表达谱芯片在医学中的应用

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表达谱芯片对EB病毒诱导甲基化沉默基因的筛选

第４８卷第４期２０１２年８月
青岛大学医学院学报
ＡＣＴＡＡＣＡＤＥＭＩＡＥＭＥＤＩＣＩＮＡＥＱＩＮＧＤＡＯＵＮＩＶＥＲＳＩＴＡＴＩＳ
Ｖｏｌ．４８，Ｎｏ．４０１２Ａｕｕｓｔ２ｇ
：ＡＭＥＴＨＹＬＡＴＩＯＮＳＩＬＥＮＣＥＥＢＶＩＮＤＵＣＥＤＧＥＮＥＳＧＥＮＯＭＥＷＩＤＥＳＵＲＶＥＹＢＹＧＥＮＥＥＸＰＲＥＳＳＩＯＮＭＩＣＲＯＡＲＲＡＹ－，ＷＡＮＧＪｉｎＬＩＵＸｉａ，ＨＡＮＭｅｉａｎ，ＷＵＧｕｏｃａｉ，ＷＡＮＧＹｕｎ，ＬＵＯＢｉｎＤｅａｒｔｍｅｎｔｏｆＭｉｃｒｏｂｉｏｌｏＱｉｎｄａｏＵｎｉｖｅｒｓｉ－ｐｇｙｇｇ，ｙｇ（，Ｑ）ｔＭｅｄｉｃａｌＣｏｌｌｅｅｉｎｄａｏ２６６０２１，Ｃｈｉｎａｙｇｇ［］ＡＢＳＴＲＡＣＴｂｅｃｔｉｖｅＴｏｓｃｒｅｅｎＥＢＶｉｎｄｕｃｅｄｓｉｌｅｎｃｅｉｎＥＢＶａｓｓｏｃｉａｔｅｄｃａｒｃｉｎｏｍａａｎｄｆｉｎｄｔｈｅｍｅｃｈａｎｉｓｍｅｎｅｓａｓｔｒｉｃＯ－－ｇｇｊ，ＥｏｆＥＢＶｔｕｍｏｒｅｔｈｏｄｓＢｅｍｌｏｉｎＡｉｌｅｎｔＨｕｍａｎＷｈｏｌｅＧｅｎｏｍｅＥｘｒｅｓｓｉｏｎＰｒｏｆｉｌｉｎ４×４４Ｋ）ｃｈｉｓＢＶ－ｅｎｅｓｉｓ．Ｍｙｐｙｇｇｐｇ（ｐｇ，，ａｎｄ－ｎｅａｔｉｖｅｃａｒｃｉｎｏｍａｃｅｌｌｌｉｎｅｓｂｅｆｏｒｅａｎｄａｆｔｅｒｔｒｅａｔｍｅｎｔｏｆＡｚａｗｅｒｅｄｅｔｅｃｔｅｄ．ＴｈｅｒｅｓｕｌｔｓｗｅｒｅｖａｌｉｄａｔｅｄｂｏｓｉｔｉｖｅａｓｔｒｉｃｇｙｐｇｒｅａｌｔｉｍｅｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔＰＣＲａｎｄＢＧＳ．Ｒｅｓｕｌｔｓｈｅｒｅｗｅｒｅ６８ｃｏｍｍｏｎｉｎＥＢＶ－ｃｅｌｌｌｉｎｅｓｂｅｆｏｒｅｖｅｒｓｕｓｕａｎｔｉｔａｔｉｏｎｅｎｅｓｏｓｉｔｉｖｅ－Ｔｑｇｐ，ｗａｆｔｅｒＡｚａｔｒｅａｔｍｅｎｔｗｉｔｈＥＢＶ＋ｖｅｒｓｕｓＥＢＶ－ｃｅｌｌｌｉｎｅｓｈｉｃｈｗｅｒｅＥＢＶｒｅｌａｔｅｄｍｅｔｈｌａｔｉｏｎｓｉｌｅｎｃｅｓｅｃｉｆｉｃｏｆｃａｎｅｎｅｓａｓｔｒｉｃ－－ｙｐｇｇ，ｅｎｅｓｃｅｒ．Ａｔｔｈｅｆｏｌｄｃｈａｎｅｏｆ１．５ａｎｄ２．０，１９ａｎｄ３ｇｅｎｅｓｗｅｒｅｄｅｔｅｃｔｅｄｒｅｓｅｃｔｉｖｅｌ．ＴｈｅＰＣＲａｎｄＢＧＳｒｅｖｅａｌｅｄｔｈａｔｔｈｅｇｇｐｙ，ｏｓｉｔｉｖｅａｓｔｒｉｃｉｎＥＢＶ－ｃａｎｃｅｒｃｅｌｌｓｗｅｒｅｌｏｗｌｅｘｒｅｓｓｅｄａｎｄｈｉｈｌｍｅｔｈｌａｔｅｄ．ＣｏｎｃｌｕｓｉｏｎＴｈｅｓｅｌｅｃｔｉｏｎａｎｄｉｄｅｎｔｉｓｃｒｅｅｎｅｄ－ｐｇｙｐｇｙｙｆｉｃａｔｉｏｎｏｆｓｉｌｅｎｔａＶ－ｏｓｉｔｉｖｅｅｎｅｍｅｔｈｌａｔｉｏｎｉｓｏｆｉｍｏｒｔａｎｃｅｉｎｉｄｅｎｔｉｆｉｎｔｈｅａｔｈｏｅｎｅｓｉｓｏｆｔｕｍｏｒｓ．－ｇｐｇｙｐｙｇｐｇ［］；ｍ；，；ｅｎｅｓＫＥＹＷＯＲＤＳｅｒｅｓｖｉｒｕｓ４，ｈｕｍａｎｅｔｈｌａｔｉｏｎｔｕｍｏｒｓｕｒｅｓｓｏｒｏｌｉｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅａｒｒａｓｅｕｅｎｃｅａｎａｌｓｉｓｈｇｐｙｐｐｇｙｑｙ

