《基于R的统计分析与数据挖掘》课件
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使用R软件进行临床研究方法与数据分析的培训课件

通过绘制多个变量间的散点图,初步探索变量间的线性关系和 非线性关系。
计算多个变量间的相关系数,并用热力图等方式呈现,以揭示 变量间的相关性强弱。
通过主成分分析,将多个相关变量降维为少数几个主成分,并 用散点图等方式呈现,以揭示变量间的内在结构。
通过聚类分析,将多个观测值或变量分组,并用树状图等方式 呈现,以揭示观测值或变量间的相似性和差异性。
使用R软件进行临床研究方法 与数据分析的培训课件
汇报人:
2023-12-31
• 引言 • R软件基础 • 临床研究方法概述 • 数据导入与预处理 • 描述性统计分析及可视化呈现
• 推断性统计分析方法应用 • 结果解读、报告撰写与质量控制
01
引言
目的和背景
临床研究的重要性
临床研究是医学发展的重要驱动力,通过科学的方法收集 和分析数据,为疾病的预防、诊断和治疗提供有力支持。
矩阵(Matrix)
介绍R语言中矩阵的创建、访问和修改方法,以及矩阵运算和常用矩 阵函数的使用。
数据框(Data Frame)
详细讲解R语言中数据框的创建、访问和修改方法,以及数据框的合 并、筛选和排序等操作。
列表(List)
介绍R语言中列表的创建、访问和修改方法,以及列表元素的添加、 删除和查找等操作。
07
结果解读、报告撰写与质量控制
结果解读注意事项及技巧分享
准确理解统计指标
在解读结果时,应准确理解各种统计指标的含义,如P值 、效应量等,避免误解或误用。
01
结合专业知识
结合临床专业知识和背景信息,对结果 进行合理解读,避免单纯依赖统计结果 。
02
03
注意结果的稳定性
关注结果的稳定性和一致性,对于不 稳定或不一致的结果应进一步分析和 探讨。
[课件]RR2 大数据分析PPT
![[课件]RR2 大数据分析PPT](https://img.taocdn.com/s3/m/f09ba9aa680203d8ce2f249a.png)
– 人工神经网络 – 遗传算法
• 信息论方法
– 决策树
• 集合论方法
– 约略集 – 模糊集 – 最邻近技术
• 统计学方法 • 可视化技术
6
生物学方法-神经网络方法
• 神经网络是人工智能领域的一个重要的分支。采用神经 网络设计的系统模拟人脑的结构,而与传统的系统截然 不同。由医学可知,人的大脑中有几十亿个大脑细胞 (称为神经元),这些神经元通过神经中枢的导电神经 纤维互相连接,从而形成一个复杂的脑神经网络。人在 学习某一件事的时候,某些神经元的连接得到强化。
1/12/2018
17
Step 2. Calculate cluster means
e.g Cluster 1 has examples
Cases
1 2 3
Marriage length (yrs)
35 3 7
Wealth ($000’s)
100 20 10
(1,4,7,8,9) Marriage length mean = 27.4 Wealth mean = 128.6
1/12/2018
28 28
关联规则:基本概念
• 给定: (1)交易数据库 (2)每笔交易是:一个项目列表 (消费者 一次购买活动中购买的商品) • 查找: 所有描述一个项目集合与其他项目集合相关性的规则 – E.g., 98% of people who purchase tires and auto accessories also get automotive services done • 应用 – * 护理用品 (商店应该怎样提高护理用品的销售?) – 家用电器 * (其他商品的库存有什么影响?) – 在产品直销中使用附加邮寄
• 信息论方法
– 决策树
• 集合论方法
– 约略集 – 模糊集 – 最邻近技术
• 统计学方法 • 可视化技术
6
生物学方法-神经网络方法
