从患者开始谈基因检测的整个流程

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基因检测服务详细流程

基因检测服务详细流程

因泰生命科技公司服务流程2018。

1.1前言成都因泰生命科学技术有限公司(以下简称:因泰生命)依托四川大学华西医院转化神经科学中心神经疾病研究室、四川大学华西医院遗传研究室暨生物治疗国家重点实验室疾病基因组学研究室,致力于“打造基于基因技术的个体差异化精准医疗和健康管理系统”,我们以基因检测技术、信息工程、移动互联网技术和传统医学的治未病为纽带,秉承“差异化治疗"的理念,形成涵盖“测、防、治”三个方面的完整体系,全面介入服务大众的大健康产业.总体来说,基因检测服务是从检测前咨询开始:首先要了解受检者的预期,明确患者的检测目的,如用药指导,耐药后寻找新的方案,是仅检测一个基因或多个基因突变状态等,帮助他们选择合适的产品.还有更重要的是及时发现是否有家族遗传史,保证家庭成员可以及早调整生活方式,作体检时就密切关注的相关问题。

这些都是需要在这部分搞清楚。

其次就是样本的获取与运输、DNA制备与文库构建、质控与上机测序。

应该取多少组织样本,应该采取哪些样本,这根据检测目的不同而不同。

血液样本应该在医疗机构采集,而唾液、口腔上皮细胞则可以用我们提供的采集盒,按要求要家中自行完成。

然后,快递到华西精准医学中心。

由专家进行处理,然后进行基因序列的检测.得出数据后,由相关的遗传学家,分子生物学家进行专业的数据分析,要没有分析这一步,再多的数据也是没有用的,我们为受检者做的,就是从大量的数据中,找出有用的信息.最后就是解读了,对受检者提出风险提示,为临床医生提供,对临床实践又何指导,这就是做基因检测的核心意义。

一、基因检测总体步骤我们目前的服务流程,主要由四个部分组成:检测前咨询;实验室处理;信息分析;临床解读。

有以下几个步骤:1、受检者通过医院专科门诊医生或直接向具有临床检测资质的机构提出检测需求.目前绝大多数受检者都是通过医院或医生的建议送检,也有少数自己送检,这主要是因为目前大众对基因检测的认识程度和检测后续的指导治疗和遗传咨询都离不开临床医生。

