1表达谱芯片
基因芯片的操作流程及步骤ppt课件
仅有上述5个能同靶DNA杂交。 • 可以用人工合成的已知序列的所有可能的n体寡核苷酸探
针与一个未知的荧光标记DNA/RNA序列杂交，通过对杂 交荧光信号检测，检出所有能与靶DNA杂交的寡核苷酸， 从而推出靶DNA中的所有8 nt亚序列，最后由计算机对大 量荧光信号的谱型（pattern）数据进行分析，重构靶 DNA 的互补寡核苷酸序列。
生物芯片的制作步骤
细胞
对mRNA进行标记 杂交
基因表达资料
“雪亮工程"是以区（县）、乡（镇） 、村（ 社区） 三级综 治中心 为指挥 平台、 以综治 信息化 为支撑 、以网 格化管 理为基 础、以 公共安 全视频 监控联 网应用 为重点 的“群 众性治 安防控 工程” 。
基因芯片研制的总体蓝图
检测样品 的制备
获取样品分子的 数量和序列信息
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基因芯片是信息时代的产物
横跨：生命科学、物理学、
计算机科学、微电子技术 光电技术、材料科学 等现代高 科技。
我国第一家批量生产基因 芯片 拥有近2千条基因药物发明专利
• 东南大学吴健雄实验室 • 中科院计算所生物信息学实验室 • 上海生科院
“雪亮工程"是以区（县）、乡（镇） 、村（ 社区） 三级综 治中心 为指挥 平台、 以综治 信息化 为支撑 、以网 格化管 理为基 础、以 公共安 全视频 监控联 网应用 为重点 的“群 众性治 安防控 工程” 。
基因芯片技术的原理和发展
基因芯片技术的原理和发展随着科技的不断发展，人们对于基因的研究也越来越深入，基因芯片技术作为一种迅速发展的生物技术，具有重要的理论意义和实践价值。
基因芯片技术是一种高通量和高标准化的分子生物学技术，可以用于基因表达、基因变异、蛋白质量、DNA甲基化等领域的研究。
1. 基因芯片技术的原理基因芯片技术是将DNA分子、RNA分子或蛋白质分子等多样化的生物大分子分子序列固定在一块小小的玻璃片或硅片上，然后利用微量的核酸或蛋白质的杂交反应来检测样品中这些生物大分子的存在或相对数量。
这些生物大分子的浓度水平可以用来衡量基因的表达情况、基因变异、蛋白质相互作用等生物学过程。
具体操作过程包括：1.1 表达谱芯片表达谱芯片是一种测量运用基因芯片技术研究基因表达的方法。
在表达谱芯片上可以固定多种类型的DNA序列，例如真核细胞DNA片段，互补DNA片段、探针、引物等。
对于鉴定被检测样品的物种，应选择特异而高丰度的探针或引物。
通过部分或大量存储的文献或数据库，研究人员首先确定所需的目标基因，然后通过设计合适的核酸杂交探针，将所需目标基因的序列在探针区域进行固定。
1.2 基因组芯片基因组芯片是一种利用基因芯片技术直接测量基因组中DNA 分子存在量的方法。
基因组芯片和其他一些技术类似，通常分三部分作用：建立样品库，设计并制备基因组芯片，通过基因芯片技术来测量DNA分子的存在量。
2. 基因芯片技术的发展基因芯片技术是一种非常年轻的生物技术，近年来其不断得到完善和发展，具有日益广泛的应用前景。
2.1 应用于生物医学基因芯片技术在生物医学领域得到广泛的应用，其中最具有代表性的应用是基因诊断和基因治疗。
通过基因芯片技术，可以对特定基因的表达情况和蛋白质质量进行分析和检测，为许多临床诊疗和治疗提供了关键方法。
2.2 应用于生态环境基因芯片技术也可以用于生态环境监测，特别是对于环境中的有害生物及其基因信息的监测。
基因芯片技术可以通过绿色监测来减轻生态环境对生物生态的影响。
chip实验
Chip实验存在的问题和挑战
• Chip实验技术仍面临成本高、实验操作复杂、数据分析难度大
等问题，需要进一步改进和优化
• 通过改进芯片设计和实验技术，可以降低实验成本和误差，提
高实验结果的可靠性
• 通过引入新的数据分析和生物信息学方法，可以提高数据分析
的准确性和效率，挖掘更多生物信息
对未来Chip实验的
信度和生物学意义
表达谱，常用的芯片类型有抗体芯片、
多肽芯片等
Chip实验的优缺点
Chip实验的缺点主要有成本高、实验操作复杂、数据分析难度大
• 芯片制作和实验操作需要较高的技术要求，成本较高
• 实验过程中容易产生误差，需要严格的实验质量控制
• 数据量庞大，需要专业的生物信息学知识和统计分析方法进行分析
特异性结合
Chip实验通常采用荧光标记或放射性
标记方法
• 探针是一段与目标分子互补的DNA
• 荧光标记法是通过荧光染料标记目标
或RNA序列
分子，然后通过荧光扫描仪检测信号
• 通过探针与目标分子的结合，实现对
• 放射性标记法是通过放射性同位素标
目标分子的检测
