最新家畜育种学第6章育种值估计
《家畜育种学》
二、评定各类生产性能的主要指标
1．产肉性能指标
2．产乳性能指标
2学时
掌握生产性能测定的基本形势；掌握产肉、产乳性能的一般指标及测定方法
3．产毛性能指标
4．产蛋性能指标
5．繁殖性能指标
三、影响家畜生产性能的因素
四、评定家畜生产性能的原则
第四节 记录系统
2学时
P107习题四
了解产毛、繁殖性能指标及测定方法；掌握产蛋性能指标的测定；掌握测定结果的记录原则和方法
四、伴性性状选择和伴性基因频率计算（自学）
五、生化遗传和分子遗传技术鉴定基因型（自学）
第三节 数量性状的选择
一、数量性状的特点及其研究方法
二、数量性状选择原理
三、影响选择效果的因素
2学时
了解对杂合子进行选择的方法；掌握数量性状的特点及其选择原理；掌握影响选择效果的因素
四、数量性状选择方法
第四节 阈性状的选择
实习三 家畜个体育种值估计
3学时
掌握简化的复合育种值估计方法，加深对遗传力的理解
实习四 简化选择指数的制订
2学时
掌握选择指数制订的一般步骤及注意事项
实习五 群体有效含量的计算
2学时
加深对群体遗传多样性保护理论的理解以及计算方法
使用教材
张沅主编，《家畜育种学》（动物生产类专业用），中国农业出版社，2001
第三节 引种与风土驯化简介（补充）
第十三章：育种的组织和措施简介（补充）
2学时
P331 习题十二
掌握保种的原理及保种方法，了解引种和风土驯化的含义及注意事项，了解育种工作组织的一般方法
专题讲座一：现代分子生物技术在畜禽育种中的应用
2学时
个体育种值的估计与选种指数的制订
牛号
本身
平均 记录 乳量 次数
母亲
平均 记录 乳量 次数
半姐妹
平均 乳量
头数
001 4500
3
4800
6
5520 23
002 5520
5
5000
8
5020 37
003 6000
1
4700
4
5300 33
004 4900
2
4900
5
5300 33
005 5000
3
4800
6
5820
5
006 3750
1
综合育种值
• 按各性状的育种学重要性和经济学重要性制订加 权值，对个体不同性状的育种值进行加权，得到 综合育种值，作为选种的依据
综合选择指数是对综合育种值的一种估计！
简化的综合选择指数制订
• 常用的简化选择指数公式：
• •
n
P 2 i
3. I W h 为第i个性状的经济加权值； i i
P 为第i个性状的遗传加权i值1（遗传率）； i
1 (n 1)rA*h2 rAnh2
1 (n 1)rp
•混合家 系的平均 亲源相关 系数：
d并r为A产配仔d种的1 母畜数4d
利用单一来源资料估计育种值
• 根据资料来源的不同，计算出bAP,然后代入公
式
，可得被估个体的估计育种值
• 由于亲属间亲缘相关的差异，不同来源的资料的重要性程度不同，
开产日龄（天） 179 202 176 187 192 177 176 178 178 179 189 176 176 205 199 192 193 177 180 170 181.1
第六章 个体遗传评定
第六章个体遗传评定—选择指数法上一章论述了几种基本的选择方法，其实质就是利用个体本身和所在家系的性状表型值，根据遗传力和度量次数的不同，进行适当的加权来提高选择的准确性。
实际上这是符合现代育种学精神的，即充分利用个体的各种有关信息，包括各类亲属的各种相关性状，应用现代统计分析方法和先进的计算工具，达到尽量准确估计个体育种值，从而获得最大的遗传进展。
由于个体育种值估计是育种学的核心内容之一，本章首先论述几种主要亲属信息估计育种值、以及多性状综合育种值估计的基本方法，在下一章将论述现代混合模型方法的个体育种值估计。
第一节个体育种值在第二章已论述过数量性状表型值的剖分，它是由个体的遗传和环境效应共同作用的结果，其中遗传效应中由于基因作用的不同可以产生三种不同的效应，即基因的加性效应（A）、显性效应（D）和上位效应（I）。
虽然显性和上位效应也是基因作用的结果，但在遗传给下一代时，由于基因的分离和自由重组，它们是不能确实遗传给下一代的，在育种过程中不能被固定，难以实现育种改良的目的。
只有基因的加性效应部分才是能够确实遗传给下一代的，因此将控制一个数量性状的所有基因座上基因的加性效应总和称为基因的加性效应值，它是可以通过育种改良稳定改进的。
个体加性效应值的高低反映了它在育种上的贡献大小，因此也将这部分效应称为育种值。
