第五章(1)PUBMED外文医学期刊文献检索
概况
网址：/pubmed 或 /pubmed 或 (com; org; net)
由美国国立医学图书馆（National Library of Medicine - NLM）国家生物技术信息中心 （National Center for Biotechnology Information - NCBI）向因特网用户提供免费 MEDLINE检索服务(1997-6-26)
3、了解： PubMed 、OVID、Elsevier ScienceDirect数据库 的检索结果的显示、下载及个性化服务等； Web of Science收录的数据库资源及特色。
PubMed概况 PubMed功能栏介绍 认识PubMed文献 PubMed基本检索 PubMed高级检索 主题词MeSH检索 循证及临床查询检索
概况
收录70余个国家4900多种生物医学期刊的题录 与文摘，是世界上最权威的医学数据库
现有1950年以来的1650多万篇文献的记录(其中 MEDLINE记录1400多万条)
目前每年增加60余万条文献记录 在全部记录中有76%的文献为英文；在2000年
以来的记录中90%的文献为英文；收录中文刊 60余种
2、熟悉： PubMed 、OVID、Elsevier ScienceDirect及Web of Science数据库的进入方式及检索界面； PUBMED、 OVID、Elsevier ScienceDirect及Web of Science数据库 的检索规则及Web of Science的个性化服务 。
PubMed全文获取
第一节 PubMed
一、概述：由美国国立医学图书馆下属的国家生物技术信息 中心于2000年4月研制开发的免费数据库检索系统，主要 用于生物医学领域研究文献的检索。与NCBI所提供的其 他数据库，如分子生物学数据库、PubMed Central、图书 库等一样， PubMed 也使用Entrez作为其检索系统 。 网址/pubmed/ PubMed收录了超过2400万篇有关生物医学的文摘及 题录数据，部分文献可获取全文。这些记录绝大部分可回 溯至1984年，部分早期文献可回溯至1865年。主要来自 于MEDLINE、生命科学类期刊及在线电子图书等，主要 涉及生物医学及健康领域，也包含部分生命科学、行为科 学、化学科学及生物工程的内容。此外， PubMed还提供 进入其他相关网站的链接。
医学文献检索与利用
第五章 外文医学期刊文献检索
南华大学图书馆 龙颖 TEL：13016195600 EMAIL：1642486074@
学习目标
1、掌握： PubMed 、OVID、Elsevier ScienceDirect及Web of Science数据库的常用检索途径及检索方法； Web of Science数据库的基本检索方法及检索结果输出与分析方 法。
3.Publisher supplied citation 是PubMed接受出版商提供的非生 物医学文献（MEDLINE不收录）的电子期刊文献记录，标注 为[PubMed-as supplied by publisher]。
4.OLDMEDLINE 是PubMed中部分1966年以前出版且未被 MEDLINE收录的文献记录，标注为[PubMed-OLDMEDLINE] 。
/pubmed/
检索词输入框
使用帮助
常用工具
更多服务
PubMed记录唯一识别号PMID
PubMed记录的四种来源
1.MEDLINE 是PubMed记录的主要来源，标注为[PubMedindexed for MEDLINE]。
2.In-process citations 是系统为加快文献的报道速度，将尚未标 引MeSH主题词、文献类型的最新文献记录先存入临时库中， 待完成加工处理后再转入MEDLINE的记录，标注为[PubMedin Process]。
近年来，越来越多的出版社通过电子期刊平台发布最新
的文献信息，先于印刷版期刊发表的电子期刊文献标注为 [Epub ahead ห้องสมุดไป่ตู้f print]。
MEDLINE与PubMed的区别
➢ PubMed是一个免费的搜索引擎，由NLM所属的国家生物技术信息中心（NCBI） 于2000年4月开发.基于WEB的生物医学信息检索系统 （/pubmed/），提供生物医学方面的论文搜寻以及摘 要。它的数据库来源有：MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、 Record supplied by publisher等，数据类型：期刊论文、综述以及与其他数据库 链接。PubMed的资讯并不包括期刊论文的全文，但可能提供指向全文提供者 （付费或免费）的连结。
[PubMed-as supplied by publisher]
➢ MEDLINE是一个数据库，是美国国立医学图书馆（The National Library of Medicine，NLM）创建的国际性综合生物医学信息书目数据库，是当前国际上最权 威的生物医学文献数据库。内容包括美国《医学索引》（Index Medicus，IM）的全部 内容和《牙科文献索引》（Index to Dental Literature）、《国际护理索引》 （International Nursing Index）的部分内容，涉及基础医学、临床医学、环境医学、 营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社会医学等领域。 MEDLINE收录1966年以来世界70多个国家和地区出版的4000余种生物医学期刊 的文献，近1400万条记录。目前每年递增30-35万条记录，以题录和文摘形式进行 报道，其中75%是英文文献，70%-80%文献有英文文摘。