记目标分子，然后通过放射性探测器检
测信号
Chip实验的技术手段
• 网络图是一种用于展示基因或蛋白质之间相互关系的图像，可
以帮助理解生物过程中的相互作用
06
Chip实验技术的发展趋
势
Chip实验技术的创
新
• Chip实验技术的创新主要体现在芯片设计、实验技术、数据分
析方法等方面
• 芯片设计方面，可以通过优化探针排列、提高探针密度等方法，
提高芯片的检测灵敏度和特异性
1990年代末期，蛋白质组学芯片技术逐渐兴起
生物芯片技术
待测样品（用Cy3-dUTP 标记）
对照样品（Cy5-dUTP）
三、杂交与结果分析
（一）杂交反应：与传统的杂交方法类似
——是已标记的样品与芯片上的探针进行反应后产生一系 列信息的过程。
与传统的核酸分子杂交相同，但要求更高：
选择合适的反应条件、减少生物分子之间的错配率。 考虑杂交反应体系中盐浓度、探针GC含量和所带电荷、 探针与芯片之间连接臂的长度及种类、检测基因的二级结 构的影响。
第二节 蛋白质芯片
根据制作方法和应用的不同，蛋白质芯片分为两种: 1. 蛋白质功能芯片
细胞中的每一种蛋白质占据芯片上一个确定的 点，主要是高度平行地检测天然蛋白质活性 。 2. 蛋白质检测芯片 将能够识别复杂生物溶液（如细胞提取液）中 靶多肽的高度特异性配体进行点阵，这种芯片 能够高度并行的检测生物样品中的蛋白质 。
生物芯片技术（biochips）
生物芯片（biochips）
——指采用光导原位合成或微量点样等方法，将大量生物大
分子如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等生物样 品有序地固化于支持物的表面，组成密集二维分子排列， 然后与已标记的待测生物样品中的靶分子杂交，通过特定
的仪器对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分
第十章 生物芯片技术
3.芯片实验室(labs-on-chip) • 高度集成化的集样品制备、基因扩增、核酸标记
及检测为一体的便携式生物分析系统 • 实现生化分析全过程集成在一片芯片上完成，从
而使生物分析过程自动化、连续化和微缩化 • 芯片实验室是生物芯片技术发展的最终目标
பைடு நூலகம்
蛋白质芯片的应用举例：
利用蛋白质芯片进行肿瘤诊断的一般原理程序
• 根据芯片的用途不同： 表达型芯片、测序芯片和芯片实验室
生物芯片技术简介
生物芯片技术简介生物芯片技术通过微加工工艺在厘米见方的芯片上集成有成千上万个与生命相关的信息分子，它能够对生命科学与医学中的各种生物化学反应过程进行集成，从而实现对基因、配体、抗原等生物活性物质进行高效快捷的测试和分析。
它的显现将给生命科学、医学、化学、新药开发、生物武器战争、司法鉴定、食品与环境监督等众多领域带来庞大的革新甚至革命。
生物芯片技术研究的背景原定于2005年竣工的人类30亿碱基序列的测定工作（Human Genome Project，基因组打算）由于高效测序仪的引入和商业机构的介入差不多完成，。
如何样利用该打算所揭示的大量遗传信息去探明人类众多疾病的起因和发病机理，并为其诊断、治疗及易感性研究提供有力的工具，则是继人类基因组打算完成后生命科学领域内又一重大课题。
现在，以功能研究为核心的后基因组打算差不多悄然走来，为此，研究人员必需设计和利用更为高效的硬软件技术来对如此庞大的基因组及蛋白质组信息进行加工和研究。
建立新型、高效、快速的检测和分析技术就势在必行了。
这些高效的分析与测定技术已有多种，如DNA质谱分析法，荧光单分子分析法，杂交分析等。
其中以生物芯片技术为基础的许多新型分析技术进展最快也最具进展潜力。
早在1988年，Bains等人就将短的DNA片段固定到支持物上，以反向杂交的方式进行序列测定。
当今，随着生命科学与众多相关学科（如运算机科学、材料科学、微加工技术、有机合成技术等）的迅猛进展，为生物芯片的实现提供了实践上的可能性。
生物芯片的设想最早起始于80年代中期，90年代美国Affymetrix公司实现了DNA探针分子的高密度集成，立即特定序列的寡核苷酸片段以专门高的密度有序地固定在一块玻璃、硅等固体片基上，作为核酸信息的载体，通过与样品的杂交反应猎取其核酸序列信息。
生物芯片由于采纳了微电子学的并行处理和高密度集成的概念，因此具有高效、高信息量等突出优点。
基因芯片技术的前景基因芯片用途广泛，在生命科学研究及实践、医学科研及临床、药物设计、环境爱护、农业、军事等各个领域有着广泛的用武之地。
表达谱芯片array
