植物和小麦SnRK2基因家族的研究进展
马铃薯抗逆相关基因SnRK2家族的克隆与功能分析

马铃薯抗逆相关基因SnRK2家族的克隆与功能分析马铃薯抗逆相关基因SnRK2家族的克隆与功能分析近年来,随着环境条件的不断变化和全球气候变暖的影响,农作物种植遭受逆境胁迫的情况越来越严重。
作为重要的经济作物之一,马铃薯也面临着干旱、高温、盐碱等多种逆境的威胁。
为了提高马铃薯的逆境抗性,科研人员对其抗逆相关基因进行了广泛的研究。
其中,SnRK2家族被认为是马铃薯逆境抗性的关键基因家族之一。
SnRK2家族是植物中一类重要的蛋白激酶,在植物生长发育和逆境应答中发挥着重要的调控作用。
为了进一步研究SnRK2家族在马铃薯中的功能以及其在逆境应答中的调控机制,科研人员进行了马铃薯SnRK2基因的克隆及功能分析。
首先,研究人员通过生物信息学方法,在马铃薯基因组数据库中鉴定出了多个可能与抗逆性相关的SnRK2基因。
随后,通过RT-PCR技术,从马铃薯品种中分离和克隆了SnRK2基因。
经过测序验证,并与已有的马铃薯SnRK2序列进行比对,确认了克隆得到的马铃薯SnRK2基因。
接下来,为了进一步了解SnRK2基因在马铃薯逆境应答中的功能,研究人员利用基因转化技术将马铃薯SnRK2基因导入模式植物拟南芥中。
通过对转基因拟南芥的表型观察和生理指标分析,发现马铃薯SnRK2基因的导入显著提高了拟南芥的抗旱和耐盐能力。
此外,通过基因表达分析,发现马铃薯SnRK2基因在拟南芥中的导入显著激活了一系列与逆境应答相关的基因表达。
进一步的研究显示,马铃薯SnRK2基因在拟南芥中的导入还促进了抗氧化系统的活化,提高了拟南芥对逆境胁迫下产生的活性氧的清除能力。
此外,马铃薯SnRK2基因的导入还增强了拟南芥根系的生长和发育,并提高了植株的光合效率和叶片干物质积累。
这些结果表明,马铃薯SnRK2基因在植物抗逆应答中发挥重要作用,可以改善植物对逆境胁迫的适应能力。
综上所述,研究人员通过克隆和功能分析,揭示了马铃薯抗逆相关基因SnRK2家族在植物逆境应答中的重要作用。
草地早熟禾蛋白激酶SnRK2.4基因克隆及非生物胁迫响应分析

草地早熟禾蛋白激酶SnRK2.4基因克隆及非生物胁迫响应分析金一锋;高岩松;王琦;王萌萌;赵迪;熊毅;陈阳【期刊名称】《华北农学报》【年(卷),期】2022(37)5【摘要】蛋白激酶是植物逆境防御机制中重要的核心成分,植物蛋白激酶SnRK2是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,可通过磷酸化途径在植物逆境胁迫响应中发挥重要作用。
分析草地早熟禾蛋白激酶基因SnRK2.4在非生物胁迫下的表达规律,旨在揭示其在逆境调控中的作用,以优质的冷季型草坪草草地早熟禾为试材,利用RT-PCR 方法克隆得到SnRK2.4基因,其包含一个1092 bp开放阅读框区,编码363个氨基酸序列,利用生物信息学分析其分子特征,并采用实时荧光定量PCR方法观测不同组织部位、非生物胁迫下该基因表达模式。
结果表明,草地早熟禾SnRK2.4属于SRK/SAPK家族,包含典型的STKc_SnRK2结构域,酪氨酸激酶磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性位点等功能域,其与二穗短柄草同源性最高。
实时荧光定量PCR结果表明,草地早熟禾SnRK2.4基因表达水平存在组织特异性,穗部表达量最高,根、茎、叶中无显著差异,草地早熟禾SnRK2.4基因积极响应干旱、盐、低氮、低磷、ABA、BR等非生物胁迫。
【总页数】7页(P9-15)【作者】金一锋;高岩松;王琦;王萌萌;赵迪;熊毅;陈阳【作者单位】齐齐哈尔大学生命科学与农林学院;抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室【正文语种】中文【中图分类】Q78【相关文献】1.非生物胁迫诱导的玉米蛋白激酶基因ZmCIPK1的cDNA克隆和表达分析2.草地早熟禾NAC基因鉴定及非生物胁迫下表达模式分析3.非生物胁迫诱导的玉米蛋白激酶基因ZmCIPK3的cDNA克隆和表达特性4.草地早熟禾蛋白激酶OSK4基因的克隆及对非生物胁迫响应分析5.草地早熟禾SnRK2.2基因克隆及非生物胁迫响应分析因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
