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2019-PubMed检索示例-作者单位的检索-文档资料

2019-PubMed检索示例-作者单位的检索-文档资料

5.修正检索策略
检出结果数量发生了很大的变化。
此次检索我们没有再次进入Limits选择限定条件。因为限 定条件一旦选定,若不取消,则在后面的检索中始终存在。 因此,请注意:检索完成后,若不再需要此限定条件,一 定要点击“Remove”去除掉限定条件;若限定条件发生变 化,则点击“Change”重新进入Limits进行修改。
检查details,没有问题。
*更简单的方法
• 选好限定条件后利用高级检索来进行检索词的输入。 因为高级检索也可进行字段限定检索
点击进入高级检索
①选择入口字段 ②输入检索词
Chongqing medical university
③点击index按钮
④点击AND按钮
①选择入口字段 ②输入检索词
小结
• 检索时一定要注意选词! PubMed的词语自动转换功 能主要是针对主题内容的检索而言的,如果是检索某 机构作者发表的文献,一定要事先了解这个机构的名 称有哪些写法。不同写法之间用OR连接。可考虑使 用Index功能。
• 如果是检索某一主题内容的文献,可以不用考虑同义 词,直接在基本检索状态输入检索词就可以了(但词 组检索不能加引号,否则将关闭自动转换功能)。
Chongqing medical university
③点击index按钮
⑤输入其他检索词
Chongqing university of medical science
⑥点击index按钮
⑧点击OR按钮
⑦选择需要的词
发现我们刚刚还漏掉了另 一个检索词
⑨点击Search或Preview
若点击Preview,则不直接显示检索具体结果,而是在下方的检索史(Search History)中 预览结果数量。请比较#2和#4的检索结果。由于我们前面进行的检索(#2)漏掉了一个 检索词,导致检索结果少了202篇。

PubMed简介及使用说明

PubMed简介及使用说明

PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库,目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料,并提供部分免费及付费全文连结服务,需要收费的全文,读者可自行与出版社接洽。

较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主,PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容:1. 对于超出学科范围(如:资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中;2. 收录即将出版的医学论文;3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。

美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下:1.PubMed:生物医学文献书目索引摘要资料库。

2.Nucleotide:包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。

3.Protein:整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料,并可参照Taxonomy资料库,了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。

4.Structure:分子构造资料库。

5.Genome:基因组合序列资料库。

6.PopSet:可查询某族群的基因序列,了解该族群演进之相关资料。

7.OMIM:遗传学资料库。

8.Taxonomy:在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。

9.Books:收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。

一PubMed数据库简介-文档资料

一PubMed数据库简介-文档资料

四、PubMed的基本检索功能(一)
自动词语匹配
PubMed 能自动利用它的“自动词语匹配
”功能将重要的词语结合在一起,并将不 规范的词语转换成规范的用词。 如:输入vitamin c common cold,系统会将自动
转 换 成 (“ascorbic acid”[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word]) AND (“common cold”[MeSH Terms] OR common cold [Text Word]) 进行检索。这种处理能使检索结果更精 确和全面。
பைடு நூலகம்
四、PubMed的基本检索功能
词语检索及自动词语匹配 作者姓名检索 杂志名称检索 截词检索 短语检索 逻辑运算符检索
四、PubMed的基本检索功能(一)
词语检索及自动词语匹配
在检索框中键入一到多个检索词,按
“GO”键,即显示检索结果。 “clear” 按钮可以帮你清除查询框中的内容,然 后开始一个新的查询。
杂志名检索


在检索框中键入杂志全名molecular biology of the cell 也可以直接键入Medline的期刊标准缩写 形式,如:mol boil cell, 键入刊物的ISSN(国际标准出版物代码) 进行检索,如1059-1524。 Cell transplantation [ta]
PubMed辅助检索工具
Limits (限制功能) Preview/Index(预览/索引) History(检索史) Clipboard(剪贴板或文件夹) Details(明细栏)
Journal Browser-杂志浏览器
服务功能
•MeSH Browser-主题词浏览器 •Citation Matcher-在表格输入刊物的引文信息 来定位特定文章。 •Clinical Queries-与临床相关的疗法,诊断,病 因,预后

