Viral Envelope Protein 53R Gene Highly Specific
兽医微生物学与免疫学试题答案
兽医微生物学与免疫学试题（一）一、名词解释（每题2分）1、质粒质粒是染色体外的遗传物质，为双股环状DNA。
分子量比染色体小，可携带某些遗传信息2、LD50 ：能使实验动物在感染后一定时限内发生半数死亡的活微生物量或毒素量3、持续性感染：是指有些病毒感染机体后，可在受感染细胞内长期存在或终身带病毒，而且经常或反复间断地向外界排出病毒。
4、单克隆抗体在机体淋巴组织内可存在千百种抗体形成细胞(即B细胞)，每种抗体形成细胞只识别其相应的抗原决定簇，当受抗原刺激后可增殖分化为一种细胞群，这种由单一细胞增殖形成的细胞群体可称为细胞克隆(clone)。
同一克隆的B细胞可合成和分泌在理化性质、分子结构、遗传标记以及生物学特性等方面都是完全相同的均一性抗体，亦可称之为单克隆抗体。
5、细菌素某些细菌能产生一种仅作用于近缘关系细菌的抗生物质。
其抗菌范围窄，在细菌分型及流行病调查上具有一定意义6、毒力岛：毒力岛是指编码细菌毒力基因簇的分子质量比较大的染色体DNA 片段,其特点是两侧一般具有重复序列和插入元件,通常位于细菌染色体tRNA 位点内或其附近,不稳定,含有潜在的可移动元件,其基因产物多为分泌性蛋白或表面蛋白。
7、干扰素：是由病毒或诱生剂刺激人或动物有核细胞产生的糖蛋白，因能干扰病毒在非感染组织的复制，故称为干扰素。
8、抗原转变：指编码抗原的基因组重排引起的变异幅度大时，产生新的亚型，这种变异为质的改变，往往引起流感的世界大流行。
9、细胞病变效应：病毒在细胞内增殖引起的细胞变性、死亡、裂解等细胞损伤，称为病毒的细胞病变效应。
10、朊病毒是亚病毒中一类重要的感染因子，侵害动物与人类，传染性极强。
不具有病毒结构，主要由蛋白质构成，迄今尚无含有核酸的确切证据二、填空题（每空1分）1、细菌的基因转移包括：（接合）、（转化）、（转导）、（溶原性转换）。
2、病毒的主要化学组成为（蛋白质）、（核酸）、（脂质）、（糖类）。
3、在细菌繁殖曲线图中，细菌在（对数生长）期繁殖速度最快。
rpl基因组
rpl基因组RPL基因组RPL基因组是指编码核糖体蛋白L（Ribosomal Protein L）的基因组。
核糖体是细胞中合成蛋白质的关键器官，由不同的蛋白质和核糖核酸组成。
核糖体蛋白L是其中的一种，它在核糖体的正常功能中扮演着重要的角色。
RPL基因组是由多个RPL基因组成的，这些基因位于染色体上。
在人类基因组中，已经发现了超过80个RPL基因，这些基因被分布在不同的染色体上。
每个RPL基因编码一个特定的核糖体蛋白L。
RPL基因的序列是高度保守的，这意味着它们在不同物种中的序列有很高的相似性。
这种高度保守性反映了核糖体蛋白L在生物进化中的重要性和稳定性。
研究人员对RPL基因组进行了广泛的研究，发现它们在细胞的生长、分裂和蛋白质合成等过程中起着重要的作用。
通过研究RPL基因的表达模式和功能，科学家们可以更好地理解核糖体的合成机制以及与疾病相关的异常变化。
近年来，研究人员发现了一些与RPL基因组相关的遗传变异。
这些变异与一些疾病的发生和发展密切相关，如白血病、淋巴瘤等。
这些研究结果为人们进一步研究和治疗这些疾病提供了重要的线索。
RPL基因组的研究还揭示了核糖体蛋白L在细胞自噬、免疫应答等其他生物学过程中的作用。
这些发现有助于人们更好地理解细胞的生物学功能和疾病的发生机制。
随着基因组学和生物技术的不断发展，人们对RPL基因组的研究将更加深入。
通过对RPL基因组的深入研究，我们将能够更好地理解核糖体的结构和功能，揭示核糖体与疾病之间的关联，并为新型治疗方法的开发提供新的思路和靶点。
RPL基因组是编码核糖体蛋白L的基因组，它在细胞的正常功能、疾病的发生和发展等方面起着重要的作用。
对RPL基因组的研究将有助于人们更好地理解核糖体的合成机制、细胞生物学过程以及疾病的发生机制。
随着科学技术的不断进步和发展，相信我们对RPL 基因组的研究会取得更多重要的突破和进展。
干扰素
IRF-5 IRF-6 IRF-8/ICSBP
IRF-9/ISGF3r various tissues vIRFs (1-4)
Type I Interferons:
Human IFN-α: Induced by dsRNA via TLR3 Auto-induction Transcription factors IRF-3, IRF-5, IRF-7 Does not appear to require c-Jun.
