适用于野生软枣猕猴桃遗传多样性分析的SSR引物筛选

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猕猴桃野生居群的SSR分析初报

猕猴桃野生居群的SSR分析初报栗琪;李作洲;黄宏文【期刊名称】《植物科学学报》【年(卷),期】2004(022)002【摘要】采用SSR分子标记技术对我国猕猴桃的2个商业栽培物种--中华猕猴桃和美味猕猴桃的9个天然居群(共221个样)的遗传多样性进行了初步分析.通过对14对猕猴桃引物的筛选,8对重现性好的引物扩增结果表现出良好的多态性.在8个多态性位点上共获得222个等位基因.居群等位基因平均数A=17.3,多态位点百分率P=100,多态信息指数PIC为0.87～0.96,显示出我国的猕猴桃野生居群具有极高的遗传多样性.中华猕猴桃和美味猕猴桃野生居群拥有高比例的共同等位基因,反映出二者的亲缘关系极近.【总页数】4页(P175-178)【作者】栗琪;李作洲;黄宏文【作者单位】中国科学院武汉植物园,武汉,430074;中国科学院武汉植物园,武汉,430074;中国科学院武汉植物园,武汉,430074【正文语种】中文【中图分类】Q347;S663.4【相关文献】1.野生大麻居群遗传多样性ISSR分析的取样策略 [J], 张庆滢;郭蓉;陈璇;许艳萍;郭孟璧;郭鸿彦;杨明2.野生大麻居群遗传多样性ISSR分析的取样策略 [J], 张庆滢;郭蓉;陈璇;许艳萍;郭孟璧;郭鸿彦;杨明;3.福建中部3个野生蕉自然居群基于NTSYS和STRUCTURE软件的ISSR分析[J], 赖恭梯;赖钟雄;刘炜婳;叶炜;林玉玲;刘生财;陈裕坤;张梓浩;吴高杰4.福建东南部野生蕉7个自然居群289份样品的ISSR分析 [J], 陈红俊;赖钟雄;刘炜婳;赖恭梯;张梓浩;叶炜;刘生财;林玉玲5.天山樱桃野生居群遗传多样性SSR分析 [J], 李春侨;周龙;陆彪;董凯向;刘春燕因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A001[发明专利]

专利名称：用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A001
专利类型：发明专利
发明人：黄宏文,张琼,钟彩虹,龚俊杰,刘春燕
申请号：CN201410525014.5
申请日：20140930
公开号：CN104293942A
公开日：
20150121
专利内容由知识产权出版社提供
摘要：本发明公开了一种用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A001，涉及分子遗传育种技术领域。

本分子标记A001在雌株中扩增得到的特异片段核苷酸序列如SEQ.IDNo1所示；所述标记的引物序列如SEQ.IDNo2和SEQ.IDNo3所示。

本分子标记A001可用于猕猴桃雌雄性别的早期鉴定检测，避免大量雄株在育种和生产中造成极大的浪费；利用高密度遗传图谱，能快速发掘性别相关的分子标记用于辅助育种，为功能标记的开发提供了重要的实践经验；本分子标记A001用于雌雄性别标记辅助选择，将大大提高育种中雌株的选择效率，缩短育种周期，具有很大的应用潜力和较高的经济价值。

申请人：中国科学院武汉植物园
地址：430074 湖北省武汉市武昌磨山
国籍：CN
代理机构：武汉宇晨专利事务所
代理人：黄瑞棠
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猕猴桃的遗传转化研究以及SSR分子标记在其遗传多样性中的应用

猕猴桃的遗传转化研究以及SSR分子标记在其遗传多样性中的应用摘要：猕猴桃栽培品种存在一定的缺陷，利用遗传转化技术对猕猴桃品质特性改良具有广泛的应用前景。

对猕猴桃目的基因的分离，猴桃遗传转化的基本方法和研究进展以影响猕猴桃转化效率的因素进行了总结，并对猕猴桃遗传转化需解决的问题进行了探讨。

综述了SSR标记技术在猕猴桃群体遗传多样性研究、基因连锁图谱的构建、种质资源鉴定以及分子标记辅助育种等方面的应用概况，并在此基础上提出了今后猕猴桃育种发展的方向。