三个新的玉米SnRK2基因的鉴定和特征分析

三个新的玉米SnRK2基因的鉴定和特征分析作者:李利斌刘开昌李现刚来源:《山东农业科学》2009年第12期摘要:利用比较基因组学的方法从玉米的基因组中鉴定出三个新的SnRK2基因,并对这三个基因的外显子-内含子结构、蛋白基序、遗传进化以及上游顺式调控元件进行了分析,为进一步研究它们在玉米逆境应答中的功能和利用它们进行玉米分子育种奠定了基础。
关键词:玉米;SnRK2基因;比较基因组学;特征分析中图分类号:Q785 文献标识号:A 文章编号:1001-4942(2009)12-0007-05植物在生长发育过程中经常遇到不良的环境条件如干旱、盐胁迫、低温或高温的影响。
为了生存,植物进化出复杂的生理和遗传机制来感受外部刺激并对逆境做出响应[24]。
阐明植物逆境胁迫的抗性机制和提高作物在各种胁迫条件下的抗性水平是各国科学家研究的主要目标。
已有研究表明,植物SNF1相关蛋白激酶家族基因参与了植物的多种逆境响应和生长发育过程[2~4,6,7,9,14,21,23,25]。
根据核酸和蛋白序列相似性,植物中的SNF1相关蛋白激酶基因分为三个家族:SnRK1、SnRK2和SnRK3[12]。
其中,SnRK1和动物中AMPK基因同源,主要参与碳代谢和能量代谢;SnRK2和SnRK3为植物特有,主要参与对环境因素如干旱和盐胁迫等的应答过程。
越来越多的研究表明,SnRK2家族基因在植物脱落酸(Abscisic acid, ABA)信号转导、渗透胁迫响应、气孔开闭、矿质营养吸收以及生长发育过程中具有重要作用。
例如,拟南芥AtSnRK2.6/OST1可以和ABI(ABA不敏感型突变体)互作来整合ABA和渗透胁迫的信号,正向调节气孔关闭[1,19,26]。
最近研究发现AtOST1在拟南芥中对于防止细菌从气孔的入侵是必需的[18]。
对AtSnRK2.10的研究显示,它能够磷酸化拟南芥和水稻中的脱水素蛋白,而且可以和磷脂酸结合调控逆境反应[22]。
植物非生物胁迫的研究进展

植物非生物胁迫的研究进展作者:于新海李濛周红昕来源:《农业与技术》2016年第09期摘要:植物生长的自然环境是由一系列复杂的生物胁迫和非生物胁迫构成。
且植物对这些胁迫的反应同样复杂,其中干旱、水淹、冷、高盐等非生物胁迫对植物的危害尤为严重。
文章对国内外近年来植物非生物胁迫响应机制、转录因子在非生物胁迫过程中的作用和基因工程对培育具有非生物胁迫耐受性作物的应用进行讨论。
关键词:非生物胁迫;转录因子;基因工程中图分类号:Q789 文献标识码:A DOI:10.11974/nyyjs.20160532020在植物生长过程中会受到各种各样的非生物胁迫或生物胁迫,其中非生物胁迫包括盐碱胁迫、干旱胁迫、冷胁迫、热胁迫等等因素。
为了适应在各种不同胁迫条件下的生存环境,植物进化出了响应不同胁迫信号刺激的调控途径。
当植物受到这些胁迫条件胁迫后,将会激活植物体内响应该胁迫的调控途径,使植物能够抵抗该胁迫,从而生存下去。
因此,研究植物的耐非生物胁迫可以帮助科学家们了解植物是如何抵御外界环境胁迫及通过哪些关键途径来进行调节。
目前,随着全测序成本的降低,已经完成了拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)、玉米(Zea mays L.)、大豆(Giycine Max L.)、水稻(Oryza sativa L.)、苹果(Malus domestica.)等许多物种的全基因组测序[1]。
结合全基因组测序结果、差异转录组分析结果和大量基因的功能分析,发现转录因子在这一过程中起着重要作用,其中转录因子包括MYB和AP2/ERF等家族。
