核酸的酶促降解及核苷酸代谢
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核酸降解与核苷酸代谢

嘧啶碱的分解
不同生物嘧啶碱的分解过程也不 一样,一般情况下含氨基的嘧啶要 先水解脱去氨基,脱氨基也可以在 核苷或核苷酸水平上进行。
2.嘧啶碱的分解
NH 2 N
N
O
H
-NH2
β-丙氨酸
O
NH
二氢尿嘧啶
N
O
H
(开环)
H2O
H2O
β-脲基丙酸
嘧啶还原途径的分解
-CH3
嘧啶分解
• 其中二氧化碳经呼吸道排出体外,氨在
AMP激酶
AMP + ATP —— 2ADP
glycolytic enzymes or oxidative phosphorylation
ADP —— ATP
2 .ATP通过核苷单磷酸激酶生成其他NDP
ATP + NMP —— ADP + NDP
3.NTP的生成
核苷二磷酸激酶
XTP + NDP
XDP + NTP
肠黏膜细胞中还有核苷酸酶 (磷酸单 酯酶),水解核苷酸为核苷和Pi。
脾、肝等组织中的核苷酶进一步水解 核苷为戊糖和碱基。
核酸酶
核酸
核苷酸酶
核苷酸
磷酸
核苷酶
核苷
戊糖
碱基
(嘌呤碱,嘧啶碱)
核酸酶(Nuclease)
核酸酶是作用于核酸磷酸二酯键的水 解酶,包括核糖核酸酶(RNase)和脱氧核 糖核酸酶(DNase),其中能水解核酸分子 内磷酸二酯键的酶又称为核酸内切酶 (endonuclease),从核酸的一端逐个水解 下核苷酸的酶称为核酸外切酶 (exonuclease)。
NH 2 N
N
N H
N
第十一章 核苷酸代谢

续;
叶酸结构类似物
阅读:
氨甲蝶呤是一类重要的抗肿瘤药物,对急性白血病、绒 毛膜上皮癌等有一定疗效。这类药物能够抑制肿瘤细胞 核酸的合成,但对正常细胞亦有影响,故毒性较大,限 制了临床上的运用;
作为二氢叶酸还原酶特异抑制剂,在实验室可用于配制
选择培养基,筛选抗性基因或鉴定胸腺嘧啶核苷激酶基
因,十分有用。
UMP是胞苷酸(CMP)和胸苷酸(TMP)的前体; 合成嘧啶核苷酸时首先形成嘧啶环(与嘌呤核苷酸不
同),再与PRPP结合成为UMP;
关键中间化合物 —— 乳清酸;
生物利用CO2、NH3、Asp、PRPP首先合成尿苷酸(UMP)
P240图11-9
UMP是胞苷酸(CMP)和胸苷酸(TMP)的前体
P240图11-10194 Nhomakorabea年 结论:DNA是生命的遗传物质
更有说服力的噬菌体实验
1952 年 , Hershey 和 Chase 病毒(噬菌体) 放射性同位素 35S标记病毒 的蛋白质外壳, 32P标记病 毒的DNA内核,感染细菌。 新复制的病毒,检测到了 32P标记的DNA,没有检测到 35S标记的蛋白质, DNA在病毒和生物体复制或 繁殖中的关键作用。 8年的时间
结果说明:加热杀死的S型肺炎球菌中一定有某种特 殊的生物分子或遗传物质,可以使无害的R型肺炎球 菌转化为有害的S型肺炎球菌 这种生物分子或遗传物质是什么呢?
纽约洛克非勒研究所
Avery
从加热杀死的S型肺炎球菌将蛋白质、核酸、多糖、脂 类分离出来,分别加入到无害的R型肺炎球菌中,
结果发现,惟独只有核酸可以使无害的R型肺炎球菌转 化为有害的S型肺炎球菌。
核酸降解和核苷酸代谢

