病毒的分类与命名

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第三章 病毒的分类与命名ppt课件

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(5)分类阶元只有在病毒代表种的特性得到 了充分了解和在公开出版物上进行过描述, 以致于明确了它们的分类地位,并使其分 类阶元与其他类似的分类阶元相区别时, 才能确定下来。
(6)当病毒有明确的科、而分属未确定时, 这一病毒种在分类学上称为该科的未确定 种(unassigned species)。
植物病毒(Plant Viruses)
植物病毒(plant viruses) 噬藻体(phycophage)
真菌噬菌体或真菌病毒(mycophage) 动物病毒(Animal Viruses)
原生动物病毒(protozoal viruses) 无脊椎动物病毒(inverteble viruses)
昆虫病毒(insect viruses) 脊椎动物病毒(verteble viruses)
第三章 病毒的分类与命名
精品课件ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
病毒分类与命名的意义
病毒分类是将自然界中存在的病毒种群,按照它们的性质相 似性和亲缘关系加以归纳编排,以了解病毒共性与个性的特点. 专门研究病毒分类的学科称为病毒分类学.
由于新病毒的不断发现,且对已知不断性质的了解还不够全 面,所以目前病毒分类学尚处于不成熟阶段.
1. 进行未知病毒的分类和命名。可利用病毒分科、属、种的关系 ,对未知病毒与已经描述过的病毒比较研究和鉴定,若发现新 病毒,可按国际病毒分类命名委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)的规定,提出新描 述的病毒,附有足够的资料,申述理由
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2. 有利于病毒研究工作的交流.病毒分类使病毒研究工作的 交流能够顺利进行。
3. 对寻找新的病毒疫苗株很有意义。利用病毒分类和命名的知 识,有可能寻找新疫苗株。如 Jenner发现牛痘苗能预防人的天 花病,

第二章病毒的分类与命名

第二章病毒的分类与命名
现有的病毒分类名称只要是有用的就应保留,新 的命名不能与已经承认的病毒名称重复。人工产生的病 毒和实验室的杂种病毒在分类学上不予考虑。
病毒种的定义和命名
病毒“种”是指构成一个复制谱系( replicating lineage) 、占据一个特定小生境(ecological niche) 、具 有多个分类特征的病毒。
④ 病毒蛋白:如结构蛋白和非结构蛋白的数量,大小 以及功能和活性,氨基酸序列等; ⑤ 病毒脂类含量和特性; ⑥ 碳水化合物含量和特性; ⑦ 病毒基因组组成和复制。
病毒抗原性质: 包括病毒血清学性质与其抗原的关系。
病毒生物学特性: 包括病毒天然的宿主范围; 病毒在自然状态下的传播与媒介体的关系; 病毒的地理分布,致病机理,组织嗜亲性; 病毒引起的病理和组织病理学特点。
一、病毒的命名与分类系统进展概况
病毒的分类和命名大事记
1966年 在莫斯科举行的第九届国际微生物学会上成立了国际病毒命名委员 会 (International Committee on Nomenclature of Viruses, ICNV),并 通过了上述 新的8项分类原则。 1971年 ICNV公布了关于病毒分类和命名的第一次报告,将当时了解得比较 清楚的500多种病毒分为RNA和DNA病毒两大类,并且分为43个病毒属。 1973年 ICNV正式更名为国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)。 1976年 ICTV公布了病毒分类和命名的第二次报告,将病毒已建立的属(组) 按宿主分为五大类。 1979年 公布了病毒分类和命名第三次报告,并根据病毒核酸类型,包膜有 无将病毒分为7大类,总共有53个科(组或群)。
但在设立一个新的病毒属时必需有一个 同时被承认的代表种(type species) 。