当植物受到生物或非生物胁迫刺激后,会激活脱落酸、乙烯等信号途径,从而激活转录因子的表达,再通过转录因子结构域内的反式作用元件特异性结合到下游靶基因启动子区域的顺式作用元件上,来激活或者抑制下游功能基因的表达来完成调节作用。
这一过程中,最终需要通过基因来行使功能,因此本文重点讨论植物非生物胁迫反应中主要的可能机制。
小麦SnRK2.2基因克隆、表达载体构建及转化

小麦SnRK2.2基因克隆、表达载体构建及转化作者:张照贵李冰王佳佳张桂芝李斯深来源:《山东农业科学》2014年第11期摘要:SnRK2基因家族成员参与蛋白质的磷酸化,在植物抵御非生物胁迫方面发挥重要的作用。
本研究以水稻SAPK2基因序列为基础,通过RT-PCR技术克隆得到一个新的小麦SnRK2基因,命名为TaSnRK2.2,并提交到GenBank(登录号:KJ850253)。
TaSnRK2.2基因全长4 118 bp,由9个外显子和8个内含子组成,包含一个1 026 bp的开放阅读框,编码341个氨基酸。
SnRK2.2基因序列在禾本科植物中高度保守,TaSnRK2.2与水稻SAPK2以及玉米SnRK2.2亲缘关系较近。
TaSnRK2.2基因编码的蛋白质分子量为38.64 kD,理论等电点为5.45,含有SnRK2基因家族典型的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶保守结构域和多处磷酸化位点。
构建了TaSnRK2.2基因过表达载体,转化拟南芥,获得转基因植株,通过RT-PCR方法检测到TaSnRK2.2基因在拟南芥中稳定表达。
关键词:小麦;非生物胁迫;TaSnRK2.2;克隆;转基因中图分类号:S512.1+Q785 文献标识号:A 文章编号:1001-4942(2014)11-0001-07 小麦是世界上最重要的粮食作物之一,全世界约有35%的人口以小麦为主食,在中国粮食消费总量中,小麦占43%以上。
我国地理环境复杂,自然灾害多发,干旱、盐碱以及极端温度等环境因素严重影响小麦产量,威胁小麦粮食生产安全。
植物在长期的进化过程中形成了一系列应对复杂多变环境、抵御逆境胁迫的调控机制,众多的调控和防御类基因构成了植物应答和抵御逆境胁迫的分子生物学基础[1~3]。
研究表明,蔗糖非发酵相关蛋白激酶(Sucrose non-fermenting 1-related protein kinase,SnRK)参与蛋白质的磷酸化,在植物激素信号传导、抵御非生物胁迫和调节植物生长发育等方面发挥重要的作用[4~6]。
小麦SnRK2.2基因克隆、表达载体构建及转化

小麦 S n R K 2 2基 因克 隆 、 表达载体构 建及转化
张照贵 , 李冰 , 王佳佳 , 张桂 芝 , 李斯深
A b s t r a c t S u c r o s e n o n— f e r m e n t i n g J—r e l a t e d p r o t e i n k i n a s e 2( S n R K 2 )g e n e f a m i l y m e m b e r s p a r t i c i -
( 山东 农 业 大 学作 物 生 物 学 国 家 重 点 实 验 室/ 山东省作物生物学重点实验室 , 山东 泰 安 2 7 1 0 1 8 )
摘
要: S n R K 2基因家族成员参与蛋 白质 的磷 酸化 , 在植 物抵御非 生物胁迫 方面发 挥重要 的作用 。本研
究 以水稻 S A P K 2基 因序列 为基础 , 通过 R T— P C R技术克隆得到一个新 的小麦 S n R K 2基 因, 命名为 T a S n R K 2 . 2 ,
并提交到 G e n B a n k ( 登录号 : K J 8 5 0 2 5 3 ) 。T a S n R K 2 . 2基 因全 长 4 1 1 8 b p , 由 9个 外 显 子 和 8个 内含 子 组 成 , 包
