白菜类蔬菜亲缘关系的AFLP 分析
RFLP和AFLP分析白菜型油菜和甘蓝型油菜遗传多样性及其在油菜改良中的应用价值(英文)
RFLP和AFLP分析白菜型油菜和甘蓝型油菜遗传多样性及其在油菜改良中的应用价值(英文)刘仁虎;孟金陵【期刊名称】《遗传学报：英文版》【年(卷),期】2006(33)9【摘要】采用RFLP和AFLP标记对来自中国和欧美的7份甘蓝型油菜和22份白菜型油菜进行了遗传多样性分析。
在这29份材料中,166个酶-探针组合和2对AFLP引物共检测到1477个RFLP标记和183个AFLP标记。
RFLP数据显示以拟南芥EST克隆作探针比用油菜基因组克隆做探针能检测到更多的多态性位点,且采用EcoRⅠ或BamHⅠ酶切比HindⅢ酶切多态性好,白菜型油菜和甘蓝型油菜中基因的拷贝数平均都为3个左右。
UPGMA聚类分析表明中国白菜型油菜的遗传多样性比甘蓝型油菜和欧美白菜型油菜丰富,欧美甘蓝型油菜与欧美白菜型油菜聚为一类,而与中国甘蓝型油菜差异更大。
中国白菜型油菜丰富的遗传多样性为中国甘蓝型油菜的改良提供了宝贵的资源,揭示了利用白菜型油菜A基因组和甘蓝型油菜A基因组间亚基因组杂种优势的可能性。
【总页数】10页(P814-823)【关键词】限制性片断长度多态性;扩增片断长度多态性;遗传多样性;油菜育种;亚基因组杂种优势【作者】刘仁虎;孟金陵【作者单位】华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室【正文语种】中文【中图分类】S635.1;S511.03【相关文献】1.分子标记技术在我国甘蓝型油菜资源遗传多样性研究中的应用进展 [J], 董云;庞进平;王毅;方彦2.RAPD和AFLP在分析尼罗罗非鱼遗传多样性研究中的应用比较 [J], 杨东;余来宁3.AFLP在植物种质资源鉴定与遗传多样性分析中的应用 [J], 王姗姗; 刘小娇; 靳玉龙; 白婷; 朱明霞; 王波; 张文会; 张玉红4.用RFLP标记分析甘蓝型油菜的遗传多样性 [J], 孟金陵;A.Sharpe;C.Bowman;田志宏;傅廷栋;钱秀珍;D.Lydiate5.人工合成甘蓝型油菜中花色与芥酸含量的遗传连锁分析(英文) [J], 刘雪平;涂金星;陈宝元;傅廷栋因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
大白菜基因组DNA的提取及AFLP反应体系的建立
１ ｔ ｎ ｌ ｎ ￣ｅｒ ｇＲ ｓａｃ ｅｔｒ ｏ Ｖｅｅ ｂｅＢｅ ｉｇ １０ ９ ； ｎ ｔｕｅ ｆ ｇｔｂｅ ｄＦｏ ｒ ｏ Ｃ ｉｅｅ ａ ｅ ｉ ａ Ｅ ｇａｅｉ ｅｅｒｈＣ ｎｅ ｆｒ ｇｔ ｌ， ｉｎ ， ０ ０ ７ ２Ｉｓｔｔ ｏ Ｖｅｅａｌｓ ｎ ｌｗｅｓ ｆ ｈｎ ｓ Ａｃｄｍｙｏ Ａｇｉ ｌ ｒ ｅ－ Ｎａ ｏ ｎ ａ ｊ ｉ ａ ｆ ｒ ｕｔ ｅＳ ｉ ｃ ｕ ｅ ｃ， ｏ ｍｇ １０ ８ ｎ ｃＢ ｉ ， ００ １ ｊ Ｃ ｒ ｓｏ ｄｎ ｌ０． ｎ ｓｕｈ ｎ ｅｃ ． ｍ ｏｒ ｐ ｎ ｉｇａｌ ｒｍｅｇｈ ｃｕ ＠ｎ ｒｖｏ ｅ ｌｈ ｏ
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大白菜基因组DNA的提取及AFLP反应体系的建立
菜基因组 ＡＦＬＰ 分析的技术体系，为从分子水平上 认识大白菜种质的遗传多样性和遗传亲缘关系、构 建大白菜遗传连锁图谱等研究奠定基础。
１ 材料和方法
蔬菜，在全国蔬菜栽培面积中占第一位（中华人民共 １．１ 大白菜种质材料
和国农业部，２００４），对其基础理论以及重要经济性
状进行分子水平的研究，为有效地利用现有资源进
分子植物育种 ３７２ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｌａｎｔ Ｂｒｅｅｄｉｎｇ
１．２ 试剂
１０ ×Ｈ Ｂｕｆｆｅｒ，ＤＮＡ 模 板 ４．０ μＬ （ 约 １２０ ｎｇ），和