肿瘤基因检测解读流程

肿瘤基因检测解读流程

肿瘤基因检测解读流程肿瘤基因检测解读流程1. 引言肿瘤基因检测是一项重要的医学技术,可以帮助医生了解患者体内肿瘤的遗传信息,从而为临床诊断和治疗提供重要依据。

本文将对肿瘤基因检测的解读流程进行详细介绍,帮助读者更好地理解这一技术的应用和意义。

2. 深度评估肿瘤基因检测内容在进行肿瘤基因检测解读之前,我们首先需要对检测内容进行深入评估。

肿瘤基因检测会通过对肿瘤组织样本的DNA进行测序分析,检测出与肿瘤相关的基因变异。

这些基因变异包括突变、缺失、重排等,可能与肿瘤的发生、发展和治疗反应等方面有关。

我们将根据具体的检测内容,制定相应的解读策略。

3. 广度评估肿瘤基因检测主题在对肿瘤基因检测内容进行深入理解之后,我们需要从广度上评估肿瘤基因检测的主题。

肿瘤基因检测的主题涉及多个方面,包括遗传变异与肿瘤风险、个体化治疗指导、药物疗效预测以及肿瘤进展风险评估等。

我们将从简到繁,由浅入深地探讨这些主题,让读者能够逐步深入了解肿瘤基因检测的应用和意义。

4. 解读流程4.1 样本收集与准备在进行肿瘤基因检测之前,首先需要采集肿瘤组织样本,并进行样本的预处理,包括DNA提取和质量检测等。

这一步骤的准确性和可靠性对后续的检测结果至关重要。

4.2 DNA测序与数据分析采集到的肿瘤组织样本将进行DNA测序,得到大量的测序数据。

通过生物信息学分析,对测序数据进行处理和解读,筛选出与肿瘤相关的基因变异,并进行相应的注释和过滤。

4.3 参考数据库查询与解析为了进一步理解检测得到的基因变异信息,我们需要进行参考数据库的查询与解析。

这些数据库包括NCBI、COSMIC等,提供了大量的遗传变异信息和相关研究数据,有助于我们对基因变异的功能和临床意义进行评估。

4.4 结果解读与报告综合得到的检测结果、数据库查询和相关文献资料,我们将对基因变异的解读进行详细的分析和评估。

解读的内容包括基因变异的类型、频率、功能以及与肿瘤相关的可能机制等。

基因检测技术流程

基因检测技术流程

基因检测技术流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成,希望大家下载以后,能够帮助大家解决实际的问题。

文档下载后可定制随意修改,请根据实际需要进行相应的调整和使用,谢谢!并且,本店铺为大家提供各种各样类型的实用资料,如教育随笔、日记赏析、句子摘抄、古诗大全、经典美文、话题作文、工作总结、词语解析、文案摘录、其他资料等等,如想了解不同资料格式和写法,敬请关注!Download tips: This document is carefully compiled by the editor. I hope that after you download them, they can help yousolve practical problems. The document can be customized and modified after downloading, please adjust and use it according to actual needs, thank you!In addition, our shop provides you with various types of practical materials, such as educational essays, diary appreciation, sentence excerpts, ancient poems, classic articles, topic composition, work summary, word parsing, copy excerpts,other materials and so on, want to know different data formats and writing methods, please pay attention!基因检测技术在近年来的发展中扮演着越来越重要的角色,不仅在医学领域有着广泛的应用,还在疾病诊断、基因疾病风险评估、药物治疗方案选择等方面提供了可靠的辅助。

基因检测报告范文

基因检测报告范文

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含有可信的科学性内容,包括基因检测常见的材料,检测流程,报告
说明等内容
一、基因检测材料
基因检测是一项复杂的分子遗传学检测,常用检测材料有细胞、组织、血液、唾液等。

其中,细胞是最常用检测材料,它可以提供基因的直接证据,既能检
测到一些基因的表达水平,又能检测到一些基因突变的情况,比如各种癌
症的基因检测。

此外,血液、唾液和组织也是常用的基因检测材料,其中
血液常用于进行药物代谢基因检测,以确定患者对其中一种药物的代谢能力;唾液常用于基因疾病的诊断;组织则常用于组织内基因的检测。

二、基因检测流程
基因检测的流程一般包括样本提取、PCR扩增、DNA测序、数据分析、报告出具。

1、样本提取:样本提取是基因检测的第一步,也是基因检测的重要
一步。

根据检测材料的不同用不同的提取方法,其常用的提取方法有超声
破碎法、离心法和PCR法。

2、PCR扩增:PCR扩增是基因检测中常用的扩增方法,它可以大量的
扩增特定的DNA片段,以便于进行下一步的分析。

3、DNA测序:DNA测序是基因检测的关键一步,它可以快速准确的测
定特定片段的DNA序列,以获得更准确的结果。

全基因检测的费用大概多少钱详解基因检测的价格和流程

全基因检测的费用大概多少钱详解基因检测的价格和流程

全基因检测的费用大概多少钱详解基因检测的价格和流程全基因检测的费用也许多少钱全基因检测是一种高科技的检测方式,可以猎取个体全部基因信息,对遗传性疾病、药物敏感性等方面进行分析,对人类健康供应很大关心,但是也存在肯定的费用问题,下面具体介绍全基因检测的价格和流程。

