Pacbio 测序带领我们探索的未知
pacbio测序原理
pacbio测序原理PacBio测序原理。
PacBio测序是一种基于单分子实时测序技术的第三代测序方法，它具有高通量、长读长、低假阳性率等特点，在生物医学研究、基因组学和生物信息学等领域有着广泛的应用。
PacBio测序的原理主要包括DNA样品制备、DNA聚合酶链反应、测序反应和数据分析等步骤。
首先，DNA样品制备是PacBio测序的第一步。
DNA样品可以来源于各种生物组织或细胞，如血液、细胞培养物等。
在这一步骤中，需要对DNA样品进行纯化和质量检测，确保样品的纯度和完整性，以保证后续的实验顺利进行。
接下来是DNA聚合酶链反应（PCR）。
PCR是一种体外扩增DNA的方法，通过PCR可以将少量的DNA扩增成足够用于下游实验的量。
在PacBio测序中，PCR主要用于扩增目标DNA片段，以便进行后续的测序反应。
测序反应是PacBio测序的核心步骤。
PacBio测序采用的是单分子实时测序技术，其原理是将目标DNA片段连接到一种特殊的DNA聚合酶上，形成DNA聚合酶-DNA复合物。
然后，将DNA聚合酶-DNA复合物固定在测序芯片上，通过激光逐个测序DNA片段，实现对DNA序列的高通量测序。
最后是数据分析。
PacBio测序生成的数据量大，需要进行复杂的数据分析和生物信息学处理。
数据分析的步骤包括测序数据的质控、序列拼接、基因组注释等，最终得到目标DNA序列的完整信息。
总的来说，PacBio测序原理是基于单分子实时测序技术，通过DNA样品制备、PCR扩增、测序反应和数据分析等步骤，实现对DNA序列的高通量、长读长、低假阳性率的测序。
这种测序方法在基因组学研究、临床诊断、药物开发等领域有着广泛的应用前景，将为生命科学领域的研究和发展带来新的机遇和挑战。
人类基因组的全面测序
人类基因组的全面测序随着科技的进步，人类基因组的全面测序已经成为了一个可能的事情。
通过这种方式，人们可以更加深入地了解人类基因的构成和结构，掌握关于人类疾病以及其他遗传特征的信息。
虽然这种技术还处于一个相对新的阶段，但是它已经在医学界和科学界引起了广泛的关注和兴趣。
一、什么是人类基因组的全面测序人类基因组的全面测序是指对人类DNA中的每一个碱基进行测序的一种技术。
这种技术可以分为两种不同的方法：第一种是整块测序，也就是将整个基因组分解成许多小的部分，再对每一个小部分进行测序；第二种是定向测序，也就是对于已知具体位置和序列的基因进行测序。
无论采用哪一种方法，全面测序都需要经过多个步骤。
首先，DNA通过化学和物理方法进行提取和纯化。
接着，它会被裂解成许多小片段，并用化学方法连接到一个载体上，例如另一段DNA 或一些其它物质。
然后，这些基因片段会被随机分配到一些不同的载体上，并与每一个载体上的其他序列一起被测序。
最后，计算机程序会把所有的测序结果组合在一起，形成一个整体的人类基因组测序。
二、人类基因组的全面测序的技术的现状人类基因组的全面测序技术目前还处于较为初步的阶段，因此还需要不断的改进和优化。
目前，市面上主要有两种全面测序技术：Illumina和PacBio。
Illumina是一种利用化学荧光的方法对DNA进行测序的技术，其优点是成本低廉，速度快，但是它只能够测序较短的DNA片段，而无法测序整个基因组。
PacBio则是一种比较新的技术，可以测序长达几万个碱基的DNA片段，因此非常适合于测序整个基因组。
但是，它的成本却相对较高。
除了技术方面的改进，人类基因组的全面测序还存在着一些伦理和法律问题。
其中，主要问题之一是如何保护测试数据的隐私。
由于人类基因组的全面测序数据涉及到个人的隐私信息，所以必须要对这种数据进行保密处理。
同时，利用人类基因组全面测序数据开展大规模研究也需要考虑到伦理道德问题，需要尊重个体的权利和隐私。
