斑马鱼胚胎发育时期
斑马鱼胚胎发育阶段相关基因的挖掘与分析
斑马鱼胚胎发育阶段相关基因的挖掘与分析近年来，斑马鱼成为一种常用的实验室模式生物，其胚胎发育过程十分规律和可控，是研究发育生物学和基因调控机制的重要模型。
随着基因挖掘技术的不断发展，越来越多的基因与斑马鱼胚胎发育阶段相关性得到了发现。
因此，分析斑马鱼胚胎发育阶段相关基因的功能和调控机制对于揭示生命活动的本质有着至关重要的意义。
一、斑马鱼胚胎发育阶段及其分子机制斑马鱼是一种小型热带鱼类，其胚胎发育阶段可分为十几个时期，分别对应着不同的形态和生理特征。
这些不同的发育阶段均是由基因表达的时空调控所驱动的，特定的基因激活和抑制导致了不同的胚胎形态和器官功能的发生。
在斑马鱼的早期发育过程中，主要涉及到卵母细胞的受精和初胚形成。
此阶段的发育主要由母源性基因调控，如 nop5、dead end、Vasa等。
随着器官的逐渐形成，受精卵将发展成为由脑、眼、肌肉等不同组织构成的多细胞胚胎。
这个过程中涉及到神经、视觉、肌肉等多种发育生物学特征，同时也是多个信号通路的交错调节，如 BMP、Wnt、Notch、Hedgehog等。
在胚胎发育的晚期，涉及到器官的成熟和功能细化等生理特征。
这个过程也是多种生化信号和调节因子交错作用下的结果，其主要涉及到细胞增殖、周期、分化等方面的调控，如 Cyclin D1、Nodal、Sox9等。
以上所述只是基础的胚胎发育阶段及其分子机制，实际上与胚胎发育相关的基因非常多且复杂。
因此，对斑马鱼胚胎发育相关基因的挖掘与分析显得尤为重要。
二、斑马鱼胚胎发育相关基因的挖掘通常，对基因的挖掘可以通过多种方式进行。
例如，可以通过对小分子化学物质的筛选和识别来验证潜在的胚胎发育相关基因，或者采用基于全反式PCR和转录组测序技术的方法进行基因调控因子的预测和鉴定。
另外，通过胚胎发育过程中的突变模式和形态，可获得一些具有生物学意义的候选基因，对其功能的研究也是非常重要的。
目前，已经有大量的胚胎发育相关基因在斑马鱼中被发现并得到了鉴定。
斑马鱼的发育历程
囊胚期胚胎正面观。A：256-细胞期（2.5h）；B：高囊胚期（3.3h）；C：高 囊胚期和椭形期之间的转变（3.5h）；D：椭形期和球形期之间的转变（3.8h） ；E：穹顶期（4.3h）；F：30%-外包期（4.7h）。比例尺=250μm
精品课件
原肠期 (5.25-10h)
外 包 运 动 的 继 续 ， 以 及 形 态 发 生 细 胞 的 内 卷 （ involution ） 、 集 合 （ convergence）和延伸（extension）运动的发生，产生了原始胚层和胚轴。
极 外包期腹侧观， 观胚盾期，箭头指 ：示
胚 盾 外；
E
6h
D
；原 ：动物极观 肠期发育。 胚： 环 期
外 ：胚盾 包期（ 期 （
） ）； ，胚盾标志背 ：胚环期（ 侧 ，）
C
F 70%8h
5.25h B
A 50%-
体节期（10-24h）
此期发生了一些有趣的形态学变化：体节发生、器官原基可见、尾芽 更为显著、胚体延长（图15）、AP和DV轴变得明确、第一次出现细胞 发生形态分化以及胚体开始运动。此期可称“尾芽期”，因为在此整 个时期，尾芽一直存在于不断伸长的胚轴末端。
此期用“实囊胚”（ “stereoblastula”）称之可能更准确，因为
这一术语意味着胚胎还没有形成囊胚腔（blastocoele），而事实正是 如此（图8），仅在胚盘深层细胞之间存在不规则的间隙。卵裂取向不 确定，比卵裂期亦更不规则。此后卵裂产生的子细胞从整齐的细胞面 伸出，不论从侧面还是从顶面观都是如此，因而确定此期分期用细胞 大小判断比用细胞位置判断更为有效。从动物极观，胚盘呈轻度椭球 形（尤在早期）。
