stata软件meta分析操作详细攻略报告
Meta分析软件操作指南

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Review Manager简介
• 把文献和数据读入软件
• 非常重要的:数据摘取/Meta分析
– 演示与练习
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新建Review
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Meta分析软件
2. STATA 该 软 件 是 美 国 Computer Resource Center研制的统计软件,从1985年起,连续推 出了多个版本,目前最新版本为10.0。
该软件可完成二分类变量和连续性变量的Meta 分析,也可以进行Meta回归分析,还可以绘制 Meta分析的相关图型,如森林图(Forest)、 漏斗图(Funnel)和L’Abbe图。
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点Data and analysis 前的加号
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meta分析步骤详解,以及常见问题解析

meta分析步骤详解,以及常见问题解析Meta分析的完整步骤,根据个⼈的体会,结合各位友⼈的经验总结⽽成,meta的精髓就是对⽂献的⼆次加⼯和定量合成,所以这个总结也算是对⼤家经验的meta分析吧。
▽⼀、选题和⽴题1形成需要解决的临床问题系统评价可以解决下列临床问题:1. 病因学和危险因素研究;2. 治疗⼿段的有效性研究;3. 诊断⽅法评价;4. 预后估计;5. 病⼈费⽤和效益分析等。
进⾏系统评价的最初阶段就应对要解决的问题进⾏精确描述,包括⼈群类型(疾病确切分型、分期)、治疗⼿段或暴露因素的种类、预期结果等,合理选择进⾏评价的指标。
2指标的选择直接影响⽂献检索的准确性和敏感性,关系到制定检索策略。
3制定纳⼊排除标准。
⼆、⽂献检索1检索策略的制定这是关键,要求查全和查准。
推荐Mesh联合free word检索。
2⽂献检索,获取摘要和全⽂国内的有维普全⽂VIP,CNKI,万⽅数据库,外⽂的有medline ,SD,OVID等。
3⽂献管理强烈推荐使⽤endnote,procite,noteexpress等⽂献管理软件进⾏检索和管理⽂献。
查找⽂献全⽂的途径在这⾥,讲⼀下找⽂献的过程,以请后来的朋们参考(不包括⽹上有电⼦全⽂的):1. 查找免费全⽂(1)在pubmed center中看有⽆免费全⽂。
有的时候虽然没有显⽰free full text,但是点击进去看全⽂链接也有提供免费全⽂的。
我就碰到⼏次。
(2)在google中搜⼀下。
少数情况下,NCBI没有提供全⽂的,google有可能会找到,使⽤“学术搜索”。
本⼈虽然没能在google中找到⼀篇所需的⽂献,但发现了⼀篇⾮常重要的综述,⾥⾯包含了所有我需要的⽂献(当然不是数据),但起码提供了⼀个信息,所需要的⽂献也就这么多了,因为⽼外的综述也只包含了这么多的内容。
这样,到底找多少⽂献,找什么⽂献,⼼⾥就更有底了。
(3)免费医学全⽂杂志⽹站。
提供很过超过收费期的免费全⽂。
用stata实现诊断性试验的meta分析

STATA已经有独立的模块(metandi)来做诊断性试验的meta分析,所用方法是拟合了一个两水平的混合logistic回归模型。
虽然该模块还没有与metan模块类似的对话框,但是应该来说已经是一个比较大的进步。
最终的呈现结果不仅能给出基于多水平模型估计得到的南京58信息网ROC曲线下面积(hierarchical summary receiver operating characteristic,hsroc),同时能得到“拐点”信息(summary point),以下摘选该模块的帮助内容来简要介绍该模块。
Titlemetandi -- Meta-analysis of diagnostic accuracySyntaxmetandi tp fp fn tn [if] [in] [, plot gllamm force ip(g|m) nip(#) nobivariate nohsroc nosummarypt detail level(#) trace nolog]by is allowed with metandi; see [D] by.See metandi postestimation for features available after estimation, in particular, the predict command. metandiplot graphs the results from metandi.Descriptionmetandi performs meta-analysis of diagnostic test accuracy studies in which both the index test under study and the reference test (gold standard) are dichotomous. It takes as input four variables: tp, fp, fn, and tn, giving the number of true positives, false positives, false negatives, and true negatives within each study. It fits a two-level mixed logistic regression model, with independent binomial distributions for the true positives and true negatives conditional on the sensitivity and specificity in each study, and a bivariate normal model for the logit transforms of sensitivity and specificity between studies.In Stata 10, metandi fits the model by using the official Stata command xtmelogit by default. In Stata 8 or 9, metandi uses the user-written command gllamm, which must be installed.To ensure you have the most recent version of gllamm, type ssc install gllamm, replace.metandi does not allow covariates to be fit; i.e., meta-regression of diagnostic accuracy is not supported.。
如何用stata软件实现贝叶斯meta分析

