利用SSR分子标记建立辣椒纯度鉴定体系
SSR标记荧光毛细管电泳在种子检测中常见问题分析
SSR标记荧光毛细管电泳在种子检测中常见问题分析李巧英（山西省种业发展中心，太原030006）摘要：SSR分子标记荧光毛细管电泳在农作物种子质量检测中常用于种子真实性检测、种子纯度鉴定和指纹数据库的构建。
试验过程中模板DNA浓度、特异峰型的统计分析以及仪器设备运行和维护、试验结果与指纹数据库的比对等关键环节都直接影响待测样品的结果判定。
就检测中遇到的问题进行分析，并提出相应的解决方法，以期为农作物种子质量检测荧光毛细管电泳技术平台提供参考。
关键词：SSR标记；荧光毛细管电泳；种子检测；问题；分析分子标记技术是近年来发展较快的基因检测技术，随着新标记方法的开发和试验技术的改进，在基因水平上检测农作物种子信息逐渐成为监控种子质量的一个重要手段。
由于分子标记法不受自然条件和表现性状的约束，实现了种子品种遗传信息室内快速检测，受到大家的青睐。
SSR作为第2代分子标记方法，是一种共显性标记，具有重复性好、等位变异多、数据分析简便、易操作等优点，在农作物种子质量检测中被广泛使用。
荧光毛细管电泳技术将荧光检测的高灵敏度和毛细管电泳的高效性结合，利用电泳和电渗流的电动力学原理，在毛细管中灌满胶分离PCR产物，检测荧光信号，数据软件分析系统将其转化成峰图，显示试验结果。
该技术自动化程度高，检测通量高，试验操作简单，数据统计程序化，避免人为估算的主观性，结果精确到1bp[1]，直接显示扩增产物片段的大小，实现了指纹图谱与碱基序列长短之间的对应转换，易于实验室间结果比对，常用GeneMapper 和GeneMarker分析SSR扩增片段[2]。
本文就试验中遇到的荧光信号强度、特异峰型的统计分析以及毛细管电泳仪运行和维护、试验结果与数据库比对等问题进行分析，为SSR分子标记荧光毛细管电泳检测农作物种子质量试验技术标准化提供参考。
拟，为所有专业方提供可控管、无破坏性、性价比高、低风险并允许反复运用的可行性方法。
BIM技术可以有效地提高施工技术水准，预防施工事故，减少施工成本浪费并缩短时程，强化施工过程中决策、控管能力。
《分子标记SSR标记》课件
contents
目录
• SSR标记介绍 • SSR标记技术原理 • SSR标记实验操作 • SSR标记在遗传育种中的应用 • SSR标记研究展望
01
SSR标记介绍
SSR标记定义
SSR标记，即简单序列重复标 记，是一种基于PCR技术的 DNA分子标记。
它由2-6个碱基组成的重复单位 串联而成，具有高度多态性， 可应用于基因组遗传分析。
04
分子标记辅助选择
通过SSR标记与目标性状关联，实 现分子标记辅助选择，加速育种
进程。
SSR标记在动物遗传育种中的应用
动物资源保护与利用
SSR标记用于评估动物的遗传多样性， 有助于动物资源的保护和合理利用。
基因定位与疾病关联研究
SSR标记用于基因定位和疾病关联研 究，为动物疾病防控和动物育种提供
疾病易感性分析
02
通过SSR标记分析某些疾病的易感性，有助于疾病的预防和早期
干预。
个体识别与亲子鉴定
03
SSR标记还可用于个体识别和亲子鉴定，为法医学和人类学等领
域提供技术支持。
05
SSR标记研究展望
SSR标记技术的发展趋势
自动化与高通量
随着技术的发展，SSR标记将更加自动化和高通量，提高检测效 率和准确性。
基因组DNA提取
从生物样本中提取基因组DNA 。
PCR扩增
使用设计的引物进行PCR扩增 ，得到SSR片段。
数据分析
对电泳结果进行统计分析，评 估遗传差异和多样性。
SSR标记技术优缺点
01 优点
02 操作简便，检测结果稳定可靠。
03
可用于检测微卫星序列的长度多态性，反映基因组
应用分子标记检测作物杂交种纯度研究现状及比较分析
