PubMed简介及使用说明
pubmed文献检索方法
pubmed文献检索方法摘要：一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文：一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院（NIH）开发和维护的一个免费生物医学文献数据库，包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页，可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮，可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定，从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中，可以采用一些策略提高检索效果。
例如，使用截词符（*）进行词干检索，或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例：假设我们想查找关于“新冠病毒”（SARS-CoV-2）的研究文献，可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”，然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章，如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等，了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符（AND、OR、NOT）在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如，输入“新冠病毒AND 疫苗”，可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中，可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件，缩小检索范围，提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具，如引文导出、文献收藏、文献标签等。
PubMed检索
发展历程
NLM早在1879年即开始编译医学文献的检索刊物 《医学索引》(Index Medicus ,IM)
从1964年起，采用计算机进行电子编辑和排版，在此 基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(Medical Literature Analysis & Retrieval System)，即著名 的MEDLARS系统
MeSH转换表 Vitamin h→ "biotin"[MeSH Terms] OR "biotin"[All Fields] OR "vitamin h"[All Fields]
期刊转换表 new england journal of medicine → "N Engl J Med"[Journal] OR "new england journal of medicine"[All Fields]
临床查询（Clinical Queries）
Clinical Study Categories（临床研究类文献） Systematic Reviews（系统评价） Medical Genetics（医学遗传学）
MeSH: Clinical Queries
结果限定选项
直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、 Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索
PubMed每条记录均有惟一的识别号 PMID(PubMed Unique Identifier) 。
❖ MEDLINE: PubMed主体部分，记录均标有 [PubMed-indexed for MEDLINE]
Pubmed_应用
的基本检索功能（ 四、PubMed的基本检索功能（七）
逻辑运算符检索
在检索框中输入逻辑运算符， 在检索框中输入逻辑运算符，执行顺序从 左向右，可用括号来改变此顺序。 左向右，可用括号来改变此顺序。 如：lung cancer AND smok* #1 OR #2 (#1 OR #2) AND #3
PubMed辅助检索工具
Limits （限制功能） 限制功能） Preview/Index（预览 索引） 索引） （预览/索引 History（检索史） （检索史） Clipboard（剪贴板或文件夹） （剪贴板或文件夹） Details（明细栏） （明细栏）
PubMed Services :
服务功能
辅助检索工具（ 五、 PubMed辅助检索工具（二）
2. Preview/Index： ： Preview是对检索结果进行预览，显示检索结果的 是对检索结果进行预览，
条数和最近三次检索式， 条数和最近三次检索式，用户可根据具体情况在 和最近三次检索式 检索提问框中用逻辑运算符组配新的检索式。 检索提问框中用逻辑运算符组配新的检索式。 Index是对提交的检索词列出按字顺排列的某一字段 是对提交的检索词列出按字顺排列的某一字段 索引词表的位置和数量（括弧内） 的索引词表的位置和数量（括弧内），可用流动 条来回进行查看列表。选中的词高亮显示， 条来回进行查看列表。选中的词高亮显示，然后 选择合适的逻辑运算符进行检索。 选择合适的逻辑运算符进行检索。
