分子生物学常规实验方法
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实验一大肠杆菌感受态细胞的制备及质粒转化
【实验目的】
熟悉利用CaCl2法制备大肠杆菌感受态细胞的操作及质粒转化大肠杆菌的方法。
【实验原理】
当大肠杆菌生长到OD600约为0.2~0.4时,用冰冷的氯化钙低渗溶液处理大肠杆菌细胞,细胞膨胀成球形,可使大肠杆菌进入一种易于接受外源DNA的状态(感受态),处于此状态的细胞称为感受态细胞(competent cells)。此时,若在感受态细胞中加入质粒,则质粒DNA与Ca2+形成的复合物粘附于细胞表面,经过42℃短暂的热激处理后,DNA与Ca2+形成的复合物进入大肠杆菌细胞,在不含抗生素的培养基中短暂培养,使转入大肠杆菌质粒上的抗生素抗性基因表达,在含相应抗生素的选择培养基上可将转化菌(含质粒)与未转化细菌分开,转化细菌经过不断分裂增殖形成菌落,而未转化的细菌则不能。
【器材与试剂】
1.实验仪器培养箱,恒温摇床,超净工作台,低温台式离心机,分光光度计,水浴锅,高压灭菌锅,微孔滤器(含0.22μm滤膜),酒精灯
2.实验试剂氯化钠(AR),无水氯化钙(AR),蛋白胨,酵母提取物,1.0 mol/L NaOH,氨苄青霉素钠,琼脂粉,LB液体培养基:蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,NaCl 10 g,800 mL 蒸馏水溶解后,用NaOH溶液调pH至7.0,蒸馏水定容至1 000 mL,121℃高压灭菌20 min;LB固体培养基:蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,NaCl 10 g,800 mL蒸馏水溶解后,用1.0 mol/L NaOH调pH至7.0,蒸馏水定容至1 000 mL,然后加入琼脂粉15 g,121℃高压灭菌20min,分别倒入无菌培养皿。若配制选择性培养基,当温度降至60℃左右时,加入1 mL氨苄青霉素溶液(100mg/mL),混匀,分别倒入无菌培养皿;CaCl2溶液:准确称取无水氯化钙11.1 g,用双蒸水溶解,并定容至1 000 mL,121℃高压灭菌20 min,4℃保存;氨苄青霉素钠溶液:准确称取氨苄青霉素钠0.5 g,用蒸馏水溶解并定容至5 mL,用微孔滤器过滤除菌后,分装于Eppendorf管中,-20℃保存。
3.实验材料E.coli DH5α, pUC18质粒
【实验步骤】
1.接种大肠杆菌单菌落于2 mL LB液体培养基中,37℃振荡(约250r/min)培养过夜。2. 将2 mL过夜培养物转接到盛有100 mL的LB液体培养基的500 mL三角瓶中,37℃继续振荡培养至OD600约为0.2~0.4(约2 h)。
3.取1 mL培养物于一灭菌的Eppendorf 管中,冰浴放置10~30 min,4℃,1 500×g离心5 min,弃上清。
4.沉淀用0.2 mL冰冷氯化钙溶液轻轻悬浮,冰浴放置15 min,4℃,1 500×g离心5 min,弃上清。
5.沉淀再用0.2 mL氯化钙溶液轻轻悬浮,放置在冰浴中,制成大肠杆菌感受态细胞。
6. 取5 µL pUC18质粒(不超过10 ng),加入制好的感受态细胞中,轻轻混匀,冰浴30 min。
7. 42℃热激90 s后,迅速置于冰浴5 min。
8. 加入800 µL培养基,37℃振荡(100 r/min)温育1 h,使pUC18上的氨苄青霉素抗性基因得以表达。
9. 取200 µL涂布于含氨苄青霉素钠(100 µg/mL)的LB固体培养基上, 正向放入37℃培养箱中培养1 h,再倒置培养过夜至菌落清晰,统计菌落数量。
【注意事项】
1.应使用处于对数生长期的大肠杆菌细胞,OD600最好不超过0.4。
2.整个实验最好在低温环境下进行,以获得较高的转化效率。
3.每次悬浮沉淀细胞要轻缓,避免剧烈振荡。
【实验作业】
根据质粒的用量,计算本实验制备感受态的转化率(cfu/µg DNA)。
参考文献
1.卢圣栋. 现代分子生物学实验技术. 北京:高等教育出版社,1993. 287~289
2.刘进元等. 分子生物学实验指导. 北京:清华大学出版社,2002. 22~25
3.Cohen SN, Chang ACY, Hsu L. Nonchromosomal antibiotic resistance in bacteria: Genetic transformation of Escherichia coli by R-factor DNA. Proc Natl Acad Sci USA, 1972,69:2110 4. 魏群.分子生物学实验指导.北京:高等教育出版社,1999.53~55
实验二质粒的提取与琼脂糖凝胶电泳分析
【实验目的】
熟悉碱法提取质粒以及DNA的琼脂糖电泳分析的原理和方法。
【实验原理】
在碱性条件下,染色体DNA发生变性,共价闭合的质粒DNA仍为自然状态。当溶液调至中性且有高浓度的盐存在条件下,变性的染色体DNA交联成不溶性的网格结构,变性的染色体DNA与蛋白质发生共沉淀,而质粒DNA仍存在于上清液中,通过离心去除沉淀,溶液中的质粒DNA可被异丙醇沉淀。
DNA在碱性的电泳缓冲溶液中因带负电荷,电泳时向正极移动,不同DNA的电泳迁移率与其分子长度与形态有关,DNA分子越大,则迁移率越小,因此,通过电泳可将不同长度的DNA分子分开。
【器材与试剂】
1.实验仪器细菌培养箱,控温摇床,高压灭菌锅,微量移液器,高速台式离心机,电泳仪,水平电泳槽,紫外分析仪,pH计,微波炉
2.实验试剂琼脂粉,100 mg/mL 氨苄青霉素钠,氯仿,异丙醇,70% 乙醇,琼脂糖,溴化乙锭,20 μg/mL RNase A, LB液体培养基,溶液I:50 mmol/L葡萄糖,10 mmol/L EDTA, 25 mmol/L Tris-Cl缓冲溶液(pH8.0);溶液II:0.2 mol/L NaOH,1% SDS;溶液III: 3 mol/L 醋酸钾,5 mol/L 醋酸;TE缓冲溶液:10 mmol/L Tris-Cl(pH8.0),1 mmol/L EDTA;TAE 缓冲溶液(50×):2 mol/L Tris-乙酸,0.05 mol/L EDTA,pH8.0;载样缓冲溶液(10×):0.25% 溴酚蓝,30%甘油。
3.实验材料转化pUC18的大肠杆菌(E.coli DH5α),λDNA/EcoR I, Hind III
【实验步骤】
一、质粒的提取
1.从平板上挑取转化pUC18的大肠杆菌的单菌落,接种于20 mL 含100 μg/mL 氨苄青霉素钠的LB液体培养基中,37℃,振荡(250 r/min)培养过夜。
2.取1.2 mL培养物置于Eppendorf管中,10 000 rpm离心1min,弃上清。
3.沉淀菌体用0.1 mL溶液I重新悬浮,加入0.2 mL溶液II,颠倒数次至溶液变得澄清,最后加入0.15 mL溶液III,轻轻颠倒Eppendorf管数次,10 000 rpm离心10 min。
4.上清液移入一个新的Eppendorf管中,加入0.2 mL氯仿,快速颠倒数次,10 000 rpm离心10 min,将上清液移入另一个Eppendorf管中,加入等体积异丙醇,混匀,10 000 rpm离