应用分子标记检测作物杂交种纯度研究现状及比较分析作者：刘子记曹振木杨衍来源：《长江蔬菜·学术版》2013年第06期摘要：分子标记技术可以弥补和克服杂交种纯度形态学及同工酶鉴定中的许多缺陷和难题，为作物杂交种纯度鉴定提供一种准确、可靠、快速、方便的方法。
通过综述几种常用分子标记技术的原理、优缺点及其在作物杂交种纯度鉴定中的应用现状，展望了分子标记检测技术在杂交种纯度检测乃至遗传育种、良种推广中的重要性，以期为研究分子标记技术提供参考。
关键词：纯度鉴定；分子标记；杂交种；多态性种子是重要的农业生产资料，是实现农业科技进步的载体。
种子质量的优劣直接影响农产品质量和优良品种的增产潜力，而种子质量的好坏在很大程度上取决于种子的纯度，开展种子纯度检测对保证种子质量和提高生产效益具有重要意义。
生物混杂及机械混杂是影响杂交种纯度的主要原因，作物杂交种纯度检验的常用方法主要包括形态鉴定、田间鉴定和同工酶电泳技术鉴定等[1]。
种子形态差异有限，且易受环境条件影响，因此形态鉴定准确性较差；田间鉴定所需时间较长，成本较高，表型易受栽培措施和环境条件的影响，不同的鉴定者对同一性状的评价也存在一定的差异，不能满足快速检测杂交种纯度的需要；同工酶鉴定虽然准确、可靠、不受外界环境影响，但多态性不够丰富，且有组织和器官特异性[2]。
随着作物新品种数量的不断增加，遗传基础日趋狭窄，传统的鉴定方法不能有效区分遗传关系较近的杂交种[3]，难以满足作物杂交种纯度鉴定在精确度方面的要求。
近年来，随着DNA分子标记技术的问世及迅速发展，使得从基因组水平上检测杂交种纯度成为可能。
分子标记技术能够从DNA水平上揭示杂交子代与亲本间的遗传差异，不受植株生长季节的限制，不受基因表达、栽培条件和环境条件的影响，无器官、组织及发育特异性，能够检测微小的变异，多态性丰富，稳定性高，可以大大缩短检验时间[4]。
近年来，分子标记技术在国内外被广泛应用于作物杂交种纯度鉴定。
ssr分子标记原理
ssr分子标记原理SSR分子标记原理引言：SSR分子标记（SSR molecular tagging）是一种用于分析和鉴定生物体内特定分子的技术。
它基于分子生物学和生物化学的原理，通过特定的标记物，可以在细胞、组织或体液中准确地检测和定位目标分子。
本文将介绍SSR分子标记的原理及其在科研和医学领域的应用。
一、SSR分子标记的原理SSR分子标记是一种基于DNA序列多态性的分子标记技术。
它利用了DNA序列中的简单重复序列（simple sequence repeat, SSR），即由1-6个碱基重复组成的核酸序列。
SSR序列在基因组中广泛存在，具有高度变异性和遗传稳定性，因此可以作为DNA分子标记的候选序列。
SSR分子标记的原理可以简单概括为以下几个步骤：1. DNA提取：从样品（如细胞、组织或体液）中提取总DNA。
2. SSR标记物设计：根据目标分子的序列信息，设计特异性引物，引物的两端分别包含互补的SSR序列。
3. PCR扩增：利用PCR技术，使用设计好的引物对DNA进行扩增，扩增产物中包含了目标分子的序列和SSR序列。
4. 电泳分析：将PCR扩增产物进行电泳分析，根据SSR序列的长度变异性，可以将不同样品中的目标分子进行定性和定量分析。
二、SSR分子标记的应用SSR分子标记技术在科研和医学领域具有广泛的应用价值，以下是几个典型的应用案例：1. 遗传多样性研究：SSR分子标记可以用于研究不同物种或不同个体间的遗传多样性。
通过对多个基因座进行SSR分子标记，可以获得物种或个体的遗传背景信息，进而推断种群结构、基因流动和进化关系等。
2. 基因定位和图谱构建：SSR分子标记可以用于构建遗传图谱，帮助研究人员定位和克隆感兴趣的基因。