侧 ； ：
外 包 期 （ ） ， 在 一 些 胚 胎 中 可 见 尾 芽 （ 箭 头 所
斑马鱼早期胚胎发育囊胚sphere时期的蛋白组学研究
本研究以高通量和高灵敏度的 ｉＴＲＡＱ蛋白 质组定性定量技术为基础，结合高效液相色谱串 联质谱法 （ＬＣＭＳ／ＭＳ），检测斑马鱼胚胎发育 ｓｐｈｅｒｅ时期蛋白质表达情况，探索新的蛋白质，并 进一步分析这些蛋白质的生物学功能，从而获得 不同蛋白在该时期的表达情况及其参与的生物 学过程，以期为进一步研究斑马鱼胚胎发育过程 及其调控机制提供基础数据和参考。
文章编号：１００４－２４９０（２０１９）０１－００５３－１２
斑马鱼早期胚胎发育囊胚 ｓｐｈｅｒｅ时期的蛋白组学研究
陈 漪１，２，３，胡瑞芹１洋生物科学国际联合研究中心（上海海洋大学，中国科学技术部），上海 ２０１３０６； ２．水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室（上海海洋大学），上海 ２０１３０６； ３．水产科学国家级实验教学示范中心（上海海洋大学），上海 ２０１３０６）
斑马 鱼 胚 胎 发 育 至 ４ｈｐｆ即 胚 胎 球 型 期 （ｓｐｈｅｒｅ），是介于囊胚（ｂｌａｓｔｕｌａ）和外包（ｅｐｉｂｏｌｙ）
研究斑马鱼的胚胎发育及其关键期发育
研究斑马鱼的胚胎发育及其关键期发育斑马鱼作为实验室中常用的模式生物之一，其相对简单的生殖和发育过程使得它成为了人们研究胚胎发育的重要对象之一。
斑马鱼的生殖过程非常规律，整个胚胎发育周期为24小时左右，孵化出的幼鱼期只有3天时间，因此研究斑马鱼胚胎发育的关键期是极为重要的。
1.斑马鱼的繁殖周期按照斑马鱼的繁殖周期，胚胎发育可分为四个阶段：受精卵期、原肠胚期、中胚层期和胚胎期。
在受精卵期，由于胚胎的细胞数量较少，细胞分化还未开始，因此对于实验研究比较有利。
而原肠胚期则是胚胎细胞分化的关键时期，不同类型的细胞开始出现，胚胎的体轴形成也在这一时期完成。
中胚层期则是各个器官的形成时期，器官原基逐渐形成并开始发育。
胚胎期则是细胞分化和器官形成的阶段，各种器官开始具备其特定的功能。
2.斑马鱼的胚胎发育与研究方法在研究斑马鱼的胚胎发育过程中，有两种经典的实验方法：一种是观察胚胎的形态，另一种则是分子遗传学方法。
观察胚胎形态的方法包括显微镜观察、形态学分析、各种染色法和微剖检查等。
分子遗传学方法则包括DNA微注射、利用Tol2系统进行基因转染、利用Morphant植入进行基因敲除和利用各种转录因子进行基因表达调控等。
这些方法能够全面深入地研究斑马鱼发育过程中的各个细节，为发育生物学研究提供了成熟的基础。
3.斑马鱼的胚胎发育关键期胚胎发育关键期即是指在这些时期，斑马鱼胚胎发育过程中出现了大量的关键分化事件，从而对胚胎发育产生了决定性的影响。
比如，在受精卵期，精卵和精子合并形成的原始受精卵很快分裂成数千个相同大小的细胞，进入囊胚阶段，随后囊胚开始对细胞进行分化。
在这个时期，实验研究可以利用形态和分子生物技术，来全面了解斑马鱼胚胎发育基本的细胞分化过程。
原肠胚期则是一个重要的发育关键期，这时各个器官开始发育，形成胃肠道和脊髓，并且产生了一些重要的基因表达调控。
中胚层期和胚胎期是一个比较综合和复杂的发育时期，不同器官之间紧密联系和相互影响，分化程度和细胞命运已经初步确定，此时的特定基因已经被表达并进入各个器官的形态调控中。
形式动物斑马鱼
模式动物斑马鱼斑马鱼（Danio rerio）属于辐鳍亚纲（Actinopterygii）鲤科（Cyprinidae）短担尼鱼属（Danio）的一种硬骨鱼，原产于南亚，是一种常见的热带观赏鱼，因其体侧具有斑马一样暗蓝与银色相间的纹条而得名。