基因表达谱芯片技术在帕金森病研究中的应用进展

体对黑质神经元损伤后的延迟反应［３］。ＭＰＴＰ处理后黑质和纹状体最重要的基因改变包括神经元突触、细胞骨架，粘附分子以及神经递质相关基因，以及与泛素蛋白酶体系统、细胞周期凋节因子和氧化应激反应相关的基因；在黑质中线粒体相关基因和胶质细胞炎症反应基因也发生改变。除ＭＰＴＰ模型外，６一羟基多巴胺（６－ＯＨＤＡ）对黑质多巴胺能神经元亦具有选择性
２不同病程的ＰＤ模型基因表达差异分析基因表达谱芯片技术最大的优势在于对不同的模型、疾病
万方数据
１４６
Ｃｈｉｎｅｓｅ
ＪｏｕｒｎａｌｏｆＲｅｈａｂｉｌｉｔａｔｉｏｎ．Ａｐｒｉｌ２０１０。Ｖ０１．２５
Ｎｏ．２
的不同阶段、不同脑区的基因表达差异进行系统性分析。神经变性模型、转基因模型和ＰＤ患者的基因表达谱芯片研究能够拓展研究者对该病的认识，能够有效比较疾病早期和晚期受累
究时必需注意到这些因素的干扰。
是纹状体多巴胺水平降低的代偿效应，该研究提示另外一种动
基金项目：’国家自然科学基金资助项目（３０３００１１４）收稿日期：２００９—０７—２２作者单位：１．襄樊市中心医院神经科，湖北襄樊４４１０２１；２．华中科技大学同济医学院附属协和医院神经科，武汉４３００２２作者简介：徐芳（１９７９一），女，硕士，主要从事帕金森病的相关研究。
毒性作用，可以导致纹状体几乎所有的多巴胺丢失［““，６－ＯＨ—
完美的动物模型能够复制人类ＰＤ的所有特征。现在已经进行
有几项ＰＤ尸检标本的基因表达谱芯片研究［１””Ｊ。与ＭＰＴＰ
小鼠模型相似，在尸检标本中也发现突触基因、线粒体相关基因、氧化应激和泛素蛋白酶体功能相关基因表达的改变。尤其是分子伴侣、蛋白降解系统等表达降低，导致多巴胺神经元内
ａｐｏｐｔｏｓｉｓ

cma基因芯片

cma基因芯片摘要：1.CMA基因芯片的概述2.CMA基因芯片的应用领域3.CMA基因芯片的技术优势4.我国在CMA基因芯片研究的发展现状5.CMA基因芯片的未来发展趋势正文：随着生物科技的发展，基因芯片技术逐渐崭露头角，其中CMA （Chromosome Microarray Analysis）基因芯片备受瞩目。