本试验采用 ＡＦＬＰＴＭ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｓｙｓｔｅｍ Ｉ Ｋｉｔ，内切 酶为 ＥｃｏＲⅠ／ＭｓｅⅠ。ＡＦＬＰ Ｐｒｅ－ａｍｐ Ｐｒｉｍｅｒ ＭｉｘⅠ、引 物试剂盒、１００ ｂｐ ＤＮＡ ｌａｄｄｅｒ、３０￣３３０ ｂｐ ＤＮＡ ｌａｄｄｅｒ 均为 Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ 公司产品。Ｔａｑ 酶选用赛百盛产品。
分子标记技术与数值分类方法相结合，是研究 植物遗传多样性与亲缘关系，从而对品种资源合理 利用与保护的有利工具（黄建安等， ２００６）。扩增片段 长度多态性（ＡＦＬＰ）是 ２０ 世纪 ９０ 年代初期发展的一
种分子标记技术，该技术结合了 ＲＦＬＰ 的稳定性和 ＲＡＰＤ 技术的简便高效性，同时又能克服 ＲＦＬＰ 带型 少、信息量小以及 ＲＡＰＤ 技术不稳定的缺点（杨娟等， ２００５； 王惠哲等， ２００７）。因为 ＡＦＬＰ 技术显现的多态
编号 Ｓｅｒｉａｌ Ｎｏ． １７ １８ １９ ２０ ２１ ２２ ２３ ２４ ２５ ２６ ２７ ２８ ２９ ３０ ３１ ３２
种质名称（代号） Ｇｅｒｍｐｌａｓｍ ｎａｍｅｓ 正定二桩 Ｚｈｅｎｇｄｉｎｇ Ｅｒｚｈｕａｎｇ 安阳大包 Ａｎｙａｎｇ Ｄａｂａｏ 玉泉抱头青 Ｙｕｑｕａｎ Ｂａｏｔｏｕｑｉｎｇ 大青口核桃纹 Ｄａｑｉｎｇｋｏｕ Ｈｅｔａｏｗｅｎ 通县大青口 Ｔｏｎｇｘｉａｎ Ｄａｑｉｎｇｋｏｕ 北京橘红心 Ｂｅｉｊｉｎｇ Ｊｕｈｏｎｇｘｉｎ 兴城麻叶 Ｘｉｎｇｃｈｅｎｇ Ｍａｙｅ 晋菜三号 Ｊｉｎｃａｉ３ 连江平头连江白 Ｌｉａｎｊｉａｎｇ Ｐｉｎｇｔｏｕ Ｌｉａｎｊｉａｎｇｂａｉ 鱼溪白 Ｙｕｘｉｂａｉ 集安大花心 Ｊｉ＇ａｎ Ｄａｈｕａｘｉｎ 泌阳菊花心 Ｂｉｙａｎｇ Ｊｕｈｕａｘｉｎ 福山二包头 Ｆｕｓｈａｎ Ｅｒｂａｏｔｏｕ 福山大包 Ｆｕｓｈａｎ Ｄａｂａｏ 焦作小包心 Ｊｉａｏｚｕｉ Ｘｉａｏｂａｏｘｉｎ 洛阳大包头 Ｌｕｏｙａｎｇ Ｄａｂａｏｔｏｕ
白菜类蔬菜遗传多样性的AFLP分子标记研究
白菜类蔬菜遗传多样性的AFLP分子标记研究郭晶心;周乃元;马荣才;曹鸣庆【期刊名称】《农业生物技术学报》【年(卷),期】2002(010)002【摘要】首次对白菜(Brassica rapa)类蔬菜的遗传多样性和分类进行了AFLP分子标记研究.共采用了137份材料,从64对引物组合中选择了4对扩增条带多、多态检出率高的3+3引物组合,检测了210个位点,并对AFLP数据进行了聚类分析.结果表明,芜菁和白菜类蔬菜各自单独聚为一类,它们的亲缘关系较远.在白菜类蔬菜当中,所有大白菜和薹菜聚为一类,它们是比较特殊的类群,且亲缘关系密切.小白菜的聚类结果与其园艺学分类差别较大.小白菜各类型间的相似性程度较低,说明小白菜的起源较大白菜要早.大白菜的聚类表明,大白菜现有品种的遗传多样性较为狭窄.【总页数】6页(P138-143)【作者】郭晶心;周乃元;马荣才;曹鸣庆【作者单位】北京农业生物技术研究中心,北京,100089;北京农业生物技术研究中心,北京,100089;北京农业生物技术研究中心,北京,100089;北京农业生物技术研究中心,北京,100089【正文语种】中文【中图分类】S634【相关文献】1.甘肃省主栽马铃薯品种遗传多样性的AFLP与SSR分子标记分析 [J], 李建武;李灏德;国宏;李高峰;马胜;张荣;贾小霞;齐恩芳2.利用AFLP分子标记对广西荔枝优稀种质遗传多样性及分类研究 [J], 彭宏祥;曹辉庆;朱建华;廖惠红;黄凤珠;李江舟;梁文3.基于AFLP分子标记探讨福建近海竹荚鱼群体遗传多样性 [J], 张丽艳;牛素芳;张曼;王军4.香鱼(Plecoglossus altivelis)养殖群体遗传多样性的AFLP分析及性别特异性分子标记筛选 [J], 闫松松;苗亮;李明云;范慧慧;胡谋;陈炯;史雨红5.基于AFLP和SSR分子标记的两个优良彩叶桂品种遗传多样性分析 [J], 陈雅玲; 罗永松; 陶秀花因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