斑马鱼个体小，易于饲养，成体长4-5cm，雄鱼体修长，雌鱼体肥大。
可在有限空间里养殖相当大的群体，可满足样本需求量大的研究。
斑马鱼发育迅速，在28.5℃培养条件下受精后约40min完成第一次有丝分裂，之后大约每隔15min分裂一次，24h后主要器官原基形成，相当于28d的人类胚胎，幼鱼孵出后约3个月达到性成熟。
雌雄鱼通过调控光周期控制14:10（光照:黑暗）产卵时间，成熟鱼每周可产卵一次，一尾雌鱼每次可产卵100-300枚。
胚胎体外受精，体外发育，胚体透明，易于观察。
受精卵直径约1mm，易于进行显微注射和细胞移植等操作。
一、斑马鱼的品系经过30多年的研究应用和系统发展，已有约20个斑马鱼品系，斑马鱼基因数据库-ZFIN（http://zfin/org）里有相关的资料可供查询和下载。
目前研究中常用的斑马鱼野生型品系主要为AB 品系、Tuebingen（Tu）品系、WIK 品系，斑马鱼基因组计划所用品系是Tu。
AB品系是实验室常用的斑马鱼品系，由单倍体细胞经早期加压法获得。
Tu品系斑马鱼具有胚胎致死突变基因，用于基因组测序前敲除该致死突变基因。
WIK品系较Tu品系具有更多的形态多样性。
此外，还保存有3000多个突变品系和100多个转基因品系。
这些品系资源对于利用斑马鱼开展各种科学研究起着很大的推动作用。
二、斑马鱼突变品系的筛选斑马鱼突变的方法主要有三种：已基亚硝脲（ENU）化学诱导、γ或χ射线照射和插入诱变。
ENU是一种DNA烃基化试剂，在生殖细胞减数分裂前诱导碱基对的替换，诱导产生的突变率为0.1%-0.2%，涉及单个基因的突变。
射线照射导致染色体大片段的缺失或染色体重排，产生突变率达1%。
斑马鱼胚胎发育时期
斑马鱼胚胎发育的分期CHARLES B. KIMMEL, WILLIAM W. BALLARD, SETH R. KIMMEL等原著俄勒冈大学神经生物学学院；达特茅斯学院生物系黄万旭译浙江大学生命科学学院摘要：我们对斑马鱼（zebranfish, Danio rerio）胚胎发育的分期作了一系列的阐述。
我们定义了胚胎发育的七段时期（period）——合子（zygote）、卵裂（cleava g e）、囊胚（blastula）、原肠（gastrula）、分节（segmentation）、咽囊（pharyngula），以及孵化期（hatching period）。
这一划分强调了发生于受精后头3天的主要发育过程中的变化情况，同时我们也回顾了发生于每一时期的诸如形态发生及其他主要事件。
时期的下一划分单位是分期（stage）。
各分期都有名称，而非标号，反映了分期序列的灵活性和持续演变过程，因为我们从这一物种中还能得到更多。
各分期的命名是基于用解剖立体显微镜（dissecting stereomicroscope）观察活体胚胎所容易观察到的形态学特征为依据的，同时也充分利用了活体胚胎的透明性，这一性质使我们可以用组合显微镜（compound microscope）和Nomarski干涉相差照明（Nomarski interference contrast illumination）观察到即使很深层的结构。
显微照相（photomicro- graphs）和组合显微描图（composite camera lucida line drawings）则以图片刻画了每一分期。
此外还有一些图像则显示了发育过程中一些可用作分期辅助标志的显著特征。