含一个 1 0 2 6 b p的开放 阅读框 , 编码 3 4 1 个 氨基酸 。S n R K 2 . 2基 因序列在禾本科植 物 中高度保守 , T a S n R K 2 . 2 与水稻 S A P K 2以及玉米 S n R K 2 . 2亲缘关系较近 。T a S n R K 2 . 2基 因编码 的蛋 白质分子 量为 3 8 . 6 4 k D, 理论 等 电点 为 5 . 4 5, 含有 S n R K 2基 因家族典 型 的丝氨酸/ 苏 氨酸蛋 白激 酶保守 结构 域和 多处磷 酸化位 点。构建 了 T a S n R K 2 . 2基 因过表达载体 , 转化 拟南芥 , 获得转基 因植 株 , 通过 R T— P C R方法检 测到 T a S n R K 2 . 2基 因在 拟
SnRK蛋白激酶家族及其成员SnRK2的功能
摘 要 蔗糖 非酵 解 型 蛋 白激 酶( coe o . r nig卜rl e rti iae S R  ̄ s rs nf met u n e n ea d oe kn s, n K) t p n
2存 在于 植物 中 _
的一类 S r h 类 蛋 白激酶 ,参与植物 体 内多 种信号途 径 的转 导 ,在 植物 的抗逆 境生理 过程 中扮演 了重要 角 e/ r T
植 物在 不 断进化 的过程 中发展 出 一 应 对各 种 体 内多种信 号 途 的转 导 ,对 植物 的抗逆 境 生理 起 到 套 非 生 物逆 境 的保 护机 制 , 些逆 境 包 括 干 旱 、 冷 、 非 常重 要 的作用 。 这 寒 高盐、 高温和 氧化 等 等 。在这 些 不利 因素下 , 物 可 植 S R 家 族 分 为 S R 、n K nK n K1S R 2和 S R n K3等 三
关键 词 S R 蛋 白激 酶家族 , n K2 功 能, 号传导 n K, SR , 信
Th n eS RK o e nKi a eFa l ndt eF n to f n Pr ti n s miya u c in o RK2Pr t i n s h S o en Ki a e
Li n Li he ku Li uS n i
Al a i o l t r l nv r n k l S i Na u a E i me t l ce c n e , rh a t o e tyUn v ri , r i ,1 0 4 o n a i n eCe t r No t e s r sr i e st Ha b n 0 0 S F y 5
Re iw & P o r s ve rges
S R 蛋 白激 酶家族 及其 成员 S R nK n K2的功 能
植物SnRK1蛋白激酶研究进展
ResearchprogressofplantSnRK1proteinkinase
ZHANGYu1,2,YUShunwu2,LIJia2,LITianfei2,CHENChen2,GAONingning1,2,LUOLijun2 (1 CollegeofPlantScience& Technology,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China;
140
张余,等:植物 SnRK1蛋白激酶研究进展
够磷酸化底物 SAMS发挥 SNF1激酶功能。根据序列相似性和表达模式将 OSKs家族分为 2类:group1 (包括 osk1基因)和 group2(包括 osk24、osk35两个基因),group1主要在生长组织中表达,如幼苗、花和 未成熟的种子;group2则在未成熟的胚中强烈表达,并且表达峰值早于 sbe1和 waxy基因,暗示着 group2 中的 OSKs基因在水稻早期胚乳发育过程中起着关键作用。OSK24P:Gus转基因植株组织化学染色分析 显示,OSK24基因主要在果皮、糊粉层和胚乳细胞中表达,并且 OSK24基因表达模式的转变与每个组织中 淀粉粒的出现呈正相关,表明 OSK24基因在库器官碳水化合物代谢方面发挥着特殊的作用[9]。
Keywords:SnRK1;Energymetabolism;Growthanddevelopment;Stressresponse;ABA