AFLP标记技术在大白菜种子真实性及品种纯度鉴定中的应用
AFLP标记技术在大白菜种子真实性及品种纯度鉴定中的应用田雷;王辉;孙江;贾希海;曹鸣庆;郭晶心;周乃元
【期刊名称】《中国蔬菜》
【年(卷),期】2001(000)004
【摘要】@@近年来,种子生化鉴定技术的应用对种子纯度检验的准确、快速和实用起了很大推动作用,但生理生化指标(如同工酶等)存在组织特异性和可利用位点有限,针对性强等限制因素.笔者对AFLP标记技术在大白菜种子真实性及品种纯度鉴定中的应用效果进行了探讨,以期建立一种稳定、快速、准确的鉴定方法.
【总页数】2页(P29-30)
【作者】田雷;王辉;孙江;贾希海;曹鸣庆;郭晶心;周乃元
【作者单位】北京市种子管理站检验中心,;北京市种子管理站检验中心,;北京市种子管理站检验中心,;北京市种子管理站检验中心,;北京市农科院生物技术中心;北京市农科院生物技术中心;北京市农科院生物技术中心
【正文语种】中文
【中图分类】S634
【相关文献】
1.AFLP分子标记技术在浙蒲2号种子纯度快速鉴定中的应用 [J], 王玲平;戴丹丽;吴晓花;汪宝根;李国景
2.AFLP标记技术在鉴定甘蓝种子真实性及品种纯度中的应用 [J], 田雷;王辉;孙江;贾希海;曹鸣庆;郭晶心;周乃元
3.SSR分子标记技术在西瓜品种纯度快速鉴定中的应用研究 [J], 牛茜;田雅栏;吴明
生
4.不同种子蛋白在杂交油葵品种纯度定中应用的可行性研究 [J], 林展;金石桥;傅友兰;赵建宗
5.种子蛋白质电泳在品种纯度鉴定中的应用 [J], 郑成超;金锡奎
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利用大白菜DH群体构建AFLP遗传连锁图谱
利用大白菜DH群体构建AFLP遗传连锁图谱
张晓芬;王晓武;娄平;张晓伟;王永清;原玉香;赵建军;孙日飞
【期刊名称】《园艺学报》
【年(卷),期】2005(32)3
【摘要】以大白菜‘汴早-26’和‘光90E16’的F1代进行游离小孢子培养所获得的含有59个株系的DH群体为试材,利用AFLP技术通过63对引物筛选共获得346个AFLP多态性标记,运用JoinMap3.0软件构建大白菜遗传连锁图谱。
该图谱主要包括10个连锁群,总图距为708cM,平均图距为2.0cM。
【总页数】6页(P443-448)
【关键词】大白菜;DH群体;AFLP;遗传连锁图谱
【作者】张晓芬;王晓武;娄平;张晓伟;王永清;原玉香;赵建军;孙日飞
【作者单位】中国农业科学院蔬菜花卉研究所;河南省农业科学院生物技术研究所;四川农业大学林学园艺学院
【正文语种】中文
【中图分类】S634.1
【相关文献】
1.利用抗、染根肿病F2群体构建大白菜AFLP遗传连锁图谱 [J], 王淼;王剑;李宏博;林荣杓;朴钟云
2.利用AFLP构建大白菜高密度遗传连锁图谱 [J], 王剑;许磊;Su Ryun Choi;Yong Pyo Lim;朴钟云
3.利用DH群体构建大白菜分子遗传图谱 [J],
4.利用芥蓝×青花菜DH群体构建AFLP连锁图谱 [J], 王晓武;娄平;何杭军;杨宝军;张延国;赵建军
5.利用大白菜抗感干烧心病F2群体构建AFLP遗传连锁图 [J], 孙秀峰;陈振德;李德全
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AFLP分子标记应用于白菜品种鉴定
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利用AFLP构建大白菜高密度遗传连锁图谱