的基本检索功能（ 四、PubMed的基本检索功能（六）
短语检索
PubMed首先将键入的检索词（词组）视为合理 首先将键入的检索词（词组） 首先将键入的检索词 的短语在短语索引中进行查找。 的短语在短语索引中进行查找。如：poison ivy 将其视为词组进行查找。 ， PubMed将其视为词组进行查找。 当 PubMed 将其视为词组进行查找 没有找到该词组时， 没有找到该词组时 ， 系统将自动把两个词分开 进行检索； 进行检索； 如果不希望系统将两词分开， 则需要用“” “”把 如果不希望系统将两词分开 ， 则需要用 “” 把 检索词括起来，即强迫PubMed进行词组检索。 进行词组检索。 检索词括起来，即强迫 进行词组检索 如“single cell”。 。 当用双引号括起词语时， 当用双引号括起词语时，PubMed将不执行自动 将不执行自动 词语匹配功能。 词语匹配功能。
pubmed的使用
1简介
• PubMed 是一个免费的搜寻引擎，提供生 物医学方面的论文搜寻以及摘要。它的数 据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学， 但亦包括其他与医学相关的领域，像是护 理学或者其他健康学科。它同时也提供对 于相关生物医学资讯上相当全面的支援， 像是生化学与细胞生物学。该搜寻引擎是 由美国国立医学图书馆提供，作为 Entrez 资讯检索系统的一部分。PubMed 的资讯 并不包括期刊论文的全文，但可能提供指 向全文提供者（付费或免费）的链接。
将两次历史添加上去，再搜索
得到较好结果
结果
全文的获取
• 由于pubmed是文摘数据库，能提供的全文 很少，故全文需要在其他全文数据库中寻 找。一般pubmed会提供相关链接，该链接 指向的目标能够提供全文（免费或收费）。 或者自己根据pubmed的相关信息到其他数 据库中寻找。Google的学术搜索也相当强 大能找到不少免费全文。
pubmed界面简介
可选检索范围
简单检索
搜索后结果
再次搜索后结果
选定副主题后搜索结果
可对结果进一步筛选
筛选后结果
• 布尔逻辑检索的简单应用 • 对于关键词较多，关键词间逻辑关系较复 杂的检索要求有很好的效果。（以DNA与 watson为例）
先检索其中一个
在检索另一个
选择“高级检索”
• 1、抓住要检索内容的关键词，比如《×××的现状与展 望》就是一篇综述而在收索时就不能收索“现状与展望”。 • 2、考虑到关键词的类似说法，即有可能出现的同义词， 比如“AIDS”的相关词“HIV”。 • 3、使用布尔逻辑法提高检索效率。 • AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词之一存在 于文中，该文就会被列出。 • OR则是至少有一个关键词出现在文中，该文才会被列出， 这种运算在有相似主题和同义词时十分有效。 • NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分除去， 比如“A NOT B”就是指A中不包含B的部分。这种方法 虽然提高了精确度，但降低了检全率。
PubMed 数据库使用介绍
Copyright ©2006
Evidence Based Medicine Center，Lanzhou University
Copyright ©2006
Evidence Based Medicine Center，Lanzhou University
Copyright ©2006
Evidence Based Medicine Center，Lanzhou University
Evidence Based Medicine Center，Lanzhou University
Copyright ©2006
二、PubMed收录范围（1）
（一）MEDLINE
——全世界70多个国家和地区的4800余种生物医学期刊 ——自1966年至今数据1400万余条 ——内容每周更新一次，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、 卫生保健和前临床科学等。 ——标识[PubMed - indexed for MEDLINE] ——1950 年到1965年全世界生物医学期刊 ——目前数据大约200多万条 ——标识[PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966] ——1996年8月开始增加该数据库，只提供基本的引文信息和文摘， ——每天更新，经过标引以后进入MEDLINE，并从PreMEDLINE 中删除这些记录。 ——标识[MEDLINE in process]
Copyright ©2006
Evidence Based Medicine Center，Lanzhou University
Copyright ©2006
2、主题检索（MeSH Database）
Evidence Based Medicine Center，Lanzhou University
pubmed使用介绍
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围
MEDLINE
4800余种生物医学期刊，内容涉及医学、护理 、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等 学科。这些期刊来源于美国和世界上70多个国 家和地区。 文献量达1千2百多万条记录，并回溯到1966年 。 记录中用[PubMed-indexed for MEDLINE]标记 表示
[注] 截止2006年3月15日PubMed公布的数据