R-5'-P
R-5'-P
5-氨基咪唑-4-羧酸 核苷酸(CAIR)
5-氨基咪唑核苷酸 (AIR)
甲酰甘氨咪核苷酸 (FGAM)
O
C
HO
C
C H2N
N Asp
H2O
ATP
CH
N
合成酶
R-5'-PFra bibliotekCOOH OC
HC N C H
CH2
C
H2N COOH
延胡索酸 N
CH
N
裂解酶
R-5'-P
O
C
H2N
C
C H2N
二、嘌呤核苷酸的降解
AMP
GMP
嘌呤核苷酸的结构
AMP GMP
H(I) 黄嘌呤氧化酶
(次黄嘌呤)
X
G
(黄嘌呤)
黄嘌呤 氧化酶
嘌呤碱的最终 代谢产物
腺嘌呤脱氨酶含量极少 腺苷脱氨酶和腺苷酸脱氨酶活性较高
腺嘌呤脱氨基主要在 核苷和核苷酸水平
鸟嘌呤脱氨酶分布广
鸟嘌呤脱氨基主要 在碱基水平
嘌呤类在核苷酸、核苷和碱基三个水平上的降解
1. 从头合成途径
(1)尿嘧啶核苷酸的合成
2ATP 2ADP+Pi
Gln + HCO3氨甲酰磷酸合成酶Ⅱ
(CPS-Ⅱ )
H2N C OPO3H2 + Glu
O
氨甲酰磷酸
CO2 + NH3 + H2O
2ATP N-乙酰谷氨酸
2ADP+Pi
氨基甲酰磷酸
Pi
线粒体
鸟氨酸
瓜氨酸
鸟氨酸循环
鸟氨酸
尿素
10核酸酶促降解和核苷酸代谢

10核酸酶促降解和核苷酸代谢
核酸酶是一组分子量较大的蛋白质,是DNA和RNA的重要降解酶,可以促进DNA与RNA的合成、降解、改造等反应。
这些反应包括线粒体DNA 的重组和修复、DNA的合成与维护、RNA的转录、基因表达、以及核苷酸代谢等。
除此之外,核酸酶还可以促进核酸复制、转录和翻译等步骤,具有促进基因表达和改变基因组结构,修复和维护DNA和RNA的能力。
核酸酶分子通过承载一组众多的催化朙朙,可以与目标核酸分子特异性结合,从而促进其降解,从而获得活性核苷酸供后续合成、降解及修复反应中进行活性相互作用。
核苷酸代谢是基因表达和维护生物体内水平的重要过程。
它通过把位于染色体中的胞嘧啶转录成嘧啶碱型核苷酸,并通过不断转化的反应来修改基因表达水平,定期的转录修复等,从而维护细胞内的水平。
核苷酸代谢可以通过核酸酶来促进,核酸酶可以促进核苷酸复制、转录和翻译,从而促进核苷酸的代谢。
核苷酸代谢可以在一些特定的细胞有效地合成、降解、传播和重组信号,以改变基因表达组成如RNA和DNA的重组和修复,从而调节基因的水平。
生物化学第十章核酸的酶促降解和核苷酸代谢

①腺苷酸代琥珀酸合成酶 ③IMP脱氢酶
②腺苷酸代琥珀酸裂医解学p酶pt ④GMP合成酶
19
• 嘌呤核苷酸从头合成特点
• 嘌呤核苷酸是在磷酸核糖分子上逐步合成的。 • IMP的合成需5个ATP,6个高能磷酸键。
AMP或GMP的合成又需1个ATP。
医学ppt
20
(3)嘌呤核苷酸合成补救途径
参与补救合成的酶:
医学ppt
27
(4). dTMP或TMP的生成
脱氧核苷酸还原酶
UDP
dUDP
CTP CDP dCDP dCMP
TMP合酶
dUMP
N5, N10-甲烯FH4
FH2
FH4 FH2还原酶 NADP+ NADPH+H+
脱氧胸苷一磷酸
dTMP
医学ppt
28
(5) 嘧啶核苷酸的补救合成
嘧啶 + PRPP 嘧啶磷酸核糖转移酶 磷酸嘧啶核苷 + PPi
六核苷酸,粘端切口 六核苷酸,粘端切口
Sal I
‥ ‥G T C G A C ‥‥ ‥ ‥C A G C T G ‥‥
六核苷酸,粘端切口
Sma I
‥ ‥
‥C ‥G
C G
CG GC
G C
G C
‥‥ ‥‥医学ppt
六核苷酸,平端切口 9
限制性内切酶的命名和意义
例:Eco R I,这是从大肠杆菌(Ecoli)R菌珠中分离出的一种限
AMP
AT医P学ppt ADP
21
•补救合成的生理意义
补救合成节省从头合成时的能量和一些氨 基酸的消耗。
体内某些组织器官,如脑、骨髓等只能进 行补救合成。
医学ppt
第十章 核酸的酶促降解和核苷酸代谢精品PPT课件

