Ｍ
ＺＨｏ Ｆｅ ｇ Ｕ ｎ
【ｂｔ ｃ】 Ｔ ｉｐｐｒ ｒｆ ｅ ｒ ｅ ｔ ＩＯ ｔ ｄｒ，ｎ ｙｉｏ ｔ ＩＯ ｌ ｆ ｍ ｔｔｅ ｓ ｏ Ｅ Ｄ Ａｓ ｆ ｈ ＤＣ Ｍ ｆ ｒ ａ， ｅ ｆ Ａ — ｓ ｉｌ ｃｂ ｅ ａ ｄ ｌ ｓ ｅ ｉ ｏ ｅ ｈ ｕ Ｌ
Ｍ ｄ ｉ ）是美 国放射学会 和美 国电器制造商协会 ｅｉｎ ， ｃｅ 组织制定的专 门用于医学 图像存储和传输的标准 。 经过十多年的发展 ， 该标 准已经被 医疗设备生产商 和医疗界广泛接受 ， 为医学 图像信息学领域的国 成
际通 用标 准 。
信息对象可以完成五个方面的功能 ： （） １传输和存储完整 的对象 （ 如图像 、 波形和文
据元素一 一对应。它 由组号 和元素 号构成 ， 如 例 （０ ８０２ ） ０ ０ ，０ ０就是组号为 ０ ００ ， ｘ０ ８元素号为 ＯＯ ２ ｘ ００ 的“ 检查 日期” 数据元素 的 Ｔ ｇ ａ 号。Ｄ Ｃ Ｍ 的数据 ＩＯ 字典定义 了许多数据元素标记 ， 涵盖 了大多数 的应
用需 要 。组号 为偶 数 的 是标 准 数 据元 素 ， 体 含 义 具 在 ＤＩＯＭ 的数 据 字 典 中定 义 ； 号 为 奇 数 的为 私 Ｃ 组
・
有数据元素 ， 由用户在使用过程中定义。
３ ・ ２
第 １ 卷・ ５ １ 第 期
周峰 ： Ｉ Ｏ 医学 图像文件格式解析与信息提取 ＤＣ Ｍ
DICOM简要说明
DICOM简要说明一、概述 (2)二、DICOM基本介绍 (3)DICOM解释 (3)DICOM资料的结构 (3)DICOM的服务功能对（SOP） (4)SCU/SCP（ServiceClass User/Provider） (5)DICOM的工作过程 (5)三、常用测试工具介绍 (6)四、实际DVT测试 (7)模拟器配置介绍 (7)Print SCP模拟器 (11)Storage SCU模拟器 (17)Worklist SCP模拟器 (18)DICOM Network Analyzer (19)五、EFILM功能介绍 (24)Storage SCP测试 (26)Storage SCU测试 (27)Query/Retrieve测试 (29)一、概述文档编写目的是为了大家对DICOM有一些基本的了解与一些DICOM测试工具的简单使用方法。
二、DICOM基本介绍引用：DICOM解释DICOM(digital imaging communications in medicine)。
从字面上解释，第一，应用对象是数字化的图像；第二，DICOM规范的核心是“通信”。
综上所述，DICOM可以解释为“医学数字化图像通信/交流的共同规格”，既“医学数字成像和通信”。
DICOM资料的结构一个患者到医院就诊，为了判断他的病灶，医生需要指定不同的检查(例如: CT，MR，超声)，每一项检查都需要由相对应的仪器完成，但仪器产生的是一系列的影像(例如CT产生一组10张，MR产生10张和20张各一组影像)，这些影像和病人如何产生关联呢?在DICOM规格中，使用了相对应的资料结构来描述: 定义出Patient，Study，Series，Image四个层次来存储上述例子。
Patient中包含了该病人的所有基本资料(姓名，性别，年龄等)和医生指定的检查Study;Study中包含了检查种类(CT，MR，B超)和指定检查的Series;Series中包含检查的技术条件(毫安，FOV，层厚等)和图像Image。
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接着昨天，对文件格式的分析：0100h-0119h：这里的02001000将其进行字节转换后为00020010，这里标签的含义是UID，5549即为UI，值域长度为1200，将其字节转换后为0012即为18，表示后面18个字节都是值的内容即1.2.840.10008.1.2。
011ah-0135h：这里的02001200将其进行字节转换后为00020012，值描述还是UI，值域长度为14 00即为20个字节，值的内容为1.2.40.0.12.0.9812.0。
0136h-0147h：这里的02001300将其进行字节转换后为00020013，其值描述为5348即为SH（可见标准第五部分short string），0A00即值域长度为10，其值的内容为0.1B/WIN32。
0148h-015fh：这里的02001600将其进行字节转换后为00020016，其值描述为4145即为AE，值域长度为1000字节顺序转换为0010即为16个字节长度，其值的内容为IRIS后跟12个字节的空格（20）。
0160h-0171h：这里的08000500将其进行字节转换后为00080005，查找标准第六部分得知其为特定字符集（Specific Character Set），0A00字节转换后000A知字节长度为10，后跟两个字节的保留字，从0168h开始为ISO_IR100，表示ISO组织的一个记录号。