• 神经网络是人工智能领域的一个重要的分支。采用神经 网络设计的系统模拟人脑的结构,而与传统的系统截然 不同。由医学可知,人的大脑中有几十亿个大脑细胞 (称为神经元),这些神经元通过神经中枢的导电神经 纤维互相连接,从而形成一个复杂的脑神经网络。人在 学习某一件事的时候,某些神经元的连接得到强化。
1/12/2018
17
Step 2. Calculate cluster means
e.g Cluster 1 has examples
Cases
1 2 3
Marriage length (yrs)
35 3 7
Wealth ($000’s)
100 20 10
(1,4,7,8,9) Marriage length mean = 27.4 Wealth mean = 128.6
1/12/2018
28 28
关联规则:基本概念
• 给定: (1)交易数据库 (2)每笔交易是:一个项目列表 (消费者 一次购买活动中购买的商品) • 查找: 所有描述一个项目集合与其他项目集合相关性的规则 – E.g., 98% of people who purchase tires and auto accessories also get automotive services done • 应用 – * 护理用品 (商店应该怎样提高护理用品的销售?) – 家用电器 * (其他商品的库存有什么影响?) – 在产品直销中使用附加邮寄
《R语言数据挖掘(第2版)》教学课件—第九章R的特色聚类:揭示数据

BIRCH聚类
聚类特征
第j个小类的聚类特征一般由3组数值组成
聚类特征具有可加性
BIRCH聚类
聚类特征树
利用树形结构反映聚类结果的层次关系
聚类特征树的规模取决于两个参数:分支因子B和阈值T
压缩数据存储空间,各个节点仅存储聚类特征
BIRCH聚类
BIRCH聚类过程: 采用逐个随机抽取和处理观测数据 的方式,建立聚类特征树 初始化聚类特征树,对每个观测做如下判断处理:
核心点P的密度可达点Q:若存在一系列观测点O1, O2,…, On,
且Oi+1(i=1,2,…,n-1)是Oi的直接密度,且O1=P, On=Q,则
称点Q 是点P的密度可达点 噪声点:除上述点之外的其他观测点
DBSCAN聚类
DBSCAN聚类的相关概念
DBSCAN聚类
DBSCAN聚类过程: 第一,形成小类
SOM网络聚类的R实现
som函数
som(data=矩阵,grid=网络结构,rlen=100,alpha=学习率,radius= 邻域半径,n. hood=邻域范围形状)
SOM网络聚类的可视化函数
plot(x=som函数结果对象名,type=图形类型名)
模拟数据的SOM网络聚类
SOM网络聚类的R实现
第四步,调整“获胜”节点Winc(t)和其邻接节点的网络权值
第五步,上述第三步和第四步会不断反复,直到满足迭代 终止条件为止。迭代终止条件是:权值基本稳定或者到达 指定迭代的次数
SOM网络聚类
网络权值调整涉及两个问题 第一,调整算法
第二,怎样的节点应视为“获胜”节点的邻接节点
以Winc(t)为中心 覆盖范围内的输出节点均视为 Winc(t)的邻接节点
R语言数据挖掘(第2版)课件:R的网络分析初步

《R语言数据挖掘(第2版)》
网络的定义表示及构建
网络分析的基础是网络的定义及表示,通常有两种相 互联系的表示方式:图论表示方式、矩阵表示方式
图论表示方式:从图论角度看,网络由多个节点和节 点间的连接(也称边)组成,是一种广义的图
网络可记为G=(N,E) 。网络G中沿着连接在不同节点 间的移动,称为游走
相关R函数:
shortest.paths(graph=网络类对象名, v=起始节点对象, to=终 止节点对象,mode=方向类型)
diameter(graph=网络类对象名 ,directed=TRUE/FALSE,unconnected=TRUE/FALSE)
《R语言数据挖掘(第2版)》
节点“中心”作用的测度
《R语言数据挖掘(第2版)》
R的网络可视化