通过SSR标记物在遗传图谱上的位置，可以确定目标基因的大致区域，为后续的克隆工作提供有力的指导。
3. 疾病诊断和预后评估：SSR分子标记在医学诊断中的应用也日益广泛。
通过对特定基因的SSR序列进行分子标记，可以检测和鉴定与疾病相关的突变或多态性。
ssr分子标记技术存在问题
ssr分子标记技术存在问题SSR（Single-Strand Conformation Polymorphism Analysis）分子标记技术是一种常用的分子生物学工具，用于检测DNA或RNA的序列变异。
然而，虽然SSR分子标记技术在许多领域都有着广泛的应用，但它也存在一些问题需要解决。
本文将探讨SSR分子标记技术存在的问题，并提出一些解决方案。
第一部分：介绍SSR分子标记技术首先，让我们简单介绍一下SSR分子标记技术。
SSR是指简单重复序列（Simple Sequence Repeats），也被称为微卫星序列，它是DNA 或RNA分子中短序列的重复单元。
SSR分子标记技术可以通过PCR扩增和凝胶电泳等方法来分析样品中这些重复序列的长度变异，从而研究基因型和表型之间的关系。
第二部分：SSR分子标记技术存在的问题然而，尽管SSR分子标记技术在基因型鉴定、种群遗传结构分析和品种选育等方面表现出了良好的应用前景，但它也存在以下几个问题：1. 数据分析复杂：SSR分子标记技术获得的数据通常需要进行复杂的分析，包括基因频率、遗传多样性等统计学参数的计算。
这对于非专业人士来说可能是一个挑战。
2. 缺乏标准化操作流程：不同实验室或研究机构之间使用的SSR分子标记技术操作流程可能存在差异，导致结果的可比性不高。
3. 多态性程度低：由于SSR分子标记技术只能分析简单重复序列，因此它对于复杂基因组的分析有一定局限性。
在某些物种中，SSR位点的多态性程度较低，导致分辨率不高。
第三部分：解决方案尽管SSR分子标记技术存在问题，但我们可以通过以下途径来解决这些问题：1. 开发简化的数据分析工具：研究人员可以开发易于使用且功能强大的数据分析工具，以简化SSR分子标记技术数据的处理过程，并提供可视化和统计学参数计算等功能。
2. 建立标准化的操作流程：国际间的合作可以制定和推广SSR分子标记技术的标准化操作流程，确保不同实验室或研究机构之间获得的结果具有可比性。
SSR分子标记在作物遗传育种中的应用_罗冉
基因组学与应用生物学，2010年，第29卷，第1期，第137－143页Genomics and Applied Biology,2010,Vol.29,No.1,137－143评述与展望Review and ProgressSSR 分子标记在作物遗传育种中的应用罗冉吴委林张旸李玉花*黑龙江哈尔滨东北林业大学生命科学学院,哈尔滨,150040*通讯作者,lyhshen@摘要SSR (simple sequence repeat)是建立在PCR 技术上的一种广泛应用的分子标记，具有含量丰富、多态性高、共显性等优点。
本文简要介绍了SSR 分子标记技术的原理和特点，重点介绍了SSR 分子标记技术在作物遗传育种中的应用，主要在作物遗传多样性、基因定位、分子辅助标记、遗传图谱构建、品种鉴定和纯度鉴定等方面进行阐述。
关键词SSR,分子标记,作物,遗传育种SSR Marker and its Application to Crop Genetics and BreedingLuo Ran Wu WeilinZhang Yang Li Yuhua *Heilongjiang Harbin College of Life Sciences of Northeast Forestry University,Harbin,150040*Corresponding author,lyhshen@ DOI:/10.3969/gab.029.000137Abstract SSR (simple sequence repeat)is a classic technique for molecular marker based on PCR technique,which had many advantages,such as abundance,high polymorphism,co-dominance etc.This paper has clarified the concept and characteristics of SSR marker,then presents emphatically its application to plant genetics and breeding,and focus on genetic diversity,gene mapping,marker assistant selection,construction of genetic map,varietal identification,purity identification and so on.Keywords SSR (simple sequence repeat),Molecular markers,Crop,Genetics and breeding /doi/10.3969/gab.029.000137基金项目：本研究由国家科技部863项目(2008AA10Z156)和国家自然基金重点项目(30730078)共同资助遗传标记(genetic marker)是指在遗传分析上用作标记的基因，也称为标记基因。
印度南瓜‘贝栗7号’杂交种子纯度SSR分子标记鉴定
印度南瓜‘贝栗7号’杂交种子纯度SSR分子标记鉴定印度南瓜‘贝栗7号’是一种优质的南瓜品种，具有高产、抗病、抗逆性强等优点，深受农民和种植户的青睐。
为了保证种子的质量和纯度，需要对种子进行鉴定。
传统的鉴定方法具有时间长、成本高以及准确性低的缺点，因此急需一种新的快速、准确的鉴定方法。
SSR分子标记是一种应用广泛的分子生物学技术，可以快速、准确地鉴定种子的纯度和杂交程度。
本文旨在通过SSR分子标记鉴定，对印度南瓜‘贝栗7号’杂交种子进行纯度鉴定。
一、印度南瓜‘贝栗7号’的特性印度南瓜‘贝栗7号’是一种上等的南瓜品种，具有早熟、高产、抗病、抗逆性强等优点。
果实呈椭圆形，果皮呈深绿色，果肉细腻味甜，风味极佳。
‘贝栗7号’适合在温暖湿润的气候条件下种植，对土壤要求不苛刻，栽培管理简单，是一种农民和种植户都喜爱的南瓜品种。
二、SSR分子标记技术概述SSR（Simple Sequence Repeat）又称微卫星序列，是一种重复序列，其长度在1-6个碱基对之间。
SSR分子标记是通过检测DNA中微卫星序列的不同，来鉴定不同品种或个体之间的遗传差异。
它具有快速、准确、重复性好的特点，被广泛应用于植物基因组结构、遗传多样性和亲缘关系的研究中。
通过SSR分子标记技术，可以对种子的纯度和杂交程度进行精准鉴定。
三、印度南瓜‘贝栗7号’种子纯度SSR分子标记鉴定方法1. 样品收集需要准备好待鉴定的‘贝栗7号’种子样品。
取不同批次、不同来源的种子进行检测，以保证鉴定的代表性和准确性。
样品收集时需要避免受到外界环境的污染，并在鉴定前对样品进行充分的干燥处理，以保证DNA的完整性和稳定性。
2. DNA提取将收集到的‘贝栗7号’种子样品进行DNA提取。
目前市面上有多种DNA提取试剂盒可供选择，可以根据实际情况选用适合的提取试剂盒进行操作。
提取得到的DNA需要保证纯度和浓度的合适，以保证后续PCR扩增反应的顺利进行。
3. SSR引物筛选选择适合的SSR引物对‘贝栗7号’种子样品的DNA进行PCR扩增。
