种间转移扩增法筛选长爪沙鼠微卫星位点

爪 沙 鼠 的基 础 研 究 相 对 薄 弱 ， 其 是 遗 传 学 基 础 尤
研 究 开 展 的 甚 少 ， 使 对 长 爪 沙鼠 生 物 学 特 性 及 致
应 用 研 究 不 够深 入 。找 到更 多 的遗 传 标 记 物 是 开
展 长爪 沙 鼠 遗 传 研 究 的基 础 和 条 件 ， 微 卫 星 由 而
２ ２ 长 爪 沙 鼠 微 卫 星 位 点 的 类 型 分 析 ．
１ １１ 实 验 动 物 ： 洁 级 长 爪 沙 鼠 ２ ． ． 清 ２只 ， 别 不 性
限， 体质 量 ４ ８ ， ９～ ５ｇ 由首都 医科大 学实 验动 物部提
供 【 Ｃ Ｋ（ ）０ ０— ０ ２ ， 于提取 基 因组 Ｄ Ａ。 Ｓ Ｘ 京 ２０ ０ １ 】 用 Ｎ １ １２ 仪 器 ： 脂 糖 凝 胶 电 泳 仪 （ 京 六 一 仪 器 ．． 琼 北
Ｔ ｅｐ ｓ ｉ Ｃ ｒｄ ｃ ｅ ｅ ｕｎ ｅ ｎ ｏ ｆ ｍ ｄ ａ ｉ ｐｅ ｓｑ ｅ ｃ ｅ ｅ ｔ（ Ｓ ｈ ｏｉ ｖ Ｐ Ｒ ｐ ｏ ｕ ｔ ｗ ｒ ｓｑ ｅ ｃｄ ａ ｄ ｃ ｎ ｒ ｅ ｓｓ ｌ ｅ ｕ ｎ ｅ ｒｐ ａ Ｓ Ｒ） ｌ ｉ ｅ ｕｔ Ｏ ｅｅ ５ ６ ｔｅ ｓ ｅ ｉ ｍ ｏ ．Ｒ ｓ ｌ ｃ ｆｔ ｓ ３ ｈ ｍ ｕｅｍａ ｅｓ ３ ３（ ８ ３ ％ ）ｗ ｒ ｉ ｒｔ ｙａ ｐｉｅ ｒ ｅｌｂ ｒ ｏ ｅｂｌ ｆ ｈ ｓ ３ ３ｓｑ ｅ ｃ ｄｍ ｒｅｓ ３ ｏ ｓ ｒ ｒ ， １ ５ ． ９ ｋ ｅｅｄ ｃ ｅ ｍ ｌ ｄｆ ｍ ｔ ｏａ ｒ ｇ ｒｉ ．Ｏ ｅｅ １ ｅ ｕ ｎ ｅ ａｋ ｒ，１０ ｓｅｌ ｉ ｆ ｏ ｈ ａ ｔｙ ｓ ｔ
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【 关键词 】 小 鼠； 长爪沙 鼠； 微卫 星 ； 种间转移扩增
【 中图分类号 】Ｑ ５—３ ９ ３
【 文献标识码 】Ａ
【 章编 号】ｌ０ －８７ ２ １ ） １ ０ １０ 文 Ｏ ５４ ４ （０ １ ０ — ０ －５ ０
Ｄｏ ：０ ３ ６ ／ ．ｓｎ １ ０ －８ ７ ２ １ ． １ ０ １ ｉ１ ． ９ ９ ｊｉｓ ． ０ ５ ４ ４ ． ０ １ ０ ． ０
Ｔ ａ — ｉ ｇ Ｉ Ｗｅ ，Ｄ ａ －ａ ＡＮ Ｙｕ ｎ ｑ ｎ ，Ｌ ｉ Ｕ Ｘｉｏ ｙ ｎ，Ｌ ｉ ｇ Ｕ Ｊｎ ，Ｗ Ｕ Ｙａ － ｕ ｎ ｈ ａ，ＷＡＮＧ Ｃｈ ｏ ａ ，Ｃ ＨＥＮ Ｚ ｅ — ｎ ｈ ｎ ｗｅ
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从 Ｇ ｎ ａｋ中 ｅＢｎ