PubMed简介——是什么？
PubMed数据范围
OldMedline
1950-1965年间发表的200多万篇文献 没有MeSH字段和摘要 记录中用[PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966] 标记表示。
PubMed简介——是什么？
文摘型数据库PubMed 检索方法与技巧
翁蕾鸣 北京大学医学图书馆信息咨询部
主要内容
PubMed简介——是什么？ PubMed特色服务——能干什么？ PubMed检索方法——怎么用？ 其他辅助功能
PubMed简介——是什么？
创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国 生物技术信息中心(NCBI) 1996年1月开始向全球开放 特色：免费、收录广、内容全、检索途径多、 检索体系完备、 文摘库，部分文献还可在网 上直接免费获得全文。
PubMed简介——是什么？
NCBI (National Center for Biotechnology Information，美国国立生物技术信息中心) 目前国际上几个重要分子生物信息网站之一 成立的原因:已故的参议院议员Claude Pepper发现 计算信息处理方法对生物医学研究的重要性 1988年11月4日成立 是National Institutes of Health（NIH 美国国立卫 生研究院）底下的National Library of Medicine（ NLM 美国国立医学图书馆）的部门之一 NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位。
pubmed检索系统
（三）高级检索
＃2 ＃1
逻辑与 逻辑或 逻辑非 删除 显示结果
检索历史
清除检索史
显示细节
保存到NCBI
点击查看检索结果
例：检索高血压护理方面的文献
hypertension
例：检索高血压护理方面的文献
例：检索高血压护理方面的文献
Hype压护理方面的文献
（四）强制检索：“gastric ulcer”
（五）截词检索：antidod*
(六) 字段限定检索：blood[ta]、blood[so]
( 七) 逻辑组配检索：由左至右、或and优先
（二）主题词检索
主题词 检索词对应的主题词，而非文献 主题词注释信息 检索生成器选项
∨ 副主题词： 限定检索主 题词某一方 面的文献
Zhonghua cancer wai ke za zhi
同时输入多个检索条件
(一)基本检索：智能检索
西咪替丁治疗胃溃疡
Stomach ulcer 主题词 Gastric ulcer Cimetidine
文本词
拆 分
自动转换匹配功能
对输入的有实际意义的检索词、短语，系统会自动进行词
语的匹配转换，并返回检索结果。
一、简 介
收录1865年以来80多个国家和地区出版的39个文种的5600 余种期刊的生物医学文献2200多万篇。内容覆盖医学、护理、 牙科、兽医、卫生制度与医疗保险、临床前科学等。
现收录期刊5600余种，美国占47%，39个文种，英文文献
90%，80%有英文摘要， 70%可链接全文，17%免费获取全文。
（二）
缺点：
主题词检索
PubMed系统中只有MEDLINE数据库中的记录进行了主题 词标引，所以主题词检索只对MEDLINE中的记录有效， 而PubMed中其他来源的记录不支持主题词检索，因此，
PubMed使用教程指南
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一、基本检索
6.期刊检索
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发送至检索恇
点击选中
20
一、基本检索
6.期刊检索
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点击执行检索
21
一、基本检索
6.期刊检索
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检索成果
22
二、辅助检索区
1.Limit （限定检索） 2.Preview/index（预览/索引） 3.History（检索史） 4.Clipborard（剪贴板） 5.Detail（检索式详览）
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环节1 点击预览和索引
环节2 输入待选词
环节4 拟定与检索栏中 检索提问旳逻辑关系
环节3 索引选词
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3.History（检索史）
▪ 检索式回忆 ▪ 编辑检索式 ▪ 如#3 AND child
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检索历史回忆
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检索式
检索时间 检出篇数
检索式编号可替代检索式进行输入检索
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2024/9/21
点击有关规范词
64
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选择检索 选择副主题词
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2024/9/21
执行检索
