转座子类型

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原核生物转座子类型

原核生物转座子类型

原核生物转座子类型
原核生物的转座子主要有以下几类:
1.插入序列(Insertional Sequence,IS):两端有IR,只编码转座酶。

2.类转座因子(类转座子):结构同IS但不能独立存在,只作为复合子的两端组件。

3.复合转座子:两端由IS或类IS构成,带有某些抗药性基因或其他宿主基因,一旦形成复合式转座子,IS序列就不能再单独移动,只能作为复合体移动。

4.TnA转座子家族:两端为IR可编码转座酶、解离酶和抗性物质。

此外,真核生物的转座子主要包括转座子和反转录转座子两类。

具体分类如下:
1.转座子:包含两类。

a.玉米内的可控制因子,可分为自主性因子和非自主性因子,如Ac-Ds体系。

b.果蝇中的转座子,如P转座子,导致杂种不育。

2.反转录转座子:包含三类。

a.反转录病毒RNA:整合宿主靶DNA。

b.病毒超家族:有LTR,编码反转录或整合酶,可含内含子。

如Ty Copia LINSL1。

c.非病毒超家族:无重复序列,不编码转座产物、无内含子。

如SINSB1/ALU、假基因。

以上信息仅供参考,建议查阅关于原核生物转座子的文献资料或咨询相关生物学家,获取更准确的信息。

转座子的分类

转座子的分类

转座子的分类转座子是生活中常用的连接电机和电动工具的部件,它是利用固定在两个端盖上的导线相互交叉构成的连接件。

它与螺钉,螺栓等紧固件配合,将旋转运动变为直线移动。

常见的连接件有四种,分别是螺钉,螺母,转动轴承以及本文所要讲到的转座子。

在原电动工具上有三类: 1、不可调式(内装式):由固定在端盖上的两根细钢丝拧入调节环,进行调整。

2、可调式:用一根粗铜丝或铁丝代替细钢丝,穿过环形槽孔,然后把手柄和钢丝连接起来,进行调节。

3、定子绕组可分为:通风式转座子和干燥式转座子。

通风式转座子又称为铁壳式转座子。

在这种转座子中,当需要将电机反转时,只要拔下插头,并把转座子上的通风管拔出即可实现反转。

但此种转座子中通风管容易堵塞。

干燥式转座子也叫做铝壳式转座子。

干燥式转座子外壳密封,电机内部有一个放置机油的盒子,当转座子装反时,油会流向电机的外壳,电机受潮而烧坏。

干燥式转座子中的电机外壳不会因为潮湿而进水。

3、定子绕组可分为:通风式转座子和干燥式转座子。

通风式转座子又称为铁壳式转座子。

在这种转座子中,当需要将电机反转时,只要拔下插头,并把转座子上的通风管拔出即可实现反转。

但此种转座子中通风管容易堵塞。

干燥式转座子也叫做铝壳式转座子。

干燥式转座子外壳密封,电机内部有一个放置机油的盒子,当转座子装反时,油会流向电机的外壳,电机受潮而烧坏。

干燥式转座子中的电机外壳不会因为潮湿而进水。

4、不论什么形式的转座子,其通风管都应该安装在电机内部最外层。

5、我国最早出现的转座子是不可调的定子绕组转座子。

早期的不可调转座子不能将电机正反转,通常电机不能逆转,即所谓的“死转子”。

由于上述诸方面的原因,所以不可调转座子在市场上被淘汰。

现代电机转子的设计,采用了先进的结构,包括磁路和机械结构等。

由于这些条件的改善,使得电机的正反转变得简单和轻松。

如图所示,转子包括外环,内环和嵌放转子磁极的滑环。

分类介绍:转座子的种类较多,按连接方式可分为内装式和外装式两种。

DNA的转座(DNA TRANSPOSITION)