国内全基因检测市场价格国内目前主要的全基因检测公司有易、益康基因、精睿、基因宝等,由于技术和服务水平有所不同,价格也会有很大的差别。

一般来说,基本的全基因检测费用在5000元左右,高级别的检测会更加贵,达到1万-2万元不等。

此外,国内对医疗检测的资费也相应地在一个较高的范畴内。

除此之外,有一些公司还供应共性化的全基因检测方案,比如依据客户需求选择不同的分析项,这样可依据个人状况定制检测,费用会依据检测项目量而有所浮动。

需要留意的是,目前全基因检测的价格并不是很透亮,许多公司需要通过私人定制、折扣等方式来进行详细报价,无法保证价格的公开性,须经过细节的询问了解。

全基因检测的详细流程样本采集与检测:全基因检测需要供应DNA样本,采集物通常是血液、唾液、口腔拭子等,全基因检测需要的是全基因组信息,因此采集与检测需要特别细心和急躁。

数据分析:检测完成后,试验室将收集到的大量DNA数据给解读并初步分析,打算关注哪些潜在基因变异或变化。

然后将这些数据应用于进一步的分析,例如将数据与某一特定疾病进行比较,以确定患病风险和猜测潜在疾病。

报告输出:最终全基因检测会为患者供应一份具体的DNA检测报告。

报告通常包括个人基因风险评估、潜在基因变异或变化的介绍、涉及疾病与意外损害(如药物过敏)的信息、相关的医疗建议和治疗方案,有些服务还会供应用户与专家的沟通沟通途径。

全基因检测是否值得全基因检测大致的费用已经了解,接下来我们需要留意的是,无论个人全基因检测如何,也要审慎考虑这份报告对实际健康的影响。

尽管全基因检测可以供应有用的信息,但这些信息可能对你的生活不存在明显的影响,或者是对你选择特定治疗方案有特别大的影响,在全基因检测之前,您需要了解此检测的优缺点,并明确自己的期望以及选择一个合适的检测项目。