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检索成果 题录：著者、篇名、刊名
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2.阿司匹林治疗心肌梗死
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首先，将概念切提成2个面： Aspirin/治疗应用 心肌梗死/药物治疗
然后，分别进行规范词选择检索
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69
2024/9/21
70
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- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库，目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料，并提供部分免费及付费全文连结服务，需要收费的全文，读者可自行与出版社接洽。
较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主，PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容：1. 对于超出学科范围(如：资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中；2. 收录即将出版的医学论文；3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。
美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下：1.PubMed：生物医学文献书目索引摘要资料库。
2.Nucleotide：包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。
3.Protein：整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料，并可参照Taxonomy资料库，了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。
4.Structure：分子构造资料库。
5.Genome：基因组合序列资料库。
6.PopSet：可查询某族群的基因序列，了解该族群演进之相关资料。
7.OMIM：遗传学资料库。
8.Taxonomy：在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。
9.Books：收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。
10. ProbeSet：以检索的方式使用基因学诠释文献资料库。
11. 3D Domains：以3D方式呈现细胞结构。
贰、连线方式直接连至网址：/sites/entrez?holding=itwcathlib_fft_ndi ，即可使用已设定国泰医图Link-Out的PubMed资料库。
参、 检索方式一、 主画面功能介绍(一)关于Entrez 检索系统:Entrez 是一Web-based 检索系统，用以检索下图所示各资料库，只要从其中一个资料库出发，可在检索结果中进行跨资料库的检索。
1 2345(二)辅助说明PubMed资料库中备有详尽的资料库线上操作求助讯息，包括：Help、FAQ、Tutorial、New/Noteworthy 以便使用者自学；另有网站资料、功能异动讯息以告知使用者应注意的事项。
(三) 检索区使用者在对话框中输入欲查询的主题词汇、作者、刊名、文献识别号(PMID)…等即可建立检索，取得检索结果。
(四) 功能快捷列1. Limits使用者可限制查询的栏位、附摘要的文献、出版品的类型、语文、主题类别(如：AIDS、Bioethics...)、研究对象年龄层、研究对象(人类或动物)、性别、系统最近更新时间、出版时间。
2. Preview/IndexPreview可预览：a.先前检索结果之笔数，并决定是否要修正检索策略，如不修正亦可从笔数直接连至检索结果。
b.亦可在「Add Term(s) to Query or View Index」输入词汇预览检索结果之笔数，或是输入后按下Index，看各栏位中该词出现的资料笔数，并选择AND、OR、NOT加入原有的检索策略中进行检索。
3. History每个检索步骤系统都会产生一个检索号码，在本区可看到所有的检索步骤历史记录。
如要运用先前的检索策略，可直接输入检索号码并加以布林逻辑运算，如：#2 AND #3，表示将第二个及第三个检索步骤加以交集运算。
若八小时内未再进行任何检索步骤，则此记录将被系统消除，此外，以#标示的步骤号码所储存的检索策略将被系统视为无效的检索策略，下次登入系统时，将无法以#标示的检索策略追踪新增的文献资料。
4. Clipboard该资料区可暂存检索一次或是多次的检索结果，以进行后续的列印、储存、或文献传递服务之订购，最多可显示500笔记录，同样地，若八小时内未再执行任何步骤的话，则记录将被系统消除。
5. Details使用者输入检索词后，可在此检视PubMed如何将检索词转换成系统控制词汇，并可直接在PubMed Query中进行检索策略之编辑。
若需储存该次检索策略，可直接按下URL键，并配合浏览器所提供之书签（Bookmark）功能，将该检索策略以网址形式储存在浏览器中的书签档案中，以便日后之使用。