关键词：斑马鱼，形态发生，胚胎发生，合子，卵裂，囊胚，原肠，分节，咽囊，孵化目录概述 (1)全文组织结构 (1)步骤 (3)温度与标准发育时间 (8)合子期（0-0.75h） (9)卵裂期（0.75-2.25h） (9)囊胚期（2.25-5.25h） (12)原肠期(5.25-10h) (16)体节期（10-24h） (21)咽囊期（24-48h） (33)孵化期（48-72h） (42)早幼期 (48)谢辞 (48)斑马鱼胚胎发育的分期概述分期为发育研究提供了准确度。
斑马鱼的胚胎发育与影响因素
斑马鱼的胚胎发育与影响因素鲁东⼤学⽣命科学学院学院20 10 －20 11 学年第⼆学期学院______________ 专业_____________ 年级________ 班________ 学号_____________姓名______________密封线学⽣须将⽂字写在此线以下《发育⽣物学》课程论⽂课程号：2522080.关键词：斑马鱼；发育；葡萄糖；溶液浓度；温度；TCDD⼀、斑马鱼简介斑马鱼(zebra fish)，⼜名蓝条鱼、花条鱼、斑马担尼鱼。
斑马鱼是⼀种常见的热带鱼。
斑马鱼体型纤细，成体长3-4cm，对⽔质要求不⾼。
孵出后约3个⽉达到性成熟，成熟鱼每隔⼏天可产卵⼀次。
卵⼦体外受精，体外发育，胚胎发育同步且速度快，胚体透明。
发育温度要求在25-31℃之间。
斑马鱼由于个体⼩，养殖花费少，能⼤规模繁育，且具许多优点，吸引了众多研究者的注意。
经过30多年的研究应⽤和系统发展，已有约20个斑马鱼品系，斑马鱼基因数据库⾥有相关斑马鱼的资料可供查询和下载，⽅便了研究。
斑马鱼的细胞标记技术、组织移植技术、突变技术、单倍体育种技术、转基因技术、基因活性抑制技术等已经成熟，且有数以千计的斑马鱼胚胎突变体，是研究胚胎发育分⼦机制的优良资源，有的还可做为⼈类疾病模型。
斑马鱼已经成为最受重视的脊椎动物发育⽣物学模式之⼀，在其它学科上的利⽤也显⽰很⼤的潜⼒.⼆、斑马鱼的发育过程1〕卵⼦的发⽣斑马鱼卵⼦发⽣过程中乱母细胞的发育是不同步的。
在卵⼦发⽣早期，核内许多⼩核仁开始富集，其数⽬在接下来的时期中可以达到1500个，他们分布在和的外围和靠近内部核膜。
斑马鱼卵⼦发⽣过程⼀般分为5个时期，即StageⅠ-Ⅴ;有时也将StageⅡ和Ⅲ作为⼀个时期将卵⼦发⽣分为4个时期。
各个时期的基本特征是：StageⅠ是原始滤泡⽣长阶段，乱母细胞没有卵黄，是⼀个有细胞质包围着升值滤泡的圆形球体。
其染⾊体去浓缩并出现灯刷装状表型，此时DNA⾼度延伸，形成⼀个具有典型形态学上的包含RNA和蛋⽩质的恻环。
关于斑马鱼的发育历程课件
合子期 卵裂期 囊胚期 原肠期 早幼期 孵化期 咽囊期 体节期
合子期（0-0.75h）
新受精的卵子直至其第一次卵裂发生，称合子期（图3），约受精后 40分钟。受精时形成的合子直径约0.7mm。合子期只含有一个分期， 但其间也发生很多变化，可以很容易划分这一时期（见 Hisaoka and Battle,1958）。
=250μm
束 时 卵 黄 消 失 处 。 比 例 尺
头 示 尾 芽 ， 尾 芽 腹 侧 （ 即 此 图 左 侧 ） 的 显 著 区 域 显 示 外 包 结
9h 10h
J 90%K 90%L
C
F 70%75%-
8.4h
G
） 增 大 为 小 膨 出 （箭头所示）； ；： ： 尾 芽 期 （ 外包期腹
侧 ）观 ，， 箭前 头侧 示脊 小索 膨前 出板 ，（ 短对 箭比
层期 在（ 其 一 侧） ；背 ： 侧观
， 外包期（ 箭头示轴中 ），在一些胚胎中可见尾芽 胚层与中线边界，近轴中胚
5.7h
H I 80%-
8h
； 外： 包 期（ 外包 ）， 期（ 箭 头示腹 ）， 侧： 薄 的 排外 泄包 区ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ ；腹 ： 侧观