pacbio测序类型 -回复
pacbio测序类型-回复测序是一种关键的生物技术，用于确定DNA或RNA的序列。
在过去的几十年中，测序技术经历了许多演变和革新。
其中一种最新的测序技术是PacBio测序，该技术以其高质量的长读长为特点，因此在基因组学和生物学研究中得到了广泛的应用。
本文将详细介绍PacBio测序类型的原理、优势、应用以及未来的发展方向。
PacBio测序是由Pacific Biosciences公司开发的一种测序技术。
该技术基于单分子实时测序（Single-Molecule Real-Time sequencing，SMRT）的原理，使用独特的SMRT细胞和DNA聚合酶，能够实现单个DNA分子的实时测序，产生高质量的长读长。
PacBio测序的原理基于DNA的聚合酶链反应（polymerase chain reaction，PCR）。
首先，将待测的DNA片段连接至圆形DNA适配器上，形成一个环状的DNA模板。
然后，将这个环形模板放置在SMRT细胞上。
每个SMRT细胞由一个孔道组成，该孔道中有一个DNA聚合酶和DNA 聚合酶的底物。
当DNA聚合酶与模板DNA结合时，它会开始合成互补的DNA链，并在合成的过程中释放出脱氧核苷酸。
这些释放的脱氧核苷酸通过光学信号被探测并记录下来。
通过持续观察这些信号的时间和强度变化，就可以确定DNA的序列。
与传统的测序技术相比，PacBio测序具有许多显著的优势。
首先，PacBio测序产生的读长通常非常长，通常达到几万个碱基对。
这使得PacBio测序在基因组重组、基因家族分析和结构变异等方面具有独特的优势。
其次，PacBio测序具有高准确性，能够识别和纠正单个碱基对的错误。
这对于复杂基因组的测序和重复序列的分析非常重要。
此外，PacBio测序还能够实时监测DNA合成的过程，因此可以检测到DNA的甲基化修饰和其他表观遗传学变化。
PacBio测序在许多领域都有广泛的应用。
在基因组学研究中，PacBio 测序被用于全基因组测序、基因组重测序和基因变异的检测。
单分子测序PacBio技术和应用解决方案
单分子测序PacBio技术和应用解决方案单分子测序技术是现代基因组学研究的重要手段之一，它以其高通量、高准确性和长读长的特点受到广泛关注。
PacBio公司研发的单分子测序PacBio技术，通过单分子实时测序，为科学家们提供了一种全新的基因组学研究解决方案。
PacBio技术基于SMRT（Single Molecule, Real-Time）技术平台，利用DNA聚合酶复制和DNA测序技术，实现对DNA单分子的实时测序。
相比传统的下一代测序技术，PacBio技术具有独特的优势。
首先，它具备高通量的优势，能够在较短的时间内获得大量的测序数据；其次，PacBio技术具有高准确性，能够有效避免由于PCR扩增等环节引入的测序错误；最重要的是，PacBio技术具有长读长的特点，可以获得几千到几万个碱基的单次读长，有助于解决基因组结构和功能复杂的区域。
在实际应用中，PacBio技术已经展现出了广阔的应用前景。
首先，它在基因组组装和结构研究方面发挥着重要作用。
传统测序技术由于读长限制，对于复杂基因组结构的解析存在困难。
而PacBio技术的长读长能够克服这一限制，促使基因组的完整拼装和结构的精确研究。
其次，PacBio技术在基因组重测序和变异检测方面也具有广泛应用。
PacBio技术通过长读长的特点，能够帮助科学家更准确地鉴定出基因组中的复杂变异，如结构变异、重复序列和长插入片段等。
此外，PacBio技术还被广泛应用于转录组学研究、表观基因组学研究以及种群遗传学研究等领域。
然而，PacBio技术也存在一些挑战和局限性。
