DNA甲基化
dna甲基化例子
dna甲基化例子
有很多DNA甲基化的例子，以下是其中的一些：1. 癌症：DNA甲基化在癌症的发展中起着重要的作用。
在肿瘤细胞中，DNA甲基化的异常可以导致基因的失活，从而促进癌症的进展。
2. 基因调控：DNA甲基化可以影响基因的表达。
在某些基因上，DNA甲基化可以阻止转录因子结合到DNA上，从而使基因无法被转录，因此导致该基因的失活。
3. 遗传变异：DNA甲基化也可以是一个遗传变异的来源。
甲基化位点的变化可能会作为个体间的遗传标记，对个体特征和疾病易感性产生影响。
4. 表观遗传学：DNA甲基化是表观遗传学的一个重要组成部分。
它可以通过调节基因的表达，影响个体表型的形成和发展。
5. 环境因素：环境因素可以影响DNA的甲基化状态。
例如，饮食、化学物质和暴露在毒素中都可以影响DNA的甲基化模式，从而对个体的健康产生影响。
这些只是DNA甲基化的一些例子，实际上，DNA甲基化在基因组中的作用非常广泛，并且仍然是广泛的研究领域。
dna甲基化的原理
dna甲基化的原理DNA甲基化是指DNA分子上的碱基（特别是腺嘌呤和胞嘧啶）上附加一个甲基（CH3）基团的化学修饰过程。
这种修饰作用发生在甲基转移酶酶作用下，将甲基从甲基供体转移到DNA分子上。
DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰方式，调控着基因组的稳定性，DNA复制和RNA转录等生物过程。
DNA甲基化的原理可以概括为以下几个步骤：1.甲基供体提供：DNA甲基化需要一个供应甲基基团的供体，这个供体通常是S-腺苷甲硫氨酸（SAM）。
SAM经过甲基转移酶的催化作用，在该过程中，SAM的甲基通过与SAM一些基团的共价键断裂，生成S-腺苷-L-同-蛋氨酸（SAH）。
2. 甲基转移酶催化：甲基转移酶（DNA甲基转移酶）是调控DNA甲基化的重要酶类。
这些酶能够识别特定的DNA序列，如CpG二核苷酸丰富区域，以及保守的dna甲基化特性。
甲基转移酶首先与DNA结合，然后将SAM供体的甲基转移给DNA分子。
这个过程是可逆的，并且在受到一些信号影响时可以被逆转。
3.甲基化的位置和模式：DNA甲基化通常发生在胞嘧啶（C）的C5位或腺嘌呤（A）的N6位。
具体来说，CpG二核苷酸丰富区域（CpG岛）常常是DNA甲基化的热点区域。
这种模式主要表现在线粒体DNA和内源性逆转录病毒的基因组DNA中。
4.甲基化与基因表达：DNA甲基化可以影响基因的表达。
局部甲基化会抑制转录因子的结合，阻碍转录因子和RNA聚合酶的结合，从而抑制转录的发生。
另一方面，全局甲基化可能导致基因组整体的转录沉默。
DNA甲基化调控的机制主要有两种：1.直接调控：DNA甲基化被认为是一种直接抑制基因转录的机制。
当DNA部分被甲基化，这会导致一些核蛋白质（转录因子）不能与甲基化的DNA结合。
因为转录因子无法结合到DNA上，这样会阻碍RNA聚合酶从而抑制基因的转录。
2.间接调控：DNA甲基化还可以通过在染色质水平上装配或阻止一些蛋白质如组蛋白修饰酶，进一步间接地影响基因表达。
dna甲基化的概念
dna甲基化的概念
DNA甲基化是一种生物化学过程，其中甲基基团（CH3）加在DNA分子中的脱氧核苷酸上。
这个过程是通过DNA甲基转移酶酶催化的。
DNA甲基化在基因组稳定性和基因表达调控中起着重要作用。
它能够影响基因的表达模式，并且对细胞命运决定也有影响。
DNA甲基化通常发生在CpG双核苷酸的序列上，即DNA链上紧邻着一个胞嘧啶（C）核苷酸和一个鸟嘌呤（G）核苷酸组成的序列。
这些区域通常被称为CpG岛。
DNA甲基化可以导致基因的沉默和基因组稳定性，通过两种途径影响基因表达：一是通过直接阻碍转录因子与DNA结合，从而抑制基因的转录活性；二是通过招募甲基化相关蛋白质如甲基结合蛋白(MBD)来改变染色质的结构和组装方式，导致基因区域不稳定并更容易被染色质调控。