下面介绍与个体育种值估计有关的几个基本概念。
（1）估计育种值由于个体育种值是可以稳定遗传的，因此根据它进行种畜选择就可以获得最大的选择进展。
但是育种值是不能够直接度量到的，能够知道的只有是由包含育种值在内的各种遗传效应和环境效应共同作用得到的表型值。
因此只能利用统计分析方法，通过表型值和个体间的亲源关系来对育种值进行估计，由此得到的估计值称为估计育种值（estimated breeding value，EBV）。
（2）估计传递力对于常染色体上的基因来说，由于后代的遗传基础是由父母亲共同决定的，一个亲本只有一半的基因遗传给下一代。
家畜育种学07种畜的遗传评估(三)：BLUP育种值估计
随着数理统计学与线性模型理论、计算机科学与 互联网络技术的迅速发展，家畜育种值估计的方
l tt 1 l ti
2 i 1 p
p t 1
0 . 75 0 . 25 f p
个体的父母已知为 p 或 q ，假设 p q
0 . 5 ( l pi l qi ) l ti 0 . 5 l qi 0 i 1、
，这时：
2、 p q t 1
y 是所有观察值构成的向量
， ， ，
b 是所有固定效应（包括）构成的向量
X 是固定效应的关联矩阵 u 是所有随机效应构成的向量 Z 是随机效应的关联矩阵 e 是随机残差向量 随机变量的数学期望： E ( b ) b E ( u ) 0 E ( e ) 0 E ( y ) Xb
方差-协方差矩阵结构：
/jcyzx/index.htm
因子
离散型
• • 通常表现为若干个有限的等级或水平 固定因子 ——有意识地抽取若干个特定的水平， 目的是对这些水平的效应进行估计或进行比较 ， 如年效应 随机因子——因子的若干水平可看作是来自该因 子的所有水平所构成的总体的随机样本，目的是 要通过该样本去推断总体，如个体的遗传效应。
的父母未知时：
a ti a it 0
a ti a it 0 .5 a ip
i 1、 2、 t 1
个体 t 的父或母为 p 时 ：
i 1、 2、 t 1
家畜育种学
家畜育种学绪论1、家畜育种学：指研究改进、保护和利用家养动物遗传资源，以提高生产效率的原理、方法和技术的一门科学。
2、家畜育种（广义）：通过改进、保护和利用家养动物遗传资源求得当前和未来更高的生产效率的全部活动。
绪论家畜育种对发展畜牧业的作用？1.影响动物的生产效率2.充分利用畜禽品种资源优势3.培育新品种和品系4.发挥现有优良品种中优秀种畜的作用5.进一步培育或筛选杂交配套系第一章家畜的起源与进化⏹家畜：通俗认为经过驯养且具有一定经济价值的家养动物。
⏹物种：指具有不同的生态特点，彼此之间存在着生殖隔离，二倍体染色体、数目和基本形态互不相同的生物集团。
⏹品种：指家畜种在人类干预下所发生的分化，在家畜种内具有更为接近的亲缘关系，具有相似并能稳定遗传的形态生理特征，因而也具有一致的生产性能，并具有一定数目的类群。
第一章家畜的起源与进化⏹品种应具备的条件①血统来源相同；②性状及适应性相似；③遗传性能稳定；④一定的结构；⑤足够的数量；⑥必须通过政府部门的审定和认定。
第一章家畜的起源与进化⏹品种的分类1、按培育水平分类①原始品种②培育品种2、根据经济用途分类①专门化品种②兼用品种第二章家畜的生长发育和体质类型⏹生长：同类细胞数目增加或体积增大，使个体由小到大，体量逐渐增加的这一种现象称为生长。
⏹发育：由受精卵分化出不同的组织器官、产生不同的形态、结构与功能的这一过程，它是个体生育机能逐步实现和完善的一个过程。
第二章家畜的生长发育和体质类型⏹生长与发育的关系：⏹生长是由于细胞分裂造成个体体量增加的过程。
⏹发育是由于细胞分化形成新的组织、器官的过程。
⏹生长为发育创造条件，而发育则在组织器官形成后又能刺激个体生长，并决定个体生长的发展和方向，两者共同促进，共同发展。
第二章家畜的生长发育和体质类型研究生长发育的意义：☐对个体进行后天改造☐根据生长发育的结果，保证营养水平☐有利于进行选种第二章家畜的生长发育和体质类型⏹累积生长：家畜在任一时期所测得的体重或体尺，是前期生长发育的累积结果。
家畜育种学资料（完整版）
家畜育种学资料（完整版）家畜育种学资料一、名词解释1.保种：保护现有家畜品种，使之不遭混杂和灭绝。
实质涵义：将品种视为遗传资源而保存其基因库，尽可能不使基因座上的等位基因丢失，无论它目前是否有用或无用。
2.背膘厚：指背上皮下脂肪的厚度。