pubmed文献检索PPT课件
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2. PubMed的主题词检索是其最具特色的 功能之一，能保证较好的查准率及查准 率。主题词组配副主题词使检索结果更 为专指，限定在主要主题词检索能使结 果更准确。
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3.但是主题词检索也有一些固有的缺陷， 比如很多专指的概念没有相应的主题词， 一些新出现的概念要几年后才收录为主 题词这种情况下，不宜采用主题词检索， 采用字段限定检索等方法也能得到较好 的查准率。此外，主题词检索还可能会 漏掉一些最新的文献（in process citations），这也是需要注意的。
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Clinical Queries临床咨询
研究范畴:一般疾病的病因学、预后、
诊断、预防以及治疗 Finding Systematic Reviews：提供系统 评价、meta分析、临床试验综述临床指 南等循证医学文献信息的查找
Medical Genetics Searches
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编辑版
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4）应用MeSH主题词的Major Topic（主 要主题词）检索：
可以使检索结果更加准确。
点选Restrictions Search to Major Topic headings only，
限定检索结果为主要主题词。
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建立检索式
如果有多个主题词， 可以先分别对每个主题词进行检索， 再在高级检索的Search History中用检索 序号进行布尔逻辑运算； 也可以通过主题词检索页面的PubMed search 直接建立检索式
形变异词。 ▪ 截词功能只限于单词，对词组无效
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布尔检索
布尔运算符AND，OR，NOT必须大 写 从左至右进行布尔运算 以通过加圆括符改变运算顺序
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法摘要：一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文：一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院（NIH）开发和维护的一个免费生物医学文献数据库，包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页，可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮，可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定，从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中，可以采用一些策略提高检索效果。
例如，使用截词符（*）进行词干检索，或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例：假设我们想查找关于“新冠病毒”（SARS-CoV-2）的研究文献，可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”，然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章，如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等，了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符（AND、OR、NOT）在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如，输入“新冠病毒AND 疫苗”，可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中，可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件，缩小检索范围，提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具，如引文导出、文献收藏、文献标签等。
医学文献检索课程教学大纲(临床医学专业)
