蛋白质组学在肿瘤研究中的应用

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组学技术在疾病诊断和治疗中的应用

组学技术在疾病诊断和治疗中的应用

组学技术在疾病诊断和治疗中的应用随着科技的迅速发展,组学技术在医学领域中的应用越来越广泛。

组学技术包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等。

利用这些技术,可以深入了解疾病发生的机制,帮助医生进行精确定位诊断,以及开发更加个性化的治疗方案。

以下将从四个方面介绍组学技术在疾病诊断和治疗中的应用。

一、基因组学基因组学是对生物体内所有基因组成的研究,它将疾病的发生和基因变异联系在一起。

目前,许多先进的基因组技术被用于疾病的诊断和治疗中。

例如,基因测序技术可以扫描一个人的基因组,找出与某种疾病相关的基因变异,为诊断和治疗提供依据;单细胞测序技术可以帮助发现病原体、肿瘤细胞等少量细胞的变异信息,进一步加深对疾病的理解;干细胞技术可以提供一种研究基因组功能、疾病模型及新药开发的有效工具。

这些技术的应用,有望为疾病的早期诊断、治疗及新药开发提供更多可能。

二、转录组学转录组学是对细胞内所有RNA转录产物(包括mRNA、lncRNA、miRNA等)的研究,它可以反映出基因在特定条件下的表达情况。

研究显示,肿瘤细胞的基因表达方式会发生变化,因此转录组学技术可以帮助诊断各种类型的癌症。

例如,通过测量肿瘤细胞和健康细胞的转录谱差异,可以确定具有诊断意义的生物标志物,并用于癌症的早期诊断。

同时,转录组学技术也可以为新药研发提供帮助,利用这些技术,可以确定靶标基因,筛选优异的药物候选物。

三、蛋白质组学蛋白质组学是对细胞内所有蛋白质的研究。

蛋白质是生物体内的重要物质,很多疾病的发生是由于蛋白质异常造成的。

例如,肿瘤、心血管疾病、神经系统疾病都涉及蛋白质的异常变化。

利用蛋白质组学技术,可以分析出数以万计的蛋白质之间相互作用的网络,找出具有治疗可能的蛋白质标靶。

蛋白质组学还可以用于诊断某种疾病的风险,以及为特定疾病患者制定个性化的治疗方案。

四、代谢组学代谢组学是对生物体所有代谢产物的研究。

代谢组学的应用可以帮助医生了解某些疾病的生化过程,进而确定患者的诊断和治疗方案。

组学研究在临床医学中的应用

组学研究在临床医学中的应用

组学研究在临床医学中的应用近年来,人类对生命科学的探索和研究已经进入了一个崭新的阶段。

在这里,组学研究成为了各个领域的研究者们的热点方向之一。

随着基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多个领域的开拓与深入,组学研究在临床医学中的应用越来越广泛,为人类健康事业带来了无限的可能。