本文将介绍CMA基因芯片的概述、应用领域、技术优势，以及我国在该领域的研究现状和未来发展。

一、CMA基因芯片的概述CMA基因芯片，又称染色体微阵列分析，是一种高通量、高灵敏度的基因检测技术。

通过检测基因组DNA序列的拷贝数变异（CNV）和基因表达水平，CMA基因芯片在遗传病、肿瘤等疾病的诊断、研究及治疗中具有重要价值。

二、CMA基因芯片的应用领域1.遗传病诊断：CMA基因芯片可检测染色体非整倍体、微缺失、微重复等遗传病，提高诊断的准确性和效率。

2.肿瘤基因诊断：通过检测肿瘤相关基因的拷贝数变异和表达差异，有助于肿瘤的早期发现、分型和预后评估。

3.基因表达谱分析：研究生物体内基因的表达模式和调控关系，为功能基因组学研究提供有力支持。

4.农业育种：CMA基因芯片可用于品种选育、遗传资源评价和分子育种等领域。

三、CMA基因芯片的技术优势1.高度集成：一块CMA基因芯片可同时检测多种指标，实现多维度分析。

2.分辨率高：CMA基因芯片的分辨率可达单个碱基级别，提高检测的准确性。

3.样本需求低：CMA基因芯片采用荧光定量PCR技术，对样本需求较低，适用于各类生物样本。

4.数据分析便捷：CMA基因芯片的数据分析软件成熟，便于实验结果的解读和应用。

四、我国在CMA基因芯片研究的发展现状近年来，我国CMA基因芯片研究取得了世界领先的成果，不仅在技术研发上不断突破，还广泛应用于临床诊断、基础研究等领域。

我国已有多家企业研发出具有自主知识产权的CMA基因芯片产品，并逐步实现产业化。

五、CMA基因芯片的未来发展趋势1.芯片技术的优化：进一步提高芯片的分辨率、灵敏度和检测效率，降低成本。

基因芯片技术在心脏外科的应用

要是晚期心衰表达谱的鉴别，非表达谱病因学的鉴别。之，而总该实
验成为鉴别正常和异常心功能表达谱的公认的里程碑。３在心肌保护方面的应用国外有研究表明用基因芯片研究鼠经典心肌缺血预处理（ｃｅｃｐｅｏｄｔｎｎ，Ｃ的基因表达谱。ＩｈｍｉｒｃｎｉｏｉｇＩ）ｓｉＰ相对于无ＩＣ的心Ｐ
肌，经典ＩＣ后缺血再灌注心肌有３个基因发生了变化这些基因Ｐ１
玻璃片或其他载体上构成的，用作基因表达分析。核苷酸芯片是可寡将寡核苷酸探针按矩阵方式固定在玻璃片或其他载体上构成的，主要
用于ＤＮＡ测序、基因突变及多态性变化的分析。在这个过程中，基因芯片如同一面超高倍率放大镜，映射出被测患者基因结构与正常人基因结构上的细微差异，从而诊断出疾病。同时，它还具有操作简便，信息综合处理能力强，结果可靠和仪器配套齐全等优势，因而在医学领域备受青睐，如可利用该技术对疾病的异常表达基因进行检测，可用于遗传性疾病及肿瘤的诊断与治疗，及致病微生物的检测。基因芯片技术以其高通量、高效率、大规模的独特优势，也为心血管外科的各类疾病的研究提供了强有力的系统研究
本文着重阐述了基因芯片技术在先天性心脏病研究慢性心衰、肌保护及心脏移植排斥反应四方面的应用。心【关键词】基因芯片寡核苷酸芯片ｃＤＮＡ芯片

组织芯片技术原理及应用

组织芯片技术原理及应用一、组织芯片技术基本原理组织芯片技术又称为组织微阵列技术，是近年来基因芯片技术的发展和延伸，属于一种特殊芯片技术，具有体积小、信息含量高、可根据不同的需要进行组合和设计的特点，一次性实验即可获大量结果。