《医学文献检索》课程教学大纲（Medical Literature Retrieval）一、课程基本信息课程编号：14233087课程类别：专业课适用专业：临床医学专业学分：2总学时：32先修课程：学科基础课后续课程：循证医学、其他专业课课程简介：本课程是一门学习如何检索与获取利用医学文献信息资源的学问和技艺的科学方法课程，通过教学，简明扼要地介绍医学文献信息检索及其对医学科研的影响、信息资源与信息媒体的基础知识，详细介绍医学文献信息检索的基本原理和基本技术，并根据医学信息资源类型特点，系统介绍中外文期刊医学信息资源、特种医学信息资源、学术分析评价信息资源、网络免费医学学术信息资源等的检索方法与检索规则，特别强调这些资源中能够实现免费检索的使用特点与检索技巧。
此外，专门介绍医学信息资源组织管理与利用方面的相关知识，如医学信息资源采集、个人医学信息资源管理、医学信息资源筛选、再生医学信息形成与处理等。
主要教学方法与手段：本课程采用课堂多媒体课件讲课或实时网络演示，在注意对基本概念介绍的同时，重在对各类医学信息资源检索系统操作方法、操作步骤的介绍，并结合对应的专题实习以及自选课题综合实习的教学方式，达到传授基本理论知识，掌握实际检索操作技能的目的。
选用教材：周毅华.医学信息资源检索教程[M].南京：南京大学出版社，2016必读书目：1、湛佑祥，陈锐，陈界，等.医学信息检索学[M].北京：人民军医出版社，20142、何蛟，王博，张林.医学科研与信息检索应用[M].北京：清华大学出版社，2013选读书目：1、罗爱静，于双成.医学文献信息检索[M].第3版.北京：人民卫生出版社，20152、陈平，张轶群.实用生物医学信息检索[M].北京：科学出版社，20153、顾萍，谢志耘.医学文献检索[M].北京：北京大学医学出版社，20134、李晓玲，符礼平.医学信息检索与利用[M].第5版.上海：复旦大学出版社，20145、李红梅.医学信息检索与利用[M].北京：科学出版社，20146、彭奇志，林中.信息资源检索策略与分析[M].南京：南京大学出版社，20137、陈荣, 霍丽萍.信息检索与案例研究[M].上海：华东理工大学出版社，20158、谢新洲，周静.新编科技查新手册[M].北京：人民出版社，2015二、课程总目标：本课程教学的主要目标是培养医学生新型的信息素养和创新思维能力，使学生能够开拓视野、站在更高的科学角度观察与思考医学科学及其研究，逐步提高医学学术研究思维逻辑能力，为将来从事临床医疗实践和开展医学科学研究打下良好基础。
第五章pubmed使用指南1
– 仅知道作者姓，则必须加上字段标识，如： Smith[au] – 2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索
最后修订日期 规范词表词 规范词确立日期 系统组织的文摘 版权拥有者 题录提供机构的识别号 病史相关与原始记录 其他关键词 提供其他关键词的机构 数据提供者机构 文章总页数 出版商提供数据时间 期刊出版国 数据库文献编号
作为主题词的个人姓名
出版状态 文献类型 出版模式（纸张或电子） 参考文献数 已撤回的文献 酶或化学物质代码
总结
2、针灸治疗疾病的主题词检索方法 第一步：#1 explode 疾病/all subheadings 第二步：#2 Acupuncture/all subheadings 第三步：#3 explode Acupuncture Therapy /all subheadings 第四步：#4 Moxibustion/all subheadings 第五步：#1 AND (#2 OR #3 OR #4)
第2步：检索白血病/药物疗法
主题检索举例： 长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献
第2步：检索白血病/药物疗法
主题检索举例： 长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献
第2步：检索白血病/药物疗法
主题检索举例： 长春新碱（Vincristine ）治疗白血病（leukemia）的文献
临床咨询和系统评价
系统评价
《医学文献检索》教学大纲
《医学文献检索》教学大纲（临床医学专业）本文由【中文word文档库】搜集整理。
中文word文档库免费提供海量教学资料、行业资料、范文模板、应用文书、考试学习和社会经济等word文档课程编号：学时数：32 其中实验或上机学时：12一、课程的性质和任务本课程是一门以信息组织原理，信息检索与利用的原理、原则和方法为主线，以电子与网络文献信息、数据库与Internet上医学文献信息的检索为重点；系统介绍医学文献信息的类型、特点，文献检索的原理、方法、原则等基本知识，各类文献信息检索工具及其使用方法，以及医学信息利用与情报调研、医学论文写作方面的内容。
旨在培养学生获取和利用文献信息能力、提高学生的信息素养的方法学课程。
是提高学生自学能力和独立研究问题能力的科学方法课。
本课程的任务，使学生在了解医学文献基本知识、文献检索的基本知识及基本原理基础上，熟悉并掌握各种医学及相关学科专业文献检索工具、数据库的特点和检索方法，以及网络医学资源的分布及利用方法，培养医学生的信息素养，提高其信息获取和信息利用能力，使学生能够系统地了解和较为熟练地掌握各类检索工具的使用方法，培养学生懂得如何获得与利用文献情报，增强自学能力和研究能力。
二、相关课程的衔接与本课程相衔接的课程包括：文献计量学和医学科研方法等课程。
三、教学的基本要求基础理论和基本知识：1．文献的基本知识：文献、情报、知识、信息的概念；不同文献类型的特点；情报与情报意识对科学活动及个人知识增殖的作用。