表达谱芯片array英文回答：Spectrum chips arrays, also known as spectral chips arrays or spectral sensor arrays, are devices that are used to detect and analyze different wavelengths of light. These arrays consist of multiple individual chips, each capable of sensing a specific range of wavelengths. By combining multiple chips with different wavelength sensitivities, spectrum chip arrays can cover a wide range of the electromagnetic spectrum.The main purpose of spectrum chip arrays is to enable the identification and characterization of different materials based on their spectral signatures. Each material has a unique spectral signature, which is the pattern of light absorption and reflection at different wavelengths. By comparing the spectral signature of an unknown material to a database of known spectral signatures, it is possible to determine the composition or properties of the material.One common application of spectrum chip arrays is in environmental monitoring. For example, these arrays can be used to analyze the composition of water samples, allowing scientists to detect pollutants or contaminants. Another application is in agriculture, where spectrum chip arrays can be used to monitor the health and nutrient content of crops.In addition to their scientific and industrial applications, spectrum chip arrays also have potential consumer applications. For instance, these arrays can be used in smartphones to enable advanced camera features, such as accurate color reproduction and automatic white balance adjustment. They can also be used in wearable devices for fitness tracking, by analyzing the user's blood oxygen levels through the detection of specific wavelengths of light.Overall, spectrum chip arrays are versatile devicesthat have a wide range of applications. They enable the detection and analysis of different wavelengths of light,allowing for the identification and characterization of materials. Whether in scientific research, industrial processes, or consumer electronics, spectrum chip arraysplay a crucial role in understanding and utilizing the electromagnetic spectrum.中文回答：谱芯片阵列，也称为光谱芯片阵列或光谱传感器阵列，是用于检测和分析不同波长的光的设备。