SNF1蛋白激酶(Sucrosenonfermenting1relatedproteinkinase1,蔗糖非发酵1相关蛋白激酶)最初是 在酵母中发现的,由于酵母 snf1突变体不能利用半乳糖、麦芽糖、丙三醇和几个非酵解的糖类,因此被命 名为蔗糖非酵解蛋白激酶[1]。SNF1蛋白激酶在进化过程中非常保守,动物 AMPK(AMPactivatedprotein kinase)和植物 SnRK1(Sucrosenonfermenting1relatedproteinkinase1)属于直系同源基因。植物 SnRK1 属于 SnRK超家族,SnRK超家族分为 SnRK1、SnRK2和 SnRK3三个亚家族,其中 SnRK2和 SnRK3基因家 族为植物所特有,主要参与植物应答 ABA和盐胁迫[24]。SnRK1蛋白激酶是由 3个亚基构成的复合体,为 植物感受能量缺乏的核心调节子。如,一年生的烟草在食草动物啃食后通过 SnRK1激酶复合体中的 β亚 基 GAL83改变源库关系直接参与碳水化合物在叶片和根中的分配,提高烟草的适应性[5]。1991年,第一 例植物 SnRK1基因从黑麦胚乳中被分离出来,由于能够恢复酵母 snf1突变体在含有丙三醇和葡萄糖培养 基上的表型,暗示着植物 SnRK1同酵母 SNF1基因所编码的蛋白具有相似的功能,在碳代谢方面发挥重要 作用[6]。SnRK1激酶能够在蛋白水平对底物 SPS(蔗糖磷酸合成酶)、NR(硝酸还原酶)、HMGCOA(乙酰 辅酶 A还原酶)、TPS5(海藻糖磷酸合成酶 5)等碳氮代谢过程中的关键酶类进行磷酸化修饰,在植物体的 糖调控网络中发挥调节作用,进一步影响植物各个器官的生长和发育[7]。
植物花粉发育与抗逆机制的研究进展
植物花粉发育与抗逆机制的研究进展植物花粉是植物繁殖的重要组成部分,也是植物抵御外界环境不良影响的关键。
在过去的几十年里,科学家们对植物花粉的发育和抗逆机制进行了广泛的研究,为发展高产高质农作物提供了理论和实践基础。
第一部分:植物花粉的发育及其调控机制花粉发育是花生殖生长过程中的一个重要环节,也是花生殖发育的必要阶段。
植物花粉发育可分为花粉母细胞分裂、花粉粒体细胞壁形成、花粉粒成熟三个阶段。
每个阶段都存在一系列的调控机制。
在花粉母细胞分裂阶段,花粉母细胞会经历一系列的细胞周期和有丝分裂过程,不同类型的基因调控会影响细胞周期和分裂过程,最终决定花粉产能。
例如,拟南芥中MYB80基因和ARP6基因的表达缺失会导致花粉母细胞不稳定和早期细胞分裂异常。
花粉粒体细胞壁形成阶段中,花粉粒体细胞壁的合成和降解、蛋白质表达和糖代谢等关键过程都由一系列信号途径和基因网络调控。
拟南芥中MALE STERILITY1 (MS1)基因是调控花粉粒体细胞壁发生的重要基因,其表达失调会导致花粉粒体细胞壁合成受阻,从而影响花粉发育。
在花粉粒成熟阶段,各种酶的分泌、花粉粒物质储藏蛋白的合成和转运等关键事件也都存在调控机制。
例如,拟南芥中HAM1基因编码叶酸1号载体,调控花粉紫外线B波长响应,保证花粉粒化学反应适应环境。
第二部分:植物花粉的抗逆机制植物花粉虽小,但在生长和繁殖过程中却面临着各种不利环境胁迫。
因此,植物必须采取一些特殊的抗逆机制来保证花粉发育过程不受干扰和损害。
干旱、冷害、热害等逆境环境会影响花粉发育、花粉粒成熟和花粉萌发等多个阶段。
目前,科学家们已经发现一些具有重要抗逆机制的基因和信号途径,例如HSP70、ABA、SnRK2、LEA等等。
这些基因和途径对于植物花粉发育和逆境环境的适应具有重要意义。
HSP70基因家族在高温、低温、热害等胁迫条件下能够保护细胞膜完整性和蛋白质稳定性,从而维持花粉发育和成熟。
ABA途径在引起植物花粉干旱胁迫的环境下能够诱导花粉发育与成熟,并平衡花粉萌发。
苹果SnRK2基因家族的鉴定和生物信息学分析
苹果SnRK2基因家族的鉴定和生物信息学分析陈娜娜;刘金义;蔡斌;王刚;王敏;程宗明【期刊名称】《中国农学通报》【年(卷),期】2013(29)13【摘要】SnRK2是植物特有的一类Ser/Thr类蛋白激酶,在植物逆境生理过程中扮演了重要的角色。