性 随机变 量 ,均 可 表示 为 指 数 族 的概 率 分 布形 式 。在
广义 贝 叶斯 随机效 应模 型 中 ,首先 ,假定 每个研 究效 应
量的估计值 Y (i=正态分 布 :
Y 一N(0 ,S )
(1)
0 一N( ,r )
(2)
且p Yf~N(0f,S + )
广 义贝 叶斯 随机 效应模 型 的 meta分 析
广义 线 性 模 型 (generalized linear models,GLM ) 作 为 一般线 性模 型 的 推广 ,将 诸 多 不 同的 分 布 函数 统
△通信作者 :沈毅 ,E-mail:sunny@ntu.edu.ca
一 到指数 族框 架 内 。无论 因变量 Y是 连续 性还是 离 散
近年来 ,尽 管模 拟算法 不 断改进 ,但 贝 叶斯 方 法 的 计 算 复杂性 仍使 众 多 研 究 者望 而 却 步 。此 外 ,数 据 处 理 软件 的 匮乏也 成为 贝 叶斯 统计 发展 的桎 梏 。最 常用 于贝 叶 斯分 析 的 BUGS类 软 件 是 一 种 为 Windows系 统 编 写 的免 费软 件 ,内含一 系列 抽样 方法 ,可对 给定 问 题 自动挑选 最 佳 解 决方 案 。但该 软 件 编 程 复 杂 ,且 无 法 直接提 供可 视化 meta分析 结果 ,如 森林 图、漏 斗 图 、 模 型诊断 图等 ,而这一点却是 meta分析所必不 可少 的。
中国卫生统计 2018年 4月第 35卷第
如 何 用 stata软 件 实 现 贝 叶 斯 meta分 析
南通大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系(226019) 张 晟 周 洁 何 书 汪徐林 沈 毅
stata meta回归结果详细解读

stata meta回归结果详细解读Meta回归是一种统计方法,用于整合多个独立研究的结果,以得出一个总体效应估计。
在Stata中进行Meta回归分析后,我们主要通过以下几种统计量和图形进行结果的解读:1. 森林图:这是一种用于展示多个研究的效应量、置信区间和权重的图形。
横线上的点代表单个研究的效应量,横线长度代表该效应量的95%置信区间范围,横线上的方块大小代表该研究的权重,即该项研究对Meta分析的贡献度。
图中的菱形则代表合并后的结果;图中的垂直实线是无效线,用于判定结果差异有无统计学意义,若单个研究或合并效应量的95%置信区间与该直线相交,则代表两组的差异没有统计学意义。
2. Q统计量和I2统计量:Q统计量是服从自由度为K-1的卡方分布,本质是卡方检验,属于异质性定性分析的方法。
一般认为当P<0.1时,表明各研究间存在异质性。
3. 气泡图:这是另一种用于展示Meta回归结果的图形,例如以年龄为协变量的气泡图。
在进行Meta回归分析时,还需要注意以下几点:- 异质性检验:通过Q统计量和I2统计量进行异质性检验,以判断各研究间是否存在显著差异。
- 亚组分析和敏感性分析:这些分析可以帮助我们更深入地了解Meta回归结果的稳定性和可靠性。
我们还可以通过查看回归系数和其95%置信区间来评估每个协变量对因变量的影响。
如果回归系数的95%置信区间不包含零,那么我们可以得出结论说该协变量对因变量有显著影响。
我们还需要注意可能存在的一些偏倚问题,如出版偏倚、选择偏倚等。
这些问题可能会影响到Meta回归结果的准确性和可靠性。
因此,在进行Meta回归分析时,我们需要尽可能地选择那些经过同行评审的研究,并考虑使用一些方法来修正可能存在的偏倚问题。
Meta回归是一种强大的统计工具,可以帮助我们从大量的独立研究中提取出有用的信息。
然而,正确地解读Meta回归结果需要一定的专业知识和经验。
如果你不确定如何解读你的结果,或者你对结果有任何疑问,你应该寻求专业的统计咨询。
手把手教你用Stata进行Meta分析Meta简明教程(7)