(五) PubMed服务项目1. Journal Database：可透过输入期刊刊名、ISSN或Medline刊名缩写查询期刊的出版资讯。
2. MeSH Database：点选此功能后，在检索栏位中输入欲查询的词汇，可浏览PubMed资料库中所使用控制词汇。
3. Single Citation Matcher：使用栏位化的检索方式，找寻特定刊名、卷期、作者、篇名的文献资料。
4. Batch Citation Matcher：以指令式的方式批次检索资料库中相关的文献，只要输入刊名、年代、卷期、起始页、作者名、关键词其中部分栏位资料即可。
5. Clinical Queries: 临床病理资料，本功能提供临床病理资料之查询，并依Haynes RB等专家所制订的最佳化检索策略之机制，使用者可先行选择检索方向，如：治疗方式(Therapy)、诊断方式(Diagnosis)、病因(Etiology)、预后状况(Prognosis)其中的一类，并可选择预期之检索结果是较具相关性(sensitivity)或精确率(specificity)较高的。
6. LinkOut：LinkOut为PubMed提供使用者连结外部网路资源之功能选项，连结内容包括国外图书馆馆藏目录、线上电子全文、书目资料库清单、消费者健康资讯、研究参考资料等资讯。
如有外部资源的连结，使用者可在PubMed摘要书目中看到LinkOut此一选项。
7. 免费个人化检索服务—My NCBI：在MY NCBI服务页建立个人检索帐号/密码后，即可使用个人化检索服务，该服务提供储存/删除检索结果、MyLinkOut设定及文献传递等个人化服务二、检索技巧(一) 常用的检索方式:1. 主题概念检索:检索词的转换:在检索词汇方面，使用者所输入的检索词都将自动被转换对映至MeSH，但系统会同时以MeSH及Text Word方式进行检索，例如检索vitamin h，系统将以Biotin[MeSH] OR vitamin h[Text Word]进行检索。
如果需找特定词汇，可在词汇间加入引号，如："single cell "。
2. 刊名检索: 输入刊名全称、缩写或是ISSN号码时，系统将自动对应至刊名检索，例如输入：new England journal of medicine，将被转换成N Engl J Med[Journal Name]，其意义同N Engl J Med[ta]。
3.作者查询:输入形式为：姓名字的首字缩写，例如smith ja。
使用者亦可用指令方式查询作者名：lai my[au]；或是在「limit」功能中指定查询作者名。
(二) 切截如英美文字的拼法或是词尾的变化而需要模糊查询时，可使用*作为切截符号，如：flavor*，可找到以flavor开头的字，如：flavored、flavorful..，最多可显示150笔以此字开头的资料。
但是*是以单字词为主要使用对象，如查询：infection*可以找到infections，但无法找到infection control。
(三) 布林逻辑PubMed接受AND、OR、NOT布林逻辑语法，但需以大写输入，如：vitamin c OR zinc，如欲同时使用两个以上的布林语法，则可利用括弧『( )』以利系统判定执行之先后，如：common cold AND (vitamin c OR zinc)，括弧中的主题概念之组合将先被运算后视为一个概念再与括弧外的主题概念进行布林逻辑之运算。
三、 检索结果：以Nosebleed 为检索例，所得检索结果呈现方式如下图所示，兹分述细项功能如下：1. 展示： 可选择以一般格式(Summary)、简要格式(Brief)、含摘要格式(Abstract)、XML 格式、显示是否有LinkOut(提供相关的网路资源连结)...等格式显示所有的书目记录。
若选择摘要格式(Abstract)，可以看到本馆收录电子全文的馆藏图示，并可直接连结全文。
2. 显示笔数：可选择每页欲显示的检索结果之笔数，系统预设为20笔。
3. 排序：可选择以作者或刊名或出版日期排序。
4. Send to ：使用者可勾选欲储存的检索结果，如未勾选，系统预设为全选，再选择下拉清单中Save 键，并输入”自订的档名.txt”，可将检索结果储存在local 端的电脑中。
如按下「Text 」键，将以纯文字档显示当页检索结果。
或send toClipboard 、E-mail 等。
5. 检索结果：在检索结果中，每一笔记录都标示着「Related Articles 相关文献」，相关文献以同一主题概念在不同文章中出现的频率为计算基准，两篇文献有愈多相近的主题概念表示愈相关，PubMed 据以评量提供「相关文献」。
如按下作者姓名的超连结，可显示该笔的书目附摘要的详细记录，记录旁亦有「Related Articles 」及「Links 」。
「Links 」提供「Books 」及「LinkOut 」两种选择，其中「Books 」为从摘要中撷取主题概念并列出相关的MeSH 主题词，可连至相关的电子书全文；「LinkOut 」为线上电子全文、书目资料库清单、消费者健康资讯、研究资料等外部连结资料。
此外，每笔书目记录均会标示PMID ，如：PMID: 7998669，表示这篇文献在系统中的流水编号为7998669，申请馆际合作文件时如填上此号码，可加速找到该文件。
1 2 34 5肆、全文之取得(一)PubMed CentralPubMed Central为美国国家医学图书馆生命科学数位文献中心，目前收录Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials等240余种全文电子期刊，提供HTML 及PDF格式之免费电子全文。