利用隐马可夫模型搜索和系统建树的方法,在苹果基因组中鉴定出了16个SnRK2基因家族成员,然后从系统发生、理化性质、二级结构、motif、C末端序列和EST等方面对其进行了预测和分析。
结果表明,苹果SnRK2家族为亲水性蛋白,二级结构主要以α-螺旋和不规则卷曲为主;在系谱发生上与拟南芥、水稻、玉米所有的SnRK2蛋白一起分成了3个亚族;motif和C末端序列分析显示,苹果SnRK2蛋白激酶家族具有较高的保守性;EST表达分析显示,16个MdSnRK2在不同组织中呈不均匀分布,具有组织特异性。
本研究为苹果SnRK2基因家族生物学功能的研究奠定了生物信息基础。
【总页数】8页(P120-127)【关键词】苹果;SnRK2;蛋白激酶;基因组【作者】陈娜娜;刘金义;蔡斌;王刚;王敏;程宗明【作者单位】南京农业大学园艺学院【正文语种】中文【中图分类】S661.1【相关文献】1.蓖麻SnRK2基因家族的鉴定和特征分析 [J], 敖涛;胡尊红;和珊;胡学礼;刘旭云;刘爱忠2.苹果WRKY基因家族生物信息学及表达分析 [J],3.草莓SnRK2基因家族的鉴定与表达分析 [J], 刘涛; 王萍萍; 何红红; 梁国平; 高雪琴; 卢世雄; 陈佰鸿; 毛娟4.苹果LIM基因家族生物信息学及表达分析 [J], 袁高鹏; 韩晓蕾; 卞书迅; 张利义; 田义; 张彩霞; 丛佩华5."SH6"苹果矮化中间砧SnRK2基因的克隆及生物信息学分析 [J], 晁琳珂;王恩莹;李鸽;郝素晓;赵艺清;卢艳芬;姚允聪因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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植物和小麦SnRK2基因家族的研究进展作者:张洪映贾宏昉代晓燕来源:《安徽农业科学》2014年第13期摘要干旱、高盐、极端温度等逆境因子是限制作物产量和品质提高的重要因素。
挖掘和利用逆境应答基因资源是改良其抗逆性的前提和基础,对于研究植物抗逆机制具有重要意义。
蔗糖非发酵相关蛋白激酶家族2(Sucrose nonfermenting1related protein kinase 2,SnRK2)是广泛存在于植物中的一类Ser/Thr蛋白激酶,参与植物体内多种信号途径的转导,在植物的抗逆境生理过程中扮演了重要角色。
为了促进小麦SnRK2基因家族的研究,该文对SnRK2基因的结构、抗逆功能、互作蛋白,以及小麦SnRK2基因家族的研究现状进行了阐述。
关键词植物;小麦;SnRK2;抗逆性中图分类号 S511 文献标识码 A 文章编号 0517-6611(2014)13-03805-03Abstract Drought, salinity and low temperatures are major factors limiting tobacco productivity and quality. To survive adverse stresses, plants have developed complex signaling networks to perceive external stimuli, and then manifest adaptive responses at molecular and physiological levels. Mining and deployment of these genetic resources are the foundations for improving the drought resistance in wheat (Triticum aestivum L.). Sucrose nonfermenting1related protein kinase 2 (SnRK2) is a class of Ser/Thr protein kinase widely existing in plant and involved in a variety of signaling pathways, which