内卷运动的开始意味着原肠期的开始，目前可以说是发生于50%-外包时（图 11A）。结果在达到50%-外包后的数分钟内出现了一个增厚的外围区域，称作 胚环（germ ring），几乎与此同时完全包围了囊胚边缘（图11B，及C箭头所 指）。随后集合运动几乎同样快速地沿胚环产生一个局部的堆积，称胚盾（ embryonic shield , 图11D，及E箭头所指）。在发生这些事件期间，外包暂 时中止，但胚盾形成后外包又继续。胚层边缘沿卵黄细胞延伸直至将其完全 包绕（图11F-L）。其延伸近乎恒定速度进行，约每小时包绕卵黄细胞的15% ，这也提供了大部分原肠期分期的有用指标（图12）。
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斑马鱼胚胎发育的分期CHARLES B. KIMMEL, WILLIAM W. BALLARD, SETH R. KIMMEL等原著俄勒冈大学神经生物学学院；达特茅斯学院生物系黄万旭译浙江大学生命科学学院摘要：我们对斑马鱼（zebranfish, Danio rerio）胚胎发育的分期作了一系列的阐述。
我们定义了胚胎发育的七段时期（period）——合子（zygote）、卵裂（cleava g e）、囊胚（blastula）、原肠（gastrula）、分节（segmentation）、咽囊（pharyngula），以及孵化期（hatching period）。
这一划分强调了发生于受精后头3天的主要发育过程中的变化情况，同时我们也回顾了发生于每一时期的诸如形态发生及其他主要事件。
时期的下一划分单位是分期（stage）。
各分期都有名称，而非标号，反映了分期序列的灵活性和持续演变过程，因为我们从这一物种中还能得到更多。
各分期的命名是基于用解剖立体显微镜（dissecting stereomicroscope）观察活体胚胎所容易观察到的形态学特征为依据的，同时也充分利用了活体胚胎的透明性，这一性质使我们可以用组合显微镜（compound microscope）和Nomarski干涉相差照明（Nomarski interference contrast illumination）观察到即使很深层的结构。
显微照相（photomicro- graphs）和组合显微描图（composite camera lucida line drawings）则以图片刻画了每一分期。
此外还有一些图像则显示了发育过程中一些可用作分期辅助标志的显著特征。
关键词：斑马鱼，形态发生，胚胎发生，合子，卵裂，囊胚，原肠，分节，咽囊，孵化目录概述 (1)全文组织结构 (1)步骤 (3)温度与标准发育时间 (8)合子期（0-0.75h） (9)卵裂期（0.75-2.25h） (9)囊胚期（2.25-5.25h） (12)原肠期(5.25-10h) (16)体节期（10-24h） (21)咽囊期（24-48h） (33)孵化期（48-72h） (42)早幼期 (48)谢辞 (48)概述分期为发育研究提供了准确度。
这是因为不同的胚胎即使在同一群体中一起生长，其发育亦有不同程度的差异，我们已看到在斑马鱼发育过程中出现的不同步性。
体外同时受精产生的胚胎，孵育于温度合适的稀疏环境（28.5℃，5-10个胚胎/ml），最早期即出现不同步性，并随时间延续愈加显著。
通过对比显示，不同群体中的差异比同一群体中的更大。
基因差异能部分说明而不能完全解决这一问题，因为即使来自同一斑马鱼克隆系的胚胎其发育亦有不同步性。
就不同胚胎而言，通过形态学标准分期可部分解决这一问题。
例如，头部的原始三叉神经感受神经元（primary trigeminal sensory neurons）和躯干的原始运动神经元（primary motoneurons）都是在体节连续沿体轴出现这段时期内开始轴突发生的。