3.标准乳：乳脂率为4%的乳。
4.标准乳量：乳脂率为4%的乳量。
5.表型值选择：依据被测个体本身及其亲属的表型值进行选择留种的方法。
6.不完全双列杂交法：即缺乏部分组合或纯繁组的双列杂交。
7.采食量：指在不限食条件下猪的平均日采食饲料量。
8.测定站测定：指将各育种场待测个体集中在一个专门的性能测定站，在相对一致、更严格的条件下，在统一的期限内进行的生产性能测定。
9.测交：被测个体与隐性纯合体的交配。
10.产蛋量：指一定时间内的产蛋个数。
常用开产至40周龄、55周龄、72周龄等时的累积产蛋数表示。
11.产蛋总重：指一只鸡或某群鸡在一定时间范围内产蛋的总重量。
12.产乳量：衡量乳用家畜产乳多少的指标。
13.初生窝仔数：指窝产仔猪的数量，包括产仔总数和产活仔数两个次级指标。
14.初生窝重：同窝初生个体重量之和。
15.纯种：指属于同一品种的个体。
16.纯种繁育：指同一品种个体间进行交配繁殖，同时进行选育提高的方法。
17.大理石状：肌内脂肪的分布情况。
取胸腰椎接合处背最长肌横断面置于4℃下存放24小时后对照标准大理石状图评分。
18.单系：来源于一头优秀系祖并具有与系祖相似的外貌特征和生产性能的畜群。
19.单向性选择：把种群中某一极端变异个体保留，淘汰另一极端变异的个体，使种群的基因频率朝着某一个方向变化。
20.地方品系：由于各地生态条件和社会经济条件的差异，在同一品种内经长期选育而形成的具有不同特点的地方类群。
21.顶交：即用近交系的公畜与无亲缘关系的非近交系母畜交配，杂种后代供经济利用的方法。
22.动物克隆技术：指用胚胎或机体的某一部分的细胞来完成繁衍后代的过程。
23.胴体斜长：从耻骨联合前缘中点至第一肋与胸骨结合处前缘的长度。
家畜育种学
家畜育种学绪论何为家畜育种？其强调内容包括哪些？1)家畜育种(animal breeding )一种从遗传上逐代改进家畜群体重要性状，从而提高经济效益的技术和方法。
2)着重强调：一是强调遗传上的(遗传结构)改进，而非由非遗传因素带来的改进，故育种又称为遗传改良二是强调产生优良后裔，期望下一代有提高。
而饲养等措施是强调挖掘当代的生产潜力；三是强调着眼于群体（畜群、品系、品种等）的遗传改进，即群体平均水平的遗传改进；四是强调育种的重要目的之一是为求得最大的经济效益。
第一章什么是家畜？家畜:家养动物，在家养条件下能够累代繁衍，并能供作人类生活或生产资料。
广义概念：人类已经驯化的哺乳纲与鸟纲的动物。
狭义概念：仅指属于哺乳纲的驯化动物，属于鸟纲的驯化动物另称为家禽.驯化动物与驯养动物有何区别？驯养(tameness):人类为了某种目的从自然界中猎捕回来野生动物，加以驯服而成。
--无意识驯化（domestication）：经过人类数千年甚至上万年的饲养、选择与育种，动物的体型发生巨大变化，完全失去其野性，生活习性发生根本改变，对人类有很大依赖性。
--有意识解释种、品种、品系的概念及区别。
物种是具有一定形态、生理特征和自然分布区域的生物类群，是生物分类系统的基本单位。
品种（breed）：具有一定的经济价值，主要性状的遗传性比较一致，能适应一定的自然环境或饲养条件，在产量和品质上比较符合人类的要求，为人类提供生活资料和生产资料。
品系（strain, line）：指起源于共同祖先的一个群体。
（一般）指来源于同一头卓越系祖（公畜）的畜群，具有与系祖类似的特征和特性，并且符合该品种的标准。
家畜品种一般如何进行分类？按改良程度分为原始品种和培育品种。
原始品种：在农业生产水平较低，选种选配水平不高，饲养管理粗放情况下所形成的品种。
培育品种：有明确的育种目标，在遗传育种理论与技术指导下，经较系统人工选择而育成的家畜品种。
按经济类型分为专用品种和兼用品种。
家畜育种学 教学大纲
家畜育种学课程编码：3023009115 课程名称：家畜育种学总学分：3总学时：48课程英文名称：Animal Breeding先修课程：普通遗传学、动物数量遗传学、生物统计与试验设计适用专业：动物科学一、课程性质、地位和任务家畜育种学是动物科学专业一门重要的专业基础课，在动物科学专业课程体系中起承上启下作用。
一方面它与前期所学生物统计与试验设计、普通遗传学、数量遗传学密切相关，另一方面又是后期动物生产各论课的铺垫。
本课程的主要任务是阐述家畜育种的基本原理和方法，育种措施的设计和优化，育种技术的新发展及其运用于育种实践，家畜遗传资源的保护与利用等。