DNA的转座(DNA TRANSPOSITION)
DNA的转座 (DNA transposition)
1、转座成分概述
1)转座子(元)或转座元件 (transposon or transposable element): 即能够反复插入到基因中许多位点的特殊DNA片段, 它们可从一个位点转移到另一个位点,从一个复制子到另 一个复制子。(在转移时原来位置上的这些结构依然存在 或不存在)。
b) 转座不是简单的转移,涉及转座子的复制
c) 转座插入的靶位点并非完全随机(插入专一型) Hotspots (热点)
Regional preference ( 在3kb区域内的随机插入) d) 某些转座因子(Tn3)对同类转座因子的插入具有排他性
(免疫性) e) 靶序列在转座因子两侧会形成正向重复 f) 转座因子的切除与转座将产生复杂的遗传学效应
2)特点:
♣ 不必借助同源序列就可移动的DNA片段,即转座作
用与供体和受体之间的序列无关。 ♣ 原核生物和真核生物均有转座子。 ♣ 转座序列可沿染色体移动,甚至在不同染色体间跳 跃。
3)种类与特点
(1) 两种类型: A 简单转座子(simple transposon) 或(插入序列 insertion sequence IS ) B 复合转座子(composite transposon) (2) 特征: a)两端有20~40bp的反向重复序列(IR)
b)具有编码转座酶(transposase)的基因
c)复合转座子除转座酶基因外还有1—数个基因。 d)转座酶催化转座子插入新位点。
A 插入序列 ♣ 最简单,是细菌染色体、质粒和某些噬菌体的 正常组分,是一个自主的单位,每种IS均编码自身 转座所需的蛋白质。 ♣ 命名: IS+编号(鉴定类型) 长度 700~2000bp

遗传学:转座因子的遗传分析

遗传学:转座因子的遗传分析
(2)有4个编码区(0、1、2、3)和3个内含子(1、 2、3)
P因子基因在体细胞和生殖细胞mRNA加工剪切存在差异,产生 不同的蛋白(转座阻遏蛋白和转座酶)
M雌× P雄杂交F1出现杂交劣育的机制:
M品系雌性细胞质内缺失转座阻遏蛋白,P品系雄性细胞核存
在P因子,F1代生殖细胞P因子自由转座,F1劣育
是细菌染色体或质粒DNA的正常组成部分,不含宿主基 因,但都含有编码转座酶的基因。
一个细菌常有多个IS,都可以自主转座,因为自身带有转 座酶
已 知 IS 有 10 余
种 , 长 7685700 之 间 , 两 端有反向重复 序列
图11-7
2.2 转座子(transposon Tn) 较大,一般2000-25000bp 除含转座有关基因外,还带抗药基因和其它基因 复合转座子:两端带有IS 简单转座子:两端没有IS而有简单重复序列IR
被切离而缺失,DR只留下一个 如重组发生在IR之间,结果IR之间的DNA发生倒

图11-31
5.2 诱发基因突变与启动外显子混编
转座子插入某个基因往往导致基因失活:
转座子插入所在基因转录方向相同,转录终止在转座子的 多聚A信号位点,形成半截mRNA 有时也能正常表达—渗漏突变 转座子插入与所在基因的方向相反,前体RNA中的转座子 序列在转录后加工切除,编码正常
有的后代完全是有颜色
麦克林托克的伟大发现
1940-1950,McClintock研究玉米胚乳紫色、白色 以及白色背景上带紫色的遗传
1951, McClintock提出了生物基因组中存在转座 因子学说(就是Ac-Ds系统 )(下图)
这些转座因子可沿染色体移动,也可以不同染色 体跳跃
这是遗传学发展史中划时代的重大发现

转座子类型资料

转座子类型资料
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插入序列的结构特征
• (1)含短的末端反向重复序列,且每条 链上的反向重复序列可以相互配对形成茎 环结构;
• (2)含编码转座酶的基因(其突变将导 致不能转座);
• (3)在转座子两外侧的靶DNA中存在 5-9 bp 的短正向重复序列。
正向重复序列的形成过程
转座酶
DNA聚合酶和连接酶
插入序列的转座特点
复合转座子的转座特点
• 可以作为一个整体进行转座; • 含有的一个或两个IS元件也可进行单独转座。
类插入序列
指IS10R,IR50R和IS903,它们的结 构和IS相似,但不独立存在。而是作为复 合转座子(compositetransposons)两臂的 组件。
TnA家族
长约5kb左右,两端具有IR,而不是 IS,中部的编码区不仅编码抗性标记, 还编码转座酶和解离酶的DNA序列。
Thank you!!!
4、转座子的转座机制
所有转座子的共同机制: 在靶DNA上造成交错切口,转座子与突出的末端
相连,填补缺口。 据转座子的移动机制,可分为: ◆复制型转座(replicative transposition) ◆非复制型转座(nonreplicative transposition) ◆保守型转座(conservative transposition)
II类转座因子家族 P Hobo Mariner FB Tc1 Ac/Ds Spm/dsom Mu/mn Tam1 Tam3 TU/puppy
ITR
TSD
31
8
12
8
28
2