Toll-like receptor pairs
Cell surfaces a. b. c. d. TLR-1/TLR-2 -bacterial lipopeptides and GPI-anchored proteins in parasites; TLR-2/TL6 - lipoteichoic acid from grampositive cell walls and zymosan from fungi; TLR-4/TLR-4 -LPS from gram-negative cell walls TLR-5* - bacterial flagellin
Adaptive
Delayed (1-2 weeks)
The innate immune responses are •present from birth •non-specific •do not become more efficient over time (but there is evolutionary selection)
进展
1.干扰素产生与TLR和RLR相关； 2.干扰素的产生受调控； 3.干扰素的信号通路及效应机制； 3. 病毒可以逃逸干扰素的作用； 4.干扰素如何应用与临床实践。
分子生物学习题答案
练习一参考答案一、名词解释1．中心法则答：central dogma，指遗传信息从 DNA 传递给 RNA，再从 RNA 传递给蛋白质的转录和翻译的过程。
遗传信息可以通过复制、转录或逆转录在 DNA 和DNA 之间或 DNA 和 RNA 之间传递，但是从核酸到蛋白的信息传递是单向的。
这是生物体遗传信息传递所遵循的基本法则。
2．核酶答：ribozyme，核酶一词用于描述具有催化活性的 RNA, 即化学本质是核糖核酸(RNA), 却具有酶的催化功能。
核酶的发现对于所有酶都是蛋白质的传统观念提出了挑战。
3．泛素答：ubiquitin，泛素是一种 76 氨基酸的多肽，可以在三种酶（E1，E2， E3）的催化下共价连接到把蛋白的 Lys ε-NH2，并进一步通过多泛素化，介导靶蛋白被蛋白酶体降解。
4．端粒酶答：telomerase，端粒酶是一种核糖核酸蛋白酶，由 RNA 和蛋白质构成，具逆转录活性，能够以自身的RNA 为模版，通过多次互补配对，延长染色体端粒3’末端。
5．信号肽答：signal peptide，指新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移（定位）的 N-末端的氨基酸序列（有时不一定在 N 端），至少含有一个带正电荷的氨基酸，中部有一高度疏水区以通过细胞膜。
大多数信号肽跨膜后被切除。
6．Intron答：内含子，内含子是基因内的可以被转录，但是在转录后的 RNA 加工加工过程被切除的部分，它不出现在成熟的 RNA 分子中。
大多数真核生物的基因都有内含子。
7．Shine-Dalgarno Sequence答：SD 序列，在原核 mRNA 上起始密码子 AUG 上游 4~13 个核苷酸处一段富含嘌呤的序列，可与16SrRNA 上的一段嘧啶丰富区域通过碱基互补结合，是原核 mRNA 和核糖体小亚基结合位点。
8．Okazaki Fragments答：冈崎片段，DNA 复制过程中，在后随链的复制是不连续的，首先形成DNA 短片段（1000-2000 碱基），这些片段被称为冈崎片段，它们随后被共价连接成完整的后随链。
15523660_空肠弯曲菌PEBIA蛋白的原核表达及间接ELISA方法的建立
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空肠弯曲菌 5EQ$@ 蛋白的原核表达及 间接 EL)M@ 方法的建立
着至关重要的作用"这 可 能 是 病 原 体 在 宿 主 体 内 获 得 碳 源 的 重 要 方 式 # (4) 因 此"空 肠 弯 曲 菌 C=&!; 蛋白对于该菌的致病性研究及检测具有重要意义#
目前"对 空 肠 弯 曲 菌 的 检 测 方 法 主 要 是 常 规 生 化 方 法(+)$C#9(6)$实 时 荧 光 定 量 C#9(0)$C#9? =B%D;(/)$.JKLE<KHQC#9(!8)$B;.C(!!)$核 酸 探 针$ 蛋 白 质 组 学 等 方 法 # 这 些 方 法 在 特 异 性 $灵 敏 度 $检 测 限 等 方 面 虽 然 能 满 足 要 求 "但 仍 有 一 些 局 限 性 "如 耗时较长"操作复 杂"需 要 特 殊 仪 器"无 法 实 现 大 量 样品的 快 速 筛 选# 在 病 原 的 血 清 学 诊 断 当 中" =B%D; 检测方法的敏感性$特 异 性 及 高 效 性 均 较 为 突出#以重组蛋白作为特异性抗原所建立的病原抗 体的检测方法"比以 全 菌 为 抗 原 的 检 测 方 法 更 方 便 快捷且成本低廉 # (!") 因此"本 试 验 通 过 对 空 肠 弯 曲 菌 C=&!; 蛋白 进 行 可 溶 性 原 核 表 达"建 立 血 清 中 空肠弯曲菌抗体的间接 =B%D; 检测方法"可实现对 大量样品的快速检 测"为 进 一 步 防 制 空 肠 弯 曲 菌 腹 泻提供参考依据#