通过体节数目分期比通过受精后逝去的时间分期能更准确地预测这些神经元在发育过程中的位置。
参照分期序列来记录实验能提供很好的方式确保实验的再现性，并允许随后加入新的观察结果和数据。
一系列基于形态学的划分同时也有利于交流，“18-体节胚胎”比“受精后18小时胚胎”这一称谓含有更丰富的意义，尤其在交叉物种比对中。
以往的斑马鱼发育分期尽管不如目前的完善，也相当准确地反映了头一天的胚胎发育，并提供了多组有用的图片（Hisaokaand Battle, 1958; Hisaoka and Firlit, 1960）。
Warga 和Kimmel （1990）简要地描述了囊胚期和原肠期。
本系列分期的先前版本见于已出版和发行的《斑马鱼手册》（The Zebrafish Book，Westerfield,1994）一书。
新版做了细微的修正和补充，更新版本可以电子版形式在http://zfish. 获得。
表1. 早期发育的各时期时期h 描述合子0 新受精的卵子完成首个合子细胞周期卵裂0.75 细胞周期2至7快速同步发生囊胚 2.25快速间时同步（metasynchronous）细胞周期（8，9）在原肠中期转变中变为延长的异步（asynchronous）周期；随后外包（epiboly）开始原肠 5.25 内卷（involution）、聚合(convergence)和延伸（extension）等形态学运动形成上、下胚层和胚轴；持续到外包运动结束分节10 体节、原始咽弓和神经原节（neuromeres）发育；原始器官发生；开始运动；尾部出现咽囊24 种系期（phylotypic-stage）胚胎；体轴由先前绕卵黄囊的弯曲状态开始伸直；循环系统、色素沉着和鳍开始发育孵化48 原始器官系统完成快速形态发生；软骨在头和鳍中发育；陆续开始孵化早幼72 鳔膨胀；觅食及积极的躲避行为全文组织结构我们命名了每一分期，而不是像其他序列那样使用数字编码，因为命名的分期更为灵活且易于记忆和识别。
分期的定义不是一个瞬间的时刻点，而只是一个用以近似定位连续发育过程中一小段时间的手段。
有了分期命名，我们就可以很容易地加入所知细节，或是为了某一特定的研究在序列中插入一个新的分期，而无需求助于诸如小数、负数、正数这类令人生厌的工具。
例如：我们现在描述了一个5-，随后又描述了一个14-，但一项特定的研究可能要用到其间的8个分期（6-体节，7-体节等等），此时我们可以立刻明白其含义（而不必再行描述）。
我们强调的是，这里不作描述并不意味将其排斥于分期之外。
表2. 胚胎发育的分期a分期h HB 描述合子期1-细胞0 1，2 胞质流向动物极，形成胚盘卵裂期2-细胞0.75 3 部分卵裂4-细胞 1 4 2×2排列的卵裂球8-细胞 1.25 5 2×4排列的卵裂球16-细胞 1.5 6 4×4排列的卵裂球32-细胞 1.75 7 规则的2层卵裂球，有时4×8排列64-细胞 2 8 规则的3层卵裂球囊胚期128-细胞 2.25 9 5层卵裂球；卵裂面不规则256-细胞 2.5 7层卵裂球512-细胞 2.75 9层卵裂球；NO：YSL形成1k-细胞 3 10 11层卵裂球；NO：单排YSL核；卵裂细胞周期轻度不同步高囊胚 3.33 >11层卵裂球；胚盘开始变平；NO：2排YSL核；分裂不同步椭形 3.66 11 胚盘变平产生椭球形；NO：多排YSL核球形 4 12 球形；胚盘与卵黄之间为水平边界穹顶 4.33 13 仍为球形；当外包开始时，卵黄细胞向动物极顶起30%-外包 4.66 14 胚层如倒置杯状不均一增厚；边缘达动植物极距离30%原肠期50%-外包 5.25 