Synergy of DNA methylation and histone deacetylase inhibitors in the re-expression of RASSFIA an
基因突变和表观遗传变异
碱基类似物（5-BU）的掺入——转换
碱基类似物（2-AP）的掺入——转换
碱基类似物 （2-AP）的掺入 ——转换
(2) 2-氨基嘌呤(2-AP)也是碱基的类似 物，有正常状态和稀有状态两种异构体， 可分别与T和C配对结合。当2-AP掺入到 DNA复制中时，由于其异构体的变换而 导致A∶T G∶C
2.碱基的修饰剂 (1) 亚硝酸（introus acid, NA） (2) 羟胺 (3) 烷化剂，它们的作用是使碱基烷基化 3.DNA插入剂 原黄素（proflavin） 吖啶橙（acridine orange） 溴化3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶鎓 （etnidium bramide） ICR的复合物等
亚硝酸（introus acid, NA）有氧化脱氨作用， 可使G →黄嘌呤（X）仍和C配对，故不产生突变； 但C脱氨→ U，使C∶G转换成A∶T； A脱氨→次黄嘌呤H，使A∶T转换成G∶C。
碱基修饰剂的诱变作用
(1) 亚硝酸 (2) 羟胺 (3) MMS/EMS
（ 2 ）羟胺只特异地和胞嘧啶起反应，在 第4个C原子上加-OH，产生4-OH-C，此 产 物可以和A 配对，使C∶G转换成T∶A
பைடு நூலகம்
图 21- DNA 的体外定点突变
基于PCR 的体外定点突变
基于PCR 的体外定点突变
9.4 突变剂的检测
用 Ames法 检测诱变剂
突变和人类疾病
（一）自发突变和人类的疾病
一.重复序列异常所引起的遗传病 线粒体的脑脊髓病（mitochondlrial encephalomyopathies)是线粒体重复顺序之 间产生缺失所致。 脆性X染色体综合征 X-连锁脊髓和延髓肌娄缩，也称Kennedy’s症 强直性肌营养不良（Myotonic dystrophy）
DNA去甲基化与基因激活过程
万方数据万方数据万方数据图２ＤＮＡ去甲基化模型．图中包括目标摹因的识别，染色体重组，植物中的碱基切除修复系统．植物识别特异性目标并施行ＤＮＡ去甲基化，有Ｉ玎能足ｓｉＲＮＡ利用一种未知的ＤＮＡ去甲摹化复合物诱导ＤＮＡ去甲基化．也有可能包括染色体重组和／或碱基切除修复蛋Ｆｉ在接触和修复步骤中，孓甲基胞嘧啶被碱基切除系统切除甲摹摹团，很“ｒ能还伴随着染色体结构的改变．为了能让ＤＮＡ去甲基化蛋ｒＩ和转录机制接触目标基因。
染色体霞组因子和组蛋白修饰蛋白转化染色体为激活状态．在ＤＮＡ去甲基化的碱基切除修复系统进程中。
一种双功能ＤＮＡ糖苻酶ＤＭＥ或ＲＯＳＩ，利用其ＤＮＡ糖苷酶活性移除ｒ１个碱基，并利用其ＡＰ裂解酶活性切除脱碱基位点，得到的核苷酸缺几由未确认的ＤＮＡ多聚酶和ＤＮＡ连接酶完成填补工作．ＤＮＡ去甲基化和染色体重组后，目标基因开始表达．互作用也是一个重点。
关于脉孢菌和拟南芥的研究报道称，其组蛋白Ｈ３Ｌｙｓ９的甲基化影响ＤＮＡ的甲基化ｍ““。
最近的报道发现Ｈ２Ｂ的泛素化对ＤＮＡ的甲基化也有影响。
因此，一个有趣的问题是，究竟是染色体的状态影响了ＤＮＡ的去甲基化进程还是ＤＮＡ的去甲基化影响了染色体的状态改变，仍值得深入研究。
参考文献【ｌＪＣｈｒｉｓｔｏｆＮ．ＡｃｔｉｖｅＤＮＡｄｅｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎａｎｄＤＮＡｒｅｐａｌｒ［Ｊ】．Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ。
２００９．７７（Ｉ）：１一１１．【２１ＰｅｒｉｎｉＧ．ＴｕｐｌｅｒＲ．Ａｌｔｅｒｅｄｇｅｎｅｓｉｌｅｎｃｉｎｇａｎｄｈｕｍａｎｄｉｓｅｎｓｅｓ［Ｊ］．Ｃｌｉｎ｜ｆＩ｜ＪＣ＾■：啦Ｃ日％ｔ憾．可■＾ｔｏｄ酬ＥＳ日●Ｉ１０２ＴＡＣ－ｇ＿ＩＭ／￥５２Ｖ０１．２２ＮＯ．２墨驾Ｇｅｎｅｔ，２００６，６９（Ｉ）：Ｉ一７．【３】ＳｉｍｏｎｓｓｏｎｌＳ，ＧｕｒｄｏｎＪ．ＤＮＡｄｅｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎｉｓｎｅｃｅｓｓａｒｙｆｏｒｔｈｅｅｐｉｇｅｎｅｔｉｃｒｅｐｒｎｇｒａｍｍｉｎｇｏｆｓｏｍａｔｉｃｃｅｌｌｎｕｃｌｅｉ［Ｊ】．ＮａｔｕｒｅＣｅｌｌＢｉｏｌ，２００４．６（１０）：９８４—９９０．【４】ＳｕｚｋｉＨ．ＧａｂｆｉｅｌｓｏｎＥ，ＣｈｅｒｔＷ。
炎症性肠病的自噬与表观遗传修饰
200030)
DOI:10.3969/j.issn.2095-4344.2532
ORCID: 0000-0003-0627-9236(郭娅静)
文章快速阅读：
文章特点— (1)文章较详细地描述了自噬在炎症性肠病中的作用； (2)阐述了表观遗传修饰对炎症性肠病自噬的调控。
背景：
研究内容：
表观遗传修饰对炎症 性肠病自噬的调控机 制尚未得到阐明。