此外，DNA甲基化在胚胎发育、细胞分化，以及致病性疾病的发生等过程中也发挥着重要的调节功能。
DNA甲基化可以被环境因素和生物学过程所影响，并且在许多疾病中也具有重要作用，包括癌症、神经系统疾病和心血管疾病等。
因此，研究DNA甲基化在基因表达和疾病发生中的作用对于理解基因组调控和疾病机制非常重要。
DNA甲基化
DNA甲基化DNA甲基化（DNA methylation）是最早发现的修饰途径之一，大量研究表明，DNA 甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。
含义：在甲基转移酶的催化下,DNA的CG两个核苷酸的胞嘧啶被选择性地添加甲基,形成5－甲基胞嘧啶，这常见于基因的5'—CG-3'序列.大多数脊椎动物基因组DNA都有少量的甲基化胞嘧啶，主要集中在基因5’端的非编码区，并成簇存在。
甲基化位点可随DNA 的复制而遗传，因为DNA复制后,甲基化酶可将新合成的未甲基化的位点进行甲基化。
DNA的甲基化可引起基因的失活,DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化，从而影响了蛋白质与DNA的相互作用,甲基化达到一定程度时会发生从常规的B—DNA向Z-DNA的过渡，由于Z-DNA结构收缩，螺旋加深，使许多蛋白质因子赖以结合的原件缩入大沟而不利于转录的起始，导致基因失活。
另外,序列特异性甲基化结合蛋白（MBD/MeCP）可与启动子区的甲基化CpG岛结合,阻止转录因子与启动子作用,从而阻抑基因转录过程。
DNA甲基化主要形成5－甲基胞嘧啶（5—mC)和少量的N6-甲基腺嘌呤（N6-mA）及7－甲基鸟嘌呤（7-mG）结构基因：含有很多CpG 结构,2CpG 和2GPC 中两个胞嘧啶的5 位碳原子通常被甲基化,且两个甲基集团在DNA 双链大沟中呈特定三维结构。
基因组中60％~ 90% 的CpG 都被甲基化，未甲基化的CpG 成簇地组成CpG 岛，位于结构基因启动子的核心序列和转录起始点。
有实验证明超甲基化阻遏转录的进行。
DNA 甲基化可引起基因组中相应区域染色质结构变化，使DNA 失去核酶ö；限制性内切酶的切割位点，以及DNA 酶的敏感位点，使染色质高度螺旋化,凝缩成团，失去转录活性。
5 位C 甲基化的胞嘧啶脱氨基生成胸腺嘧啶（C—T转换），由此可能导致基因置换突变，发生碱基错配，如果在细胞分裂过程中不被纠正，就会诱发遗传病或癌症。
dna甲基化的主要形式和生物学作用
dna甲基化的主要形式和生物学作用
DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰，它对DNA分子中的碱基进行修饰，可以在不改变DNA分子一级结构的情况下调节基因组的功能，在生命活动中有着重要的生物学功能。
DNA甲基化的主要形式有两种：维持甲基化和从头甲基化。
维持甲基化是指在DNA复制后仍然保持原有位点甲基化形式不变的过程，即在甲基化DNA半保留复制出的新生链相应位置上进行甲基化修饰，新生链只在与母链甲基化位置相同的碱基处发生甲基化。
从头甲基化不依赖DNA复制，是从未发生甲基化的位点的甲基化，能引起新的甲基化形式的产生。
DNA甲基化的生物学作用包括：
1. 基因表达的调控：DNA甲基化可以抑制基因的表达，通过在基因启动子区域形成甲基化CpG岛来抑制基因的表达。
2. 遗传印记：DNA甲基化可以导致某些基因的沉默或激活，从而影响个体的表型。
3. 染色体稳定性：DNA甲基化可以影响染色体的稳定性，有助于防止染色体畸变和基因突变。
4. 胚胎发育：DNA甲基化在胚胎发育过程中起着重要的作用，有助于控制胚胎发育过程中的基因表达。
5. 癌症发生：DNA甲基化异常与癌症的发生密切相关，一些基因的甲基化可以导致其表达沉默或降低，从而促进癌症的发生。
总的来说，DNA甲基化的主要形式和生物学作用都是复杂而多样的，它们在不同生物过程和不同生物类型中发挥不同的功能和作用。