网络可视化的核心是以怎样的外观轮廓展示网络,尤 其对较为庞大的网络更为如此
合理安排网络外观轮廓的算法
最小分割法:目的是最小化连接间的交叉数 最小空间法:基于几何意义上的空间距离,令空间距离较
近的节点摆放在相邻的位置上 谱分解法:依据节点的特征向量中心度安排节点的位置 树形/层次法:根据节点间的连接将节点安排成树形形状,
edge.betweenness(graph=网络类对象名),可计算连接的中间 中心度
《R语言数据挖掘(第2版)》
节点重要性的其他方面
结构洞
一个系统(网络)中,若某个成员(节点)退出系统,使 得局部系统中的其他成员(节点)间不再有任何联系(连 接)。从结构上看就像局部网络中出现了一个关系断裂的 “洞穴”,该成员称为一个结构洞
在网络G中,若一对节点被两个以上的连接相连, 则称网络G存在多边
若网络G存在环或者多边,则称网络G为多重图。 否则为简单图。网络的分析中,通常需将多重图简 化为简单图后再研究
网络的定义表示及构建
网络分析的基础是网络的定义及表示,通常有两种相 互联系的表示方式:图论表示方式、矩阵表示方式
图论表示方式:从图论角度看,网络由多个节点和节 点间的连接(也称边)组成,是一种广义的图
网络可记为G=(N,E) 。网络G中沿着连接在不同节点 间的移动,称为游走
相关R函数:
shortest.paths(graph=网络类对象名, v=起始节点对象, to=终 止节点对象,mode=方向类型)
diameter(graph=网络类对象名 ,directed=TRUE/FALSE,unconnected=TRUE/FALSE)
《R语言数据挖掘(第2版)》
节点“中心”作用的测度
《R语言数据挖掘(第2版)》
R的网络可视化
网络可视化的核心是以怎样的外观轮廓展示网络,尤 其对较为庞大的网络更为如此
合理安排网络外观轮廓的算法
最小分割法:目的是最小化连接间的交叉数 最小空间法:基于几何意义上的空间距离,令空间距离较
近的节点摆放在相邻的位置上 谱分解法:依据节点的特征向量中心度安排节点的位置 树形/层次法:根据节点间的连接将节点安排成树形形状,
edge.betweenness(graph=网络类对象名),可计算连接的中间 中心度
《R语言数据挖掘(第2版)》
节点重要性的其他方面
结构洞
一个系统(网络)中,若某个成员(节点)退出系统,使 得局部系统中的其他成员(节点)间不再有任何联系(连 接)。从结构上看就像局部网络中出现了一个关系断裂的 “洞穴”,该成员称为一个结构洞
在网络G中,若一对节点被两个以上的连接相连, 则称网络G存在多边
若网络G存在环或者多边,则称网络G为多重图。 否则为简单图。网络的分析中,通常需将多重图简 化为简单图后再研究
R语言数据挖掘(第2版)课件:R的近邻分析:数据预测

旁置法适合样本量较大的情况
留一法
在包含n个观测的样本中,抽出一个观测作为测试样本集, 剩余的n-1个观测作为训练样本集;依据建立在训练样本
集上的预测模型,对被抽出的一个观测进行预测,并计算
预测误差;这个过程需重复n次;最后,计算n个预测误差
的平均值,该平均值将作为模型预测误差的估计
《R语言数据挖掘(第2版)》
R的K-近邻法和应用示例
K-近邻的R函数
knn(train=训练样本集, test=测试样本集, cl=输出变量, k=近 邻个数K,prob=TRUE/FALSE, use.all=TRUE/FALSE)
knn1(train=训练样本集, test=测试样本集, cl=输出变量) knn.cv(train=训练样本集,cl=输出变量,k=近邻个数)
数据的预处理
《R语言数据挖掘(第2版)》
K-近邻法中的近邻个数
最简单情况下只需找到距离X0最近的一个近邻Xi,即 参数K=1(1-近邻) 1-近邻法非常简单,尤其适用于分类预测时,特征 空间维度较低且类别边界极不规则的情况 1-近邻法只根据单个近邻进行预测,预测结果受近 邻差异的影响极大,通常预测波动(方差)性较大, 稳健性低