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2 国际病毒分类委员会
• 病毒命名筹备委员会(PCNV) 1963
Preparatory Committee for Nomenclature of Virus
• 国际病毒命名委员会(ICNV) 1966
International Committee for Nomenclature of Virus
• 裸露单RN分A病子毒负链RNA病毒目
• 类病毒
• 另增设M亚on病o毒n因eg子a(vsuirbavilreasl agent)
• 1999年第7次分类报告:认可的病毒约4000 种,设3个目
• 不是所有病毒都必须隶属某个目,在没有适当目的情况
下,科可以是最高的病毒分类等级
2、病毒最新分类系统:
一、病毒分类与命名的沿革
3. 1966~1970
➢ Wildy 任ICNV主席,第一次报告——病毒的分类与命名, 描述并划定43个属(或相当于属的组、群)及其他成员; 《病毒学论文集》第5卷
➢ 采用了密码进行分类(每个密码包括4对符号); ➢ 通过了“国际病毒命名法则”,共18项。
一、病毒分类与命名的• 寄沿生革于一种以上寄主
寄主种类



核酸链类型 核酸含量
核衣壳外形 传播方式/传播介体
R/1 : 2/5 :
E/E : S/O
RNA/SS: 200万Da/5% : 截头杆状/截头杆状: 种子植物/确切介体不

R/1 : 2.3/5+ 0.6-1.3/51:977年E终/E止: S/Ne (TRV)
三、病毒分类进展及最新分类系统
• (10)肿瘤病毒群
一、病毒分类与命名的沿革
2. 1962~1966

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希腊字母在新命名中不能使用,如果缩拼字对这一领 域的病毒学研究工作者是有意义的,而且经过几个国际病毒 研究小组建议,那么缩拼字命名是可以接受的。
现有的病毒分类名称只要是有用的就应保留,新的命名 不能与已经承认(chéngrèn)的病毒名称重复。人工产生的病毒和 实验室的杂种病毒在分类学上不予考虑。
第十页,共37页。
第四页,共37页。
一、病毒(bìngdú)的命名与分类系统进展概况
病毒(bìngdú)的分类和命名大事记
1937年 Levaditi和Lepine就曾根据病毒对组织的亲和性进行分类。 1948年 Holmes提出根据病毒所引起的宿主症状的分类方案。 1950年 第五届国际微生物学会提出了有关病毒分类的8项原则。 1963年 国际微生物命名(mìng míng)委员会病毒分会根据安德鲁斯(Andrewes) 提 出的分类建议提出了新的8项分类原则: ① 核酸的类型、结构和分子量; ② 病毒粒子的形状和大小; ③ 病毒粒子的结构; ④ 病毒粒子对乙醚、氯仿等脂溶剂的敏感性; ⑤ 血清学性质和抗原关系; ⑥ 病毒在细胞培养上的繁殖特性; ⑦ 对除脂溶剂以外的理化因子的敏感性; ⑧ 流行病学的特征。
第二章 名
病毒的分类 与命 (fēn lèi)
第1、系统分类
根据病毒间的亲缘关系来进行划分成一定类群→科学 名称→适当描述
2、实用:按照一定的分类系统制成分类表,以便(yǐbiàn)对 未知病毒进行鉴定。
由于在性质上毫不相关的病毒具有相同的形态 特征,且病毒具有特殊的繁殖方式,主要采用复制方式来完
在现今水平,要得到一个既能反映病毒的进 化,又能体现病毒间亲缘关系的自然的分类系统, 难度比较大。
第三页,共37页。
目前已发现的病毒的种类约4000多种。

病毒的分类命名

病毒的分类命名

呼吸道病毒
消化道病毒 性传播病毒
病毒的抵抗力
一、耐冷怕热 二、紫外线敏感
三、氧化剂敏感
四、包膜病毒对脂溶剂敏感 五、耐甘油
三. 分类原则
核酸类型和结构(RNA/DNA, ds/ss, linear/circular, fragment /nofragment)) 病毒体形状和大小 病毒体形态结构
对脂溶剂敏感性



临床分类
1、非嗜器官性病毒
2、嗜器官性病毒:嗜神经病毒
嗜肝病毒 嗜皮肤黏膜病毒 嗜眼病毒 嗜唾液腺病毒
二. 病毒分类原理

强调其分类和命名的稳定性、实用性、认可 性和灵活性。Fra bibliotek
稳定性:病毒的名称及其所属关系一旦确定下 来,就应尽可能保留。 实用性:病毒的分类体制应该对病毒学研究领 域是有用的。 认可性:病毒分类阶元和名称应该为病毒学研 究者乐意接受和使用。 灵活性:病毒分类阶元可以依据某些新发现而 进行重新修订和在确定。
第二章 病毒的分类与命名
一. 分类依据

