pubmed使用介绍

PubMed简介——是什么？
Entrez可以检索的数据库：
 Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)，人类遗传疾病相关文献数 据库
 PopSet，族群演化分析相关研究资料  Protein sequence database，蛋白质序列数据库（包含Swiss-Prot、
文摘型数据库PubMed 检索方法与技巧
翁蕾鸣 北京大学医学图书馆信息咨询部

主要内容
PubMed简介——是什么？ PubMed特色服务——能干什么？ PubMed检索方法——怎么用？ 其他辅助功能

PubMed简介——是什么？
 创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国 生物技术信息中心(NCBI)  1996年1月开始向全球开放

PubMed简介——是什么？
 NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为  生物数据库  生物信息工具

PubMed简介——是什么？
 生物数据库  永久数据的大的组织体  结合计算机软件执行更新、查询与存取数据 的功能。  容易取得信息并且只取得回答特殊生物问题 的信息  Entrez： NCBI的数据库搜寻与存取系统，可 用来获取单一数据库或许多数据库的整合数 据。  目前，NCBI提供的公开（Open Access）数据 库包括如下：

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PubMed简介——是什么？
 NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为  生物数据库  生物信息工具

PubMed简介——是什么？
Entrez  一个整合的访问序列，定位，分类和结构数据的搜索和检索
系统。  整合的数据库包括核酸序列，蛋白序列，大分子结构，全基
因组，和通过PubMed检索的MEDLINE。  可以检索相关的序列，结构和参考文献。
BLAST  序列相似搜索程序，还可作为鉴别基因和遗传特点的手段。  在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索。
附加软件工具 开放阅读框寻觅器（ORF Finder），电子PCR，序列提
交工具Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以 从HTTP或FTP来获得。

PubMed简介——是什么？
Entrez可以检索的数据库：
 Books 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库  Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of
Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、 临床与文献相关数据  Conserved Domain Database（CDD），蛋白质功能区块保留序列数据库  3D Domains，蛋白质功能区块立体结构数据  Gene，包含许多物种的基因数据库  Genome，包含超过800种物种的基因组数据库  GENSAT，小鼠中枢神经系统基因表现图谱  GEO Datasets，基因表现实验与生物芯片数值结果数据  GEO Profiles，基因表现图谱  HomoloGene，同源基因批注数据库  Journals，期刊文献（包含PubMed）  MeSH，医学主题词数据库  NCBI Web Site，所有NCBI网页  NLM Catalog，美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录  Nucleotide sequence database，核酸序列数据库（包含GenBank、RefSeq 和PDB等三大序列数据库）

 http://pubmed.cn/ （汉化） 英文检索

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新版PubMed首页 特色： 简洁、清新 检索速度较快

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PubMed数据范围
 数据类型：期刊论文、综述以及与其他数 据资源链接。
 特点：
 免费提供题录和文摘  提供与原文的网址链接(部分免费获取）  提供检索词自动转换匹配  操作简便、快捷
 特色：免费、收录广、内容全、检索途径多、 检索体系完备、 文摘库，部分文献还可在网 上直接免费获得全文。
 http://pubmed.gov

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 NCBI (National Center for Biotechnology Information，美国国立生物技术信息中心)  目前国际上几个重要分子生物信息网站之一  成立的原因:已故的参议院议员Claude Pepper发现 计算信息处理方法对生物医学研究的重要性  1988年11月4日成立  是National Institutes of Health（NIH 美国国立卫 生研究院）底下的National Library of Medicine（ NLM 美国国立医学图书馆）的部门之一  NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位。

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数wenku.baidu.com来源

MEDLINE：[pubmed-indexed for medline]
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supplied by Publisher]。
PIR、PRF、PDB等数据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译之蛋白质 序列资料）  PubChem BioAssay，化学成分之生物活性筛选资料  PubChem Compound，小分子化学物质结构  PubChem Substance，具生物活性之化学物质筛选数据  PubMed，科学文献报导数据库  PubMed Central，科学文献数字全文数据库  Site Search，可搜寻NCBI的网页与FTP  SNP，单点核酸多样性数据库(dbSNP)  Structure，分子模型数据(MMDB)  Taxonomy，以核酸或蛋白质为基础的分类学信息  UniGene，人类unique基因序列数据库  UniSTS，unique序列卷标地址数据库