一、基因组学在临床医学中的应用在人类基因组计划的带动下,基因组学得到了广泛的应用。

特别是在肿瘤领域的研究中,基因组学对癌症的预后和治疗起到了重要的作用。

目前,许多癌症的基因突变都被发现,如肺癌、乳腺癌、胃癌、大肠癌等。

在这些疾病中,基因组学可以帮助医生确定治疗方案,以更好地对病人进行治疗。

例如,EGFR突变在肺癌中非常常见,而且是可以靶向治疗的,可以选择口服的靶向药物来治疗。

此外,基因组学还可以在体外诊断某些疾病,例如新生儿先天性遗传病、染色体异常等。

二、转录组学在临床医学中的应用转录组学是研究细胞转录物的领域。

通过对不同组织和生长阶段的细胞的转录谱进行分析,可以了解RNA表达和调控在生命过程中的作用。

在临床医学中,转录组学可以诊断一些疾病。

目前,转录组学在癫痫和免疫疾病的研究上较为成熟,它可以通过分析基因的表达变化,帮助医生确定患者的治疗方案。

此外,转录组学也可以用于新药的开发过程中。

通过研究药物与特定细胞和基因的相互作用,可以更好地设计和优化药物,以更好地适应患者的临床需求。

三、蛋白质组学在临床医学中的应用蛋白质是生命体系中最基本的成分之一。

人体内的生物大分子,如酶、激素、抗体等都是蛋白质,它们都扮演着不同的功能和作用。

在临床医学中,蛋白质组学可以通过扫描和分析蛋白质的异质性,预测病情的进展和治疗的效果。

例如,通过蛋白质组学,可以确定某种蛋白质的表达量,从而预测疾病的预后。

此外,蛋白质组学对于新药的开发也很有帮助,它可以通过分析蛋白质的结构和功能,帮助制药企业更好地设计和制造药物,使它们更加适应患者的需求。

四、代谢组学在临床医学中的应用代谢组学是研究生物体内代谢产物的组成和变化的领域。

基于分子生物学技术的癌症分子诊断和治疗研究

基于分子生物学技术的癌症分子诊断和治疗研究

基于分子生物学技术的癌症分子诊断和治疗研究癌症是一种非常复杂的疾病,它的发生和发展涉及到基因、蛋白质、细胞、组织等多个层面。

传统的治疗方式主要包括手术、化学治疗和放射治疗等,但是这些方法都有各自的限制和缺陷。

近年来,基于分子生物学技术的癌症分子诊断和治疗研究越来越受到关注,因为它可以更加精准地确定癌症的类型、分级和风险,同时还可以提供更加个性化的治疗方案。

一、分子生物学技术在癌症诊断中的应用分子生物学技术主要包括DNA测序、蛋白质组学、代谢组学和细胞组学等,这些技术可以用来研究癌症的发生机制、诊断标志物和靶向治疗靶点等。

DNA测序是一种用来检测基因序列的技术,通过对癌症患者的基因组进行测序,可以发现与癌症发生有关的基因突变和拷贝数变异等。

这些异常都可以作为癌症的诊断标志物,同时还可以为治疗提供依据。

比如说,EGFR基因突变在肺癌中非常常见,如果检测到了这个基因的突变,就可以选择使用EGFR靶向药物进行治疗。

此外,DNA测序还可以用来判断癌症的分级、预测预后和监测治疗反应等。

蛋白质组学是一种研究蛋白质表达谱的技术,通过对癌症患者的肿瘤组织或者体液进行蛋白质组学分析,可以鉴定出与癌症发生和发展有关的蛋白质标志物。

这些标志物不仅可以用来诊断癌症,还可以作为药物研发和治疗评价的依据。

比如说,HER2蛋白在乳腺癌中非常重要,如果HER2表达过量,就可以使用HER2靶向药物进行治疗。

代谢组学是一种研究代谢产物谱的技术,通过对癌症患者的体液进行代谢组学分析,可以发现与癌症发展相关的代谢异常。

这些异常可以作为癌症的诊断标志物,还可以为治疗提供依据。

比如说,癌症患者的血液中会出现一些代谢产物的变化,比如谷氨酸和精氨酸等,这些变化既可以用来判断癌症的类型,也可以用来评估治疗效果。

细胞组学是一种研究细胞形态和结构的技术,通过对癌症患者的肿瘤组织进行细胞组学分析,可以发现与癌症发生和发展相关的形态学变化。

比如说,肝癌患者的肝细胞会呈现典型的异型增生和不同程度的细胞核异型性,这些变化可以作为癌症的诊断标志物,还可以用来判断癌症的分级和预后。

多组学方法在医学研究中的应用

多组学方法在医学研究中的应用

多组学方法在医学研究中的应用在过去的几年中,多组学方法在医学研究中的应用越来越广泛。

多组学方法将不同层面的信息进行整合和分析,如基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等,以期发现更深入和全面的生物学信息,从而为疾病的早期诊断和治疗提供更多的线索。

本篇文章将总结多组学方法在医学研究中的应用及其优点。

1. 转录组学转录组学是指通过对人体的RNA进行测序和分析,研究基因转录的调控机制及其在疾病发生、发展和治疗中的作用。

在癌症研究中,转录组学被广泛应用,包括在肿瘤细胞中查找有意义的新基因和开关分子,比较肿瘤组织和正常组织的基因表达差异,以及研究药物在治疗癌症中调节基因表达的机制。

