基于COI基因探讨雉科6个属的分类地位
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材料与方法
试验材料为雉科 4 属 7 种 81 个鸟类的血液， 扩 增、 测定其 COI 序列， 并从 GenBank 和 BOLD 下载了 21 属 46 种 159 条雉科鸟类 COI 基因序列， 本研究共 涵盖了雉科 21 属 46 种 240 条 COI 序列， 见表 1。 1 ． 1 DNA 提取 抽取血液样本的上层血清后， 取 10 μL 的去除 血清的血液样本采用酚氯仿抽提法提取总 DNA， 用 －20 ℃ 保存。 0． 8% 琼脂糖凝胶电泳检测， 1． 2 PCR 扩增
1 ） 中央高校基本科研业务费专项资金（ DL09CA01 ） 。 1985 年 1 月生， 第一作者简介： 刘园园， 女， 东北林业大学野生 动物资源学院， 硕士研究生。 通信作者： 白素英， 东北林业大学野生动物资源学院， 副教授。 E－mail： syb01@ 163． com。 收稿日期： 2011 年 9 月 26 日。 责任编辑： 潘 华。
刘园园张Biblioteka 伟白素英蔡晓琪
李
立
（ 东北林业大学， 150040 ） 哈尔滨，
（ 湖南省野生动物救护繁殖中心）
BOLD 中获取 21 摘 要 试验测定了雉科 4 属 7 种的 81 条 COI 序列， 获得片段长度为 690 bp， 并从 Genbank、 属 46 种的相应序列， 进行了序列和系统发生分析 。通过计算属间遗传距离 ， 并以中华秋沙鸭 （ Mergus squamatus ） 、 ME 法和 ML 法对雉科 46 种鸟类构建系统发育树 ， 马来闭壳龟（ Cuora amboinensis） 为外群， 用 NJ 法、 来探讨雉科内 存在争议属的分类问题 。结果表明： 血雉与鹑类关系更近； 雪鸡属与石鸡属关系很近 ； 山鹑属始终与鹌鹑属聚在一 起； 勺鸡属与雉鹑属相邻而自成一个支 ； 原鸡属与竹鸡属和鹧鸪属始终聚在一起 ； 山鹧鸪属最先分化出来 ， 在整个 雉科类群的基部。 关键词 雉科； COI 基因； 分类地位 分类号 Q959． 7 Phylogenetic Relationships Among Six Genera in Phasianidae Based on COI Genes / Liu Yuanyuan，Zhang Wei，Bai Suying，Cai Xiaoqi（ School of Wildlife Resources，Northeast Forestry University，Harbin 150040 ，P． R． China ） ； Li Li （ Wildlife Conservation and Breeding Center of Hunan Province ） / / Journal of Northeast Forestry University． － 2012 ， 40 （ 6 ） ． －89 ～ 94 A study was conducted to discuss the phylogenetic relationships among Ithaginis，Tetraogallus，Perdix，Pucrasia， Gallus and Arborophila in Phasianidae，which have remained controversial． Eightone COI genes （ 690 bp ） of 7 species form 4 genera were sequenced，and the homologous sequences of 46 species in 21 genera were downloaded from Genbank and BOLD． Genetic distances were calculated and phylogenetic trees of 46 species of birds in Phasianidae were made by the methods of NJ，ME and ML to investigate the classification