基因名称斜体
基因名称斜体基因名称：TP53TP53是一种编码蛋白质的基因，其产物为p53蛋白。
p53蛋白在细胞中具有重要的调控作用，能够促进DNA修复、细胞周期阻滞、凋亡等过程，从而维护细胞的稳态。
本文将从以下几个方面对TP53进行详细介绍。
1. TP53的基本信息TP53基因位于人类染色体17p13.1位置，由11个外显子和10个内含子组成。
该基因编码393个氨基酸的p53蛋白，分子量约为43kDa。
p53蛋白包含一个N末端转录激活结构域（TAD）、一个核定位信号（NLS）、一个DNA结合结构域、一个富含亮氨酸重复序列（LXXLL）的C末端反应性区域以及一个Oligomerization Domain（OD）。
2. TP53的生物学功能2.1 p53在DNA损伤修复中的作用当细胞遭受DNA损伤时，p53可以通过直接与DNA结合或与其他蛋白质相互作用来介导DNA修复过程。
例如，在双链断裂修复中，p53可以与DNA损伤响应蛋白ATM相互作用，从而激活DNA修复途径。
2.2 p53在细胞周期调控中的作用p53还能够通过调节细胞周期来维护细胞的稳态。
当细胞遭受DNA损伤时，p53会通过抑制CDK（Cyclin-Dependent Kinase）活性和下调Cyclin D1等促进细胞周期进程的因子来阻止细胞进入S期，从而给予细胞足够时间进行DNA修复。
2.3 p53在凋亡中的作用当发生严重的DNA损伤时，p53可以通过促进凋亡来消除受损细胞。
p53会引起Bax、PUMA等凋亡相关基因表达上调，从而导致线粒体膜电位下降、释放出Cyt c等促进凋亡的因子。
3. TP53与疾病的关系由于p53在维持基因组稳态和保护机制中扮演着重要角色，TP53突变与多种疾病密切相关。
例如，在多种肿瘤中均发现了TP53基因突变或缺失。
此外，一些遗传性疾病也与TP53突变相关，例如LFS（Li-Fraumeni综合征）和CNS（Choroideremia-Nephropathy Syndrome）等。
植物SNARE 蛋白的结构与功能
植物学通报 2005, 22 (6): 715￣722 Chinese Bulletin of Botany专题介绍植物 SNARE 蛋白的结构与功能①鲍永美 王州飞 张红生 ②(南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室 南京 210095)摘要在真核生物细胞囊泡运输过程中的膜融合主要是由SNARE蛋白介导的, SNARE蛋白的结构高度保守。
研究发现, 植物中的SNARE蛋白促进植物细胞板形成, 能与离子通道蛋白相互作用, 有利于 植物的正常生长发育, 能提高植物的抗病性及参与植物的向重力性作用。
应用基因组学和蛋白质组学 技术结合细胞学水平上的分析方法有助于深入揭示植物SNARE蛋白家族成员的功能, 明确SNARE蛋 白在信号转导途径中的作用, 阐明动植物免疫系统的区别和联系。
关键词 SNARE蛋白, 结构, 功能Structure and Function of SNAREs in PlantBAO Yong-Mei WANG Zhou-Fei ZHANG Hong-Sheng②(State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095)AbstractThe membrane fusion in vesicle trafficking in the cells of eukaryotic organisms ismediated by soluble-N-ethyl-maleimide-sensitive fusion protein attachment protein receptor (SNARE) proteins, which are highly conserved in their structures from various species, including yeast, animals and plants. Increasing research has demonstrated many tissue- or subcellularspecific components of SNAREs involved in the formation of the cell plate, interacting with ion channel proteins, and gravity sensing in plants. SNARE proteins might play important roles in plant growth, development and response to abiotic and biotic stresses. The application of genomics and proteomics approaches, as well cytological methods, will accelerate our understanding of diverse functions of the plant SNARE family and their specific location in the signal transduction pathway, and the differentiation and relation between animal and plant immunity systems. Key words SNARE protein, Structure, Function 植物细胞内可溶性物质的运输主要是通 过细胞内的囊泡(vesicles)在不同细胞器膜结 构间穿梭运输而实现(Sanderfoot et al., 1999), 囊泡充当了整个系统的运输工具。