2. 蛋白质组学蛋白质组学是对蛋白质进行高通量、系统化的测定和分析,旨在了解蛋白质之间的相互作用,蛋白质在细胞中的定位及其在疾病生理和生化过程中的作用。

蛋白质组学在新药研究中也有重要地位,可以帮助了解新药作用的靶位和药效,从而更好地进行药物设计和开发。

3. 代谢组学代谢组学是指对生物体内所有化合物的种类和量进行定量分析,从而研究代谢反应的调节和代谢产物在疾病发生和发展中的作用。

代谢组学在研究疾病早期诊断和评估中也有重要地位,例如通过测定血液中的代谢产物来检测癌症等疾病的发生和进展。

4. 基因组学基因组学是通过对人体基因组进行分析和比较,研究基因的分布、变异和调控机制,以期推进对疾病发生、发展和治疗的认识和理解。

基因组学被广泛应用于人类遗传学、疾病机制和新药研究等领域。

总的来说,多组学方法不仅能够帮助我们了解生物学的深层信息,还可以在疾病预防、早期诊断和治疗中起到重要作用。

与传统的单组学方法相比,多组学方法更加全面、深入,可以更好地进行系统分析和综合解读,从而为疾病的治疗和防治提供更多的线索和可能性。

未来,在多组学方法的不断发展和完善下,我们相信可开创出更为广阔的医学研究新领域。

分子生物学前沿(一)2024

分子生物学前沿(一)2024

分子生物学前沿(一)引言概述:分子生物学是研究生物体内生物大分子如DNA、RNA和蛋白质以及其相互作用的学科领域。

近年来,随着技术的不断进步和新的研究方法的出现,分子生物学进入了一个前所未有的前沿阶段。

本文将探讨分子生物学的五个前沿领域,包括基因组编辑、表观遗传学、蛋白质组学、CRISPR技术以及单细胞测序。

一、基因组编辑1. CRISPR-Cas9系统的原理和应用2. TALEN和ZFN技术的优势与局限性3. 基因编辑在疾病治疗中的潜力4. 基因修饰在农业领域的应用5. 基因组编辑的道德和伦理问题二、表观遗传学1. DNA甲基化和染色质重塑2. 表观遗传修饰对基因表达的调控3. 表观遗传学在疾病治疗中的作用4. 可逆性表观遗传变化的研究进展5. 表观遗传学与环境因素的关联研究三、蛋白质组学1. 蛋白质组学的研究方法和技术2. 大规模蛋白质互作网络的构建与分析3. 蛋白质定量与定位的新方法4. 蛋白质组学在疾病研究中的应用5. 蛋白质药物研发的新进展四、CRISPR技术1. CRISPR在基因治疗中的应用2. CRISPR用于疾病模型建立的优势3. CRISPR修饰哺乳动物基因组的技术挑战4. CRISPR技术的新进展和改进5. CRISPR应用的道德和安全性问题五、单细胞测序1. 单细胞测序技术的原理和方法2. 单细胞测序在发育生物学中的应用3. 单细胞测序揭示人体组织和器官的异质性4. 单细胞测序在肿瘤研究中的突破5. 单细胞测序的数据分析方法和挑战总结:分子生物学在基因组编辑、表观遗传学、蛋白质组学、CRISPR 技术以及单细胞测序等前沿领域取得了重要突破。