利用分子标记辅助育种
利用分子标记辅助育种一、分子标记辅助育种概述分子标记辅助育种是现代生物技术与传统育种方法相结合的一种高效育种技术。
它利用分子标记与目标基因紧密连锁的特性，在作物育种过程中对目标基因进行追踪和选择，从而显著提高育种效率和准确性。
随着分子生物学技术的不断发展，分子标记辅助育种已成为作物遗传改良的重要手段，在农业生产中发挥着越来越重要的作用。
二、分子标记辅助育种的关键技术1. 分子标记类型- SSR标记（简单重复序列标记）：SSR标记具有多态性高、共显性遗传、重复性好等优点。
其核心是由1 - 6个核苷酸组成的简单重复序列，广泛分布于基因组中。
通过设计特异性引物对SSR区域进行扩增，根据扩增产物的长度多态性来检测个体间的差异。
例如，在水稻育种中，利用SSR 标记可以有效区分不同品种的水稻，为品种鉴定和纯度检测提供了可靠的方法。
- SNP标记（单核苷酸多态性标记）：SNP标记是基因组中单个核苷酸的变异，是最常见的遗传变异类型。
它具有数量多、分布广泛、检测通量高的特点。
SNP标记的检测方法包括基于PCR的方法、芯片技术和新一代测序技术等。
在玉米育种中，SNP标记已被广泛应用于全基因组关联分析（GWAS），用于挖掘与重要农艺性状相关的基因位点，为分子标记辅助选择提供了丰富的标记资源。
- AFLP标记（扩增片段长度多态性标记）：AFLP标记结合了RFLP（限制性片段长度多态性）和PCR技术的优点，具有较高的多态性检测效率。
其原理是通过对基因组DNA进行限制性内切酶酶切，然后连接特定的接头，再进行选择性扩增。
扩增产物通过电泳分离，根据片段长度多态性来分析遗传差异。
在小麦育种中，AFLP标记可用于构建遗传连锁图谱，定位控制小麦抗病性、品质等性状的基因。
2. 目标基因定位与克隆- 连锁分析：连锁分析是通过研究标记与目标基因在染色体上的连锁关系来定位目标基因的方法。
当标记与目标基因紧密连锁时，它们在遗传过程中倾向于一起传递。
SSR分子标记讲解
SSR分子标记的步骤
第五步：结果分析
微卫星分子标记对18份山羊草基因型的扩增结果
SSR分子标记引物设计
一
从有关数据库（GenBank, EMBL DDBJ等）或文章中查 询
引物 设计
二
使用近PCR 分离SSR标记
SSR分子标记的步骤
第三步：扩增产物电泳分离：一般用聚丙烯凝
胶电泳或者特殊的琼脂糖凝胶检测扩增产物 第四步：染色： 一，银染 A，银染液的配制： 固定液(100mL冰乙酸加水稀释至1000mL)； 染色液(2gAgNO3、1．5mL37％甲醛，加水稀 释至1000mL)；显色液(30gNa2CO3、1．5mL37 ％甲醛、0．2mLNa2S203，加水稀释至1000mL) 终止液(10％冰乙酸)。
SSR座位突变率高，对变异反应非常敏感等等。
SSR分子标记的步骤
第一步：DNA 提取： 第二步：PCR :
PCR体系（15微升）：45纳克模板DNA 2.25微摩尔/升引物 11.5毫摩尔/升 氯化镁 各625微摩尔/升 4种dNTP 10X PCR缓冲液 1.5U Taq DNA 聚合酶 PCR反应程序 ： 变性94 摄氏度 3min 30次循环：94摄氏度 25s ，50-60摄氏度 25s ，72摄氏度 45s 最后72摄氏度延伸 10min
SSR分子标记的步骤
B，银染法操作：固定30min→去离子水洗涤510min→染色3Omin→去离子水洗涤2次(每次不超过 30S) →显色至所要程度→终止显影。 二，溴化乙锭(EB)染色： 将EB贮液(10mg· mL-1)用双蒸水稀释至 0．5μg·mL-1，
EB染色操作：将电泳后的凝胶放人染色液中 30min，染色后的凝胶放人蒸馏水中清洗5min，再 将凝胶放人紫外凝胶成像仪观测结果。