典型的近邻分析方法是K-近邻法(KNN)。它将样本 包含的n个观测数据看成为p维(p个输入变量)特征 空间中的点,并根据X0的K个近邻的(y1 ,y2 ,…,yk)依 函数计算
《R语言数据挖掘(第2版)》
K-近邻法中的距离
常用的距离: 闵可夫斯基距离 欧氏距离 绝对距离 切比雪夫距离 夹角余弦距离
R的近邻分析:数据预测
《R语言数据挖掘(第2版)》
学习目标
理论方面,理解近邻分析方法的原理和适用性。了解 特征提取在近邻分析中的必要性和提取方法。掌握基 于变量重要性和观测相似的加权近邻法的原理和使用 特点
留一法
在包含n个观测的样本中,抽出一个观测作为测试样本集, 剩余的n-1个观测作为训练样本集;依据建立在训练样本
集上的预测模型,对被抽出的一个观测进行预测,并计算
预测误差;这个过程需重复n次;最后,计算n个预测误差
的平均值,该平均值将作为模型预测误差的估计
《R语言数据挖掘(第2版)》
R的K-近邻法和应用示例
K-近邻的R函数
knn(train=训练样本集, test=测试样本集, cl=输出变量, k=近 邻个数K,prob=TRUE/FALSE, use.all=TRUE/FALSE)
knn1(train=训练样本集, test=测试样本集, cl=输出变量) knn.cv(train=训练样本集,cl=输出变量,k=近邻个数)
数据的预处理
《R语言数据挖掘(第2版)》
K-近邻法中的近邻个数
最简单情况下只需找到距离X0最近的一个近邻Xi,即 参数K=1(1-近邻) 1-近邻法非常简单,尤其适用于分类预测时,特征 空间维度较低且类别边界极不规则的情况 1-近邻法只根据单个近邻进行预测,预测结果受近 邻差异的影响极大,通常预测波动(方差)性较大, 稳健性低
典型的近邻分析方法是K-近邻法(KNN)。它将样本 包含的n个观测数据看成为p维(p个输入变量)特征 空间中的点,并根据X0的K个近邻的(y1 ,y2 ,…,yk)依 函数计算
《R语言数据挖掘(第2版)》
K-近邻法中的距离
常用的距离: 闵可夫斯基距离 欧氏距离 绝对距离 切比雪夫距离 夹角余弦距离
R的近邻分析:数据预测
《R语言数据挖掘(第2版)》
学习目标
理论方面,理解近邻分析方法的原理和适用性。了解 特征提取在近邻分析中的必要性和提取方法。掌握基 于变量重要性和观测相似的加权近邻法的原理和使用 特点
[课件]RR2 大数据分析PPT
![[课件]RR2 大数据分析PPT](https://img.taocdn.com/s3/m/f09ba9aa680203d8ce2f249a.png)
• 通常使用距离来衡量两个对象之间的相异度。 • 常用的距离度量方法有:
明考斯基距离( Minkowski distance):
d (i, j) q (| x x |q | x x |q ... | x x |q ) i1 j1 i2 j2 ip jp
其中 i = (xi1, xi2, …, xip) 和 j = (xj1, xj2, …, xjp) 是两个p维 的数据对象, q是一个正整数。
• 在人工神经网络中,用计算机处理单元来模拟人脑的神 经元,并将这些处理单元象人脑的神经元那样互相连接 起来,构成一个网络。神经网络并非使用编程的方式让 计算机去做某项工作,而是采用所谓“训练”的方法让 神经网络进行“学习”。完成某项工作的正确动作,使 得神经网络的某些连接或模式得到强化;而错误的动作 则使神经网络的相应连接或模式不被强化。从而让神经 网络“学会”如何去做这项工作。
• d(i,j) d(i,k) + d(k,j)
• 可以根据每个变量的重要性赋予一个权重
2018年12月1日星期六 Data Mining: Concepts and Techniques 13
K-平均算法
• 给定k,算法的处理流程如下:
1.随机的把所有对象分配到k个非空的簇中; 2.计算每个簇的平均值,并用该平均值代表相应 的簇; 3.将每个对象根据其与各个簇中心的距离,重新 分配到与它最近的簇中; 4.回到第二步,直到不再有新的分配发生。