0172h-018fh：这里的08000800将其进行字节转换后为00080008，查找标准第六部分得知其为图像类型（Image Type），同上一个数据元一样这个地方也没有表示值，1600字节转换后0016得知字节长度为22，后跟两个字节的保留字，从017ah开始为ORIGINAL\PRIMARY\AXIAL，表示该图像的类型。
0190h-01b1h：这里的08001600将其进行字节转换后为00080016，查找标准第六部分得知其为SOP服务类的UID（SOP Class UID），为什么这里就不需要判断VR而有标签直接得出是属于UI呢？是隐形显示吗隐形显示与显性显示的区别如何从图像中看出来！1A00转换字节为001A即长度为26，后跟两个字节的保留字，从0198h开始为1.2.840.10008.5.1.4.1.1.2，与下面的00080018一起指得是与DICOM文件的传输识别有关的识别码。
01b2h-01f1h：这里的08001800将其进行字节转换后为00080018，查找标准第六部分得知其为SOP实例的UID（SOP Instance UID），3800进行字节转换为0038则为56个字节，后跟两个保留字，从01bah开始为1.2.840.1136.19.2.81.290.23014.32126.1.2.20081217.250500。
01f2h-0201h：这里的08002000将其进行字节转换后为00080020，查找标准第六部分得知其为研究日期（Study Date），0800转换后为0008即八个字节的长度，后跟两个字节的保留字，从01fah开始其值内容为20081217。
0202h-0211h：这里的08002100将其进行字节的转换后为00080021，查找标准第六部分得知其为系列日期（Series Date），0800即八个字节，后跟两个字节的保留字，从020ah开始其内容20081217。
0212h-0221h：这里的08002200将其进行字节的转换后为00080022，查找标准第六部分得知其为Acquisition Date，同上一样在021ah开始其值内容为20081217。
0222h-0231h：这里的08002300将其进行字节的转换后为00080023为图像日期（Image Date），同上一样在022ah开始其值内容为20081217。
0232h-023fh：这里的08003000将其进行字节的转换后为00080030为研究时间（Study Time），这里的值域长度为六个字节，后跟两个保留字，在023ah开始150437。
0240h-024dh：这里的08003100将其进行字节转换后为00080031为Series Time，同上一样在0248h开始为150437。
024eh-0263h：这里的08003200将其进行字节转换后为00080032为Acquisition Time，0E00得知其值域长度为14个字节，后面有两个保留字，从0256h开始值域内容为150453.564159。
0264h-0271h：这里的08003300将其进行字节转换后为00080033为Image Time，0600得知其值域长度为6个字节，后跟两个保留字，从026ch开始值域内容为150500。
0272h-0279h：这里的08005000将其进行字节转换后为00080050为Accession Number，后跟四个保留字。
027ah-0283h：这里的08006000将其进行转换为00080060为Modality，0200其字节长度为两个字节，后跟两个字节的保留字，4354即为CT在其中的P是如何得来的吗？0284h-029dh：这里的08007000将其进行转换为00080070为制造商（Manufacturer），1200其字节长度为18个字节，后跟两个保留字，从028ch开始为值的内容即GE MEDICAL SYSTEMS。
029eh-02c1h：这里的08008000将其进行转换后为00080080为机构名称（Institution Name）,1C00其字节长度为28个字节，后跟两个保留字，从02a6h开始为值的内容即People HSP of Dangshan Anhui。
02c2h-02c8h：这里的08009000将其进行转换后为00080090为Referring Physician’Name，（相关医师的名字）后面为四个字节的保留字。
02c9h-02d3h：这里的08001010将其进行转换后为00081010为Station Name，0200的长度为二个字节，后面为两个字节，其值域的内容为4354即CT。
02d4h-02ddh：这里的08003010将其进行转换后为00081030为研究描述（Study Description），其值域长度为0200即两个字节，后面跟两个保留字，值域为H（还有一个空格）。