of controversial genera，using Mergus squamatus and Cuora amboinensis as outgroups． Results show that Ithaginis is relatively close to Perdicini； the relationship between Tetraogallus and Alectoris is very close； Perdix and Coturnix cluster together； Pucrasia and Tetraophasis is adjacent； Gallus，Bambusicola and Francolinus cluster together； Arborophila is at the base of Phasianidae group，and it is the first genus to diverge from other species． Keywords Phasianidae； COI genes； Phylogenetic relationships
双向测序。
Genbank 序列号 / BOLD 序列号
本研究选用的雉科鸟类和外群的序列信息
AY666409 ，DQ432706 ，FJ465298 ，GQ4813 16 ，GQ481315 ，GQ481314 ，GQ481313 ， FJ8 08621 ，USNM550484 ，FJ752426 FJ465299 GU951807 FJ752425 FJ194942 ，FJ752424 ，GQ922643 ，GQ922644 FJ752423 EU165706 1B－973 ，AB073301 BISE－Aves248 ，GQ481648 ，GQ481649． MKP 1444 1B－4569 ， 1B－4570 ，AP003195 ，FJ808632 ，GQ481650 ，GQ481651 ，GQ481652 ， GQ481653 ，HM102295 ，KRIBB 1520． GQ150381 ，GQ150382 GQ150379 ，GQ150380 GQ150378 ，GQ150383 ，GQ150385 ，GQ150386 ，GQ150387 EU165707 GQ482330 ，GQ482331 ，FJ752431． BISE－Aves194 ，BISE－Aves474 ，DQ433069 ，DQ433070 ，DQ433890 ，DQ433891 ，NHMO－ BC404 ，NHMO－BC403 ，GU951808 ，GQ482332 ，DQ433893 ，DQ433892 GQ482760 1B－1015 ， 1B－1029 GQ922647 ，FJ799728 ，GQ922645 ，GQ922 646 ，FJ752428 1B－2330 ， 1B－2331 1B－153 ，FJ752434 ，GQ922603 ，GQ922604 ，GQ922605 ，GQ922606 ，GQ922607 ， GQ922608 ，GQ922609 ，GQ922610 ，JF834896* ． FJ752433 ，GQ922630 ，GQ922631 ，GQ92263 2 ，HQ221859 ，JF834897* ． 1B－927 ，GQ922639 ，GQ922640 GQ922614 ，GQ922613 AB086102 ，AP003317 ，AP003318 ，AP003319 ，AP003321 ，AP003322 ，AP003323 ， AP003580 ，AY235570 ，AY235571 ，DQ648776 ，FJ80863 ，GQ922621 ，PW002 ，X52392 AP003325 AP006746 ，AP003320 ，AP006741 AP003324 GQ922649 GQ871234 AB164627 EU417810 ，GQ922618 ，GQ922619 ，GQ9226 20 ，JF834901* ，JF834902* ，JF834903* 1B－474 ，GQ922611 ，GQ922612 ，GQ922638 EU417811 