将数百个乃至数千个不同来源的组织粘贴到同一张固相载体如玻璃片或硅片上，形成组织微阵列。

组织芯片技术可以迅速测试临床标本组织，和其他技术联合应用能够迅速筛选新的基因分子并评估其生物学作用，进一步在大批量样本中证实这种作用，有助于建立与诊断、治疗和预后相关的各种参数，从而构成完整的基因检测体系。

这对人类基因组学的研究与发展，尤其对基因和蛋白质与疾病关系的研究、疾病相关基因的验证、新药开发与筛选、疾病的分子诊断、治疗过程的追踪和预后等方面具有实际意义和广阔的应用前景；在形态学教学工作中亦具有十分重要的实用价值。

二、组织芯片在医学领域中的应用（一）组织芯片在肿瘤研究的应用1.组织芯片在肿瘤诊断中的应用目前大多数肿瘤诊断是依靠形态学的改变来确定的。

但是，肿瘤可能还未发生形态学的改变或其改变不具有特征性，如何早期发现肿瘤并进行诊断，是医学研究的重点。

在寻找肿瘤诊断标志物时，可将肿瘤和正常组织放在同一芯片上进行比较。

2.组织芯片在肿瘤分类中的应用不同分类的肿瘤由于其组织学类型和肿瘤细胞功能状态及其特异性受体的不同，治疗方案、疗效及预后均不同。

这种以组织芯片技术和免疫组织化学表达谱为基础的分子生物学分类系统为肿瘤分类开辟一个新的途径。

3.组织芯片在肿瘤的浸润转移研究中的应用肿瘤浸润转移是一个多步骤、多基因调控的复杂过程，其具体分子机制不清。

肿瘤的浸润转移与肿瘤的治疗及预后密切相关。

应用组织芯片技术可研究特异性蛋白质在肿瘤浸润转移部位的不同表达水平，从而揭示肿瘤浸润转移与相关蛋白质标志物的关系。

4.组织芯片在肿瘤临床治疗研究中的指导作用应用组织芯片技术对肿瘤治疗中的各种蛋白质表达差异进行检测可提示治疗效果。

MicroRNA在肿瘤分子诊断中的应用

MicroRNA在肿瘤分⼦诊断中的应⽤MicroRNA 在肿瘤分⼦诊断中的应⽤欧志英　夏慧敏[摘　要]　MicroRNA （miRNA ）在⼤多真核⽣物中表达，通过抑制翻译或诱导靶mRNA 降解。

miRNA 是⼀种新的转录后基因表达调控模式，在复杂疾病形成过程中发挥着重要作⽤，调节了多种⽣物学过程，包括⽣长发育、信号转导、免疫调节、细胞凋亡、增殖及肿瘤发⽣等。

越来越多的证据表明异常表达的miRNA 是⼈类疾病的标志，包括肿瘤。

差异表达的miRNA 可能作为疾病早期诊断、分⼦分型及预后判断的指标，同时也可能成为多种肿瘤耐药新的治疗靶标。

因此，miRNA 在肿瘤中可能作为诊断、预测和治疗的⽣物标志。

[关键词]　肿瘤；MicroRNA （miRNA ）；分⼦诊断；治疗；预测；⽣物标志物Application of microRNA in cancer molecular diagnosisOU Zhiying ，XIA Huimin(Molecular Biology Lab, Guangzhou Women and Children's Medical Center, Guangdong, Guangzhou 510623, China) [ABSTRACT]　MicroRNA (miRNA) is a new mode of post-transcriptional regulation of gene expression. It is expressed in most of the eukaryotes, which can inhibit translation or induce target mRNA degradation. miRNA plays an important role in the formation of complex diseases and regulates a variety of biological processes, including growth and development, signal transduction, immune regulation, apoptosis, proliferation and tumor genesis and so on. More and more evidences show that the abnormal expression of miRNA is a sign of human diseases, including cancer. Differentially expressed miRNA may be used as the indicators of early diagnosis, molecular typing and prognosis. It may also be a variety of tumor-resistant new therapeutic targets. Therefore, miRNA may be used as cancer biomarkers for diagnosis, prediction and treatment.[KEY WORDS]　Tumor ；MicroRNA(miRNA)；Molecular diagnosis ；Therapy ；Prediction ；Biomarker基⾦项⽬：⼴东省⾃然科学基⾦(20121054)；⼴州市重⼤民⽣科技专项(2010U1-E00741)作者单位：⼴州市妇⼥⼉童医疗中⼼分⼦⽣物学实验室，⼴东，⼴州 510623通讯作者：欧志英，E-mail: ouzhiying@/doc/5e6817334.htmlmiRNA 作为⼀类重要的参与基因表达调控的分⼦，代表了⼀种新的基因表达调控模式，它在细胞中调节约30%的蛋⽩编码基因，在致病过程中起着重要作⽤。