首先，PacBio技术在测序过程中存在较高的错误率，尤其是在测序末端。
其次，PacBio技术相对于传统测序技术而言，成本较高，限制了其在大规模样本测序中的应用。
另外，PacBio技术的数据分析复杂度较高，对于研究人员的计算能力和经验要求较高。
为了克服这些挑战，科学家们正在不断探索和改进PacBio技术。
一方面，通过提高机器和化学改进，已经成功降低了PacBio技术的错误率，使其更适用于高准确性的研究需求。
pacbio三代测序原理
pacbio三代测序原理随着生物学的发展，对于基因组的研究和分析也越来越重要。
在基因组研究中，测序是必不可少的一步。
测序技术的发展使得人们能够更加深入地了解基因组和生物学的本质。
PacBio三代测序技术是近年来新兴的一种测序技术，其原理和流程与传统的二代测序有很大的不同。
本文将详细介绍PacBio三代测序的原理和流程。
PacBio三代测序是基于单分子实时测序技术的。
其使用的测序仪是PacBio RS II或Sequel，这些测序仪能够实现单分子实时测序。
与传统的二代测序技术不同，PacBio三代测序能够在单个分子水平上进行测序，因此无需进行PCR扩增和文库构建等步骤，从而避免了PCR扩增引入的偏差和文库构建过程中的损失。
此外，PacBio三代测序还具有长读长优势，能够产生数千到数万的bp长的reads，从而大大提高了测序的准确性和覆盖度。
PacBio三代测序的原理是基于SMRT（Single Molecule Real Time）技术，该技术基于荧光信号实现单分子实时测序。
具体来说，PacBio 测序仪利用荧光标记的四种不同核苷酸（A、T、C、G）在DNA合成过程中的释放来进行测序。
当DNA合成时，DNA聚合酶会在荧光标记的核苷酸加入到新合成的链中时释放荧光信号。
这些荧光信号被PacBio 测序仪捕获并转化为序列信息。
由于荧光标记的核苷酸释放荧光信号的速度是非常快的，因此PacBio测序仪可以实时监测DNA合成的过程，从而实现单分子实时测序。
PacBio三代测序的流程主要分为三个步骤：样品准备、测序反应和数据分析。
首先，需要从样品中提取DNA，并将其质量和浓度进行检测。
接下来，将DNA片段直接加入到PacBio测序仪中，不需要进行PCR扩增和文库构建等步骤。
在测序反应中，PacBio测序仪会将荧光标记的核苷酸加入到新合成的DNA链中，并实时监测荧光信号。
最后，将测序得到的数据进行分析，包括序列拼接、错误校正和注释等步骤，从而得到高质量的基因组序列。
PacBio单分子超长测序
五、测序通量
测序复合物和玻璃底板结合的方式 测序复合物：聚合酶、测序模板、测序引物组成的复合物。 复合物是通过聚合酶连接到玻璃底板上，连接方式是：聚合酶上 标记生物素，玻璃底板上标记链霉亲和素，利用生物素合链霉亲和 素的亲和力，把聚合酶、玻璃底板结合到一起。
五、测序通量
实验过程中，测序复合物是被随机铺撒到15W个小孔中。
PacBio单分子超长测序
主要内容
第一部分： 简介 第二部分： 测序原理 第三部分： 优势&劣势 第四部分： 限制读长因素 第五部分： 测序通量
一、简介
Pacific Biosciences公司（PacBio）的单分子测 序技术，最长的读长可达3万个碱基； 是目前读长最长的二代测序技术。
一、简介
Average： maximun：
~8.5kb >30kb
PacBio的读长分布图
二、测序原理
和其他二代测序一样， PacBio测序也是采用边 合成边测序的方式。 不同的是：
聚合酶是固定在测序 小孔的玻璃底板上。
二、测序原理