《微电子与集成电路设计导论》第六章 新型微电子技术
纳电子器件——Memristor忆阻器 ➢ 全称记忆电阻（Memristor），是表示磁通与电荷关系的电路器件。
特点
➢ 电阻取决于多少电荷经过了器件。 ➢ 若电荷以一个方向流过，电阻会增加；
如果让电荷以反向流动，电阻就会减小。 ➢ 具有记忆能力，断电后电阻值保持不变。
纳电子器件——石墨烯
➢ 它是已知材料中最薄的一种，且牢固坚硬； ➢ 优良的导电特性：它在室温下传递电子的速度比已知导体都快。
优势
➢ 碳纳米管FET沟道为一维结构，载流子 迁移率大大提高。
➢ 碳纳米管FET参与碳纳米管导电的是表 面。
➢ 碳纳米管FET通过选择源漏材料，可完 全消除源漏结势垒
图6.4.2 CNT-FET典型结构示意图
纳电子器件——有机分子场效应晶体管
该技术利用了分子之间可自由组合的化学特性，晶体管电极之间的距离仅为1纳米到2 个纳米，是目前世界最小的晶体管。同时具有制造简单，造价低廉的优点。
2006年3月， 佐治亚理工学院 （Georgia Institute of Technology） 的研究 员宣布，成功地制造了石墨烯平面场效应 晶体管并观测到了量子干涉效应。并基于 此研究出根据石墨烯为基础的电路。
6.4.2 纳电子材料
纳米材料一诞生，即以其异乎寻常的特性引起了材料界的广泛关注。这 是因为纳米材料具有与传统材料明显不同的一些特征。
人类社会是在不断征服自然和不断攀登科技顶 峰而前进的，纳米技术也是如此。
现在世纪纳米技术和纳米材料，正向新材料、 微电子、计算机、医学、航天、航空、环境、 能源、生物技术和农业等诸多领域渗透。
纳米打假
纳米技术并非高不可攀，但也决非人人都能“纳”一把， 因此，我们要提前做好纳米技术的打假工作，建立一套十分 严格的评审和考核制度，为纳米技术的发展创造良好的空间， 防止样样都要“纳”一把现象的发生，尽量避免恶意炒作 “伪纳米”，不能等到造成极其严重的恶果后，再去打与堵。
【国家自然科学基金】_基因表达芯片_基金支持热词逐年推荐_【万方软件创新助手】_20140803
精子发生 癌前病变 电磁脉冲 电磁场 淫羊藿总黄酮 海马 拟南芥 微阵列 差异表达 小脑 基因芯片技术 基因网络 基因差异表达 发育 原位杂交 分化 内毒素类 免疫调节 免疫反应 克隆,分子 乳杆菌 严重急性呼吸综合征 丙酮醛 三氧化二砷 rt-pcr rna干扰 p53 hepg2细胞 cdna芯片 cdna微阵列 as2o3 龋齿 鼻咽肿瘤 黑色素瘤 黄连解毒汤 黄瓜 高通量基因芯片 高通量 高腊日粮 骨髓 骨肉瘤 骨桥蛋白 骨形态发生蛋白质类 饥饿 颅内动脉瘤 预后 靶标 靶基因 静脉血栓栓塞症 陆地棉 锌 铅 金雀异黄素 重组蛋白
神经干细胞 神经免疫调节网络 癌 电离辐射 甘蔗 炎症 毒性 早期反应基因 探针 差异表达 小鼠 宫颈癌 室间隔缺损 子宫内膜细胞 坏疽 右归丸 发育毒性 卵巢肿瘤 动脉血栓形成 动脉 动物模型 免疫组化 免疫 信号传导 五氯酚 乳腺肿瘤 乳腺癌 下丘脑外侧区 rt-pcr mirna ier5 60coγ 射线 黑色素瘤 黑穗病菌 麝香草酚 鸡胚绒毛尿囊膜模型 鳜鱼 鲢鱼 高脂饮食 高癌家系 骨髓间充质干细胞 骨髓细胞 香蕉 颈7神经根 颅脑创伤 非线性 非生物胁迫 静脉血栓栓塞症 陆地棉 阴虚内热 间充质干细胞 问充质干细胞 金属硫蛋白1e 重症肌无力
推荐指数 60 23 22 11 9 7 6 6 5 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 3 3 3 3 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2
2009年 序号 1 2 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52
第九章 生物芯片及数据分析技术
蛋白分子相互作用分析
常用数据库： • STRING 、pSTIING等
String9.05在线分析
pSTIING在线分析
单基因分析
常用数据库： • 美国国家生物技术信息中心（NCBI） • 欧洲生物信息研究所（EBI）
蛋白质芯片技术
蛋白质芯片（Prochip）
——与DNA芯片比较类似，只不过蛋白质芯片利用的 是抗原/抗体、配基/配体（或受体）等蛋白质之间的相互作 用。