利用AFLP构建大白菜高密度遗传连锁图谱王剑;许磊;Su Ryun Choi;Yong Pyo Lim;朴钟云【摘要】以大白菜根肿病抗性材料CR Shinki DH系和感病性材料大白菜自交系94 SK杂交F_2 的138个单株作为构建遗传图谱的群体.利用AFLP技术通过45对引物筛选共获得835个AFLP标记,应用其中608个AFLP标记和6个与抗根肿病基因CRb紧密连锁的AFLP标记转化成的SCAR标记构建了一张包含556个标记位点、10个连锁群、覆盖基因组长度为795 cM的连锁图谱.该图谱中每个连锁群上的标记数在10～83个之间,平均图距在0.86～4.34 cM之间,连锁群长度在43.4～120.9 cM之间.CRb基因定位于第3连锁群9 cM的范围内.【期刊名称】《江苏农业科学》【年(卷),期】2010(000)001【总页数】4页(P27-30)【关键词】AFLP;大白菜;遗传连锁图谱;抗根肿病基因【作者】王剑;许磊;Su Ryun Choi;Yong Pyo Lim;朴钟云【作者单位】沈阳农业大学园艺学院,辽宁沈阳110161;沈阳农业大学园艺学院,辽宁沈阳110161;College of Agriculture and Life Science,Chungnam National University,Daejeon 305-764,Korea;College of Agriculture and Life Science,Chungnam National University,Daejeon 305-764,Korea;沈阳农业大学园艺学院,辽宁沈阳110161【正文语种】中文【中图分类】S634.103.6大白菜[Brassica rapa L. ssp. pekinesis (Lour. ) Olsson]是芸薹属植物中最重要的叶菜类作物之一，原产于我国，在全国各地均有栽培，它在整个蔬菜生产中占有很重要的地位。
青麻叶大白菜种质资源遗传多样性的AFLP分析
２ Ｓｈｏ ｏ ｇ ｃｌ ｒ ａｄＢｏｎｉ ｅ ｎ ，ｉ ｊ ｎ ｅ ｉ ，ｉ ｊ ３０７ ，ｈｎ ； ．ｃｏｌ ｆ ｒ ｕｔ ｅ ｎ ｉ ｇ ｅｒ ｇＴａ ｉ Ｕ ｉ ｒｔ Ｔａ ｉ ００ ２Ｃ ｉ Ａ ｉ ｕ ｅ ｎ ｉ ｎｎ ｖ ｓｙ ｎ ｎ ａ
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摘要： 利用 Ａ Ｌ ＦＰ分 子标 记 技 术 ， ４ 份 青 麻 叶大 白菜 品 系 间 的遗 传 多 样性 与 亲缘 关 系进 行 分 析 。５ 引物 组 合 在 对 ２ 对
４ ２份 品系 中 共获 得 １４条带 ， 中多态 性 条 带 ８ ２ 其 ９条 ， 态性 比例 为 ７ ．％ 。计 算 ４ 多 １８ ２份 品系 间 的相 似 系数 范 围 为 ０ ４ ９ ． ～ ６ ０９７平 均 ０７７ ． ， ７ ．０ 。聚类 结 果 可划 分 为 ４组 ， 一组 大 部 分来 源 天 津市 津 南 区和 塘 沽 地 区 ； 二 组 基 本上 都 来 自津 南 区 ； 第 第
冯 英 ， 张秦 英 ， 莉 ， ， 一 刘 张 显 ， 闻风 英 张 斌 ，
（ ． 北农 林 科技 大 学 园 艺学 院 ， １西 陕西 杨 凌 ７２０ ；． １１０２ 天津 大 学 农 业 与生 物工 程 学 院 ， 津 天 ３０８） ０３４ ３０７ ００２ ３天 津科 润 蔬 菜研 究 所 ， ． 天津
白菜Ogura细胞质雄性不育基因组的AFLP分析
徐
２１ ０ ２年第 ４ ｏ卷第 ２期
一 ２ １一
海， 单奇伟， 张永吉， 等．白 Ｏ ｕａ 菜 ｇｒ 细胞质雄性不育基 因组的 Ａ Ｌ Ｆ Ｐ分析［ ］ Ｊ ．江苏农业科学 ， １ ， （ ） ２ — ３ ２ ２ ４ ２ ： ２ ０ ０ １
白菜 Ｏ ｕａ ｇｒ 细胞质雄性不育基 因组 的 Ａ Ｉ ＦＰ分析