关键词：猕猴桃；遗传转化；SSR；猕猴桃；遗传多样性猕猴(Actinidia)属猕猴桃科猕猴桃属植物，其风味独特，营养丰富，Vc含量高，有一定保健功效，因而倍受关注。

我国猕猴桃栽培面积居世界第一位，产量排第二位。

目前，猕猴桃的栽培品种往往存在某些性状缺陷，如耐贮藏性和抗逆性较差等。

通过常规育种方法改良往往周期长、工作量大、效率较低，很难满足生产发展的需要。

采用遗传转化技术培育新品种，有几个明显的优点：首先，它可以有目的、有计划地引入优良性状而不需要改变原有的其它特性；其次，它可以突破物种障碍，把许多原来植株中没有的基因引入；另外，它可以在幼苗期对转化植株进行筛选和鉴定，大大缩短了得到稳定遗传的新品种所需要的时间。

因此，遗传转化技术为猕猴桃种质改良开辟了一条新的途径，其将大大缩短猕猴桃的育种年限，扩展猕猴桃的育种范围，拓宽猕猴桃的基因资源，从而大力推动猕猴桃育种工作的进程。

一直以来，我国乃至世界上的主要栽培品种比较单一，引种区域相对狭小，此外，由于猕猴桃属中普遍存在自发的种间杂交和种内多倍化的现象，因此不同学者对该属植物种的界定及亲缘关系存在不同的看法。

分子标记技术是猕猴桃群体遗传结构分析、物种遗传多样性鉴定、遗传基因连锁图谱构建以及分子标记育种等方面的理想工具。

利用分子标记技术分析生物个体之间DNA序列差别并用于作图的研究始于1980年。

经过多年的发展，现在的DNA标记技术已有10多种，其中简单重复序列(SSR)或称微卫星DNA、简单串联重复序列(STRP)是高等真核生物基因组中种类多、分布广、具有高度的多态性和杂合度的分子标记技术，比RFLP和RAPD分子标记具有更丰富的多态性，呈孟德尔式遗传。

软枣猕猴桃性别相关的SRAP分子标记

软枣猕猴桃性别相关的SRAP分子标记作者：李旭吴松权姜明亮朴一龙来源：《江苏农业科学》2016年第08期摘要：以软枣猕猴桃成龄雌株、雄株叶片为试验材料，利用SRAP分子标记手段及SPSS 软件对统计数据进行聚类分析，结果表明，从初筛的80对引物中筛选出15对可稳定扩增出多态性条带的引物组合，19个雌、雄植株共得到77个条带，多态性条带为72个，多态率达到93.50%；雌株多态性比率为68.8%，雄株多态性比率为87.0%；me2-em1、me6-em6、me7-em5、me7-em7这4对引物的扩增结果表现出雌雄株间的多态性比率具有明显差异；供试的19个植株经聚类分析分成2组，2组中均有70%以上表现出相同的性别。

基于性别相关的SRAP 可以有效分辨出软枣猕猴桃雌株、雄株。

关键词：软枣猕猴桃；雌雄异株；性别鉴定；SRAP；分子标记中图分类号： Q943文献标志码：文章编号：1002-1302（2016）08-0069-03软枣猕猴桃[Actinidia arguta （Seib.et Zucc.）Plangch.ex Miq.]是猕猴桃科猕猴桃属中水平和垂直分布最广泛的多年生落叶藤本果树之一[1]，我国南北各地、朝鲜、日本、俄罗斯均有分布，以我国东三省资源最为丰富，其中，小兴安岭和长白山山区较为多见，是珍贵的抗寒果树资源。

软枣猕猴桃果实富含维生素C、酚类物质、类胡萝卜素及多种矿质元素，具有一定的药用价值。

目前，软枣猕猴桃作为第3代猕猴桃，受到世界各国的广泛关注，其产业开发正蓬勃发展。

但是，软枣猕猴桃为雌雄异株植物，以雌株产果实，雌株的经济价值明显高于雄株，而软枣猕猕猴桃实生苗需要5～7年才能结果，童期漫长，且实生繁殖后代出现雌雄比约为1 ∶[KG-*3]4的性别分离[2]，不利于生产需要。