人类基因组计划
人类基因组计划（human genome project, HGP）是 一项国际性科学研究计划，旨在阐明人类基因组30 亿个碱基对的序列，从物理和功能角度发现和定位 人类基因组基因，破译人类全遗传信息，使人类第 一次在分子水平上全面地认识自我。 对人类基因组的研究推动了整个生命 科学的发展，同时也形成一门崭新的 科学——基因组学（genomics），即 研究基因组的科学。
人类基因组计划主要研究内容
以具有遗传多态性的遗传 以一段已知核苷酸序 标记为位标、以遗传学距离为 列的DNA片段（称为序列 图距的基因组图。 核苷酸序列图即最详尽的物 标签位点，sequence tagged 理图。通过测序得到基因组 site，STS）为位标，对构 遗传学距离以厘摩 的序列，是一般意义上的人 成基因组的DNA分子进行 （centi-Morgan, cM）表示。 类基因组计划。 测定，从而对某段DNA 序 连锁的遗传标志之间的重组频 列在染色体上的相对位置 率为1% 时，它们的相对距离 做一线性排列。 为1cM， 相当于106 bp(1Mb)。 以kb或Mb作为图距而 绘制的基因组图。 遗传多态性标记为： RFLP、MS/STR、SNP。
生物芯片
芯片实验室（Lab-on-a-chip）：生物芯 片技术发展的最终目标。
表达谱芯片
表达谱芯片谱芯片是一种用于光谱分析的芯片技术，它可以在非常短的时间内分析样品的光谱特征。
下面是一个1000字的表达谱芯片的示例：谱芯片是近年来出现的一种创新技术，它可以用于光谱分析，具有高效和快速的特点。
这种芯片利用了微纳米技术，将传统的光谱仪压缩到了一个微小的芯片上。
谱芯片的工作原理非常简单，它通过集成光源、样品槽和光谱探测器等功能模块，将传统的光谱仪中的各个组件融合在一起。
当我们需要进行光谱分析时，只需要将样品放置在芯片上，然后通过一系列的控制信号，谱芯片即可对样品的光谱特征进行分析。
谱芯片的优势主要体现在两个方面。
首先，谱芯片具有高效的特点。
传统的光谱仪通常需要几分钟甚至几小时才能完成一次光谱分析，而谱芯片则可以在数秒钟内完成同样的分析任务。
这种高效的特点使得谱芯片可以广泛应用于各个领域，包括化学、生物学、药物研发等。
其次，谱芯片具有快速的特点。
传统的光谱仪需要进行复杂的操作和调试，而谱芯片则可以实现自动化和高度集成化，从而大大减少了使用者的操作难度和分析时间。
谱芯片的应用非常广泛。
在化学领域，谱芯片可以用于进行化学反应的监测和控制，从而提高了实验室的工作效率。
在生物学领域，谱芯片可以用于研究生物分子的结构和功能，从而帮助科研人员更好地理解生命的奥秘。
在药物研发领域，谱芯片可以用于药物的快速筛选和分析，从而加速新药的开发进程。
此外，谱芯片还可以应用于食品安全监测、环境污染监测等领域，为人们的生活和健康保驾护航。
尽管谱芯片具有诸多优势，但是目前仍面临一些挑战。
首先，谱芯片的制造工艺相对复杂，需要高度的集成和微纳米加工技术。
其次，谱芯片的成本相对较高，限制了它在大规模应用中的普及。
此外，部分样品可能需要进行前处理才能在谱芯片上进行分析，这对使用者提出了更高的要求。
总之，谱芯片作为一种创新的光谱分析技术，具有高效、快速以及广泛应用的特点。
随着科技的不断进步和成本的降低，相信谱芯片会在未来得到更加广泛的应用，为各个领域的科学研究和工程实践带来更多便利和发展机遇。
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康成生物全基因组表达谱芯片技术服务康成生物为您提供全基因组表达谱芯片技术服务，您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作，并提供完整的实验报告。
根据您的需要您可选择不同厂家提供的全基因组表达谱芯片，包括Phalanx，Agilent 和 NimbleGen。
Phalanx全基因组表达谱芯片华联生物科技开发的标准规格的高密度基因组芯片 (Phalanx Whole Genome Microarray)在开发过程中透过台湾工业技术研究院与英国Sanger Institute等国外权威研究机构合作，从设计到生产再到实验的各个步骤中均执行严格标准，采用创新技术，广泛吸收现有芯片的优点，使得其生产的高密度基因组芯片获得了优异的国际品质。
康成生物为您提供华联生物高密度基因组芯片及全程技术服务。
●Phalanx Slide TM 专利片基处理技术华联生物的高密度基因组芯片，探针设计采用台湾工业技术研究院特有探针设计软件平台（Integrated Massive Probes Optimal Recognition Tool，IMPORT）。