Ｏ ｕａ ｇｒ胞质不 育 同 源类 型 的 白菜不 育 系及 其 保 持 系基 因组 Ｄ Ａ进行分析 ， Ｎ 以期找 到与不 育性 相关 的分子标 记 ， 并对 特 异片段进行生物信息学分 析 ， 为克隆不 育基 因和深入研究 不
５； ｓ 接 头 ： Ａ Ｇ Ｔ Ａ Ｔ Ｃ Ｇ Ｇ一 ３ Ｔ Ｃ Ｃ Ｍ ｅＩ ５ 一Ｇ Ｃ Ａ Ｇ Ｇ Ｃ Ｔ Ａ ３ ， 一 Ａ Ｔ
徐 海 ， 单奇伟 张永吉 ， ， 张 慧 ， 陈龙正 宋 ， 波 袁希汉 ，
（． １ 江苏省农业科学 院蔬菜研究所 ，江苏南京 ２ ０ １ ２ 南京农业大学 园艺学 院，江苏南京 ２ ０９ １０ ４； ． １０ ５； ３ 中国科学 院遗传与发育生物学研究所 ，北京 １０ ０ ） ． ０ １ １
白菜 （ ｒｓｃ ｐ ｐ ｃｉｅｓ ） Ｂａｓ ａｒ ａｓ ． ｈｎｎｉ 原产 中国 ， 中国南 方 ｉ ａ ｓ ｓ 是
田中发 现的天然雄性不 育株， 白菜杂交 并经 ６代 以上 回交 与 育成 的稳 定 的不 育 系 ， 经鉴 定 为 Ｏ ｕａ细胞 质 雄性 不 育 系 ｇｒ （ ｇｒ Ｍ ） Ｏ ｕａＣ Ｓ 。该不育 系败育彻底稳定 ， 综合经济性状 优 良，
ＣＴＣＧＴＡＧＡＣＴＧＣＧＴ ＡＣＡＴＧＣＡ 一３ ３ 一ＣＡＴＣＴＧ ＡＣＧＣＡ ＴＧＴ ，
一
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园 艺 学 报 2001,28(4):331～335Acta H orticulturae S inica白菜类蔬菜亲缘关系的AFLP分析孙德岭1 赵前程2 宋文芹1 陈瑞阳1(1南开大学生命科学学院,天津300192; 2天津市蔬菜研究所,天津300384)摘 要:利用AF LP分子标记技术对白菜类蔬菜间的亲缘关系进行了研究。
使用10对选择性引物组合,扩增出4173条扩增带,并对其进行聚类分析。
结果表明:芜菁与结球白菜和不结球白菜亲缘关系远;而结球白菜与鸡冠菜和毛白菜亲缘关系较近,与其它不结球白菜亲缘关系较远。
从分子水平上分析了薹菜、菜薹、柴乌、箭杆白、马耳朵白等不结球白菜类蔬菜之间的亲缘关系。
关键词:白菜类;AF LP;亲缘关系中图分类号:S634 文献标识码:A 文章编号:05132353X(2001)0420331205白菜类蔬菜包括不结球白菜、结球白菜和芜菁3个亚种类型,因其品种类型丰富、亲缘关系复杂,早期植物分类学家对其定名后,国内外许多学者又根据形态特征、生理性状、杂交关系、染色体组成及地理分布等特性,对其进行过多方面的研究和论证〔1～5〕,但在分类和起源上仍说法不一,存有争议〔6〕。
本研究采用AF LP分子标记技术,从分子水平上分析了白菜类各品种间的亲缘关系,为研究白菜类蔬菜起源、演化及分类提供理论依据。
1 材料与方法供试材料由天津市蔬菜研究所及中国农业科学院蔬菜花卉研究所资源库提供(表1)。
1.1 DNA提取取叶片在液氮冷冻条件下用研钵研碎。
DNA的提取参照Murray的CT AB法〔7〕。
提取到的DNA经0.7%琼脂糖凝胶电泳与已知浓度的Cambda DNA进行对比,对提取的总DNA进行检测。
1.2 AF LP分析参照V os等〔8〕的方法,AF LP试剂盒购自GI BC O2BR L公司。
每个样品总DNA250ng,经限制内切酶EcoRⅠ和MseⅠ消化后,在消化片段末端加上人工接头。
共用了10个EcoR Ⅰ引物(E1:E+ACC,E2:E+AAC,E3:E+AC A,E4:E+ACC,E5:E+ACT,E6:E+ AG C,E7:E+AAC,E8:E+AAC,E9:E+AC A,E10:AG C)和10个MseⅠ引物(M1:M +CT C,M2:M+CTT,M3:M+CTG,M4:M+CTG,M5:M+C AC,M6:M+CT C,M7: M+C AG,M8:M+CT C,M9:M+CTT,M10:M+C AA),其中E和M分别表示EcoRⅠ引物和Mse引物共同序列,E表示的共同序列为5’2G ACTG CG T ACC AATT C23’,M表示的共同序列为5’2G ATG AG T CCT C ACT AA23’,E与M后的3个碱基为选择性碱基,分别接在E和M收稿日期:2000-11-24;修回日期:2001-04-06的3’端。