病毒分类学是随着病毒学尤其是分子病毒学的 发展而建立起来的,并逐步走向成熟。自从 1937年首次提出根据病毒对组织的亲合性进行 分类到现在为止,将病毒系统划分为3个目64个 科。

总之,为了使分类和命名得到统一,根据 Mayo在1998年报道,在ICTV常务委员会的提 议下,批准了41条原则。

病毒的分类与命名

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病毒的分类与命名
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按生物分类学标准,分类应能反映生物体的进化与种系发生的关系。

但病毒不可能按这个原则分类,一般仍按病毒鉴定等的实际需要而分类。

各种生物体均可有病毒寄生。

已知有动物病毒、植物病毒、放线菌病毒及细菌病毒(即噬菌体)。

医学上重要的病毒有500种左右,其中有不少对人类有致病力。

有些病毒也能在节肢动物中增殖(如虫媒病毒)。

目前通过的分类法是将支物病毒分为脱氧核糖病毒 (Deoxyriboviruses 简称DNA病毒)与核糖核酸病毒(Riboviruses 简称RNA病毒 )两大类。

再按病毒的理化性状分为若干科(族属)(表74-1)。

表74-1 按病毒理化及生物性状的分类
说明:
①正痘病毒(Orthopoxvirus)包括天花、类天花、牛痘、牛痘苗、兔痘、猴痘及鼠脱脚病等病毒皆对乙醚有抵抗性,而其他的痘病毒则对乙醚敏感。

②呼肠病毒(Reovirus)有一个外衣壳和一个内衣壳。

内壳有32个壳微粒,外衣壳的壳微粒数目则未确定,认为总共有92个壳微粒。

③病毒体大小是指直径或直径×长度。

④脱去囊膜的裸露病毒体,其核衣壳的直径为100nm,但有囊膜的病毒体则可大至200nm。

第二章_病毒的分类与命名

第二章_病毒的分类与命名
(1)形体微小,缺乏细胞结构; (2)只含一种核酸:DNA 或RNA; (3)依靠自身的核酸进行复制; (4)缺乏完整的酶和能量系统; (5)严格的细胞内寄生。
1978年,Luria和Darnell进一步指出,病毒只含 有一种核酸,能在活细胞内复制,并且利用活细 胞的合成机制产生子代病毒粒子。
第二节 病毒分类和命名
一 . 病毒分类与命名的沿革 1937年Levaditi和Lepine根据病毒对组织的亲和
性进行分类。 1948年Holmes提出根据病毒引起的宿主症状分类。
1950年第五届国际微生物学会提出了有关病毒分类 的八项原则:
(1)形态和繁殖方式; (2)化学结构与物理性质; (3)免疫性能; (4)对理化因子的敏感性; (5)传播方式; (6)对不同宿主组织和细胞的嗜亲性; (7)病理变化,包括包含体形式; (8)临床症状。
病毒可以在活细胞中复制和增殖,并将基因信息传 递给子代,因此病毒又可以看作是一种遗传单位。 病毒都没有自身的能量系统,只能依赖宿主细胞提 供。从这个意义上来说,任何病毒都不能离开宿主 细胞而独立的进行自我复制。
病毒的定义随着分子病毒学的发展而不断延伸。 目前,比较公认的病毒定义:病毒是一类比较原 始的、有生命特征的、能够自我复制和严格细胞 内寄生的非细胞生物。
2.病毒抗原性质 主要包括病毒血清学性质与其抗原的关系。
3.病毒生物学特性 包括病毒天然的宿主范围;病毒在自然状态下的
传播与媒介体的关系;病毒的地理分布、致病机理、 组织嗜亲性;病毒引起的病理和组织病理学特点。
一般而言,病毒粒子形态、基因组组成和复制特 性、病毒结构蛋白、非结构蛋白的数目和大小往 往作为病毒分类和命名的依据,而病毒基因组的 核酸类型、基因组的单双链、反转录过程和病毒 基因组的极性则与病毒目的分类和命名有关。