DNA甲基化——表观遗传学的重要组成部分
DNA甲基化——表观遗传学的重要组成部分DNA甲基化是一种表观遗传学调控机制，通常指DNA分子上的甲基化修饰。
这种化学变化涉及DNA链上的甲基基团与Cytosine碱基的配对，对基因表达和细胞分化等生命过程具有重要作用。
DNA甲基化不仅在正常生长发育中发挥至关重要的作用，而且也涉及很多人类疾病的发展。
本文将介绍DNA甲基化的基本原理、分布方式、调控机制及其在疾病中的作用。
一、DNA甲基化的基本原理DNA是由4种不同的核苷酸构成的，其中包括Adenine、Thymine、Cytosine和Guanine。
DNA的甲基化通常发生在Cytosine碱基的C5位，即通过甲基基团与细胞内的S-Adenosyl Methionine（SAM）反应，形成5-甲基Cytosine（5mC）。
DNA甲基化是基因组合成和生物遗传变异的关键机制之一。
它可以调控基因的表达和细胞分化，与疾病的发展密切相关。
虽然越来越多的研究表明，DNA甲基化是一种可逆的表观遗传修饰，但它仍然是一种稳定的标记，可以被逐代遗传，影响基因表达和细胞分化。
二、DNA甲基化的分布方式DNA甲基化在不同种类和类型的细胞中存在和分布不同。
在人体内，DNA甲基化主要发生在GC富集区域，如基因启动子、繁殖起始点、转录因子结合区等。
这些区域往往影响到基因表达的调控，因此被视为关键的甲基化信号的地点。
另一方面，DNA甲基化还出现在基因体内部的非编码区域，如intron、intergenic regions、satellite DNA和telomeres。
虽然对它们的确切功能还有争议，但这些甲基化信号可能参与调控DNA复制、染色体结构和修复。
三、DNA甲基化的调控机制DNA甲基化是由DNA甲基转移酶（DNMTs）负责催化核苷酸中的甲基基团的加成。
DNMTs可以对一些具有特定序列和结构的DNA区域进行偏好性的甲基化修饰。
这些区域的一个重要特征是在基因表达和细胞分化中发挥着重要的作用。
DNA甲基化与CpG岛
• 引言 • DNA甲基化的功能 • CpG岛的特性与分布 • DNA甲基化与CpG岛的关系 • DNA甲基化与CpG岛的研究方法 • DNA甲基化与CpG岛的前景与展望
01
引言
DNA甲基化的定义
DNA甲基化是指在DNA序列中，CpG位点的胞嘧啶被甲基所 修饰的过程。这种修饰是一种重要的表观遗传学标记，对基 因表达和细胞分化等生物学过程具有重要影响。
甲基化与失活
在X染色体失活过程中，DNA甲基化在X染色体上广泛发生，导致相关基因沉默 和X染色体整体失活。这种甲基化模式有助于维持X染色体失活的稳定性和遗传性 。
03
CpG岛的特性与分布
CpG岛的识别标准
01
CpG密度高
CpG岛内CpG位点的密度显著高于 周围序列。
启动子关联
CpG岛通常与基因的启动子区域相 关联。
该方法使用特异性抗体富集甲基化的DNA片段， 然后进行高通量测序，以识别甲基化位点。
该方法使用甲基化结合蛋白（MBD蛋白）富集甲 基化的DNA片段，然后进行高通量测序，以识别 甲基化的CpG岛。
06
DNA甲基化与CpG岛的前景与展望
在疾病诊断和治疗中的应用
肿瘤甲基化检测
通过检测肿瘤组织中DNA的甲基化状态 ，有助于肿瘤的早期诊断和预后评估。
在基因组印记和X染色体失活过程中， DNA甲基化起到关键作用，通过甲基 化特定基因或基因组区域，使这些基 因或区域沉默，不参与基因表达。
基因组印记
印记基因
基因组印记是指某些基因在不同细胞类型中的表达存在差异，这些差异由DNA 甲基化水平决定。印记基因通常在发育过程中由父本或母本来源的等位基因选 择性表达。
亚硫酸氢盐测序
高中生物甲基化知识点
高中生物甲基化知识点
甲基化是指在DNA分子中加入甲基基团(CH3-)的化学修饰过程。
甲基化在细胞中起到了重要的调控作用，特别是在基因表达调控方面。
以下是高中生物甲基化的一些基本知识点：