肺癌基因检测的流程

肺癌基因检测的流程

肺癌基因检测的流程肺癌是一种严重威胁人类健康的恶性肿瘤,近年来,随着医学技术的不断发展,基因检测在肺癌的诊断、治疗和预后评估中发挥着越来越重要的作用。

那么,肺癌基因检测到底是怎样一个流程呢?下面就为大家详细介绍一下。

一、检测前准备1、医生评估患者在考虑进行肺癌基因检测之前,医生会对患者的病情进行全面评估。

包括患者的病史、症状、影像学检查结果(如胸部 CT 等)、病理诊断结果等。

医生会根据这些信息,判断患者是否适合进行基因检测,并为患者解释基因检测的目的、意义和可能的结果。

2、患者知情同意在决定进行基因检测后,医生会向患者详细介绍检测的过程、风险、费用以及可能的结果。

患者需要签署知情同意书,表示了解并同意进行基因检测。

3、样本采集肺癌基因检测的样本可以是肿瘤组织、血液或胸腔积液等。

(1)肿瘤组织样本如果患者进行过手术或穿刺活检,获取了肿瘤组织,那么这是最理想的检测样本。

通常,这些组织会被保存在医院的病理科。

(2)血液样本对于无法获取肿瘤组织或者不愿意进行有创操作的患者,可以选择采集血液样本进行基因检测。

血液中的循环肿瘤 DNA(ctDNA)也可以反映肿瘤的基因信息。

(3)胸腔积液样本如果患者有胸腔积液,并且积液中含有肿瘤细胞,也可以作为检测样本。

二、样本送检采集好的样本会被送往专业的基因检测实验室。

在送检过程中,需要严格按照样本运输的要求,保证样本的质量和稳定性。

三、实验室检测1、 DNA 提取实验室人员会从样本中提取 DNA。

对于肿瘤组织样本,需要先进行病理评估,确保样本中含有足够的肿瘤细胞。

对于血液样本,需要通过特殊的方法富集其中的 ctDNA。

2、基因测序提取到的 DNA 会经过一系列的处理和扩增,然后进行基因测序。

目前常用的基因测序技术包括二代测序(NGS)、聚合酶链反应(PCR)等。

3、数据分析测序得到的大量数据需要经过专业的生物信息学分析,以确定是否存在基因突变以及突变的类型和频率。

4、结果解读基因检测结果需要由专业的医生或遗传咨询师进行解读。

靶向药基因检测流程

靶向药基因检测流程

靶向药基因检测流程是一种新型的基因检测方式,可以通过检测病人的基因信息,帮助医生和药剂师确定病人最适合的靶向药物,有效提高治疗效果。

一、患者基因样本采集
患者基因样本可以采集血样、唾液样、口腔粘膜细胞等多种方式。

在采样前,医生应该先通过问诊和体验检查确定患者病情,确定需要进行基因检测的药物种类,并获得一份确认基因检测的知情同意书。

二、基因检测
患者基因样本采集后,药剂师将其提交给专业实验室进行基因检测。

检测结果将包括患者的基因序列信息和某些基因变异的结果,这将根据药物和疾病状态进行分类和解释。

三、结果解析
结果解释通常由专业解释人员和医生联合完成。

根据患者的基因检测结果,他们将对可能对药物构成影响的基因变异进行解释,并分析每种药物对基因的影响。

四、药物选择
在药物选择阶段,医生将综合患者的基因检测结果以及病情等因素,选择最符合患者个体化治疗的药物。

基于个体化理念,通过这种方式得到的药物方案,可以提高药物治疗的效果,并减少患者的创伤和费用。

五、个性化治疗监测
实施了个体化靶向药治疗后,医生和药剂师会进行随访和监测,以确保所选药物的治疗效果。

对于存在药物不良反应的患者,应及时调整治疗方案。

综上,个体化靶向药基因检测流程是应用生物信息学分析,为临床合理应用规划治疗提供科学依据的一种创新的基因检测方式,可以大幅度提升药物疗效和安全性,又符合现代医学个体化诊疗的新思路。

基因检测流程

基因检测流程

基因检测流程介绍基因检测是通过分析个体的基因组,了解其遗传信息和潜在风险的一种方法。

它可以帮助人们了解自己的遗传特征、预测潜在疾病风险以及指导个性化的健康管理。

本文将详细介绍基因检测的流程。

流程步骤基因检测的流程可以概括为以下步骤:1. 采集样本基因检测首先需要采集个体的生物样本,常见的样本类型包括口腔拭子、唾液、血液等。

通过采集样本,可以提取出个体的DNA,用于后续的基因分析。

2. DNA提取样本采集之后,需要对样本进行DNA提取。

DNA提取的方法有多种,常见的包括化学方法、机械方法以及自动化提取方法。

提取得到的DNA可以通过定量、纯化等步骤获得高质量的DNA样品。

3. 基因测序DNA提取完成后,可以进行基因测序。

基因测序是将DNA序列转化为计算机可识别的数据。

目前常用的基因测序技术包括Sanger测序、高通量测序(包括DNA芯片和下一代测序技术)等。

测序结果可以得到个体的基因组信息。

4. 数据分析基因测序之后,需要对测序结果进行数据分析。

数据分析包括对基因序列的比对、变异检测等处理。

通过对数据进行分析,可以得到个体的基因型信息、基因变异信息,进而了解其遗传特征和相关的疾病风险。

5. 结果解读数据分析完成后,需要对结果进行解读。

基因检测公司或专业机构的遗传学家和临床医生会根据检测结果提供解读和解释,包括解释基因变异的意义、潜在的疾病风险以及建议的健康管理措施等。

6. 健康管理基于基因检测结果,个体可以进行个性化的健康管理。

根据基因检测结果,可以制定有针对性的健康计划、饮食和运动指导等,从而更好地预防潜在的疾病发生。

基因检测的应用领域基因检测可以应用于多个领域,包括但不限于以下几个方面:1. 遗传病风险评估基因检测可以帮助评估个体患上某些遗传病的风险。

通过检测某些与遗传病相关的基因变异,可以得知个体患病的风险等级,从而采取相应的预防和治疗措施。

2. 癌症风险评估基因检测还可以评估个体患上某些类型癌症的风险。

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从患者开始谈基因检测的整个流程题记:几颗玉米放进爆米花机器,出来便是爆米花;一个智力一般的高中生放到人大附中,三年后出来就是国际一流大学新生;二两五花肉和几个青椒交给一名厨师,出来的便是香喷喷的回锅肉。