当q = 1时, d 称为曼哈坦距离( Manhattan
distance)
2018年12月1日星期六
d (i, j) | x x | | x x | ... | x x | i1 j1 i2 j 2 ip jp
明考斯基距离( Minkowski distance):
d (i, j) q (| x x |q | x x |q ... | x x |q ) i1 j1 i2 j2 ip jp
其中 i = (xi1, xi2, …, xip) 和 j = (xj1, xj2, …, xjp) 是两个p维 的数据对象, q是一个正整数。
• 在人工神经网络中,用计算机处理单元来模拟人脑的神 经元,并将这些处理单元象人脑的神经元那样互相连接 起来,构成一个网络。神经网络并非使用编程的方式让 计算机去做某项工作,而是采用所谓“训练”的方法让 神经网络进行“学习”。完成某项工作的正确动作,使 得神经网络的某些连接或模式得到强化;而错误的动作 则使神经网络的相应连接或模式不被强化。从而让神经 网络“学会”如何去做这项工作。
• d(i,j) d(i,k) + d(k,j)
• 可以根据每个变量的重要性赋予一个权重
2018年12月1日星期六 Data Mining: Concepts and Techniques 13
K-平均算法
• 给定k,算法的处理流程如下:
1.随机的把所有对象分配到k个非空的簇中; 2.计算每个簇的平均值,并用该平均值代表相应 的簇; 3.将每个对象根据其与各个簇中心的距离,重新 分配到与它最近的簇中; 4.回到第二步,直到不再有新的分配发生。
当q = 1时, d 称为曼哈坦距离( Manhattan
distance)
2018年12月1日星期六
d (i, j) | x x | | x x | ... | x x | i1 j1 i2 j 2 ip jp
多元统计分析——基于R 语言 PPT课件-聚类分析

多元统计分析
——基于R语言
中国人民大学:何晓群
苏州大学:马学俊
03
聚类分析
➢学习目标:
1.了解适合用聚类分析解决的问题;
2.理解对象之间的相似性是如何测量的;
3.区别不同的距离;
4.区分不同的聚类方法及其相应的应用;
5.理解如何选择类的个数;
6.简述聚类分析的局限。
3.1 聚类分析的基本思想
3.1.1 目的
的关系越密切; 的绝对值越接近0,表示指标和指标的关系越疏远。对于间隔尺度,常用的
相似系数有夹角余弦和相关系数。
(1)夹角余弦:指标向量 1 , 2 , … , 和 1 , 2 , … , 之间的夹角余弦
ij 1 =
间隔尺度定义
σ=1
+ )个样品,它们的重心用ത , ത , ത 表示,则
1
ത = ( ത + ത )
某一类 的中心为ത ,它与新类 的距离为2 (, ) = (ത − ത )’ (ത −ത ),经证明重心法的递推
公式为:
聚类分析不仅可以用来对样品进行分类,而且可以用来对变量进行分类。对样品的分类
常称为型聚类分析,对变量的分类常称为型聚类分析。与多元分析的其他方法相比,
聚类分析的方法还是比较粗糙的,理论上也不算完善,但由于它能解决许多实际问题,所
以很受实际研究者重视,同回归分析、判别分析一起称为多元分析的三大方法。
和ഥ
间距离。
(5)离差平方和法: = σ∈ ( −ത )′ ( − ത ) , = σ∈ ( −ത )′ ( − ത ) ,
′
+ = σ∈ ⊔ ( −)ҧ ( − ),
——基于R语言
中国人民大学:何晓群
苏州大学:马学俊
03
聚类分析
➢学习目标:
1.了解适合用聚类分析解决的问题;
2.理解对象之间的相似性是如何测量的;
3.区别不同的距离;
4.区分不同的聚类方法及其相应的应用;
5.理解如何选择类的个数;
6.简述聚类分析的局限。
3.1 聚类分析的基本思想
3.1.1 目的
的关系越密切; 的绝对值越接近0,表示指标和指标的关系越疏远。对于间隔尺度,常用的
相似系数有夹角余弦和相关系数。