Autophagy and epigenetic modification in inflammatory bowel disease
Guo Yajing1, Huang Yan2, Shi Yin2 (1Yueyang Clinical Medical School, Shanghai University of Traditional Chinese Medicine, Shanghai 201203, China; 2Shanghai Institute of Acupuncture-Moxibustion and Meridian, Shanghai 200030, China)
郭娅静，女，1989 年生， 河南省郑州市人，汉族， 上海中医药大学在读博 士，主要从事炎症性肠病 的相关研究。
通讯作者：施茵，博士， 主任医师，上海中医药大 学上海市针灸经络研究 所，上海市 200030
组蛋白甲基化阅读蛋白的英文缩写
组蛋白甲基化阅读蛋白的英文缩写英文回答：The term "chromatin readers" refers to proteins that recognize specific patterns of histone methylation and initiate appropriate biological responses. These readers contain diverse structural domains that allow them to engage with methylated chromatin and mediate downstream signaling events. Chromatin readers play crucial roles in gene regulation, DNA repair, and other nuclear processes.Here is a list of the major classes of histone methyl reader domains along with their abbreviations:Chromodomain (CHD)。
MBD family of methyl-CpG binding domain proteins (MBD)。
Tudor domain (TUD)。
Zinc finger domain (ZnF)。
Plant homeodomain (PHD)。
Double chromodomain (DCHD)。
E3 ubiquitin ligase (E3)。
Among these domains, CHD, Tudor, and MBD are the most commonly found, and their presence usually defines aprotein as a chromatin reader. The DCHD domain is found in a subset of chromatin readers, and it typically engages with methylated CpG islands. PHD domains recognize specific patterns of histone methylation and are often involved in recruiting effector proteins to methylated chromatin. Zinc finger domains can also bind methylated histones, but they have a broader specificity than other reader domains. E3 ubiquitin ligases are chromatin readers that target methylated histones for ubiquitination, leading to their degradation or modification.Chromatin readers have diverse biological functionsthat are dictated by the specific histone methylation marks they recognize. For example, the reader protein CBX3 is involved in gene silencing and heterochromatin formation, while the reader protein 53BP1 is involved in DNA repair and checkpoint signaling. Other chromatin readers, such as the MBD family proteins, are involved in transcriptional