02deh-02f1h：这里的08009010将其进行转换后为00081090为厂商的模块名称（Manufacturer’Model Name），其值域长度为0C00即12个字节，后面跟两个保留字，其值的内容为ProSpeed FII。
02f2h-02fdh：这里的10000000将其进行转换后为00100000为组长（Group Length），0400表示值域长度为四个字节，后面跟两个字节的保留字，值域为>。
02feh-030fh：这里的10001000将其进行转换后为00100010为病人的姓名（Patient’Name），0A00表示值域长度为10，后跟两个字节的保留字，值的内容为HENG NAO。
0310h-031dh：这里的10002000将其进行转换后为00100020为病人的ID号（Patient ID），0600表示值域的长度为6个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为98392，这是医生给病人的一个编号。
031eh-0325h：这里的10003000将其进行转换后为00100030为病人的出生日期（Patient's Birth Date），后面为四个字节的保留字。
0326h-032fh：这里的10004000将其进行转换后为00100040为病人的性别（Patient's Sex），值域长度为0200即两个字节，后面跟两个字节的保留字，值的内容为4D即M。
0330h-033bh：这里的10001010将其进行转换后为00101010为病人的年纪（Patient's Age），0400表示值域长度为4个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为019Y。
033ch-0347h：这里的18000000将其进行转换后为00180000为组长（Group Length），0400表示值域长度为4个字节，后跟两个字节的保留字，值域为0。
0348h-0353h：这里的18001500将其转换后为00180015为自身检查（Body Part Examined），0400表示值域为4个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为HEAD。
0354h-035fh：这里的18005000将其转换为00180050为Slice Thickness，0400表示值域为4个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为10.0。
0360h-036bh：这里的18006000将其转换为00180060为KVP，0400表示值域为4个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为120。
036ch-0379h：这里的18009000将其转换为00180090为Data Collection Diameter，0600表示值域为6个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为250.0。
037ah-0391h：这里的18000010将其转换为00181000为Device Serial Number，1000表示值域为16个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为0000290.0023014。
0392h-039fh：这里的18002010将其转换为00181020为软件版本（Software Version(s)）06 00表示值域为6个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为2.04C。
03a0h-03bbh：这里的18003010将其进行转换后为00181030为协议名称（Protocol Name），1400表示值域为20个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为1.10Head5/2i+10/2i。
03bch-03cdh：这里的18005010将其转换为00181050为Spatial Resolution，0A00表示值域为10个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为0.4200000。
03ceh-03e1h：这里的18000011将其转换为00181100为Reconstruction Diameter，0C00表示值域为12个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为250.0000000。
03e2h-03f5h：这里的18001011将其转换为00181110为Distance Source to Detector，0C00表示值域为12个字节，后跟两个字节的保留字，值的内容为949.0750000。