可是这中间都发生了啥是什么重要步骤将初始原料打磨成了成品10ml 的血液或者一块肿瘤组织,最终变成了一份20 页的检测报告这是怎么实现的中间都发生了什么本文旨在回答这个问题。

基因检测的整个流程可分为哪几个大的步骤概况性地了解一个事务的框架是很有必要的,因为这样我们心里会有“底”。

不管别人怎么分,我简单粗暴地把它分为四个程序:1,检测前咨询部分;2,实验室部分;3,信息分析部分;4,临床解读部分。

五脏俱全的基因检测公司应该包含以上所有的四个程序,除非存在部分业务外包的情况,例如有的公司只做临床解读部分。

1)检测前咨询部分:不是所有的癌症患者都应该检测,都值得检测,检测目的是为了明确是否可以使用靶向药物,还是仅仅为了玩,选择哪种产品更加适合,这些都是需要在这部分搞清楚。

2)实验部分:应该取多少组织样本,测序过程中有哪些细节步骤,这可是个核心环节。

3)信息分析:实验部分做完以后所得到的是一大堆序列,不分析就是一堆垃圾,信息部要做的就是从这些垃圾中挑选黄金。

4)临床解读:黄金挑选出来不拿去换成大米然后进肚,那也没什么用,基因检测的结果有什么意义,对临床实践又何指导,全在这里了。

四个程序,每个程序又包含哪些小工序呢通过上面的介绍,我们可以大体了解基因检测分为四个程序,也明白四个程序主要做什么。

可是,每一个程序又具体涉及哪些小程序呢剖析程序的过程,就是知识差异化的过程。

1,检测前咨询:患者预期、产品选择;2,实验部分:样本获取与运输、DNA 制备与文库构建、质控与上机测序;3,信息分析部分:数据分析、报告初稿;4,临床解读部分:检测报告、临床实践、报告解读/人文关怀。

总而言之,简单来说,从明确患者的检测目的开始(用药指导,耐药后寻找新的方案,仅检测一个基因或多个基因突变状态等),到选择合适的产品,然后获取规范的样本(血液,组织,唾液等),然后合适的运输方式到达实验室,然后一些列的规范实验室操作及数据分析,最后到科学的检测报告与咨询服务。

这就是四个程序所包含的内容。

每一个程序分为许多小工序,每一个小工序又有许多学问与讲究。

下面将会详细介绍每一个小工序。

程序一:检测前咨询部分:患者预期。

销售经理、产品经理、主治医生与患者需要充分沟通,明确该基因检测的目的,知道检测技术的局限性,做好患者的预期控制。

:产品选择。

对于基因检测产品来说,产品选择几乎等同于检测基因的选择。

哪些基因需要强行检测、哪些基因推荐检测、哪些基因有一定的检测价值,这些需要阐述清楚。

最后,根据患者的经济情况与病情,综合选择(这是理想状况)。

实际操作过程中,销售经理往往会以经济利益为导向。

:临床信息。

患者的临床信息对于基因检测报告者有重要意义,信息掌握越全面报告越个性化,咨询解读也更有针对性。

因此,完整详实的临床申请单需要提供。

程序二:实验部分:样本类型。

需要明确一点,能够运用无创的尽量用无创(唾液与血液),因为没有一个患者希望无缘无故的在自己身上打洞。

固体:手术样本,穿刺样本,石蜡包埋组织,石蜡切片组织;液体:全血,血清血细胞,胸水,腹水,唾液。

1)手术样本:(肿瘤组织》50mg,癌旁正常组织》25mg,收到组织后立即用至少 5 倍体积的10%中性福尔马林固定液固定),切片25张以上,厚度5卩m,肿瘤细胞占比》50%, 坏死组织区域2)穿刺样本:穿刺一针以上,肿瘤细胞占比 > 50%,坏死组织区域3)石蜡包埋组织:常温保存运输即可,最好是1 年以内。