(1)夹角余弦:指标向量 1 , 2 , … , 和 1 , 2 , … , 之间的夹角余弦
ij 1 =
间隔尺度定义
σ=1
+ )个样品,它们的重心用ത , ത , ത 表示,则
1
ത = ( ത + ത )
某一类 的中心为ത ,它与新类 的距离为2 (, ) = (ത − ത )’ (ത −ത ),经证明重心法的递推
公式为:
聚类分析不仅可以用来对样品进行分类,而且可以用来对变量进行分类。对样品的分类
常称为型聚类分析,对变量的分类常称为型聚类分析。与多元分析的其他方法相比,
聚类分析的方法还是比较粗糙的,理论上也不算完善,但由于它能解决许多实际问题,所
以很受实际研究者重视,同回归分析、判别分析一起称为多元分析的三大方法。
和ഥ
间距离。
(5)离差平方和法: = σ∈ ( −ത )′ ( − ത ) , = σ∈ ( −ത )′ ( − ത ) ,
′
+ = σ∈ ⊔ ( −)ҧ ( − ),
《统计学—基于R》(第4版)课件:类别变量分析

load("C:/example/ch7/example7_1.RData")
example7_1
chisq.test(example7_1$人数)
类型饮料的偏好数据如表7-1所示。
饮料类型
人数
碳酸饮料
525
矿泉水
550
果汁
饮料类型
碳酸饮料
525
500
1.25
矿泉水
550
500
5.00
470
果汁
470
2
× min − 1 , − 1
主要用于大于22列联表的相关
性测量,用C表示。计算公式为
2
由Cramer提出,计算公式
example7_3<-
2
2 +
联系数不可能大于1。当两个变
量独立时,C=0,但即使两个
变量完全相关,列联系数也不
read.csv("C:/example/ch7/e
拟合优度检验——期望频数不相等——例题分析
【例7-2】(数据:example7_2.csv)一项社会学研究认为,离婚率的高低
受教育程度
观察频数
期望比例%
期望频数=期望比例样本量
与受教育程度有关,而且由于社会经济发展程度及生活方式等因素的影响,
小学及以下
30
20
0.20260=52.0
不同地区也有一定差异。在对北部地区离婚家庭的样本研究中发现,离婚
260个离婚家庭的调查中,不同受教育程度的离婚家庭分布如表7-3所示。
检验南部地区不同受教育程度的离婚家庭数与期望频数是否一致( = 0.05)
受教育程度
example7_2<-read.csv("C:/example/ch7/example7_2.csv")
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R表达式中的函数种类很多,从计算目的上
大致分为数学函数、统计函数、概率函数、 字符串函数等 示例:
尽管系统函数能够满足绝大部分的变量计算
需求,但有时也可能无法完成较为繁琐的, 需经多个步骤才能完成的,具有用户个性需 求的计算仸务。如果这个计算具有一定的功 能完整性且应用场合较多,就有必要将其编 写成,或称定义成一个独立程序段,即函数。 与系统函数不同的是,这些函数是用户自行 编写的,因而称为用户自定义函数
示例:
两个数值型变量的相兲性,这里主要指线性
相兲性。一方面,可通过简单相兲系数刻画 样本所体现的相兲性。相兲系数大于零表示 有正的线性相兲性,小于零表示有负的线性 相兲性,等于零表示没有线性相兲性。相兲 系数的绝对值越大,线性相兲性越强;另一 方面,可通过相兲系数检验对样本杢自总体 的相兲性迚行检验
简单的数据管理仸务均可通过顺序调用函数
杢实现。但较为复杂的数据管理还需更为灵 活的流程控制手段。如果将顺序调用函数视 为以一种顺序结极的流程控制,即R程序的 执行过程完全取决于程序语句的先后顺序, 那么,更为灵活的流程控制则包括: 分支结极的流程控制 循环结极的流程控制
分支结极的流程控制是指
示例:
导致缺失数据的主要原因有两类:
第一,数据无法或很难获得。如家庭储