AY666332 ，AY666562 ，BISE－Aves80 ，BISE－Aves464 ，EF515775 ，FJ752430 ，GQ482362 ～ GQ482364 ，GQ922650 ，GQ922651 ，KRIB B 48 ，KRIBB719 ，KRIBB723 ，KRIBB2915 ， NHMO－BC402 AB164626 EU417812 GQ922648 ，FJ752429 AB164624 ，JF834900* AB164623 ，JF834898* ，JF834899* AB164622 1B－15 ， 1B－367 ， 1B－368 ， 1B－369 1B－361 ， 1B－362 ， 1B－363 ，GU187969 ，JF8349 06* 1B－365 1B－364 ，FJ752427 ，GQ922633 ，GQ922634 ，GQ922635 ，JF834904* ，JF834905* GQ482159 EF011465
雉科（ Phasianidae ） 鸟类大都雌雄异色， 雄性具 有艳丽的装饰性羽毛， 雌性多具棕褐色的隐蔽色。 血雉、 雪鸡、 斑翅山鹑和山鹧鸪的尾较翅短， 尾羽的 换羽顺序从中央到外侧， 这些特点与鹑族各属相同； 勺鸡与原鸡雌雄异色， 被划为雉族， 而这 6 个属的分 类地位一直存在争议。 线粒体 DNA 中的细胞色素 C 氧化酶亚基 I（ cytochrome oxidase subunit I，COI ） ， 其突变速度是核 DNA 突变速度的 10 倍， 由于线粒体遗传为母系遗 传发生基因重组的可能性就低。进化主要以碱基替 换为主， 含有系统发育信号。 COI 不但能够保证足 ［1 ］ 够的变异， 而且又容易用通用引物扩增 ， 已经用 。 本文通过测定雉 于鸟类系统发生关系的研究 科鸟类的 COI 序列， 并结合 GenBank 和 BOLD 中的 雉科鸟类 COI 序列， 为研究雉科存在争议比较大的 6 属的分类地位问题提供一定的分子理论依据 。
我国6个地方鸡品种线粒体COI基因遗传多样性分析
我国6个地方鸡品种线粒体COI基因遗传多样性分析
屠云洁;高玉时;周新民;张学余;王克华;唐修君
【期刊名称】《扬州大学学报：农业与生命科学版》
【年(卷),期】2007(28)3
【摘要】以我国地方鸡品种为研究对象，测定6个地方鸡品种线粒体细胞色素C
氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因部分序列，分析COⅠ基因序列的多态性。
结果表明：6个地方鸡品种线粒体COⅠ基因序列有22个突变位点，占分析位点总数的3．52％；6个地方鸡品种单倍型多样度平均为0．7274，核苷酸多样度平均为0．352％，品种间核苷酸分歧度为0．283％～0．791％。
6个地方鸡品种的
COⅠ基因序列具有较高的遗传多样性。
【总页数】3页(P31-33)
【关键词】地方鸡品种;线粒体CO;Ⅰ基因;遗传多样性
【作者】屠云洁;高玉时;周新民;张学余;王克华;唐修君
【作者单位】中国农业科学院家禽研究所
【正文语种】中文
【中图分类】S831.2
【相关文献】
1.基于线粒体COI基因序列的丽文蛤群体遗传多样性和遗传结构分析 [J], 田云方;叶莹莹;吴常文;傅泽钦
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李超;张明昭;顾颖;孙效文
3.基于线粒体COI基因序列的丽文蛤群体遗传多样性和遗传结构分析 [J], 田云方;叶莹莹;吴常文;傅泽钦;
4.江苏省地方鸡品种线粒体DNA遗传多样性分析 [J], 贾晓旭;唐修君;樊艳凤;陆俊贤;葛庆联;黄胜海;高玉时
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基于线粒体COⅠ基因序列的梭鲈野生群体遗传结构
基于线粒体COⅠ基因序列的梭鲈野生群体遗传结构鲁翠云;孙志鹏;曹顶臣;耿龙武;那荣滨;吴学工;郑先虎【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2024(48)1【摘要】为了解梭鲈种群的遗传结构,实验利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因部分序列分析了中国6个和中亚2个群体的遗传差异,并与欧洲群体的单倍型序列进行了比较。