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ViralEnvelopeProtein53RGeneHighlySpecificSilencingandIridovirusResistanceinFishCellsbyAmiRNA
Yu-SinKim1,2.,FeiKe1.,Xiao-YingLei1,RongZhu1,Qi-YaZhang1*1StateKeyLaboratoryofFreshwaterEcologyandBiotechnology,InstituteofHydrobiology,ChineseAcademyofSciences,Wuhan,China,2CollegeofLifeScience,KimIlSungUniversity,Pyongyang,DemocraticPeople’sRepublicofKorea
AbstractBackground:Envelopeprotein53RwasidentifiedfromfrogRanagryliovirus(RGV),amemberofthefamilyIridoviridae,and
itplaysanimportantroleinthevirusassembly.Althoughinhibitionofiridovirusmajorcapsidprotein(MCP)bysmallhairpinRNAs(shRNAs)hasbeenshowntocauseresistancetoviralinfectioninvitro,RNAinterference(RNAi)toinhibitaquaticanimalvirusenvelopeproteingeneproducthasnotbeenreported.
Methodology:WedevisedartificialmicroRNAs(amiRNAs)thattargetaviralenvelopeproteingeneRGV53R.By
incorporatingsequencesencodingamiRNAsspecificto53RofRGVintopre-miRNA155(pSM155)vectors,whichusethebackboneofnaturalmiR-155sequenceandcouldintracellularlyexpress53R-targetedpre-amiRNAs.Thepre-amiRNAscouldbeprocessedbytheRNaseIII-likeenzymeDicerinto21–25ntamiRNAs(amiR-53Rs)infishcelllines.Thelevelsof53Rexpressionwereanalyzedthroughreal-timePCRandRGVvirionsassemblywereobservedbyelectronicmicroscopyinfishcellstransfectedwithorwithoutamiR-53Rsat72hofRGVinfection.
Conclusion/Significance:TheresultsarguethatviralenvelopeproteinRGV53Rcanbesilencedandthevirionsassembly
wasdeficientbyamiR-53R-1,andfurtheridentifiedthefirstamiRNAofenvelopeproteingenefromiridovirusthatwasabletocauseresistancetovirusinfectioninfishcells.Thedatademonstratethattheviralinfectionisefficientlysuppressed(58%)byamiR-53R-1targetingpositon36–57ofRGV53R.Moreover,electronmicroscopicobservationsrevealedvirionassemblydefectorreducedvirionsassemblycapacitywascloselycorrelatedtoexpressionofamiR-53R-1.BasedonrealtimePCRoftheMxgene,wefoundnoevidenceofactivationofIFNbyamiR-53R-1.