聚合酶和DNA模板、测序引物结合在一起；然后加入带四 色荧光的dNTP底物，这些dNTP都在其磷酸基团上标上了荧光 基团，四种碱基各标一种颜色，当一种与正要合成的碱基一致 的dNTP被聚合酶抓住时，酶会长时间的抓住这个dNTP，不让 这个dNTP飘走；这时候，激发光就会从小孔的底部照进来，打 在dNTP上，就会在较长时间内发出荧光，仪器会根据拍到的颜 色进行碱基判读。
四、限量在一定程度上也限定了读长。
五、测序通量
测序通量绝对限制因素： 芯片小孔数 目前一张芯片有15W个小孔，但是并不是每一个小孔都能够产 生有效数据。测序通量在0.3G~0.4G。
单分子测序PacBio技术和应用解决方案
单分子测序PacBio技术和应用解决方案一、技术原理SMRT：single molecular real time SequencingPacBio RS，RS表示Real time Sequencing关键之一：DNA聚合酶基本原理：DNA聚合酶和模板结合，4色荧光标记4种碱基，经过Watson配对后不同的碱基加入，会发出不同光，根据光的波长与峰值可判断进入的碱基类型。
和其他基本测序技术一样，在反应管中进行的是大规模平行的多分子反应，怎样在其中进行单分子反应检测？周围有大量的荧光标记的游离碱基，怎样将反应信号与周围游离碱基的强大荧光背景区别出来？通过一个物理现象解释：ZMW（zero-mode waveguides，零模波导孔）。
例如微波炉壁上可看到有很多密集的小孔。
小孔直径有考究，如果直径大于微波波长，能量就会穿透面板泄露。
如果孔径小于波长，能量不会辐射外部，起保护作用。
在一个反应管（SMRTCell：单分子实时反应孔）中有许多这样的圆形纳米小孔，即ZMW（零模波导孔），外径100多纳米，比检测激光波长小（数百纳米），激光从底部打上去后不能穿透小孔进入上方溶液区，能量被限制在一个小范围（体积20X 10-21L）里，正好足够覆盖需要检测的部分，使得信号仅来自这个小反应区域，孔外过多游离核苷酸单体依然留在黑暗中，将背景降到最低。
单个ZMW底部固定有一个结合了模板DNA的聚合酶，当加入测序反应试剂后，每个碱基配对合成后会发出相应的光并被检测。
一个SMRTCell中有15万个ZMW，每个孔中有一个单分子DNA链在高速合成，如众星闪烁。
原始检测数据的结果，每合成一个碱基即显示为一个脉冲峰，每分钟>100个碱基的速度，配上高分辨率的光学检测系统，就能实时检进行检测。
关键点之二：荧光标记位点。
这是影响测序长度的非常关键的因素。
二代测序都标记在5…端甲基上，在合成过程中，荧光标记物保留在DNA链上，随DNA链的延伸会产生三维空间阻力导致DNA链延长到一定程度后会出现错读。
pacbio sequencing原理
pacbio sequencing原理PacBio测序（Pacific Biosciences sequencing）是一种第三代测序技术，采用了单分子实时测序（Single Molecule Real-Time Sequencing，SMRT）技术原理。
本文将介绍PacBio测序的原理和工作流程，并讨论其优势和应用。
PacBio测序的原理是基于DNA聚合酶的活性。
在测序过程中，DNA模板被固定在一个单个的微小孔中，该孔被称为SMRT细胞。
然后，DNA聚合酶从DNA模板的单链上开始合成新的DNA链。
DNA聚合酶在添加新的核苷酸时会释放出一个荧光信号，这个信号会被检测器记录下来。
PacBio测序的工作流程包括样本准备、测序反应、数据分析和结果解读。
首先，需要从待测样本中提取DNA，并对其进行质量检测和纯化。
然后，将纯化的DNA片段连接到SMRT细胞中，形成DNA 片段库。
接下来，将SMRT细胞放入PacBio测序仪中进行测序反应。
在测序反应中，DNA聚合酶会逐个加入核苷酸，并记录下荧光信号。
这个过程是实时进行的，所以可以获得实时的测序数据。
一旦测序完成，就可以进行数据分析。