4)石蜡切片组织:常温保存运输即可,最好是6 周以内。

5)全血:6ml-10ml for NGS (Streck 管,含有保存液,负压真空抽满),轻轻垂直平面90°旋转10 次,6-25 C (常温)运输,3 (7)日内送达,可用干冰/制热剂制造维持环境温度。

6)血浆血细胞(普通试管):抽血后2h 内将全血4C 1600g离心10min,分别收集上清和沉淀至离心管中;上清再4°C 16000g 离心10min ,收集上清血浆转移至15mL 离心管中。

血浆血细胞样品,均封口膜封口,干冰运输。

7)胸水:8)腹水:这两个情况比较少,至少我们公司很少遇到这样的样本。

:质控。

血液样本是否合格,是否可以进行测序上机,样本质量怎么样安捷伦2100 生物分析仪或者4200 TapeStation 核酸分析仪,通过DNA 完整值(DIN )来数字化基因组DNA 的完整性。

如果不用这些仪器,可以通过跑胶来实现这一步。

质控不合格,只有重新采样。

标准流程只需要卩g DNA , DNA的0D 260/280在之间,RNA 的RIN值》。

实验中发现,只要RIN值大于7,就可以获得比较满意的结果。

(RIN :RNA 完整值)。

总的来说,质控两个指标:1)足够的DNA 量;2)完整的DNA 基因组。

这个步骤在构建文库后上机测序前完成。

:文库构建。

简而言之,获取足够量的/目的的/前期适合上机测序而标准处理的DNA 。

其程序主要有:片段化,连接,扩增。

1)片段化:我们总不能直接将那么长的DNA 去测序吧,测序仪就只能一次测几百bp 的DNA ,超声波片段化等方法,获得DNA 片段为正态分布200-500bp ,通过一定方法(切割琼脂糖凝胶电泳条带)选择所需长度的DNA片段(150-200bp),其它的片段就扔了(不影响覆盖范围)。

2)末端修补:上面的方法(物理方法)片段化的DNA ,一般来说两端都被破坏了,不再是平平整整的了,而后续步骤需要在两端加测序接头,所以我们得先把这个破坏的两端修补好。

修补所需三种酶:5‘端延伸的酶,5'端连接的酶,3‘端延伸的酶。

3)3' 端加A :片段化且两端修补好的DNA ,3‘端加上一个碱基A,而下一步骤的连接接头3'端有一个碱基T,这样就实现了碱基互补而连接起来了。

这样做还有以下几个原因:提供连接效率;防止接头与DNA 片段多种方向连接;减少接头之间的连接。

值得一提的是1)2)3)的步骤可以用WGSFramentation Mix 搞定。

4)两端加接头:首先明确接头3‘端有一个突出的碱基T,插入片段3'端有一个突出的碱基A ; 其次,这个工序是在插入片段两端加入东西;这个东西包括以下几个部分:测序接头(P5, P7;测序时用于与种植在Flow Cell 上的序列碱基互补配对用),Barcode(用于标识该条DNA 片段属于哪个样本,4 个碱基),单分子编码序列(Index ,用于识别是哪条DNA 片段,12 个随机碱基) ;其中Y 型的序列是已经商业化的试剂盒。