手把手教你用Stata进行Meta分析Meta简明教程(7)Meta简明教程目录1. 认识一下meta方法! | Meta简明教程(1)2. 一文初步学会Meta文献检索| Meta简明教程(2)3. 如何搞定“文献筛选” | Meta简明教程(3)4.Meta分析文献质量评价 | Meta简明教程(4)5.Meta分析数据提取| Meta简明教程(5)6.一文学会revman软件| Meta简明教程(6)Meta简明教程(7)上一期介绍了Revman 软件对二分类数据、连续型数据、诊断性试验数据、生存-时间数据进行meta分析,本期将利用Stata对以上数据进行meta分析。
大家可以到本公众号下载Stata软件(重磅推荐:分类最全的统计分析相关软件,了解一下?请关注、收藏以备用)Stata12.0 界面一、二分类数据分析数据形式例:研究阿司匹林(aspirin)预防心肌梗死(MI)7个临床随机对照试验,观察死亡率,数据提取如下:操作步骤1.构建数据1)启动Stata 12.0 软件后,可以直接点击工具栏中DataEditor (edit)按钮。
也可在在菜单栏中点击Data→Data Editor→ DataEditor (edit),出现以下界面。
2)点击变量名位置,依次输入研究名称(research),阿司匹林组死亡数(a),阿司匹林组存活数(b),安慰剂组死亡数(c),安慰剂组存活数(d)3)录入数据:在变量值区域输入数据2. 数据分析1)导入meta模块:在Command窗口中进行编程,首先需要在Stata中安装meta 模块:在Command窗口输入“ssc install metan”,选中点回车。
结果窗口中出现下面的结果,说明已经安装了meta模块。
2)输入meta分析代码:在Command窗口输入“Command窗口输入“metan a b c d, or fixed”,点回车,完成结果分析。
meta分析stata演示文稿

数据
计量资料
亚组分析---design
亚组分析---location
随机效应模型,异质性太大
漏斗图
ES:效应量(例如血糖下降变 seES:效应量的标准误
直接复制,可得白色的图
WMD
Begg's funnel plot with pseudo 95% confidence limits .5
Stata软件实现步骤
基线数据的录入与导入; 菜单操作或者编写程序; 生成森林图以及所需要的图形; 数均值、标准差,一篇文献,低中高剂量
Wmd 单位统一 ,加权均值,如血糖的单位都是 mmol/l
Msd 标准化均值
wmd
森林图操作步骤
发表的文献中符合要求的数据进行合并,计算出其 合并效应。
举例说明
1、计量资料的meta分析
运动、饮食与降空腹血糖 检索文献、检索词筛选出80-90篇 读摘要筛选30-40篇,精读剩下12篇 State软件做分析,得出合并效应森林图
检索文献流程图
合并效应森林图
几个关键的步骤
文献的纳入与排除(检索策略与纳入标准); 纳入文献的质量评估(几种评估量表); 森林图的生成与亚组分析(合并效应WMD,SMD); 漏斗图的制作及其意义;
前瞻性RR 回顾性OR
表2.1 Aspirin预防心梗死亡的临床试验结果基线情况
study year
Aspirin group
Placebo group
total
death
total
death
MRC-1 1974
615
49
624
67
CDP 1976
758
44
771
64
stata软件meta分析操作详细攻略