2. 文献检索的基本原理：文献检索的意义和作用；文献检索类型、文献检索步骤和方法；检索语言及检索策略。
3. 检索工具的类别、特点及其检索方法4. 数据库（包括书目数据库、事实数据库、数值数据库、全文数据库）、计算机检索（包括联机检索、光盘检索及Internet信息检索等）的基本知识。
基本技能：1．掌握若干种基本的综合性和专业性中外文检索工具，了解其内容特点、编排结构和著录格式，能够通过多种检索途径使用它们检索与专业相关的不同类型的文献。
[医学]第五章(1) PUBMED外文医学期刊文献检索
![[医学]第五章(1) PUBMED外文医学期刊文献检索](https://360docs-1393072327.cos.ap-beijing.myqcloud.com/2dce36120912a216147929d3.webp)
/pubmed/
检索词输入框
使用帮助
常用工具
更多服务
PubMed记录唯一识别号PMID
PubMed记录的四种来源
1.MEDLINE 是PubMed记录的主要来源，标注为[PubMedindexed for MEDLINE]。
2.In-process citations 是系统为加快文献的报道速度，将尚未标 引MeSH主题词、文献类型的最新文献记录先存入临时库中， 待完成加工处理后再转入MEDLINE的记录，标注为[PubMedin Process]。
MEDLINE是一个数据库，是美国国立医学图书馆（The National Library of Medicine，NLM）创建的国际性综合生物医学信息书目数据库，是当前国际上最权 威的生物医学文献数据库。内容包括美国《医学索引》（Index Medicus，IM）的全部 内容和《牙科文献索引》（Index to Dental Literature）、《国际护理索引》 （International Nursing Index）的部分内容，涉及基础医学、临床医学、环境医学、 营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社会医学等领域。 MEDLINE收录1966年以来世界70多个国家和地区出版的4000余种生物医学期刊 的文献，近1400万条记录。目前每年递增30-35万条记录，以题录和文摘形式进行 报道，其中75%是英文文献，70%-80%文献有英文文摘。
概况
网址：/pubmed 或 /pubmed 或 (com; org; net)
由美国国立医学图书馆（National Library of Medicine - NLM）国家生物技术信息中心（ National Center for Biotechnology Information NCBI）向因特网用户提供免费MEDLINE检 索服务(1997-6-26)
【医学PPT课件】PubMed检索指南
限 定 检 索 窗 口 全 貌
添加作者检索
添加期刊检索
限定记录有全文、免费全文或 摘要
文献发表时间限定
记录添加到PubMed时间限定
限定记录有全文、免费全文或 摘要
人类与动物限定 性别限定
文献语种限定
文献子集限定
Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等 字段
Title/Abstract [TIAB]
四、PubMed检索功能
检索
1、自由词智能检索
在检索框中键入一到多个单词，如键入： vitamin c AND common cold hepatitis b AND (diagnosis OR therapy)
SubHeadings 副主题词
对一个主题词的多个方面进行修饰限定 的词，又称限定词。
特征栏功能介绍-Clipboard
（四） Clipboard功能介绍
将每次满意的检索结果暂时保存至此 最后集中处理（下载存盘或发E-mail） 最多500条记录，断开连接后保存8小时
（五） Details功能介绍
Details：显示计算机响应的本次检索式。
点击“URL”
/entrez/query.fcgi?cmd=Pu reSearch&db=pubmed&details_term=effect%5BAll%2 0Fields%5D%20AND%20%28%28%22magnetic%20r esonance%20imaging%22%5BTIAB%5D%20NOT%2 0Medline%5BSB%5D%29%20OR%20%22magnetic% 20resonance%20imaging%22%5BMeSH%20Terms% 5D%20OR%20MRI%5BText%20Word%5D%29%20A ND%20Review%5Bptyp%5D%20AND%20%222005/0 2/13%2000.01%22%5BEDAT%5D%20%3A%20%222
（一）外文医学期刊摘要库pubmed
（一）外文医学期刊摘要库PubMed实习目的：PubMed是查找世界范围内医学专业文献的重要检索平台。
通过实习，要求熟练掌握Basic search、Advance search、Sidebars、Single Citation Matcher、Clinical Queries 等功能；熟练掌握检索结果的浏览与输出方法。