5)PCR 富集:如果样本不够,那么我们就需要扩增它才能上机测序,这就是该环节存在的必要。

由于每个经4)处理的片段两端都有P5与P7,因此PCR 引物只需设计与它们配对的就行了。

如果样本足够,这一步就省了呗。

6)文库定量:这里才应该是质控,也就是的步骤。

7)基因捕获:我们只将需要的DNA 片段去测序,不需要的去测不是浪费钱吗于是在测序之前,我们就用这个工序将目的DNA 挑选出来(为什么要捕获) ;目前目标序列捕获方法有3 种,NimbleGesn Sequence Capture array,Agilent SureSelect DNA Capture Array ,Agilent SureSelect TargetEnrichment System ,值得注意的是不同捕获方法可能测序仪器有不同的要求(捕获的方法有哪些;罗氏和安捷伦);我们捕获的探针设计可以自己设计,初步设计,需要检测的位点提交到商业公司,真正的设计还是需要专业的商业公司来干(捕获探针的由来);例如目标区域为100Kb ,好的探针是100%覆盖这100Kb ,而有的商业公司达不到,只能覆盖到97% ,那么意味着有3%的区域捕获不到,更谈不上对这些区域测序了,所以覆盖率很重要;对于这100Kb 的目标片段,前10Kb 探针捕获了100 个片段,第10Kb-20Kb 的探针捕获了10 个片段,那么这样的话就是均一性不好,最终可能会得出结论10Kb-20Kb 这一段突变频率过高/过低,因此均一性很重要;如果一个探针设计出来想捕获目标片段,却捕获到了别的垃圾片段,我们还对它测序,这不是浪费钱吗所以,探针特异性很重要。

(好的捕获是怎么样的)。

8)PCR 扩增:PCR 再次扩增捕获的DNA 片段,上机前再一次加足样本量。

9)文库再次定量:相当于上机前的再一次质量检测。

:上机测序。

通过前面的步骤,我们从患者身上的一块肿瘤组织或者一管血开始,然后分离提纯我们需要的基因组DNA ,再把这些DNA 打成小片段,然后再在这些DNA 小片段两头接上识别标记和测序接头,最后再通过基因捕获技术筛选出目的DNA ,根据需求PCR 扩增。

通过这么多步骤,就是为上机测序做准备。

一句话,上机测序的过程就是读取这些DNA 小片段的序列,如ATCTGGCTT...(~160bp) ,这样万级、亿级的DNA 片段个数。

至于这些DNA 片段是怎么样在机器上被测出来的,这又是个大问题,我在《液体活检有哪些》这篇文章有简要说明,这里不管它,毕竟世界上那么多事情,哪有想管就管得了的呢至此,实验部分结束。

程序三:信息分析部分:下机数据识别。

数以亿计的DNA 小片段,一大饼,杂乱无章,很多情况是几十个患者的样本都一起的,更乱。

一句话,这个步骤将属于不同患者的DNA 小片段放进不同的盒子里,分类。

这是怎么实现的呢我们在构建文库的加接头步骤时,同时加上了Barcode 序列,同一个患者使用同一个Barcode,不同的患者使用不同的B arcode,那么计算机通过这个Barcode 轻松识别然后放进不同的盒子里。

值得注意的是,DNA 是两条链, 有的公司会两条链同时测序以增加准确性,因此一个 A 患者会有两个盒子属于他( A1 :正义链的DNA 小片段集合;A2 :反义链的DNA 小片段集合) 。

还值得注意的是,如果样本是血液, 有的公司会同时检测cfDNA 和gDNA ,那么一个B 患者就会有四个盒子属于他 (B1, B2, B3 , B4 )。

图像转换。

下机的时候那些DNA片段最初其实是图像格式的,例如红色表示碱基A,绿色表示碱基T,需要用专业工具将图像格式转换成序列。

Illumina 公司提供专业软件,只需对其调用就可以完成这一步骤。

一句话:图像转换成序列。

:比对到基因图上。

将这些上以亿级的DNA 小片段归位,如果你是1 号染色体的第500 位到第650 位之间的片段,就把你归到这个位置下面。

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