1. 甲基化是一种化学修饰，通过在DNA的嘌呤和胸腺嘧啶碱基上加入甲基基团来改变DNA的结构和功能。
2. 甲基化通常发生在DNA的CpG位点上，即嘌呤碱基C和胸腺嘧啶碱基G的相邻位置。
3. DNA甲基化可以影响基因表达的方式，通常是通过抑制转录因子与DNA结合，阻止基因的转录。
4. 甲基化模式在细胞发育和分化过程中起着重要的调控作用。
在不同类型的细胞中，甲基化模式可以有所不同，从而导致基因表达的差异。
5. 甲基化在遗传学中也起着重要的作用。
甲基化可以通过影响染色体的结构和稳定性，对基因组的稳定性和遗传信息传递起到调控作用。
6. 甲基化异常与一些疾病的发生和发展密切相关。
例如，DNA甲基化异常可以导致某些肿瘤的发生，也与一些遗传性疾病和神经系统疾病有关。
7. 甲基化可以通过多种方法检测，包括甲基化特异性PCR、甲基化敏感性限制性内切酶消化和甲基化测序等。
8. 甲基化的调控可以通过DNA甲基转移酶和DNA甲基去除酶来实现。
DNA甲基转移酶负责在DNA分子上加入甲基基团，而DNA甲基去除酶则负责去除DNA上的甲基基团。
以上是高中生物甲基化的一些基本知识点，希望对你有帮助。
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人类基因组单体型图细胞株中与遗传和基因表达变化有关的DNA甲基化模型摘要背景：DNA甲基化是参与基因调控和疾病的一种重要表观遗传学机制，但很少人知道在个体间甲基化机制存在差异。
在这，我们从77个图约鲁巴人的人类基因组单体中测量了22,290 CpG二核苷酸的淋巴母细胞系的甲基化水平，同时也使用了全基因组的基因表达和基因型数据。
结果：通过对超过三百万常见的单核苷酸多态性（SNP）位点的甲基化水平关联的分析，我们确定在173个基因的180个CpG双核苷酸位点与附近的单核苷酸多态性（独联体通常在5 KB内）的错误发现率为10％。
在迪斯科相互作用蛋白2的同源基因B（DIP2B，以前推测在DNA甲基化中发挥作用）中发现SNP rs10876043是最有趣的传输信号，全基因范围内的信号与第一组分的甲基化模式是有联系的。
而且我们发现在整体信号联系中只有少量的反式作用。
正如预期的那样，通过测量的RNA序列，我们发现基因的启动子甲基化和基因表达水平呈负相关关系。
最后，发现有一个显着的SNP位点重叠，均与甲基化与基因的表达水平有关。
结论：我们的研究结果显示在个体间的差异在DNA甲基化方面有很强的遗传成分。
此外，丰富的单核苷酸多态性会影响甲基化和基因表达，为共享机制的一小部分的基因提供了证据。
背景：D NA甲基化在真核生物的基因组起着重要的调节作用。
甲基化的改变可以影响转录和表型的变化[1]，但DNA甲基化本身的变化根源，现在仍然知之甚少。
大量证据确实存在DNA甲基化的个体差异随着年龄的增长[2,3]，组织[4,5]，物种[6]。
在哺乳动物中，DNA甲基化是通过DNA甲基转移酶（转移酶）介导的，是在复制过程中负责重新甲基化和维持甲基化模式。
参与合成的甲基化和DNA去甲基化的基因也可以影响甲基化的变化。
例如，突变的甲基转移酶DNMT3L[7]和亚甲基四氢酸还原酶MTHFR[8]基因可导致人的血液中DNA低甲基化。
这些变化发生在全基因组水平，与遗传变异是不同的，而是有针对性的对基因组区域影响DNA甲基化变异，例如，在H19/IGF2位点的差异性甲基化与遗传多态性有关9]。
最近的证据表明，DNA甲基化的依赖所在基因的序列含量[10〜12]。
在对家庭与双胞胎甲基化模式的研究中发现有很强的遗传效应，但随机因素和环境因素也有可能发挥重要作用2,14]。
最近的工作表明，基因变异可能对所在的甲基化模式有重大影响[5,15-18]，但影响甲基化的遗传变异是何种程度，机制尚不清楚。
此外，在DNA甲基化变化的基础上对个体基因表达影响到何种程度，仍然是未知之数。
DNA甲基化一直被认为是基因表达的一个关键调节器。