play a pivotal role in plant stress physiology. To promote the study of SnRK2 kinase, the current plant and wheat SnRK2s studies, including sequence structure,function of stress resistance, and interacting proteins will be reviewed in this paper.Key words Plant; Wheat; SnRK2; Stress resistance蛋白质的可逆磷酸化是逆境条件下植物体内能量代谢和信号转导的重要途径,由蛋白激酶和蛋白磷酸酶和共同调控。
其中,蛋白质的磷酸化是通过蛋白激酶催化完成的[1]。
研究发现,许多蛋白激酶在植物新陈代谢和防御机制的信号转递中具有重要作用。
其中,SNF1是一种被称为蔗糖非发酵的蛋白激酶(surcrose nonfermenting1,SNF1),最初在酵母中分离出来,响应细胞内低葡萄糖信号。
现在被广泛研究的SNF1蛋白激酶超家族包括:酵母SNF1、哺乳动物AMPK(AMPactivated protein kinase,AMPK)和植物SnRK(SNF1related protein kinase)。
根据结构和功能特点,可将SnRK超家族分为3个亚族:SnRK1、SnRK2和SnRK3,3个亚组的基因序列间有42%~46%的相似性,主要差异在C端调控区。
其中,SnRK1与SNF1/AMPK序列相似度高,具有直接的功能同源性,SnRK2和SnRK3则不同于SnRKl家族,它们是植物特有的基因家族[2-4]。
近年来研究发现,SnRK2广泛参与了植物的非生物胁迫应答[5-7]。
小麦是重要的粮食作物,基因组庞大、序列复杂、基因转化困难等原因,使小麦的结构基因组、功能基因组和蛋白质组研究远落后于水稻、玉米等作物。
小麦SnRK2蛋白激酶的功能及抗逆机理研究未形成完整体系。
因此,笔者对小麦SnRK2激酶的研究进行综述,以期为促进小麦抗逆基因资源的研究和利用。
1 SnRK2的序列结构SnRK2是一个相对较小的植物专一性蛋白激酶家族,在拟南芥、水稻和玉米等的研究发现其成员约为10个,具有典型的N端和C端功能结构域,N端催化域高度保守,C端为调控区[5-7]。
与SnRK1相比,SnRK2的C端缺少140~160个氨基酸,相对较短,该C端的显著特征是具有一个富含谷氨酸或天冬氨酸(D/E)的酸性补丁结构。
据此可将SnRK2分为SnRK2a(Subclass I和Subclass II)亚族和SnRK2b(Subclass III)亚族。
其中SnRK2a的C端富含天冬氨酸,而SnRK2b中富含谷氨酸。
研究发现,SnRK2的C端结构域和酶的激活、ABA信号传递及蛋白间的相互作用相关[8-9]。
2 小麦SnRK2基因的研究植物应答逆境胁迫的过程非常复杂,涉及多种信号传递通路。
根据是否有ABA(脱落酸)的参与,将胁迫应答分为ABA依赖途径和非ABA依赖途径。
越来越多的研究表明,SnRK2家族成员以不同的调控方式广泛参与植物的逆境胁迫信号传递,在植物的逆境应答中具有重要作用。
在植物中分离到的第1个SnRK2成员(PKABA1)来自经ABA处理的小麦胚胎cDNA文库,研究发现PKABA1可以与ABA 反应元件结合因子ABF结合从而调节植物体内的脱落酸(abscisic acid,ABA);受ABA、冷和渗透胁迫诱导表达[10]。
研究者随后对PKABA1高度同源基因TaPK3(相似性为97%)的研究发现,TaPK3基因在小麦新生幼芽中富集,不受非生物胁迫诱导表达。
可见,SnRK2基因的功能并不局限在植物的胁迫抗性方面[11]。
通过扫描干旱胁迫小麦幼苗的cDNA文库,2个高度同源的SnRK2基因W55a和W55c(相似性为98.54%)被克隆,其属于Subclass II亚族成员;位于小麦2BS染色体上;可以被干旱、高盐、ABA和水杨酸等激活,但不受冷胁迫诱导[12]。