如牛胰脱氧核糖核酸酶 ( DNaseⅠ),可切割 双链和单链 DNA ,产物为 5′-磷酸为末端的寡核 苷酸。
三、限制性内切酶
限制性内切酶主要是从细菌中分离得到,能识
别特定的核苷酸顺序,细菌自身的DNA序列已被甲 基化(甲基化酶),不会被水解。因此这些酶仅限 于水解外源 DNA 以保护自身,故称为“限制性” 酶。
(一)核酸外切酶
➢ 作用于核苷酸链的一端,逐个水解下核苷酸。 ➢ 是非特异性的磷酸二酯键
3’-核酸外切酶:从3’-OH 端开始,生成 5’- 单
核苷酸,如蛇毒磷酸二酯酶。 5’-核酸外切酶:从5’-OH 端开始,生成3’单核苷酸,如牛脾磷酸二酯酶。
外切核酸酶对核酸的水解位点
BBBBBBBB
5´ p
RNAase T1
Pu :嘌呤
Py:嘧啶
牛胰核酸酶(牛胰 RNase) 作用于嘧啶核苷酸的磷酸二酯键,其专一作用
于 RNA,对 DNA 不作用。
核酸酶促水解作用部位
二、脱氧核糖核酸酶
脱氧核糖核酸酶专一水解 DNA ,作用方式作为 内切酶,切断双链,或切断单链,作为外切酶有 5′ 3′切割或是 3′ 5′切割。
(1)5’端凸出(如EcoR I切点)
5’-
GAATTC
-3’
3’-
CTTAAG
-5’
5’-
G AATTC
-3’
3’-
CTTAA G
-5’
(2)3’端凸出(如Pst I切点)
5’-
CTGCAG
-3’
3’-
GACGTC
-5’
5’-
CTGCA
G
-3’
3’-
G
ACGTC
-5’
三、限制性内切酶
限制性内切酶主要是从细菌中分离得到,能识
别特定的核苷酸顺序,细菌自身的DNA序列已被甲 基化(甲基化酶),不会被水解。因此这些酶仅限 于水解外源 DNA 以保护自身,故称为“限制性” 酶。
(一)核酸外切酶
➢ 作用于核苷酸链的一端,逐个水解下核苷酸。 ➢ 是非特异性的磷酸二酯键
3’-核酸外切酶:从3’-OH 端开始,生成 5’- 单
核苷酸,如蛇毒磷酸二酯酶。 5’-核酸外切酶:从5’-OH 端开始,生成3’单核苷酸,如牛脾磷酸二酯酶。
外切核酸酶对核酸的水解位点
BBBBBBBB
5´ p
RNAase T1
Pu :嘌呤
Py:嘧啶
牛胰核酸酶(牛胰 RNase) 作用于嘧啶核苷酸的磷酸二酯键,其专一作用
于 RNA,对 DNA 不作用。
核酸酶促水解作用部位
二、脱氧核糖核酸酶
脱氧核糖核酸酶专一水解 DNA ,作用方式作为 内切酶,切断双链,或切断单链,作为外切酶有 5′ 3′切割或是 3′ 5′切割。
(1)5’端凸出(如EcoR I切点)
5’-
GAATTC
-3’
3’-
CTTAAG
-5’
5’-
G AATTC
-3’
3’-
CTTAA G
-5’
(2)3’端凸出(如Pst I切点)
5’-
CTGCAG
-3’
3’-
GACGTC
-5’
5’-
CTGCA
G
-3’
3’-
G
ACGTC
-5’
生物化学_09 核酸降解和核苷酸的代谢