随 机选 取 小 鼠微 卫 星 位 点 引 物 ５ ６对 ， 这 些 引 物 对 长 爪 沙 鼠基 因 组 Ｄ Ａ 扩 增 ， 阳 性 目 的 条 带 进 行 序 列 分 析 ， ３ 用 Ｎ 将 找 出符 合 微 卫 星 序列 特 征 的 短 串 联 重 复 序 列 。结 果 ５６对 小 鼠微 卫 星 引 物 在 长 爪 沙 鼠基 因组 中 扩 增 出 了 ３ ３个 ３ １ 阳性 条 带 ， 序 列 分 析 ， 定 １０个 长爪 沙 鼠 微 卫 星 位 点 ； 中 完 美 型 位 点 占 ８． ７ （０ ／ ３ ） 不 完 美 型 位 点 占 经 确 ３ 其 ０７ ％ １５ １０ ， １ ．３ （５ １０ ， 小 鼠 同 源 性 为 ２ ． ％ （３ ／ ３ ） 将 筛 选 出 的 微 卫 星 位 点 在 Ｇ ｎ ａｋ中 注 册 ， 册 号 从 ９２％ ２／３ ）与 ４３ １０ ５ ６ 。 ｅＢ ｎ 注 Ｇ ５２９ Ｕ ６ ６４到 Ｇ ５ ２ ２ 。结 论 Ｕ ６ ８３ 小 鼠和 沙 鼠 的微 卫 星 位 点 具 有 较 高 的 同源 性 ， 小 鼠 的 微 卫 星 位 点 引 物 直 接 扩 增 用 长 爪 沙 鼠基 因组 Ｄ Ａ 可 有 效 地 筛 选 出 长 爪 沙 鼠微 卫 星 位 点 。 Ｎ
ａ ａｙ ｉ ． Ｍ ｅｈｏｄ ５ ６ ｍｏ ｓ ｏ ｉｗｅ ｅ ｒｎｄ ｍｌ ｅ ｅ ｔ ｄ ｆｏ Ｇｅ Ｂａ ｎ ｍｐ ｉ ｅ ｎ Ｍ ｏ ｏｉｎ ｇ ｒ ｉｓｇ ｎ ｔｃＤＮＡ． ｎ ｌｓｓ ｔ ｓ ３ ｕ ｅｌ ｃ ｒ ａ ｏ ｙ ｓ ｌｃ ｅ ｒ ｍ ｎ ｎｋ ａ ｄ ａ ｌｆ ｄ ｉ ｎｇ ｌａ ｅ ｂｌ ｅ ｅｉ ｉ
厂 ）３ １ ；Ｋ ８高 速 冷 冻 离 心 机 （ ｉ ａ公 司 ， Ｓ ； Ｓｍ ｇ Ｕ Ａ） 超 净 工作 台 （ 海智 城 分 析 仪器 制 造 有 限公 司 ） Ｐ Ｒ 上 ；Ｃ 仪（Ｔ Ｐ Ｃ一２ ０ Ｐ ｈｅ ｈ ｒ ａ ｃｃ ， ｉ ｌ ｄ公 司 ， ０ ｅ ｉ Ｔ ｅｍ ｌ ｙｌ Ｂｏ ｌ ｒ ｅ —ａ
Ｋ ２ ０ １０ ５０ ） Ｚ ０ ９ ０ ２ ０２ 。
［ 者 简 介 ］ 元 卿 ，１ ８ 作 谭 （ ９ ３一）， ， 士 研 究 生 ， 究 方 向 ： 验动 物 分 子 遗 传 学 。 男 硕 研 实 ［ 讯 作 者 】 振 文 （ ９ ９一）男 ， 士 ， 授 ， 通 陈 １５ ， 博 教 主要 从 事 实 验 动 物 教 学 与科 研 工 作 。Ｅ ｉ： ｚｅ ＠ ｓｈ ．ｏ ｍａ ｃｗ ｎ ｏ ｕ ｃｍ ｌ
２
中 国 实 验动 物 学 报 ２ １ ０ １年 ２月 第 １ ９卷 第 １ 期 Ａ ｔ Ｌ ｂＡｎ ｃ Ｓｎ Ｆ ｂｕｒ，０ １ Ｖ １１． ｏ １ ｃａ ａ ｉ Ｓｉ ｉ，ｅｒａ ２ １ ， ｏ．９ Ｎ ． ａ ｔ ｙ
１ 材 料 和 方 法
１ １ 材 料 ．
性产 物进行 序 列分 析 后 ， 选 到 了 １ ０个 符 合 微 卫 筛 ３ 星条 件 （ ２ 的长爪 沙 鼠微卫 星位点 。将 这 些位 点 图 ） 在 Ｇ ｎ ａ ｋ上 注册 ， ｅＢ ｎ 相应 的注 册 号 见 表 １ 。从 这 些 位点 的类 型分 析 中发 现 ， １ ５个 微 卫 星位 点 属 于 有 ０ 完美 型位 点 ， ８ ． ７ ； 他 类 型位 点 为 ２ 占 ０７％ 其 ５个 ， 占 １ ． ３ 。在 １ ０个 长 爪 沙 鼠微 卫 星 位 点 中 ， ６ ９２％ ３ 有 ９ 个位 点 的等 位 基 因大 小 为 ２ ０～３ ０ ｂ ， ５ ． ％ ０ ０ ｐ 占 ３ １ （ ２。 表 ）