这些研究对于理解生命的基本机制、疾病的发生发展以及药物研发具有重要意义。

然而,这些领域仍面临着许多挑战,包括伦理道德问题、技术和方法的改进以及数据分析的挑战等。

随着进一步的研究和发展,分子生物学前沿领域将不断拓展我们对生物的认识和应用。

多组学分析在肿瘤研究中的应用

多组学分析在肿瘤研究中的应用

多组学分析在肿瘤研究中的应用引言肿瘤是一类恶性疾病,其发病机制及治疗方案一直备受科学家们关注。

随着科技的不断进步和应用,多组学分析技术逐渐得到应用,并在肿瘤研究中发挥着重要作用。

本文将介绍多组学分析技术以及其在肿瘤研究中的应用。

一、什么是多组学分析技术?多组学分析技术是指对一个或多个组织或细胞的DNA、RNA、蛋白质等多组学数据进行综合分析,以揭示其与生理、病理、环境等因素之间的关系。

多组学分析技术应用广泛,包括转录组学、蛋白组学、代谢组学等。

二、多组学分析技术在肿瘤研究中的应用1. 肿瘤分子分类多组学分析技术可以揭示肿瘤分子分类,即将肿瘤分成不同亚型,以便制定个性化治疗方案。

曾有研究对四种不同类型的乳腺癌进行基因表达谱分析,发现每种亚型的基因表达谱具有独特的特征,这表明亚型间的差异与疾病特征有关。

利用多组学分析技术进行肿瘤分子分类,可以帮助医生制定更加针对性的治疗方案,并提高治疗效果。

2. 肿瘤发生机制研究通过多组学分析技术可以揭示肿瘤的发生机制,进而找到相关的治疗方案。

例如,研究人员利用蛋白质组学技术对前列腺癌和正常组织进行比较,发现一些前列腺癌组织中的蛋白质含量与正常组织存在显著差异。

这些差异蛋白质的产生可能与前列腺癌的发生机制有关,进而可以找到相关治疗方案。

3. 肿瘤治疗效果监测通过多组学分析技术可以监测肿瘤治疗效果。

例如,研究人员利用代谢组学技术对腹腔肿瘤化疗前后进行比较,发现化疗前后代谢产物的数量和种类发生了变化,这意味着化疗对肿瘤的代谢产生了影响。

通过多组学分析技术可以监测治疗效果,以便更好地控制肿瘤的发展。

三、多组学分析技术的局限性1. 数据规模较大,分析难度较大。

多组学数据一般包含数以千计的变量,需要进行预处理和压缩,才能为后续分析做好准备。

2. 数据质量则是影响分析结果的关键因素之一。

为了保证结果的准确性和可信度,多组学数据的采集、存储和处理需要进行标准化,避免数据的噪声和误差。

分子生物学技术在癌症诊疗中的应用

分子生物学技术在癌症诊疗中的应用

分子生物学技术在癌症诊疗中的应用引言癌症作为一种挑战包括所有科学领域的大疾病,每年都会导致数百万人死亡。

近年来,尤其是分子生物技术的发展,对癌症的诊断和治疗开辟了新的途径。

分子生物学技术可用于癌症的早期诊断、预测患者治疗反应以及设计个性化治疗方案。

在这篇文章中,我们将讨论分子生物学技术在癌症诊疗中的应用。

1. 基因测序技术的应用人类基因组已被测序完毕并已发表,这是基因测序技术的成功范例。

通过测序研究,我们了解了有关肿瘤基因的重要信息,因此可以更好地研究这些肿瘤,并更好地设计治疗方案。

例如,通过肿瘤基因检查,我们可以预测患者是否具有某些突变基因,从而确定治疗方案、预测疗效并设计个性化治疗方案。

2. 转录组学的应用转录组学是研究基因表达的新方法,它可以帮助研究人员更好地了解肿瘤细胞的基因表达模式。

通过生物信息学和大规模计算,我们可以对转录组学数据进行分析,从而找到一些与癌症发生、进展及治疗相关的分子标志物。

此外,我们还可以通过设计合适的siRNA来抑制某些癌症相关的基因,并观察这些siRNA是否具有治疗作用。

3. 蛋白质组学的应用蛋白质组学是研究蛋白质在生物过程中的表达、定位、功能以及它们之间的相互作用。

和转录组学一样,蛋白质组学可以为癌症诊断和治疗提供新的思路。

目前,已经研发出了一些可以快速筛选大量蛋白质的技术,例如质谱分析技术、蛋白质芯片技术等。

通过这些技术,我们可以更好地了解癌细胞产生何种蛋白质并发掘新的分子标志物。

4. DNA芯片技术的应用DNA芯片技术可用于检测一组与癌症相关的基因,从而帮助研究人员确定诊断和治疗的基础。

其中远程DNA芯片技术可用于诊断某些晚期癌症。

该技术可以检测患者体内癌细胞释放的肿瘤特异性DNA,这些DNA片段被称为访问DNA(ctDNA)。

通过血液检测,我们可以测定ctDNA的水平,从而预测癌症治疗的反应和进展状态以及进行高度个性化的治疗方案设计。

结论分子生物学技术对癌症的早期诊断、治疗反应预测以及个性化治疗方案设计提供了新的思路和方法。

肿瘤的蛋白质组的基本操作流程

肿瘤的蛋白质组的基本操作流程

肿瘤的蛋白质组的基本操作流程肿瘤的蛋白质组研究是深入了解肿瘤生物学和发展个体化治疗的重要手段之一。

研究肿瘤蛋白质组的基本操作流程可以分为样本采集、蛋白质提取、质谱分析和数据分析等几个主要步骤。

1. 样本采集样本采集是研究肿瘤蛋白质组的第一步,样本的选择和采集方式直接影响后续的实验结果。

常用的样本来源包括组织样本、血液样本和细胞培养物等。

组织样本可以通过手术获取,血液样本可以通过采集患者的外周血,细胞培养物可以通过培养肿瘤细胞株获得。

采集样本时需要注意样本的保存条件,以保证蛋白质的完整性和稳定性。

2. 蛋白质提取蛋白质提取是从样本中提取目标蛋白质的过程。

常用的蛋白质提取方法包括细胞裂解和蛋白质溶解等。

细胞裂解是将样本中的细胞破裂释放出蛋白质,可以通过机械方法(如超声波破碎)、化学方法(如离子溶液)或酶解等方式进行。

蛋白质溶解是将蛋白质从样本中溶解出来,可以使用蛋白质溶解缓冲液进行。

蛋白质提取的目标是获得高纯度、高浓度的蛋白质溶液,以便后续的质谱分析。

3. 质谱分析质谱分析是研究蛋白质组的关键步骤,通过质谱仪器对蛋白质样本进行分析,获得蛋白质的质量、结构和功能等信息。

常用的质谱分析方法包括质谱图谱分析和质谱定量分析。

质谱图谱分析是通过质谱仪器对蛋白质进行离子化、分离和检测,获得蛋白质的质谱图谱。

质谱定量分析是通过质谱仪器对样本中不同蛋白质的信号强度进行统计和比较,得出蛋白质的相对或绝对含量。

4. 数据分析数据分析是质谱分析的重要环节,通过对质谱数据的处理和解读,可以获得有关肿瘤蛋白质组的丰富信息。