电泳结束后,将两块玻璃小心分开,把凝胶放入10%的乙酸中固定,直至前沿颜色褪尽,然后用双蒸水洗涤3次,每次2min,沥干水后转至染色液(2g硝酸银,3m L 37%甲醛,溶于2L双蒸水)中染色30min,再用双蒸水洗涤5～6s。
转至显影液(60g 碳酸钠,3m L37%甲醛,400μL10%硫代硫酸钠溶于2L双蒸水中)显色,至电泳条带清晰,加入等体积10%乙酸定影。
将凝胶用双蒸水洗涤后,自然干燥。
1.3 数据处理和分析选择清晰可辨的电泳带,以1和0记录多态片段的有和无,以获得矩阵。
将矩阵用NTSY S软件(1.8版)分析聚类,根据遗传相似性系数用UPG RM方法在微机上完成聚类分析图。
以上述矩阵作原始数据,利用C语言进行编程,完成对白菜类各品种扩增总带数及特异性带数的统计计算。
表1 供试品种T able1 The varieties used in the experiment代号N o.品种Variety拉丁学名Scientific name来 源S ource1长形芜菁Changxing wujing Brassica campestris L.ssp.rapifera M atzg贵州兴仁县X ingren G uizhou2圆形芜菁Y uanxing wujing B.campestris L.ssp.rapifera M atzg安徽怀远县Huaiyuan Anhui3平邑薹菜Pingyi taicai B.campestris L.ssp.chinensis M akino var.tai2tsai H ort山东平邑县Pingyi Shandong4勺子头薹菜Shaozitou taicai B.campestris L.ssp.chinensis M akino var.tai2tsai H ort山东滕县T engxian Shandong5柴 乌Chaiwu B.campestris L.ssp.chinensis M akino安徽合肥市Hefei Anhui6乌塌菜Wutacai B.campestris L.ssp.chinensis M akino var.rosularis Tsen et Lee.江苏南京Nanjing Jiangsu7四月慢S iyueman B.campestris L.ssp.chinensis M akino天津市蔬菜所T ianjin VegetableResearch Institute8明港箭杆白M inggang jianganbai B.campestris L.ssp.chinensis M akino河南新县X inxian Henan9南通鸡冠菜Nantong jiguancai B.campestris L.ssp.chinensis M akino江苏南通市Nantong Jiangsu10毛白菜M aobaicai B.campestris L.ssp.chinensis M akino四川平武县Pingwu S ichuan11马耳朵白M a’erduobai B.campestris L.ssp.chinensis M akino安徽广德县G uangde Anhui12四九菜心S ijiu caixin B.campestris L.ssp.chinensis M akino var.parachinensis Tsen et Lee云南Y unnan13双选菜心Shuangxuan caixin B.campestris L.ssp.chinensis M akino var.parachinensis Tsen et Lee云南Y unnan14丰抗70Fengkang70 B.campestris