通过本课程的学习，使学生获知家畜品种、品系的概念和标准、生产性能测定、质量性状和数量性状的选择、育种值与遗传评定、选配、品种与品系的培育、杂种优势等方面的基础理论知识，掌握一些选种、选配和杂交的基本实践技能，培养学生灵活运用育种理论和措施解决生产中实际问题的能力，为今后动物生产各论课的学习与毕业后的工作奠定基础。
为学好《家畜育种学》学生必须具备相应的生物统计与实验设计、普通遗传学、数量遗传学等课程的基础知识。
二、教学目标要求1．正确理解性能测定、遗传评定、选种、选配等育种基本环节和常用育种基本技术；2．深刻理解品种标准、性能测定、选择反应及其影响因素，个体育种值估计，品质选配与亲缘选配，品种与品系的培育，杂种优势利用，遗传资源保护等基本理论和方法；3．熟悉各种常见家畜品种的特征和生产力类型，熟练掌握系谱编制、综合选择指数计算、近交系数与亲缘系数计算、个体育种值估计等基本技能；4．能根据实际生产需求设计育种方案并确定相关的育种措施，并能利用新近发展起来的计算机或分子生物学技术来解决家畜育种中的一些实际问题。
三、理论教学内容及安排绪论（2学时）教学目标：通过学习家畜育种学的概念、主要研究内容、发展历史，使学生初步了解家畜育种学的主要研究内容及应用前景，理解本课程与其它课程的关系以及本课程在畜牧业生产中所起的作用，培养学生对本门课程学习兴趣，并为后续课程学习打下基础。
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h2 0.5h2 0.5h2 0.25h2 0.5h2 0.5h2
kh 2 1 (k 1)re
0.5kh 2 1 (k 1)re
0.5kh 2 1 (k 1)re
0.25 kh 2 1 (k 1)re
0.5kh 2 1 (k 1)re
0.5kh 2 1 (k 1)re
h2
0.5nh2 1 0.5(n 1)h2
多种资料育种值的估计
A=0.1A1+0.2A2+0.3A3+0.4A4
当h2<0.2时，A1、A2 、A3、 A4分别为根据亲代、 本身、同胞、后裔资料估计的育种值(低h2)。
当0.2≤h2<0.6时，A1、A2 、A3、 A4分别为根 据亲代、同胞、本身、后裔资料估计的育种值(中 等h2)。
当h2≥0.6时，A1、A2 、A3、 A4分别为根据亲代、 同胞、后裔、本身资料估计的育种值(高h2)。
个体本身，个体父亲，个体半同胞计算的育种值分别为13.5， 14.0，13.52 （P.81）
半同胞后裔：
bAP 10 0..5 2(n51 2n )h2h10 0..5 2 (555 0 010 ). 50.50.4717
AHO PbA(PPP)1.4 00.47 1(17.3 21)41.3 6226
RBV=A/P * 100%
家畜育种学第6章育种值估计 2011
个体育种值的概念
数量性状表型值由个体基因型值和 环境效应值共同决定。 P=G+E
P=A+D+I+E
P=A+R（剩余值）
遗亲传缘力系乘数以不同信
一个体单次度 量值
一个体k次度量均值
n个同类个体单次度量 均值
本身 亲本 全同胞兄妹 半同胞兄妹 全同胞后裔 半同胞后裔
多种资料育种值的估计
A=0.1A1+0.2A2+0.3A3+0.4A4
可见: 亲代的可靠性总是最低，同胞可靠性总是低于后裔 本身资料的可靠性随h2增大而逐渐增大
复合育种值能充分利用所获得的资料，根据它进行选 种的效果比根据单项资料的育种值好。
多种资料育种值的估计
例：计算表6-2中1250号个体多项资料的估计育种值（P.82）
H2=0.5,为中等遗传力性状 A=0.1*AP+0.2*AHS+0.3*A+0.4*AHO =0.1*14.0+0.2*13.52+0.3*13.5+0.4*13.62=13.602
（参见P.86 13.6672）
相对育种值（RBV）
以畜群平均值为标准，将个体育种值化为没 有单位的相对值的形式。
0.25nh2 10.25(n1)h2
0.5nh2 1 0.5(n 1)h2
0.5nh2 10.25(n1)h2
多种资料育种值的估计
简化的复合育种值是将单项资料估计的育种 值根据其可靠程度不同，给以不同的权数复 合而成的。
为了计算方便，可将四种资料对应的权数定 为0.1，0.2，0.3，0.4
即 A=0.1A1+0.2A2+0.3A3+0.4A4