病毒的命名和分类

病毒的命名和分类

2)根据病毒所引起旳病变旳性质 疱疹病毒科、痘病毒科 3)以病毒酶作用旳基质 正粘病毒科、副粘病毒科 4)以病毒旳最初分离部位 腺病毒科
5)感染宿主旳部位 鼻病毒属、肠道病毒属 6)以几种属旳缩拼词作为科名 乳多空病毒科
流感病毒旳命名措施
1.国际上通用旳流感病毒命名措施
型别/分离地点/分离序号/分离时间(年代) (血凝素和神经氨酸酶序号)
3.ICTV不统一要求病毒种下列旳分类和命 名。有关血清型、基因型、病毒株、变异 株等旳命名由公认旳国际教授组决定。
4.对人工产生旳病毒和试验室杂交株不予分 类考虑,这些病毒旳命名也一样由公认旳 国际教授组决定。
5.当代表组员病毒经过充分鉴定并在刊登 旳文件上描述后,才干建立一种类,以便 与相同旳类区别。一样,命名一种病毒时, 该病毒必须经过充分鉴定并在文件上刊登 以明确区别于相同旳病毒
以mRNA为关键:根据病毒旳DNA或RNA是
与mRNA互补(-)和不互补(+) 而将病毒分
为6类。
II类(+DNA)
VI类 +RNA
IV类
I类(±DNA) mRNA
V类(-RNA)
III类(±RNA)
四、动物病毒旳分类现状
➢ 一 DNA病毒
(一)单链DNA病毒 细小病毒科(Parvoviridae):猪细小病毒(PPV) 圆环病毒科(Circoviridae) :猪圆环病毒(PCV)
最新旳病毒分类报告:第六次报告( 1995年) 目前已知旳病毒有3600多种,它们分别属于
71个病毒科; 其中动物病毒(涉及脊椎动物病毒和无椎脊动
物病毒)有2023余种,分属27个病毒科;
(二)分类根据
1.病毒旳形态学特征
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强调拉丁双名法的属名应反映出寄主类别、传播 方式及病毒颗粒形态,分4目: 蚜传病毒目(Aphivirales) 叶蝉传病毒目(Cicavirales) 无介传病毒目(Invirales) 介传传病毒目(Xenovirales)
一、病毒分类与命名的沿革
(1)呼吸道病毒群 • (1)外胚层病毒群 • (2)肠道病毒群 • (2)外胚层及内胚层病毒群 动物病毒分类法 • (3)肝炎病毒群 • (3)中胚层及内胚层病毒群 • (1) 波氏病毒属:多角形包涵体 • (4)皮肤及黏膜病毒群 (1) 根据组织胚胎学与病毒的组织亲和性,将脊椎 • (4)外胚层向神经性病毒群 • (2)动物病毒分为 史氏病毒属:折光性和多态性的包涵体 8 个类群 • (5)虫媒病毒群 • (5)内胚层向神经性病毒群 • (3) 勃氏病毒属:细胞质内有颗粒状包涵体 • (6)神经系统病毒群 (2) 临床及流行病学分类法(根据病毒传染途径、 • (6)中胚层病毒群 • (4)侵染部位及所致的症状分 瓦氏病毒属:昆虫痘病毒 • (7)眼病毒群 10群) • (7)血流感染病毒群 • (5) 摩氏病毒属:无包涵体 • (8)唾液腺病毒群 (3) 昆虫病毒分类法 (根据病害类型、包含体有无及 • (8)致肿瘤病毒群 (9)慢病毒群 形状分4~5• 属) • (10)肿瘤病毒群
4. 1970~
• 只寄生于脊椎动物 • 只寄生于无脊椎动物
• 只寄生于细菌 国际病毒命名委员会(ICNV)改为国际病毒分类委员会 • 只寄生于植物 (ICTV, 1973) ;
第三届国际病毒学代表大会, ICTV报告特点:
从实际工作出发,首先按宿主分五大类; 病毒的化学组成、形态结构、生理生化仍是重要依据;
类群 病毒 细菌 真菌 藻类
已知种 5 450 6 660 72 000 40 000
估计种 400 000 100 000 1 500 000 400 000
已知种占 的比例%
生 物 资 源 种 类
• 仅从1994年的不完全统计,已有新发现约40种病毒对人
1.3 6.7 5 10
类健康构成新的威胁; 40 000 200 000 原生动物 • AIDS 、疯牛病、肝炎、感冒、 SARS ;
将所有已知的病毒,根据核酸的类型分为八大类群: 三、病毒分类进展及最新分类系统
• 95年以前植物病毒不设目
• •
• DNA病毒——ssDNA病毒 • DNA病毒——dsDNA病毒
• DNA与RNA逆转录病毒 • 年采用科、属、种分类系统 RNA病毒——dsRNA病毒 95 • RNA病毒——负链、ssRNA病毒 1991 年ICTV第5次报告设1个目: • RNA病毒——正链、ssRNA病毒 • 裸露 RNA病毒 单分子负链 RNA病毒目 • 类病毒 Mononegavirales • 另增设亚病毒因子 (subviral agent)
建立国际病毒命名委员会(ICNV,International
Committee for Nomenclature of Virus)
3. 1966~1970 Wildy 任ICNV主席期间,组织国际间的协
作,发表ICNV的第一次报告
4. 1971~ 今 病毒分类与命名的工作得到巩固和发展
一、病毒分类与命名的沿革