结果在640 bp的COⅠ基因序列中检测到5个变异位点,定义了7种单倍型,发现Hap1为8个梭鲈群体的共享单倍型,且与欧洲群体的HapA相同,在中国群体所占比例(93.36%)高于中亚群体(72.58%)和欧洲群体(53.85%);Hap2和Hap3是中国群体的特异单倍型,而Hap4~Hap7为中亚群体的特异单倍型。
单倍型序列的聚类图和网络图均显示Hap1/A为梭鲈群体的原始单倍型,中国和中亚群体的特异单倍型相对于原始单倍型仅有1~2个位点的变异,属于Hap1/A的亚型,与欧洲群体的特异单倍型具有较大的差异。
每个群体检测到1~4种单倍型,斋桑湖(ZS)群体单倍型最多,而中国的腾格里湖(NX)、兴凯湖(XK)和鸭绿江(YJ)群体仅有1个单倍型(Hap1);塔什干(TS)群体的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)最高(Hd=0.514±0.069;π=0.00079±0.00011),其次是ZS群体,而中国梭鲈群体的多样性参数较低。
AMOVA分析结果显示,梭鲈群体间遗传变异占20.74%,群体间遗传分化程度较高(0.15≤F_(st)=0.20736<0.25),TS群体与ZS群体和中国群体间的遗传分化极大(F_(st)>0.25),中国群体中仅黑河(HH)群体与其他群体的遗传分化较大,而中国其他5个群体间无遗传分化。
基于群体间遗传距离的系统进化树显示,来自中国的6个梭鲈群体与哈萨克斯坦的ZS群体聚为一支,而乌兹别克斯坦的TS群体独立为一支。
研究结果为梭鲈群体的繁殖及放流管理提供了参考。
利用线粒体COII基因序列对中国尾蛱蝶属系统分化的研究(鳞翅目:蛱蝶科)
利用线粒体COII基因序列对中国尾蛱蝶属系统分化的研究(鳞翅目：蛱蝶科)王戎疆;万宏;龙玉;雷光春;李绍文【期刊名称】《昆虫学报》【年(卷),期】2004(047)002【摘要】利用线粒体C0II基因序列分析法,研究了我国尾蛱蝶属5种蝴蝶的系统分化.结果表明,在尾蛱蝶属5个种的12个样品中,405 bp长的COII片段有11.4%的位点为多态性位点,大部分的碱基改变是转换.各物种内不同个体间的差异明显小于不同物种间的差异,种内个体间的差异一般为0.5%～1.5%,各物种间的差异绝大多数在4%以上.利用最大似然性法构建的尾蛱蝶属聚类关系图显示,尾蛱蝶属蝴蝶分为两大分支,一支包括大二尾蛱蝶、二尾蛱蝶和忘忧尾蛱蝶,另外一个分支包括窄斑凤尾蛱蝶和黑凤尾蛱蝶聚在一起.在大二尾蛱蝶、二尾蛱蝶和忘忧尾蛱蝶这一分支中,大二尾蛱蝶和忘忧尾蛱蝶的亲缘关系较近,而二尾蛱蝶较远.这些分子系统学的结果均与形态学的结果相一致,是对形态分类的有力支持.【总页数】5页(P243-247)【作者】王戎疆;万宏;龙玉;雷光春;李绍文【作者单位】北京大学生命科学学院,北京,100871;北京大学生命科学学院,北京,100871;北京大学生命科学学院,北京,100871;北京大学生命科学学院,北京,100871;北京大学生命科学学院,北京,100871【正文语种】中文【中图分类】Q969【相关文献】1.中国粉眼蝶属分类研究(鳞翅目:蛱蝶科:眼蝶亚科) [J], 袁峰;史宏亮;李宇飞;谌安明2.中国绢斑蝶属分类研究(鳞翅目,蛱蝶科,斑蝶亚科) [J], 张雅林;房丽君;周尧3.中国尾蛱蝶属分类研究并记一新种(鳞翅目,蛱蝶科) [J], 房丽君;张雅林4.基于线粒体Cyt b基因和CO Ⅰ基因序列研究豹蛱蝶亚科(鳞翅目,蛱蝶科)10属间的系统发生关系 [J], 张大秀;郝家胜;邹方振;朱国萍;潘鸿春;张小平5.中国秆野螟属昆虫线粒体COⅠ基因遗传多样性及其分子系统学研究(鳞翅目:草螟科) [J], 杨瑞生;王振营;何康来;白树雄;姜义仁因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
基于线粒体COⅠ基因序列探讨卵翅蝗亚科系统发育关系
［摘要］基于线粒体 COⅠ基因 538 bp 片段重建了斑腿蝗科中 4 亚科（卵翅蝗亚科、稻蝗亚科、禿蝗亚科和黑蝗亚科）10 属 37 种