雌雄异株和幼苗期雌雄无法辨别给软枣猕猴桃种质资源的改良和育种带来巨大困难，因此，软枣猕猴桃的性别鉴定在生产和遗传育种方面有着重要的意义。

使用SSR标记对猕猴桃品种和选择系的分子鉴定

使用SSR标记对猕猴桃品种和选择系的分子鉴定
谢国禄
【期刊名称】《作物育种信息》
【年(卷),期】2005(000)007
【摘要】为了确定遗传相似性，并评价遗传多样性和亲缘程度，本试验用9个简单序列重复（SSR）标记来调查了代表全世界90％以上猕猴桃生产的48个猕猴桃品种和选择系。

这9个SSR标记是多态的，并且检测到了总共213个等位基因，结果发现每个位点平均有23．7个等位基因，其变幅在9-38个等位基因。

【总页数】1页(P14)
【作者】谢国禄
【作者单位】无
【正文语种】中文
【中图分类】S663.4
【相关文献】
1.基于ISSR标记的猕猴桃品种r遗传多样性分析及指纹图谱构建 [J], 张安世;韩臣鹏;齐秀娟;张中海
2.SSR分子标记鉴定两系杂交水稻"荃两优2118"的种子纯度 [J], 王立广; 张翔; 黄贯刘; 汪仁举; 康圣好; 熊延军; 张奎
3.122份栽培桃品种(系)黄白肉性状的分子标记辅助鉴定 [J], 鲁振华;沈志军;牛良;潘磊;崔国朝;曾文芳;王志强
4.ISSR分子标记技术在桃品种鉴定中的应用 [J], 孙淑霞;李靖;陈栋;谢红江;涂美艳;
江国良
5.利用SCoT分子标记分析85个猕猴桃品种(系)及野生近缘种的遗传结构 [J], 王悦星;周婉莹;张文慧;吴婉婉;张晓娟;于月华
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枣品种鉴定技术规程ssr分子标记法

枣品种鉴定技术规程ssr分子标记法一、引言枣是中国传统的重要经济作物之一，具有丰富的营养价值和药用价值。

枣的品种鉴定对于枣的种质资源保护、品种选育和市场推广具有重要意义。

随着生物技术的发展，分子标记技术成为枣品种鉴定的重要手段之一。

其中，ssr分子标记法在枣品种鉴定中具有广泛应用和较高的准确性。

本文将详细介绍ssr分子标记法在枣品种鉴定中的技术规程。

二、ssr分子标记法概述ssr（Simple Sequence Repeat）又称微卫星，是DNA序列中重复出现的简单序列。

ssr分子标记法是一种基于PCR扩增的分子标记技术，通过扩增和分析ssr位点上的DNA序列差异，实现对枣品种的鉴定和遗传多样性分析。

ssr标记具有高度重复性、多态性强、稳定可靠等特点，被广泛应用于植物基因组研究和品种鉴定。

三、ssr分子标记法的实验步骤为了准确地进行枣品种鉴定，需要按照以下步骤进行实验：1. DNA提取•从枣叶片或嫩枝中提取总DNA。

•使用CTAB法、高盐法等常用的DNA提取方法。

•确保提取的DNA质量和纯度，以保证后续实验的准确性。

2. ssr引物设计和合成•根据已知的ssr序列进行引物设计。

•引物应具有良好的特异性和扩增性。

•可以通过商业合成或实验室自行合成。

3. PCR扩增•根据ssr引物序列设计PCR扩增反应体系。

•设置合适的PCR扩增程序和条件。

•使用阳性和阴性对照进行扩增反应的验证。

4. 电泳分析•将PCR扩增产物进行电泳分析。

•选择合适的琼脂糖凝胶和电泳条件。

•根据扩增产物的大小和带型特征进行品种鉴定。

四、ssr分子标记法的优势和应用ssr分子标记法在枣品种鉴定中具有以下优势和应用：1. 高度重复性ssr序列在基因组中高度重复，因此可以通过ssr分子标记法对枣品种进行高度重复性的鉴定。