还可以对 发表偏倚进行Begg,s检验和Egger,s检验。 目前,Stata软件是Meta分析备受推崇的软件, 国外高质量 杂志更倾向于接收Stata Meta分析图形界面。
*
1.2 stata软件界面
回顾窗口
*
工具栏
结果窗口
变量窗口
命令窗口
1.3 stata软件快捷菜单
打开数据
数据编辑
变量管理
读书报告
Stata软件在Meta分析中的运用
2020/3/5
1
目录
1 Stata软件简介 2 Stata中二分类资料的Meta分析 3 Stata中连续性资料的Meta分析 4 异质性的处理 5 发表偏倚检验
*
1 第一部分
Stata软件简介
2020/3/5
3
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试验组 样本数
试验组 均数
试验组 标准差
对照组 样本数
对照组 均数
对照组 标准差
作者
发表年份
2021/3/7
CHENLI
13
*
2.3 metan菜单命令
计数资料 连续性资料
效应量
效应量的标 准误
研究标签
命令输入
年份标签
亚组分析
按某种顺序排 列
2021/3/7
CHENLI
14
*
2.3 metan菜单命令
202Байду номын сангаас/3/7
*
调整统计量Z值及 P值。
CHENLI
33
logor
5.2 Begg法漏斗图
Begg's funnel plot with pseudo 95% confidence limits 4
2
0
-2 0
2021/3/7
*
.5
1
s.e. of: logor
CHENLI
1.5
34
5.3 Begg法检测发表偏倚(连续性)
2021/3/7
CHENLI
4
*
1.1 stata软件简介
相对RevMan而言,Stata的Meta分析功能更全面和强 大,该软件除了可以完成二分类变量和连续性变量的Meta 分析,也可以进行Meta回归分析、 累积Meta分析、单个 研究影响分析、诊断试验的Meta分析、剂量反应关系 Meta分析、生存分析资料合并等几乎所有Meta分析方法。
连续性资料的不 用取对数
图形显示依据 权重大小
2021/3/7
CHENLI
35
*
SMD
5.3 Begg法漏斗图
Begg's funnel plot with pseudo 95% confidence limits 1.5
异质性
2021/3/7
*
无效线
95%可信 区间
权重
CHENLI
对于有利结局菱形在右 边有效,左边无效;不 利结局则相反。
18
2.6 连续性资料森林图
无效线
当两均数差值为0时,差 异无统计学意义,故无 效线在0处。
2021/3/7
CHENLI
19
*
2.7 连续性资料森林图
无效线
当两均数差值为0时,差 异无统计学意义,故无 效线在0处。
2021/3/7
CHENLI
24
*
4. 2 meta回归菜单操作
因变量 协变量
标准误 ReML法
2021/3/7
CHENLI
25
*
4. 2 meta回归结果
2021/3/7
*
P值大于0.05,提示发 表年限与研究间异质性 无关。
CHENLI
26
4. 3 敏感性分析
2021/3/7
CHENLI
27
CHENLI
3
3
1.1 stata软件简介
Stata是一个功能强大而又小巧玲珑的统计分析软 件,最初由美国计算机资源中心(Computer Resource Center)研制,现为Stata公司的产品。从1985年1.0 版 问世以来,通过不断的更新和扩充,软件功能已日趋完善。
它操作灵活、简单、易用,同时具有数据管理软件、 统计分析软件、绘图软件、矩阵计算软件和程序语言 的特点,在许多方面别具一格,和SAS、 SPSS一起并称 为新的三大权威统计软件。
漏斗图 敏感性分析
发表偏倚
2021/3/7
CHENLI
10
*
2 第二部
分
二分类和连续性资料的meta分析
2021/3/7
CHENLI
11
11
2.1 二分类资料数据录入
作者
试验组 发生数
发表年份
试验组 未发生
对照组 发生数
对照组 未发生
更改变 量名称
2021/3/7
CHENLI
12
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2.2 连续性资料数据录入
还可以对 发表偏倚进行Begg,s检验和Egger,s检验。 目前,Stata软件是Meta分析备受推崇的软件, 国外高质量 杂志更倾向于接收Stata Meta分析图形界面。
2021/3/7
CHENLI
5
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1.2 stata软件界面
回顾窗口
2021/3/7
*
工具栏
结果窗口
变量窗口
命令窗口
CHENLI
6
1.3 stata软件快捷菜单
打开数据
数据编辑
变量管理
数据查看
2021/3/7
CHENLI
7
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1.4 stata软件界面
导入其他数据
2021/3/7
CHENLI
8
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1.5 stata软件meta模块
Meta分析模块
2021/3/7
CHENLI
9
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1.5 stata软件meta模块
常用meta分析 累积meta分析 Meta回归分析
模型
效应量
2021/3/7
CHENLI
15
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2.4 metan菜单命令
模型
2021/3/7
CHENLI
16
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2.4 资料分析结果输出
合并统计量
异质性Q检验 P值
2021/3/7
*
CHENLI
I2值
17
2.5 二分类资料森林图
中间短横线代表一 个试验结果的可信 区间,位于横线中 间的小方块代表OR 值。最下方菱形符 号代表纳入全部试 验的综合结果。短 横线/菱形与无效线 相交表示差异无统 计学意义。
读书报告
Stata软件在Meta分析中的运用
2021/3/7
CHENLI
1
1
2021/3/7
*
目录
1 Stata软件简介 2 Stata中二分类资料的Meta分析 3 Stata中连续性资料的Meta分析 4 异质性的处理 5 发表偏倚检验
CHENLI
2
1 第一部分
Stata软件简介
2021/3/7
发表偏倚的检验方法:漏斗图法、Begg和Egger法、 剪补法和失安全系数法。
2021/3/7
CHENLI
30
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5.1 漏斗图法检测发表偏倚
只能定性的识别发 表偏倚。
2021/3/7
CHENLI
31
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5.2 Begg法检测发表偏倚(二分类)
方法选择
2021/3/7
CHENLI
32
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5.2 Begg法结果输出
2021/3/7
CHENLI
20
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异质性的处理
4 第四部
分
2021/3/7
CHENLI
21
21
4. 1 亚组分析
按照用药方式 分为两个亚组
2021/3/7
CHENLI
22
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4. 1 亚组分析菜单命令
输入亚组命令
2021/3/7
CHENLI
23
*
4. 1 亚组分析森林图
不同亚组的异 质性
总的异质性
*
4. 3 敏感性分析
2021/3/7
CHENLI
28
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5 第五部
分
发表偏倚检验
2021/3/7
CHENLI
29
29
5.1 发表偏倚检验
发表偏倚是meta分析最常见的系统误差。通常阳性 结果较阴性结果更易发表,形成了为数不少的“抽屉文 件”,根据发表文献所做的综合分析有可能歪曲了真实 效应。据调查统计,临床试验报告阳性结果的发表率约 为77%,阴性结果发表率仅为42%。因此meta分析必须 对发表偏倚进行讨论。