核酸链类型 核酸含量

核衣壳外形

传播方式/传播介体
R/1
:
2/5 :
E/E
:
S/O
RNA/SS: 200万Da/5% : 截头杆状/截头杆状: 种子植物/确切介体不详
R/1 : 2.3/5+ 0.6-1.3/5 :
E/E : S/Ne (TRV)
1977年终止
三、病毒分类进展及最新分类系统
1、病毒的命名与分类仍然很乱,不够统一 • 命名: 地名(马尔堡,布尼亚)、人名(Rous, Epstein&Barr) 症状或病理特征(花叶,登革热,脊髓灰质炎等) 病毒粒子形态(弹状、丝状等) 宿拼字、字母、数字(Bromo, T4, ΦX174) • 分类: 动物病毒分类等级——科、属、种 植物病毒——组、亚组、种
2 国际病毒分类委员会
• • 病毒命名筹备委员会(PCNV) 1963 国际病毒命名委员会(ICNV) 1966
Preparatory Committee for Nomenclature of Virus
International Committee for Nomenclature of Virus
1. 1961以前•
一、病毒分类与命名的沿革
2. 1962~1966
成立国际病毒命名委员会(ICNV),制定4项基本方针:
(1) (2) (3) (4)
必须明确列出病毒的组(或属) 提出这些组的代表成员(种) 提出各组(或属)的名称 探讨利用密码进行分类的方法
存在问题:
(1) 存在明显的不调和态度 (2) 脊椎动物病毒分类与其他病毒分类差别显著 (3) 需同时应用专门知识并采取共同途径 (4) 制定病毒学工作者愿意采用的病毒名称
ICNV的宗旨:
1、建立一个国际公认的病毒分类系统 2、为各分类组群确定一个国际公认的 名称 3、通过举行会议、出版报告、交流病 毒学家关于病毒分类和命名的最新 结果
二、关于病毒密码程式cryptogram
1966年,国际病毒命名委员会ICNV建立“编码子委员会”
核酸类型 核酸分子量 病毒粒子外形 寄主种类
• 1999年第7次分类报告:认可的病毒约4000 种,设3个目
• 不是所有病毒都必须隶属某个目,在没有适当目的情况 下,科可以是最高的病毒分类等级
2、病毒最新分类系统:
1999年第7次分类报告:3个目、64科、233属
• • • • • • 有尾噬菌体目caudovirales 3科 dsDNA 2002年,在巴黎召开ICTV会议,产生6个新科,8个新属 单分子负链RNA目mononegavirales 4科 -ssRNA 另有3个属名发生变化 套病毒目nidovirales 2科 +ssRNA 未确定目 55科 未确定目、科(独立属) 29属 亚病毒感染因子:subvirus 卫星病毒 satellites 类病毒 viroids 2科 朊病毒 prions
2、病毒最新分类系统:
2005年第8次分类报告(1259页): 5450个病毒 最大特点:进一步明确了“种”作为病毒分类系统中的 3个目; 最小分类阶元,在每一个确定种下面列出了至少1个、 73科、11亚科; GenBank 上的登 至多几十个不同的分离物以及它们在 录号,增加了许多反映病毒基因序列同源性关系的系统 289属 树图,并将原子分辨率的粒子三维结构插入到相应的科 1950种 /属中,使读者对病毒粒子空间结构有更详细的了解。
• 病毒分类的主要依据
第四章 病毒分类和命名