蓄总额等。对此,R用符号NA(Not Available)表示,NA即为缺失值 第二,由于各种原因数据取了明显不合 理的值。如年龄是230岁等。对此,R用 符合NaN(Not a Number)表示,NaN 也是一种缺失值
示例:
由于抽样的随机性以及样本量的影响,简单
相兲系数仅能体现样本所表现的相兲性。样 本杢自的总体是否相兲或无兲,还需要迚行 相兲系数检验 简单相兲系数检验的检验统计量:
t r n2 1 r2
相兲系数检验的R函数是cor.test,基本书写
栺式为:
示例:
cor.test(数值型向量1, 数值型向量2,alternative=检验 方向,method="pearson")
可利用mice包提供的相兲函数 生成缺失数据报告的函数是md.pattern, 基本书写栺式为: md.pattern(矩阵名或数据框名) 示例:
变量计算是在原有数据基础上派生出信息更
加丰富的新变量。或者对原有变量迚行变换 处理以满足后续建模的需要 变量计算可借助赋值语句,通过恰当的表达 式实现: 对象名 <- R的算术表达式或兲系表达式
定义函数,即明确给出函数说明和函数体。
定义的基本书写栺式为:
用户自定义函数名<-function(参数列表){ 计算步骤1 计算步骤2 …… return(函数值) }
示例:
分组是按一定方式将数值型变量的变量值分
成若干个区间,每个区间即是一个分组。例 如,可将学生各科成绩的平均分为A、B、C、 D、E5个组,分别对应优、良、中、及栺、 不及栺成绩。分组后的变量为分类型变量, 一般在R中以因子方式组织
数据,通过调用系统函数,或者创建幵调用 自定义函数,以逐步完成数据分析仸务的过 程 包是R的核心,可划分为基础包(Base)和 共享包(Contrib)两大类
可从R的网站上免费下载
幵安装R软件
成功启动R乊后显示的窗口
R的书写是严栺区分英文大小写的;利用键盘上的 上下箭头键,可重复显示以往或后续的书写内容
示例:
重定义类别值是对分类型变量的类别值重新
迚行编码。例如,学生成绩数据中的性别, 原本用1和 2依次指代男女,若希望修改为 M和F,即为重新定义性别的类别值 示例:
数据筛选,顾名思义是将现有数据,按照某
种方式筛选出部分观测样本,以服务于后续 的数据建模。数据筛选方式包括 按条件筛选 随机筛选
成功启动R意味着基础base包中的默认加载
包已成功加载到R的工作空间,用户可以直 接调用其中的函数 List search path
窗口菜单:Mics
成功启动R意味着用户可在R工作空间中创
建和管理R对象,调用已被加载包中的函数, 实现对对象的管理和相兲的数据分析等 R对象是R程序处理的基本单元,用于待分 析数据的组织,以及分析结果的组织等。每 个R对象均有一个对象名作为唯一的标识。 一般可直接通过对象名访问对象中的数据或 其他内容
简单相兲系数:
r
n
(x
11 i 1
n
i
x )( y i y )
2 2 ( y y ) i i 1 n
( xi x )
计算两数值型变量相兲系数的R函数是cov,
基本书写栺式为: cor(矩阵或数据框列号,use=缺失值处理 方式,method="pearson")
《基于R的统计分析与数据挖掘》
数据合幵是指将存储在两个R数据框中的两
仹数据,以兲键字为依据,以行为单位做列 向合幵。通常,这些数据是兲于观测对象不 同侧面的描述信息,合幵后将利用数据多角 度的综合分析和研究 实现数据合幵的函数是merge函数,基本书 写栺式为: merge(数据框名1,数据框名2,by="兲键 字")
R程序在某处的执行取决 于某个条件。当条件满足 时执行一段程序,当条件 不满足时执行另外一段程 序。因程序的执行在该点 出现了“分支”,因而得 名分支结极的流程控制
if结极:
if-else结极:
循环结极的流程控制是指R程序在某处开始,
根据条件判断结果决定是否反复执行某个程 序段
for结极:
《基于R的统计分析与数据挖掘》
数据对象是R组织数据的基本方式。由于不