2. 多态性强ssr序列具有多态性，不同品种之间的ssr位点会出现不同的DNA序列差异，因此可以通过ssr分子标记法对枣品种进行多态性鉴定。

软枣猕猴桃栽培品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析

软枣猕猴桃栽培品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析王丹丹;张彦文【期刊名称】《东北师大学报：自然科学版》【年(卷),期】2017(49)3【摘要】为了对软枣猕猴桃栽培品种进行分子鉴别及分析不同品种间的亲缘关系,采用对叶片直接进行PCR扩增的方法,利用EST-SSR分子标记技术构建了常见的42个软枣猕猴桃品种的数字指纹图谱和模式指纹图谱数据库(cluster project),并进行了遗传多样性分析.结果表明:利用21对软枣猕猴桃核心引物扩增所有品种的基因组,共检测到132个等位位点,包括122个多态性位点,多态性比率为92.4%.每对引物扩增出的等位位点数为3~8个,平均每对引物扩增6.28个基因型,扩增条带大小100~300bp,多态信息含量(polymorphism information content,CPIC)为0.721,基因流为1.454,平均杂合率为0.691.其中,7对引物,即ACAR2,ACAR13,ACAR53,ACAR75,ACAR92,ACAR112和ACAR120可作为指纹图谱构建的首选引物,利用其中的ACAR2,ACAR13,ACAR53和ACAR75以引物组合方式构建指纹图谱可区分42个品种.聚类分析表明在遗传距离0.64处42个品种被分为一类,在遗传距离0.81处分为4类.聚类结果与品种的特性及来源具有较高的一致性.【总页数】8页(P104-111)【关键词】软枣猕猴桃;EST-SSR标记;指纹图谱;遗传多样性;聚类分析【作者】王丹丹;张彦文【作者单位】辽东学院农学院;东北师范大学草地研究所【正文语种】中文【中图分类】Q663.4【相关文献】1.披碱草属牧草DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 [J], 张锐; 唐艾嘉; 解继红; 石凤翎; 赵彦2.披碱草属牧草DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 [J], 张锐; 唐艾嘉; 解继红; 石凤翎; 赵彦3.睡莲种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 [J], 苏群; 杨亚涵; 田敏; 卜朝阳; 毛立彦; 张进忠; 潘介春; 卢家仕4.基于iPBS标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 [J], 崔学强;唐璇;黄昌艳;邓杰玲;李秀玲;卢家仕;张自斌5.基于cpSSR标记的山药种质资源DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 [J], 张静珍;王连军;雷剑;柴沙沙;杨新笋;张文英因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

不同品种野生软枣猕猴桃最佳组培方法的研究

不同品种野生软枣猕猴桃最佳组培方法的研究刘延吉;郝桂杰;姜岩岩;田晓艳【期刊名称】《北方园艺》【年(卷),期】2012(000)017【摘要】以5个品种野生软枣猕猴桃(H1、H2、H3、H4和H5)茎段为外植体,采用6-BA和NAA的组合进行研究,筛选适宜于野软枣猕猴桃各品种快繁的最佳培养基,以期建立离体培养快繁体系.结果表明:品种和培养基对猕猴桃外植体扩繁有显著影响；H1在MS+6-BA 1.0 mg/L+NAA 0.2 mg/L的培养基中最适宜扩繁；H2在MS+6-BA 1.5 mg/L+NAA 0.2 mg/L的培养基中最适宜扩繁；H3和H4在培养基MS+6-BA 1.5 mg/L +NAA 0.3 mg/L中最适宜扩繁；H5在的培养基MS+ 6-BA 2.0mg/L+NAA 0.2mg/L中最适宜扩繁.【总页数】3页(P124-126)【作者】刘延吉;郝桂杰;姜岩岩;田晓艳【作者单位】沈阳农业大学生物科学技术学院,辽宁沈阳110866;沈阳农业大学生物科学技术学院,辽宁沈阳110866;沈阳农业大学园艺学院,辽宁沈阳110886;沈阳农业大学食品学院,辽宁沈阳110866【正文语种】中文【中图分类】S663.4【相关文献】1.扶桑组培最佳培养基配方及不同激素水平影响研究 [J], 谢晓蓉;张以顺;等2.青岛野生软枣猕猴桃与其他品种之间雄蕊及花粉特性的研究 [J], 刘猜; 辛华3.软枣猕猴桃"魁绿"品种组培微繁技术研究 [J], 胡皓; 张志东4.丹东地区不同品种软枣猕猴桃需冷量研究 [J], 常婧;张利萍;姜冬;潘丕克5.长白山野生软枣猕猴桃组培快繁技术研究 [J], 玄英实;周丽洁;周旭;李敏;张阳;朴雪梅;匙坤;金雪梅因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