和锥头蝗科 1 属 1 种（外群）的系统发育关系。结果显示：（1）4 亚科的亲缘关系为（（（卵翅蝗亚科、稻蝗亚科）秃蝗亚科）黑蝗亚
大理大学学报
JOURNAL OF DALI UNIVERSITY
［DOI］10. 3969 / j. issn. 2096-2266. 2016. 12. 014
第1卷 第12期 2016年12月 Vol.1 No.12 Dec. 2016
基于线粒体 COⅠ基因序列探讨卵翅蝗亚科系统发育关系
胡 洲，徐吉山，毛本勇*
较差的碱基后，使用 ClustalX 软件〔14〕进行同源性比 对，共得到平均长度为 619 bp 的数据集，序列采用 MEGA4.0〔15〕进行序列组成及饱和度分析，之后采用 ML 法构建系统发育树。见表 1。
表 1 样品来源及其 COⅠ基因序列 GenBank 登录号
亚科
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ïïLeabharlann ï扩增体系为：DNA 模板 3 μL、上游引物 2 μL、下 游引物 2 μL、Taq 酶 1 μL、Buffer 10 μL、DNTP 2 μL、 H2O 30 μL。
PCR 反应条件：95 ℃预变性 3 min，运行循环： 95 ℃变性 30 s，60 ℃退火 1 min，72 ℃延伸 1 min，共 35 个循环，72 ℃延伸 10 min，25 ℃保存。个别样品 在实验中出现非特异的条带，且经优化条件无法去
目前缺乏针对卵翅蝗亚科开展的分子系统学 研究，或仅见涉及该亚科个别属的 1~2 个物种的报 道，所以有必要在增加属级单元和物种数量以加大
基于线粒体COI序列分析对紫贻贝群体遗传多样性的研究分析
基于线粒体COI序列分析对紫贻贝群体遗传多样性的研究分析沈玉帮;张俊彬;冯冰冰;李家乐【期刊名称】《海洋通报》【年(卷),期】2011(030)004【摘要】本文采用线粒体COI基因序列分析对我国沿海6个紫贻贝群体124个个体的遗传多样性和群体结构进行了初步研究.在紫贻贝6个群体中共发现13个单倍型和33个核苷酸多态位点.青岛群体单倍型数目是最多的,温州群体、丹东群体和宁德群体次之.6个紫贻贝群体的基因多样性为0.569～0.821,核苷酸多样性为0.015 5～0.051 0,表现出较低的遗传多样性.紫贻贝不同群体之间的遗传分化较小,所有群体之间没有发生显著的遗传分化.分子方差分析表明,紫贻贝的变异主要存在于群体内.该研究为紫贻贝的可持续开发和资源保护提供了一定的理论依据.%Genetic biodiversity of Mytilus galloprovincialis was estimated, based on sequence analyses of the mitochondrial cytochrome oxidase I (mfDNA COI) gene, employing 124 individuals of 6 groups along the coast of eastern and southern china. 13 haplotypes and 33 variation sites were observed in the sequences of the 124 individuals. QD population had the greatest number of haplotypes, while secondary for WZ population, DD population and ND population. Among all six populations, gene diversities ranged from 0.569 to 0.821, and the nucleotide diversities from 0.0155 to 0.0510, suggesting that M. Galloprovincialis has low genetic diversity. The pairwise estimates of FST between M. Galloprovincialis populations weresmall, and