基因表达的遗传基础已经通过组织[19]和人口[20]进行了研究。
两条证据都表明与基因表达变化有关的遗传变异主要位于启动子转录起始位点附近。
然而，很少人知道遗传变异改变基因表达的确切的机制。
通过结合遗传特性、表观遗传学和基因表达数据，可以知道这些过程之间的基本关系，但这样的研究是在基因组范围内是罕见的。
最近的两项研究已经检测出人脑样品中DNA甲基化和基因表达之间的联系[5,18]。
这两项研究都发现每个表型都有相当数量的位点，但只有的少数几个位点有较强的基因甲基化和表达的变化。
为了更好地理解遗传变异在控制DNA甲基化的变化的作用，以及其对基因表达变化带来的影响，我们从人类基因组单体型图采集了77个人的淋巴母细胞系（LCLs）并研究了DNA启动子甲基化。
这些细胞系代表一种独特的资源，因为它们已经是人类基因组单体型图中密集的基因型21]，并且正在基因组计划中测序。
另外，这些细胞系的基因表达和RNA测序[23,24]已经使用微矩阵研究了许多组，以及更小的变化研究染色质辅助功能和PolII的结合[25,26]。
最后，一个单体型图细胞株，现在正在紧张研究的ENCODE项目[27]。
这种融合来自同一个细胞株的全基因组数据的不同类型的遗传变异会影响基因调控的机制，最终实现更清晰的认识。
结果：DNA启动子甲基化模式的特征为了研究个体间变异的甲基化图谱，我们测量了77个图约鲁巴人的淋巴母细胞系（LCLs）的整个基因组甲基化水平，这些样本来自无关从人类基因组单体型语（YRI）收集的个人。
对于这些样品，我们也有可公开获得的基因型[21]，以及估计的RNA测序的77个样本中的69个基因的表达水平[24]。
在重复使用的Illumina公司HumanMethylation27 DNA分析微珠的芯片的检测，这是基于对基因分型的bisulfiteconverted进行甲基化图谱个人的CpG-网站提供的定量测量DNA甲基化的基因组DNA。
TheIllumina阵列探测目标27,578 CpGsites。
然而，我们有限的探头，以绘制出独特的基因组中，并没有包含已知的序列变异分析，留给我们的一个数据集的22,290的13,236个基因的启动子区域的CpG位点（见方法）。
杂交后，甲基化水平估计作为比强度得到的信号从被甲基化了的甲基化和非甲基化的等位基因的信号强度的总和的等位基因。
继杂交，甲基化水平估计所得的甲基化的等位基因甲基化和unmethylated 等位基因强度信号的总和超过强度信号的比率。
甲基化水平通过两次复制被标准化确定分为点。
我们测试统计了潜在的混杂变量，可能会影响甲基化水平的淋巴瘤细胞白血病的相关性[29]，如LCL细胞的生长率，Epstein-Barr病毒的拷贝数变异生物和其他措施（见附件1），60个人在我们的研究[30];这些变化没有显着解释在我们的样本中的甲基化水平（图S1在此1）。
然而，我们观察HapMap项目的影响的阶段（从阶段1/2和3的样品）中的常染色体显性遗传的数据的第一主成分载荷的分布，提示第一甲基化部分主要组件可能会捕捉技术变化，可能相关的LCL文化的。
然而，我们观察到HapMap 阶段（从第1/2 阶段vs 3 样本）对分布在常染色体显性遗传的数据中，第一次主成分荷载的的影响表明甲基化的第一个主要组件部分可捕捉潜在相关的拼箱文化的技术变化。
在下游的关联映射分析，我们采用了修正，采用主成分分析回归前三个主成分占不可测量的干扰因素，提高功率检测数量性状位点。
甲基化的总体模式位于常染色体，X染色体上，并在附近的印记基因（图1a）CpGsites不同的甲基化模式进行观察。
大部分（71.4％），常染色体显性遗传的CpG位点主要是未甲基化（观察到的甲基化比例<0.3），15.6％为半甲基化（分数的甲基化是在0.3和0.7之间），13％的甲基化。
正如预期的那样，这些模式与以前观察到的全基因组水平启动子附近低甲基化水平附是一致的[4,31]。