9
54
2
10/11
8
13
3
200
9

转座因子介绍

转座因子介绍

宿主 DNA
过量的 OUT-RNA 与其配对,抑制 IN-RNA 的转录
甲基化阻止转录酶和 DNA 结合
甲基化阻止转录酶合成 图 23- 46 几种抑制 Tn10 专座的机制,主要是通过控专座酶的合成来调节
主要类型转座子
类型
细菌插入序 列(IS)
结构特征
TIRs;转座酶和或拆 分酶编码基因 IS组份;抗药基因 TIRs;蛋白质编码 基因(有内含子)
表 复合转座子的结构和功能
转座因 子 Tn903 Tn9 Tn10 长 度 (bp) 3100 2500 9300 遗传标 记 KanR CamR TetR 末端组 件 IS903 IS 1 IS 10R IS 10L Tn5 5700 KanR IS 50R IS 50L 反向 1 bp的改变 反向 有2.5%的 差异 方向 反向 正向 二组件的关 系 相同 推测相同 组件的功能 二者皆有功 能 预计有功能 有功能 无功能 有功能 无功能
① 如IS1因子不论以什么方向插入都会降低基因的表达,
②而IS2因子以同一方向插入到染色体中,则会减少基因的表 达,但以相反方向整合,则会增加基因表达。 ③不同转座元件的转座频率不同。一般为10-3-10-4 次/世代。 ④恢复频率则很低(通过精确切除IS元件而产生),为10-6-10-10/ 代。比插入频率率低 10 -3 倍。
• 3.复合转座子在两个末端有IS序列 • 4.首先,在靶位点处产生一个交错切口,切 出转座子。接着,转座子与靶位点连接。 最后,填补插入位点两侧的单链区。 • 5.转座子转座时能够导致宿主序列的缺失、 重复或插入。另外,转座子通过宿主重组 系统导致基因组重排。
2 复合转座子(composite
transposon)

分子生学技术-第七章 DNA的重组与转座

分子生学技术-第七章 DNA的重组与转座

2、复合式转座子
它是一类较复杂的转座子,由两个重复序列 夹着一个或多个结构基因组成。除了含有转位相 关的功能外,还带有一些其他基因,如抗药性基 因、抗重金属离子基因等。 它们都具有末端反向重复序列、可编码基因 和插入位点的正向重复序列
TnA转座子:
结构较复杂,长度约5000bp。两端没 有IS结构,仅含有两个末端反向重复序列, 一般约38bp。内部通常含有转位相关的基 因和抗药性基因等,插入位点约5bp。
②果蝇中的转座子—P转座子 两端有31bp的反向重复序列,靶位点产生8bp 的正向重复序列,有四个外显子和三个内含子, 在体细胞中,只有前两个内含子被切除,产生一个 转座阻遏蛋白;在卵细胞中,三个内含子全部被切 除,可产生转座酶,导致P转座子转座和后代不育。
四、转座的遗传学效应
a、转座引起插入突变 各种IS、Tn转座子都可引起突变 b、转座产生新的基因 转座上存在一些抗药性基因或抗重金属基因 等
一、霍利迪结构(Holliday Structure)
霍利迪结构:它是DNA重组过程中的一个中间体, 重组时两个DNA双链体以四股DNA在连结点形成的十字 形DNA分子构象。
异源双链 (Hetero duplex):指在重组部位,每条双 链中均有一段DNA链来自另一个双链中的相对链。
分支迁移(Branch migration):一旦两个重组的 DNA分子形成霍利迪结构,交叉连接点很容易像拉链一 样移动,从而扩大异源双链体区域,这一过程叫分支迁 移。
2、Rec BCD核酸酶 Rec BCD蛋白具有DNA解螺旋酶、核 酸内切酶和外切酶的活性。它可以帮助有游 离末端的DNA形成单链DNA片段,从而有 利于RecA 蛋白作用。 它识别并切割Chi序列:5'GCTGGTGG-3'