数据分析的方法包括蛋白质鉴定、差异分析和功能注释等。

蛋白质鉴定是将质谱数据与数据库中已知蛋白质的质谱图谱进行比对,确定质谱数据中的蛋白质身份。

差异分析是比较不同样本间蛋白质组的差异,筛选出与肿瘤发生发展相关的差异蛋白。

功能注释是对已鉴定的蛋白质进行生物学功能和通路分析,揭示肿瘤发生发展的潜在机制。

肿瘤的蛋白质组研究的基本操作流程包括样本采集、蛋白质提取、质谱分析和数据分析等几个关键步骤。

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・2198・ [1O] [12] [13] [14] [15] [16] J Clin Microbiol,2004,42(1):65—72. Gilburd B.Autoantibodies profile in the sera of patients with Sjogren ̄syndmme:the ANA evaluation—a homogeneous,multi— plexed system[J].Clin Dev Immunol,2004,11(1):53—56. Shovman 0.Multiplexed AtheNA multi—lyte immunoassay for ANA screening in autoimmune diseases[J].Autoimmunity, 2005,38(1):105—109. Avaniss—Aghajani E,S Be ̄on,ASarkissian.Clinical value of multiplexed bead——based immunoassays for detection of autoanti-- bodies to nuclear antigens[J].Clin Vaccine Immunol,2007,14 (5):505—509. Schmitt M.Bead—based multiplex genotyping of human papillo— maviruses[J].J Clin Microbiol,2006,44(2):504—512. Ye F.Fluorescent micmsphere—based readout technology for mul- tiplexed human single nucleotide polymorphism analysis and bac- terial identification[J].Hum Mutat,2001,17(4):305—316. Dalva K.M Beksac.HIJA typing with sequence—specific oligonu— cleotide primed PCR(PCR—SSO)and use of the Luminex tech- nology[J].Methods Mol Med,2007,134:61—69. Baums IB.Luminex detection of fecal indicators in fiver samples, marine recreational water,and beach sand『J].Mar Pollut Bull, 囹综述囹 蛋白质组学在肿瘤研究中的应用 周勇军,侯敢,黄迪南,陈书勇 [17] [18] [19] [2O] [21] [22] M0DERN 0NC0L0GY.Dec.2008.V0I.16.N0.12 2007。54(5):521—536. Dunbar SA.Quantitative,multiplexed detection of bacterial patho— gens:DNA and protein applications of the Luminex LabMAP sys— tern[J].J Microbiol Methods,2003,53(2):245—252. Picketing JW.Comparison of a multiplex flow cytometrie assay with enzyme——linked immunosorbent assay for auantitation of an・- tibodies to tetanus,diphtheria,and Haemophilus influenzae Type b[J].Clin Diagn Lab Immunol,2002,9(4):872—876. Qj SZ.Genotyping of genital human papillomavims by DNA se- quencing and luminex methods[J].Zhongguo Yi Xue Ke Xue Yuan Xue Ban,2007,29(2):181—185. Studentsov YY.Enhanced enzyme—linked 4mmunosorbent assay for detection of antibodies to virus—-like particles of human papil・・ lomavims[J].J Clin Microbiol,2002,40(5):1755—1760. Waterboer T,P Sehr,M Pawlita.Suppression of non—specific binding in serological Luminex assays[J].J Immunol Methods, 2006,309(1—2):200—204. Martins T B.Heterophile antibody interference in a multiplexed fluorescent micmsphere immunoassay for quantitation of cytokines in human serum[J].Clin Diag Lab Immunol,2004,11(2):325 329. (编校:谭云) 