我们没有发现证据的性别特异性的常染色体显性遗传的甲基化模式，与以前的报告一致[4]。
与此相反，用CpG的网站的X染色体上具有高度显着的性别特异性差异（图S2）与半甲基化模式符合女性X-染色体失活。
类似的峰半甲基化的CpG位点附近的转录开始的网站（TSSS）已知的常染色体显性遗传印记基因在整个样本。
我们观察到一个先前报道[4]在位于1 kB的TSSS中（图1b）的CpG位点的甲基化水平下降。
已启动子甲基化水平的改变CpG岛[32]。
with respect to关于我们发现，虽然距离CpG岛（CGI）边界[33]（包括CpG基海岸[34]）没有显著影响甲基化水平，的CpG位点位于CGI的甲基化和变量（Wilcoxonrank和检验P <2.2×10-16）相比，外部网站的CGI程序（图1，图S3的其他文件1）。
甲基化通常是发现在1-2KB基因区域是有关的规模要跨越基因组区域相关[4,35]。
我们调查是否常染色体甲基化程度（共-甲基化）之间的相关性依赖于CpG的站点之间的距离。
我们观察到，在位于靠近探头的甲基化水平（2 KB）有高度相关性（图1c）内的细胞类型相关，这表明，个人之间的甲基化水平的变化。
我们观察到的甲基化级别为位于邻近的探测器(相距达2 kb) 高度相关的（图 1 c），指示该个人之间的甲基化水平的变化相关内单元格类型。
图1c还表明，对CpG的网站，均在一个CGI表现出更大的比对其中至少一个的CpG 位点以外的CGI，控制距离合作-甲基化的证据，这意味着DNA甲基化的CpG 岛的微分调节内部和外部的CGI程序[32]。
1 c 还显示两人都在CGI 内的中央人民政府网站对表明co-methylation 比对中央人民政府网站，至少一个是CGI 以外的更多证据的距离，暗示的DNA 甲基化Cpg 的内部和外部希捷[32] 差异调节控制。
DNA甲基化与转录，组蛋白修饰早已被牵连甲基化在基因表达的调控。
为了研究甲基化在基因表达变化的作用，我们比较了甲基化水平的估计基因表达的基础上RNAsequencing（图2a）。
在个人，我们发现了一个显着的负相关关系，甲基化和跨越11,657个基因的基因表达水平（图S4的其他文件1）（平均秩相关系数r =-0.454）。
我们分为四分位值从高至低基因表达的基因，并观察附近的甲基化水平的TSS下降（图1b），只出现在中高表达的基因（图2b）。
我们还问，是否在不同的个体的甲基化水平的变化与在基因表达水平的变化的相关性。
在基因水平上69个人之间的比较表明温和但显着过剩的负相关基因（排列P <0.0001）。
被认为是DNA甲基化与组蛋白修饰相互作用过程中基因表达的调节[36,37]。
我们在我们的样本中的甲基化水平比较与组蛋白修饰ChIP-seq测序的数据，从CEPH研究中心人类基因组单体型图的直线加速器相干光源（GM12878）的ENCODE编码项目。
我们发现DNA甲基化水平和活性基因（图1d，图S3和S5的其他文件1）的组蛋白标记的目标存在较强的负相关性。
例如，DNA甲基化是在H3K27ac峰，这是指示性的促进剂[38]，以前被转录水平呈正相关[39]和DNA甲基化水平呈负相关[31]。
同样，转录标记H3K4me3和H3K9ac了：DNA甲基化水平呈负相关。
我们也观察到较低的甲基化水平的转录因子结合位点预测的CENTIPEDE算法，采用细胞类型的具体数据包括DNase1测序读[40]，甲基化的情况下是非常重要的转录因子结合的期望相一致。
基因组关联的SNP基因型与DNA甲基化接下来，我们评估遗传变异是否有助于个体间变异DNA甲基化水平，我们首先测试是否有SNP位点与整体的DNA甲基化模式，测量通过主成分分析（见方法）。
最有趣的信号，获得的SNP rs10876043，其中有一个第一主成分的甲基化在基因组范围的重大变化与（P= 4.5×10-9），这也表明一个温和与平均的全基因组甲基化水平（P =4.0×10-5）（表S1中的其他文件1）。