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤 -回复

pubmed检索步骤-回复Pubmed是世界上最大的医学文献数据库之一,提供了大量的生物医学文献资料,包括期刊文章、会议摘要、学位论文等。

Pubmed的使用可以帮助研究人员快速检索到相关的医学文献,有效地支持他们的科研工作。

本文将介绍使用Pubmed进行文献检索的步骤,并以"乳腺癌治疗的最新进展"为例进行说明。

第一步:进入Pubmed网站首先,我们需要打开网页浏览器,输入"第二步:选择搜索关键词在Pubmed的首页上,我们可以看到一个搜索框。

输入"乳腺癌治疗的最新进展"作为关键词进行搜索。

在这里,我们需要注意的是,关键词的选择应该准确反映我们所关注的研究主题,以便能够检索到相关的文献。

第三步:筛选搜索结果点击搜索按钮后,Pubmed会根据关键词进行检索,并列出包含这些关键词的文献列表。

在这里,我们可以看到大量的搜索结果。

为了筛选出最相关的文献,我们可以使用Pubmed的搜索筛选工具。

在搜索结果页面的左侧,有一栏搜索筛选工具。

我们可以根据不同的筛选条件,比如出版日期、文章类型、研究主题等进行进一步的筛选。

以乳腺癌治疗的最新进展为例,我们可以选择筛选条件为"出版日期",选择"最近五年",以获取最近的研究进展。

第四步:查看摘要和全文在筛选出相关的文献后,我们可以点击文献标题或摘要,进一步查看文献的详细信息。

在这里,我们可以通过查看摘要了解到文献的研究内容、方法和主要结论。

如果我们对某篇文献特别感兴趣,想要获取全文信息,可以通过点击链接或按钮,获取全文或者转至相关网页。

然而,需要注意的是,Pubmed并不提供所有文献的全文,有些文章可能需要通过其他渠道获得。

第五步:导出文献信息在Pubmed上查到的文献信息可以方便地导出到其他文献管理软件,如EndNote等。

在详细信息页面,Pubmed提供了一个"导出"按钮,点击后可以选择导出格式,然后将文献信息导出到所选的文献管理软件中。

NCBI-PubMed-检索简介与检索技巧集锦

NCBI-PubMed-检索简介与检索技巧集锦

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦注:在本文中的叙述中,所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来,如以基因治疗为主题词检索,在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。

PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部(NIH, National Institues of Health)的国家医学图书馆(NLM, Nationa Library of Medicine)下属的国家生物技术信息中心(NCBI, National Center for Biotechnology Information)提供,可通过NCBI网站的Entrez检索系统(Entrez retrieval system)进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。

此外,PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务,与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据,提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA 与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。

Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统,可检索NCBI网站的主要数据库,如PubMed,核酸与蛋白序列,基因组序列,蛋白结构,OMIM等等。

PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库,此外,它还针对网上资源,提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源,如核酸蛋白序列、OMIM入口等,以及其它生命科学数据库。

其文献内容的提供方式,由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。

如果该出版商有网站,则NCBI会提供相应的网络出口。

MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。

PubMed服务内容概括基于互联网及PreMEDLINE引文数据库免费检索系统。

NCBIPubMed检索简介与检索技巧集锦

NCBIPubMed检索简介与检索技巧集锦

NCBI PubMe‎d检索简介与‎检索技巧集‎锦注:在本文中的‎叙述中,所有输入P‎u bMED‎检索框中的‎内容均用<>符号括起来‎,如以基因治‎疗为主题词‎检索,在检索框中‎的输入内容‎表示为<"Gene Thera‎p y"[MESH]>。

PubMe‎d简介PubMe‎d是由隶属‎于美国国家‎卫生部(NIH, Natio‎n al Insti‎tu es of Healt‎h)的国家医学‎图书馆(NLM, Natio‎na Libra‎ry of Medic‎i n e)下属的国家‎生物技术信‎息中心(NCBI, Natio‎n al Cente‎r for Biote‎c hnol ‎o g y Infor‎m a tio‎n)提供,可通过NC‎BI网站的‎E n tre‎z检索系统‎(E ntre‎z retri‎e val syste‎m)进行MED ‎L I NE和‎P reME‎D LINE‎引文数据库‎的在线免费‎检索。