The applications of proteomics in tumor researches ZHOU Yong—jun,HOU Gan,HUANG Di—nan,CHEN Shu—yong Institute of Biochemistry and Molecular Biology,Guangdong Medical College,Zhanjiang 524023,China. 【Abstract】Proteomics is the study of constitution of all proteins and their dynamic changes in cells,tissues or or— gans.It quantitatively and dynamically studies an organism as a whole at the protein level and a complete protein li— brary will be established.By using proteomics technique to separate and identify the differentially expressed protein between tumor cells and normal origin cells,more tumor specific markers will be found.It can provide more research i— deas and theoretical basis to reveal the pathogenesis of tumors,tumor metastasis,drug resistance and tumor therapy. 【Key words】proteomics;tumor;diferentially expressed protein Modem Oncology 2008,16(12):2198—2202 

【指示性摘要】蛋白质组学是研究细胞、组织和器官内所有蛋白质的组成及其动态变化的科学,是在蛋白质水 平上定量、动态、整体地研究生物体,并建立完整的蛋白质文库。应用蛋白质组学技术分离鉴定肿瘤细胞与 常起源细胞之间的差异表达蛋白,可为寻找肿瘤的特异标志物,揭示肿瘤的发病机制,研究肿瘤转移、耐药机 制及肿瘤治疗等提供更多的研究思路和理论依据。 【关键词】蛋白质组学;肿瘤;差异表达蛋白 【中图分类号】R730.3 【文献标识码】A 【文章编号】1672—4992一(2008)12—2198—05 