regulation and DNA methylation maintenance.Overall, the identification and characterization of chromatin readers have provided valuable insights into the mechanisms of gene regulation and other nuclear processes. These readers are essential components of the epigenetic machinery that governs cellular development and function.中文回答：组蛋白甲基化读取蛋白是指能够识别特定组蛋白甲基化模式并启动适当生物反应的蛋白质。
DNA甲基化与组蛋白甲基化的关系_李建许
遗 传HEREDI TAS (Beijing )26(2):267～270,2004专论与综述收稿日期:2003-05-29;修回日期:2003-09-28作者简介:李建许(1978-),男,河南人,硕士研究生,研究方向:分子遗传学通讯作者:刘红林(1966-),男,江苏人,教授,研究方向:动物遗传育种。
E -mail :ggcpc @njau .edu .cnDNA 甲基化与组蛋白甲基化的关系李建许,刘红林(南京农业大学动物科技学院,南京210095)摘 要:在真核生物基因组及基因组以外,存在着多种共价修饰,其中,DNA 和组蛋白的甲基化都与基因的沉默存在着联系,DNA 和H3K 9的甲基化在调节基因过程中具有协同作用,并拮抗H3K4的甲基化。
近来的研究显示,两种甲基化机制之间似乎还存在着联系,即DNA 的甲基化可能依赖于H3K 9的甲基化,但在哺乳动物中,两种甲基化的关系可能更复杂。
关键词:DNA ;组蛋白;甲基化;甲基转移酶中图分类号:Q 953 文献标识码:A 文章编号:0253-9772(2004)02-0267-04The Relationship of DNA Methylation and Histone MethylationLI Jan -Xu ,LIU Hong -Lin(C oll ege o f Animal S cience and Technol ogy ,Nanjing Agr icu ltural Univer s ity ,Na njing 210095,China )A bstract :In and out of the eukaryotic genomes ,there exist many covalent modifications ,of which are the me thyla tio n of DNA and histones ,and they are both involved in genes silencing ,in w hich the methylation o f DN A and H3K 9are sy ner -gistic ,but the methylation of H3K4is antag onistic to them .The rencent studies show that these two methy lations are cor -related ,that is ,DN A methylatio n is dependent on the methylation of H3K 9.However ,the relationship of these tw o methylations is more complicated in mammals than in low er eukary otons and plants .Key words :DN A ;histones ;methylation ;methy ltransferase 长期以来,基因组DNA 都是生物学家们研究的中心,但是,研究过程中出现的许多现象似乎都与基因本身无关,例如,在哺乳动物中,编码功能蛋白的基因仅占整个基因组的一小部分,而基因以外的区域却存在着大量的非编码序列,例如内含子、重复序列和转座子等,那么,哺乳动物是如何有效地保持这些非编码序列长期的保持沉默,以实现基因的准确表达的;在一些细胞内,为什么肿瘤抑制基因并未发生突变却失活,并导致癌变的可能。
组蛋白组氨酸甲基化
组蛋白组氨酸甲基化【中英文版】Title: Histone Methylation on LysineTitle: 组蛋白组氨酸甲基化Introduction:Histone proteins play a crucial role in packaging DNA into a compact and organized structure called chromatin.One of the post-translational modifications that regulate chromatin structure and gene expression is histone methylation.Specifically, the addition of methyl groups to lysine residues within the histone proteins is a key mechanism for controlling access to the DNA.介绍：组蛋白是DNA包装成紧凑且有组织结构（染色质）的关键蛋白质。