在芯片的制作过程中，华联生物应用表面化学专利技术（PhalanxSlide TM Technology）对片基表面进行处理，使得片基与寡核苷酸探针的亲和活力更高，背景噪音更低，点阵的均一性更强。
●高速的PhalanxArray探针布放技术华联生物在点样过程中，采用非接触式基因探针布放技术，并以方阵基因探针高速布放技术 (PhalanxArray Technology)之优势，大量生产。
PhalanxArray 同时使用196个排列整齐的PhalanxJets，在一张芯片上布放39，200个均一的探针。
PhalanxArray能够布放多达1，000，000张高密度芯片，布放效率和产量是目前市场上一般芯片布放系统的100倍。
●先进的PhalanxJet TM专利点样技术华联生物开发出独特的PhalanxJet TM系统，结合其先进的非接触式基因探针布放技术和专利的片基处理技术，保证了探针布放的高重复性。
尤其重要的是，PhalanxJet TM系统可以最大限度的避免探针布放中可能的探针交叉污染。
每个单独的PhalanxJet TM包含200个独立的点样针，分别对应不同的探针，在布放时彼此独立，不会相互干扰。
●严谨的检测探针和控制探针设计华联生物的的高密度基因组芯片，寡核苷酸探针均经过严格筛选，能特异性检测数据库中的基因，灵敏度高，特异性强。
人类基因组表达谱芯片，探针信息主要基于数据库UniGene V.175版，同时整合了各大重要数据库信息。
小鼠基因组表达谱芯片，探针信息基于数据库MEEBO (Mouse Exonic Evidence Based Oligonucleotide)。
华联生物的高密度基因组芯片，实验控制探针设计严谨，包括GAM，OGAM，CGAMs，IHCs，ITQC，ETQC等等，并且还采用了多家公司已经设计好的芯片检测探针，如SpotReport Oligo Array 验证系统，Stratagene 的Alien Oligo Array 验证系统，以及Ambion 公司的ArrayControl Sense Oligo Spots 系统等等，从而全面检测样品质量，杂交反应效果，标记反应效果等。
使得芯片质量与实验效果得到双重保障。
●生物芯片质量评估标准MAQC规范依据美国食品药物管理局（FDA）与国际上主要生物芯片企业协商制定的生物芯片质量评估标准MAQC计划规范，华联全基因组表达谱芯片各项指标，包括检出率，再现率，重复性和准确性，均达到或者超过国际先进水平。
●实验全过程反复优化，采用多种独特技术华联生物的高密度基因组芯片在杂交步骤中采用了独特的热收缩杂交袋，将芯片固定在杂交袋内，在杂交液一定的情况下，有效的提高杂交反应的均一性，从而提升杂交效率，增进杂交效果，使实验结果的准确性和可靠性大大提高。
在实验中，康成生物基于华联生物提供的实验条件进一步优化改进。
康成生物对RNA样品的质量要求更加严格，在采用Trizol的方法进行RNA抽提后，进一步用DNase消化DNA，并采用Qiagen纯化柱对RNA进行纯化，探针标记和杂交则严格按照华联生物的要求。
芯片检测采用先进的GenePix 4000B荧光检测系统以保证优质的实验结果。
Agilent全基因组表达谱芯片Agilent公司的原位喷墨专利技术（SurePrint）可以实现在1＂x 3＂的玻璃片基上灵活地、大规模地原位合成60mer的寡核苷酸探针，该技术可以很快很灵活地响应并实现最新的芯片探针设计方案，使研究者及时得到高质量的、最新的芯片，作为研究基因表达变化的利器。
每个芯片探针的设计除了经过软件考虑其Tm、二级结构、序列特异性等之外，还都要经反复实验筛选优化以得到灵敏度和精确度更高、重复性更好的结果。
2006年美国FDA发表的现主流芯片平台评估报告MAQC中，Agilent array 的结果与 Taqman array 结果的重复性最高。
在国际论文期刊上，也有很多利用Agilent array 平台发表的高质量文章，具体请参阅Agilent 网站。
目前提供的芯片有人、小鼠、大鼠的全基因组表达芯片，每个物种覆盖的基因超过41000个，探针设计综合参考了各种公共数据库，是经过实验验证的经典设计方案。