【收稿日期】 【修回日期】 【基金项目】 【作者单位】 【作者简介】 

2oo7一l2—12 2oo8—03—07 广东省自然科学基金(编号:5011588);广东省自然科学基金(编号:04011397) 广东医学院生物化学与分子生物学研究所,广东湛江524023 周勇军(1982一),男,湖南邵阳人,硕士研究生,主要研究方向:肿瘤蛋白质组学。 现代肿瘤医学2008年l2月第16卷第l2期 肿瘤是严重威胁人类健康的高发病率和高死亡率疾病。 肿瘤的发生是在环境与遗传因素相互作用下,机体正常细胞 经多因素、多基因、多途径协同作用发生转化,失去原有的生 长分化调节而异常增生的结果。在这一癌变过程中,不论是 环境还是遗传因素,最终都必须通过基因及其相应的蛋白质 来发挥作用,基因的功能活动最终也要靠蛋白质来体现…。 由于在DNA—mRNA一蛋白质的过程中存在着转录后剪切 和翻译后的修饰加工及蛋白质合成后的转移定位等多种变 化,使得基因组DNA或mRNA的水平和状况并不完全代表 蛋白质的水平和状况 。因此,有必要从蛋白质整体水平来 揭示肿瘤的发生发展,阐明其癌变本质。应用蛋白质组学技 术进行肿瘤蛋白质组学研究,通过比较分析差异表达蛋白, 可以从组织或细胞蛋白质整体水平上揭示肿瘤的发生发展。 本文综述了近年来蛋白质组学技术应用于肿瘤研究的一些 进展。 1蛋白质组学的概念及肿瘤蛋白质组学研究的相关技术 1994年,澳大利亚科学家Wilkins和Willian首次提出蛋 白质组学的概念,其含义是指一个基因组、一种生物或一种 细胞/组织所表达的全套蛋白质,也可以说是指细胞、组织或 机体全部蛋白质的存在及其活动方式 。蛋白质组学是研 究细胞、组织和器官内所有蛋白质的组成及其动态变化的科 学,是在蛋白质水平上定量的、动态的、整体的研究生物体, 并建立完整的蛋白质文库,这对于了解生命现象的本质具有 重大意义。其研究领域主要包括三个方面:①蛋白质大规模 鉴定和转录后修饰的研究;②对肿瘤等疾病有广泛应用前景 的蛋白质表达水平的比较,即差异显示蛋白质组学;③应用 质谱技术和酵母双杂交技术对蛋白质间相互作用的研究。 随着蛋白质组学研究的不断深入,现已形成一个“肿瘤蛋白 质组学”的分支。肿瘤蛋白质组学可动态、整体、定量地观察 肿瘤发生、进展中蛋白质种类、数量的改变,现已广泛用于各 种肿瘤的研究。 肿瘤蛋白质组研究的发展主要依赖于三大技术的进步: ①双向凝胶电泳(two—dimensional electrophoresis,2一DE)分 析分离技术的发展,它是一种用于由细胞、组织或其他生物 样本中提取的复杂蛋白混合物分析的高效且广泛应用的检 测方法,也是目前常用的一种能分离大量蛋白质并进行定量 的方法 J,具有高通量、高灵敏度、高分辨率的特点 ;②电 喷雾质谱(electro spray ionization mass spectrometry,ESI—MS) 和基质辅助激光解吸飞行时间质谱(matrix—assisted laser desorption ionization of flight mass spectometry,MALDI—TOF— MS)技术的发明及在蛋白质分析中的成功应用,使具有极高 的灵敏度的质谱技术成为蛋白质组研究的核心工具,是目前 蛋白质组研究技术中最具活力和潜力的技术,其基本原理是 通过电离源先将样品分子离子化,再根据各离子间荷质比 (m/z)的差异分离蛋白质,并确定其分子量和PI等属性参 数 ]。③生物信息学,生物信息学技术由数据库、计算机网 络和应用软件组成,运用数学和信息学技术,组织和分析数 据,可用于蛋白质的结构预测、数据库建立及分析。目前蛋 白质组研究的主要方法之一是利用双向凝胶电泳来分离复 杂的蛋白组分,并利用专门的计算机软件对所得的图象进行 数据采集和分析,然后采用氨基酸组成分析、微量蛋白质序 列分析、质谱分析等技术,对从凝胶上回收的蛋白质斑点进 行精细的鉴定,获得有关蛋白质的等电点、分子量、数量、表 ・2199・ 达变化及翻译后加工等方面的大量信息。 2蛋白质组学在肿瘤研究中的应用 2.1 寻找肿瘤相关的特异性蛋白标志物 应用2一DE联合质谱可以鉴定分离肿瘤细胞与正常起 源细胞之间的差异表达蛋白,而这些差异蛋白点隐含着巨大 的生物学信息,其中一些特异性蛋白就是肿瘤的特异标记 物,因此2一DE联合质谱被广泛应用于发现新的标志物 。 肿瘤的早期发现是肿瘤防治中的关键,但肿瘤发生的早期常 常缺乏特定的症状,大多数恶性肿瘤被发现时已是晚期,并 伴有广泛的转移。因此找到合适的肿瘤标志物进行早期诊 断和治疗就显得尤为重要 。 结直肠癌是常见的恶性肿瘤之一,近年在我国的发病率 和死亡率也迅速上升,早期诊断和治疗是减少其死亡率的有 效途径。Roessler M等 应用双向凝胶电泳分析16例配对 的结直肠癌和邻近的正常组织样本。发现了735个表达差 异的蛋白质点,并采用质谱技术鉴定5种蛋白质在结直肠癌 中表达异常增高并经免疫印迹法证实,如B一转化生长因子 诱导蛋白IG—H3、烟酰胺一N一甲基转移酶、腺甙双磷酸激 酶等。再应用高敏感的免疫测定方法测定血清中的烟酰胺 

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