一、病毒分类与命名的沿革 二、关于病毒密码程式 三、病毒分类进展及最新分类系统
一、病毒分类与命名的沿革
1. 1961以前 各自研究领域的科学家提出或建立一些分类
系统,进展缓慢,缺乏国际间的协作;
2. 1962~1966 借助国际微生物学术会议(1966, 莫斯科),
4、病毒命名的一般规则:
1、分类和命名应是国际性的.并普遍适用于所有病毒; 2、国际病毒分类系统采用目(order)、科(family)、亚科(sub family)、 属(genus)、种(species)分类阶元; 3、ICTV不负责病毒种以下的分类和命名,病毒种以下的血清 型、基因型、毒力株、变异株和分离株的名称由公认的国际 专家小组确定; 4、人工产生的病毒和实验室构建的杂种病毒在病毒分类上不予 考虑,它们的分类由公认的国际专家小组负责;
被子植物 线虫 昆虫 鱼类 鸟类 哺乳动物
270000 15 000 950000 19 000 9 198 4 170
320 000 500 000
84
20 3
8 000 000 24 000 9 500 4 300
12 80 ~ 100 ~100
本章要点
• 了解病毒分类的现状 • 病毒分类与其它微生物分类的区别
国际病毒分类委员会(ICTV) 1973年
International Committee on Taxonomy of Virus
PCNV推荐病毒分类的8条标准:
(1963年国际微生物学命名委员会病毒分会)
1、核酸的类型、结构和分子量; 2、病毒粒子的形状和大小; 3、病毒粒子的结构; 4、病毒粒子对乙醚、氯仿等脂溶剂的敏感性; 5、血清学性质和抗原关系; 6、病毒在细胞培养上的繁殖特性; 7、对除脂溶剂以外的理化因子的敏感性; 8、流行病学特征。
增加了科、属、种、群名词的词源;
设立七个小组委员会。
ICTV 八次报告(2005年7月),不断修改。
病毒分类的国际组织机构
1 病毒命名分会委员会(SCNV) 1951
Subcommittee on Virus Nomenclature
巴西 里约热内卢: 第五届国际微生物学会议
SCNV推荐病毒分类的8条标准:
一、病毒分类与命名的沿革
3. 1966~1970
Wildy 任ICNV主席,第一次报告——病毒的分类与命名, 描述并划定43个属(或相当于属的组、群)及其他成员; 《病毒学论文集》第5卷 采用了密码进行分类(每个密码包括4对符号); 通过了“国际病毒命名法则”,共18项。
• 寄生于一种以上寄主 一、病毒分类与命名的沿革
三、病毒分类进展及最新分类系统 “Species”: 一个基本分类单元,一大群表型特征高度 相似,亲缘关系极其接近,与同属内其它物种有 明显差异的菌株的总称。 1、病毒“种 species”的定义:
A virus species is defined as “a polythetic class of viruses that constitutes a replicating lineage and occupies a particular ecological niche” • 构成一个复制谱系——系统进化特性(共同祖先) • 占据特定的小生境——特定的生物学特性、地理 分布、寄主范围、致病机理等 • 具有多个分类特征——多原则分类
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