采用cDNA芯片对人胃腺癌凋亡相关基因表达谱的研究

ａｓｇａｓｔｉｒｃｃａｎｃｅｒ）ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｎｄｐｏｇｒｒｅｓｓｉｏｎ．Ｉｔｉｓｎｅｃｅｓｓａｒｙｔｏｓｃｒｅｅｎａｐｏｐｔｏｓｉｓｇｅｎｅｓｒｅｌａｔｅｄｔｏｇａｓｔｉｒｃｃａｎｃｅｒ、Ａｉｍｓ：
Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ：ＧＡＯＨｅｎｇｊｕｎ，ＮａｔｉｏｎａｌＥｎｇｉｎｅｅｉｒｎｇＣｅｎｔｅｒｆｏｒＢｉｏｃｈｉｐａｔＳｈａｎｇｈａｉ，Ｅｍａｉｌ：
维普资讯
・
４５６・
ＣｈｉｎＪＧａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ，２０ｏ７．Ｖｏ１．１２．Ｎｏ．８
采用ｃＤＮＡ芯片对人胃腺癌凋亡相关基因表达谱的研究
汤晓怀王亚东钱南萍侯俊民朱家沂胡莺ｚ胡远皆２郜恒骏ｚ
Ｔｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐｏｆｒｉｌｅｓｏｆａｐｏｐｔｏｓｉｓｒｅｌａｔｅｄｔｏｇａｓｔｉｃｒｃａｎｃｅｒ．Ｍｅ￣ｏｄｓ：ｃＤＮＡｍｉｃｏａｒｒａｙｒｅｌｅｖａｎｔｔｏｈｕｍａｎａｐｏｐｔｏｓｉｓｗａｓｕｓｅｄｔｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅａｎｄｃｏｍｐａｒｅｔｈｅｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐｏｆｒｉｌｅｓｏｆｇａｓｔｉｒｃａｄｅｎｏｃａｒｃｉｎｏｍａａｎｄｔｈｅｐａｒａｃａｎｃｅｏｕｒｓｔｉｓｓｕｅ．ＩＧＦＢＰ４ｇｅｎｅｗａｓｓｅｌｅｃｔｅｄｔｏｖａｌｉｄａｔｅｔｈｅｔｅｓｔｉｎｇｏｆｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｂｙｃｏｍｐａｉｎｒｇｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｏｆ

基因表达谱芯片技术进展及其在中药网络药理学研究中的应用

需信息量大，传统的分子生物学技术已难以达到研究需要。全转录组表达谱芯片通过对基因表达进行高通量检测和分
析，为中药复杂体系的作用机制研究提供重要术支持。文章介绍了基因芯片技术在网络药理学的最新应用进展，以白
脉散有效成分组研究为例，介绍了表达谱芯片技术的基本应用方法，分析了表达谱芯片技术在中药网络药理学研究中应
基因表达谱芯片技术进展及其在中药网络药理学研究中的应用
刘庆山，陈小玉，庄述娟
（中央民族大学中国少数民族传统医学研究院，北京１０００８１）
摘要：近年来网络药理学为阐明中药复杂化学体系与复杂生物系统的相互作用提供了新的思路，然而由于相关研究所
ｔｗｅｅｎｃｏｍｐｌｅｘｃｈｅｍｉｃａｌｃｏｎｓｔｉｔｕｅｎｔｓｏｆｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌＣｈｉｎｅｓｅｍｅｄｉｃｉｎｅ（ＴＣＭ）ａｎｄｓｙｎｄｒｏｍｅｓｏｆｔｈｅｃｏｍｐｌｅｘｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓｙｓｔｅｍ．Ｈｏｗ —
ｅｖｅｒ，ｎｏｒｍａｌｍｏｌｅｃｕｌａｒｂｉｏｌｏｇｙｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓａｒｅｄｉｆｆｉｃｕｌｔｔｏｍｅｅｔｔｈｅｎｅｅｄｏｆｌａｒｇｅｉｎｆｏｍａｒｔｉｏｎａｂｏｕｔｔｈｅｃｏｒｒｅｌａｔｉｖｅｒｅｓｅａｒｃｈ．Ｔｈｅｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐｒｏｉｆｌｅｂｅｃｏｍｅｓａｎｉｍｐｏｒｔａｎｔｔｅｃｈｎｉｃａｌａｓｓｉｓｔａｎｃｅｆｏｒｍｅｃｈａｎｉｓｔｉｃｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｉｏｎｂｙｔｈｅｈｉｇｈｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔｓｃｒｅｅｎｉｎｇａｎｄａｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ．Ｔｈｉｓｔｅｘｔｌｉｇｈｔｓｏｎｔｈｅａｄｖａｎｃｅｄａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐｒｏｉｆｌｅｓａｎｄｉｎｔｒｏｄｕｃｅｓｔｈｅｐｒｏｃｅ —