从小麦根部cDNA差减文库中分离到1个新的SnRK2基因TaSRK2C1;基因表达分析研究发现,其受干旱、高盐、低温和外源ABA诱导表达,在植物中过表达TaSRK2C1基因能显著增强植株的抗逆能力[13]。
小麦TaSnRK2.9基因的克隆与生物信息学分析发现,其与水稻SAPK9基因直系同源,同属于Subclass II亚族;在小麦的根、茎、叶和花等器官均都有表达,且在叶片的表达量最高;目前还没有对其功能的系统报道[14]。
笔者对小麦TaSnRK2.3、TaSnRK2.4、TaSnRK2.7和TaSnRK2.8的抗逆性研究发现,4个基因在植物的各组织均有表达,其中,TaSnRK2.3和TaSnRK2.4在新生组织中表达较高,而TaSnRK2.7和TaSnRK2.8在根部表达最高;TaSnRK2.7不能被ABA激活,而其他基因受ABA 诱导表达;4个基因同时受干旱、冷和高盐胁迫诱导;转基因后均能显著增强植物的非生物胁迫抗性[15-18]。
通过对TaSnRK2.7基因组序列进行直接测序,研究其单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)发现,一些SNP位点与抗逆相关;利用SNP将TaSnRK2.7精细定位于小麦2AL染色体WMC179.4 和WMC401标记之间,与磷素和可溶性糖高效积累的QTLs定位相近[19-20]。
对TaSnRK2.8的SNP研究发现了一个与SNP与苗期生物量和可溶性糖显著关联的SNP [21]。
这些研究结果显示,SnRK2可能与其直系同源基因酵母SNF1相似,具有调节糖代谢功能。
3 SnRK2基因参与植物体内的糖代谢途径糖不仅能够为植物的生长发育提供能量和代谢中间产物,同时还具有信号传递功能,调节逆境相关基因的表达。
然而,由于糖信号转导与植物体内的生长代谢过程及激素等信号转导途径等形成复杂的网络联系,其确切机制尚未清楚[22-24]。
与SnRK2基因的SNP分析一致,转基因功能研究发现,拟南芥AtSnRK2.6基因[25]和小麦TaSnRK2.8基因[18]在植物中过表达后,能显著增加可溶性糖含量、降低细胞渗透势从而增强植物的抗逆能力。
可见,SnRK2基因同时参与了植物体内的糖代谢和逆境信号传递过程,关于其确切的分子调控机制尚待研究。
4 SnRK2参与逆境应答的一种调控机制对SnRK2的上游激活因子和特异性底物的研究可以深入了解其功能。
从目前的研究结果看,SnRK2可以被ABA及渗透胁迫等逆境因子激活,其活性调控是以自身磷酸化为基础,但其调控机制并不清楚。
早期对SnRK2上游活化因子的研究发现蛋白磷酸酶2C(PP2C)对OSTI/SnRK2.6基因起负调控作用[26]。
前人在检测SnRK2酶活及寻找靶蛋白的过程中发现其底物主要是碱性亮氨酸拉链类(Basic leucine zipper,bZIP)转录因子。
例如在小麦、水稻和拟南芥里发现ABA下游应答转录因子ABF/AREB(ABA responsive transcription factots)可能是SnRK2家族基因的磷酸化底物[27-28]。
美国和德国的2个实验室分别报道了通过体外试验研究ABA信号传递途径的发现[29-31]:PYR/PYL/RCAR家族是ABA的受体,其与ABI1和ABI2等蛋白磷酸酶(PP2Cs)、SnRK2蛋白激酶共同调控ABA依赖型基因的表达。
当植物体内缺乏ABA时,PP2C可以抑制SnRK2的自我磷酸化;在ABA存在条件下,ABA与受体PYR/PYL/RCAR形成的复合体可以捕获PP2C,此时的SnRK2可以自我磷酸化,激活下游转录因子ABF,开启ABA应答元件ABRE的转录,进而调控下游ABA依赖型基因的表达。
植物体内的研究发现,拟南芥中受ABA诱导的SnRK2家族Subclass III亚族成员的信号传递途径符合ABAPYRPP2CSnRK转录因子相偶联的ABA信号通路[32-34]。
5 小结与展望综上所述,小麦SnRK2成员具有组织表达差异,以不同的调控方式广泛参与了植物的逆境胁迫应答反应。