β-地中海贫血基因检测(PCR-反向点杂交法)

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反向斑点杂交技术
反向斑点杂交(reverse dot blot,RDB)是Saiki等提 出的一种斑点杂交技术,该技术采用固化了多种特异 性探针的膜条与扩增靶序列杂交,使一次杂交即可同 时筛查被检DNA中的多种突变。这种以膜上固定探针取 代固定靶DNA的方式,改变了传统杂交法一次只能检测 一种突变的模式,具有快速、简便、高敏感度和特异 性强的特点,尤其在基因突变检测、基因分型、病原 体的检测等领域有其独特的优势。
③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在72℃、DNA聚合酶 (如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列 为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的 与模板DNA链互补的链。
重复循环变性--退火--延伸三过程,每一次循环使反 应体系中的DNA分子数增加约一倍,而且这种新DNA分 子又可成为下次循环的模板。理论上循环n次,就增 加2n倍,即DNA分子数呈指数式增加。当经30次循环后, DNA产量达230拷贝,约为109拷贝。每完成一个循环需 2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几 百万倍。
反向斑点杂交技术原理
反向斑点杂交采用生物素标记的引物进行靶核酸的扩 增,将扩增产物同固定在尼龙膜上的探针进行杂交, 一次杂交反应可以检测多种靶序列。该方法具有快速、 简便,高灵敏度和特异性的特点,广泛应用于病原体 检测、基因突变检测、基因分型以及遗传多态性检测 等多个方面,具有潜在的临床应用价值。
31M
43M
-32M -29M -30M 14-15M CAP
IntM
βCD17/ βIVS-II-654标本
蓝色斑点为阳性杂交信号,因此
N (+) M (-)
该位点无突变
N (+) M (+)
该位点杂合突变
N (-) M (+)
该位点纯合突变
27/28M IVS-I-1M IVS-I-5M
PCR-反向点杂交应用
41-42N 654N -28N
71-72N 17N
βEN
31N
27/28M
41-42M 654M -28M 71-72M 17M
βEM
31M
IVS-I-1M
43M
-32M -29M -30M 14-15M CAP
IntM
IVS-I-5M
βIVS-II-654/ βN标本
41-42N 654N -28N
【目的】
1.掌握PCR技术原理及方法,熟悉其注意事项 2.掌握反向点杂交技术原理及方法,熟悉其应用
PCR技术,即聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)是由美国PE Cetus公司的Kary Mullis在1983年(1993年获诺贝尔化学奖)建 立的。这项技术可在试管内的经数小时反应就 将特定的DNA片段扩增数百万倍,这种迅速获取 大量单一核酸片段的技术在分子生物学研究中 具有举足轻重的意义,极大地推动了生命科学 的研究进展。它不仅是DNA分析最常用的技术, 而且在DNA重组与表达、基 因结构分析和功能 检测中具有重要的应用价值。
71-72N 17N
βEN
71-72M 17M
βEM
-30M 14-15M CAP
31N 31M IntM
27/28M IVS-I-1M IVS-I-5M
βCD17/ βN标本
41-42N 654N -28N
71-72N 17N
βEN
31N
41-42M 654M -28M 71-72M 17M
βEM
71-72N 17N
βEN
31N
27/28M
41-42M 654M -28M 71-72M 17M
βEM
31M
IVS-I-1M
43M
-32M -29M -30M 14-15M CAP
IntM
IVS-I-5M
β CD41-42/ βN标本
41-42N 654N
41-42M 654M
43M
-32M
-28N -28M -29M
5.显色
A液:POD=2000:1,轻摇保温30min,后用A液 洗膜2次,各5分钟。C液室温洗膜2min,之后置 显色液避光显色20min
杂交反应条件按照试剂盒要求
结果判断
41-42N 654N -28N
71-72N 17N
βEN
31N
27/28M
41-42M 654M -28M 71-wk.baidu.com2M 17M
35cycles
反应条件按照试剂盒要求
影响PCR的因素见理论课内容
3.杂交 :
15ml管 探针膜条(做好记号) A液 5-6ml DNA溶液(PCR产物)25ul
沸水浴10min
42℃杂交1.5小时以上
4.洗膜 :
50ml塑料管 B液 40ml
42 ℃预热
取出膜条,置于 50ml塑料管中
42 ℃洗涤15min
广泛应用于基因突变检测(如地中海贫血、 G6PD缺乏症、耳聋等遗传病的检测)、基因分 型、遗传多态性检测以及病原体检测等多个方 面,具有广泛的临床应用价值。
IntM
IVS-I-5M
β-28/βN标本
41-42N 654N
41-42M 654M
43M
-32M
-28N -28M -29M
71-72N 17N
βEN
71-72M 17M
βEM
-30M 14-15M CAP
31N 31M IntM
27/28M IVS-I-1M IVS-I-5M
β-28/ β-28标本
β-地中海贫血基因检测
(PCR-反向点杂交法)
β-地中海贫血(简称β-地贫)是一种由于β珠蛋白基因突变导致肽链表达失衡而产生的单基 因遗传血液病,多由β-珠蛋白基因点突变所致, 是我国南方各省最常见、危害最大的遗传病之一。 在中国人群中常见的突变位点有CD41-42(-TCTT)、 CDL7(A→T)、IVS-Ⅱ-654(C→T)和TATAbox28(A→G)等位点。因本病多为点突变所致,故常 用PCR加反向点杂交(RDB)确定突变类型。
【操作步骤】
1.DNA获取(已准备好了)
2.PCR扩增(采用试剂盒) : 反应液管(做好记号)
5000rpm,2秒
总体积25微升
加入 2ul DNA溶液
反应体系各组分的用量见理论课内容
PCR扩增条件
50℃, 95℃, 94℃, 55℃, 72℃, 72℃,
15min 10min 1min 30sec 30sec 7min
PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:
①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后, 使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为 单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;
②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单 链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列 配对结合;
βEM
31M
IVS-I-1M
43M
-32M -29M -30M 14-15M CAP
IntM
IVS-I-5M
杂交膜条
41-42N 654N -28N
71-72N 17N
βEN
31N
27/28M
41-42M 654M -28M 71-72M 17M
βEM
31M
IVS-I-1M
43M
-32M -29M -30M 14-15M CAP
【原理】
PCR技术原理
DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。 双链DNA在多种酶的作用下可以变性解链成单链, 在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复 制成同样的两分子挎贝。
PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其 特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
【原理】
PCR技术原理
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