基因表达谱芯片技术在帕金森病研究中的应用进展

基金项目：国家自然科学基金资助项目（３０１）３０１４０收稿日：０— —２期２９７２００
物模型的基因表达数据。多巴胺神经元培养物模型具有更好的一致性，更有利于使用基因表达谱芯片技术观察基因表达变化。有人用ＭＰＰ＋和６ＯＨＡ处理两种多巴胺能细胞株－Ｄ（Ｍ９ＮＤ和Ｓ７１产生中等程度的细胞死亡。在ＭＰ＋和Ｎ４４），Ｐ６０ＨＡ处理的ＭＮ９－ＤＤ细胞中都观察到未折叠蛋白反应相关基因，如转录因子ＣＯＰＧＤ１３达升高。同时蛋白定量Ｈ／ＡＤ５表分析发现ＭＰ＋和６ＯＨＡ处理后与未折叠蛋白反应相关的Ｐ－Ｄ蛋白，ＰＲＫ和ｅＦ磷酸化程度增高［。对Ｓ４４如ＥＩ２６１Ｎ７１细胞的基因表达谱芯片分析发现，Ｅ氧应激相关基因（线粒体电如子传递链亚单位）囊泡转运蛋白（、如突触融合蛋白８以及路易）体成分、血红蛋白氧Ｎ－Ｅ１表达升高ｓ。尽管对细胞培养模］型进行基因表达谱芯片研究能获得较高的信噪比，有助于发现基因表达改变，但是培养细胞并非真正的有丝分裂后神经元，细胞培养环境也不能真正模拟八脑的微环境，八脑微环境能而够影响多胺神经元损伤后黑质纹状体系统基因表达的改变。１２遗传性ＰＤ模型的基因表达谱芯片研究最常使用的遗传性ＰＤ模型是一突触核蛋白（— ）Ｓ转基因模型。果蝇中在高表达ＳＮ基因后对全基因组表达水平进行观察，Ｙ并检测从临床前期到疾病晚期所有时间点的基因表达改变］结果发现，５种有改变的基因中很多都出现在疾病早期，０提示与脂质、膜转运和能量稳态有关的基因在神经元变性之前就已经发生改变。当然也不能忽略果蝇ＳＮ转基因模型发病机制与人类 —ＹＰＤ发病机制之间存在差异，随着小鼠等其它ＳＮ转基因模Ｙ型研究的进展，以和果蝇模型进行比较，可并得出更接近于人类ｍ发病机制的结果。１３原发性ＰＤ患者基因表达谱芯片研究神经毒素ｍ模型和转基因模型可较好模拟人类ＰＤ的主要发病机制，所有的研究均发现ＰＤ模型中某些特殊基因表达改变，但还没有一个完美的动物模型能够复制人类ＰＤ的所有特征。现在已经进行有几项ＰＤ尸检标本的基因表达谱芯片研究［］１。与ＭＰｏ” ＴＰ小鼠模型相似－尸检标本中也发现突触基因、粒体相关基在线因、Ｅ氧ｆ应激和泛素蛋白酶体功能相关基因表达的改变。尤其是分子伴侣、蛋白降解系统等表达降低，导致多巴胺神经元内蛋白异常折叠、聚集，可能是多巴胺神经元变性死亡的重要这机制。另外氧应激、Ｅ炎症反应、以及细胞周期蛋白表达升高，导致细胞周期异常启动都参与ＰＤ发病过程。某些基因表达改变还可以作为神经元变性的早期标志，但是在人群中，因表基达的改变除与ＰＤ病程有关外，还可能与遗传背景、性别、龄、年种族和地理环境有关，因此对ＰＤ患者进行基因表达谱芯片研究时必需注意到这些因素的干扰。