Citation:KimY-S,KeF,LeiX-Y,ZhuR,ZhangQ-Y(2010)ViralEnvelopeProtein53RGeneHighlySpecificSilencingandIridovirusResistanceinFishCellsbyAmiRNA.PLoSONE5(4):e10308.doi:10.1371/journal.pone.0010308
Editor:AlfredLewin,UniversityofFlorida,UnitedStatesofAmericaReceivedNovember15,2009;AcceptedMarch31,2010;PublishedApril23,2010Copyright:ß2010Kimetal.Thisisanopen-accessarticledistributedunderthetermsoftheCreativeCommonsAttributionLicense,whichpermitsunrestricteduse,distribution,andreproductioninanymedium,providedtheoriginalauthorandsourcearecredited.
Funding:ThisworkwassupportedbygrantsfromtheNationalMajorBasicResearchProgram(2009CB118704,2010CB126303),theNationalNaturalScienceFoundationofChina(30871938,30800854),AgricultureCommonwealScientificResearchPlan(200803013)andChinaPostdoctoralScienceFoundation(20080440975).Thefundershadnoroleinstudydesign,datacollectionandanalysis,decisiontopublish,orpreparationofthemanuscript.
CompetingInterests:Theauthorshavedeclaredthatnocompetinginterestsexist.*E-mail:zhangqy@ihb.ac.cn.Theseauthorscontributedequallytothiswork.
IntroductionIridovirusesareoneofthesignificantviralpathogensforaquaticanimalsthathavecausedgreateconomiclossesintheaquacultureindustryworldwide[1].Ranagryliovirus(RGV),amemberofiridoviruses,causessystemicinfectiousiridoviraldiseaseinculturedpigfrog(Ranagrylio)[2].SomeRGVgenesandtheirfunctionshavebeenidentified,includingdeoxyuridinetriphos-phatase(dUTPase),thymidinekinase(TK),3b-hydroxysteroiddehydrogenase(3b-HSD)andERV1(essentialforrespirationandvegetativegrowth1)[3–6].Recently,anenvelopeproteinthatmayplayanimportantroleinvirusassembly,RGV53R,wasidentifiedandcharacterizedfromRGV.RGV53Rhashomo-loguesinallsequencediridoviruses.ThestructuralconservedfeaturessharedbyiridovirusenvelopeproteinswerealsofoundinRGV53R.TheintracellulardistributionanddynamicchangesofRGV53Rrevealedthatitco-localizedwiththeERcomponentsatearlystageofposttransfection[7].Therefore,RGV53Rwas
selectedforfurthercharacterizationtounderstandthemolecularpathogenesisandgenesilencingbyartificialmicroRNAs(amiRNAs)inRGVinfection.DiscoveryoftheRNAinterference(RNAi)pathwayhasledtoexcitingnewstrategiesfordevelopingtreatmentforviraldiseases[8].Todate,siRNAsandmiRNAshavebeenusedforsilencingexpressionofthemajorcapsidprotein(MCP)encodedbytigerfrogvirus(TFV)andredseabreamiridovirus(RSIV),twoiridoviruscausingseverediseaseinaquaticanimals[9–11].ButtheenvelopeproteinofiridovirushasnotbeendemonstratedasatargetforRNAiaswellasMCP.RNAinterferenceisaprocessofpost-transcriptionalsequencespecificgenesilencinginmanyeukaryotes.TheuseofRNAitoinhibitvirus,includingsiRNAsandmiRNAs,offersanewapproachforcontrollingviralinfections[12,13].ArtificialmiRNAs(amiRNAs)expressionplasmidvectorssuchaspre-miRNA155-designedshRNAsvectors(pSM155)whichweredesignedtotargetonORFofendogenousandexogenousgeneshavebeendevelopedandusedforRNA