胚层厚度仍不均一胚环 5.66 胚环在动物极可见；50%-外包胚盾 6 15 胚盾在动物极可见；50%-外包75%-外包8 16 背侧明显增厚；可见上下胚层和排泄（evacuation）区90%-外包9 脑原基增厚；脊索原基从节板分离尾芽10 17 尾芽显著；脊索原基从神经突（neural keel）分离；早期小膨出（polster）；神经突前侧出现中间矢状沟；100%-外包体节期1-体节10.33 第一体节沟5-体节11.66 18 小膨出显著；视囊，Kuperffer囊14-体节16 19 EL=0.9mm；眼基板；脑神经元，V形躯干体节；NO：前肾导管20-体节19 20 EL=1.4mm；0.5<YE/YB<1；肌收缩；晶状体；耳囊；交叉条纹；后脑神经元显著；尾部延伸26-体节22 EL=1.6mm；HTA=125°；侧向条纹；耳石（otoliths）；原基-3咽囊期原基-5 24 EL=1.9mm；HTA=120°；OVL=5；YE/YB=1；视网膜和皮肤早期色素沉着；中鳍折叠；卵黄血红细胞；心脏搏动原基-15 30 EL=2.5mm；HTA=95°；OVL=3；YE/YB>1；YB/HD=2;早期触碰反射和简单的应激运动；视网膜色素沉着；背侧条带达12体节；弱循环；主动脉至尾端一半；主静脉编织；浅胸鳍芽；直尾；NO：尾端细胞退化；第1大动脉弓血液循环原基-25 36 EL=2.7mm；HTA=75°；OVL=1；PF(H/W)=3/4；早期运动；尾部色素沉着，背部条纹加深；强循环；单一大动脉弓对；主静脉达尾部3/4； NO：PF顶端上胚层缘高胸鳍42 EL=2.9mm；HTA=55°；1/2<OVL<1；YE/YB=1.5;YB/HD<1.3;PF(H/W)=1；去绒膜胚胎游动后背上位静息；YE仍为锥形；PF顶端上胚层缘显著；早期侧带；完整的背侧带；黄素细胞仅见头部；虹膜色素细胞仅见视网膜；心包显著；NO：心腔；血管段；颚弓和舌弓；前肠发育；嗅觉纤毛；耳囊壁增厚孵化期长胸鳍48 EL=3.1mm；HTA=45°；OVL=1/2；PF(H/W)=2；背上位静息；YE开始变细，PF突出；背腹侧条纹汇于尾部；侧带约6个黑素细胞；视网膜上虹膜色素细胞丰富；头部显著黄色；NO：循环见于2-4大动脉弓及血管段；嗅觉纤毛摆动；半规管（semicircular canal）；神经丘（neuromast）EL：胚体长度；PF：胸鳍；HB：Hisaoka 和Battle (1958)斑马鱼分期大致序列（一直到HB分期20大致准确）；HD：背侧观头部直径；NO：Nomarski optics；H/W：高/宽；YB：卵黄球；YE：卵黄延伸部；YSL：卵黄合胞体层；HTA：头-肢角；OVL：耳囊长度为从更广的视角观察发育过程，我们将数个分期归为一组，形成更长的时间段称为时期（表1），并在文中总结了发生在这些时期内的主要事件。
术语表中定义了一些特定的术语，文中黑体字强调的术语在分期中是重要的。
表2对各个分期作了简要的描述，而图1则展示了相应的草图。
我们可以利用这些资料大致定位我们所感兴趣的一个分期，然后尽可能在文中和其他图中找到更多细节。
步骤分期我们可以通过使用立体显微镜观察活体胚胎来大致确定发育分期，通常用透射光（而非反射或入射光）以及高放大倍数（约50×）。
在体节期尾部伸长，如果胚胎仍处于绒膜（chorion）内，尾部最终将环绕驱干和头部，以致不易观察。
此时，我们必须将胚胎移出绒膜，可以使用5号镊子（forceps）手工移去，也可用蛋白溶解酶（proteolytic enzyme）处理。
咽囊晚期，一旦受到触碰，胚胎（如已去除绒膜）会反射性游走，这种情况下，可用0.003%三卡因（tricaine）以麻醉之。