PacBio测序产生的数据量较大，需要进行数据过滤和校正。
数据过滤可以去除低质量的测序数据，提高测序结果的准确性。
数据校正可以修正由于DNA聚合酶的错误引入的测序错误。
校正后的数据可以被用来进行序列组装和变异检测等进一步分析。
PacBio测序相比传统的二代测序技术有许多优势。
首先，PacBio 测序可以产生较长的读长，通常在10 kb以上，这使得对基因组结构和复杂变异的研究更加方便。
其次，PacBio测序的错误率较低，尤其是在相同覆盖度下，比二代测序技术更准确。
此外，PacBio测序可以直接检测DNA的甲基化状态，有助于研究表观遗传学。
PacBio测序在许多领域都有广泛的应用。
在基因组学研究中，PacBio测序可以用于基因组组装、变异检测和结构变异分析等。
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匆匆这几年,Pacbio 测序带领我们探索的未知PacBio测序仪是Pacific Biosciences公司研发的单分子实时测序系统（Single Molecule Real Time, SMRT），DNA测序是在SMRT Cell中进行的，其专利SMRT Cell含有15,000个纳米级的零模波导孔（zero-mode waveguides, ZMWs），每个ZMW都能够包含一个DNA聚合酶及一条DNA样品链进行单分子测序，并实时检测插入碱基的荧光信号。
该平台无需扩增即可直接对单个分子进行测序，有效避免了PCR扩增偏好性及GC偏好性。
同时，可利用测序过程聚合酶反应的动力学变化首次实现对碱基修饰进行直接测序，适合传染病、微生物、农业和复杂遗传病的研究。
1动植物全基因组de novo测序（1）鳕鱼鳕鱼基因组（830 Mb）测序项目启动于2008年，由CEES的科学家牵头，早期投入是在454平台上用shotgun和mate-pair测序以及基于BAC的Sanger测序法，但早期组装结果非常不理想，Contig十万个以上，Scaffold上千个，平均每个Scaffold中35%都是Gap，于是他们被迫选择了Pacbio第三代测序。
当我们把PacBio数据导入到之前的Draft中去后，大片段甚至是Kb以上级别的Gap就神奇地消失了，我们之前几年的辛苦在这里瞬间完成了，我们遇到的STR和杂合性问题也迎刃而解了。
“我们之前从没见过如此之快的组装速度，全程才用了36小时。
”（2）仿刺参中国科学院海洋研究所在天津生物芯片的技术支撑下，突破了刺参复杂基因组测序和组装技术瓶颈，采用新一代测序技术获得132gb高质量dna序列数据，覆盖全基因组160倍。
科研人员利用针对高复杂度基因组组装的创新策略，在国际上首次成功完成了野生刺参的基因组组装，目前获得的框架图总长度达到765mb，组装叠连群contign50达112kb，该数值优于国际迄今已发表的多数水产动物基因组图谱的指标。
（3）某二倍体植物某二倍体植物基因组大小为350M左右，且杂合度比较高。
天津生物芯片使用P6-C4试剂组合，进行上机测序，测其全基因组DNA。
最终测得subreads的总数据量为30.4Gb，经过过滤的subreads长度的N50值为15,450bp，subreads 的平均长度为11,054b。
采用TBC研发的拼接策略仅用Pacbio进行denovo拼接，最终获得了321Mb基因组序列，最终拼接结果的Contig N50值达到1.35Mb。