no significant genetic differentiation was observed between populations. AMOVA analysis showed that a large proportion of variation was attributed within population of M. Galloprovincialis. This study provides objective data for the sustainable exploitation and fishery management of M. Galloprovincialis.【总页数】6页(P435-440)【作者】沈玉帮;张俊彬;冯冰冰;李家乐【作者单位】上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306;上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306;上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306;上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306【正文语种】中文【中图分类】S917.4【相关文献】1.紫贻贝野生群体与养殖群体线粒体COI基因的遗传比较分析 [J], 庞宇杰;李继姬;郭宝英2.基于线粒体COⅢ基因分析厚壳贻贝（Mytilus coruscus）养殖群体遗传多样性[J], 周超;郭宝英;吴常文;叶莹莹;李继姬;冯广朋3.基于线粒体D-loop区和COI基因序列研究2个禾花鲤群体和野生鲤群体的遗传多样性与系统进化关系 [J], 潘贤辉; 罗辉; 叶华; 林勇; 周康奇; 陈忠; 杜雪松; 黄姻; 覃俊奇; 文露婷; 潘志忠; 邓潜4.基于线粒体COI序列的中华绒螯蟹养殖群体与野生群体遗传多样性与遗传结构分析 [J], 轩中亚;薛竣仁;陈修报;姜涛;刘洪波;杨健5.基于线粒体COI序列的矛尾复虾虎鱼5个野生群体的遗传多样性分析 [J], 祝斐;应博凯;贾超峰;孟乾;高波;孙瑞健;宋双双;徐大凤;卢瑶瑶;张志伟;陈淑吟;张志勇;陈心因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
雉科四族鸟类的分子系统发生研究
Ａ ｒ ｇ ｕ ｓ ｉ ａ ｎ ｉ ｎ ｉ ａ ｎ ｄ Ｐ ａ ｖ ｏ ｃ ｉ ｎ ｉ ） ， ａ ｔ ｏ ｔ ａ ｌ ｏ ｆ ６ ９ ４ ｎ ｕ ｃ ｌ ｅ ｏ ｔ ｉ ｄ ｅ ｓ ｏ ｆ ｍｉ ｔ ｏ ｃ ｈ ｏ ｎ ｄ ｒ ｉ ａ ｌ ＤＮＡ （ ｍｔ ＤＮＡ ）Ｃ Ｏ Ｉ ｇ ｅ ｎ ｅ ｓ ｏ ｆ ７ ｓ ｐ ｅ ｃ ｉ ｅ ｓ
发 生，本研 究分析 了雉科 ４属 ７ 种 鸟类 线粒 体 Ｄ ＮＡ Ｃ Ｏ１ 基因 ６ ９ ４ ｂ ｐ序列 ，共 发现 ２ １ ０个变异位点 ，其 中简约信
息位 点 １ ８ ０个 。４个族之 间，眼斑雉族 和孔 雀族 的遗传距离最小为 ０ ． １ ４ ５ ；眼斑雉族和雉族 间的最大 为 ０ ． １ ９ ２ 。４ 个族在 系统 发生树上聚成两个 明显 的分支 ，其 中鹑族和雉族 聚成一支 ，眼斑 雉族 和孔雀族聚成另一支 。形态和分 子 的证据均 表明眼斑雉族和孔雀族关系较近 。 关键词 ：雉 科；细胞色素 ｃ氧化酶亚基 １ ；系统发生 中图分 类号 ：Ｑ ４ ５ ９ ． ７ ２ ５ 文献标识码 ：Ａ Ｄ Ｏ Ｉ ： １ ０ ． ３ ９ ６ ９ ／ ｊ ． ｉ ｓ ｓ ｎ ． １ ６ ７ ４ — ８ ０ ８ ５ ． ２ ０ １ ３ ． ０ ２ ． ０ ２ ４
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基于COI基因探讨雉科6个属的分类地位
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基于线粒体coi基因的马鲅科鱼类dna条形码研究