调节染色质结构和基因表达的一种后翻译修饰是组蛋白甲基化。
特别是，向组蛋白中的赖氨酸残基添加甲基团是控制DNA访问的关键机制。
Process:The process of histone methylation is carried out by a family of enzymes known as histone methyltransferases (HMTs).These enzymes add methyl groups from S-Adenosylmethionine (SAM) to specific lysine residues on the histone proteins.The precise location of the methylation event determines the regulatory function of the histone methylation mark.过程：组蛋白甲基化过程由一类称为组蛋白甲基转移酶（HMTs）的酶执行。
表观遗传学研究方法进展
表观遗传（ epigenetic） 是指 DNA 序列不发生变 化，但基因表达却发生了可遗传的改变。这种改变 是细胞内除了遗传信息以外的其他可遗传物质发生 的改变，且这种改变在发育和细胞增殖过程中能稳 定遗传［1，2］。
表观 遗 传 学 的 现 象 很 多，DNA 甲 基 化 （ DNA methylation） 、组蛋白 修 饰 （ histone modification） 、基 因组印记（ genomic imprinting） 、RNA 编辑（ RNA editing） 、基因沉默、核仁显性、休眠转座子激活和性别 相关性基因剂量补偿效应等都是典型的表观遗传现 象［3，4］。表观遗传研究目前主要集中在 DNA 甲基
关键词： 表观遗传学 DNA 甲基化 组蛋白修饰 限制性内切酶酶切法 重亚硫酸盐法 染色质免疫共沉淀 单分 子实时测序 单分子纳米孔测序
Research Method guo1． 2 Chen Liang1 Lou Qiaojun1 Luo Lijun1． 2
·技术与方法·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2011 年第 9 期
表观遗传学研究方法进展
郑小国1． 2 陈亮1 楼巧君1 罗利军1． 2
（ 1 上海市农业生物基因中心，上海 201106； 2 华中农业大学，武汉 430070）
X染色体失活的研究进展
X染色体失活的研究进展梁文权;赵存友【摘要】在胚胎发育过程中,哺乳动物雌性细胞的两条X染色体中有一条会通过X 染色体失活机制随机失活.X染色体失活中心(X chromosome inactivation center,XIC)是X染色体失活的主要调控区域,而位于XIC中Xist基因已被证明为X 染色体失活的主要调节基因.Xist与Tsix的相互调控机制已被多方研究和证实,两者共同参与了胚胎早期发育过程中的X染色体失活的生理过程.X染色体失活异常与许多临床疾病相关,且X染色体失活的机制作为一个良好的表观遗传学研究模型,吸引越来越多研究者的关注,然而现有的关于X染色体失活机制的研究多零散且片段,现本文现将近年来关于X染色体失活机制的研究进展作一综述.【期刊名称】《妇产与遗传（电子版）》【年(卷),期】2016(006)004【总页数】4页(P8-11)【关键词】X染色体失活;早期胚胎发育;Xist基因;Tsix RNA【作者】梁文权;赵存友【作者单位】510515广州,南方医科大学基础医学院基础医学;南方医科大学医学遗传学教研室【正文语种】中文【中图分类】R715.5在哺乳动物的发育过程中，性染色体决定了性别分化，雌性哺乳动物的两条X染色体中的一条异常固缩而失去活性。
1949年Barr在观察雌猫的有丝分裂间期神经细胞核中发现一条深染的小体，他把该小体命名为“Barr Body”［1］，“Barr Body”后被证实为一条异常固缩无活性的X染色体。
1961年Lyon提出了假说:雌性哺乳动物 (XX)细胞中仅有一条X染色体有转录活性，另一条异常固缩的X染色体失去活性;X染色体失活发生于胚胎早期;X染色体的失活随机发生，可为父源遗传失活，亦可为母源遗传失活;失活的X染色体在细胞的有丝分裂过程中可稳定传递［2］。
近60年来研究者对X染色体的失活机制提出了许多学说，然而仍无法对该现象进行完美解释。
本文综述了近60年来关于X染色体失活的多个重要学说，希望能对X染色体的失活机制有进一步的认识。