2微生物基因组测序(1)真菌Oklahoma州立大学和Oklahoma大学的科学家联手研究独黑粉菌基因组，该真菌以厌氧状态寄生在大型家畜的胃肠道中，负责降解植物类材质，该研究有望揭示并合理利用降解功能基因，最终发表在ASM journal Applied and Environmental Microbiology，标题为The Genome of the Anaerobic Fungus Orpinomyces sp. Strain C1A Reveals the Unique Evolutionary History of a Remarkable Plant Biomass Degrader。
经分离的C1A菌株拥有大型真菌基因组，超过100Mb，共16000个以上的编码基因。
这项研究的难点是，C1A菌株的GC含量超低，仅17%，可以说是他们见过的GC含量最低的物种。
不仅如此，这个菌株还有一个非常罕见的特征，即基因间的非编码区域非常大，占据了73%，里面大量SSR，占整个基因组5%的比例，可以说是他们见过的最复杂的真菌。
研究人员最开始基于Illumina的Paired-End技术，测了290X覆盖度，但组装效果非常糟糕，Contig数为82325个，N50仅为1666bp，而且其中32.4%都是长度仅300-900的短Contig，于是他们只好加测了10X覆盖度的PacBio数据，最终使QV值达到59.7，即准确率接近99.9999%。
“最终的组装结果使N50/N90获得了不可思议的提升，特别是发现了大量之前在Illumina结果中丢失的内含子信息，其中主要都是SSR。
”参与研究的Mostafa Elshaheda教授说道。
有了接近完整图的基因组信息后，研究人员进行了下一步的功能性研究。
他们发现C1A菌株是个令人非常震惊的生物降解器，对植物材质的适用性非常广泛，比如对柳枝、玉米秸、苜蓿等这些性质不同的植物都可以降解，几乎所有他们尝试的植物都可以适用，这一特点使得C1A有望应用到生物燃料生产中去。
(2)细菌PacBio RS II测序系统无需PCR的建库技术，大大减少了高GC基因组所带来的偏好影响；领先的超长测序，reads 读长10-14kb，有效提高基因组组装精准度和完整性，可更精确检测基因组变异及修饰情况，更适用于微生物基因组研究。
美国国立卫生研究院（NIH）和Pacific Biosciences的研究人员利用PacBio的单分子实时（SMRT）测序技术，解析了与肠杆菌（Enterobacteriaceae）相关的医院获得性感染中质粒介导的抗生素耐药性。
这项成果发表在2014年的《科学-转化医学》上。
最近几年，美国频频出现“超级细菌”感染。
当研究人员筛查超过14,200个患者样本及数百个从医院环境中采集的样本时，研究小组追踪到10名患者，携带了包含KPC阳性质粒的肠杆菌。
还有两名患者在出院后被检测出KPC肠杆菌呈阳性。
研究人员之前试图利用短读取（short-read）测序技术对含有KPC的质粒进行测序和追踪，但遇到了一些问题。
Segre解释道，部分原因在于含有抗性基因的质粒往往含有大的、移动的遗传元件。
她指出，以这项研究中的碳青霉烯耐药性质粒为例，KPC基因的两侧伴有Tn4401转座子，伸出去多达10,000个碱基。
因此，在试图鉴定每个细菌细胞中的多个质粒时就面临挑战。
为了解决这个问题，研究人员决定利用PacBio的RSII 系统来产生单分子的长读取，这让他们能够同时查看细菌基因组的序列和质粒的序列。
利用这种方法，他们对2012-2013年鉴定出的12名KPC阳性患者的分离株进行了测序，同时对2011年爆发期间采集的2个分离株和医院内的6个环境监控样本进行了测序。
3全长转录本Iso-Seq测序基于PacBio SMRT单分子实时测序技术的全长转录组测序无须打断RNA片段，使用RACE技术反转录得到的全长cDNA。
该平台的超长读取（median 10kb）包含了单条完整转录本序列信息，后期分析无需组装，所测即所得。