小麦品种纯度鉴定ssr分子标记法
小麦品种纯度鉴定ssr分子标记法
小麦品种纯度鉴定是指通过分子标记技术来确定小麦品种的纯度和遗传背景。
SSR（Simple Sequence Repeat）分子标记法是一种常用的分子标记技术，通过检测DNA中的微卫星序列来进行分析。
下面我会从多个角度来回答这个问题。
首先，SSR分子标记法的原理是利用PCR扩增技朧，通过特定引物扩增目标微卫星序列，然后利用聚丙烯酰胺凝胶电泳等方法对扩增产物进行分离和检测。
这种方法能够检测DNA序列中的微卫星重复序列，因为不同品种的小麦在微卫星序列上会存在差异，通过分析这些差异可以确定品种的纯度和遗传背景。
其次，利用SSR分子标记法进行小麦品种纯度鉴定的过程一般包括DNA提取、PCR扩增、电泳分离和数据分析等步骤。
首先是DNA 提取，从待测小麦品种的叶片或种子中提取DNA样品；然后是PCR 扩增，使用特定的微卫星引物对DNA样品进行PCR扩增，产生特定长度的DNA片段；接着是电泳分离，将PCR产物经过聚丙烯酰胺凝胶电泳，根据片段大小进行分离；最后是数据分析，根据电泳图谱分析PCR产物的特征，来确定小麦品种的纯度和遗传背景。
此外，SSR分子标记法在小麦品种纯度鉴定中具有高度的灵敏性和重复性，能够对小麦品种进行准确的鉴定和分类。
通过对小麦品种进行SSR分子标记分析，可以帮助农业科研人员和育种者确定小麦品种的亲缘关系、纯度和遗传特征，为小麦品种改良和种质资源保护提供重要依据。
综上所述，SSR分子标记法在小麦品种纯度鉴定中发挥着重要作用，通过对小麦品种的DNA序列进行分析，可以准确地确定其纯度和遗传背景，为小麦育种和种质资源管理提供科学依据。
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水稻杂交 种的纯度体系 ， 并注册 国家专利 ， 产生 了巨大 的经济效 益 。 我国辣椒每年采用传统种子纯度鉴定方法需要
土地 ５４８ ５ ．ｈ ２费用 ２０ ５ ．～６ ５ ｍ ， ２ ５０～２０ ９０万元 ， 如果 利用 Ｓ Ｒ分子 标记 技 术 只需 ２ ２ 元 即可 完成 Ｓ ２ ６万
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子纯度 鉴定 工作 者 提供 参 考 ， 同 时 为 辣 椒 种 子 指 纹 图谱的建立 奠定基础 。
２ １ 年第 １ ００ 期
◆试验研究◆
２ １兴 蔬 ３ １ 兴 蔬 ２ １兴 蔬 绿 燕 、 湘 秀 丽 、 ０、 ０、 ０、 福 福湘
１ ． Ｐ Ｒ 产 物 的检 测 扩 增 完成 后 在 ８ ．４ Ｃ ２ ％聚丙 烯 酰胺 凝 胶 上 电 泳 （６Ｖ，４ｍｉ） 电泳 完 成 后 观 察 １０ １０ ｎ ，
纯度鉴定 。因此 ， 辣椒种子纯度鉴定 Ｓ Ｒ技术体系 Ｓ 的建立不但为种子企业节约了种子纯度鉴定成本 、
为市 场 提供 了优 质 的种 子 ， 缓减 我 国人 多 地少 的 还 矛盾 ， 我 国辣 椒杂 交种 种 业 的可 持续 性 发 展具 有 对
重要 意义 。
本 研 究 旨在 利 用 Ｓ Ｒ在辣 椒 基 因组 中分 布 比 Ｓ
建 立奠定 了基 础。
关键 词
辣椒 ；Ｓ 纯度 Ｓ Ｒ；
辣 椒 （ ａｓ ｕ ｎｕ ．是我 国重 要 的蔬 菜 ， Ｃｐｉ ｍａ ｕｍＬ） ｃ Ｈ 也 是 重 要 的 调 味 品 ， 目前 我 国辣 椒 年 种 植 面 积 １０ １０万 ｈ 总 产值 ２０ ３０亿元 ，５ １ ０ ７ ０ｔ ２ 。随着育 种进 程 的加 快 ， 椒 品种急 辣 剧 增 多 ，优 质 杂交 种 的种类 和需 求 量 的 日益增 加 ，