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摘要为进一步研究野生软枣猕猴桃种质资源的遗传多样性，以软枣猕猴桃基因组ＤＮＡ为模板，优化了ＳＳＲ反
应体系并确定了反应条件，筛选出了多态性较高的标记．从来自中华猕猴桃基因组的６５对ＳＳＲ引物初步筛选出ｌ５
对有较好扩增带型、增稳定性好的引物，其中较好多态性的引物有１２对．用筛选的引物进一步对四川天全二郎山的野生软枣猕猴桃群体进行了ＳＳＲ分析，在１５个个体中共检测出了１４１个等位基因，平均每个位点检测到９．４个等位基因，平均ＰＩＣ值为０．７４５．关键词软枣猕猴桃；简单重复序列；引筛选；等位基因
ＡｃｔｉｎｉｄｉａｓａｍｐｌｅｓｗｅｒｅｔｈｅｎｃｏｌｌｅｃｔｅｄｆｒｏｍＥｒｌａｎｇｓｈａｎｏｆＹａａｎ，Ｓｉｃｈｕｎ，ａａｎｄａｎａｌｙｚｅｄｕｓｉｎｇｔｈｅａｂｏｖｅ１５ｐｒｉｍｅｒｐａｉｒｓ．Ａ
中图分类号Ｑ９４３文献标识码Ａ文章编号１６７２－４３２１（２０１３）０４－００２８－０５
ＳＳＲＰｒｉｍｅｒＳｃｒｅｅｎｉｎｇｆｏｒｔｈｅＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＧｅｎｅｔｉｃ
（１ＳｃｈｏｏｌｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｓｏｕｔｈ — ＣｅｎｔｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｆｏｒＮａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ，
２ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＰｌａｎｔＧｅｒｍｐｌａｓｍＥｎｈａｎｃｅｍｅｎｔａｎｄＳｐｅｃｉａｌｔｙＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ，ＷｕｈａｎＢｏｔａｎｉｃａｌＧａｒｄｅｎ，
Ｖ０Ｉ．３２Ｎｏ．４Ｄｅｃ．２０１３
适用于野生软枣猕猴桃遗传多样性分析的ＳＳＲ引物筛选
覃瑞，赖娟娟，李作洲，满玉萍，王彦昌，
（１中南民族大学生命科学学院，武汉４３００７４；２中国科学院武汉植物园，植物种质创新与特色农业重点实验室，武汉４３００７４）
第３２卷第４期２０１３年１２月
中南民族大学学报（自然科学版）ＪｏｕｒｎａｌｏｆＳｏｕｔｈ－ＣｅｎｔｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｆｏｒＮａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ（Ｎａｔ．Ｓｃｉ．Ｅｄｉｔｉｏｎ）
ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｗｕｈａｎ４３００７４，Ｃｈｉｎａ）
ＡｂｓｔｒａｃｔＩｎｏｒｄｅｒｔｏｓｔｕｄｙｔｈｅｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆｗｉｌｄＡｃｔｉｎｉｄｉａａｒｇｕｔａｇｅｒｍｐｌａｓｍ，ｇｅｎｏｍｅＤＮＡｏｆｔｈｅｗｉｌｄｓｐｃｉｅｓｗｅｒｅｕｓｅｄａｓｔｅｍｐｌａｔｅｏｒｆｄｅｃｉｄｉｎｇｔｈｅＳＳＲｒｅａｃｔｉｏｎｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓａｎｄｉｄｅｎｔｉｆｙｉｎｇｔｈｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｅｍａｒｋｅｒｓ．ＦｉｆｔｅｅｎｐａｉｓｒｏｆｐｒｉｍｅｓｒｗｅｒｅｓｃｒｅｅｎｅｄｏｕｔｆｒｏｍｓｉｘｔｙｉｆｖｅｇｅｎｏｍｅＳＳＲｐｒｉｍｅｒｓｏｆＡ．ｃｈｉｎｅｎｓｉｓ，ａｍｏｎｇｗｈｉｃｈｔｗｅｌｖｅｐａｉｒｓｗｅｒｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ．１５