基因芯片研究灸命门穴延缓衰老的分子机制

基因芯片研究灸命门穴延缓衰老的分子机制一、内容综述随着科学技术的不断发展，基因芯片技术逐渐走进了人们的视野。

基因芯片研究灸命门穴延缓衰老的分子机制，正是这一技术在中医领域的独特应用。

灸命门穴作为中医养生的重要方法，对于延缓衰老具有一定的疗效。

而基因芯片技术的发展，为揭示灸命门穴延缓衰老的分子机制提供了有力的技术支持。

灸命门穴是人体经络系统中的一个重要穴位，位于腰部具有温肾壮阳、益精填髓、强身健体等作用。

通过灸治命门穴，可以调节人体的内分泌系统，促进新陈代谢，提高机体的抗病能力，从而达到延缓衰老的目的。

然而灸命门穴延缓衰老的具体分子机制尚不明确，这就需要通过基因芯片技术来揭示其中的秘密。

基因芯片技术是一种高通量、高分辨率的生物信息分析技术，可以通过对大量基因进行同时检测和测序，快速准确地揭示基因的功能和相互作用。

通过对灸命门穴相关的基因进行基因芯片测序，科学家们可以发现哪些基因与灸命门穴延缓衰老的作用密切相关，从而为进一步研究提供方向。

目前关于灸命门穴延缓衰老的基因芯片研究已经取得了一定的成果。

研究人员发现，灸命门穴能够影响多种基因的表达，包括与细胞凋亡、细胞增殖、免疫应答等有关的基因。

这些研究成果不仅为我们提供了关于灸命门穴延缓衰老的新认识，也为今后的研究提供了方向。

基因芯片技术的发展为揭示灸命门穴延缓衰老的分子机制提供了有力的技术支持。

随着研究的深入，我们有理由相信，灸命门穴这一传统中医养生方法将在未来发挥更大的作用，为人类的健康事业做出更大的贡献。

1. 研究背景和意义随着人类对健康和长寿的追求，研究延缓衰老的方法变得越来越重要。

基因芯片技术作为一种高通量、高分辨率的技术手段，为揭示生命科学领域的奥秘提供了有力支持。

灸命门穴作为中医养生的重要方法，被认为具有调节人体机能、延缓衰老的作用。

因此研究灸命门穴延缓衰老的分子机制，对于发掘中医药在抗衰老领域的优势，提高人们的生活质量具有重要意义。

基因芯片技术的出现，使得科学家们可以快速、准确地分析大量基因信息，从而揭示基因与生物体之间的相互作用。

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Chromosomal copy number_cyto2.7M
Population genetics_SNP6.0 Linkage Disequilibrium _SNP6.0 Resequencing_300k
…and Visualization
RNA--Expression Analysis
Single stranded, labeled ‘target’ Oligonucleotide ‘probe’
*
*
* *
5 µm
*
Millions of copies of a specific oligonucleotide probe
1.28cm
>6500,000 different complementary probes
Affymetrix Confidential
18
Affymetrix荧光标记系统——信号级联放大原理
Target Washing and Staining • Antibody-based signal amplification • Streptavidin Phycoerythrin (SAPE) is the signaling molecule • Amplified with biotinylated anti-streptavidin antibody
4

Future utilization of genomic knowledge may allow:

Affymetrix Confidential
Moving GeneChip® to the Clinic Affymetrix致力于将技术应用于临床
Research
准确稳定 Discovery Validation and Pre-clinical & Optimization Clinical Trials
1. Molecular basis of biology/disease
1. Mechanism of Action
1. Clinical efficacy
2. Mechanism of Toxicity 2. Clinical safety
2. Discover and classify disease subtypes
1.28cm
Image of Hybridized GeneChip Array
Affymetrix Confidential 15
Harnessing the Power of Photolithography
Feature
Lamp
Mask
Chip
Affymetrix Confidential
16