马 科 （Ｐｏｌｙｎｅｍｉｄａｅ）隶 属 于 硬 骨 鱼 纲 （Ｏｓｔｅｉｃｈｔｈｙｅｓ）辐 鳍 亚 纲 （ＳｕｂｃｌａｓｓＮｅｏｐｔｅｒｙｇｉｉ） 鲈形目（Ｐｅｒｃｉｆｏｒｍｅｓ），广泛分布于温带、亚热带和 热带近岸海域以及淡水河流的入海口。马科 鱼类如六丝多指马（Ｐｏｌｙｄａｃｔｙｌｕｓｓｅｘｆｉｌｉｓ），肉质 鲜美、营 养 价 值 高；还 有 一 些 种 类 如 长 指 马 （Ｐｏｌｙｎｅｍｕｓｐａｒａｄｉｓｅｕｓ），形态优美、有较强的观赏 性，是珍稀 名 贵 的 经 济 鱼 类 ［１－２］。 全 世 界 已 知 马 科 鱼 类 共 有 ８属 ４３种，其 中 中 国 有 ３属 ７ 种［３－５］，分 别 为 四 指 马 属 （Ｅｌｅｕｔｈｅｒｏｎｅｍａ）的 四 指马 （Ｅ．ｔｅｔｒａｄａｃｔｙｌｕｓ）和 多 鳞 四 指 马 （Ｅ． ｒｈａｄｉｎｕｍ），多指 马 属 （Ｐｏｌｙｄａｃｔｙｌｕｓ）的 五 指 多 指马（Ｐ．ｐｌｅｂｅｊｕｓ）、黑斑多指马（Ｐ．ｓｅｘｔａｒｉｕｓ）、
目前，中国马科鱼类 ＤＮＡ条形码的研究 仅见有严安琪 等 ［１７］对 浙 江 海 域 四 指 马 和 黑 斑 多指马以及 邓 春 兴 ［１８］对 中 国 近 海 四 指 马 属 等少数物种局部地区的研究。本研究测定了在 中国黄海、东海和南海 ７省 １０个地点采集的 ３属 ５种 ３３条标本的线粒体 ＣＯＩ序列，结合 ＧｅｎＢａｎｋ 中下载的 ５属 １６种的 ＣＯＩ序列，进行中国马科 鱼类 ＤＮＡ条形码研究，旨在明确该科鱼类的分 类地位，为中国马科鱼类种质资源的保护和开 发利用提供科学依据。
文章编号：１００４－２４９０（２０２０）０１－０００１－０９
基于线粒体COⅠ基因序列分析5个巨[鱼丕]群体的遗传多样性
采用酚 －氯仿方法 提 ［１３］ 取巨 基因组 ＤＮＡ，１％的琼脂 糖凝胶进行电泳检测后经凝胶成像系统进行拍照并保存在 －２０℃ 冰箱。巨 ＰＣＲ扩增所用的引物为杜民等［１７］设计 合成的 １对简并引物，其名称和序列分别为 Ｂａｙａ０９Ｆ：５′－ＧＡ
群体在分子水平上进行遗传多样性研究，为今后建立基于 ＤＮＡ分子标记的巨 物种提供资料基础。本试验选用来自 澜沧江上游（Ｌ）、怒江坝（Ｂ）、红河曼耗（Ｍ）、景洪（Ｊ）以及怒 江下游（Ｎ）不同群体的巨 作为试验材料，采用基因克隆方 法获得讨不同巨 群体的遗传和进化关系。
收稿日期：２０１７－１２－３１ 基金项目：国家自然科学 基 金 （编 号：３１３６０６３８）；云 南 省 中 青 年 学 术
带头人后备人才项目（编号：２０１５ＨＢ０５９）；云南省教育厅科学研究 基金重大专项（编号：ＺＤ２０１３００９）；红河学院中青年学术带头人后 备人才项目（编号：２０１４ＨＢ０２０３）。 作者简介：牛宝珍（１９７９—），女，湖北枣阳人，硕士，实验员，主要从事 水生生物资源研究。Ｅ－ｍａｉｌ：ｎｉｕ２０１１ｂａｏ＠１２６．ｃｏｍ。 通信作者：杜 民，博 士，副 教 授，主 要 从 事 水 生 生 物 技 术 与 资 源 研 究。Ｅ－ｍａｉｌ：ｄｕ２００５ｍｉｎ＠１２６．ｃｏｍ。
COⅡ基因在昆虫分子系统学研究中的作用和地位
COⅡ基因在昆虫分子系统学研究中的作用和地位
卜云;郑哲民
【期刊名称】《昆虫知识》
【年(卷),期】2005(42)1
【摘要】细胞色素氧化酶Ⅱ(cytochromeoxidaseⅡ,COⅡ)基因位于线粒体DNA(mtDNA)上,编码细胞色素氧化酶亚基Ⅱ,该亚基为细胞色素c提供重要的结合位点。
COⅡ基因进化速率较快,是昆虫分子系统学研究中理想的分子标记。
目前,已经利用该基因从各个分类水平对昆虫系统发育关系、物种形成与分化、种群遗传与变异及生物地理等方面做了广泛的研究。
研究表明,利用该基因可以很好地解决昆虫属、种及种下分类单元的系统发育问题,但是在解决科、亚科等高级阶元的系统发育关系时仍存在一些局限,COⅡ基因与其他mtDNA及核基因的联合分析能够更好地解决昆虫的系统发育问题。
【总页数】5页(P18-22)
【关键词】昆虫;分子系统学研究;COⅡ;系统发育关系;生物地理;亚科;种下分类;基因;细胞色素氧化酶;细胞色素c
【作者】卜云;郑哲民
【作者单位】陕西师范大学动物研究所
【正文语种】中文
【中图分类】Q949;Q969.445.6
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