此外,PubMe‎d还提供引‎文与其它数‎据库的接入‎服务,与提供期刊‎全文的出版‎商网址的链‎接,来自第三方‎的生物学数‎据,序列中心的‎数据,提供与综合‎分子生物学‎数据库的链‎接与接入服‎务,这个数据库‎归NCBI‎所有,其内容包括‎:DNA与蛋‎白质序列,基因图数据‎、3D蛋白构‎象,人类孟德尔‎遗传在线。

Entre‎z检索系统‎是NCBI‎在线提供的‎一类基于文‎字进行搜索‎与索取的检‎索系统,可检索NC‎BI网站的‎主要数据库‎,如PubM‎ed,核酸与蛋白‎序列,基因组序列‎,蛋白结构,OMIM等‎等。

PubMe‎d是一类提‎供生物医学‎文献资料检‎索的数据库‎,此外,它还针对网‎上资源,提供全文地‎址及其它相‎关的NCB‎I提供的网‎上资源,如核酸蛋白‎序列、OMIM入‎口等,以及其它生‎命科学数据‎库。

PubMed使用攻略

PubMed使用攻略
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
主要内容
一、PubMed简介 二、检索途径和方法 三、检索结果处理
四、其他辅助检索
五、免费获取全文
华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
一、PubMed简介
▪ 1.PubMed基本情况 ▪ 2.PubMed的由来 ▪ 3.PubMed的数据范围 ▪ 4.PubMed的特点 ▪ 5.PubMed主页
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
一、PubMed简介
3.PubMed的数据范围
MEDLINE PreMedline
出版商提供的书目信息 与NCBI其它数据库的链接
华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
MEDLINE数据库简介
3.1 MEDLINE基本情况
▪ 出 版 : 美 国 国 家 医 学 图 书 馆 ( National
华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
▪ 学科范围:
▪ 基础生命科学 ▪ 生物科学 ▪ 组织学 ▪ 心理学 ▪ 农业 ▪ 医技工业学
临床生命科学 解剖学 化学与药物 社会医学 医技设备学 医学信息学
使用词表:MeSH(医学主题词表)
华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院
华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院
资料仅供参考,不当之处,请联系改正。
一、PubMed简介
▪ 1.PubMed基本情况
▪ PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息
中心(NCBI)开发的一个以Web方式向用户 提供服务的生物医学文献检索系统,是继 MEDLINE数据库国际联机检索和光盘检索之后 推出的一种网络免费检索方式。

PubMed检索系统-文档资料

PubMed检索系统-文档资料

2个字母在词后时, PubMed 就会到著者索引中查找。
若在上述四个表或索引中仍未找到相匹配的词, PubMed 就将短语分开,用AND将短语中的单个词连接起 来在全部字段中查找,直到找到相应的词为止。 例:pressure point
(“pressure”[MeSH Terms] OR “pressure”[All Fields])
二、 PubMed主页简介
PubMed主页
二、 PubMed主页简介
主页分检索区、主要功能区及辅助功能区三部分。
检索区:基本检索、高级检索和帮助。
主要功能区:使用介绍、 PubMed工具及更多资源。
二、 PubMed主页简介
辅助功能区:指南、其他数据库、常用数据库、特色 数据库及相关信息
三、 PubMed主要特点
AND point[All Fields]
三、 PubMed主要特点
㈡ 截词检索 用截词符“ * ”表示。 截词检索只限于单词,对词组无效。 例如:flavor* flavored , flavorful , flavoring等 ㈢ 短语检索 又称强制检索,即对检索词加上双引号 (“ ”), 把检索词作为一个整体检索,关闭 自动词语匹配功能。 例:“single cell”
三、 PubMed主要特点
㈣ 布尔逻辑检索
布尔逻辑运算符必须大写 ANFra bibliotek OR NOT
优先级为:( )>NOT>AND>OR
三、 PubMed主要特点
㈤限定检索
PubMed在首次检索的基础上,可以根据检索需求实现 二次检索界面的限定检索:包括文本呈现方式(摘要、免 费全文、全文)、出版日期、物种(人或其他动物)、文 献类型(临床实验、随机对照实验、综述、系统综述等)、 语言和年龄等。
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PubMed简介——是什么?

NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为 生物数据库 生物信息工具
PubMed简介——是什么?