检索提示：①一般检索可以利用基本检索页面的自动匹配检索功能再结合sidebars完成；在检索结果页面的右下部分“Details”框可查看检索系统根据用户输入的检索词自动转换成的后台检索表达式，并允许用户修改后继续检索；②期刊库（Journals Database）可查阅期刊的出版信息、在美国国立医学图书馆的收藏情况，以及期刊刊载的论文；③单篇引文匹配器(Single Citation Matcher)用于查找特指的一篇文献记录；④临床咨询（Clinical Queries）采用了内置过滤器（filter）技术，专为临床医师提供快捷查询疾病的治疗、诊断、病因学、预后以及疾病预测指南、系统综述、循证医学、临床遗传学等方面研究文献。
1．模拟练习：浏览PubMed检索主页的各项检索功能，试查：2000年以来有关肺肿瘤与吸烟的研究文献。
（1）词组自动匹配检索、限定检索和修改检索策略练习①在检索提问框中输入lung cancer smoking，不加任何逻辑运算符和限定条件，执行检索；②在[Details]框浏览检索系统自动匹配转换而成的检索表达式，可根据自己的需求修改检索式重新检索；③在sidebars中将上述检索结果筛选出版年为近两年；限定”Core Clinical Journals”，执行检索，浏览检索结果。
（2）浏览检出文献记录及相关文献，练习输出检索结果①分别以Summary、Abstract、MEDLINE等格式浏览检出的文献记录；②练习File、E-mail、Clipboard等功能。
PubMed 医学文献检索
（2）刊名转换表（Journal Tanslation Table）
包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。 该转换表能把键入的刊名全称转换为 “MEDLINE缩写[Journal Name]”后进行检索。 如：在检索提问框中键入：“new England journal of medicine”, PubMed将其转换为“N Engl J Med [Journal Name]”后进行检索。
PubMed系统是用于检索MEDLINE、PreMEDLINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国 国立医学图书馆最重要的书目文摘数据库，内 容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生 保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和 地区的4500余种生物医学期刊，现有书目文摘 条目1700万余条，时间起自1950s。
PubMed 网上更新速度是每周一次。 PubMed数据库收录的文献大多数原始语 种也是英语，或有英文摘要，但1975年 以前的文献无英文摘要。
一、辅助检索功能
辅助检索功能包括条件限定【Limits】、预 览/索引【Preview/Index】、检索史【History】 和粘贴板【Clipboard】4种功能设置。
三、批量文献匹配
四、词汇自动转换功能 （Automatic Term Mapping） ）
在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按 顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检 索。 （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括 MeSH MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发 现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的 MeSH词和Text Word词（题名词和文摘词）进行检索。 例如：键入“Pancreatic cancer”，系统将其转换成 “Panreatic Neoplasms[MeSH Terms] OR Pancreatic cancer[Text word]”后进行检索。
医学文献检索(PubMed)
PubMed的功能和用途
PubMed不仅提供了文献的搜索和访问服务，还提供了作者、期刊、引用等高 级检索功能。它被广泛用于医学研究、临床实践和学术交流。
PubMed的数据库结构和搜索词语
PubMed的数据库结构由文章的标题、摘要、关键词、作者等元素构成。通过选择合适的搜索词语，可以提高 检索结果的准确性和相关性。
PubMed中的文献类型有哪些？
PubMed中包含了各种类型的医学文献，包括研究论文、临床试验、综述文章、案例报告等。可以根据需求选 择不同类型的文献。
医学文献检索(PubMed)
PubMed是生命科学和生物医学领域的一种免费资源，提供了世界各地医学文 献的搜索和访问服务。
Байду номын сангаас
什么是PubMed？
PubMed是由美国国立卫生研究院（NIH）开发和维护的一个生物医学数据库，其中包含了医学领域的上百万篇 研究文献。
PubMed的历史和发展
PubMed起源于20世纪70年代，最初是一个由计算机制作的CD-ROM数据库。随着互联网的发展，PubMed逐渐 成为全球科研人员的主要文献检索工具。
如何通过关键词在PubMed中搜索医学文献？
在PubMed中，可以使用关键词来进行简单的文献检索。通过输入与所需主题相关的关键词，可以快速找到相 关的医学文献。
如何使用MeSH词汇在PubMed 中进行高级搜索？
MeSH词汇是一种用于描述医学主题的控制词汇。在PubMed中，使用MeSH词 汇可以进行更精确和细致的高级文献检索。