Associate genomic sequences with function
Understand impact of polymorphisms
Fully integrative ‘Systems’ models for understanding disease Comprehensive evaluation of drug efficacy and safety Patient stratification and clinical management
DNA methylation_promoter tiling Alternative splicing_exon
Affymetrix Confidential 11
基因芯片化学原理
Affymetrix提供的是密度最高的芯片技术
GeneChip® Array Hybridized Probe Cell
Mismatch
Affymetrix Confidential 25
Affymetrix Confidential
26
Affymetrix Confidential
27
Affymetrix Confidential
28
Expression Catalog Products

Big Three
光蚀刻原位合成生产工艺是高质量芯片的基础
*
* *
* *
*
*
*
*
*
*
* *
* *
Quantitative
Yes
Reproducible
Affymetrix Confidential 17
Yes
Probe design
独具创新的PM-MM探针设计
Oligo 探针
Perfect Match
PM
MM
Mismatch
Annotation Strategy Exon arrays Splice variants
Tiling strategy Unbiased look at the genome
பைடு நூலகம்
Tiling and Exon arrays are possible by high information
Affymetrix Confidential 23
Affymetrix Confidential
RNA Analysis
10
One Platform – many applications
DNA--Genotyping Family based linkage studies_10k One Genechip System Whole-genome disease association_SNP6.0 Central Annotation Pharmacogenetics_DMET
Affymetrix Confidential
19
1. 与PE耦联的SA和 cRNA上的生物素结合。 2. 生物素标记的抗体和SA结合。 3. 与PE耦联的SA再与抗体上的生物素结合。
表达谱芯片实验流程
表达谱实验流程
Cells
AAAA AAAA AAAA
IVT
Biotin-rNTP cDNA
29
S. aureus Soybean Sugar cane Tomato Vitis vinifera Wheat Xenopus laevis Yeast Zebrafish 30个物种的全基因组

Reagents

Available for all of the major steps of the assay Controls
Affymetrix Confidential
9
Introduction: What GeneChip Can Do? Affymetrix芯片技术囊括基因组转录组水平的研究热点
G G A G G C
A C G T
A C G T
DNA Analysis
DNA
GG A
GG C
RNA
Eukaryotic Cell
表达谱基因芯片重要品质
区分低拷贝
特异性
区分高同源
灵敏度
准确的结果假阳性
好的重复性
Affymetrix Confidential
24
GeneChip Expression Array Design
Gene Sequence
5´
3´
Multiple oligo probes
Perfect Match
3. Predict disease outcome 4. Identify therapeutic targets
3. Efficacy in pre-clinical 3. Therapy modification
4. Determine dosage
4. Patient stratification
3
The Genomics Time Line
医学研究进入组学时代，基因芯片技术提供全基因组的视角
PreGenomics
Pre- ~1980s
Current Era (Transition)
Future
PostGenomics
Now, next ~15 years

Full impact of genomic knowledge yet to be realized Current era is one of knowledge- and tool- building
Clinic
方便完善 Clinical Applications
Multiple Chip Formats
Affymetrix Confidential 5
High Throughput Automation
Affymetrix 基因芯片技术在临床研究中的应用情况
目前已发表21000篇文献 Understanding Biology/Disease Understanding Therapy Understanding Patient Response

Custom
Affymetrix Confidential
SLE病人滑膜组织特异性表达谱biomarker的筛选

实验样本 swollen knees of untreated SLE patients (n = 6), RA patients (n = 7), and 骨关节炎 (OA) patients (n = 6). 芯片分析结果 In SLE synovial biopsy tissue, 40 of the 54,675 transcripts present on the slides were found to be specifically up-regulated and 34were down-regulated as compared with the other groups;（严谨筛选）对上述芯片筛选出来的部分基因进行RT-PCR&Immunostaining验证重要结论 Arthritis in SLE has a very distinct molecular signature as compared with that in OA and RA, characterized by up-regulation of IFI genes and downregulation of genes involved in ECM homeostasis.