其测序结果可直接用于后续的Isoform、同源基因、基因家族、等位基因、可变剪接、lncRNA 等分析。
引导人们更深层次的理解位于中心法则中心地位的这一生命活动，另外还可用于对所在基因组的注释升级，完善基因组数据库。
2013年10月的Nature biotechnology上斯坦福大学的Sharon等用PacBio对人的20个不同组织样本未打断的转录组进行了测序，通过比较分析，发现CCS re ads大部分为全长转录本序列，且无论是长度还是reads质量以及转录本完整性等方面都要远远优于454测序结果。
共鉴定出了约14000个spliced GENCODE genes，超过10%的部分有新的结构，而比对到未注释区域的转录本有相当一部分具有lncRNA的特征。
结果有力的证明了PacBio对复杂真核生物进行全长RNA分子深度测序的可行性。
天津生物芯片借鉴《PNAS》文章将Illumina与PacBio的测序技术结合起来解决异构体鉴定和定量的成功经验，将我司第三代测序平台PacBio RS II用于RNA-seq ，可以直接得到从5’端到3’端的高质量全长转录本信息，转录组不再需要组装，所测即所得。
同时结合第二代测序低价格、海量数据、高准确率读长等优点，从而高性价比地得到基因的全长isoforms序列，同时使得isoforms定量更加可信，大大缩短后续的应用分析时间。
4 复杂遗传病的研究（1）利用新的基因组测序技术，研究人员揭示出了人类基因组中从未见过的遗传变异2014年11月10日的《自然》（Nature）杂志上。
该文利用PacBio单分子实时测序测序技术，揭示出了人类基因组中成千上万从未见过的遗传变异。
这些研究发现关闭了长期以来因无法测序造成的许多人类基因组作图缺口，这一发现被业界评论为首次构建了白金人类基因组！领导这一研究小组的是华盛顿大学基因组学系教授、霍华德•休斯医学研究所研究员、弗雷德•哈钦森癌症研究中心人类生物学部兼职教授Evan Eichler博士，其主要从事于基因组学与生物信息学研究，是国际上进行人和其他灵长类动物比较功能基因组学与生物信息学研究的顶尖科学家。
Eichler说：“长期以来科学家们对许多疾病的遗传病因都感到困惑不解。
这一称作为单分子、实时DNA测序(SMRT)的新技术，使得研究人员现在鉴别出这些疾病背后的潜在遗传突变成为了可能。
现在，我们进入到了以往对我们来说不透明的一个遗传变异的全新领域。
”这一由生物研究公司Pacific Biosciences of California Inc开发的“长读”技术，使得研究人员能够构建出相比以往更高分辨率的基因组结构变异图谱。
研究的主要作者、Eichler实验室博士后Mark Chaisson开发出了这种方法，使得利用这一数据以碱基对分辨率来检测结构变异成为了可能。
（2）PacBio用于HLA分型研究优势明显HLA分型，人体器官移植中，准确的HLA分型很重要。
HLA是一个长片段，而且单体型对配型成功、移植成功有重要意义。
现在医学上正在尝试用PacBio 的序列来为HLA准确分型提供解决方案。
2015年5月，《PLOS One》刊登了安东尼·诺兰研究所科学家的一项可行性研究。
该研究取两例血液样本，两例唾液样本及三例已知HLA分型的细胞系样本，通过PacBio RS II对样本进行单分子实时测序，获得3个HLA-I等位基因全长序列，每个基因测序深度达到150X。
同时，研究人员还运用了Luminex LABType 序列特异性的寡核苷酸分型试剂盒对上述样本进行了分型。
该研究还发现了4个新的HLA等位基因，并通过了Sanger测序验证。
研究结果显示，单分子实时测序技术可以很好地应用于高通量HLA分型中。
研究人员在文章中强调，相比于其他测序平台，该技术能够对同聚体域进行更精准的测序。