【 ｙｗｏｄ 】 Ｍｏｓ ； ｎｏ ａ ｅｂｌ Ｍｉ ｏａ ｌｔ；ｒｓ・ ｌ ｃｔ ｎ Ｋｅ ｒ ｓ ｕ ｅ Ｍｏｇｌ ｎｇｒｉ； ｃ ｓｔ ｌｅＣ ｏｓａ ｉ ａｏ ｉ ｒ ｅｉ ｍｐ ｆ ｉ ｉ
长 爪 沙 鼠 被 誉 为 “ 能 性 ” 验 动 物 ， 生 命 多 实 在 科 学 诸 多 领 域 已得 到 广 泛 应 用 ¨ 。 但 由 于 对 长
种 极 好 的分 子 标 记 体 系 ， 用 其 对 个 体 基 因 组 应
［ 金 项 目 】 家 自 然 科 学 基 金 项 目 （ ｏ ３５ ０ ６ ； 家 科 技 支 撑 计 划 课 题 （ ｏ ２ ０ Ｂ Ｉ３ ０ ； 京 市 教 委 重 点 项 目 （ ｏ 基 国 Ｎ ． ０ ７ ２ １） 国 Ｎ ． ０ ９ Ａ ８ Ｂ ２） 北 Ｎ
于在 基 因 组 中分 布 广 泛 、 息 含 量 大 、 果 稳 定 可 信 结 靠 、 于 鉴定 及 简 单 的 遗 传 方 式 等 特 点 ， 其 成 为 易 使
一
引 物筛 选 长 爪 沙 鼠微 卫 星 位 点 ， 建 立 长 爪 沙 鼠 为 微 卫 星位 点 遗传 数 据 库 积 累数 据 。
写 石
种 间转 移 扩增 法筛 选 长 爪 沙 鼠微 卫 星 位 点
谭 元卿 ， 李薇 ， 杜小燕 ， 路静 ， 吴艳花 ， 王超 ， 陈振文
（ 都 医科 大 学 基 础 医 学 院 实 验 动 物 学 系 ， 京 １０ ６ ） 首 北 ００ ９
【 摘要 】 目的
筛选 长爪 沙 鼠新 的微卫星位点 ， 为长爪沙 鼠遗传分析提供遗传标记物 。方 法
分 析后 ， 以得 到 丰 富 的 多 态 性 信 息 和 数 据 ， 可 目前
已广泛 地 应 用 于 各 种 生 物 的基 因定 位 、 锁 分 析 ， 连 群 体遗 传 结 构 分 析 和 标 记 辅 助 选 择 等 方 面 的 研
究 。但 长 爪 沙 鼠 的 微 卫 星 位 点 报 道 较 少 ， 有 仅 Ｎ ｕ ａ ｎ等 在 ２ ０ ｅｍ ｎ ０ １年 筛 选 的 ９个 微 卫 星位 点 。 根 据微 卫 星 引 物 在 不 同 种 动 物 间 有 保 守 性 原 理 ， 我们 采 用 了种 间转 移 扩 增 法 —— 用 小 鼠 的 微 卫 星
Ｓ ｒ ｅ ｉ ｆ ｎ ｖ ｌｍ ｉ ｒ ｓ ｔ ｌ ｔ ｃ ｅ ｎ ｎｇ ｏ ｏ ｅ ｃ ｏ ａ ｅ ｌ ｅ ＤＮＡ ａ ｋｅ ｓ ｉ ｏ ｏ ｉ ｎ ｉ ｍ ｒ ｒ ｎ Ｍ ｎｇ ｌａ ｇ ｒ ｌ ｙ ｃ ｏ ｓ ａ ｐｌ ｃ ｔｏ ｅ ｂｉｓ ｂ ｒ ｓ － ｍ ｉ ａ ｉ ｎ ｉ ｆ
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