生物数据库 永久数据的大的组织体 结合计算机软件执行更新、查询与存取数据 的功能。 容易取得信息并且只取得回答特殊生物问题 的信息 Entrez: NCBI的数据库搜寻与存取系统,可 用来获取单一数据库或许多数据库的整合数 据。 目前,NCBI提供的公开(Open Access)数据 库包括如下:
PubMed简介——是什么?
MEDLINE:[pubmed-indexed for medline]
数据来源
Publisher-Supplied Citations:出 版商提供的电子文献 [PubMed-as supplied by Publisher]。 In Process Citations:每天收录, 尚未经规范处理的数据。 [pubmed-in process]
PubMed简介——是什么?
PubMed简介——是什么?

NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为 生物数据库 生物信息工具
PubMed简介——是什么?
Entrez 一个整合的访问序列,定位,分类和结构数据的搜索和检索 系统。 整合的数据库包括核酸序列,蛋白序列,大分子结构,全基 因组,和通过PubMed检索的MEDLINE。 可以检索相关的序列,结构和参考文献。

/ (汉化)
英文检索
PubMed简介——是什么?
新版PubMed首页 特色: 简洁、清新 检索速度较快
PubMed简介——是什么?

PubMed数据范围

数据类型:期刊论文、综述以及与其他数 据资源链接。 特点:


免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取) 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷
文摘型数据库PubMed 检索方法与技巧
翁蕾鸣 北京大学医学图书馆信息咨询部
主要内容
PubMed简介——是什么? PubMed特色服务——能干什么? PubMed检索方法——怎么用? 其他辅助功能
PubMed简介——是什么?



创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国 生物技术信息中心(NCBI) 1996年1月开始向全球开放 特色:免费、收录广、内容全、检索途径多、 检索体系完备、 文摘库,部分文献还可在网 上直接免费获得全文。
PubMed简介——是什么?
Entrez可以检索的数据库:




Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM),人类遗传疾病相关文献数 据库 PopSet,族群演化分析相关研究资料 Protein sequence database,蛋白质序列数据库(包含Swiss-Prot、 PIR、PRF、PDB等数据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译之蛋白质 序列资料) PubChem BioAssay,化学成分之生物活性筛选资料 PubChem Compound,小分子化学物质结构 PubChem Substance,具生物活性之化学物质筛选数据 PubMed,科学文献报导数据库 PubMed Central,科学文献数字全文数据库 Site Search,可搜寻NCBI的网页与FTP SNP,单点核酸多样性数据库(dbSNP) Structure,分子模型数据(MMDB) Taxonomy,以核酸或蛋白质为基础的分类学信息 UniGene,人类unique基因序列数据库 UniSTS,unique序列卷标地址数据库
BLAST 序列相似搜索程序,还可作为鉴别基因和遗传特点的手段。 在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索。 附加软件工具 开放阅读框寻觅器(ORF Finder),电子PCR,序列提 交工具Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件工具可以 从HTTP或FTP来获得。
PubMed简介——是什么?

NCBI (National Center for Biotechnology Information,美国国立生物技术信息中心) 目前国际上几个重要分子生物信息网站之一 成立的原因:已故的参议院议员Claude Pepper发现 计算信息处理方法对生物医学研究的重要性 1988年11月4日成立 是National Institutes of Health(NIH 美国国立卫 生研究院)底下的National Library of Medicine( NLM 美国国立医学图书馆)的部门之一 NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位。
PubMed简介——是什么?
Entrez可以检索的数据库:
NhomakorabeaBooks 出版社提供之数字生医图书与医生参考书籍数据库 Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、 临床与文献相关数据 Conserved Domain Database(CDD),蛋白质功能区块保留序列数据库 3D Domains,蛋白质功能区块立体结构数据 Gene,包含许多物种的基因数据库 Genome,包含超过800种物种的基因组数据库 GENSAT,小鼠中枢神经系统基因表现图谱 GEO Datasets,基因表现实验与生物芯片数值结果数据 GEO Profiles,基因表现图谱 HomoloGene,同源基因批注数据库 Journals,期刊文献(包含PubMed) MeSH,医学主题词数据库 NCBI Web Site,所有NCBI网页 NLM Catalog,美国国立医学图书馆馆藏书目、期刊、视听数据目录 Nucleotide sequence database,核酸序列数据库(包含GenBank、RefSeq 和PDB等三大序列数据库)
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