L.ssp.pekinensis Olss on山东Shandong15太原二青T aiyuan erqing B.campestris L.ssp.pekinensis Olss on山西Shanxi16秋绿75Qiulü75 B.campestris L.ssp.pekinensis Olss on天津T ianjin2 结果与分析2.1 扩增结果本试验中选择了10个引物组合进行AF LP技术分析,获得了较好的扩增结果(图1), 10对引物组合扩增出629个遗传位点,16个品种共获得4173条扩增带。
各品种扩增带分布均匀,最多的是324条带,最少的204条带(表2)。
233 园 艺 学 报 28卷2.2 聚类分析用NTSY S 软件(1.8版)计算出遗传相似性系数,以16个样品间的相似性系数构成矩阵,按UPG MA 法进行聚类分析构建聚类图(图2)。
在聚类图中,当遗传相似性水平取0.62时,可将16个品种分为两大类群。
第一类群包括1号、2号两个芜菁品种;余下14个品种组成了第二大类群,此类群还可进一步分成5个亚群,其中结球白菜14号(丰抗70)、15号(太原二青)、16号(秋绿75)成为一个亚群;不结球白菜中9号(鸡冠菜)、10号(毛白菜)聚为一个亚群;两个薹菜品种3号(平邑薹菜)、4号(勺子头薹菜)在一个亚群;两个菜薹品种13号(双选菜心)和12号(四九菜心)聚类后又与8号(箭杆白)、11号(马耳朵白)聚类后组成一个亚群;5号(柴乌)、6号(乌塌菜)、7号(四月慢)在一个亚群。
图1 白菜类蔬菜16个样品的AF LP选择性扩增结果样品代号名称见表1Fig.1 The AF LP selective amplification result of16samples from Chinese cabb ageSam ple numbers see T able 1表2 白菜类各品种AF LP 特异带和扩增总带数T able 2 Specific and Total AF LP B ands ofChinese cabb age varieties代号N o.特异带S pecific bands扩增总带数T otal bands1726724032436291422635327062255752678428293260101225113291122257130251140204156254162212 注:样品代号名称见表1N ote :Sam ple numbers see T able 1图2 白菜类蔬菜AF LP 标记聚类分析图样品代号名称见表1Fig.2 Clustering figure of AF LP of Chinese cabb ageSam ple numbers see T able 13334期 孙德岭等:白菜类蔬菜亲缘关系的AF LP 分析 433 园 艺 学 报 28卷3 讨论3.1 AF LP技术用于白菜类蔬菜亲缘关系鉴定的可行性本试验采用10对AF LP引物组合获得4173条扩增带。
扩增带清晰,丰富,多态性强,通过聚类分析明显地把来源不同的芜菁、薹菜、菜薹品种各自首先聚类,表明本试验技术和结果的可靠性。
3.2 白菜类蔬菜基因组DNA之间的亲缘关系在聚类图(图2)中取遗传相似水平为0.62时,供试的白菜类各品种分为两大类群。
第一大类群为芜菁亚种,从亲缘关系上看,它与其它白菜类蔬菜亲缘关系远。
第二大类群为结球白菜亚种和不结球白菜亚种。
不结球白菜亚种包括:四月慢、乌塌菜、四九菜心、双选菜心、平邑薹菜、柴乌、马耳朵白、南通鸡冠菜等品种。
而3个结球白菜品种(丰抗70、太原二青、秋绿75)在第二类群的最外侧组成一个独立亚群,表明它与其它不结球白菜亲缘关系也较远,这可能与结球白菜进化程度较高有关,其亲缘关系介于芜菁和不结球白菜之间。
而两个薹菜品种被聚在不结球白菜类中。
谭其猛〔4〕认为中国白菜的野生类型可能较近于今日的薹菜,也就是说在白菜类中,薹菜较为原始。