第五节DNA的转座Transposons

第五节DNA的转座Transposons

5、DNA复制时在前导链上DNA沿5’-3’方向合成,在滞后链上 则沿3’-5’方向合成。( )
6、DNA的复制需要DNA聚合酶和RNA聚合酶( )
7、核小体是由H2A、H2B、H3、H4各两个分子生成的( ) 和由大约200bp DNA组成的。八聚体在中间,DNA分子盘绕在 外,而( )则在核小体的外面。
雄性染色体 P 因子
ORF0 ORF1 ORF2 ORF3
雄性染色体 P 因子
ORF0 ORF1 ORF2 ORF3
P 品系 (P♂×P♀) 雌性染色体 P 因子
ORF0 ORF1 ORF2 ORF3
P♂×M♀ 雌性染色体
P 细胞型 66KD 阻遏物
66K
阻遏物
抑制所 有P因 子转 座
P 细胞型
TnA 转座子家族-两端为 IR,可编码转座酶、解离酶和抗性物质
转 AC-Ds-植物(玉米)中的激活-解离因子
转 座
座 子
P 因子-果蝇中父本因子,在 M♀×P♂中导致杂种不育
因 子
反转录病毒、RNA →DNA→整合宿主靶 DNA
真 核
反 转 录
病毒超家族
Ty Copia LINSL1
(1)有长末端重复序列 (2)编码反转录酶或整合酶 (3)可含内含子
转座子(transposon) 反转录转座子(retrotransposon)
反转录转座子(retrotransposon):指通过RNA为中 介,反转录成DNA后进行转座的可动元件。
IS-两端有 IR,只编码转座酶
原 类转座因子-结构同 IS,但不能独立存在,仅作为复合转座子的两端组件
核 复合转座子-两端由 IS 或类 IS 构成,可编码抗抗菌素物质
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作为一个整体进行转座。
复合转座子
由两个重复序列夹着一个或多个结构
基因如某些抗药性基因和其它基因组成,
其两端的组件由IS和类IS组成。
转座因子 Tn903 Tn9 Tn10
长度(bp) 3100 2500 9300
遗传标记 KanR CamR TetR
末端组件 IS903 IS 1 IS 10R
方向 反向 正向
复合转座子的转座特点
• 可以作为一个整体进行转座; • 含有的一个或两个IS元件也可进行单独转座。
类插入序列
指IS10R,IR50R和IS903,它们的结 构和IS相似,但不独立存在。而是作为复 合转座子(compositetransposons)两臂的 组件。
TnA家族
长约5kb左右,两端具有IR,而不是 IS,中部的编码区不仅编码抗性标记, 还编码转座酶和解离酶的DNA序列。
4、转座子的转座机制
所有转座子的共同机制: 在靶DNA上造成交错切口,转座子与突出的末端
相连,填补缺口。 据转座子的移动机制,可分为: ◆复制型转座(replicative transposition) ◆非复制型转座(nonreplicative transposition) ◆保守型转座(conservative transposition)
BACK
3、转座子的类型
3.1 简单转座子(插入序列)Simple transposon ( insertion sequence)
结构特征和转座特点
3.2 复合转座子 (Composite transposon)
结构特征和转座特点
3.3 类插入序列 (IS-like elements) 3.4 TnA家族
BACK
插入序列的结构特征
• (1)含短的末端反向重复序列,且每条 链上的反向重复序列可以相互配对形成茎 环结构;
• (2)含编码转座酶的基因(其突变将导 致不能转座);
• (3)在转座子两外侧的靶DNA中存在 5-9 bp 的短正向重复序列。
正向重复序列的形成过程
转座酶
DNA聚合酶和连接酶
插入序列的转座特点
BACK
=
Tn3
转座子
靶质粒
第一步 切口DNA


第四步 完成复制



座 第五步
Res位点两侧重组
第二步 连接自由末端 第三步 转座子复制
第六步
Conservative transposition
不供 形体 成保 共持 合裂 体缺 。。
Nonreplicative transposition
5、转座引起的遗传效应
II类转座因子家族 P Hobo Mariner FB Tc1 Ac/Ds Spm/dsom Mu/mn Tam1 Tam3 TU/puppy
ITR
TSD
31
8
12
8
28
2

9
54
2
10/11
8
13
3
200
9
13/14
3
12
8/5

8
反转录病毒的 含有LTR的反转录转座子 反转录转座子
非LTR的反转录转座子
二组件的关系 相同 推测相同
组件的功能 二者皆有功能 预计有功能 有功能
IS 10L
反向 有2.5%的差异 无功能
Tn5
5700
KanR
IS 50R
有功能
IS 50L
反向 1 bp的改变 无功能
复合转座子的结构特征
• (1)中间区域含编码转座酶以外的标记基因; • (2)两端具有插入序列; • (3)两末端是反向重复序列; • (4)靶位点存在短正向重复序列。
转座子
1、转座子的基本概念 2、转座子的转座特征 3、转座子的类型 4、转座子的转座机制 5、转座引起的遗传效应
1、转座子的基本概念
转座子(transposon,简称Tn), 又称易位子,是指存在于染色体 DNA上可以自主复制和位移的一 段DNA序列。
BACK
2、转座子的转座特征
• (1) 基因组内移动; • (2) 不依赖于供体与受体间的序列关系; • (3) 一般仅移动转座子序列本身。
• (1)引起插入突变 • (2)产生新的基因 • (3)引起生物进化 • (4)引起染色体畸变
注:转座引起DNA重排(Rearrangement) 转座子多个拷贝之间的同源重组引起宿主DNA的重排; 转座子重复序列间的同源重组导致精确或不精确切除。
真核生物的转座子
物种 果蝇
线虫 玉米
金鱼草 一些真核生物
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