记 录并 照相 。
碧 秀、 湘 佳 玉 、 湘探 春 及 其 它 们 的 父母 本 ， 福 福
共计 ３ ６份 。
１２方 法 ．
１ ． 辣椒总 Ｄ ．１ ２ ＮＡ 的提 取
纯 度 鉴 定 由于 样 本 较
２ 结 果 与分 析
２１ 引物筛选 与鉴 定 ．
大 ，如 何快 速 低成 本 提取 大 批 量 的 Ｄ Ａ成 为 本 实 Ｎ 验 的重点 和难点 ，本 文采 用简化 Ｃ Ａ Ｔ Ｂ法 提取 辣椒 的总 Ｄ Ａ， 只需 倒换 试 管一 次 ， 可 以获 得 高纯 Ｎ 且 便 度 、 产量 的 Ｄ Ａ。 高 Ｎ １ ． Ｐ Ｒ 反 应体 系 １ ．２ Ｃ ２ ０×Ｂ ｆｒ含 Ｍｇ ）． ｌ ｕ ｅ（ ｆ ２ １ ， ＋ ５
◆试验研究◆
２ １ 年第 １ ００ 期
辣椒杂志（ 季刊 ）
利用 Ｓ Ｒ分子标记建立辣椒纯度鉴定体 系 Ｓ
白 占兵 李 雪 峰 戴 雄 泽 ， ， ，
（ 湖南省蔬菜研 究所 湖南长沙 ４ ０２ ２湖南省蔬菜工程技 术研 究中心 湖南长沙 ４０ ２ ） １ １１５ １ １５
摘 要 从 １０对 辣椒 Ｓ Ｒ引物 中筛选 出 １ ６对 多态性较 好 的引物 ，对 兴蔬 种 业 的 １ ５ Ｓ １ ２个推 广辣 椒 品种 的 父本 、 本及 其 Ｆ 代 共 ３ 母 ６份材 料进 行 Ｐ Ｒ 差异 性筛选 ， 中 ６对 引物 能够 区分每 个 品种 的父本 、 Ｃ 其 母本 及其 Ｆ代 ； 同时对辣 椒 大群体 Ｄ Ａ 的快速 提取 、Ｃ Ｎ Ｐ Ｒ扩增 以及 制 胶 电泳 等进 行 了优 化 ， 步建立 了基 于 Ｓ Ｒ分 初 Ｓ 子标 记技 术 的辣椒 种 子纯度 鉴 定体 系。 为辣 椒 种 子纯度 鉴定 工 作者 提 供 了参考 ， 为 辣椒 种 子指 纹 图谱 的 也
１ 材料 与方 法
１１ 材 料 ．
Ｓ Ｒ分子标记可以鉴定掖单 ｌ 号种子纯度。 Ｓ ３ 利用分
子 标 记 鉴 定 水 稻 杂 交 种 的 纯 度 在 日本 已推 广 ； 目 前， 湖南农 业科 学 院已经 完善 建 立 了 Ｓ Ｒ分 子鉴 定 Ｓ
材料全部来 自于湖南兴蔬种业有限公司，分别 为： 博辣娇红 、 博辣红玉 、 博辣红牛、 博辣红秀 、 兴蔬
收稿 日期 ：０ ０ ０ — ８ ２ １— ２ ０
基 金项 目： 湖南省科技公共平 台建设 专项 “ 春夏蔬菜产业提升关键技术研究 ”项 目编号 Ｋ ８ ２ ７— １ （ ０ ０ １２ ６ ） 作者简介 ： 白占兵（９ ７ ）男 ， １７ 一 ， 主要从事分子标记辅助育种
３ ２
辣椒杂志（ 季刊 ）
１ ｏ Ｌ ｄ Ｔ ．８ ５ １１ ｚ ｏ／ ０ｍｍ ｌ Ｎ Ｐ ０１ ７ ￣ ，０ Ｉ ｌ ／ ， Ｌ引 物 ０６ ｌ ｍ ． ，
使辣椒杂交种质量鉴定研究工作显得极其重要 。传 统鉴定一般采用 田间鉴定法 ， 其依赖于品种表型差 异 ， 大多 数形 态性 状 易受 环境 影 响 ， 而 地点 、 度 间 年
也 会表 现 出一 定程 度 的差 异 ， 重 的影 响 了 品种 纯 严 度 鉴定 的准确 性 ， 实性 。 真 随着分 子生 物学 技 术 的飞 速 发展 ， 子标 记 技 分 术 已成 为作 物 品种 真实 性 和纯度 鉴 定 的发 展方 向 。 目前 ，Ｓ Ｓ Ｒ分子 标 记技 术 在鉴 定 种子 纯 度方 面 已得 到广 泛应用 。其技术 原理是 从农 作物 中分离 出位点 特 异微卫 星 Ｓ Ｒ，然 后利用 两端 的独特 序列设 计 一 Ｓ 对 引物 ，利 用 Ｐ Ｒ扩 增微 卫星 的长 度多 态性 片段 ， Ｃ 以达到种子 纯度 鉴定 的 目的。 石海 波等 『 １ １ 报道用 Ｓ Ｒ Ｓ 标 记可 以鉴 别小 麦种 子 的纯 度 。姚凤 霞 等嘲 道用 报