IMP转变为GMP和 转变为GMP (3)IMP转变为GMP和AMP
2、 补救途径
(利用已有的碱基和核苷合成核苷酸) (1) 磷酸核糖转移酶途径(重要途径)
核苷磷酸化酶
嘌呤核苷 + 磷酸 腺嘌呤 + 5-PRPP
次黄嘌呤(鸟嘌呤) 磷酸核糖转移酶
嘌呤碱 + 戊糖-1-磷酸 AMP + PPi
腺嘌呤磷酸核糖转移酶
基因组DNA 基因组 不被切割
限制—修饰的酶学假说 限制 修饰的酶学假说 1968年,Meselson 和Yuan发现了 型限制性核酸内切酶 年 发现了I型限制性核酸内切酶 发现了 1970年,Smith和Wilcox从流感嗜血杆菌中分离纯化了 年 和 从流感嗜血杆菌中分离纯化了 第一个II型限制性核酸内切酶 第一个 型限制性核酸内切酶Hind II 型限制性核酸内切酶
(2)尿嘧啶核苷酸的合成 )
天冬氨酸转氨甲酰酶 二氢乳清酸酶
乳清苷酸焦磷酸化酶/Mg2+ 二氢乳清酸脱氢酶
乳清苷酸脱羧酶
(3) 胞嘧啶核苷酸的合成
尿嘧啶核苷三磷酸可直接与NH3(细菌)或Gln(动物) 细菌) 尿嘧啶核苷三磷酸可直接与 (动物) 反应,生成胞嘧啶核苷三磷酸。 反应,生成胞嘧啶核苷三磷酸。
二、脱氧核糖核酸酶
只能水解DNA磷酸二酯键的酶。 只能水解DNA磷酸二酯键的酶。 DNA磷酸二酯键的酶 牛胰脱氧核糖核酸酶(DNaseⅠ) 牛胰脱氧核糖核酸酶(DNaseⅠ): 可切割双链和单链DNA 降解产物为3 DNA, 可切割双链和单链 DNA, 降解产物为 3’ - 磷酸 为末端的寡核苷酸。 为末端的寡核苷酸。 限制性核酸内切酶: 限制性核酸内切酶: 细菌产生的、能识别并特异切割外源DNA DNA特定 细菌产生的 、 能识别并特异切割外源 DNA 特定 中的磷酸二脂键( 序列中的磷酸二脂键 对碱基序列专一) 序列中的磷酸二脂键(对碱基序列专一)的核酸内 切酶。 切酶。
第八章 核酸的酶促降解

平齐末端 5ˊ突出的粘性末端 3ˊ突出的粘性末端 粘性末端: 经限制性内切酶水解后形成的线状双链 DNA 中每条单链的一端带有 识别顺序中的几个互补碱基,这样的末端称为粘性末端。 d.由于Ⅱ型限制性内切酶识别并切割特定顺序,使大分子 DNA 产生特定片段, 这是重组 DNA 技术和快速测序法得以建立的重要基础。作为分子生物学技术的工具,
生物化学: 核酸的酶促降解和核苷酸代谢 山农大生物化学与分子生物学系 第 1 页 共 8 页
第八章 核酸的酶促降解和核苷酸代谢
第一节 核酸的酶促降解 第二节 核苷酸的降解代谢 第三节 核苷酸的合成代谢
1
生物化学: 核酸的酶促降解和核苷酸代谢 山农大生物化学与分子生物学系 第 2 页 共 8 页
一、降解方式
3
生物化学: 核酸的酶促降解和核苷酸代谢 山农大生物化学与分子生物学系 第 4 页 共 8 页
应用极广。
限制性内切酶的命名较为特殊:如大肠杆菌的一种限制性内切 E——EcoRI
E coR I
细菌属
酶编号
菌名 菌株
5ˊ pGAATTCp
3ˊ 5ˊ pG pAATTCp
3ˊ
3ˊ pCTTAAG
5ˊ 3ˊ pCTTAAp Gp 5ˊ
5
生物化学: 核酸的酶促降解和核苷酸代谢 山农大生物化学与分子生物学系 第 6 页 共 8 页
R5 P ATP
Gln Gly
甲酸
CO2 甲酸 Gln Asp
G TP A sp
AMP
PRPPP P OCH2 O P P
IMP GMP
G ln A T P
二、嘧啶核苷酸的合成
(一)嘧啶环组成成分来源
氨甲酰磷酸 Asp
UDP
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第八章 核酸的酶促降解和核苷酸代谢
第一节 核酸的酶促降解 第二节 核苷酸的降解代谢 第三节 核苷酸的合成代谢
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一、降解方式
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生物化学: 核酸的酶促降解和核苷酸代谢 山农大生物化学与分子生物学系 第 4 页 共 8 页
应用极广。
限制性内切酶的命名较为特殊:如大肠杆菌的一种限制性内切 E——EcoRI
E coR I
细菌属
酶编号
菌名 菌株
5ˊ pGAATTCp
3ˊ 5ˊ pG pAATTCp
3ˊ
3ˊ pCTTAAG
5ˊ 3ˊ pCTTAAp Gp 5ˊ
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R5 P ATP
Gln Gly
甲酸
CO2 甲酸 Gln Asp
G TP A sp
AMP
PRPPP P OCH2 O P P
IMP GMP
G ln A T P
二、嘧啶核苷酸的合成
(一)嘧啶环组成成分来源
氨甲酰磷酸 Asp
UDP