Agilent Design ID Array format Genes coverage Database sourceWhole human genome 14850 4 x 44K ~41,000 Goldenpath, Ensembl, Unigene, Human Genome (Build 33), Refseq, GebBankwhole mouse genome 14868 4 x 44K ~41,000 USC mRNA known genes, Natl. Institute on Aging, Genbank, Unigene, Refseq, Ensembl, RIKENwhole rat genome 14879 4 x 44K ~41,000 Ensembl, UCSC Goldenpath, Unigene, Refseq, GenbankAgilent 芯片技术示意图A. 客户提供实验组（Exp）、对照组（Control）样本或Total RNA；B. 使用Nanodrop测定RNA 在分光光度计260nm 、280nm和230nm的吸收值，以计算浓度并评估纯度；C. cDNA放大及荧光标记，实验组（Cy5），对照组（Cy3）；D. 进行芯片杂交及洗脱等步骤；E. 进行图像扫描及数据分析。
NimbleGen全基因组表达谱芯片NimbleGen公司运用光介导合成专利技术生产高密度DNA芯片，其探针为50-80mer的长寡核苷酸，在单张玻璃基片上包含385,000个探针，这些长寡核苷酸探针在高严谨杂交条件下可得到高灵敏度及高特异性的无以伦比的理想实验结果。
目前可以提供人、小鼠、大鼠全基因组表达芯片，探针全部根据最新基因组版本设计，每个物种有两种设计方案供您选择，覆盖所有已知或预测基因转录本，详细参数请看下表。
Organism Catalog Number Genes Source Features Probes/ TargetHomo sapiens A4542-00-01 47,633 NCBI HG18, Build 36 385,000 8Homo sapiens A4487001-00-01 24,000 NCBI HG18, Build 36 4 x 72,000 3Mus musculus A4543-00-01 42,586 NCBI MM8 385,000 9Mus musculus A4486001-00-01 18,869 NCBI MM8 4 x 72,000 3Rattus norvegicus A6184-00-01 26,739 Ensembl RGSC 3.4 385,000 14Rattus norvegicus A6185-00-01 26,208 Ensembl RGSC 3.4 4 x 72,000 3全基因组表达谱芯片技术服务康成生物为您提供全基因组表达谱芯片技术服务，您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作，并提供完整的实验报告。
主要实验流程如下：1、样品RNA 抽提a. 实验对象为组织样品，取适量（50-100mg）新鲜组织样品或正确保存的组织样品，使用BioPulverizer TM冰冻粉碎组织，加1ml的RNA抽提试剂Trizol（Invitrogen），使用Mini-Bead-Beater-16匀浆后抽提RNA。
b. 实验对象为细胞样品，每份样品取1×106～1×107细胞，加1ml的RNA抽提试剂Trizol（样品为贴壁细胞，每10cm2培养皿Trizol使用量为1ml），裂解后抽提RNA。
2. RNA 质量检测a．使用Nanodrop测定RNA 在分光光度计260nm 、280nm和230nm的吸收值，以计算浓度并评估纯度。
b．用甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳，检测RNA 纯度及完整性。
c. 提供RNA QC报告。
注意：用于芯片检测的RNA 样品，必须是高质量的，完整的，没有RNase污染（降解的样品不能用于标记和芯片检测），没有基因组污染。
3. aRNA样品合成和标记a．样品RNA进行逆转录反应合成cDNA。
b．cDNA第二链合成c. aRNA合成及纯化d. 荧光标记aRNA并纯化4. 标记效率质量检测使用Nanodrop检测荧光标记效率，标记效率合格以保证后续芯片实验结果的可靠性。
5. 片段化aRNA使用Ambion的RNA Fragmentation Reagents对标记好的aRNA进行片段化处理。
6. 芯片杂交在标准条件下将标记好的探针和高密度基因组芯片进行杂交。
7. 图像采集和数据分析使用GenePix 4000B 芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度，并将实验结果转换成数字型数据保存，使用配套软件对原始数据进行分析运算。
8. 提供实验报告包括详细的实验方法以及芯片实验数据和图表。