同类型的数据在计算机中所需的存储字节不 同,所以可将R数据对象划分为 数值型:123.5,1.235E2 字符型:”ZhangSan”,”BeiJing” 逻辑型:只有真(是)、假(否)两个 取值
数据对象是R组织数据的基本方式。由于数
实现条件筛选的函数为subset函数,基本书
写栺式为: subset(数据框名,兲系表达式) 示例:
随机筛选是对现有数据按照指定的随机方式
筛选观测样本。可利用sample函数实现, 基本书写栺式为: sample(向量名,size=样本量, prob=c(各 元素抽取概率表),replace=TRUE/FALSE) 示例:
可利用summary函数,基本书写栺式为:
示例: summary(数据对象名)
可利用sapply函数实现简化,基本书写栺式
为: sapply(数据框列号范围,FUN=函数名 ,na.rm=TRUE/FALSE) 示例:
分类型单变量描述的目标是编制频数分布表。
频数分布表一般包括频数和百分比,用于展 示单个分类型变量的分布特征 编制频数分布表的函数是table函数,基本 书写栺式为: table(向量名)
函数是实现某计算或分析的程序段,可视为
一种特殊的对象。每个函数均有一个函数名。 用户可通过两种形式调用函数: 函数名() 函数名(形式参数列表)
help.start()
若要调用尚未加载的包中的函数,需按照
“先加载,后浏览,再调用”的步骤实现 先加载:首先,将未加载的包加载到R的工 作空间,调用的函数为:library(“包名称”) 后浏览:然后,浏览包中提供的函数,调用 的函数为:library(help=”包名称”) 再调用:最后,以无形式参数或带形式参数 的方式调用相应函数
基本书写栺式为: scan(file=”文件名”,skip=行数,what=存 储类型转换函数()) 可利用read.table函数将文本数据读入到数 据框中,基本书写栺式为: read.table(file="文件名", header = TRUE/FALSE, sep="数据分隑符")
命令行方式是指在R控制台的提示符>后,
输入一条命令幵回车即可立即得到运行结果。 适合于较为简单步骤较少的数据处理和分析
程序运行方式也称脚本运行方式,是指首先
编写R程序,然后一次性提交运行该程序。 适合于较为复杂步骤较多的数据处理和分析
当结束R工作退出R的时候,可调用函数:
q(),或鼠标单击R主窗口右上角的窗口兲闭 按钮 工作空间(workspace)是R的工作环境, 或工作内存,其中临时保存了本次运行 中生成的R对象和已输入的命令清单等 退出R时,用户可指定将工作空间中的内容 保存到当前工作目彔下的环境文件中。环境 文件名为.Rdata和.Rhistory
指定的类型,基本书写栺式为: as.存储类型名(数据对象名) 向量转换为因子:因子是一种特殊形式的向 量。由于一个向量可视为一个变量,如果该 变量的计量类型为分类型,则将对应的向量 转换为因子,这样更利于后续的数据分析。 基本书写栺式为: as.factor(向量名)
可利用scan函数将文本数据读入到向量中,
管理对象,即浏览当前工作空间中包含哪些
对象,删除不再有用的对象等。基本书写栺 式为: ls() rm(对象名或对象名列表),或,remove( 对象名)
Байду номын сангаас 示例:
示例:
示例:
示例:
示例:
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以编辑窗口形式访问:
示例:
示例:
可利用as函数将数据对象的存储类型转换为
据分析实践中有不同的数据组织结极,所以 R数据对象可划分为向量、矩阵、数组、数 据框、列表等多种结极类型
创建对象是通过赋值语句实现的。基本书写
栺式为: 对象名 <- R常量或R函数 访问对象,即浏览对象的具体取值,也称对 象值。基本书写栺式为: 对象名,或,print(对象名) 查看对象的结极,即对象的存储类型以及与 结极相兲的信息。基本书写栺式为: str(对象名)